4FEBA

Crystal structure of htt36q3h-ex1-x1-c2(beta)
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
402
structure length
402
Chain Sequence
b'KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQQQQQHQHQHQQQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Beta conformation of polyglutamine track revealed by a crystal structure of Huntingtin N-terminal region with insertion of three histidine residues.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Huntingtin
source organism Escherichia coli o157:h7
molecule tags Signaling protein
total genus 124
structure length 402
sequence length 402
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4febA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4febA02
1A7LA 4HW8A 3M8UA 1USYE 4F1UA 4ZE8A 3W15C 2DWJA 5DT6A 4H6DA 1MXWA 3AXFA 3RPWA 1SDXA 1L5TA 2XD2A 3D4CA 3TELA 3KN7A 3M3LA 3MVXA 1OIBA 3SEYA 1YPNA 3C4MA 3FVNA 3B7DA 2ZYMA 3DM0A 1I6BA 1LB9A 2O7IA 4DIGA 4PETA 1IEJA 5L9OA 4KCDA 1D3KA 1VE4A 3G7WA 1ZU0A 3N6UA 4H8IA 4R6KA 1RYXA 1ZIUA 3TCHA 4G68C 3N94A 4U2RA 2REGA 4NF5A 4U4SA 3MVZA 1AOVA 4F19A 1FQAA 1US5A 1Y4TA 3O6GA 3PPOA 4PQJA 4MH5A 5I56A 3K2DA 3IB1A 2Q88A 5EHMA 4YB6A 3QXMA 4GWOA 1Q35A 3U93A 3CSGA 5ELVA 3K0VA 3CFLA 1FQCA 1S50A 3M3KA 2YPNA 1LLSA 1A8EA 4EQ7A 1M5FA 2DXRA 1OVTA 5JTYA 1SVXB 1UTHA 1LAGE 1A55A 1P1NA 3FVKA 3PGFA 1B0HA 1MQIA 1QKBA 2XXQA 2DWIA 1PBPA 4ZZAA 3V89B 2OWSA 4AB5A 1KWHA 3Q27A 2OCUA 2RCAA 4JB7A 4C1UA 1MH3A 3LSFB 2F35A 3N6TA 5KZTA 3K6UA 3MPKA 3BFUA 3IO6A 1F9BA 1P1UA 2I3VA 4RK2A 1VFDA 2CMOA 2NXOA 3MP6A 4U1OA 4Q0CA 4U1ZA 2D5WA 3FJMA 2A5TA 5H8NA 4LP2B 1XC1A 4LA9A 4IY6A 3UA8A 3N5LA 1B3EA 1JVXA 3A3UA 3U92A 3FV1A 4YAHX 2Z23A 1BLFA 4UA8A 1SW5A 2F6PA 4ELOA 4F22A 5TPAA 4BDOA 3IO4A 5H8HA 3VVFA 4QFLA 3C35A 3MVWA 4BDNA 1NNFA 1NNPA 1DPPA 3VE1B 4QSDA 1MM6A 3OEKA 5ISUA 5L8DA 3KG2A 3G3IA 2Q8JA 3CFZA 2ZNUA 3IL1B 3O6IA 2O6AA 1NL5A 1D9VA 2HAVA 3UN6A 3GXAA 2Z8EA 4ZS9A 2HFBA 4ELRA 1SYHA 3E13X 5I57B 5DEXB 3F11A 5I58B 2Z8FA 2ANJA 2DXYA 2Q2CA 2I58A 3PMWA 2XXYA 5JEIA 1PB7A 1MY2A 4G8NA 4X1BA 1DOTA 1IZ1A 1Y3PA 3B6QA 3G3HA 5CBSA 2AIXA 3I5OA 1MDQA 3G3GA 4NF8A 2AL4A 3LSXA 1XOCA 2Z22A 1FQBA 4JSOA 1ZLQA 4NF6B 4XIGQ 3K6WA 3OO8A 3LSWA 3ZKLA 2RKMA 1H44A 4RK9A 2QRYA 4M1VA 2OK2A 2GFEA 2H4IA 4E0WA 4OEVA 2D21A 3UIFA 2R71A 2QS3A 2XXVA 4ZEIA 4OENA 1Z7NE 1Q1KA 4KFQA 3H7MA 1LBCA 2I48A 2RC9A 1D4NA 1XVXA 4MF3A 2O68A 2XXPA 5M2VA 2DE3A 2LAOA 3ONMA 2Y7PA 2UYFA 2I0BA 3G3JA 2RF1A 2OJTA 3FGSA 5DTBA 4IO5A 2G93A 4RJZA 5I59A 4IO6A 3PUYE 3EPEA 5LOMA 2QL3A 1PDAA 3GBAA 1JW4A 1JEVA 4IO3A 2B65A 2HCAA 2V3QA 4OETA 1SQYA 1H3DA 1JQFA 2CZLA 1YTVA 4LZ5A 3OO6A 3SEVA 4EQBA 1H76A 1CB6A 4OQOA 4X1DA 2FNCA 4NF5B 2PBWA 1LSTA 1MY1A 4KPTA 3QAXA 3S9MC 4R9GA 1SW2A 2NWJA 3VV5A 1MDP1 2XX9A 3O2AA 1FTMA 2GHBA 1MPDA 4LONB 4ELPA 2BJJX 4JBZA 2G29A 3S2VA 3DP4A 3FJGA 1WODA 4WKMA 3O97A 4QSEA 1M5EA 4ELQA 3LUYA 3SKPA 1S9TA 2DWAA 1N04A 3T22A 3W9WA 5JTYB 1MY0A 1UTHB 4XXUA 3CSBA 4H5GA 3RQTA 5B70A 1XVYA 1BIYA 4TLLB 3K01A 2VP1A 4OXVA 2XXRA 2RC7A 2PT2A 4L17A 3UK4A 2ZXTA 4H1XA 4NE4A 5TP9A 4G4PA 2QSXA 2F7BA 1B32A 2DS9A 1Y1MA 3VLUA 1LAHE 1SBPA 4HS7A 5L9MA 3MC2A 4XKRA 3VXBA 4BLAA 3MWBA 4FAJA 1N76A 1MXYA 2DQVA 3GBBA 4LQ2A 1SW4A 1EZPA 2ESNA 5AA2D 3L6HA 4N13A 4HTGA 1B51A 2Y7KA 3DP8A 3MQ9A 4R75A 4OFJA 2F36A 2Y7RA 3IOVA 3U94A 2Q2AA 3EQ1A 1AMFA 3S9EA 3FXUA 3KBRA 3PUZE 2A5TB 5H8NB 5HPQA 1MXUA 3MAMA 3I6VA 3TTLA 1B58A 1LCTA 4U21A 1QULA 3K6VA 2E1SA 5AA4A 3IJXB 1TFDA 4DZ1A 4JSDA 1S7YA 3S4UA 3E3KA 1SYIA 1B5JA 3H6TA 5TPAB 3DLNA 2ZMBA 5H8HB 4F29A 3Q29A 3HSTA 1PB8A 1A40A 4R2BA 1EZOA 4I9DA 4IO4A 1MQDA 3B6WA 2DOJA 3SETA 3T9UA 1P99A 3RY3A 1QJMA 1B0LA 1DTGA 1YCJA 4ZEFA 4JWXA 2I0CA 1PEBA 1PBQA 3RGYA 3QUJA 4IY5A 1QUJA 3TEPA 3TODA 4GFRA 4Q30B 3IX1A 3ZKKA 1IXIA 1POTA 2UYEA 1FW0A 2ZYNA 1BTJA 2UVIA 4DDDA 1A54A 4YKJA 4RA1A 4RY1A 3JV9A 4R6HA 1JW5A 2NVUB 4QHQA 3KN3A 2F7AA 3KOTA 4YU0A 2B3FA 3M3FA 3H3GA 4NF8B 3MPLA 2X26A 5BWJA 2PX1A 3OSRA 4IB2A 4YB7A 5FHOA 3RNNA 3OD7A 4WEPA 2F6GA 4NF4A 4KHZE 1GVCA 3TPAA 1B3GA 4FECA 5K2YA 1LFIA 4F3GA 3VFJA 4OFOA 2THIA 2VHAA 2F97A 2QS4A 2ONKE 3MBPA 4WXJA 3BFTA 4EXKA 3GZGA 3BKIB 3CI8A 2YLNA 3IOWA 2UVGA 4N07A 2Y7WA 3EN3A 2UVJA 1II5A 3RT6B 1MQHA 1O64A 3K1MA 2NOOA 1N7WA 1IXGA 2QJEA 4E0XA 1IITA 3BBRA 3U1OA 4DCYA 3S9NC 1NFTA 4XKQA 4YMAA 3MZ1A 1FTOA 2R9JA 1AIVA 2NUVA 4F3BA 4UACA 3FVOA 1B5HA 1LBBA 3OOAA 3KJ7A 4LQ5A 4IGTA 4F31B 2Z8DA 1DSNA 2OZZA 3E4RA 3CIJA 3FD3A 4LVQA 3QYTA 1B2HA 3CR9A 4U23A 4OVJA 1YAEA 2F78A 3LC8A 4JWYA 4FATA 4YMBA 1UTBA 3V83A 2HEUA 1N3WA 2V3TA 3ZSFA 3IR1A 5FTIA 1NH7A 1DTZA 3WAFA 4ZEBA 1LAXA 3MJNA 4MLVA 5K2XA 3OEMA 1O7TA 1B52A 4HCYA 3CG1A 1B9JA 4C1TA 1HSEA 2ONRA 3KGCA 4RYAA 4OHNA 1OLCA 1T0KA 3RTFB 3K6XA 4KCCA 2DE2A 5CBRA 3PPQA 2OBGA 4F18A 3VVDA 3SDFA 3H6VA 3G3FA 4ONYA 3PPNA 2I4CA 1QUIA 2YJPA 3CFXA 3KSXA 5TP9B 1NKXA 1B3FA 4F39A 4H0WA 3VDFA 4FIMA 2A5SA 4HCWA 3H6UA 5H8QA 1B05A 1FQDA 2XX8A 1B1HA 1J1NA 2H98A 3B6TA 4POWA 4QSCA 3FASA 1R6ZA 2UXAA 2UVHA 4GIZA 1ELJA 4IO7A 2H99A 4YKIA 4TOZA 3IJOB 4K3FA 4QFKA 2O69A 4OERA 4R72A 2OLBA 1NNTA 2XXWA 1DPEA 5HM4B 2QS2A 2DP8A 4EF2A 4OTEA 4KQPA 2DSFA 5IKBA 3PUXE 2O1LA 4KYSA 2QMXA 4GF8A 3TKDA 1ZKBA 4RNSA 4OESA 3OELA 1N3XA 3FXQA 3TDJA 3MP8A 3T96B 2B3BA 4DCXA 1TXFA 2PYYA 4FORA 4H65A 1TT1A 1LCFA 5DVIA 3USDA 3FATA 1PC3A 3KJTA 1P1QA 1BP5A 3SEWA 3VLWA 4FEDA 4XKPA 1US4A 2H5YA 4DXUA 4RPNA 3Q25A 3KSJA 4G68A 4TQUQ 3OO7A 1AH5A 2XHDA 3CRBA 1VSOA 4YKPA 3JYRA 1R1NA 4NWDA 4R73A 1P1WA 3JZJA 3N26A 2ZYKA 2PMSA 3C9HA 5F1QA 1IXCA 5AA3A 1EZ9A 3EHUA 3QUFA 3W9VA 1R9LA 5I56B 4AB6A 1B6HA 4MBPA 4QFOA 3R26A 5A5XA 2RCBA 4ISUA 3S9LC 1MRPA 4MLQA 1WVJA 3O66A 4F2QA 3C34A 2Y7IA 3OO9A 4NF4B 3K1NA 3U8QA 1LFGA 4EXLA 1A8FA 2DVCA 3THIA 1BKAA 2XX7A 4G8HA 3ODBA 3O9PA 3H06B 4U22A 4KYDA 4R6YA 2V93A 4OFLA 1B7HA 5DEXA 5HBCA 5I58A 4FJPA 1ANFA 3VXCA 3HO7A 1ZBMA 3RUMA 3HN0A 4R9FA 3TTKA 1SI0A 2I49A 5CMMA 4ZE9A 3RLFE 4F3SA 3IAZA 1B4ZA 2AL5A 2AYSA 3TAJA 4YB5A 1ZJLA 3KOSA 3KFMA 1URSA 4O3CA 1N0TA 1EH3A 5ITPA 3PMXA 3SERA 1MY3A 3PMVA 4LATA 1UIUA 4EF1A 2HAUA 3RTWB 3KN8A 1IUDA 5CMBA 4LZ8A 3IK6B 5I84A 3FIRA 1LAFE 5IAIA 2DVZA 1PB9A 2D3IA 3P7IA 2I4BA 4BDQA 3EF7A 1D9YA 1RYOA 4NTLA 1B7UA 1IXHA 1UTBB 2VD3A 1Y1ZA 5FHNA 3HPIA 3RN8A 3QIMA 1SD3A 1VR5A 1OMPA 3IB2A 4ZEKA 1JVYA 1MY4A 3T66A 4PP0A 2HQ0A 1XT8A 4P0GA 4OWDA 4YKKA 1ZTYA 2OWTA 4GOTA 3TQWA 1HSJA 2ALUA 1B7ZA 3FJ7A 4PFWA 1P1OA 1I6QA 2IA4A 3IORA 3UORA 1OQHA 4BDRA 2WKYA 1Z7ME 4AQ4A 2R6GE 3ECRA 3LR1A 2DE4A 4JDFA 2X7QA 3T9XB 4LZ7A 2F5XA 5I2KA 5KCJA 1FTLA 2XXUA 3TTMA 3PD9A 1LGBC 3L6GA 1B3LA 4OZ9A 1LFHA 5AE4A 1NH8A 3G3KA 4I8CA 1FTJA 3OSQA 3OMBA 1M5DA 3DELB 1SI1A 3T93B 5H8FA 3I3VA 3O28A 4BDMA 5H8QB 3HCQA 4XTCQ 1POY1 1WDNA 5CC2A 1FCKA 1FQFA 5AA2A 5EHSA 1Y3NA 3GLBA 2O51A 1MXZA 3K02A 4O3BA 3FUZA 1SW1A 4C0RA 4GVOA 5ICTA 1MPCA 3U72A 4Z0IA 3FZVA 1LB8A 3KZGA 4GXSB 4ZEDA 1OVBA 1JNFA 2KLFA 4DXCA 4RPOA 5KDTA 5I2NA 5AA1A 3C33A 5CMCA 2P1SA 4FE8A 2REJA 2QMWA 2GRVA 3C32A 2V25A 1B40A 4WEDA 5L9SA 4ESXA 5I59B 3SESA 4U4XA 3R6UA 3O6HA 1H43A 3TMGA 4EDPA 3H03A 4X9TA 4XKNA 2HZLA 3VLVA 1EU8A 4QRZA 3PUWE 1JEUA 4G68B 3HV1A 3C36A 4KD5A 4YZZA 1MG1A 1GTKA 2GHAA 1I6AA 3TCGA 5CMKA 4MFIA 3WAEA 3MVYA 1IQ7A 3IOUA 3UGWA 1JW1A 4YICA 3UP9A 3RT8A 4POXA 4ZZEA 4ZDMA 1MH4A 2QPQA 5CI5A 1GGGA 4FEBA 3EHTA 4KYEA 3ZS6A 4H8JA 5A5XB 3PD8A 1ATGA 3Q28A 2XXHA 1FTKA 1QW0A 1DMBA 2HXWA 4Q5TA 2ABHA 3MP1A 2XD3A 3SEXA 4F1VA 3ILTB 3CVGA 4ECFA 4QFNA 1NMUA 1MQJA 3CG3A 1MXXA 4NMYA 4OEUA 4EUOA 3H6WA 1M5CA 1QVSA 3KEIA 5BUUA 5B7DA 1B4HA 1RKMA 4N6PA 4BDLA 5H8SA 1MQGA 3TFLA 1TFAA 4EQ9A 2M8CA 2Q9TA 3V5AA 1VFEA 3PV0E 2Y84A 4NWCA 4R2FA 1ZMGA 5ITOA 3MUQA 3PUVE 1Y4CA 4F1YA 2F8DA 1B46A 3TYHA 2X7PA 3K4UA 2P2AA 1USYH 1FQEA 1B3HA 2ZNSA 3DP6A 2QS1A 2XXTA 2ZNTA 4KI0E 4H5FA 5JK4A 4H67A 4GD5A 4IO2A 1A99A 1IIWA 2IEEA 3V8XB 1B1XA 5AA4B 3A3CA 5J1DA 2H25A 4THIA 1UIVA 2O7UA 2ZYOA 4I62A 1HSLA 2HZKA 4P0IA 1AL3A 4NEDA 3PU5A 3TCFA 2V3UA 1I69A 3LSLA 4ND9A 2W7YA 4P11A 4PFUA 4PFYA 5EYFA 4PFTA 3OXNA 1QKAA 2F34A 1OLAA 2VOZA 1CE2A 2RINA 3QSLA 1OQGA 2P0SA 2VD2A 3T9VA 2XXIA 5CRYA 1MPBA 4LUBA 3IB0A 2F7CA 3PPRA 1NNKA 4O3AA 1JETA 4KR5A 5DVJA 4JWOA 3FVGA 2FYIA 3PPPA 3ILUB 5FHMA 4R74A 5I2KB 5KCJB 2DYXA 1URGA 2I6EA 1H45A 1TWYA 1O63A 3MZ9A 2GH9A 3K00A 3D4GA 2H9BA 4X48A 4GXAA 1GV8A 4I1DA 1MS7A 4G2ZA 1N84A 1Y9UA 5H8FB 3SEUA 5CM6A 4GL0A 4QF9A 1GR2A 3E9XA 3FXRA 3TZAA 5AA2B 3TTNA 4PE5B 3HHFA 3TTRA 4GLIA 3EHSA 3R7XA 1B5IA 5I57A 4OYVA 4GRKA 1N7XA 1Y3QA 3H4ZA 3TUSA 3C31A 1XHYA 3O29A 4ESWA 3LBSA 3T9HB 4QFPA 2PVUA 1MM7A 5F7VA 1UQWA 2FA7A 3MW0A 1MXVA 1QUKA 4M4GA 3K1PA 2DWHA 4Z7EA 2V84A 3Q26A 3VVEA 2RC8A 1M5BA 5TU0A 4Q8RA 4NF6A 4RXLA 5KDTB 5I2NB 3MZBA 3HHGA 4ZECA 5DYHA 4DE8A 2O84X 4G77A 1Y20A 4OMBA 1XS5A 4G8MA 4F3PA 2ONSA 3IOTA 4TLMB 1URDA 4DXBA 2E0SA 4GQOA 1R9QA 5ICQA 4JXIA 3A09A 2O1MA 4DLDA 4F2OA 3OENA 2VGQA 4IGRA 5FTHA 2XXXA 5DVFA 2I3WA 4GL8A 3TQLA 2Q89A 3QK6A 2PT1A 3FV2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1A7LA 4HW8A 3M8UA 1JP4A 1USYE 4F1UA 4ZE8A 3W15C 2DWJA 5DT6A 4H6DA 1MXWA 3AXFA 3RPWA 1SDXA 4PFRA 1L5TA 1KA0A 2XD2A 3D4CA 1FTAA 3TELA 3KN7A 3M3LA 3MVXA 1OIBA 3SEYA 1YPNA 3C4MA 3FVNA 3B7DA 2ZYMA 3DM0A 1I6BA 1LB9A 2O7IA 5DW8A 4DIGA 4PETA 1IEJA 5IZ3B 5L9OA 4KCDA 1D3KA 1VE4A 3G7WA 1ZU0A 3N6UA 5EQ9A 4H8IA 4R6KA 1RYXA 1ZIUA 3TCHA 4G68C 3N94A 4U2RA 2REGA 4NF5A 4U4SA 3MVZA 1AOVA 4F19A 1FQAA 1US5A 1Y4TA 3O6GA 3PPOA 3IFCA 4PQJA 4MH5A 5I56A 3K2DA 3IB1A 2Q88A 5EHMA 4YB6A 3QXMA 3BIGA 4GWOA 1Q35A 4KXPA 3U93A 3CSGA 5ELVA 3K0VA 3CFLA 2FBPA 1FQCA 1S50A 3M3KA 1K9YA 2YPNA 3SZPA 1LLSA 1A8EA 4EQ7A 1M5FA 2DXRA 1EYJA 1OVTA 5JTYA 1SVXB 1UTHA 1LAGE 1A55A 1P1NA 3FVKA 3PGFA 4O7MA 1B0HA 4NQ8A 3E78A 1MQIA 4GX6A 1QKBA 2XXQA 2DWIA 1PBPA 4ZZAA 2FVZA 4MAGA 5FBPA 4QXDA 3V89B 2OWSA 4AB5A 1KWHA 4O8MA 3Q27A 2OCUA 4P1LA 2RCAA 4JB7A 4AS5A 4C1UA 1MH3A 3LSFB 4OVPA 2F35A 3N6TA 5KZTA 3K6UA 4NX1A 3MPKA 3BFUA 2CZHA 3IO6A 1F9BA 1P1UA 2I3VA 4RK2A 1VFDA 2B4LA 2CMOA 2NXOA 3MP6A 2P3NA 1AWBA 4U1OA 4Q0CA 1FPIA 4U1ZA 2D5WA 3FJMA 3MYUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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