4FHA | Genus

Total Genus 105

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	105
sequence length	310
structure length	306
Chain Sequence	SYQDLKECKIITAFITPFHEDGSINFDAIPALIEHLLAHHTDGILLAGTTAESPTLTHDEELELFAAVQKVVNGRVPLIAGVGTNDTRDSIEFVKEVAEFGGFAAGLAIVPYYNKPSQEGMYQHFKAIADASDLPIIIYNIPGRVVVELTPETMLRLADHPNIIGVECTSLANMAYLIEHKPEEFLIYTGEDGDAFHAMNLGADGVISVASHTNGDEMHEMFTAIAESDMKKAAAIQRKFIPKVNALFSYPSPAPVKAILNYMGFEAGPTRLPLVPAPEEDVKRIIKVVVDGDYEATVTGVLRPDY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure, Function, Stability and Knockout Phenotype of Dihydrodipicolinate Synthase from Streptococcus pneumoniae rcsb
molecule keywords	Dihydrodipicolinate synthase
molecule tags	Lyase
source organism	Streptococcus pneumoniae
total genus	105
structure length	306
sequence length	310
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.2.1.52: Transferred entry: 4.3.3.7.
pdb deposition date	2012-06-06

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4fhaA00

3S1WA 1MEIA 3STGA 1IXQA 1EX5A 3PWAA 4QIUA 5C2XA 1R2RA 3MYPA 4NT0A 4HNUA 3PG8A 2E6AA 4RZ4A 3DFOA 4UTWC 1ZAJA 3H54A 3QSRA 4FNTA 3VI2A 4Q32A 3CIXA 4GJ1A 2Z6IA 1RR2A 2BSLA 1R46A 2W6RA 4UNLA 3HB9A 4NJIA 5HR7A 4IMFA 4WXYA 2ABAA 1F2JA 1VH7A 3WFAA 1YYAA 1ZALA 1QR7A 2G5WA 3PR2A 2YW4A 4O28A 1A5AA 3THAA 1TQXA 5CZ0A 4HKPA 3CB8A 2P10A 1FQ0A 3NO5A 3W2MA 1JUBA 4R53A 5E93A 1KM1A 1LRNA 1TRIA 1O5XA 1ICQA 1F5ZA 3W1LA 1EWDA 3UNDA 5TQLA 5D04C 4UFJA 4UR7A 2RH9A 1R30A 1G69A 1SZFA 3QRHA 5KZEA 5FF2A 3PAJA 1G7VA 3W7RA 4LOCA 3PC0A 3NQFA 4UTMA 1K8ZA 1VJIA 2VFEA 1WA3A 4E38A 5G2WA 3BLFA 4QISA 3M41A 2WKJA 4MLRA 4NXKA 3MMTA 1K8YA 3O6YX 1PVNA 1TPC1 2A7RA 3UWYA 3EX3A 4QM1A 5AC6A 2CZFA 4EOUA 4FO4A 2C13A 4S2BA 1Z42A 3BGJA 1YTDA 4JTFA 4NJKA 4WY0F 4WXZA 3E0IA 1KFCA 3CTLA 3CEUA 4AWUA 2Y89A 2R14A 4PEKA 3C0JA 3S5YA 2CZ5A 5K4ZA 1YXCA 3P74A 3L9CA 4NUWA 1O95A 1P4CA 1TQJA 4DPPA 2FB3A 3LXBA 4LS1A 4JTUA 1FDJA 3LI0A 1TPDA 2E68A 5A5WA 2C3ZA 2Y7EA 4O54A 4XBKA 3M5XA 1I45A 2E5BA 2AGKA 4GXMA 1KM4A 4YLWA 2V2DA 1AG1O 1NF7A 3W74A 1TV7A 4IPIA 3NGJA 1DQXA 2CLKA 3GX9A 1I8JA 1YPIA 2GVGA 4QJ1A 2C19A 3ABRA 2ZTKA 3SFKA 4WY0B 3LDVA 4MY1A 2ZRWA 5DY3A 5AYZA 1SO5A 4BK9A 1T8XA 3QH2A 3TFXA 1KTBA 5DXXA 4HPJA 2GPTA 3WJSA 2BLEA 3LCIA 2H3DA 3NQGA 3E9AA 2V81A 3HG2A 4QAIA 5CPOA 1OFPA 3QEZA 2X1TA 1OFRA 3W6YA 4TMCA 2NUXA 3NDOA 2HMCA 4KFOA 3HIJA 3PM6A 4K7YA 3DFPA 1YLVA 5C5YA 4BF9A 2VFIA 4WQ6A 1LOLA 1J5TA 2X2GA 2PRLA 3C2OA 3W2JA 2YDAA 1TTQA 3ELFA 4WOQA 1GOXA 2NLIA 3NZRA 1LDCA 2NXIA 4NJHA 4HT3A 3NQ2A 4O10A 3NQVA 3BV4A 3QSTA 3BW4A 2QDHA 4WOZA 1XBVA 4JTIA 3TR2A 1EA0A 3N19B 3STFA 1OFBA 2QCDB 3IIPA 3EB2A 2HS8A 3B05A 5KSWA 5G1YA 1ZHAA 4Y9AA 2Y88A 3W7EA 3LBMA 1FCUA 3L2IA 1XC4A 4MJZA 5CZSA 1DVJA 3O1NA 1QOPA 3TXZA 1W0MA 4QITA 4XKYA 4MY8A 3UYCA 3OBKA 4ML9A 4NJJA 4OU1A 1S5VA 1TIMA 3M43A 5U4NA 1W5QA 2CLFA 4MZYA 1TTPA 1DHPA 4UFLA 4AHOA 2ZZ6A 1J2WA 3DXIA 3GDTA 3LXCA 4N4QA 2YPIA 4PCFA 1B4EA 3U8GA 1GWJA 1F73A 1ME8A 3IGSA 4DO5A 3OVRA 5KITA 5IBXA 4N2YA 4HHPA 1I2NA 1W5NA 3LOTA 4JDYA 1FCQA 4UC5A 4LVDA 4LU0A 4AH7A 4H3DA 5HULA 1LM1A 5D2TA 3M16A 1N8FA 5D03A 2E5CA 4MOZA 4FIRA 1MEHA 1OK6A 3F4WA 4O17A 3UXAA 3IRDA 1YXDA 2J9ZA 3W7HA 3SY5A 3TSMA 3W22A 1ZAHA 5HNRA 7TIMA 1S5TA 2GJNA 3F03K 2WOQA 4O50A 4K8EA 3GR7A 4O4VA 1TB3A 3I68A 2B7OA 4JY8A 1BKSA 3M5VA 1X8FA 4E0CA 1HTIA 3ZFHA 5G1TA 3YPIA 3TQKA 5KINA 5BNKA 5KMYA 3I6RA 4HPXA 5HQEA 3O6DA 1W8SA 3WJXA 4GFSA 1FWSA 3SECA 2QCNA 3W1PA 1F76A 4LTSA 2CLHA 1QWGA 3W76A 2TYSA 3S5ZA 3G1VA 3RFAA 3PSVA 2VEPA 5HWJA 4ZZ9A 2EKCA 1LBMA 2H3BA 3LI1A 4DF1A 1Q6RA 3T7VA 5CZJA 3C3NA 1M6JA 5EPDA 3S6DA 3KVMA 3NQ7A 2X1UA 3O6CA 2AAMA 1BTMA 3HGOA 5L9FA 1F6KA 3PY2A 5IM51 3DI0A 2RFGA 5CKSA 3HJZA 1HO1A 4QSHA 3NQ8A 3EWXA 3QC3A 3BG9A 5AFDA 4JICA 5LNRA 3CHVA 4JX5A 3NVTA 5DCEA 1OFDA 1G67A 1G4TA 3TU9A 5J5RA 5C55A 2QAPA 2YYUA 1A5SA 1TPH1 3GXNA 3PVFA 2Z6JA 2QEZA 2WPBA 3FA5A 2CLOA 1L9WA 4WJEA 1DORA 2YYTA 3STEA 2X30A 4RLIA 3QMTA 1JCYA 2C18A 2JK2A 1ZY9A 5H91A 4M7TA 5I3IA 1QPRA 2H8ZA 1FDYA 3Q94A 3NPVA 1AL7A 4N6EA 2ZZ5A 4UTKA 3UZJA 3KOFA 4G1KA 4K36A 4TU1A 4YWIA 5F2MA 2Y7FA 3LCLA 1RVGA 4IOTA 2Q3RA 3Q37A 4I7UA 2JKPA 3JR2A 1YDVA 1XM3A 2A6LA 3PULA 5D2XA 4GUHA 1QAPA 3DFQA 4HSNA 3TA6A 1VPXA 1GVSA 1H51A 5BMWA 2ZBTA 3IGUA 1NFBA 4N9EA 1WYIA 4KWWA 2ZZ7A 4MIMA 1ZJIA 4GC4A 1GQNA 5FF0A 4X9SA 1TPB1 1T96A 4L4MA 2NZLA 5CPNA 4Z08A 3C2FA 4NXSA 5BRBA 2OCZA 2TRSA 3W1NA 1F6PA 2ZFAA 4ZL1A 1PCKA 3NQAA 5AHEA 3S1XA 3BG5A 4CCCA 3HPSA 5HUPA 2GVJA 3FKKA 1WBHA 5EBUA 4DPQA 3LV6A 5HWMA 2CZEA 1EIXA 2P1FA 3LRMA 2NX1A 4CCEA 2EAWA 4RX0A 1GYLA 3TUUA 3EWBX 2GVLA 3S5NA 4WD0A 4GUGA 1KFBA 3P5ZA 2ZA2A 3I7SA 3T55A 4Z1AA 3R2GA 1GT8A 4U4MA 2C0AA 4OWGA 4K38A 1JVNA 2WSRA 2ALDA 3MI2A 1LLZA 4NJGA 1TMHA 4I7VA 1H7PA 5J5DA 1S3HA 3GDLA 3TNOA 1KBIA 3NAVA 2DU2A 3NR0A 4UNKA 3LCXA 3C61A 3KVKA 4IXHA 4JX6A 5AB3A 5BW6A 1XUZA 1R2SA 3UWVA 2JKAA 3A5VA 1RD5A 1MZHA 4UTWA 3TE9A 5I3JA 1NVMA 3MI3A 1EEPA 1OX4B 2PC4A 4CNPA 2ZRUA 3B0PA 4ZQRA 5HMSA 3LHZA 5KTLA 3ABSA 3ATYA 1H63A 5F2IA 1TTIA 4MZ1A 4AMAA 1HO4A 3VFLA 3O07A 3I7RA 1H7RA 2YZRA 4I9AA 4H6KA 4MYAA 2C6QA 4MVAA 3TV8A 1ONRA 2QF7A 4CQ9A 3UWWA 3OEXA 1FUYA 1ICSA 2G95A 1QPNA 1ZCOA 3M0ZA 5LSMA 4A2RA 3W75A 2QCEA 3SIZA 3MHGA 4KKXA 3IIVA 3G18A 3IVUA 2BX7A 4NNCA 3CEPA 4I7WA 1W3NA 3DFSA 4BI7A 1TO3A 3HGJA 3QQ0A 5AHFA 4JEQA 2FPYA 5EL1A 4AB4A 1WV2A 3E49A 1AL8A 3FFSA 4KWVA 2GQ9A 2ZZ3A 2ZRXA 4FNSA 4LV9A 2VEIA 5AC8A 4DBDA 3W70A 2CW6A 1TTJA 1EP2A 3FIGA 5CG7A 2Y62A 6TIMA 3SZ8A 1LRQA 1PL9A 3N9RA 3NOEA 1J4EA 3W1TA 3QMSA 5K7JA 4FNPA 1LYXA 4JD4A 3ZWTA 4N9DA 1BWKA 3OA3A 5AC7A 1XBXA 3DKLA 3NZ1A 1I2PA 4Z0JA 1WBJA 1U5JA 2QUVA 3EKZA 3MI6A 3NPWA 2V0TA 1UBSA 5E1QA 5CGQA 1W1ZA 5BOOA 3R8RA 4RR4A 3MUXA 4ONVA 4YL2A 1B4KA 4O57A 4AF0B 3FKRA 2ZQ0A 3LHYA 3CM4A 3S8HA 3B0UX 4OGZA 2W0UA 3IIZA 3LLFA 2I14A 3B0VC 1K3UA 3QW3A 1H7NA 3TC7A 1GVRA 5FF7A 3TAOA 5F1VA 4YCOA 3T44A 3IIOA 1JCXA 4WY0A 2RKXA 5G4EA 3GK0A 4RKAA 1KV5A 2QCGA 1ADOA 4W9TA 2NXHA 4HNVA 2EF9A 3PG9A 3W7NA 1L6SA 2QCLA 4AEOA 4UXDA 4Y8FA 2C14A 3W7LA 3BW3A 2Y85A 3SGZA 5CPMA 4IUOA 4XBSA 4NX5A 1EPXA 1B57A 3W7JA 1D3HA 3G1FA 1OYAA 2ZCGA 4RZ5A 3HG4A 3A23A 3QYQA 2F7FA 3GLCA 3G3MA 4FX7A 4ALDA 2X1RA 2CZDA 1TPUA 4DO4A 3S5OA 3GAYA 1B9BA 4S2CA 1PIIA 2Z2UA 1YXYA 5G2IA 3KRUA 4NNBA 4LRSA 3CLMA 2J9YA 3G24A 1P1XA 1R2TA 3OVQA 2O7SA 3HPZA 5CPLA 1H1YA 4FNQA 5D02A 5FF4A 3N14A 3SGUA 2WO5A 3QW4B 3P82A 1RQEA 3W86A 3DKJA 4A21A 4O0ZA 1QO2A 4EVZA 3W87A 2QCDA 5K2ZA 1OVDA 4PL2A 4CQ8A 3NPXA 5I3FA 4NNAA 1T0OA 1VYSX 2QAFA 4UMCA 3M1ZA 3LRLA 3CWOX 1SO3A 3FEMA 4N9BA 3HGRA 4HNTA 1EP1A 5DBTA 1JULA 4BR1A 4CNNA 3HO8A 3RU6A 2YCEA 3QQ1A 3A9IA 4FNUA 1WQ5A 2OMAA 1GG1A 4IGHA 1FX6A 2A4AA 3ABQA 3GB6A 1D3GA 2A1YA 2I1OA 3W7PA 4OHQA 3K30A 3TMLA 5F4WA 2FFCA 1I2OA 1W3TA 2QJHA 2FJKA 1K7EA 1YTEA 4J9JA 1GTEA 3UY8A 3QZEA 4ICNA 1ME9A 1QFEA 4O18A 4UTLA 2V5BA 3N2XA 2VELA 3O8AA 3LB0A 1K7FA 2HTMA 2BTMA 5BMXA 3MHUA 4TX9A 1XDLA 4M6PA 2YGYA 5K9DA 2Z0IA 1SQ7A 1W5OA 3LTYA 3ZR4A 1TPEA 2YFOA 3TCEA 3ABOA 1X6UA 1SSGA 3BLEA 3RMJA 1Z48A 3WJZA 1VCFA 1KM5A 4K37A 3DAQA 2GUUA 3W3OA 1DJNA 4XWUA 3NEVA 3EKLA 4AWSA 1M5WA 4GWEA 4NZJA 3KRZA 1Z44A 3W7QA 1M7OA 3MYOA 3W9ZA 3W1MA 1H60A 5I3KA 3RLVA 2FPVA 4JTGA 1VRDA 4MFEA 3BGGA 3NYZA 5AHNA 4N9CA 2CWNA 2E77A 1G7UA 2J9XA 1MO0A 3W7IA 2JGYA 4KFPA 3W84A 4NU7A 1P0NA 3F4NA 1X1OA 1OHLA 2A0NA 4FX8A 3NL3A 1EUAA 1JR1A 4DEFA 5F2LA 2CLEA 3PUDA 1KM0A 4Y96A 3G1AA 4AVFA 2J24A 1BWLA 3N34A 4LNYA 3PB2A 2DZUA 4IQLA 3W1AA 2EGZA 1Z41A 4YXGA 4JXCA 2DORA 4JNMA 4WZHA 2E1DA 4QQ3A 1YDOA 1YADA 3SI9A 5CSRA 3VE9A 3PBVA 1MSSA 5CZTA 4JYFA 2R94A 1Y0EA 3T4CA 2HSAA 3AJXA 4JS3A 2V5LA 2JBMA 3QPZA 1FY6A 1JRBA 5DCDA 3CT7A 2KZHA 4D2JA 4MYXA 1QOQA 3T40A 4O11A 1Q6LA 3DHFA 1OABA 1DQWA 2V30A 1LRTA 3ZS4A 5K9CA 4DBEA 2BXVA 2Y61A 1TSIA 5AYXA 4A22A 3UXDA 1H61A 5FEWA 2O7QA 1VC4A 1JJKA 1Q3NA 2DZSA 2WNZA 3LHUA 1NSJA 2DP3A 1IIHA 1GVFA 3UWQA 2V9DA 2XFWA 4C1LA 2WJZA 4XZ9A 4Z1CA 5AHIA 1SZNA 2VXNA 3DH7A 3PBUA 4M19A 3PF3A 1UUOA 3G22A 3W1UA 3FJ6A 3I7QA 5D2WA 2V2CA 2E6YA 2NUYA 2ZRYA 3TK7A 2CU0A 4JIQA 3W88A 2NUWA 2QUTA 2Y7DA 1OF6A 1KLZA 3W83A 2PRHA 1G6CA 1KTCA 4KFNA 5GVJA 1XDMA 3MHFA 3QMRA 3GDKA 3LERA 1LZOA 2H8XA 3NL5A 3W1XA 2ISVA 1L6YA 5LNUA 4OV9A 1HUVA 3R89A 4ADTA 4WX2A 1TV8A 4AXKA 1H62A 1JCMP 4OBTA 5DBUA 2J88A 1I2QA 2Y63A 4NX0A 4YCPA 4MUZA 3BLIA 2QJGA 3CC1A 4BWLA 5C54A 2V2HA 4R7JA 3BPWA 2GQ8A 4UTTC 4FNRA 1OYCA 4IWWA 3STCA 4M7SA 2VENA 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3BW2A 4AF0A 4JTSA 4JTJA 1KM3A 1WX0A 1IIGA 4XQ6A 4O4WA 4ZQPA 3OVPA 3CQ0A 4GRSA 2VC6A 2X16A 4O16A 4N02A 1C8VA 1KFEA 4IMGA 1G4EA 2C16A 3TFCA 1CW2A 4X3ZA 3CIWA 4TO8A 3CU2A 2QCMA 3FOKA 1FXQA 3NPUA 2YXGA 2NV1A 3KVLA 2FB2A 3W71A 4DF0A 4R34A 1IXPA 3UQNA 1GYNA 5K9XA 3ZWSA 3GYEA 4EF8A 4OE7A 3L68A 3HQ1A 4O15A 3RK8A 4BFAA 2YW3A 4QNEA 2A85A 3MP4A 3OG3A 3LCWA 1XL9A 3GAKA 5KZDA 2E09A 4UFMA 3GXTA 4B5NA 3B03A 3MBDA 3FYOA 3CPRA 2OT0A 3W2UA 1OX6A 3C4UA 1TV5A 1SSDA 4NQ1A 4O52A 1QNVA 2YSWA 3IIXA 2QJIA 3L5MA 3P67A 1F7BA 3LLDA 2V8ZA 1V7YA 1EWEA 1K03A 4FF7A 5U7SA 1XXXA 1H5YA 4LC8A 1WAUA 4JY9A 1OJXA 3G1SA 4IX0A 2OZ0A 1SUXA 3LCGA 3TDFA 4EWND 4IMEA 4MFDA 3PUEA 1OX5A 1VYRA 5HUOA 1LBLA 4MZ8A 1KM2A 2FDSA 3NQEA 4UFKA 1XI3A 3LV5A 5G4WA 4ADUA 4TMBA 1KLYA 2YX0A 1ZNNA 2CLIA 4S1FA 3LXAA 3VKJA 1EB3A 1KA9F 3EX6A 2ATSA 2NWRA 4PFMA 4LS2A 4N4PA 3QF0A 1LBFA 5L6UA 3VNDA 3NQ6A 2ATMA 1RZMA 3S1VA 5AOUA 3W73A 1XBZA 3GNNA 4PH6A 1IXNA 1LCOA 3IGXA 3Q58A 4IX2A 1MEWA 3W7MA 4FIQA 1OFOA 4CNOA 1I2RA 3KVJA 1ML1A 1DOSA 5DY2A 1AMKA 1W5MA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4FHAA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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