4FECA

Crystal structure of htt36q3h
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
402
structure length
402
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAMATLEKLMKAFESLKSFQQQQQQQHQHQHQQQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Beta conformation of polyglutamine track revealed by a crystal structure of Huntingtin N-terminal region with insertion of three histidine residues.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Escherichia coli (strain k12)
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein,Huntingtin
total genus 120
structure length 402
sequence length 402
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fecA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4fecA02
5TPAA 3ZS6A 2DQVA 4H5GA 1A8EA 4TQUQ 3N6UA 1JNFA 4XKRA 4R2FA 4M1VA 2HZKA 1XT8A 1TFAA 4E0XA 4ELRA 2HQ0A 1LAGE 4OYVA 3PPRA 2Q9TA 3VVDA 3H6UA 4N6PA 1B4ZA 3UA8A 3QYTA 4QFPA 1DTGA 4ZEBA 3CFLA 1P1UA 1JEVA 4C0RA 4K3FA 1PB9A 2DOJA 4U2RA 3VDFA 1Q35A 2QL3A 1P1WA 4YMBA 3G3HA 2F78A 1XOCA 4OFOA 5CM6A 1VR5A 4DZ1A 3AXFA 3EF7A 2YPNA 5I59A 3FASA 4GVOA 1QUJA 4JSDA 5DTBA 1WODA 5FHOA 3GZGA 2RC7A 1A40A 2NXOA 3H6TA 4BDOA 1EZPA 4UA8A 1I6AA 2QS1A 4PE5B 3ILTB 3U8QA 1JW1A 2FNCA 3IL1B 5LOMA 1LBBA 1A8FA 4U23A 2OZZA 1MQJA 3LSFB 1UTBA 3PUZE 3FVKA 1PBPA 1B0LA 2Y7WA 2HCAA 3TODA 4U4SA 3PPOA 3G3GA 4NTLA 4ESXA 3S9NC 3K4UA 3K2DA 1HSJA 1VSOA 4KR5A 2UVHA 4AB5A 5KCJA 1L5TA 4NF6A 1SW4A 5JTYA 4ZDMA 3VFJA 3TDJA 1B2HA 1ZIUA 3VLWA 5CMCA 3N26A 3D4CA 2UVIA 2AYSA 3QIMA 1FTOA 1B7HA 2GHBA 2XXRA 3TUSA 2O7IA 2ZNUA 1KWHA 3UIFA 5I59B 1MH4A 4EQ9A 1NNFA 2NVUB 1FTLA 1HSLA 3SKPA 5HPQA 4F29A 3Q25A 3A09A 5M2VA 3JZJA 1N04A 1OVBA 4KFQA 3CG1A 4DXBA 1IXIA 1R9QA 1R1NA 1H3DA 1NMUA 5I2NA 2V93A 3TMGA 5HM4B 1N0TA 1UTBB 3IO6A 5H8SA 1EU8A 1II5A 1PB8A 3IB1A 4F18A 4HTGA 4GL0A 3Q28A 1SW1A 1FTJA 3WAEA 1URSA 1B58A 3K1MA 3U94A 1SDXA 4YB6A 2Y7KA 4YKPA 3CVGA 3PUVE 4Z0IA 4R9FA 1OLCA 2X7PA 3MQ9A 3PD9A 5JK4A 4ONYA 4QSEA 3MJNA 1JEUA 5JTYB 2XXIA 3RQTA 1PC3A 1FTKA 2I58A 3UORA 3FATA 2DE3A 4OEVA 3MP1A 3QXMA 3LSLA 1LGBC 1USYH 3W15C 3KJ7A 3H6VA 2XXHA 1JVYA 3KBRA 3S9MC 2Y7IA 1BKAA 4G68A 4WXJA 3O6GA 5DVIA 3LSWA 1QULA 3CR9A 3H6WA 1DTZA 1ZU0A 3PUYE 4RJZA 1TXFA 4G77A 4RXLA 3V8XB 5I2NB 4GF8A 5F1QA 1UTHB 1LAHE 3I6VA 1I6QA 1PB7A 2V25A 2I0BA 3SDFA 3GLBA 1IQ7A 3K6XA 1Y4TA 5BWJA 4JDFA 5DVJA 5TU0A 3OO6A 4LONB 4WEPA 5FTHA 2I3WA 4DCYA 4MLVA 5HBCA 3BBRA 1UQWA 4G8NA 1NNPA 3KSXA 4FIMA 1MH3A 2PBWA 3OO8A 2OK2A 2H98A 1US4A 4LZ8A 3TFLA 4QSDA 1O63A 1B5JA 3TCFA 3HHGA 3RN8A 3OSRA 4P0GA 4G68C 3TEPA 1R9LA 2XXYA 1EH3A 3MVXA 3K01A 3TPAA 2G29A 3MP6A 1N84A 5CBSA 1BIYA 3PPNA 1Y20A 4F3PA 4F3BA 3M3FA 2REGA 2B3FA 2I6EA 3IJOB 5EHSA 5L8DA 2GRVA 1D4NA 4LA9A 3UGWA 3S2VA 4F31B 2I4CA 2RC8A 4YKKA 4F2OA 2I4BA 3B6TA 1A7LA 1LLSA 4IO2A 1B1HA 1USYE 2V3TA 2XXVA 2PYYA 4OENA 2VP1A 2RC9A 2HFBA 3SEUA 2ONKE 4RPNA 2P2AA 3PGFA 3RNNA 3VLUA 4BLAA 4OETA 4NF5A 1XVYA 3OMBA 5AA2A 5I84A 2Z8FA 4YMAA 4OFJA 1B3LA 5CMKA 4WKMA 3ECRA 4KCDA 4IGTA 1RYOA 1B46A 4XXUA 1MQIA 4TLLB 1LAFE 4LP2B 4GRKA 4NF8A 4H5FA 4NEDA 3KGCA 4EXKA 5EHMA 4PFTA 1A54A 4YB5A 5F7VA 4FEBA 3VE1B 4IO4A 1H76A 3USDA 3BFUA 4ZS9A 4YZZA 3TQWA 1B3GA 5K2YA 2ZYKA 4F3SA 1DMBA 3U1OA 1LB9A 4KPTA 5CMBA 5ICQA 3OENA 4LQ5A 1J1NA 3M8UA 4IO5A 1Z7ME 3E3KA 4FEDA 1GV8A 3FGSA 4RK9A 3FJ7A 4NF5B 4QSCA 2QMXA 1PBQA 2DWHA 3E9XA 2H4IA 5AA2B 1POY1 2O51A 5CC2A 2PVUA 3MUQA 1MXUA 3PUWE 2I0CA 3KG2A 3MVYA 3O29A 3EHTA 2E1SA 3K6VA 1QKAA 4R6HA 4NF8B 3LC8A 3TELA 3PD8A 3ZKLA 1Z7NE 2FA7A 3G3JA 1LFHA 2GHAA 2F35A 1N7WA 3FXUA 4ELQA 3U72A 1P1NA 4O3CA 4EUOA 3SETA 2DSFA 3WAFA 5EYFA 4QFKA 3PV0E 2O84X 3OSQA 1B3FA 2W7YA 2GH9A 4DDDA 3G3IA 5TP9B 4GQOA 1SW2A 2XX7A 3QK6A 3SESA 3TYHA 2O69A 1MY1A 3FD3A 3VVFA 3Q27A 1IXGA 2Q88A 4DE8A 4GOTA 2HZLA 3FVNA 2VGQA 3SEWA 4EF2A 3MBPA 5DVFA 2XXQA 1VFDA 3ONMA 3C9HA 4OXVA 1BTJA 3IX1A 4PFYA 2HEUA 3CIJA 4LZ7A 3THIA 5B7DA 4F2QA 3EPEA 1WVJA 3MWBA 3ILUB 4MFIA 3UK4A 1H45A 3VLVA 1SBPA 3CRBA 3TZAA 3TTRA 4I8CA 4L17A 3FJMA 3EN3A 3H03A 4Z7EA 3C34A 4ZE8A 2B65A 4I1DA 4IB2A 3O66A 2NWJA 2QJEA 4EDPA 3HSTA 3RTFB 3H7MA 3OELA 3OO9A 1UIVA 3CI8A 4OZ9A 1OMPA 3RT6B 1QJMA 1B40A 5DYHA 1H43A 5CBRA 1S50A 3G7WA 2H9BA 3DELB 3BKIB 3FXQA 3D4GA 4TOZA 4HW8A 4R74A 4OESA 3QAXA 3G3FA 1P99A 4OEUA 3F11A 2Q89A 4FECA 3N5LA 5ITPA 3S9EA 5H8QA 2OLBA 3T93B 3PUXE 4R6YA 3KN3A 2IEEA 3ZSFA 1XVXA 3MAMA 4Q8RA 1UTHA 2O1LA 2HAUA 4F1VA 4IGRA 4U4XA 1XHYA 4R72A 5BUUA 1LBCA 1OIBA 4ND9A 5AA2D 3P7IA 4RA1A 1WDNA 2Q8JA 4BDMA 1AL3A 4PP0A 2F34A 5L9OA 3FXRA 3IAZA 1VFEA 3PPQA 4JSOA 1MM6A 2I3VA 1OVTA 1IZ1A 1MDQA 3LBSA 1B4HA 5ISUA 3IORA 3IOTA 3PMXA 5ICTA 1MXWA 3W9VA 1QVSA 2Z23A 4G8HA 4JWXA 2HAVA 1SI1A 3ODBA 3ZKKA 4FATA 2UXAA 3KSJA 2H25A 1B6HA 1NNTA 1FQBA 1AMFA 4GFRA 2DXRA 1FCKA 1D9YA 2OWTA 5H8QB 2X26A 4OWDA 3C32A 1ZMGA 4RNSA 2RCBA 1B3EA 3K1NA 3O9PA 4O3AA 4OHNA 4PETA 3TTKA 1D3KA 2REJA 5FHMA 1Y1ZA 2E0SA 3MW0A 4GXAA 3CFZA 4FORA 4N07A 2X7QA 3E4RA 3RPWA 1VE4A 1M5FA 1JVXA 4R75A 4XTCQ 3E13X 2ZYNA 5CRYA 3RLFE 1MM7A 2A5TA 2QSXA 2DE2A 3OD7A 4NE4A 4OTEA 3Q29A 1NNKA 3MVWA 2VD2A 4GXSB 2LAOA 1HSEA 2NOOA 4DXCA 1US5A 3K02A 3FZVA 3TCHA 1AH5A 2OWSA 1M5EA 1MPCA 1TFDA 2QPQA 1ZJLA 4GD5A 3HCQA 2O6AA 4LUBA 4EQBA 3CG3A 1NH8A 3PMWA 1FQAA 3S9LC 1OLAA 1M5BA 1FQFA 1H44A 3LR1A 4R2BA 2F7AA 3K6WA 2XXUA 3R6UA 1B32A 3K00A 4OVJA 1POTA 2ZMBA 2DP8A 2RKMA 3M3LA 3TCGA 4P11A 3MVZA 5I56A 3HHFA 2BJJX 3UP9A 2XXTA 3MZ1A 1PDAA 2V84A 2ONRA 3CSGA 3K0VA 3R26A 3O2AA 2A5TB 1FQCA 2P0SA 4IO6A 4ELPA 5B70A 2R71A 5IAIA 4UACA 4HCYA 1Y3PA 1LFIA 2V3QA 3RY3A 2CZLA 2HXWA 1URGA 5DT6A 4QHQA 5J1DA 1MY0A 3DP4A 4LQ2A 1AIVA 4EF1A 4F39A 3FV2A 1P1QA 4JWYA 2H99A 3OEMA 5AA1A 1JETA 4BDQA 2M8CA 3V83A 1QW0A 1Y4CA 3MPLA 2VHAA 1IUDA 4I62A 2A5SA 2V3UA 1Y3NA 4QFLA 1QUKA 2XX9A 3FJGA 5H8NA 1M5DA 1ZLQA 5I56B 1A55A 4YKJA 3SEYA 1TWYA 3A3CA 4ZEDA 1CB6A 3JYRA 1EZOA 1EZ9A 1T0KA 4HS7A 3TQLA 5I58B 1MY2A 4F1UA 2XXWA 1R6ZA 3TKDA 1B7ZA 1ANFA 5TP9A 1ELJA 1DPEA 2AL4A 4H0WA 1QKBA 1CE2A 4OFLA 2VD3A 3O97A 3VXBA 3N94A 2RINA 3C33A 3RTWB 1LSTA 4IY6A 4KYSA 4X9TA 4IY5A 3IOVA 4YAHX 3L6GA 4POXA 1QUIA 3IR1A 2QRYA 3O28A 3HN0A 4H1XA 4G4PA 1LCFA 4H67A 2DS9A 3H4ZA 3RUMA 3RGYA 3IO4A 2PMSA 3DP8A 2D21A 4YB7A 1I6BA 3QSLA 1B5HA 1O7TA 5IKBA 1ZBMA 1SQYA 4R6KA 2DWAA 3U92A 5H8NB 5DEXB 1B5IA 1NFTA 2ABHA 5FTIA 1UIUA 2FYIA 4KI0E 3VXCA 3S4UA 5K2XA 2B3BA 1S7YA 3IOUA 1GVCA 2F7CA 4DLDA 4Q5TA 4X48A 4BDLA 2F6PA 2O1MA 3M3KA 5I57B 4KYDA 2IA4A 4G8MA 1IXHA 2ZNSA 4XKPA 1Y1MA 4QFOA 1SI0A 3SEVA 4RK2A 1FW0A 4DCXA 3FIRA 2RCAA 1B05A 2ALUA 4LATA 3CSBA 1ZKBA 5ITOA 4R73A 2DVCA 1YCJA 2WKYA 3A3UA 5AA4A 4F3GA 1YAEA 3FVGA 1NH7A 5TPAB 4KQPA 3T9UA 1IEJA 2ONSA 1RYXA 3SEXA 3T66A 1MY3A 4OQOA 4ZEKA 2Q2AA 2R6GE 4ESWA 1GR2A 2GFEA 5KDTA 4H65A 1B0HA 2YLNA 2DE4A 4ZE9A 3VVEA 1Y9UA 4XKQA 1P1OA 1FQDA 4QFNA 4PFWA 2AL5A 3PPPA 4IO3A 1TT1A 1B3HA 1MXYA 1URDA 1FQEA 2VOZA 2O7UA 1BLFA 3B6QA 1MQHA 4MF3A 2OBGA 1LFGA 3LUYA 3L6HA 2DWJA 3DM0A 1JW5A 4FE8A 1BP5A 2F6GA 3KFMA 3IJXB 3I3VA 2THIA 3N6TA 5AA4B 3KZGA 4GWOA 1OQGA 2RF1A 4YICA 1YPNA 4NWDA 1B51A 2OCUA 3HO7A 3GBAA 2XHDA 4LZ5A 1SW5A 4ECFA 3SERA 1GTKA 1N7XA 4Q0CA 1GGGA 4JWOA 4PQJA 4YKIA 4U1ZA 4DIGA 5KDTB 1B52A 4C1TA 2Y7PA 4O3BA 4MBPA 4FAJA 4THIA 3EHSA 3TTMA 2XX8A 3JV9A 3B6WA 1SYIA 5KCJB 4NF6B 5CI5A 1N3WA 3T96B 4M4GA 3T9VA 1IITA 3G3KA 3KN7A 4AB6A 4C1UA 3C4MA 2Z8EA 3MZ9A 1ZTYA 2KLFA 2R9JA 1MS7A 3HV1A 4KD5A 3GBBA 1A99A 2QS4A 2PT1A 2I49A 4EXLA 4BDNA 1I69A 2G93A 4N13A 3K1PA 1LAXA 3IB2A 2Z8DA 2F5XA 1Q1KA 2ZYOA 4AQ4A 1D9VA 5KZTA 1ATGA 4U22A 5H8HA 4F1YA 1N3XA 4H6DA 5I2KA 2I48A 4X1DA 1MQGA 4JB7A 3T22A 1MXXA 2XXPA 1JQFA 1F9BA 3UN6A 4WEDA 2XD3A 4MLQA 1MG1A 2ESNA 3MP8A 2D3IA 1MRPA 1MY4A 2DWIA 4TLMB 3T9HB 2ANJA 3IK6B 4JXIA 5AE4A 2F36A 5JEIA 3R7XA 2PX1A 1PEBA 4H8IA 1NKXA 5H8FA 3VV5A 4QF9A 3W9WA 3O6HA 3EHUA 4G68B 4XIGQ 1IIWA 1O64A 4ZZEA 1DPPA 2OJTA 1Y3QA 4EQ7A 4F19A 1OQHA 5A5XA 1B7UA 3TTNA 5ELVA 3KN8A 3T9XB 3U93A 3OEKA 3V5AA 2ZNTA 1SYHA 3KOTA 3OXNA 4X1BA 4KYEA 3DP6A 3V89B 5H8HB 2DVZA 3GXAA 4G2ZA 3QUJA 3KEIA 3O6IA 4MH5A 1MXZA 5I2KB 5I58A 4P0IA 4NF4A 2AIXA 3KOSA 4JBZA 1MPDA 3MZBA 4IO7A 2DYXA 3FUZA 5CMMA 3C35A 3Q26A 1IXCA 1YTVA 4H8JA 4RY1A 2DXYA 5L9SA 2QS3A 4HCWA 2UYFA 3MC2A 1RKMA 3HPIA 1MXVA 3OOAA 4ZEIA 2Y84A 5H8FB 4OERA 1MPBA 2F97A 1N76A 3K6UA 1LCTA 3EQ1A 1NL5A 2XXXA 2QMWA 5AA3A 1FTMA 1S9TA 4GL8A 4LVQA 2QS2A 3FV1A 1M5CA 3BFTA 5A5XB 4ISUA 4YU0A 4U1OA 3RT8A 1MDP1 2PT2A 5DEXA 2P1SA 4ZEFA 2Q2CA 2ZYMA 2CMOA 2XD2A 4R9GA 1DSNA 1B1XA 2O68A 2UVGA 4RYAA 4U21A 4NF4B 4KHZE 1AOVA 5I57A 4RPOA 2D5WA 3C31A 3TTLA 3IB0A 3C36A 2Z22A 3I5OA 1DOTA 1SD3A 2F8DA 4NWCA 4XKNA 2H5YA 2ZXTA 3LSXA 5FHNA 4GLIA 1JW4A 3FVOA 4OMBA 3MPKA 4E0WA 4GIZA 4PFUA 1XS5A 1MQDA 3PMVA 4FJPA 3CFXA 4KCCA 3H06B 4Q30B 3QUFA 2YJPA 3TAJA 1B9JA 3KJTA 2Y7RA 2UYEA 5L9MA 4QRZA 2UVJA 3B7DA 1SVXB 1XC1A 4I9DA 4NMYA 1LB8A 3H3GA 2F7BA 4ZZAA 4ELOA 4POWA 4DXUA 3PU5A 3OO7A 4ZECA 4BDRA 4F22A 2NUVA 3DLNA 3IOWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5TPAA 3ZS6A 2DQVA 4H5GA 1A8EA 4TQUQ 2MKZA 3N6UA 1JNFA 4XKRA 4R2FA 4M1VA 2HZKA 1XT8A 1TFAA 4E0XA 4ELRA 1FPJA 1FJ6A 2HQ0A 1LAGE 4OYVA 4I3EA 3PPRA 2Q9TA 3VVDA 3H6UA 4N6PA 1B4ZA 3UA8A 1FJ9A 2Y5LA 3B8BA 3QYTA 5IZ3B 4HE2A 4QFPA 1DTGA 4ZEBA 3CFLA 1P1UA 1JEVA 1VDWA 3FXBA 4C0RA 4K3FA 3T0JA 1PB9A 2DOJA 4GX3A 4U2RA 3VDFA 1Q35A 2QL3A 1P1WA 4YMBA 3G3HA 4I40A 2F78A 1XOCA 1XI6A 4OFOA 5CM6A 1VR5A 4DZ1A 3AXFA 5ET8A 3EF7A 5EYGA 2YPNA 5I59A 3FASA 4GVOA 1QUJA 4JSDA 5DTBA 1WODA 5FHOA 3GZGA 4O7MA 2RC7A 1A40A 2NXOA 3H6TA 4BDOA 1EZPA 4P1LA 4UA8A 1I6AA 2QS1A 4PE5B 2OX3A 3ILTB 3U8QA 1JW1A 2L5VA 2FNCA 3IL1B 5LOMA 1LBBA 1A8FA 4U23A 2OZZA 1FBFA 1KZ8A 4JVIA 1MQJA 3LSFB 1UTBA 4HE0A 4PE3A 3PUZE 3FVKA 1PBPA 1B0LA 2Y7WA 2HCAA 3TODA 4U4SA 3PPOA 1FBGA 3G3GA 4NTLA 4ESXA 1NV0A 2FIEA 3S9NC 3K4UA 3K2DA 5ET7A 4UABA 1HSJA 1VSOA 4KR5A 2UVHA 4AB5A 5KCJA 1L5TA 4NF6A 1SW4A 5JTYA 4ZDMA 3VFJA 3TDJA 1B2HA 1ZIUA 2FVZA 3VLWA 5CMCA 3N26A 3D4CA 2UVIA 2AYSA 5ESYA 3QIMA 1FTOA 4O7IA 1B7HA 2GHBA 2XXRA 3TUSA 2O7IA 2ZNUA 1KWHA 3UIFA 5I59B 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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