4FE8A

Crystal structure of htt36q3h-ex1-x1-c1(alpha)
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
402
structure length
402
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQQQQQHQHQHQQQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Beta conformation of polyglutamine track revealed by a crystal structure of Huntingtin N-terminal region with insertion of three histidine residues.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Escherichia coli (strain k12)
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Huntingtin
total genus 120
structure length 402
sequence length 402
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fe8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fe8A02
1YCJA 4IGTA 3QUJA 3KSXA 3U93A 1NNFA 1SVXB 3K00A 3O2AA 2UVHA 5ICTA 4ZEIA 3RQTA 4H65A 1LB9A 3TFLA 4ELPA 4RXLA 3PMXA 2FA7A 4YAHX 1N84A 3HO7A 2GHBA 3FGSA 3Q26A 4O3AA 1LBCA 2UVIA 3TDJA 3RGYA 5IAIA 2XHDA 5AA4B 5I59A 4DDDA 2VHAA 3HHFA 5CMKA 3FXQA 1JEUA 2F7CA 4IB2A 4Q8RA 4LQ5A 4F1YA 2Y7KA 4RY1A 2AL5A 1MXXA 1R1NA 3EHTA 2IA4A 5AA2D 1XVYA 3OD7A 3UA8A 5L9SA 1QJMA 2B3FA 4U4SA 1MXVA 4GOTA 1DSNA 1J1NA 4C0RA 5F7VA 2A5TB 3IB0A 2CZLA 3K6WA 4R2FA 5I57A 2QL3A 3VFJA 2XXXA 4UA8A 4YB7A 5I58A 1H76A 1YTVA 3SESA 3H4ZA 3S9NC 1QW0A 2PYYA 3O28A 1H44A 4KYDA 4RK9A 3T9VA 3IO4A 4E0WA 3MP6A 1Y20A 4LA9A 4E0XA 2F97A 1I6QA 1L5TA 2ESNA 5HBCA 4YKKA 2B65A 2RINA 3SEWA 2O69A 2O84X 4QSCA 5H8FB 1OQHA 1B0HA 2DQVA 3PMWA 3FASA 3UIFA 2OWSA 4DXCA 2VD3A 1CE2A 3WAFA 1SW4A 5I2NB 1MS7A 1OLAA 4LATA 2DWIA 1IXHA 4ONYA 1NNTA 3EHSA 4H67A 3CG1A 1ZJLA 2UVJA 4G68B 4XKNA 3E4RA 3GXAA 3C31A 5AA4A 2NOOA 3EQ1A 3M3FA 3FV2A 1HSJA 4QFOA 3VLUA 4F19A 2O68A 5CMMA 2DVCA 1SW1A 3H6WA 4FJPA 4OETA 3RN8A 4EDPA 1DTGA 2QMWA 4GF8A 1SW5A 3IOWA 3CFZA 3PPNA 4R74A 1WODA 1Y3QA 4H5GA 1UTBB 1FQBA 2A5TA 1POY1 3IORA 2HCAA 3E13X 3QSLA 1URDA 4KCDA 1H3DA 1ATGA 1LLSA 3VLWA 3MZBA 4YKIA 4F3GA 2OK2A 1Y4CA 1S9TA 1H43A 1AIVA 1XVXA 3I3VA 3CFLA 1H45A 4PETA 4R9FA 3MW0A 3EF7A 3T66A 2Z23A 1VR5A 4FIMA 4OFOA 5CC2A 3TTMA 1TXFA 3TZAA 5AA1A 4THIA 2BJJX 1I6AA 1IXIA 3U72A 2Y7RA 3C35A 3TYHA 2V3TA 1MG1A 4ZZAA 2D21A 4DXBA 4IO6A 4NF8B 1B0LA 2XXWA 1RKMA 4JWOA 5H8NB 5I2NA 3N6UA 4JWXA 2Q2AA 5FHOA 3H7MA 5FTIA 2QS1A 3CSGA 2Y7WA 4JXIA 1DTZA 4F39A 1N76A 2Z22A 2R6GE 4G77A 4GWOA 2ZNUA 2HZLA 1OLCA 2ZYOA 4H6DA 4YU0A 2UYFA 2PT2A 4N07A 1A54A 1M5DA 2W7YA 3FATA 1LAFE 2OZZA 3A3UA 3RPWA 1QUJA 1M5FA 1JETA 2X7PA 2XD2A 1XT8A 2XXUA 2E0SA 2Y84A 3F11A 1IQ7A 3LUYA 5KZTA 2VOZA 3JZJA 2O7UA 2Y7PA 3OSQA 1A8EA 5BUUA 1UTBA 3M8UA 2F35A 3C9HA 1B1HA 2GHAA 3FZVA 2F6GA 4EQ9A 4ZEDA 3I6VA 5H8HB 1B3GA 2XD3A 4HCYA 1LAGE 4AB6A 4Q0CA 5I84A 2OWTA 3O6GA 1B58A 1R9QA 2Q8JA 3HSTA 4IO4A 2XXRA 4G8MA 1UTHB 1Y3PA 4XKPA 3IB2A 4F2OA 1MXUA 4Z7EA 1Y1MA 1Z7ME 5JTYB 3B6TA 4NF8A 3PGFA 2I3VA 2DVZA 5H8NA 4BDQA 1IZ1A 2RCAA 5ISUA 3V89B 1IITA 4ELRA 1FQDA 4U4XA 1A99A 2UXAA 4M4GA 4RK2A 3T93B 1B32A 1A55A 4DXUA 1GV8A 3G7WA 1SYIA 4XXUA 3O9PA 4X1DA 3ONMA 5HPQA 5TU0A 1Y9UA 1B46A 2DXRA 1B40A 4ND9A 1JQFA 1I6BA 1PBPA 3PD8A 3C36A 2H99A 4C1UA 2F5XA 2E1SA 3PUZE 1FCKA 3FVOA 4FE8A 1JVYA 1JW4A 2RC9A 4NF5B 2DWJA 3ILUB 2X7QA 2RKMA 1T0KA 3SEUA 5KCJB 4EF1A 1SQYA 2DXYA 1MPDA 4IO3A 5H8HA 2OLBA 4F18A 3Q28A 2YLNA 3ZKLA 3T9UA 4F22A 4I8CA 1II5A 1R9LA 3S9LC 1RYOA 4LVQA 3K2DA 1QKBA 1UIUA 4I62A 5H8QB 3G3FA 4ZS9A 1UTHA 5JK4A 5L9OA 2I4CA 2ZYNA 1N0TA 1TFAA 2ZYMA 5JTYA 1MY2A 1P1WA 1UQWA 1POTA 4XKRA 4X9TA 3FVNA 4GQOA 2Q9TA 4YMAA 4KYSA 4LP2B 4R72A 1YAEA 3PMVA 4IY5A 2DSFA 3K02A 3K6VA 3MQ9A 1DPEA 3H3GA 4NF6A 4GXAA 1ZBMA 1US4A 4ZECA 3VXBA 1FTOA 3K0VA 2HAUA 4OYVA 3AXFA 1N7XA 4KI0E 4H0WA 2NWJA 3TCHA 3KEIA 4F1VA 4TOZA 4NF5A 2NXOA 3KN8A 4OWDA 2DE3A 1SBPA 2O7IA 4POWA 2F7BA 3TMGA 3SERA 3U8QA 5EYFA 4JSDA 3G3GA 3Q27A 1NL5A 4OHNA 4H1XA 1S7YA 4G4PA 4OEVA 5H8SA 3SDFA 4IO7A 4H8JA 1EZOA 4HCWA 5H8QA 3MAMA 2LAOA 2OBGA 1EZPA 1YPNA 3N5LA 2H98A 4LQ2A 3PUVE 4U1OA 2YJPA 1DMBA 3OO6A 3FD3A 1GVCA 3C34A 3K1MA 3W9WA 3IOTA 5FTHA 4RA1A 1M5CA 2GFEA 3V83A 4QFKA 1JEVA 3H6UA 1USYH 2AL4A 2OJTA 3BFUA 2XX9A 3P7IA 4GXSB 3KN7A 4DCYA 1DOTA 1MPBA 3PD9A 2DYXA 1ANFA 4PFUA 3CRBA 5FHMA 2ANJA 3PPOA 2ZYKA 3RT6B 2G93A 4U22A 3DP6A 3KJ7A 3H6VA 4YZZA 2DE4A 3SEVA 1SYHA 2HXWA 5K2XA 1ZIUA 4P0GA 1M5BA 1MXYA 4MFIA 1BIYA 4NF4B 1FTJA 4IY6A 3O97A 4GD5A 2XXPA 4JDFA 1IUDA 4U2RA 2H25A 1FTLA 5J1DA 4NMYA 4O3BA 3S4UA 3N6TA 4JB7A 2VP1A 3O6HA 2YPNA 3IK6B 3DP8A 3HV1A 4AQ4A 2HZKA 3LR1A 1BKAA 3TAJA 1ZLQA 3D4GA 3E9XA 1RYXA 3OMBA 1B3EA 5TPAB 3LBSA 4KCCA 4G8NA 1QULA 3MZ1A 2Q88A 2O1LA 3RLFE 3TPAA 3TTRA 2A5SA 2F6PA 3SETA 4Z0IA 2HAVA 2I0BA 1PBQA 3A09A 1FQAA 4LUBA 3SEYA 1MQDA 3U1OA 1VSOA 1P1QA 3FJGA 1F9BA 2IEEA 1NNKA 2XXVA 5H8FA 3H03A 5I2KB 3RTWB 5EHMA 2FNCA 3E3KA 4BLAA 4OXVA 3LSFB 2F34A 4IGRA 1KWHA 3HCQA 3IR1A 1B4ZA 3IAZA 4N13A 5CI5A 4YICA 2FYIA 4ISUA 4EQ7A 3OXNA 4FECA 1ELJA 2HEUA 4LZ8A 3FVKA 3L6HA 1LCTA 4G68A 3VVFA 1EH3A 3BKIB 3UORA 3EHUA 4KPTA 4OEUA 2G29A 2XXHA 1QVSA 4NF4A 1B3LA 3N26A 4MBPA 3ZS6A 1LFHA 3PPQA 2V84A 5DT6A 3B7DA 1GTKA 1GR2A 1FTMA 4KFQA 3FJMA 4YB6A 2H5YA 5I56B 3K1NA 2DWHA 3UN6A 1N3XA 2O1MA 1GGGA 5JEIA 2I49A 3PV0E 2Z8DA 1WVJA 2M8CA 4IO2A 4GRKA 3K1PA 1LB8A 3TQWA 1MH3A 4K3FA 4YKJA 2KLFA 5A5XB 4GFRA 5CBSA 3B6QA 1TWYA 5TPAA 2PVUA 2NVUB 4ZE9A 2P1SA 3L6GA 3G3KA 1A40A 2Q2CA 1B51A 1MXZA 3MZ9A 3UK4A 2ZXTA 2XXIA 4F2QA 3O29A 3RUMA 4ELQA 2V3UA 5I2KA 3WAEA 1SDXA 2Q89A 3QXMA 1SD3A 3VDFA 4G2ZA 1NFTA 4P0IA 2RF1A 3FUZA 5AA2B 1B4HA 3B6WA 5CMBA 1PB8A 3KN3A 1MPCA 2XX8A 3O6IA 2PT1A 5KDTB 3T96B 1Y1ZA 2I6EA 4KYEA 2HFBA 3FXUA 1XOCA 1QUKA 2I48A 3OENA 1N3WA 5I56A 3EN3A 3K6UA 4TQUQ 1ZU0A 4X48A 5B70A 1MQHA 1LFIA 1NH8A 3KFMA 1JVXA 4DCXA 4U23A 1SI1A 1MQIA 2PX1A 4QHQA 1XS5A 1P1OA 4Q5TA 1US5A 2XX7A 1OQGA 3KGCA 5A5XA 3LC8A 4JBZA 3HN0A 3IOUA 1B5HA 1URSA 1LBBA 3IOVA 3S2VA 3R6UA 2UYEA 4H8IA 1ZMGA 4NE4A 4ZE8A 4KD5A 3H06B 3TTLA 4FEBA 4NWCA 4AB5A 3UGWA 1MY4A 3RT8A 3OSRA 1M5EA 3MVXA 4KHZE 3FVGA 3G3HA 1FQEA 3W15C 1USYE 3Q25A 4QFPA 3T9HB 4OFLA 4M1VA 3TKDA 5DEXB 1I69A 1MQJA 3IB1A 4EXLA 4QSDA 4LZ7A 1OIBA 3IX1A 3ZSFA 4I1DA 1O64A 1B2HA 5CMCA 4MLQA 1VE4A 5ELVA 1Y3NA 5ITPA 4MH5A 1B7UA 5DTBA 5HM4B 2D5WA 3FV1A 3KBRA 5KDTA 3C33A 3OEMA 2XXYA 2XXQA 2GH9A 1UIVA 4FATA 3TCGA 4IO5A 3MVZA 4DIGA 1QKAA 4QRZA 1R6ZA 2H9BA 3S9MC 4F29A 3TCFA 5B7DA 3LSXA 1EZ9A 3K6XA 2O6AA 3IO6A 3K4UA 1B05A 5CRYA 3QAXA 5KCJA 2RCBA 5DVJA 3KOSA 3D4CA 1P1NA 5L8DA 4JWYA 5M2VA 2R9JA 4GLIA 3CI8A 1OMPA 4DE8A 3KG2A 4Q30B 2RC8A 2GRVA 3MVWA 4ESWA 2ALUA 1TFDA 3USDA 4OTEA 4C1TA 3LSLA 3TQLA 2F36A 5CM6A 3VV5A 2ABHA 1LFGA 1JW1A 4YMBA 4WEDA 2P0SA 5F1QA 1QUIA 5DVFA 4BDOA 3CFXA 5EHSA 4WXJA 4TLMB 5FHNA 1B9JA 3TTKA 3RNNA 4BDMA 3MPKA 5DEXA 3VVEA 1OVTA 4F31B 2QS3A 3I5OA 3PUWE 3BBRA 3UP9A 4G8HA 3PUYE 1B7HA 3Q29A 2QJEA 4GL8A 4ESXA 1MDP1 2ZNSA 5L9MA 4MF3A 3FIRA 3KZGA 4PP0A 4WEPA 1LAXA 1ZTYA 4I9DA 4UACA 3GLBA 3HHGA 2V25A 3ZKKA 1VFDA 4R9GA 3IJXB 2F7AA 4RPOA 3OELA 1MDQA 4LZ5A 2QSXA 4HTGA 2QS4A 1B5JA 4L17A 1MY1A 3PU5A 5AE4A 2ONKE 2VGQA 4MLVA 4QFLA 4XIGQ 1URGA 3PPPA 2F78A 4ZDMA 3MPLA 4OENA 2PMSA 1PEBA 3GZGA 4X1BA 1S50A 3SEXA 4HS7A 4DZ1A 3IJOB 3OEKA 5TP9B 4ZEBA 3SKPA 2XXTA 3MP8A 1NNPA 1ZKBA 3MWBA 4ZZEA 2CMOA 5IKBA 1P99A 3QIMA 3LSWA 1CB6A 2Z8EA 3VLVA 4WKMA 1D3KA 4R6HA 3CIJA 1B3HA 1AOVA 2QS2A 1FQFA 4QF9A 3OO9A 4NEDA 2ONRA 3T22A 4PFYA 2DP8A 1LSTA 1NH7A 2HQ0A 3DLNA 1O7TA 3A3CA 4O3CA 3GBBA 3MJNA 3S9EA 3CVGA 1LCFA 2DS9A 4KQPA 1PDAA 3K01A 4PFWA 4NWDA 4PQJA 3M3LA 2UVGA 4G68C 1IEJA 3DELB 2I4BA 3G3JA 2R71A 3ODBA 2REGA 4YB5A 3MVYA 1SI0A 2Z8FA 3M3KA 4OZ9A 4POXA 3C32A 5ICQA 3VE1B 5DVIA 4PFTA 3THIA 2NUVA 1XC1A 3GBAA 5ITOA 3DP4A 4NTLA 2QPQA 2D3IA 3CSBA 3QUFA 3TELA 1AMFA 4FORA 2ZMBA 3OO7A 1JW5A 2I58A 2F8DA 1Z7NE 4RNSA 4QSEA 1MXWA 1O63A 3MP1A 2AIXA 4XTCQ 3MBPA 1PB9A 4OERA 1LGBC 1MM7A 2I0CA 4FAJA 4R2BA 2P2AA 1LAHE 5TP9A 2DOJA 2V93A 4JSOA 2VD2A 2AYSA 4BDRA 1DPPA 4ZEKA 3TODA 3IL1B 4F3PA 2PBWA 4RPNA 1AL3A 3CG3A 3H6TA 3KOTA 1FTKA 4BDLA 3V5AA 4OMBA 1MQGA 1MH4A 3MUQA 1B5IA 1HSLA 5LOMA 1B3FA 3U94A 3V8XB 4EQBA 5BWJA 4QFNA 1BTJA 3KJTA 2OCUA 1Q35A 3G3IA 4KR5A 4H5FA 1D9YA 3C4MA 1IXGA 1XHYA 3PPRA 3DM0A 1FW0A 4OFJA 1B6HA 4R6YA 3O66A 4ECFA 1EU8A 4DLDA 4U21A 3FXRA 1D9VA 4ZEFA 1P1UA 3RY3A 3R26A 4R75A 1B52A 2REJA 2THIA 3PUXE 1MM6A 1NKXA 3OOAA 2X26A 1IXCA 1A8FA 4GL0A 1B7ZA 1Y4TA 4RYAA 4F3BA 4YKPA 3ILTB 1BLFA 5AA3A 4RJZA 1OVBA 2ONSA 4OESA 3JYRA 2V3QA 3T9XB 1MY0A 2RC7A 4FEDA 1JNFA 4PE5B 1FQCA 4NF6B 3CR9A 1WDNA 4ELOA 4GIZA 2I3WA 5K2YA 4R6KA 3EPEA 3JV9A 1PC3A 1TT1A 1BP5A 1N7WA 4F3SA 3TUSA 3U92A 3W9VA 3QK6A 3QYTA 1N04A 3FJ7A 5CBRA 4EUOA 3R7XA 3HPIA 1B1XA 4TLLB 3KSJA 4EF2A 2B3BA 5I59B 4GVOA 1NMUA 3VVDA 4XKQA 4HW8A 5DYHA 4OVJA 1SW2A 4N6PA 2WKYA 4P11A 2H4IA 1MRPA 4OQOA 1HSEA 1D4NA 3RTFB 1PB7A 1IIWA 1Q1KA 3BFTA 4BDNA 2DE2A 2ZNTA 5I57B 3TTNA 1AH5A 4F1UA 5I58B 3N94A 1MY3A 2DWAA 5AA2A 3ECRA 3OO8A 2Y7IA 3MC2A 4R73A 2QRYA 1VFEA 4EXKA 2O51A 1A7LA 4U1ZA 3TEPA 2QMXA 3VXCA 4LONB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YCJA 1RDXA 4IGTA 3RPLB 3QUJA 3KSXA 4PE3A 3U93A 1LBYA 1DCUA 1NNFA 1SVXB 3K00A 3O2AA 2UVHA 5ICTA 4ZEIA 3RQTA 4H65A 1LB9A 3TFLA 4ELPA 4N8GA 4RXLA 3PMXA 2FA7A 1YXIA 4PFBA 4YAHX 1N84A 3HO7A 2GHBA 3FGSA 4X04A 3Q26A 4O3AA 4PAKA 1FPIA 3FXBA 1LBCA 2UVIA 3KC1A 3TDJA 3RGYA 5IAIA 2XHDA 5AA4B 1FPFA 5I59A 4DDDA 2VHAA 3HHFA 5CMKA 2QVVA 3FXQA 1JEUA 2F7CA 4IB2A 4MEVA 4Q8RA 4LQ5A 2CZIA 4F1YA 2Y7KA 4RY1A 1NI9A 2XXKA 5IZ3A 2AL5A 1MXXA 1FPLA 1R1NA 3EHTA 2IA4A 5AA2D 1K9ZA 4OVTA 1XVYA 3OD7A 3UA8A 5L9SA 1QJMA 2B3FA 3RYDA 4U4SA 1MXVA 4GOTA 1DSNA 1J1NA 4C0RA 5F7VA 4P3LA 2A5TB 3IB0A 2CZLA 3K6WA 4R2FA 5I57A 2QL3A 3VFJA 2XXXA 4UA8A 4YB7A 5I58A 1H76A 3E78A 1YTVA 3SESA 3H4ZA 3S9NC 1QW0A 2PYYA 4I40A 3O28A 4GWWA 1H44A 4KYDA 4RK9A 3T9VA 3IO4A 4E0WA 3MP6A 1Y20A 2XA5A 4LA9A 4E0XA 1RDYA 2F97A 1I6QA 1L5TA 2ZZWA 2ESNA 5HBCA 4YKKA 2B65A 2RINA 1IMFA 3RPLA 3SEWA 2O69A 2O84X 4QSCA 5H8FB 1OQHA 1B0HA 2DQVA 3PMWA 3FASA 3UIFA 3A29A 2OWSA 4DXCA 2HXRA 2VD3A 1CE2A 4MIJA 3WAFA 2Q74A 4H45A 1SW4A 5I2NB 1MS7A 1OLAA 1NUZA 4LATA 2DWIA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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