4FE8A

Crystal structure of htt36q3h-ex1-x1-c1(alpha)
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
402
structure length
402
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQQQQQHQHQHQQQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Huntingtin
publication title Beta conformation of polyglutamine track revealed by a crystal structure of Huntingtin N-terminal region with insertion of three histidine residues.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli (strain k12)
total genus 120
structure length 402
sequence length 402
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fe8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fe8A02
2UVHA 4IO4A 3TQWA 1B9JA 5F7VA 4DXCA 2O1LA 1IXCA 4OHNA 4PFUA 2ZNTA 1IEJA 3HHGA 5I2NA 3VLWA 4Q5TA 5H8HB 3D4CA 1NH8A 5ICTA 2V93A 3RT6B 2AIXA 3PPNA 1P1OA 3LR1A 4EXLA 1BKAA 2XXUA 1DPPA 5AA2B 5CMCA 4EDPA 2F36A 3PU5A 4U23A 1PB9A 1ELJA 4H65A 4KYDA 4R2FA 3C4MA 4Q30B 4AB6A 3KN8A 3DLNA 1ZKBA 5KCJA 4U4XA 2ZYNA 3I3VA 1IUDA 1QUKA 3H6TA 3OO6A 1H43A 5I2NB 1FTKA 5FTIA 3R26A 5DVIA 2Q2AA 4QSEA 1R9LA 4ZEFA 5CMMA 3ZSFA 4DDDA 1OQGA 4R75A 1OIBA 5AA3A 3FD3A 3WAFA 5EHMA 4F1YA 1YTVA 4GWOA 1QVSA 3B6TA 3RLFE 4H5GA 1DTGA 1NL5A 1FTOA 4JWOA 4XKNA 1LSTA 3O6IA 2RINA 3T66A 3HSTA 1H76A 3TELA 3K6XA 2R71A 1QJMA 2ALUA 1NMUA 3MZ9A 3QK6A 5CBRA 3EHSA 1B32A 1MPDA 4ESXA 3LBSA 3A09A 2Y84A 3ILUB 3MWBA 5KCJB 1POY1 3EN3A 3PPOA 1OLCA 4KFQA 1MDQA 4YB7A 4OESA 1I6QA 4DXUA 2QJEA 1NKXA 3VLVA 2VOZA 2I4CA 4RPNA 1AL3A 3QUJA 2I58A 3V5AA 4ZEKA 1MY0A 2OBGA 1D4NA 1MS7A 2DOJA 3CR9A 4M4GA 4NF4A 1MY3A 4QSDA 4JSOA 3RUMA 3VXBA 1LCFA 3FXQA 3TTKA 2FNCA 2YJPA 4QF9A 1AOVA 3Q27A 2DE3A 3C31A 1UTHA 3AXFA 3G7WA 1BLFA 3CVGA 2ESNA 5M2VA 3TTLA 3TDJA 2H4IA 1XT8A 3DP4A 3RPWA 2RC9A 3SEYA 1J1NA 4Q0CA 3KJ7A 3EHUA 5TP9A 4KPTA 4XKPA 4U1ZA 3A3UA 2XXTA 4R74A 1Y1ZA 4K3FA 3RTWB 1DTZA 3TTRA 1BTJA 3PUVE 5H8NA 4GIZA 3TPAA 3L6GA 4OWDA 2Y7RA 1QUIA 3C32A 3PUXE 5AA2D 1JNFA 3T9XB 4ELPA 3EPEA 4QHQA 2OWTA 5TPAA 4QFKA 2Y7WA 4JSDA 3T9UA 3BFTA 3H7MA 4NF4B 3MZBA 2NOOA 3OELA 1ZLQA 3R7XA 1O64A 2DVZA 4F29A 1UTHB 3C33A 1LGBC 3IB2A 4LVQA 2D21A 3KSJA 2W7YA 3MVZA 4ESWA 2FA7A 1LFGA 4GXAA 2Q2CA 2OWSA 1S7YA 3O6HA 1JETA 3PUZE 1B3GA 5TP9B 1JW4A 2P1SA 1FQAA 1MXZA 3FXRA 4POWA 1QKBA 1SBPA 3KN3A 5ELVA 3ODBA 1US4A 4WEPA 3CRBA 4N13A 1H45A 1D3KA 3IJOB 2ZYKA 5TPAB 2GFEA 4LATA 3IAZA 1N84A 4EUOA 2PT2A 2GHAA 3TKDA 1FQBA 3SEXA 2A5SA 2B3BA 3KN7A 3TCGA 3U8QA 2LAOA 4DLDA 4GXSB 1US5A 1GGGA 4N6PA 1A54A 4TLLB 1RKMA 1EZPA 2E1SA 4GRKA 1B40A 1PDAA 3TMGA 3W9WA 3U94A 4C1UA 3PPPA 4G8HA 1IZ1A 4RY1A 3OEKA 3HV1A 4ZEDA 1L5TA 2DYXA 4E0XA 1OMPA 4G68A 4X48A 3DELB 5B70A 1BIYA 2D5WA 2Z8FA 2F6PA 4XXUA 1LLSA 3IO4A 1LAGE 3U72A 2Q8JA 2G93A 3CI8A 4ZDMA 2UVGA 3T22A 3PD8A 3FJGA 4IY5A 2ZNUA 2F97A 2A5TA 5DEXA 3UORA 1Y1MA 1SDXA 1SYIA 3UGWA 3O2AA 1PC3A 1QKAA 1KWHA 2F7CA 2M8CA 4ECFA 3Q25A 1M5EA 5I57A 3N5LA 1GV8A 1MQJA 1Y3PA 2IEEA 3OOAA 2GHBA 4U4SA 4G68B 1VFDA 2HQ0A 3OO7A 1MRPA 5I84A 2UVIA 1JEUA 3BKIB 3KOSA 2XXYA 3TTNA 2PMSA 3ECRA 2HZKA 2OZZA 3TZAA 4IO5A 3FJMA 3PMVA 4G8MA 4LZ5A 1B7HA 3GLBA 4Z7EA 5DEXB 1USYE 4ELOA 4FAJA 2XX8A 4IO6A 1Y4CA 4KCDA 4G68C 4G8NA 3M8UA 4GF8A 4H5FA 4OZ9A 2V3QA 3MBPA 4WXJA 4X9TA 3H6VA 3ZS6A 4KYSA 4NWDA 1A8EA 5I57B 5DT6A 1A40A 4MLQA 2Y7IA 3VVEA 3Q29A 3UN6A 2DQVA 4G2ZA 3IOTA 2NUVA 3V8XB 3IORA 3BBRA 4H1XA 2RC8A 5CM6A 4OQOA 3FASA 3FXUA 2F7BA 2ZYMA 3LC8A 1GVCA 1R6ZA 3C35A 4KD5A 1B7UA 4MFIA 3KJTA 5HPQA 3R6UA 1URDA 1NNPA 2QMWA 3HCQA 3IK6B 2THIA 1MH4A 3KFMA 4JDFA 2XXQA 1H3DA 3HO7A 3DP6A 2AYSA 2Z22A 3PUWE 4DXBA 1SQYA 4AQ4A 3MJNA 3TODA 2DWJA 3U92A 3O28A 2R6GE 3RY3A 4JWYA 1SW2A 5AA4A 3EQ1A 4O3AA 1FQDA 2O1MA 1B6HA 1P1UA 3FIRA 1B05A 3M3LA 3MPLA 3ONMA 4OEVA 3S9MC 3MVYA 1FTJA 2H98A 3RT8A 4E0WA 1PBQA 4LUBA 1NNKA 4IO2A 3V83A 1P1NA 2HAUA 1B3EA 1B7ZA 1CB6A 5L9OA 1Y9UA 4DZ1A 1N3WA 3UP9A 4R6HA 4ND9A 4IGRA 4BDQA 2H99A 2KLFA 3BFUA 3SEVA 2DVCA 2XXRA 4F19A 5H8FA 1I6AA 5AA4B 2HFBA 3M3KA 4C0RA 4YU0A 4R9FA 3T93B 1MPCA 5EHSA 3IL1B 4OTEA 4QRZA 2UVJA 4FJPA 2QPQA 2F6GA 4FATA 1DPEA 1SW5A 1B2HA 4IB2A 4I9DA 3CSGA 3TTMA 2H5YA 3K6UA 2QRYA 2RC7A 2D3IA 4THIA 3SERA 3MP1A 2ANJA 2Z23A 1SI0A 4NF6A 4OFOA 4MLVA 2UXAA 3KSXA 2V3TA 3OENA 3K02A 1VR5A 1ATGA 4I62A 1LBBA 5H8FB 3RNNA 3B7DA 3V89B 5DVJA 5FHMA 1P1WA 1OQHA 2F78A 4O3BA 4LZ8A 2XXWA 1BP5A 2CZLA 2QS4A 3Q26A 5IKBA 2FYIA 2R9JA 2QMXA 3MAMA 3UIFA 5CMBA 3FV2A 4NWCA 3DM0A 4U21A 5CI5A 1MH3A 1SI1A 4P0GA 3IOVA 1A8FA 4U1OA 3K0VA 3K1NA 4MF3A 4FIMA 2I0BA 4U2RA 4G77A 3TCHA 2RCAA 2OCUA 3LSFB 5DYHA 4NF6B 1IQ7A 2PT1A 2QS3A 3N6TA 2CMOA 2P2AA 1LAHE 3K00A 4P0IA 3CFZA 3FATA 4H6DA 1EU8A 3B6QA 4HCYA 2Y7PA 1DSNA 5J1DA 3CFLA 3T9HB 4F3PA 2VGQA 4R72A 1JQFA 3C9HA 5TU0A 3MP6A 5KZTA 3K4UA 3USDA 1JW5A 1LCTA 2HZLA 4KYEA 4DCXA 4TOZA 2I6EA 4FE8A 2XX7A 1VSOA 1R1NA 3VFJA 4F31B 3FJ7A 4GLIA 3CG1A 4P11A 2HCAA 5H8NB 3M3FA 3PUYE 4F1UA 1N3XA 3CIJA 2QS1A 3PPRA 4YMBA 3VXCA 4HCWA 1YPNA 3DP8A 3GZGA 3IOWA 1MY2A 4F39A 1MQIA 3SESA 4JXIA 2F8DA 4OERA 4ZZEA 1PEBA 5A5XA 4NTLA 4I8CA 2PX1A 4N07A 4H67A 1GTKA 5I58A 3ZKLA 4ONYA 5CMKA 2F34A 4HS7A 3G3HA 2DE2A 2GRVA 1MQHA 4EF1A 1QUJA 1MQDA 3PMWA 4POXA 4OMBA 1I69A 3KBRA 2YLNA 5L9MA 3HN0A 3LSWA 3KZGA 3FVOA 1LFIA 1MG1A 3T9VA 1Y3QA 3EHTA 1S50A 2DSFA 1MXVA 1R9QA 2ZYOA 1FTMA 5ISUA 1HSEA 1EZ9A 3C34A 4GQOA 1SD3A 2QSXA 1Y4TA 1M5BA 2HAVA 1B4ZA 4Z0IA 4WKMA 3K6VA 5I56A 5A5XB 4PFTA 3PGFA 3E9XA 2G29A 3OXNA 5K2XA 5I58B 3PV0E 4YMAA 2X7PA 2XXIA 2Q89A 1O63A 2ZNSA 2XXPA 5JTYA 4DCYA 2E0SA 4EXKA 4BDOA 2PBWA 1Y20A 4RYAA 1OLAA 3H6WA 4HW8A 1B0LA 4ELQA 1B58A 1RYOA 4G4PA 4KCCA 2QL3A 2DP8A 4H0WA 1NH7A 3QXMA 5DVFA 3IOUA 1UQWA 2O7UA 4GL0A 2B3FA 4LA9A 4OFJA 2A5TB 2HXWA 3G3JA 1LAXA 2XX9A 1ZTYA 1MPBA 1MY1A 1II5A 4YKKA 1TT1A 4GVOA 5I56B 3OSRA 1GR2A 3G3KA 3K6WA 4LZ7A 4JWXA 4QFNA 4HTGA 4RA1A 5JTYB 4U22A 3S4UA 4NE4A 3A3CA 1MDP1 5EYFA 1XVXA 1TWYA 4YICA 1NNFA 4L17A 3TUSA 1UIVA 2XXHA 2Y7KA 2NVUB 2V84A 1M5DA 1LBCA 4LQ2A 3OMBA 1B1HA 1UTBA 4F2QA 2IA4A 4OETA 3JZJA 4C1TA 4QFOA 4NF8A 2OK2A 4RNSA 2RCBA 2V25A 4PETA 4BDLA 1SW4A 2NWJA 3FVKA 2ABHA 2H9BA 3U93A 3T96B 3L6HA 5DTBA 3OSQA 3KEIA 3H6UA 1VFEA 5CC2A 4YZZA 4KHZE 4FEBA 3IR1A 5AA1A 4X1DA 3K1PA 5LOMA 2P0SA 1LFHA 2NXOA 2O51A 1P1QA 5CBSA 5JEIA 4LP2B 3E4RA 4GFRA 4LONB 1IXIA 4QFLA 4MH5A 3RN8A 4R6YA 2OJTA 4XKRA 4GL8A 3THIA 1UTBB 1B3LA 3CSBA 1A99A 3G3IA 1URGA 3D4GA 4NF8B 3GBBA 3OO9A 4BDNA 4ZZAA 4EQ9A 4FEDA 2VD2A 3MVXA 4XKQA 1B3FA 3FGSA 4PFWA 3GXAA 2RKMA 3S9NC 5ITPA 5BWJA 3RTFB 1Z7ME 3PPQA 4EF2A 5I59A 1ZMGA 1B0HA 1Q35A 1N7WA 4XIGQ 3I6VA 3N94A 4OENA 4H8IA 2I0CA 3JYRA 1WODA 5F1QA 3VLUA 2AL4A 3HPIA 1ZJLA 4BLAA 3VVDA 2ONSA 4FORA 3S2VA 3LSXA 2I48A 4BDMA 4IY6A 4LQ5A 2Z8EA 1B1XA 1WDNA 3OO8A 3JV9A 1LB8A 2I4BA 3QAXA 2DWHA 4R2BA 1B52A 4RJZA 1JVYA 3G3GA 3WAEA 4F3BA 3RGYA 4XTCQ 1MXWA 1HSLA 1NNTA 1QULA 2DXRA 1OVBA 2ONKE 1XS5A 4R6KA 3K1MA 3RQTA 5I59B 1UIUA 4ZEBA 1ZU0A 4RXLA 1MXUA 2XD3A 1HSJA 4F18A 1FQCA 1VE4A 3VDFA 2DE4A 1JEVA 4OYVA 3W9VA 1FCKA 3KOTA 3QSLA 4UA8A 3ZKKA 2AL5A 3W15C 5ITOA 1S9TA 3H06B 4TLMB 3N6UA 4ZE8A 1NFTA 2F35A 2VD3A 1QW0A 4PQJA 4PP0A 1B5JA 3MPKA 2REJA 1N76A 1LAFE 5AE4A 3KGCA 1B3HA 3U1OA 3FVGA 1D9VA 4FECA 1USYH 4YKJA 2BJJX 4AB5A 4IO7A 4F3GA 1N7XA 1EH3A 3O29A 4ZE9A 1TFAA 1B51A 4EQ7A 3S9EA 1ZIUA 4GD5A 3F11A 4OXVA 5L9SA 1SVXB 3TFLA 3TEPA 1TXFA 3C36A 3KG2A 1ZBMA 4WEDA 1B46A 2DWAA 1AH5A 1Z7NE 4OFLA 2DXYA 3IO6A 4YKIA 3O6GA 4QSCA 3S9LC 2GH9A 5FTHA 1YAEA 4MBPA 4R9GA 3TCFA 2QS2A 1N0TA 4JB7A 4YAHX 5BUUA 3QYTA 4ISUA 1A7LA 1JW1A 1PBPA 4R73A 4F3SA 1RYXA 1CE2A 5H8QA 3IB1A 5KDTA 2RF1A 4NF5A 3MC2A 4IGTA 2O7IA 4GOTA 1Q1KA 4RK2A 3MW0A 1IXHA 2XXXA 5L8DA 1XOCA 1AMFA 3I5OA 3K01A 1F9BA 2V3UA 1DMBA 3MVWA 1YCJA 3N26A 5FHOA 5K2YA 1D9YA 2UYEA 3TAJA 1OVTA 3IB0A 2YPNA 1A55A 2PYYA 1FTLA 3H03A 4QFPA 1PB8A 1I6BA 2Q9TA 3TYHA 3Q28A 1MXYA 3FV1A 4UACA 3O97A 4YKPA 5CRYA 2REGA 1IIWA 3E13X 4ZS9A 2I3VA 2X26A 3OD7A 4M1VA 3CFXA 4ZECA 2F5XA 5H8QB 5KDTB 4NF5B 1POTA 2WKYA 1FQFA 3SDFA 1IITA 2OLBA 1O7TA 3FUZA 2UYFA 1IXGA 1SW1A 3MUQA 3IJXB 3OEMA 2DS9A 4DE8A 4ELRA 1SYHA 3SKPA 4TQUQ 3TQLA 4KQPA 1LB9A 1URSA 1B5HA 4F2OA 2DWIA 1ANFA 1FW0A 2O69A 3E3KA 4I1DA 3P7IA 3UA8A 3EF7A 2O84X 2VHAA 1AIVA 4F1VA 2PVUA 1TFDA 4DIGA 2B65A 1M5CA 3B6WA 3QUFA 3H3GA 1MM7A 3MZ1A 4NEDA 3SEUA 3FVNA 3LSLA 4PFYA 5JK4A 4OEUA 3MQ9A 5I2KA 4YB5A 1B5IA 4F22A 1B4HA 2ONRA 1M5FA 2ZXTA 4Q8RA 2XD2A 3VE1B 4PE5B 4IO3A 4RK9A 2ZMBA 1DOTA 3HHFA 5IAIA 2XXVA 4OVJA 4ZEIA 4KR5A 2HEUA 1H44A 2F7AA 3PD9A 4JBZA 1XVYA 4YB6A 1P99A 1MXXA 1T0KA 5FHNA 4NMYA 5H8SA 3QIMA 1N04A 3VV5A 3SEWA 1FQEA 3SETA 5B7DA 5H8HA 1XHYA 2I49A 2Z8DA 4KI0E 4H8JA 3PMXA 3LUYA 5I2KB 2H25A 2Q88A 5ICQA 2O68A 1MY4A 2XHDA 3O66A 1WVJA 2O6AA 1JVXA 1Y3NA 3VVFA 1MQGA 4EQBA 3ILTB 1XC1A 3K2DA 3O9PA 3MP8A 3G3FA 1PB7A 3GBAA 5HBCA 5AA2A 3H4ZA 2VP1A 3FZVA 3CG3A 3UK4A 2I3WA 3IX1A 4O3CA 4X1BA 1MM6A 4BDRA 4RPOA 1EZOA 5HM4B 2X7QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NAPA 2UVHA 4IO4A 4NG7A 3TQWA 4PCDA 1B9JA 5F7VA 4DXCA 2O1LA 1FBEA 1IXCA 4OHNA 4PFUA 4PDDA 2F3BA 2ZNTA 1IEJA 3HHGA 4PFRA 5I2NA 3VLWA 4Q5TA 5H8HB 3D4CA 1NH8A 2HHMA 5ICTA 2V93A 3RT6B 2AIXA 3PPNA 4O7MA 1P1OA 3LR1A 4EXLA 1BKAA 2XXUA 4N4UA 2ZZWA 1DPPA 5AA2B 1BK4A 4XFEA 5CMCA 4EDPA 2F36A 4MX6A 3PU5A 4U23A 1PB9A 1ELJA 4PBQA 4H65A 5FBPA 4JVIA 4KYDA 5ET7A 4MCOA 4R2FA 3C4MA 4Q30B 4AB6A 1EYKA 3KN8A 3DLNA 1ZKBA 5KCJA 4U4XA 2ZYNA 3I3VA 2XWOA 1IUDA 4GBVA 1NV4A 1QUKA 3H6TA 3OO6A 3KBZA 1H43A 5I2NB 1FTKA 5FTIA 2CEYA 1FJ9A 3R26A 5DVIA 2Q2AA 4QSEA 4N81A 1R9LA 4ZEFA 5CMMA 3ZSFA 4DDDA 1OQGA 1RDYA 4R75A 1OIBA 5AA3A 3FD3A 3WAFA 5IZ1A 5EHMA 4F1YA 1YTVA 4GWOA 4P3LA 1QVSA 4GBWA 3B6TA 3RLFE 1Q9DA 4H5GA 1DTGA 1NL5A 1FTOA 4JWOA 4XKNA 1LSTA 3O6IA 2RINA 3T66A 3HSTA 1H76A 3TELA 1FBPA 2P3NA 2R71A 3K6XA 1QJMA 2ALUA 1NMUA 3MZ9A 3QK6A 4PAIA 5CBRA 3EHSA 1B32A 1MPDA 4HE2A 4ESXA 1NV1A 3LBSA 3A09A 2Y84A 2R8TA 3ILUB 3MWBA 5KCJB 1POY1 4N91A 3EN3A 1NUWA 4JVDA 2VPOA 3CHGA 3PPOA 1OLCA 4KFQA 1MDQA 4YB7A 5ET8A 4OESA 1I6QA 4DXUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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