4FSVA

Crystal structure of a heat shock 70kda protein 2 (hspa2) from homo sapiens at 1.80 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
384
structure length
380
Chain Sequence
b'RGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock-related 70 kDa protein 2
publication title Crystal structure of a heat shock 70kDa protein 2 (HSPA2) from Homo sapiens at 1.80 A resolution
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 120
structure length 380
sequence length 384
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4fsvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4fsvA04
3FZHA 2GWKA 4BRPA 3LL3A 1JCGA 3SLCA 3ENHA 4ISEA 2A3ZA 4FOEA 2FSKA 3WQUA 3WXLA 3O80A 4A2BA 4EHTA 4PL7A 3L6QA 4QS8A 5AR0A 2GELA 3O08A 1S3XA 5EY4A 3H46O 4F9OA 3R8EA 1SZ2A 3VF2A 1E4FT 5FPEA 3U4LA 1BA1A 1BG3A 4BR7A 2I7NA 3BEXA 4BRNA 1BA0A 1TUYA 4K41A 5BR9A 1E4GT 2YHXA 3BP8A 3HSCA 4FWQA 3BF3A 2FSJA 4H0YB 4M7YA 2KHOA 2GUPA 2QM1A 4WQ5A 4JD2B 4JN4A 3EZWA 4H5VA 1QHAA 1MWKA 2E1YA 4B1XB 1ATSA 1GLFO 3ATUA 1EQYA 2A41A 2A5XA 2Q36A 2YHYA 4EFHA 4GNIA 3O1WA 4O5FA 2VCPA 2IVNA 2P9LA 3QDKA 3WEEB 1TYQB 4CZLA 4FWLA 5BREA 1WOQA 2WUSA 2YCHA 3RSEA 4CZHA 5AQQA 2QWLA 4BR5A 3R6MA 3CJBA 5AQUA 4GY2B 4H5TA 3TU5A 4B1VA 2CGJA 1ZXOA 3FGUA 5AQOA 4IXCA 3VENA 5AQTA 3ZETB 3D2EB 2OANA 1YAGA 2QWPA 4CZFA 4DHYA 4E1JA 2IVPA 1K8KB 2GTDA 2P9PA 3O5BA 1Y64A 4IJNA 2QWOA 2QW9A 2ZWHA 2F9WA 1DKGD 4BROA 3HTVA 5ADXA 3VEYA 2F9TA 3GE1A 4WQ4A 4FWOA 3VGLA 2PBDA 2Q0UA 5AZIA 3WQTA 5BN9A 4BC3A 2ZGZA 4BQLA 4DQ8A 3WXIA 5KPRA 4MO5A 1QQMA 1BDGA 1XUPO 4BGBA 5AQRA 1NGAA 3ENOA 4MLHA 5BPLA 2PAVA 1YVNA 2H3GX 3AARA 3VERA 2ASOA 2HF4A 3M3ZA 3CJ7A 3UB5A 1DGKN 5LY3A 3C0BA 4PKGA 3FZLA 5AQKA 4H0PA 3CQYA 4IJAA 4FL9A 2V7ZA 1ATRA 3GG4A 5E26A 5AQIA 4CZMA 3A0IX 3FZMA 1LOTB 4HWIA 3FLCO 1ATNA 5AQPA 4BRGA 4FOIA 2QWMA 2E88A 1IJJA 3ATVA 1U2VA 4H5NA 4WQ4C 3VESA 3H1VX 4A62A 4BR4A 3LDLA 2E8AA 1OKJA 5BRFA 4CZIA 4FSVA 2NZTA 4CJ7A 3GDQA 4H0VB 1DEJA 2P9KB 2W41A 3EN9A 2P9IB 5ELZA 2ASPA 3CJ9A 3MN6A 5EOYA 1WUAA 4B1ZA 1CZAN 4JHDB 1MA9B 1J6ZA 1BWFO 3ZEUA 1XC3A 3CJCA 1BO5O 2FF3B 1KAXA 3MN7A 3CIPA 4K42A 4DB3A 4M63C 1NWKA 2W40A 2Q97A 1NGGA 1R59O 4CZJA 3IDHA 3LDQA 4DCHA 1GLCG 2CH5A 4Z94A 1V4TA 3VGKA 2NRHA 4FO0A 3GOIA 5F1XA 4QS7A 4NB4A 3DAWA 2Q31A 3QICA 2P9NA 5AQVA 3SJHA 1T44A 3VPZA 4IZ9A 3C7NA 4BRIA 1NGEA 3CETA 4H0TB 5KQ8A 1BUPA 5AQSA 1GLBG 3O6WA 4IWVA 3MDQA 4BRHA 1HUXA 5TKYA 2Q2RA 2BUPA 2QWRA 4H5WA 3D2FA 5EXWA 1YUWA 3FFKB 2YI1A 1HLUA 3O4WA 3ULEB 5AQJA 3H3OB 3IMXA 4FWPA 1HKGA 4BVOA 3VEXA 5B8HA 1Q18A 4KBOA 4PL8A 3W0LA 4BRLA 3LDPA 3UKRA 3IUCA 3WUHA 4CZGA 2YJEA 4K43A 3W3DA 2HF3A 4XEIA 3RSEB 4A61A 1T6CA 1XQSC 3UKUB 2EWSA 4BC4A 5FPNA 3DWLA 3J8AA 1JCEA 1TYQA 4XH1A 1NGHA 4PKIA 5EVZA 2BTFA 1KAZA 2P9SB 2P9UA 4JNEA 1HJOA 2P9PB 1YXQA 2NLXA 1RDWX 3B8AX 1P8ZA 3LDNA 3EL2A 1SQKA 3A5OC 1HKCA 3ZETA 3D2EA 3VF4A 2E20A 2J4RA 2YJFA 1T6DA 4BQZA 5BN8A 4FWKA 3U9ZA 3O1BA 2I7PA 4XH5A 5F2RA 1Z05A 4FWRA 5BPMA 1HPMA 1GLAG 3H45C 3F9MA 4Y0WA 5AZIB 5AFUA 3FR0A 3CJAA 4CBUA 4J8FA 3IFRA 1NLVA 4FWSA 4RTFD 4RWTA 4H5RA 3HZ6A 4YDUC 1G99A 5BRDA 1H1VA 2UYTA 3AY9A 2E1ZA 2GWJA 4BG9A 2ZGYA 3MN9A 4EAHD 3M1FA 1Z6RA 3WXKA 2AA4A 3QBWA 3U9DA 3DXMA 4H03B 2V51B 1NGJA 5JMVA 3KHYA 2QXLA 3QB0A 5AZJA 2Q1NA 3HM8A 2HMPA 3EKUA 4B1YB 3LM2A 3TPQA 4BC2A 1U2VB 4BRKA 4K25A 3FZKA 3VF6A 3DXKB 3MCPA 1KAYA 4XH4A 1V4SA 3A8YA 3FZFA 1X9JA 3AAPA 3VEZA 4B1UB 4BVPA 4CZEA 5LJVA 4EHUA 5KPTA 5FPDA 2GEMA 3WXJA 4B9QA 3VOVA 4CBWA 1ZC6A 2FSNA 2D0OA 3U8XA 3QFPA 1S22A 2CGLA 2ZF5O 1RGIA 3G25A 4I6MA 1NGIA 4AM7A 3QFUA 4FPBA 4B1WB 4BG8A 3I33A 3ZEUB 3KZBA 1NGCA 2DPNA 4MO4A 3SMPA 1NGBA 3CI5A 1BU6O 5KQDA 5AQWA 4CD1A 5KPZA 4BREA 2IVOA 1NGDA 2AP1A 3OHRA 1HX1A 4HTLA 4JAXA 1GLEG 1TUUA 3EKSA 4LC9B 5I9EB 3MMVA 2P9NB 4BR0A 3CHWA 4FWMA 4H0XB 3UE5A 3C7NB 5AQYA 1NM1A 4ISFA 5AQMA 5CE3A 4BRMA 3R9PA 4JD2A 3VGMA 4CZKA 3ZX2A 3D2FB 4BR9A 3H1QA 4H0OA 2A40A 4BRDA 2E2OA 3O8MA 1NBWA 4YDUA 3M6GA 2QWQA 2ASMA 2FF6A 3L0QA 4BR2A 3MK6A 2P9LB 4BC5A 3ID8A 3P4IA 2D4WA 3CQXA 3HBTA 4RCHA 3H3NO 3UKRB 3ULEA 4QS9A 1BOTO 2A6AA 2FLOA 3WEEA 1NMDA 2Q0RA 4CD3A 1GLLO 1MDUB 3BUZB 3D7EO 1LCUA 5AQHA 1C0FA 1ZBSA 4M7XA 5F0XA 5FPMA 1GLJO 2P9UB 4FPAA 4FWNA 2HOEA 2ITMA 3UKUA 3AAQA 1X3NA 1K8KA 3DJCA 3A5MC 1C0GA 2P9SA 3VEOA 4IO8A 4A2AA 4WQ5C 4CI6A 5AQFA 1MWMA 4BRFA 4L3QA 3CJ1A 3ZX0A 1NGFA 4EIAA 4NO7A 3CERA 4ISGA 5JICA 4MLEA 2CH6A 2V7YA 3H6EA 1QZ5A 4CBXA 3JS6A 1D4XA 1U6ZA 3MN5A 3VETA 5LJWA 1JCFA 1QQOA 5AQZA 2QWNA 2D1KA 3SMSA 5EX5A 3DXMB 2E2QA 3GBTA 5ADXH 3HI0A 3QMLA 5AQGA 1IG8A 4WYBA 3BF1A 4BRCA 4BRAA 3LDOA 2VWBA 5AZJB 4AM6A 3VEWA 4BRQA 2VYPA 3GL1A 3ZX3A 3KVGA 3EO3A 3I8BA 3VEVA 3S41A 3FE1A 4C23A 5BRHA 1GLDG 5AFUH 4BGAA 5JLFA 3JXUA 2A42A 2CGKA 3L4IA 3A5LC 1QZ6A 3A5NC 3QBXA 1QQNA 2FXUA 4O8KA 5JLHA 4PKHA 2IIRA 1ESVA 2E2PA 1X3MA 5E84A 5AQLA 5AQXA 1HKBA 1KXPA 1RFQA 2P9KA 3DXKA 4I6MB 3WT0A 2P9IA 5AQNA 3SK3A 2V52B 2YHWA 3LM9A 1SAZA 4JHDA 2E2NA 5BPNA 2D0PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3I0RA 2KFNA 1B3CA 3CCVN 3LL3A 1JCGA 4FZXC 1KV0A 1B9DA 1EETA 2KYQA 4RW9A 1NH5A 1S9GA 4EHTA 3L6QA 4QS8A 5AR0A 3O08A 2HHUA 5KRTA 1RTDA 5FLXO 5JVGL 3OS0A 1BA1A 2I7NA 3SJJA 4K41A 4BDPA 2NUBA 4XIUA 1X1PA 4G9ZA 4BE7B 3HSCA 2G2KA 3OJSA 1LAWA 4M7YA 4LSNA 4ILGB 4JD2B 4JN4A 4B1XB 3EY1A 3LP0A 2B4JA 3K9JA 3LP2A 3VQBA 1C0TA 4HHFA 1EQYA 2A41A 3AO4A 3HJFA 4PA1A 2Q36A 5C15A 3O1WA 1K8BA 3AA5X 4O5FA 4E7LA 5KGWA 3QERA 3OVNA 1BL3A 4KO0A 4FWLA 1RDCA 4CZHA 3RSEA 1U45A 5AQQA 3H08A 5C42A 1VSIA 5JS1A 4CEFA 1T0ZA 4GY2B 3TU5A 5GAEP 4CECA 5AQOA 4JI3K 5AQTA 3FFIA 3L3VA 1SUQA 1Y64A 4IJNA 4B8CA 1RTIA 3SQ1A 3VEYA 2F9TA 5SWMA 4CIGA 1B9FA 2A1SA 3QNOA 1I6GA 2Q0UA 1OH6A 3KTQA 4DQ8A 5KPRA 3OYKA 4WF9L 4MO5A 1QQMA 4FCYA 1NGAA 3PO4A 2LKBA 2JLEA 2HHSA 3CC2N 2ASOA 2HF4A 3OJUA 4F4KA 3LZIA 1Q82O 3M3ZA 3CJ7A 1DGKN 4CJVA 3C0BA 3ASMA 2E6LA 5AQKA 3CQYA 4KHWA 2F8SA 4DTMA 4DSLA 2KSKA 5E26A 3MXIA 3FZMA 4HWIA 3ZT0A 4A5AA 1T7BA 1WBDA 2QK9A 2IGIA 3FLCO 4FLWA 4FZYA 4C8OA 2QWMA 3E1YA 3OYMA 2E88A 3VQDA 5CZ2A 1U2VA 4H5NA 2O8DB 4CVNE 3RTVA 3B6PA 4YORA 4OKJA 1IBKK 1RT4A 2JWLA 3L2QA 3CFPA 2E8AA 3LPUA 3T19A 5BRFA 4FSVA 2NZTA 3AVIA 3QLHA 1VQON 3NAEA 3CXCM 2P9KB 4HCBA 5M1QA 4DSJA 3MN6A 2OTJN 3A2FA 3VQPA 1J6ZA 4I9LA 4BY9C 1JL2A 2IS3A 3AO2A 4YOYA 3G10A 3CJCA 1KAXA 1L3SA 4K42A 3TR8A 4DQPA 2HHWA 4DV3K 2Q97A 4CZJA 3O3HA 4KH6A 3NF7A 4FJNA 2KZZA 4J2EA 2QXFA 1TKZA 3OBWA 1LAVA 1WSIA 2FBYA 1A5XA 2P9NA 5AQVA 2NRWA 4V19S 2GMOA 3C7NA 4CGIA 3L8BA 1EP4A 3NBPA 1BUPA 1JKZA 4IWVA 4CF2A 2VWKA 1KQSM 3KWIA 1S1UA 1XRSB 1TGOA 3LP1A 5TKYA 1LQQA 4OX9K 4QCLA 5HP1A 3NCIA 4H5WA 1HPZA 1XI1A 4CF0A 4UY8O 2HB5A 4KH4A 2YI1A 1SN1A 1L4VA 3O4WA 3K5MA 1HKGA 3VEXA 1IO2A 2VG6A 4ILJA 3LDPA 2KBHA 4CEBA 4DR6K 1QSLA 3HK2A 3DRPA 2HF3A 3IG1A 5CYMA 3RSEB 4JI7K 1NJZA 4DR2K 4N5SA 1XQSC 3K5LA 4DTUA 3T1YK 2BH1A 3J8AA 4W5RA 1JCEA 4XH1A 4PKIA 2UXBK 2P9SB 2YC1C 2P9UA 2D56A 1TV6A 3PSFA 2XY5A 1RDWX 2YHBA 3LDNA 4LD0A 3SYZA 1U4BA 3ZETA 3D2EA 2O8BB 3HP6A 1T6DA 3C6TA 1ILYA 5F2RA 1U47A 3LZJA 3K9KA 3FR0A 4LSLA 3IAYA 4RWTA 4Z4HA 2LJMA 1NK5A 4YDUC 3MXMA 1H1VA 4B9MA 4E0DA 4M45A 1XNRK 2GWJA 1M90O 4ELUA 3M1FA 1DT9A 4FM1A 3S9HA 3KD5E 3KOWA 3DXMA 2R7YA 1NGJA 2Z1GA 3OYCA 2HMIA 2QXLA 3QB0A 4DV4K 3VMFB 1LWEA 5KK4A 4DR4K 4FYDA 3QI7A 3TPQA 3U6FA 3PUFA 3KP0A 1U2VB 3HPOA 4GV9A 4BRKA 4K25A 2O4GA 3OYNA 1RDAA 3FZKA 1VSJA 4TSXA 5HRRA 3O4NA 3VF6A 3DXKB 4CEDA 1NJYA 3FZFA 1X9JA 3AAPA 4BVPA 5KPTA 4B9QA 4MQ3A 1ZC6A 3U8XA 3OYJA 1WN7A 3TANA 4DF4A 1FW6A 4JYAK 3OS2A 2RKIA 4BG8A 1TAQA 3CMAN 3QIPA 2A7TA 1CXUA 3ZCMA 2HHHK 2UXCK 1TK0A 3NE6A 4CD1A 3T7ZA 3C94A 2RPIA 1VQ9N 1BQNA 2IVOA 1CZ9A 1NGDA 4JRQA 3MEGA 1TUUA 3EKSA 2W6KA 4BDZA 2D0CA 2P9NB 1YJ9N 1N34K 1JL1A 4FWMA 2B5JA 4CFAA 3C7NB 3WNHA 2G8UA 4MDBA 4HTUA 1B7DA 4ISFA 4DG1A 5AQMA 1FK9A 2HNDA 5FDLA 2XY8A 1OH7A 1NKBA 5CE3A 5KGXA 3OS1A 4L8RB 4ZHRA 1P90A 4H8KA 4JV5K 4FJMA 3H1QA 5GAHP 2A40A 2VQFK 5LL6Z 4B9UA 3HYFA 2YIPA 4CHYA 3O8MA 3N4QA 3CW4A 5MLCQ 1JZBA 1NBWA 2Z1IA 3I55N 2QWQA 1WSHA 2FF6A 3DLLL 2BGGA 4B9NA 2LR3A 3SUQA 2N2QA 5DM7L 1TKTA 2D4WA 4LF5K 2WOMA 3H3NO 3F9KA 3ULEA 2HSTA 2A6AA 1MU2A 3V1QA 3D0PA 2Q0RA 1NK0A 1HNIA 2O8EA 4M7XA 4DSFA 1BISA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3I0R A;  2KFN A;  1B3C A;  3CCV N;  3LL3 A;  1JCG A;  4FZX C;  1KV0 A;  1B9D A;  1EET A;  2KYQ A;  4RW9 A;  1NH5 A;  1S9G A;  4EHT A;  3L6Q A;  4QS8 A;  5AR0 A;  3O08 A;  2HHU A;  5KRT A;  1RTD A;  5FLX O;  5JVG L;  3OS0 A;  1BA1 A;  2I7N A;  3SJJ A;  4K41 A;  4BDP A;  2NUB A;  4XIU A;  1X1P A;  4G9Z A;  4BE7 B;  3HSC A;  2G2K A;  3OJS A;  1LAW A;  4M7Y A;  4LSN A;  4ILG B;  4JD2 B;  4JN4 A;  4B1X B;  3EY1 A;  3LP0 A;  2B4J A;  3K9J A;  3LP2 A;  3VQB A;  1C0T A;  4HHF A;  1EQY A;  2A41 A;  3AO4 A;  3HJF A;  4PA1 A;  2Q36 A;  5C15 A;  3O1W A;  1K8B A;  3AA5 X;  4O5F A;  4E7L A;  5KGW A;  3QER A;  3OVN A;  1BL3 A;  4KO0 A;  4FWL A;  1RDC A;  4CZH A;  3RSE A;  1U45 A;  5AQQ A;  3H08 A;  5C42 A;  1VSI A;  5JS1 A;  4CEF A;  1T0Z A;  4GY2 B;  3TU5 A;  5GAE P;  4CEC A;  5AQO A;  4JI3 K;  5AQT A;  3FFI A;  3L3V A;  1SUQ A;  1Y64 A;  4IJN A;  4B8C A;  1RTI A;  3SQ1 A;  3VEY A;  2F9T A;  5SWM A;  4CIG A;  1B9F A;  2A1S A;  3QNO A;  1I6G A;  2Q0U A;  1OH6 A;  3KTQ A;  4DQ8 A;  5KPR A;  3OYK A;  4WF9 L; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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