4FSVA

Crystal structure of a heat shock 70kda protein 2 (hspa2) from homo sapiens at 1.80 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
384
structure length
380
Chain Sequence
b'RGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a heat shock 70kDa protein 2 (HSPA2) from Homo sapiens at 1.80 A resolution
rcsb
molecule keywords Heat shock-related 70 kDa protein 2
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 120
structure length 380
sequence length 384
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4fsvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4fsvA04
5AQMA 3QDKA 4BVPA 1QZ5A 3O6WA 2ZGYA 4A61A 1E4GT 5KPZA 3DXKA 4CJ7A 3VGMA 3BP8A 2P9NA 4NB4A 1SAZA 1K8KB 3H1QA 4AM7A 1HLUA 3FGUA 2FF3B 5FPMA 5LJVA 4CZGA 4BG8A 1H1VA 4HTLA 5AQFA 5ELZA 3AAPA 2IVPA 4BRAA 4IZ9A 3ULEB 4QS8A 5FPNA 2GWJA 3M3ZA 3ZX3A 3O1BA 5JLFA 4FWRA 2ZF5O 2P9SB 5AQGA 3HSCA 2P9KA 3DJCA 2WUSA 1GLJO 4MLEA 1C0GA 1V4SA 2IVOA 4CZHA 3LL3A 5BPNA 4FSVA 4M63C 4MO4A 2NRHA 4M7XA 3QFUA 1GLDG 1WUAA 3UKUB 2Q0UA 4FWMA 1QHAA 3CI5A 5AQTA 4BGAA 2A5XA 4MLHA 1JCFA 2QWRA 3CHWA 4BRFA 4CD3A 3H6EA 4BRLA 5AQUA 2KHOA 1BDGA 3LDLA 5EVZA 4H5NA 2BTFA 2A40A 4BRCA 4B1ZA 4FWOA 4K41A 3DXMA 2GUPA 2E2OA 3SK3A 5AZJB 3H45C 1QQOA 3C7NB 3VF2A 3ZETB 4CZEA 1QQMA 1X3NA 3QICA 4JNEA 4A2AA 2QWNA 4IXCA 2GEMA 4BRIA 1MWMA 4BRGA 2P9PA 3BUZB 1HKCA 4CBWA 3VEYA 3VPZA 2ITMA 5BPLA 3MN5A 3U9ZA 3QMLA 3M1FA 3A0IX 2P9UA 4CZKA 2AA4A 4BG9A 3H3NO 3ATVA 1NGEA 5AQJA 4J8FA 5AFUA 4H03B 1QZ6A 4A2BA 1DKGD 2CGKA 5AQRA 4CD1A 2I7NA 4H0PA 3CJ1A 3FZMA 5AQNA 3UKRB 1P8ZA 3H46O 2D4WA 3MN9A 1HJOA 1TYQA 2ASOA 4O8KA 3FLCO 1T6CA 4DQ8A 2EWSA 2HF4A 4EIAA 1OKJA 1ATRA 1YUWA 3FFKB 3I8BA 4FPAA 4IJAA 3KVGA 4WQ5C 3W3DA 1XQSC 1GLEG 4BR0A 4CZLA 4FWPA 5BRHA 5ADXA 1TUUA 1HKBA 5LJWA 3MN7A 4RCHA 3L4IA 2E8AA 3EN9A 3FZFA 5KPRA 4B1WB 2P9LA 2BUPA 2DPNA 3MCPA 4XH1A 4BR2A 3L6QA 4E1JA 3M6GA 1V4TA 3WXKA 2D0OA 1BOTO 4NO7A 1ZXOA 5AQYA 3H3OB 4IWVA 3S41A 2E1ZA 5AQOA 3IDHA 4FWLA 4FWQA 4CZMA 4IO8A 1Z6RA 3EL2A 3CQYA 3OHRA 4H5RA 2D0PA 1Z05A 2A42A 2FXUA 4XH4A 5AQXA 3ULEA 4QS9A 5KPTA 2NLXA 4O5FA 2W41A 3MMVA 2PAVA 5EXWA 3H1VX 3DAWA 3LDQA 1HX1A 3VEXA 3LDOA 1GLAG 2H3GX 3VEWA 4JN4A 4BVOA 2Q1NA 1GLBG 2GWKA 2VCPA 4WQ4C 2A6AA 3EKSA 4IJNA 4AM6A 4BRQA 4RWTA 1XUPO 3UKUA 2QWLA 2P9IB 4FOIA 2PBDA 1RDWX 3WQTA 1JCGA 3D2FA 1NBWA 2Q0RA 3O4WA 4CZFA 1BA1A 2AP1A 3VETA 3KZBA 2E2QA 4BR4A 3DXKB 1GLLO 5BN8A 2CH6A 3A5LC 4BC2A 2P9NB 4L3QA 3UB5A 4BRNA 5I9EB 4FO0A 3TPQA 1NGDA 4FPBA 5AZJA 3C7NA 2QWPA 3WUHA 4BC4A 2YJFA 4ISFA 3VENA 3QBXA 1NGIA 3SLCA 1ATSA 2GELA 4Y0WA 2F9TA 3O1WA 3WQUA 4H5TA 2IIRA 3D2EB 3WXLA 5AQSA 1CZAN 1ESVA 4RTFD 2P9KB 2YJEA 3P4IA 4M7YA 1NGBA 2YHYA 4PKIA 1R59O 3VF6A 1IG8A 3ZX2A 3FE1A 4BRMA 1HPMA 3AY9A 3SMSA 3A5MC 3GBTA 3HM8A 3UKRA 1YVNA 2W40A 2Q97A 3HTVA 1YXQA 2V7ZA 4FL9A 4EHUA 1NMDA 4JHDB 4XEIA 3U8XA 4B1UB 5AZIA 3J8AA 5KQ8A 3A5OC 4CBXA 4CZJA 1NGFA 2QW9A 2E88A 2Q31A 4BREA 2YI1A 4F9OA 4I6MA 3GOIA 1U6ZA 4BRKA 2A41A 1E4FT 5EX5A 3VGLA 3TU5A 3ZEUA 3DXMB 5LY3A 5AQZA 3SMPA 4H0TB 3HZ6A 3GG4A 4H5VA 1BA0A 5AQVA 3EZWA 1BWFO 1S22A 1SZ2A 2P9PB 3LDPA 3R9PA 3R6MA 3G25A 3VESA 4HWIA 1U2VA 1HKGA 2Q2RA 2VWBA 2QM1A 3WEEA 5KQDA 3RSEA 2NZTA 4QS7A 2ASPA 1NGGA 2IVNA 3JS6A 4JD2A 1NGHA 4FWNA 1X3MA 3WXJA 4WQ5A 1GLFO 3AARA 3ENOA 3IMXA 2Q36A 3BEXA 5AFUH 2OANA 5AR0A 4H0VB 4EFHA 3CJ9A 1K8KA 1TYQB 4CZIA 3EKUA 4ISGA 4C23A 5AQKA 1C0FA 4BRPA 3QFPA 3AAQA 1T44A 1MWKA 3ATUA 4EAHD 3CJ7A 5BPMA 5EOYA 3VEZA 4ISEA 4BR7A 5JMVA 1S3XA 2FF6A 4XH5A 3HI0A 4A62A 3ENHA 3A5NC 1KAZA 3A8YA 4EHTA 2P9SA 2P9LB 3GL1A 3FZLA 1IJJA 5F2RA 5ADXH 2P9IA 2ZGZA 3D7EO 4B1XB 4BC5A 2ZWHA 2VYPA 2CGJA 1NWKA 1D4XA 1G99A 3U4LA 4BRDA 1NGAA 5AQWA 5BREA 4B1VA 3MDQA 3F9MA 4PKHA 1RGIA 4K42A 3U9DA 1T6DA 3CIPA 1XC3A 3WXIA 3MK6A 3KHYA 4JAXA 5AQQA 3O5BA 3IFRA 2CH5A 3DWLA 4BR9A 5E26A 5BR9A 4WQ4A 4PL7A 5AQIA 4FWKA 1KXPA 2HF3A 5AQPA 2CGLA 1JCEA 5BRFA 5JLHA 3CJCA 3O08A 4H0OA 3QBWA 3VERA 3D2EA 3ZETA 4DCHA 5BN9A 3VEOA 1J6ZA 1MA9B 2QWMA 3C0BA 4BRHA 4CBUA 2A3ZA 4BROA 4GY2B 4YDUC 4CI6A 3WT0A 3CJBA 4B1YB 1GLCG 1BO5O 1BU6O 2ASMA 4JHDA 5E84A 3R8EA 3D2FB 4PKGA 3ZX0A 5B8HA 3GE1A 5FPEA 3BF1A 3JXUA 4GNIA 2V51B 3MN6A 1NM1A 4BQLA 5EY4A 3CETA 1EQYA 3UE5A 3BF3A 1KAXA 4WYBA 4YDUA 2F9WA 1ZC6A 2QWQA 2QWOA 5AQLA 4MO5A 3VOVA 1YAGA 4H0YB 1BG3A 2HMPA 1NLVA 3LM9A 3L0QA 2E1YA 2GTDA 1QQNA 3CERA 1X9JA 3CJAA 3O80A 2YCHA 1LCUA 2YHWA 3EO3A 4FOEA 1RFQA 2UYTA 5FPDA 4K43A 4K25A 1TUYA 1SQKA 2E2PA 2HOEA 3B8AX 3IUCA 4H5WA 3SJHA 1BUPA 3O8MA 2FSNA 3ID8A 3QB0A 4PL8A 4LC9B 3W0LA 2QXLA 2FSKA 3LM2A 2P9UB 4KBOA 1LOTB 3I33A 2V52B 2E20A 4Z94A 4BR5A 5AZIB 1Y64A 2I7PA 2J4RA 3CQXA 1ATNA 4BGBA 1DEJA 2FLOA 4I6MB 2V7YA 2D1KA 4BC3A 3ZEUB 5F1XA 3VEVA 1KAYA 3GDQA 5BRDA 3VF4A 5CE3A 3VGKA 1NGJA 5F0XA 4FWSA 5JICA 1NGCA 4BQZA 4DHYA 1MDUB 2E2NA 1ZBSA 4H0XB 2FSJA 2YHXA 3FZHA 3HBTA 5TKYA 3LDNA 5AQHA 1HUXA 1U2VB 3WEEB 3FZKA 1DGKN 3RSEB 4B9QA 4DB3A 3FR0A 1WOQA 4JD2B 1Q18A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HHIA 1EKEA 3CCLN 1QZ5A 3HO1A 4Z4EA 3TAQA 1XWLA 3DXKA 4CJ7A 4NB4A 2B6AA 1K8KB 1ZUTA 2E2FA 1EETA 4O5BA 3T19A 1QVGM 1ZFUA 3FGUA 3LANA 5FPMA 3J80O 4UAEF 2JLEA 4BRAA 4CGHA 2IVPA 4DSFA 1OMYA 2GWJA 2YC1C 3M3ZA 3ZX3A 5JLFA 2EX3A 5AQGA 2X74A 4B3SK 1IKXA 3OJSA 1V4SA 4MDBA 1VRUA 4FSVA 2OZSA 3OS0A 1GLDG 1WUAA 5JVGL 4KFBA 3UKUB 2VQFK 1TK0A 4BGAA 1S72N 3OYJA 3THXA 4JI7K 1NU0A 4KYPA 3VQEA 3LDLA 1SEGA 3MX2A 5EVZA 2A40A 2GUPA 2E2OA 3H45C 4ELTA 3DLGA 1JLAA 3CM5A 1QQMA 4IFYA 4IXCA 4V1DC 5CZ1A 1LQQA 2GEMA 1MWMA 4BRGA 1N33K 2P9PA 1NH5A 4JI1K 3KHWA 5BPLA 5J2MA 5KTQA 4DR6K 2QXFA 4CHOA 2AA4A 4OLAA 3H3NO 4B3OA 5AQJA 5AFUA 3OJUA 1QZ6A 2DY4A 4KPYA 3L2QA 5AQRA 4M3RA 3S5TA 4H0PA 3CJ1A 3FZMA 3AO5A 1A5XA 3S9HA 4KI6A 1P8ZA 3H46O 2LT8A 2D4WA 1HJOA 1RT1A 1P90A 2ASOA 4CJ3A 1T03A 3FLCO 1D5AA 2O8EA 1T6CA 1Y97A 2HBKA 2HF4A 3U3YA 1ATRA 2OTLN 3I8BA 4FPAA 3TSPA 1XQSC 1GLEG 4DQRA 4DTXA 4FWPA 3T69A 4ELVA 1RILA 4JRPA 4JYAK 1BI4B 4RCHA 3KIOA 2BH1A 2IGIA 4B1WB 2DPNA 4CIFA 1NJYA 4BR2A 1FH3A 4CHYA 3QESA 3M6GA 3WXKA 3OS2A 1C0TA 4DFMA 1J9AA 3OBYA 5HRSA 4IO9L 3S41A 4NLBA 5AQOA 1WSJA 2OPQA 4U7BA 3DMJA 1CN2A 1Z6RA 2O8BA 3SBGA 2LY5A 1Q8IA 3AO1A 5J2PA 4W5NA 1Z05A 4XH4A 5GAGP 3V81A 4CHPA 3CFRA 5KPTA 3MMVA 1NK0A 4TSXA 4DTNA 1QS4A 5EXWA 1HNZK 2W6LA 4CGIA 3KP1A 3QETA 3LDOA 5JS2A 5HRRA 4IFEA 3LDSA 4BDZA 2Q1NA 2GWKA 2MN5A 1RCHA 2X78A 3VA0A 3B6PA 3BY5A 4CJ4A 4AM6A 4BRQA 1GOBA 4RWTA 4AB0A 3QNOA 2P9IB 4BDYA 4UAFE 1UGLA 1KD1O 3D2FA 4M3UA 3V9XA 1O13A 1NBWA 1LWCA 3OYFA 3WNFA 2OYQA 3DXKB 4DV7K 3AVGA 3V9UA 4JS5A 3UB5A 2OPPA 4CEOA 4FO0A 4RG8A 3L2VA 4YFUA 5M1QA 4FPBA 2QI2A 1PE4A 2KBHA 3VENA 1HMVA 4FM2A 1ATSA 1I94K 2F96A 4Y0WA 2HHQA 2YHBA 3WQUA 3D2EB 4KHQA 4RTFD 3P4IA 4CJUA 4M7YA 3VF6A 4BACA 2HHHK 1IG8A 3JYTA 1JKZA 3CC2N 1NG9A 2A1SA 3OYHA 4CK2A 3A5MC 4Z4CA 3UKRA 3HTVA 4EHUA 3O3HA 4B1UB 1M90O 4DUYK 2GX9A 3CXCM 3THXB 1C0MA 1TAQA 4F9OA 4CHQA 5M1FA 3QEIA 3ZEUA 5LY3A 3J7ZO 2NRZA 2YNGA 4WFBL 4KHSA 2G8FA 3GG4A 3EZWA 1S22A 4NCGA 4KB1A 4E7IA 2P9PB 2YKNA 4OKKA 2F8TA 2ZE2A 3G25A 4HWIA 3AV9A 3L8BA 4JK9A 2QM1A 5KQDA 2NZTA 3KTQA 1NGGA 4JD2A 3ASMA 4HCCA 4FWNA 4B9SA 3CCEN 4NCBA 4WQ5A 3IMXA 1IBKK 1SNBA 3SV3A 4QOZB 1LQIA 1SS6A 3AO4A 5AR0A 2Z1HA 3NF7A 4DR2K 2PYJA 3CJ9A 4AQYK 1TV6A 3TAMA 4LSLA 5H1SQ 1SN4A 2MZ0A 4FYDA 2O8EB 5AQKA 4BRPA 3H08A 4EAHD 4E7KA 5BPMA 4CEEA 4JK7A 3VEZA 4FLZA 3UIQA 4ISEA 4FLUA 1ZU3A 4KH4A 2F4VK 4XH5A 4C8MA 5KK4A 3HI0A 3M8RA 3ZT4A 4DV1K 1SL1A 1X9SA 3ZYYX 4GVMA 5LMUK 4ZHRA 4WCEL 1KV0A 5F2RA 1IJJA 5C2FA 2UU9K 3D7EO 4BC5A 4HUGA 3PIPL 4JKBA 1QVFM 1YHQN 2ZQBA 1LQHA 3KOXA 1G99A 4BRDA 4DR1K 3P39A 4C8NA 4H4OA 4B3TK 1TKDA 3F9MA 4PKHA 4K42A 3MK6A 3V9ZA 3KHYA 1VQON 4FM0A 2IAJA 1KRPA 2O8BB 4JAXA 3EEQA 2P1JA 4YOWA 4YOVA 1BMRA 4BR9A 3VA3A 2MBKA 2G8HA 2OPSA 5E26A 4WQ4A 5AQIA 2CGLA 5BRFA 3D45A 1ZYWA 3DLRA 4C8OA 4DCHA 3SUQA 3T1HK 1L3UA 4CEBA 3KKRA 4LFCK 1LWEA 1ZVGA 3E01A 4K8XA 3KD1E 4GY2B 1KTQA 4CI6A 4CF1A 1FKPA 3CJBA 1GLCG 3SQ1A 1CLQA 2G8UA 1RT6A 4B8AB 4CF9A 4LF4K 5E84A 4BWMA 3D2FB 1L3VA 5J2NA 5FPEA 4JKDA 3BF1A 3JXUA 4HCBA 3VQ7A 4YOXA 3CETA 4AHUA 2JGUA 3BF3A 3T7ZA 2QWOA 1U45A 1HYSA 3BGRA 4LF9K 3VQBA 1JXBA 2QKKA 2WBNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2HHI A;  1EKE A;  3CCL N;  1QZ5 A;  3HO1 A;  4Z4E A;  3TAQ A;  1XWL A;  3DXK A;  4CJ7 A;  4NB4 A;  2B6A A;  1K8K B;  1ZUT A;  2E2F A;  1EET A;  4O5B A;  3T19 A;  1QVG M;  1ZFU A;  3FGU A;  3LAN A;  5FPM A;  3J80 O;  4UAE F;  2JLE A;  4BRA A;  4CGH A;  2IVP A;  4DSF A;  1OMY A;  2GWJ A;  2YC1 C;  3M3Z A;  3ZX3 A;  5JLF A;  2EX3 A;  5AQG A;  2X74 A;  4B3S K;  1IKX A;  3OJS A;  1V4S A;  4MDB A;  1VRU A;  4FSV A;  2OZS A;  3OS0 A;  1GLD G;  1WUA A;  5JVG L;  4KFB A;  3UKU B;  2VQF K;  1TK0 A;  4BGA A;  1S72 N;  3OYJ A;  3THX A;  4JI7 K;  1NU0 A;  4KYP A;  3VQE A;  3LDL A;  1SEG A;  3MX2 A;  5EVZ A;  2A40 A;  2GUP A;  2E2O A;  3H45 C;  4ELT A;  3DLG A;  1JLA A;  3CM5 A;  1QQM A;  4IFY A;  4IXC A;  4V1D C;  5CZ1 A;  1LQQ A;  2GEM A;  1MWM A;  4BRG A;  1N33 K;  2P9P A;  1NH5 A;  4JI1 K;  3KHW A;  5BPL A;  5J2M A;  5KTQ A;  4DR6 K;  2QXF A;  4CHO A;  2AA4 A;  4OLA A;  3H3N O;  4B3O A;  5AQJ A;  5AFU A;  3OJU A;  1QZ6 A;  2DY4 A;  4KPY A;  3L2Q A;  5AQR A;  4M3R A;  3S5T A;  4H0P A;  3CJ1 A;  3FZM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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