4FSVA

Crystal structure of a heat shock 70kda protein 2 (hspa2) from homo sapiens at 1.80 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
384
structure length
380
Chain Sequence
b'RGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Heat shock-related 70 kDa protein 2
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of a heat shock 70kDa protein 2 (HSPA2) from Homo sapiens at 1.80 A resolution
rcsb
total genus 120
structure length 380
sequence length 384
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4fsvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4fsvA04
1NMDA 4K41A 2HMPA 2P9IA 5AQUA 4CZKA 3R9PA 4WQ4A 1BUPA 3C0BA 4ISGA 1GLLO 3VENA 2D0PA 3VGKA 5FPEA 3S41A 5AQPA 3VEOA 3BUZB 2W41A 4AM7A 3QFPA 2P9LB 2NLXA 3HZ6A 3VOVA 3JXUA 2P9KA 5F1XA 5ELZA 1IG8A 1NWKA 2CGLA 3A5MC 5AQJA 2VCPA 3VEVA 1BWFO 4BR4A 1EQYA 2VWBA 3QB0A 3KHYA 3WT0A 4F9OA 1X9JA 2D0OA 3QDKA 2V52B 4FWQA 3UKRB 1E4GT 4FSVA 1YUWA 1X3MA 5AZIB 5AQOA 1X3NA 4L3QA 2QWOA 4FPAA 4BGAA 2E8AA 4FWRA 1NGCA 4B1ZA 2EWSA 2ZGZA 1K8KB 1TUYA 4BR7A 1JCGA 4BVPA 2D4WA 4Y0WA 3H6EA 3CI5A 3HI0A 3L0QA 3GG4A 4BR0A 4FOIA 2IVOA 4EHTA 1HKGA 1NGBA 2QWLA 3KZBA 3FGUA 5LJVA 5AQTA 1BO5O 2J4RA 2IVNA 3LDPA 3A5LC 5BN8A 1NGIA 1HKBA 1HKCA 4QS8A 5BR9A 3C7NA 4BGBA 5KQDA 3CHWA 3L4IA 5AQWA 3MK6A 1TYQA 4CZEA 4FWMA 3ENOA 1T44A 5AQLA 3CETA 3W3DA 1NM1A 4IXCA 3CJCA 3ZEUB 3WEEB 3VF2A 3QICA 3JS6A 4HWIA 5F0XA 2AP1A 3ZETA 4K42A 1LCUA 2W40A 3QBXA 4FWNA 2V7YA 2Q97A 2OANA 1S3XA 3VF6A 3FZLA 3LDLA 1XUPO 2GEMA 1MWMA 1Y64A 5AZJB 3D2FA 1SZ2A 1C0FA 4DQ8A 4YDUC 2DPNA 5JICA 3KVGA 1GLFO 3RSEB 5AQGA 3SLCA 4A2AA 3LDOA 4BRQA 3FR0A 4JD2B 5I9EB 2YCHA 1U2VB 3LM2A 1NGHA 4WQ4C 2D1KA 2UYTA 1BOTO 2A3ZA 3CIPA 5F2RA 1ATSA 2FSJA 5JLHA 2Q0RA 4BC4A 2GWKA 2ZF5O 2YHXA 5ADXA 1OKJA 3EKSA 2AA4A 4J8FA 4B1UB 4BQLA 3SMSA 4MO5A 4RWTA 3LDNA 4BRCA 5KPRA 2GTDA 4IO8A 1MA9B 4A62A 4K25A 3OHRA 2E2NA 3WXLA 2P9KB 3UB5A 3FLCO 4FOEA 5AQXA 4GY2B 3UKUB 1GLDG 5AQKA 1GLCG 5B8HA 3ZX2A 2P9UA 5TKYA 3FZMA 3O80A 2YHYA 4H0TB 1QQOA 3ULEB 3R8EA 4BROA 2VYPA 3VERA 4NO7A 4CBUA 2P9PB 2ITMA 1T6DA 3WUHA 3W0LA 2QWRA 2E20A 1QZ5A 1HLUA 1JCFA 4AM6A 1E4FT 3VPZA 1QHAA 4IJNA 3VEXA 4CZHA 4BRDA 1BDGA 2CGJA 4BRMA 3I8BA 1NLVA 4EIAA 5AQZA 3ATVA 5FPNA 2P9NB 1DGKN 3A5OC 2GUPA 3DXKB 5AQSA 1HX1A 3L6QA 5AQYA 4PKIA 4B1VA 1GLBG 3FZKA 2BUPA 3EL2A 4M7XA 4JHDA 5EX5A 3H1QA 1ESVA 3O1WA 3TPQA 3H46O 5CE3A 3U9DA 3IUCA 2P9SB 3CJBA 1S22A 2ASOA 4BG8A 5EXWA 4H5VA 4CZGA 1RDWX 3AAPA 2KHOA 2YJFA 2FSNA 2FXUA 4H0YB 3SMPA 3CERA 4CZLA 4CD3A 1KAXA 1TYQB 4FWOA 4KBOA 4EFHA 3WQUA 1NGDA 5AQNA 5ADXH 1BU6O 4BRKA 4I6MB 3ID8A 1ZC6A 5E26A 4EHUA 2I7PA 4BC3A 4CJ7A 4BRLA 1J6ZA 2A42A 4BRFA 4JNEA 3HSCA 4H5RA 4YDUA 4BVOA 4RTFD 3DXMA 3FZHA 5FPDA 3MN9A 3ZETB 2A6AA 2QM1A 4BREA 2QWMA 3GL1A 1DEJA 3MN7A 2E2PA 3WXKA 4DB3A 3IMXA 4C23A 4CBXA 1ZXOA 3O08A 3VF4A 3VESA 1YAGA 4BR5A 3CQXA 5AQIA 1DKGD 2BTFA 4MO4A 2QWNA 2PAVA 1WOQA 3VETA 3I33A 2P9IB 1Z05A 3IDHA 4H03B 5BN9A 3UKRA 3O5BA 1U6ZA 4MLEA 2ASMA 3D2EB 3O8MA 3R6MA 2ZWHA 3G25A 1QQNA 2CH6A 2E2QA 1KAZA 3QMLA 5LY3A 4WQ5A 2P9LA 3ATUA 4DCHA 3HBTA 4Z94A 1C0GA 1NGEA 3U9ZA 2FLOA 1IJJA 4HTLA 4BC5A 1HJOA 1HUXA 5BRDA 2QW9A 3ZX3A 3A8YA 5BPNA 2E1YA 3MN6A 4WYBA 5AZIA 4FWPA 3ENHA 2NRHA 3BP8A 3DWLA 2V7ZA 4ISEA 3VGMA 2HOEA 3O4WA 2PBDA 1BG3A 3C7NB 3FE1A 1CZAN 2A5XA 1TUUA 3M1FA 3H45C 1K8KA 3GE1A 4H0PA 2YJEA 3BEXA 2P9PA 4BRIA 1QZ6A 3WQTA 4B1WB 2A40A 2HF4A 3CJ1A 3D7EO 3A5NC 3MN5A 4BRHA 4BQZA 5AQMA 1SQKA 1P8ZA 5FPMA 1H1VA 5AQQA 3J8AA 4XEIA 1MWKA 3M3ZA 4M7YA 2FF6A 1YXQA 1Z6RA 2P9NA 1NGFA 3DXKA 1GLAG 3CJ7A 3EN9A 2NZTA 1RFQA 4JHDB 5JLFA 5KPTA 1HPMA 4JN4A 3D2FB 3VEWA 1R59O 1ATRA 2Q31A 5JMVA 2QXLA 3GDQA 1XC3A 3BF3A 3QBWA 4QS7A 1SAZA 4IWVA 4M63C 4PL8A 4CZJA 4NB4A 5EY4A 4MLHA 4BR9A 2E1ZA 3F9MA 2YI1A 1Q18A 4IZ9A 2GWJA 4CD1A 4BRAA 2HF3A 3A0IX 3U4LA 1D4XA 5BPMA 2I7NA 3AAQA 3LL3A 3EO3A 1NGAA 1KXPA 2IIRA 3TU5A 4BRNA 3RSEA 2GELA 4BRGA 5AQFA 4H0VB 1YVNA 3H1VX 4CBWA 4BR2A 3BF1A 4PKGA 3UE5A 2YHWA 1U2VA 4RCHA 1JCEA 1NBWA 1LOTB 3SK3A 4O5FA 1QQMA 2Q36A 2Q2RA 4B9QA 2F9TA 4XH1A 4ISFA 3CJAA 4CZFA 4K43A 4WQ5C 4EAHD 5BRHA 3WXIA 5BRFA 3D2EA 1T6CA 4H5WA 3MDQA 4QS9A 4A61A 5EOYA 3FFKB 3CQYA 2H3GX 1V4TA 4BG9A 5AQRA 2ASPA 4IJAA 5LJWA 4B1YB 1KAYA 3H3NO 4CI6A 2FF3B 3QFUA 1ATNA 3EZWA 3VGLA 3B8AX 3AY9A 5BPLA 5AFUA 4BC2A 2F9WA 3CJ9A 3UKUA 2E88A 2Q1NA 2IVPA 2V51B 3GOIA 4FPBA 2P9UB 5KQ8A 4O8KA 1RGIA 4XH4A 3LM9A 3ULEA 2E2OA 3DAWA 4PL7A 4PKHA 4H5NA 1BA1A 2QWPA 1XQSC 4A2BA 3P4IA 3FZFA 3U8XA 1GLJO 4JAXA 2ZGYA 3ZX0A 4B1XB 4DHYA 5AR0A 1WUAA 4LC9B 3VEZA 5E84A 3O6WA 1GLEG 3DJCA 5EVZA 3ZEUA 4CZIA 3WEEA 1ZBSA 2FSKA 4FWLA 3WXJA 3IFRA 4I6MA 3VEYA 3HM8A 4XH5A 2CGKA 1BA0A 4FWKA 4FWSA 2QWQA 5AZJA 3SJHA 1NGGA 3MCPA 1G99A 3DXMB 2A41A 3MMVA 4E1JA 3LDQA 1V4SA 5KPZA 2P9SA 3AARA 3EKUA 5AFUH 3O1BA 4JD2A 4H0OA 4BRPA 2WUSA 3M6GA 4CZMA 2Q0UA 5BREA 4H0XB 5AQVA 3GBTA 4H5TA 4FL9A 2CH5A 5AQHA 3H3OB 3HTVA 4GNIA 1MDUB 1NGJA 4FO0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZSYA 2RKIA 2HBJA 2FBTA 1TK8A 3R9PA 2Z1IA 4WQ4A 3B6PA 4FJLA 4JI0K 4CEFA 2BANA 3AVBA 4CJ5A 3C0BA 3DRSA 1JXEA 3VGKA 4FK4A 2ZQBA 1JZBA 5AQPA 3BUZB 3VEOA 4WCEL 3SV3A 3QFPA 1VQ4N 2PYLA 3LALA 1VRTA 4B3MK 2P9KA 5F1XA 2B6AA 1SL0A 1NWKA 5AQJA 4E7IA 1U48A 1FXXA 2VWKA 4KB0A 3QDKA 4FWQA 3P39A 1C0MA 5AZIB 1X3NA 4L3QA 2QWOA 3THWA 4FWRA 4B1ZA 4AAZA 3PX0A 3NHGA 4KPYA 1IKYA 4CESA 4BR7A 3DLGA 4FLUA 1GOBA 5CR4A 4BVPA 3EYZA 3MWTA 3LP3A 3DRRA 2M8BB 3ZT1A 3HI0A 3VQ7A 2G8FA 4BR0A 1NGBA 2QA4N 2FBVA 3SPZA 2IVNA 4HCBA 4B3TK 2OTJN 4KHPK 4OGEA 4QS8A 3RVCA 3WNGA 2VQFK 1YJNN 4E72A 4BGBA 5KQDA 4JRPA 1NU0A 4YOVA 1RBUA 2NRVA 3A2FA 3K9KA 3TSQA 3MK6A 1TYQA 5HRRA 2GBZA 2MBKA 4OVLA 1IH7A 3SJJA 3Q7BA 5LMUK 3V1OA 1WN7A 3ENOA 1T44A 1VSEA 3W3DA 3L2VA 1NK7A 3P31A 5M1NA 1RCHA 3CJCA 1XRSB 1GPTA 3KK3A 5T7BA 1SUQA 3QINA 3HP6A 3VF2A 3QICA 3JS6A 3K59A 5F0XA 3ZETA 2LSNA 4K42A 3T1YK 1LCUA 1N4NA 1HNZK 2V7YA 2HHQA 4GKKK 1N8RO 2BRZA 4LF4K 1WBDA 2FBYA 2GEMA 1MWMA 4B9SA 4E0DA 3D2FA 4DQ8A 2VGNA 2X74A 4CF9A 2KSKA 4A2AA 1S9GA 4C8MA 3OTOK 3KLIA 1IKVA 4M45A 4KREA 4JD2B 1VSHA 3MWPA 4F2SA 4JKFA 2A3ZA 4DQSA 5F2RA 4FLZA 1EETA 1VNBA 3IS9A 4KHNA 4DFJA 2QKKA 4FJ8A 3C6AA 2AA4A 1C6VA 4PUOA 3OJSA 1B7DA 2KPYA 4YORA 1K6YA 4RWTA 3IKMA 4DSIA 3THYB 4HTUA 1PE4A 2HHSA 4A62A 4CJTA 3V9UA 4FOEA 3CM5A 2ETJA 4OGCA 1GLDG 1I39A 3FZMA 3O80A 3AGRA 4FM1A 3ULEB 4FJJA 3CD6N 1J9AA 1D9FA 4XJXA 3AVFA 1YHQN 1T6DA 2ATQA 1MYNA 2E20A 4CFBA 1QZ5A 1W0HA 3E9PA 1C55A 5HBMA 1ICAA 1E4FT 2LJ7A 1HYVA 1POIA 4E7KA 2KFNA 1GOAA 1CZ9A 3AO2A 1OMYA 4OKEA 3V9WA 5AQSA 1HX1A 5AQYA 4PKIA 4B1VA 3EL2A 1S6PA 4R79A 4M7XA 4JHDA 3QNOA 1WMTA 4JYAK 4DTRA 3O1WA 2OZSA 1JJ2M 4FJ5A 3H46O 4J2BA 1Q86O 1DQ7A 1ASUA 4HUFA 3C6HA 2QK9A 4BG8A 1S22A 2ASOA 4FJHA 5EXWA 2VG6A 2E0HA 2KHOA 4DTUA 2B68A 2F7TA 2YJFA 5C0YA 1RTJA 5GAEP 3JSMA 1KAXA 4DV2K 2ATBA 1YJWN 4N5SA 1XMOK 3ID8A 1ZC6A 2I7PA 5EU7A 1IG9A 4BC3A 4ELUA 2GV9A 1X9SA 1J6ZA 2A42A 2QKBA 1TKXA 3HSCA 4YDUA 4BVOA 4RTFD 2A6AA 2QM1A 3RR8A 3GL1A 4CK3A 2W42A 1BK8A 1AYJA 4W5RA 2F8SA 1ZXOA 4DFMA 2E4LA 4EZ6A 3F2KA 3VQ5A 1YT3A 5J2QA 2LN8A 1JL1A 1IV0A 4WF9L 2P9IB 3ID6A 3AVIA 3UKRA 2NUBA 3OYLA 3O5BA 2P5OA 2ASMA 3N4PA 3S3NA 4B9UA 2A7TA 2ZWHA 3G25A 1QQNA 1SN4A 5HP1A 3F73A 3DLBA 1BGXT 1SEGA 4DCHA 1VSFA 4Z4CA 4Z94A 3V6DA 1C0GA 4DFPA 2FLOA 3KC6A 2F96A 1X9MA 4BC5A 3ZX3A 1HNXK 5BPNA 3G4SN 4DR1K 2G8UA 3MN6A 4OPKA 5J2MA 4Z4EA 4KHSA 3CCUN 3ZT2A 4LSNA 4CEDA 3VGMA 4YOWA 3KKSA 4KH4A 2PBDA 1XWLA 1VQKN 5K14A 4FJNA 1K8KA 4M3YA 4Y1DA 1B9FA 4EP4A 4FJGA 2NRXA 4BRIA 2ZE2A 3WQTA 4ID5A 2EHGA 3D7EO 3KWGA 4KB1A 1NJZA 4BE0A 4NCAA 1WAFA 3NCIA 1H1VA 1D9DA 4RW8A 3M3ZA 1YXQA 1Z6RA 3LPTA 2DY4A 2C1GA 4KH5A 1NGFA 2P1JA 3DXKA 4NXNK 4E3SA 1LW0A 3VMFB 3C94A 4JRQA 3OBYA 4DQRA 3EN9A 3O3GA 2O8CB 3DRPA 4KTQA 1YI2N 4KH6A 3VQDA 3SV4A 3OYMA 1RBTA 2VG7A 3VEWA 4KAZA 1JLCA 4CCHA 4K8XA 1TVRA 3O4NA 4CJQA 1XC3A 4DQPA 4M42A 3UIQA 1TKDA 5CY0A 1ZBHA 4B9TA 4M63C 4CGDA 5JENA 4AEIA 4KI6A 4BDPA 3AVNA 3QIOA 4CJUA 1WLJA 4DQQA 3I56N 4AILC 4DV3K 4CD1A 4FJIA 1XMQK 3HPOA 3A0IX 3NH0A 1D4XA 2HHTA 5KRSA 3SQ1A 1N33K 3EO3A 2O4IA 5M1OA 4J2AA 1ZVEA 4BRNA 2GELA 4B9MA 5AQFA 4H0VB 3F5TA 1FKPA 3H1VX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3ZSY A;  2RKI A;  2HBJ A;  2FBT A;  1TK8 A;  3R9P A;  2Z1I A;  4WQ4 A;  3B6P A;  4FJL A;  4JI0 K;  4CEF A;  2BAN A;  3AVB A;  4CJ5 A;  3C0B A;  3DRS A;  1JXE A;  3VGK A;  4FK4 A;  2ZQB A;  1JZB A;  5AQP A;  3BUZ B;  3VEO A;  4WCE L;  3SV3 A;  3QFP A;  1VQ4 N;  2PYL A;  3LAL A;  1VRT A;  4B3M K;  2P9K A;  5F1X A;  2B6A A;  1SL0 A;  1NWK A;  5AQJ A;  4E7I A;  1U48 A;  1FXX A;  2VWK A;  4KB0 A;  3QDK A;  4FWQ A;  3P39 A;  1C0M A;  5AZI B;  1X3N A;  4L3Q A;  2QWO A;  3THW A;  4FWR A;  4B1Z A;  4AAZ A;  3PX0 A;  3NHG A;  4KPY A;  1IKY A;  4CES A;  4BR7 A;  3DLG A;  4FLU A;  1GOB A;  5CR4 A;  4BVP A;  3EYZ A;  3MWT A;  3LP3 A;  3DRR A;  2M8B B;  3ZT1 A;  3HI0 A;  3VQ7 A;  2G8F A;  4BR0 A;  1NGB A;  2QA4 N;  2FBV A;  3SPZ A;  2IVN A;  4HCB A;  4B3T K;  2OTJ N;  4KHP K;  4OGE A;  4QS8 A;  3RVC A;  3WNG A;  2VQF K;  1YJN N;  4E72 A;  4BGB A;  5KQD A;  4JRP A;  1NU0 A;  4YOV A;  1RBU A;  2NRV A;  3A2F A;  3K9K A;  3TSQ A;  3MK6 A;  1TYQ A;  5HRR A;  2GBZ A;  2MBK A;  4OVL A;  1IH7 A;  3SJJ A;  3Q7B A; 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