4F9ZA

Crystal structure of human erp27
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
QEPTWLTDVPAAMEFIAATEVAVIGFFQDLEIPAVPILHSMVQKFPGVSFGISTDSEVLTHYNITGNTICLFRLVDNEQLNLEDEDIESIDATKLSRFIEINSLHMVTEYNPVTVIGLFNSVIQIHLLLIMNKASPEYEENMHRYQKAAKLFQGKILFILVDSGMKENGKVISFFKLKESQLPALAIYQTLDDEWDTLPTAEVSVEHVQNFCDGFLSGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Peptide binding protein
source organism Homo sapiens
publication title The Crystal Structure of the Protein-Disulfide Isomerase Family Member ERp27 Provides Insights into Its Substrate Binding Capabilities.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoplasmic reticulum resident protein 27
total genus 67
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4f9zA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4f9zA01
4EXJA 2KLXA 12GSA 1EP7A 2C3TA 2AAWA 5KEJA 4EVMA 5IPGA 4J56E 4OFMA 2H71A 1GNWA 1HNBA 3FHKA 4OFTA 3QAGA 2EIQA 3M8NA 1FVJA 2CZ3A 4KW6A 2I81A 2DJ0A 1FAAA 4K0GA 5HR2A 5B6MA 4YAVA 3DGQA 1TRWA 3KGKA 5IMVA 19GSA 4BA7A 4O5RA 2X64A 2F3MA 1YKAA 3SWLA 4NPBA 3ZREA 4L0WA 4N0VA 2VL2A 2H76A 4FYBA 4MH3A 4K7NA 3M9JA 1TK0B 1SKWB 3A2XA 1B9YC 3CMIA 4NAXA 2N5FA 3EURA 3D21A 2R3XA 1DSBA 17GSA 1SK2A 1Q98A 5J41A 2H72A 3HVXA 2FWHA 5D9XA 2H0GA 2MZCA 2OKAA 4WBRD 5IOWA 2JZSA 5DBQA 13GSA 1G7OA 3TRQA 4H86A 2EC4A 4DSSB 3BJ5A 3P2AA 3SBCA 3IOSA 2FGXA 4N30A 2ZCTA 3DYRA 4ZBAA 5L71A 2QC7A 2H30A 2ES7A 2WGRA 2DJ2A 3FYGA 1LU4A 5ECMB 4I5QA 3Q19A 3J7Yb 1YY7A 2YV9A 1ERVA 2HFDA 1EP8A 5G2ZA 3HZ8A 4QQ7A 4RQRA 1R4WA 3G7YA 4HZ2A 1TU7A 4IVFA 1O81A 2YP6A 3FZ5A 4X1UA 3O76A 5CRWA 5GAPD 1URMA 1BG5A 3ISOA 2X8CA 3CBUA 4OMVA 3IV4A 3U6VA 3BCIA 4K6XA 4LMWA 3P7XA 5D73A 1F3AA 4KH7A 4X43A 3DRNA 2PMTA 2YJ7A 1G6WA 1B48A 5G1KA 3APQA 2CZ2A 4TR3A 1XPVA 2VD0A 4JR4A 1PQNA 5J5NA 1X9MB 3G7IA 1Z3EA 2YWNA 1TK8B 1GRXA 3EC3A 2MBTA 4K0NA 1ERWA 2PBJA 4HQSA 4MZCA 1K3YA 5LCZA 3C73A 3DEXA 1FB6A 3TJFA 2C4JA 3LYKA 3VWVA 4OCFA 4F0CA 3NIVA 1GUMA 2K9FA 2YN1A 3HA9A 1FO5A 2PU9C 2V1MA 4BL7A 4MABA 3GKMA 1TRSA 2FNOA 1EV9A 1RQMA 2OA7A 3TJGA 1MTCA 4KCEA 4KDUA 4NMUA 2H1GA 3P90A 3GSTA 4KNDA 3FKFA 3TKPA 1ZGNA 1XOAA 3BOAA 1HQOA 2F8AA 2CVKA 1WE0A 2FLSA 2LNTA 11GSA 5ELGA 4K9ZA 1ILOA 1GLQA 5H5SA 2IJYA 5DAKB 2N5BA 3WGXA 1T7PB 2RUEA 1XWCA 3Q74A 1FG4A 2CAQA 2BTOT 2H6YA 4KUNA 3D4TA 3TRPA 3J7Yk 4PQIA 1KNGA 2VAFA 4ML6A 9GSSA 2L5OA 1PSQA 3F4RA 2XC2A 2VLUA 5ENUA 5CP1A 3ZLPA 2JSZA 3QPMA 1GSFA 5CYYA 1A2JA 1XW5A 1ZMAA 3VPTA 4EDYA 1G7EA 5DALB 3VI7A 2FHEA 4IJ3A 3ZVJA 5ECHB 1M9AA 4MH2A 4HUAA 1OKTA 2DC5A 2VLVA 2IMEA 3KH7A 1S3CA 3MSZA 3A3TA 1O6JA 3KEBA 1PGTA 3IPZA 4MJEA 2DSAA 2VIMA 1F37A 3QAWA 1B8XA 1XFLA 2C0EA 5D9WA 1E2YA 3DD3A 3IAS2 2K18A 1HNCA 4E8HA 4PGTA 2AB6A 1GSEA 2A2SA 3GFKA 3TDGA 2VL9A 2VLTA 3WYWA 1NHYA 3E0UA 2LUSA 1SJ6A 5ECPB 5B6NA 5CAXA 2X8GA 6GSVA 2CVBA 1SENA 4XIHA 1WPIA 1XWGA 3CRTA 4IELA 3IK9A 2PUKC 3LFLA 4JU5A 5JCGA 2L5LA 4Q5FA 3APSA 2IWTA 4ECJA 2G2QA 4IKHA 1T3BA 2WRTA 3ZFBA 1A2LA 3KP8A 2H75A 2V41A 3GKKA 4KAEA 3A5WA 4PXOA 1GH2A 1O85A 4AJ7A 1G0TA 4D73B 4GSTA 4K1FA 1WWJA 1Z6NA 2NDOA 3NOFA 2F51A 2PPTA 5ECIB 3D22A 1V57A 3RHBA 2VCVA 2OE3A 3IBHA 2IL3A 3EYTA 5CREA 4HZ4A 3KCMA 2R37A 4KB3A 3F8UA 3AY8A 2LTKA 5IOXA 2WULA 4KA0A 1SU9A 4MF6A 3UL3A 1M0UA 4O92A 1XZOA 2R2JA 3HY2A 2MBSA 3G9BA 4MA9A 2RIIA 2JACA 2GT6A 2H73A 2VO4A 4HEA2 1O7UA 6GSSA 4YQVA 2HLSA 2L59A 4TRXA 1HD2A 3WGDA 3R2QA 2VOCA 2YPMA 2E2GA 3KD0A 1DUGA 3UAPA 2R5GA 3MDKA 3KM6A 5GZZB 3RDWA 1KTEA 1WMJA 20GSA 1MEKA 4AJ8A 5J9CA 5H5QA 2J23A 4F82A 4WF4A 1WP0A 5DVBA 2A2RA 5HR1A 5B8BA 4HU9A 1Z7PA 3CSJA 4MJAA 1LJRA 1S3DA 2ON5A 1WRYA 2MMOA 4EL1A 3ZIJA 2HE3A 3I69A 3TKSC 4TOPA 3TKQA 1OAZA 3ZVJD 4IP6A 2H6ZA 1BAYA 2GSQA 3L9UA 5IMFA 2O85A 2RLIA 3GTUA 4Z7XA 4G2EA 1K3LA 5G1LA 4POLA 2PVQA 5C00A 4FH8A 4TXOA 2IMDA 3KTBA 4L0UA 1QXHA 3IHQA 3M1GA 1UN2A 1K0NA 1V2AA 1TOFA 2CT6A 1X5EA 3FK8A 1K0CA 1O8WA 1GL8A 1TI1A 2YV7A 4OFNA 1QMVA 2C0GA 5DJMA 4LL4B 2H8LA 3LQ7A 4XRAA 1ZCPA 2FA8A 1PKWA 4EDZA 4EKZA 3G7JA 4OWYA 2V6KA 3Q18A 3K8NA 1R5PA 2XPEA 1B9XC 1NM3A 1Z5YE 1GTIA 1PN9A 5HR3A 2O89A 1O73A 1OC8A 3GSSA 1SL2B 1U3AA 2HXKA 3UIWA 3FR9A 1J9BA 1T8EB 1T4YA 4LMVA 4POKA 2LRCA 4KGIA 3WGEA 4GXZA 2PERA 4JR6A 1CQGA 3GL5A 2MMAA 5IMCA 1U87A 2IFQA 5C04A 2WS2A 4I97A 3GH9A 3GX8A 2WCIA 1H75A 5IQYA 1GUHA 1SD8A 2NPBA 3GKXA 3EE2A 3HCZA 1ZZYA 3BCKA 2CQ9A 3F63A 3E9JB 2E2MA 1GSYA 2R4VA 2V32A 3VPQA 3KTLA 3BD2A 1BEDA 3QR6A 5DCHA 4IP1A 2LJAA 1K3OA 3TB2A 1A24A 5JWOB 1CQHA 3GKNA 4NHWA 4RUVA 4JBBA 1W89A 2B1KA 4IQ1A 2O8VB 3ZTLA 2FD3A 3W6GA 1F6MC 5G31A 1USBA 3VLNA 3GHAA 4EC0A 1HYUA 2RUFA 1PX7A 8GSSA 3EWLA 1OC9A 3TKSA 4WR5A 4NV2A 3GYKA 1OC3A 4MF7A 2NBSA 3LXZA 3QMXA 5D9TA 5GSSA 5F06A 3TCOA 2HI7A 3TKRA 3L9VA 14GSA 2B7KA 5HFKA 4TKYA 4GWRA 4PQ1A 1GSSA 1EOHA 1YDKA 1EOGA 2FUG2 2DIYA 2HSHA 3I6AA 2LJKA 1IYIA 4ZB9A 3PGTA 3C1RA 1JLVA 2LQQA 2YZHA 2AHEA 1PX6A 2H0HA 1JFUA 5ABRA 4F03A 3H8QA 4TXOB 1OE7A 1PMTA 1ST9A 5ID2A 5DDLA 1OE8A 1SD9A 2YCDA 2HZEA 2WFCA 2M80A 5HR0A 3GV1A 1LBKA 3LXTA 2OBKA 2LEGA 2Z9SA 2M46A 4XTSA 1QK8A 2WB9A 5FHIA 2H1DA 4NXIA 4AJ6A 2TRCP 3GNJA 3C7MA 4EO3A 5JCWA 2MMZA 5A4WA 2LRNA 2YNXA 4EF0A 1K0BA 1THXA 2K8VA 1J08A 3APOA 5AIXA 3FZ9A 1XWKA 5CO3A 1J0FA 2A4VA 1TKDB 3A2VA 3DWVA 1PD21 1XW6A 2IMFA 3FY7A 2H66A 2VCWA 2XHFA 2H0IA 2I9HA 3CSIA 2CV4A 1QUWA 2XPDA 2MMNA 2LKUA 4TR1A 2GT5A 4O7HA 5B8AA 2E7PA 1YKCA 4MP4A 1GUKA 3F3QA 4PX1A 1F2EA 3E3EA 2CX3A 3LORA 2QKEA 5EPFA 4L5LA 1XXUA 2FCHA 4LA1A 4GSNA 2IMKA 5AGYA 2C80A 4G19A 5IM9A 2I1UA 1QQ2A 4GTUA 2YWOA 2OJLA 4ZILA 1SL0B 2PGTA 3DVWA 2GSRA 5A5KA 2F8FA 1M9BA 4TR0A 4RI6A 16GSA 4WF5A 1PL2A 1XVQA 1R26A 3ZRDA 4YQUA 2TRXA 3IA1A 2V6OA 4PUFC 5JWRB 4MDCA 6GSTA 4ECBA 1OC9B 4L8EA 1OYJA 3S9FA 1O8XA 2GQLA 2J9HA 4Q5RA 2DLXA 5GAND 2KOKA 2GGTA 2GSTA 5DQYA 5INYA 2IN3A 3CTFA 4ECIA 3JCML 3ZIVA 4Q5QA 1AIUA 1WOUA 5AIVA 2VM2A 1AQXA 1VF2A 3UJ1A 3ZMLA 3LGCA 1JHBA 1TTZA 2ALBA 5JWQB 1RK4A 2GTUA 3C71A 1E6BA 1W4VA 3KMNA 4XS4A 5LD0A 1Z9HA 1MDIA 2GSSA 2HZFA 2FA4A 1A8LA 3GN3A 3H79A 2QSIA 3TOUA 1U3IA 1XW9A 4HU7A 1SK1A 5D93A 4KSMA 2ON7A 1ACVA 3CSHA 2F9SA 2H70A 4QL7A 1K0DA 5E59A 2WDUA 4MZBA 2B5EA 3DVXA 4BVYA 1Z7RA 4HQZA 3ZITA 3TGZA 3EU4A 1HNAA 4I2UA 2O7KA 3RAZA 1V9WA 2H19A 1AXDA 3V1WA 4KSOA 1PKZA 4MPFA 1GWCA 3HHVA 3IC4A 1T4ZA 3TRXA 2C8UA 1JZDA 3H93A 4N10A 4MJCA 1MD3A 3L4NA 1UVZA 1XCCA 3VWWA 1TK5B 3QD9A 3QFBC 1ABAA 3ME8A 2RM6A 1QFNA 3M0FA 3M3MA 1A0FA 1U88A 2IIYA 4YQMA 3Q6OA 3FR6A 1ZYQB 2LQOA 2M72A 2V2GA 1VF1A 3N5OA 2B1LA 1UA5A 2YOIA 4WEYA 3F6FA 1ERTA 4EUYA 3FZ4A 4HDEA 3CXGA 4TR4A 4ILFA 3UBKA 1DE2A 4QL9A 1TJDA 1GSDA 2KUCA 4V2NA 4BPYA 3HZ4A 1UC7A 2C0DA 2I3YA 5J4UA 5F07A 4GRFA 4ZB8A 2YWIA 2E0QA 2FWEA 1EGOA 1FOVA 4XRDA 5COHA 3H4KA 4ZL8A 1AQVA 1XVWA 2REMA 2PWJA 5ECOB 3FW2A 1JZWA 1KBNA 2OE0A 3C8EA 3HDCA 3LSZA 1V98A 2B6MA 3QAVA 2AV4A 2AJQB 5CRGA 2JL4A 3HXSA 1Q4JA 2JADA 4NWYA 3UEMA 2BMXA 4BVXA 1DBYA 1BQ7A 3MWHA 1X9WB 2O87A 3IXRA 5G5EA 5HFIA 4ML1A 2C0FA 4OD7A 3QCPA 2VL2C 5ECLB 3UOMA 2NVLA 4FIWA 1M2BA 3GA4A 2H6XA 2YZUA 1ZOFA 1OVNA 3RPPA 5LNKe 1QGVA 4I6XA 2VM1A 3DKSA 4XS4B 1JLWA 1YF0A 1TP9A 1Y6EA 2L6CA 3D6IA 3DIEA 5F8BA 2VCXA 3PR8A 1AUCA 3QFAC 4DSSA 3F3RA 2DBCA 3PH9A 2VCTA 3ZL5A 4GLTA 2C3QA 3HKRA 2P0GA 3VFIA 2OACA 4K2DA 4BWQA 5IMZA 2JZRA 3GUSA 4POBA 4OCEA 1PRXA 4X0XA 2FY6A 1ON4A 3ZMKA 3HJPA 3TUEA 2VCZA 1K0AA 2R6KA 4N11A 3GRXA 3HD5A 3EMPA 4P3YB 2EIRA 3ME7A 2GZPA 4TVEA 4ZXGA 4HOJA 2LRTA 4WXTA 3MNGA 4PNGA 4DSQA 3UARA 2B5XA 5FWGA 4JE1A 1SJZA 3QOUA 1T1VA 3VURA 4GSSA 4MMMA 4MLYA 3H1NA 4FYUA 2DJ1A 3GH6A 3ERFA 5AISA 3VWXA 1SK0A 4N0ZA 2H01A 2DMLA 2H1BA 1TDIA 1GTUA 3WD6A 1ML6A 2GQKA 4IW9A 3L78A 1KEBA 1NHOA 2KP1A 5ECRB 1A23A 5A4VA 4CW9A 3GMFA 3HVSA 3ZZXA 4HS1A 4GF0A 3O6TA 3M9KA 2MYGA 2P31A 4GQFA 2K6VA 1S3AA 1R5AA 2P5RA 2CA8A 3EINA 2L6DA 1SKRB 4MJBA 1WIKA 5J9BA 3RHCA 1U6TA 1A2MA 4DSRA 2AUVA 1XOBA 5IMDA 4PURA 2LNSA 1VF4A 3ERGA 1SYRA 3UMAA 1V58A 1YZXA 2DIZA 3KP9A 3IRAA 5HQPA 5DAKA 2X99A 1A0RP 1YEPA 1AAZA 1Z6MA 2HRNA 2KHPA 1BYEA 3LJRA 5D9VA 3US3A 2C1YA 3ERWA 2CVDA 5DJLA 4K7OA 2NTOA 2GS3A 3IR4A 3BBYA 5EY6A 5ELAA 3D5JA 2VD1A 3F6DA 1X0RA 3UVTA 3GTUB 2X8HA 4HI7A 3O3TA 1EEMA 1EV4A 1TU8A 5DALA 1YF1A 3KH9A 5D96A 5B7CA 4E8EA 1FB0A 4IGJA 1TXXA 3ZYWA 4POMA 4PQHA 1JZRA 1BJXA 4HJMA 1EEJA 2CAIA 3EMXA 1TI3A 5IIZA 1V40A 3HVVA 3VK9A 5G5FA 1FHEA 4ISDA 3FRCA 5ECSA 3KJYA 2YJHA 4WBJA 2DMMA 2GDRA 3D0ZA 2H74A 4JZQA 5CNWA 3LEFA 2YANA 4Q5NA 2PN8A 3W8JA 3GIXA 1GSQA 3NZNA 3ED3A 4EE0A 2L4QA 4JEDA 5G30A 4LLRA 4G9HA 4AGSA 4FYCA 5IO0A 2IFQB 1GLPA 3LWAA 4ZL7A 2YWMA 3I43A 2GLRA 1XWAA 1R7HA 1PL1A 3TJKA 4L5OA 2DJ3A 1M7TA 2JZTA 1GULA 4ZL9A 4XS6A 2QGVA 3FZAA 4V2LA 5KN1A 2BJXA 2ZNMA 4J2FA 4D73A 2B7JA 5ECKB 3I9V2 1B4PA 2FWGA 3IAM2 1YQ1A 1F3BA 1X5CA 4ZBDA 1XIYA 3KMOA 3UBLA 2LSTA 1MDKA 4IS0A 5EVOA 3HJMA 1K0OA 3L0HA 3RPNA 3TJBA 2FWFA 2EIOA 4DVCA 1SJIA 4IBPA 1M2DA 3F0IA 4I2TA 2JU5A 2D2ZA 2L57A 1AW9A 3IK7A 3F4TA 1MD4A 2OADA 2OE1A 2HT9A 2IPAA 3F9UA 3U5RE 4FO5A 1GP1A 2GZZA 2TIRA 1C72A 5KN0A 4V2MA 7GSSA 2VL3A 2ZUPA 4GQCA 1OKDA 5ID2B 3WT2A 4BWSA 5IO2A 4XS1A 4YAPA 3C1SA 2GQMA 6GSWA 2HZEB 4O32A 3TJJA 1IYHA 4KX4A 4HJ2A 4KE3A 3KXOA 1SYXA 3FEUA 3OR5A 1VGLA 2JSYA 3IDVA 4ZIJA 2HNLA 2DJKA 4RI7A 5FT3A 5EL8A 2DJJA 6GSYA 5H5RA 4GCIA 3KIJA 4MPGA 4V1Ap 1ZYEA 4MZWA 2VCQA 3QDNA 6GSUA 22GSA 6GSXA 1RW1A 1K0MA 4OO4A 4CHSA 3KZQA 1N8JA 2CX4A 3EVIA 3HYPA 3P8WA 3N9JA 1GTAA 3CYNA 4MF5A 4RQXA 4TR1B 5IPHA 1VRSD 4ZB6A 1T00A 2WZ9A 3ZFLA 1THOA 1WJKA 1PA3A 3D4MA 4PUAA 1X9SB 1GTBA 3PINA 3DMLA 4PNFA 2IMIA 1TRUA 1TRVA 2PVOC 2G0FA 1ZL9A 2LJRA 4DEJA 1DE1A 4XHMA 4TW5A 5DCGA 2WJUA 3F4SA 1BX9A 1SL1B 1M99A 1M2AA 1TW9A 1JZOA 4K8MA 18GSA 1A8YA 1MDJA 4WKWA 5D8IA 4OO5A 3TOTA 1EGRA 4XCSA 2L4CA 1SKSB 1H4OA 2XBQA 4NV5A 4MK3A 1XBSA 2KP2A 2OBIA 4MCUA 2B3SA 2B5YA 1XWBA 3DXBA 4WR4A 5KN2A 1Y25A 1B4QA 1G6YA 4ID0A 1N2AA 3MAKA 4I8BA 2LV3A 5F0GA 3IE3A 4F9ZA 3FR3A 4J57E 10GSA 3LG6A 4ECCA 5DQSA 4F0BA 2HSYA 1F9MA 3L9SA 5ECNB 4LL1B 1AC1A 2RM5A 5IMAA 2H1AA 3W8SA 2GZYA 4WETA 2VUPA 5E4WA 1AQWA 5JCUA 2I4AA 3LYPA 3VWUA 1GSUA 4K7IA 3GX0A 3CTGA 4NHZA 4ULXA 1YJ6A 4KDXA 2HYXA 3VI5A 5J3RA 5KN3A 2N5AA 1EWXA 5HFGA 4TXVA 1X5DA 4ACSA 4JRRA 1VF3A 4CDOA 1EZKA 1FVKA 1YEXA 4KDYA 3RBTA 4YH2A 5GSTA 4F2IA 5F05A 5CRHA 4KCAA 1NW2A 1I9DA 3GL3A 4IQAA 3EU3A 2AYTA 5CRDA 4IJIA 4IN0A 4ZBBA 3GURA 4IHUA 4AF2A 2LS5A 2HRFA 3TKSE 3HJOA 1I5GA 5AN1A 1FW1A 3UVHA 4G10A 1ERUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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