4FSVA

Crystal structure of a heat shock 70kda protein 2 (hspa2) from homo sapiens at 1.80 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
384
structure length
380
Chain Sequence
RGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a heat shock 70kDa protein 2 (HSPA2) from Homo sapiens at 1.80 A resolution
rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
molecule keywords Heat shock-related 70 kDa protein 2
total genus 120
structure length 380
sequence length 384
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4fsvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4fsvA04
5FPMA 4FWLA 3M3ZA 1NGBA 4AM7A 4Z94A 4FOIA 4CI6A 1X3MA 2IVNA 3LM9A 4AM6A 3A5LC 1GLJO 3EZWA 1NMDA 3F9MA 2P9PA 4FWRA 5E26A 1P8ZA 3GG4A 4BC3A 1JCGA 3CJCA 2OANA 4LC9B 4PKGA 2P9NA 2AP1A 1RGIA 3R8EA 1SAZA 3MN9A 5AQOA 1T44A 1BG3A 3MDQA 1NGCA 5B8HA 3A8YA 4BG9A 3JS6A 3EKSA 4JHDB 1S22A 4M7XA 3LDNA 3L6QA 5BPLA 2Q97A 3ID8A 3CIPA 4CJ7A 3LDQA 3QFPA 1XUPO 3R6MA 4FWNA 5AQJA 1QHAA 1NGDA 4QS8A 3OHRA 4KBOA 3ZEUA 4CZHA 4IXCA 3O08A 4EHTA 2P9SA 3CERA 4J8FA 3I8BA 2NRHA 2I7NA 4FWOA 3UKRA 3VGLA 2QWRA 3WEEA 5AQHA 2P9UB 2A5XA 3AAQA 4QS7A 2P9LA 2P9IA 2E2PA 3DJCA 1KAZA 3GE1A 2BUPA 4FSVA 3IDHA 2D0PA 1BU6O 5ADXH 4JD2B 5AQTA 1HX1A 3KVGA 3QB0A 4BRMA 1NBWA 1QZ6A 2CGJA 2D4WA 2P9KB 2H3GX 3HM8A 4IJAA 4K41A 5ADXA 1NGJA 3C0BA 2QWQA 1GLEG 1Z05A 3O1BA 3DXKA 2E2NA 4MO5A 3HZ6A 2W40A 3MK6A 5AQGA 3ATVA 3AARA 4K42A 5AQNA 1KAYA 3M1FA 3ZX2A 3FZMA 5AQPA 4DCHA 1KAXA 3VEZA 5FPDA 4BR2A 3CQXA 3MMVA 4XH1A 3D7EO 4CD3A 4B1ZA 3ZETB 3CI5A 3L0QA 4A2BA 3H3NO 3H46O 5E84A 3GOIA 3O8MA 3H45C 3VOVA 4CZKA 1HJOA 4CZLA 3H6EA 2E8AA 4O8KA 4H5WA 3CJ7A 1MWKA 2Q2RA 1V4TA 3KHYA 3O1WA 4PL8A 5BR9A 2VCPA 4H0YB 2Q31A 4XEIA 5FPEA 3CJBA 1X9JA 4FPBA 2FF6A 4C23A 3SMSA 5TKYA 3MN7A 1Q18A 1KXPA 3VEYA 3VEOA 4BRHA 3IUCA 4F9OA 4O5FA 1TUYA 5JMVA 3W3DA 5KQDA 4WYBA 3D2FB 4NB4A 5FPNA 4BROA 3HSCA 3LDPA 3EO3A 3TPQA 3GDQA 1Z6RA 4FWKA 3R9PA 5AQIA 1Y64A 3ZX3A 4BR7A 2FF3B 1U6ZA 1YUWA 2E2QA 4WQ5A 4FPAA 1J6ZA 1NGFA 4FL9A 3ENHA 2YHXA 5BREA 1HUXA 2YHWA 4RTFD 3O5BA 4H5NA 1TYQB 4DB3A 2YJFA 1JCEA 3FR0A 3O6WA 2EWSA 4ISFA 1C0FA 1NWKA 4WQ4C 1T6CA 5ELZA 5CE3A 4B1WB 4GY2B 2QWOA 2F9TA 3VF2A 3QBXA 3JXUA 5AZJB 2AA4A 1EQYA 3VEVA 4JNEA 3U9DA 1BUPA 2E2OA 2IVPA 3QMLA 2Q36A 5AQYA 5AQFA 2P9UA 4JAXA 1QQMA 1BOTO 4RCHA 2V7ZA 5AFUH 3L4IA 1QZ5A 4I6MB 3SMPA 4B1VA 3CJ1A 4BVOA 1BO5O 2IIRA 5EXWA 5EX5A 2Q1NA 4B1YB 3VPZA 1BA0A 4JD2A 4A62A 1DEJA 5AQXA 5AFUA 5AQQA 2P9KA 1HLUA 4CBUA 2E20A 3ENOA 4XH4A 4BREA 1C0GA 2UYTA 3CQYA 5KPZA 2VWBA 3HI0A 2BTFA 4ISGA 1BWFO 4CZEA 2E1ZA 3O80A 3A0IX 4BGAA 2PAVA 4BRAA 1E4FT 3VENA 3U9ZA 1E4GT 3ZETA 1RFQA 2E88A 3SK3A 3ATUA 4BC2A 4BR5A 4EIAA 1GLFO 2I7PA 1V4SA 4CZFA 3EKUA 2A40A 2QWPA 1SQKA 2V7YA 3VEXA 2HOEA 4BGBA 2PBDA 2ITMA 1IG8A 1RDWX 2V51B 2ASMA 3P4IA 4FWPA 4YDUA 3WXIA 4IZ9A 3CETA 2HF3A 3C7NB 3M6GA 3D2FA 3QDKA 3FZKA 4CBWA 1QQNA 5F2RA 3D2EB 3LM2A 1NGEA 3EL2A 4FOEA 1XC3A 1XQSC 2D0OA 5F0XA 1NLVA 3BUZB 5AQRA 2GUPA 2FSJA 3BF3A 2HF4A 2YI1A 3DXMB 2QWNA 1ATRA 1TUUA 2V52B 2GTDA 1TYQA 3FE1A 5F1XA 3VF6A 1H1VA 1HKBA 2NLXA 4A2AA 4H5VA 1R59O 1JCFA 5AZJA 4CD1A 3FFKB 1GLLO 5BRDA 2ZGZA 5JICA 3MCPA 2QWLA 1HPMA 1U2VB 1SZ2A 5EVZA 4JHDA 2A3ZA 4I6MA 2CGLA 5EOYA 4BRLA 4EHUA 3H1VX 1GLBG 3SLCA 1GLAG 1ZC6A 3W0LA 3A5NC 3HTVA 1D4XA 3VETA 2F9WA 4B9QA 4EFHA 3TU5A 3RSEB 3FZHA 4PKHA 2VYPA 2YHYA 2FLOA 1HKCA 1QQOA 5BRFA 4E1JA 4K43A 1ATNA 2Q0RA 3QFUA 2QM1A 5BPMA 2CH5A 4L3QA 2QW9A 4BRDA 3B8AX 2W41A 3WXLA 4IO8A 3H3OB 2CH6A 3WQUA 2CGKA 5AQZA 1MWMA 4WQ5C 1OKJA 1T6DA 4K25A 2Q0UA 3FGUA 4H0PA 5KPRA 5EY4A 4FWSA 4JN4A 1K8KB 2ASPA 3WQTA 4MLHA 4BRPA 4BG8A 4M7YA 4BR4A 3UKUB 3U8XA 3UE5A 4A61A 3WXJA 3FZLA 3AY9A 3ULEB 2D1KA 5AR0A 2A6AA 4DHYA 3VF4A 1DKGD 1BDGA 1YXQA 2QWMA 1LCUA 5BN8A 5LY3A 4IJNA 3VGKA 3KZBA 5AZIB 5BN9A 3VEWA 3LDOA 2YJEA 1LOTB 3CJ9A 4QS9A 4BC5A 4ISEA 5KPTA 3HBTA 5AQWA 3O4WA 3AAPA 3C7NA 5JLHA 3FLCO 3U4LA 2A42A 1MA9B 1CZAN 3QICA 1S3XA 3G25A 3D2EA 4B1UB 4BRKA 5LJWA 1BA1A 1YAGA 5KQ8A 4BRNA 4FO0A 2NZTA 3BP8A 2P9PB 1NGIA 1GLDG 3WXKA 3IFRA 3BF1A 2GELA 3DXMA 3CHWA 1ATSA 2P9NB 3IMXA 4BR9A 2GWJA 3J8AA 4PL7A 3EN9A 1GLCG 4BRIA 4H03B 4HTLA 3GBTA 4BRFA 2J4RA 2YCHA 1NM1A 3UB5A 2ASOA 1U2VA 2GEMA 4FWMA 4GNIA 3A5OC 3FZFA 2WUSA 3LL3A 2E1YA 3VGMA 3QBWA 4H0XB 3ZEUB 2A41A 5BPNA 1DGKN 4HWIA 2ZWHA 3BEXA 2P9SB 3DAWA 4CZJA 1ESVA 3I33A 4NO7A 3UKRB 2KHOA 5AQSA 3RSEA 4RWTA 2ZGYA 3WEEB 1MDUB 1HKGA 4YDUC 4BVPA 2FSKA 3DWLA 3MN5A 2IVOA 5I9EB 4DQ8A 2P9LB 2P9IB 3MN6A 3CJAA 4BC4A 3VERA 4BRQA 1NGHA 2DPNA 4CZGA 4M63C 2HMPA 4CZMA 3LDLA 2ZF5O 2GWKA 1YVNA 2FXUA 4PKIA 2QXLA 4MLEA 1ZXOA 2FSNA 5AQUA 3S41A 1NGAA 3VESA 4BR0A 3WUHA 4H0VB 3A5MC 4MO4A 1K8KA 5AQMA 5AQKA 1NGGA 5AQLA 3DXKB 4H5RA 4BRGA 4XH5A 3GL1A 5JLFA 4FWQA 3UKUA 4WQ4A 3ZX0A 5AQVA 3WT0A 1ZBSA 3ULEA 3SJHA 4CBXA 3H1QA 4IWVA 1G99A 4BQZA 4H0OA 1IJJA 5BRHA 4EAHD 5LJVA 4Y0WA 1WOQA 4B1XB 5AZIA 4H5TA 4BQLA 1X3NA 4H0TB 4CZIA 4BRCA 1WUAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BANA 2E6MA 1NGBA 3C65A 3NFAA 2YKNA 4LF6K 3ZLJA 4AM6A 3KD5E 3OYDA 1VQ5N 3KLGA 2OPQA 2KLAA 3KIOA 4CJVA 3QEWA 4NCBA 4PWDA 1D8YA 4BC3A 1TK8A 4DQIA 3TI0A 2OANA 1SL2A 4HCCA 2P9NA 1VQON 2AP1A 2W6KA 3MN9A 5AQOA 1T03A 1NGCA 2R7YA 3A8YA 3AVLA 4BG9A 3B6OA 1S22A 1JXBA 1NK0A 3LAKA 1HYVA 2EHGA 4BDZA 3G0ZA 3LDQA 3PO5A 4DF4A 1CN2A 3R6MA 3EEQA 4FK2A 1XHXA 1KV0A 1QHAA 4B3MK 3BY5A 1Q8IA 1I6FA 5GIPA 3OHRA 4OO1J 1BQMA 2HHQA 3ZEUA 3SF4D 1TKXA 4G9ZA 4EHTA 4KREA 4J8FA 3OYJA 1VQLN 4GW6A 3WNFA 4FWOA 3ZSXA 4RG8A 5KRTA 5AQHA 4GV6A 3G4SN 4LH5A 2KFZA 3OYCA 1U47A 3DJCA 1KAZA 1YT3A 4FSVA 2D0PA 1DQ7A 4QAGA 5ADXH 3C95A 3RR8A 5AQTA 1HX1A 1RT1A 1NBWA 2D4WA 2H3GX 4O4GA 2GMOA 3G10A 4X66K 1IBMK 3ZT3A 1NRAA 1NJYA 2XY5A 3O1BA 1EWQA 1N32K 4MO5A 4E7KA 2VWKA 3AARA 2A1SA 2NY8X 5HRNA 3VQQA 3OBWA 1REVA 4DCHA 1G15A 1K8AO 4CHPA 1QVGM 3MMVA 2KPYA 4XH1A 4CD3A 3FFIA 1EXQA 4CW7B 3L0QA 3TSUA 2YC1C 4CEFA 3PO4A 1K6YA 3GOIA 3H45C 4LSLA 3CCSN 4JKCA 1I39A 3SPYA 1SN4A 3CJ7A 2GL1A 1V4TA 4PL8A 4H0YB 3CC2N 4XEIA 4KB0A 5FPEA 1XNRK 1X9JA 4CJTA 4C23A 3SMSA 4FLUA 4EP4A 4W5OA 2VGMA 3VEYA 3VEOA 4B08A 4F9OA 2QA4N 4AEIA 1RTHA 4O5FA 3OYGA 1TUYA 3V9XA 4BROA 3LP2A 3LDPA 3EO3A 3T1AA 2IDOA 3LPUA 2FF3B 1ZU3A 1ASWA 3K0SA 4FK0A 2E2QA 3ZSQA 5KRSA 3MAQA 1RTIA 4CESA 3T19A 4H5NA 1LW2A 3O9RA 4CGDA 3FR0A 1N4NA 1Z26A 4WQ4C 4KB1A 1C0FA 3L4QA 3TAPA 4E7LA 3PX0A 3JXUA 1W0HA 3ASMA 3N4PA 1C0MA 3VMFB 4DLGA 2P9UA 3KTQA 5GAGP 4JAXA 3KK1A 2G8FA 1T8EA 3L4IA 1SL0A 4M3TA 4BVOA 2IIRA 4KO0A 2B3CA 2Q1NA 1SN1A 4CIEA 4FCYA 4UADE 1KFSA 4QCLA 1P00A 1NOZA 1BK8A 4ZHRA 1A5XA 3OS1A 2DY4A 2RHKA 4YOTA 1C0GA 3OYIA 2JGUA 2YKMA 1N5YA 4KH4A 1T7EA 4CEQA 1WSJA 2AJQA 4C8LA 1BWFO 4CZEA 5MLCQ 2E1ZA 4DF8A 1VHXA 2MZ0A 4OPHA 3J7AP 3I55N 3VQBA 1A5WA 4HE7A 4BC2A 4BR5A 1ZBHA 1GLFO 2I7PA 3NH2A 3T3FA 2A40A 3NAEA 1BIUA 1K8BA 3CYMA 4I7FA 2V7YA 1SQKA 1Q7YO 4V1DC 2HOEA 3T1HK 4BY9C 1NJIO 2ITMA 1NKCA 3O4NA 5EU7A 3S9HA 5HRPA 1RDWX 3P4IA 2ASMA 4Z4EA 3E7RL 3CETA 1HRHA 4I9LA 4FJXA 5F2RA 3D2EB 3E1YA 1O1WA 3LM2A 1NGEA 3HVRA 1TK5A 3HPOA 1NLVA 3TANA 2GUPA 4I2QA 5JENA 3CCLN 2G8IA 1T05A 2HF4A 3Q7BA 1NKEA 1ATRA 1XRSB 4OGCA 2GTDA 1TYQA 3MX5A 3OY9A 2YHBA 1RBTA 1LWCA 4DR2K 2NLXA 3AA5X 4FJGA 4O8UA 3EY1A 1KSPA 3QIPA 3OYKA 5DK5A 1GOAA 4Z4IA 1HPMA 1U2VB 3V9WA 4FM1A 5JS2A 3NDKA 5EVZA 5H1SQ 4WFNL 2P5OA 4JHDA 4IEIA 1QQCA 3NGZA 4FK4A 4FXDA 2G2KA 5EOYA 2CGLA 1VQKN 3R3LA 1E3MA 2O8DB 3W0LA 2JLEA 1FW6A 4RW8A 3THVA 1SKSA 3VQ7A 1N36K 3TSQA 4EFHA 3TU5A 3RSEB 4PKHA 2YHYA 3RRGA 4C8MA 1ZBFA 1HKCA 4KH5A 2LJMA 1VSHA 1BL3A 2Q0RA 4Q5VA 2CH5A 3SYZA 4CJPA 2G8WA 4IFEA 5J2NA 2QW9A 3B8AX 2W41A 1HYZA 3BDPA 4IO8A 5AQZA 1UA1A 4WQ5C 1OKJA 5M1QA 4Q0BA 2NRVA 1YVUA 2Q0UA 1UAXA 3FGUA 3HP9A 3PSIA 1JLEA 4JKAA 4JN4A 4E3SA 4J2DA 4BRPA 4DU4A 4W5NA 4BWMA 4FVMA 2PYJA 1JXEA 2JWKA 2BH1A 4MFBA 3AY9A 5AR0A 4DHYA 3CPWM 3VF4A 3THWA 1DKGD 3KOXA 3BK3C 1L3VA 2HB5A 4OPJA 4KTZA 3KZBA 3TTCA 1OVQA 1YHQN 5BN9A 3HJFA 4CIFA 1LWEA 3L3UA 3FLCO 2UXCK 3CC4N 1VNAA 2A42A 1LV5A 1CZAN 4FJIA 3OYFA 5K14A 1UOCA 2O8CA 1KVCA 4GKJK 3THYA 5LJWA 1BA1A 1YAGA 2IOCA 3AV9A 3HXMA 3KOWA 4BRNA 4CEOA 1RT3A 2OZSA 4JI1K 4A5BA 1CZ9A 1ATSA 3HPHA 3NF6A 2O8EB 4R5PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2BAN A;  2E6M A;  1NGB A;  3C65 A;  3NFA A;  2YKN A;  4LF6 K;  3ZLJ A;  4AM6 A;  3KD5 E;  3OYD A;  1VQ5 N;  3KLG A;  2OPQ A;  2KLA A;  3KIO A;  4CJV A;  3QEW A;  4NCB A;  4PWD A;  1D8Y A;  4BC3 A;  1TK8 A;  4DQI A;  3TI0 A;  2OAN A;  1SL2 A;  4HCC A;  2P9N A;  1VQO N;  2AP1 A;  2W6K A;  3MN9 A;  5AQO A;  1T03 A;  1NGC A;  2R7Y A;  3A8Y A;  3AVL A;  4BG9 A;  3B6O A;  1S22 A;  1JXB A;  1NK0 A;  3LAK A;  1HYV A;  2EHG A;  4BDZ A;  3G0Z A;  3LDQ A;  3PO5 A;  4DF4 A;  1CN2 A;  3R6M A;  3EEQ A;  4FK2 A;  1XHX A;  1KV0 A;  1QHA A;  4B3M K;  3BY5 A;  1Q8I A;  1I6F A;  5GIP A;  3OHR A;  4OO1 J;  1BQM A;  2HHQ A;  3ZEU A;  3SF4 D;  1TKX A;  4G9Z A;  4EHT A;  4KRE A;  4J8F A;  3OYJ A;  1VQL N;  4GW6 A;  3WNF A;  4FWO A;  3ZSX A;  4RG8 A;  5KRT A;  5AQH A;  4GV6 A;  3G4S N;  4LH5 A;  2KFZ A;  3OYC A;  1U47 A;  3DJC A;  1KAZ A;  1YT3 A;  4FSV A;  2D0P A;  1DQ7 A;  4QAG A;  5ADX H;  3C95 A;  3RR8 A;  5AQT A;  1HX1 A;  1RT1 A;  1NBW A;  2D4W A;  2H3G X;  4O4G A;  2GMO A;  3G10 A;  4X66 K;  1IBM K;  3ZT3 A; 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