4FSVA

Crystal structure of a heat shock 70kda protein 2 (hspa2) from homo sapiens at 1.80 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
384
structure length
380
Chain Sequence
RGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a heat shock 70kDa protein 2 (HSPA2) from Homo sapiens at 1.80 A resolution
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock-related 70 kDa protein 2
total genus 120
structure length 380
sequence length 384
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4fsvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4fsvA04
3UKUB 2P9UA 3VERA 4XH4A 3O8MA 5AQIA 3VF4A 3O1BA 4AM7A 5AQXA 3A5MC 3LM9A 1ZXOA 4RWTA 4O8KA 3FZLA 1GLAG 4A2BA 4H03B 3GL1A 2OANA 5AQZA 3QBWA 4ISGA 4CZKA 2QWMA 3ZEUB 3BF3A 4RCHA 1NGBA 1JCFA 4JD2A 5EY4A 1NGHA 3AY9A 3R8EA 4HWIA 4FO0A 3ENOA 4CZHA 5BPNA 1Q18A 4RTFD 4FWPA 4I6MA 4H0VB 4BC5A 3R6MA 5E84A 1G99A 3ATUA 4L3QA 1WOQA 5F1XA 3W3DA 1KAYA 1BWFO 1K8KB 4CZEA 3CJAA 2D0PA 2GUPA 4EHUA 3GG4A 3VEVA 2YHYA 1EQYA 1GLDG 3I8BA 2H3GX 3H3OB 5B8HA 5BN9A 3ZEUA 1JCGA 1TUUA 3MDQA 3CERA 3A5NC 5AQQA 5AQUA 4FWNA 4K42A 4B1YB 2ITMA 1BA1A 3WT0A 5AQFA 2QWPA 1BOTO 3HZ6A 4IO8A 3GDQA 5AZIB 2P9IB 4BR5A 3MN7A 4FWKA 1NGCA 3LDLA 4CBXA 1H1VA 1NGGA 1MWMA 5BRHA 4DB3A 4BVOA 3LDPA 2ASOA 4BRCA 3EKUA 4H0YB 2CGJA 3IMXA 2A6AA 3WXIA 1D4XA 3O6WA 4M7YA 1BG3A 4B9QA 2CH5A 3C0BA 4CZIA 1YXQA 3WXKA 4FWMA 2FSJA 3HTVA 4C23A 3C7NA 2QWRA 4EFHA 2A5XA 3BP8A 4FWLA 3R9PA 1ATNA 1T6DA 1S22A 5I9EB 3L0QA 3TU5A 2ASPA 3DXMB 4BC3A 4CBWA 4H0TB 4YDUA 3QFUA 2AP1A 1KAZA 3ATVA 4BRAA 5CE3A 4MLEA 5BR9A 5AQWA 2FXUA 2E2OA 3OHRA 3SJHA 2GELA 2BTFA 3UKRA 2P9SA 2V51B 2Q0UA 1ZBSA 3ID8A 3HI0A 3O1WA 4WQ4C 4IJNA 1E4FT 2P9UB 4BRGA 5AQYA 1XQSC 5ELZA 1SQKA 3CJCA 3WQUA 2HOEA 4WQ5A 4BREA 3A5LC 2W40A 2EWSA 2Q36A 4NB4A 2P9KB 4FPBA 1CZAN 1X3MA 1GLLO 4FWQA 4PL8A 3SLCA 1XUPO 5EX5A 1KAXA 2GWJA 5AR0A 3ZETB 5ADXH 1QQMA 3CIPA 1IJJA 2ZF5O 4ISEA 1RDWX 3CJ1A 2HF4A 1NGFA 5JICA 2GTDA 4CBUA 2FF3B 3P4IA 2A42A 1HJOA 3LL3A 3A8YA 4IWVA 3FFKB 3FGUA 3S41A 4DCHA 4BRLA 1NMDA 3UKRB 5FPDA 4B1XB 4BC4A 5KPZA 4A62A 1OKJA 5LJVA 2GWKA 3GOIA 5AFUH 5JMVA 4NO7A 3DAWA 1QZ5A 2HMPA 3FE1A 3MN5A 4FWRA 4ISFA 1J6ZA 2HF3A 5BREA 2P9NB 1HKCA 2E20A 3IFRA 3O5BA 4QS9A 3CQXA 3L6QA 1BA0A 1BU6O 1WUAA 5BRDA 3L4IA 4Y0WA 5LJWA 3F9MA 4B1WB 1GLJO 4CZGA 1ATSA 1KXPA 5AQOA 4XH1A 1V4SA 3CJ7A 3WEEB 4JHDA 1BDGA 3DJCA 1RFQA 4FOEA 4IJAA 1NWKA 4M7XA 5AQJA 2IVOA 3M3ZA 1QQOA 3QICA 2BUPA 3I33A 2Q31A 2QWNA 1YAGA 4BRDA 1X9JA 2Q97A 3LDNA 3M6GA 2QWQA 3ENHA 3WXLA 4BRKA 1HX1A 3ZX0A 2QW9A 3QB0A 3CI5A 3BUZB 3D2FB 1DEJA 1P8ZA 1Y64A 3U9DA 1QHAA 4BR9A 4BVPA 4BQLA 3KHYA 1S3XA 4CZFA 3VGKA 4BGAA 4K41A 4H5WA 3KVGA 4F9OA 2E1YA 4A2AA 3O80A 1YVNA 5E26A 1NGAA 4XEIA 3DWLA 3A0IX 1SAZA 3AAPA 3EO3A 2I7NA 4CZMA 3D2EA 2V7YA 3SMSA 4WQ4A 5EOYA 1QZ6A 4BRHA 4Z94A 4H0XB 1TYQB 5FPNA 5JLFA 5KPTA 5KQ8A 5AZJA 3H45C 3ZETA 4LC9B 2GEMA 3VGMA 3IUCA 2CH6A 4IZ9A 4BRNA 4E1JA 4CZJA 5FPEA 3VEYA 5KPRA 3D7EO 2D1KA 3GE1A 4H0OA 5AQRA 1GLEG 4EAHD 3QDKA 3CJBA 3D2FA 3H1VX 4BC2A 2A41A 5AQSA 3CJ9A 4EHTA 4QS8A 2E1ZA 3JXUA 1E4GT 2E2NA 1NGIA 2E88A 1Z05A 2PBDA 4YDUC 4B1VA 5KQDA 4BRIA 2Q0RA 4XH5A 2VCPA 2YHWA 3WQTA 3MCPA 2VYPA 5BRFA 3FLCO 3VF6A 5FPMA 3KZBA 2QWOA 3H46O 1GLCG 1T6CA 4BR2A 4FSVA 4FPAA 3H1QA 4AM6A 2A40A 4WYBA 3VEZA 1BUPA 3QMLA 3MN6A 2FF6A 1BO5O 2NRHA 2I7PA 3DXKA 3C7NB 2FLOA 4JHDB 2YCHA 1NGDA 4DHYA 2Q2RA 2ZGYA 5AQGA 2CGLA 5AFUA 4BR4A 1ESVA 3EN9A 2P9PB 4PKIA 4BG8A 3O4WA 2KHOA 3VENA 2IVNA 3HBTA 1MDUB 5AQPA 3ZX3A 3M1FA 2P9SB 4FL9A 3AARA 3WXJA 3LDQA 2V7ZA 3ULEA 3EL2A 2V52B 3AAQA 1NGEA 3U8XA 5AQMA 2D4WA 3O08A 1LOTB 3WEEA 4WQ5C 3VGLA 1HKBA 5AQVA 2P9LA 2ASMA 3BF1A 2P9KA 5TKYA 4PKGA 3VEXA 2QWLA 1GLBG 2E2QA 4A61A 1DGKN 3H6EA 2QM1A 5F2RA 3TPQA 2E8AA 4EIAA 3ZX2A 5AQLA 1TYQA 3CETA 3MK6A 4BRMA 4H5NA 2P9PA 2P9IA 3W0LA 5BPLA 3HSCA 3FZKA 5ADXA 1LCUA 4BGBA 3ULEB 1ZC6A 3UKUA 5AQTA 1T44A 3GBTA 3FZMA 4BR0A 1NGJA 3CHWA 4CZLA 4MLHA 1RGIA 4O5FA 4BROA 3VESA 4BQZA 5AQNA 3G25A 3IDHA 3VEOA 4BG9A 3FZHA 4GNIA 4H5RA 1DKGD 3D2EB 1SZ2A 3B8AX 4B1UB 3LDOA 4PL7A 3WUHA 3UE5A 2IIRA 4K25A 3VETA 1NBWA 1K8KA 1HPMA 1Z6RA 3DXMA 3SMPA 3JS6A 2IVPA 1U6ZA 1C0GA 5EVZA 4JD2B 5F0XA 4PKHA 4H0PA 4KBOA 2WUSA 4FWSA 1QQNA 2FSNA 2NZTA 2YJEA 3VF2A 1HKGA 3RSEB 4I6MB 4BRFA 3H3NO 3MN9A 2PAVA 4J8FA 4CI6A 4K43A 1HUXA 5JLHA 2AA4A 4BR7A 5BPMA 4GY2B 4B1ZA 1TUYA 2D0OA 2ZWHA 3LM2A 2E2PA 4MO4A 2DPNA 4JN4A 2W41A 5LY3A 3VPZA 4JNEA 1ATRA 1GLFO 1NLVA 1U2VB 1MWKA 2CGKA 3VEWA 1XC3A 1MA9B 4HTLA 3DXKB 4IXCA 1YUWA 1HLUA 2YHXA 3U4LA 5BN8A 1IG8A 2VWBA 1C0FA 2P9LB 5AQHA 5AQKA 4BRPA 4CD1A 3QBXA 4QS7A 3EKSA 4DQ8A 3FR0A 1R59O 4H5TA 5EXWA 3RSEA 2YJFA 3CQYA 3QFPA 1NM1A 5AZJB 4FWOA 2FSKA 3J8AA 5AZIA 1V4TA 2F9WA 1X3NA 2Q1NA 2J4RA 4H5VA 3UB5A 2A3ZA 4JAXA 2ZGZA 4M63C 3BEXA 4BRQA 2YI1A 4CJ7A 3U9ZA 2UYTA 3HM8A 3EZWA 4CD3A 2QXLA 3FZFA 4MO5A 3SK3A 2P9NA 3VOVA 4FOIA 3MMVA 2NLXA 1JCEA 3A5OC 2F9TA 1U2VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DU3A 3NGZA 3VERA 3KP0A 4OVLA 4AHVA 1OH8A 3P83D 3F5TA 2W42A 1YHQN 3LM9A 4DTUA 1JLFA 1ZXOA 3FZLA 1I2VA 1POIA 1GLAG 3MX5A 4CJUA 3V9WA 3DRPA 1NKBA 4M3WA 5AQZA 3QBWA 3CC4N 1E3MA 1HNZK 4ISGA 1RDAA 2GUIA 2QWMA 3ZEUB 3LZJA 3THXA 3CFOA 3HSTB 1JCFA 3CCVN 5EY4A 1NGHA 2RF2A 3R8EA 2MZ0A 3SYZA 4BY9C 5GAEP 3MEGA 4KKOA 4FWPA 2JLEA 3NVMA 5AJ3K 5E84A 3CCUN 1PTXA 4LFAK 3ATUA 2YV0X 2G8WA 2O8DA 3CCQN 4FYDA 3HVTA 1S1TA 4DV7K 3QIOA 1BWFO 4CZEA 5A2QO 5J2MA 1PX9A 2B3CA 3CJAA 2GUPA 1SEGA 4FLUA 1EQYA 2KPYA 3I8BA 2H3GX 3ZSRA 4AHUA 2RPIA 3H3OB 3CQ8A 5B8HA 1JCGA 4JS5A 4N56A 3TSPA 5AQQA 4B1YB 3DOLA 4PUOA 1VQ5N 4YHHK 4NLCA 3WT0A 4GV3A 3ZT4A 1HJRA 3UIQA 3QNNA 2P9IB 3WNGA 4GMJB 3MN7A 4FWKA 3NHGA 3LDLA 4CBXA 3BY5A 2QA4N 4M3YA 3RTVA 4DQQA 3T3FA 4DB3A 2HBMA 4BRCA 3AVKA 2NRTA 4M7YA 2G8IA 3VTIA 4V19S 4DMNA 1OH6A 1GOAA 3WXKA 4FWMA 2ZM6K 2FSJA 3CPEA 3C7NA 4PY5A 1WSHA 1KLMA 1Z26A 1ATNA 2HBKA 2MBKA 2OYQA 3DXMB 2WFBA 4H0TB 4YDUA 1NE5A 4DTSA 2AP1A 4KH4A 4BRAA 1LWCA 5C12A 4CEDA 4CJ5A 4UJ0A 4CF1A 3HI0A 3O1WA 4IJNA 4HUFA 3G71N 2IOCA 3I56N 1XQSC 3L3UA 1SQKA 3PV8A 1T8EA 2HOEA 4WQ5A 5CYQA 4M3TA 4DTMA 1NU0A 2P9KB 3THWA 5JVGL 4OX9K 1CZAN 1X3MA 1N8RO 3KLEA 1NNEA 1MR4A 4BDPA 5AR0A 3E9PA 3ZETB 4M3RA 4KV8A 2ZF5O 3SPYA 3CJ1A 2HF4A 5JICA 4LY7A 3P4IA 1MYNA 4GV6A 3ALYA 4WE1A 1Q81O 4CF0A 4KB1A 4BRLA 3PLAA 1NK6A 1KV0A 4FLWA 3DLHA 5KPZA 3TARA 3PY8A 1OH7A 3LANA 5LJVA 1JJ2M 2O4IA 5AFUH 3ZSOA 4RW4A 3DAWA 3FE1A 2KTQA 4X62K 4FWRA 4ISFA 4OJRA 4DSLA 1U45A 5C10A 3KK3A 3EEQA 3MX2A 4CJSA 5GIPA 1VSIA 1N32K 5BRDA 1EP4A 3F9MA 3NCIA 3K5MA 4JK9A 4KHNA 4DFMA 4E7IA 4JHDA 2F8TA 3DJCA 2LI7A 1RFQA 1NWKA 2BE2A 1TK8A 3K59A 3C65A 1YTUA 1BI4A 4L8RB 1KD1O 4CHYA 4E7KA 2QWNA 4BEBA 4C1NK 2C1IA 4JYAK 3ENHA 3V1RA 4BRKA 3QB0A 1QE1A 4B8CA 4BE2A 3D6RA 3D2FB 1P8ZA 2YIPA 4ID5A 4BQLA 4MDBA 2X78A 3KHYA 2P5GA 3P39A 4KHSA 4FW2A 4JI6K 4UAEF 1K73O 3SQ2A 1YVNA 4CGIA 5E26A 1NGAA 2A1SA 1SAZA 4JI3K 5JS1A 4DSFA 3AVHA 4M42A 3SMSA 4OPKA 4DR1K 1QZ6A 2EHGA 4BRHA 5JLFA 5KPTA 4O4GA 5C25A 5KQ8A 4HUGA 4B08A 2GEMA 4KHQA 3VGMA 3IUCA 1NH5A 1M1KO 3KOXA 4BRNA 2G8KA 4E1JA 1D9FA 4M45A 4DV5K 1KVBA 3D7EO 2D1KA 3GE1A 1EWQA 3IAYA 5AQRA 1GLEG 3QDKA 1VSLA 4CECA 4BC2A 3HPOA 2E3GA 3Q7CA 4OKJA 4F2SA 3VQ7A 4QS8A 3QEVA 4I7FA 3V81A 3VTHA 1NK0A 1WSGA 1WSFA 2E88A 4DR7K 2PBDA 4B1VA 3OJUA 3SQ4A 4BRIA 4XH5A 4WFAL 3N4PA 3MCPA 3VF6A 3KZBA 3NMUA 3H46O 4R5PA 2YNIA 4FPAA 3DM2A 3T19A 4WYBA 1EWRA 4C8KA 4CJFA 3QMLA 4N5SA 4FCYA 3VQAA 2IDOA 4WFNL 1L3VA 3U3GA 3MCAB 4B9UA 4N41A 4JI5K 4BR4A 1B7DA 3DLKA 1CZBA 1RT3A 2IVNA 3HBTA 4CF8A 3R1XA 5FDLA 3AARA 3I8DA 2UUAK 4H8KA 3CPWM 1U47A 1XMQK 3RMAA 1CXUA 3SNNA 1NGEA 3O08A 3AA3A 1BIZA 1EETA 1ICAA 3V1OA 4CEBA 3TAFA 1IKXA 1VSEA 3B6PA 4GKKK 4CGGA 1RT6A 1NKEA 3VGLA 3TAQA 1ITGA 1XI1A 3O9TA 4PQUA 3OYCA 1XMOK 1YI2N 2QWLA 4DFPA 1DT9A 2HHUA 1RT5A 2WOMA 3ULDA 3C6UA 2XY5A 3MWTA 3ZX2A 1S6PA 1QSYA 3CETA 2NRWA 3LP3A 3MK6A 1QS4A 3EY1A 2K35A 4Z4GA 3FZKA 2NY9X 1ASVA 1LCUA 3ULEB 1ZC6A 5AQTA 4YOYA 2F4VK 2ETJA 3FZMA 4ICLA 4FLTA 1NGJA 3L56A 5DM6L 4BQZA 3L2VA 1S1UA 4CGDA 4BG9A 3F73A 1ZUTA 5KI6A 3B8AX 3DYAA 3ID6A 4B1UB 4TSXA 3T1YK 4AEIA 1N36K 4AAZA 3DLGA 4CGFA 2YC1C 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4DU3 A;  3NGZ A;  3VER A;  3KP0 A;  4OVL A;  4AHV A;  1OH8 A;  3P83 D;  3F5T A;  2W42 A;  1YHQ N;  3LM9 A;  4DTU A;  1JLF A;  1ZXO A;  3FZL A;  1I2V A;  1POI A;  1GLA G;  3MX5 A;  4CJU A;  3V9W A;  3DRP A;  1NKB A;  4M3W A;  5AQZ A;  3QBW A;  3CC4 N;  1E3M A;  1HNZ K;  4ISG A;  1RDA A;  2GUI A;  2QWM A;  3ZEU B;  3LZJ A;  3THX A;  3CFO A;  3HST B;  1JCF A;  3CCV N;  5EY4 A;  1NGH A;  2RF2 A;  3R8E A;  2MZ0 A;  3SYZ A;  4BY9 C;  5GAE P;  3MEG A;  4KKO A;  4FWP A;  2JLE A;  3NVM A;  5AJ3 K;  5E84 A;  3CCU N;  1PTX A;  4LFA K;  3ATU A;  2YV0 X;  2G8W A;  2O8D A;  3CCQ N;  4FYD A;  3HVT A;  1S1T A;  4DV7 K;  3QIO A;  1BWF O;  4CZE A;  5A2Q O;  5J2M A;  1PX9 A;  2B3C A;  3CJA A;  2GUP A;  1SEG A;  4FLU A;  1EQY A;  2KPY A;  3I8B A;  2H3G X;  3ZSR A;  4AHU A;  2RPI A;  3H3O B;  3CQ8 A;  5B8H A;  1JCG A;  4JS5 A;  4N56 A;  3TSP A;  5AQQ A;  4B1Y B;  3DOL A;  4PUO A;  1VQ5 N;  4YHH K;  4NLC A;  3WT0 A;  4GV3 A;  3ZT4 A;  1HJR A;  3UIQ A;  3QNN A;  2P9I B;  3WNG A;  4GMJ B;  3MN7 A;  4FWK A;  3NHG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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