4FSVA

Crystal structure of a heat shock 70kda protein 2 (hspa2) from homo sapiens at 1.80 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
384
structure length
380
Chain Sequence
RGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock-related 70 kDa protein 2
publication title Crystal structure of a heat shock 70kDa protein 2 (HSPA2) from Homo sapiens at 1.80 A resolution
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 120
structure length 380
sequence length 384
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4fsvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4fsvA04
3LDLA 4IJNA 5AQUA 3CJBA 1C0FA 3VETA 3A0IX 3FZFA 3CQYA 4DHYA 4CD1A 4IO8A 2IVNA 1GLBG 3MDQA 3WEEA 3A5MC 1J6ZA 5I9EB 4BRPA 3R8EA 5BRHA 2CGLA 3BEXA 5B8HA 2I7NA 3VGMA 1KAYA 1NGFA 1GLLO 4NO7A 4QS7A 4ISEA 1TYQB 3ZX3A 2P9KA 3H1VX 3VEVA 2W40A 1BU6O 4BRGA 3DWLA 4M7YA 1D4XA 5E26A 4FWPA 3QFPA 3ZX2A 3UB5A 2E2QA 3VOVA 3VGKA 3FZMA 1V4TA 2IIRA 3WQTA 4A61A 3MN6A 4IZ9A 2E1YA 1ATRA 1JCFA 1HPMA 1T6DA 4RCHA 1MWMA 5AQOA 5ADXA 4CD3A 3WXJA 2KHOA 3VF4A 2D0OA 2FSNA 1LOTB 1BWFO 4I6MA 4JNEA 4BRCA 1ESVA 3CJCA 3VENA 3LDOA 2F9WA 3C0BA 3BF1A 4WQ5C 2GTDA 4JN4A 5BREA 3LM2A 3VF2A 3BP8A 1JCGA 3EO3A 3FZKA 1XUPO 3I8BA 3ZX0A 3DXMB 3VERA 1Z6RA 4JHDB 4MO5A 5AQNA 4BG8A 2HMPA 1SZ2A 3L0QA 4B1YB 1ZXOA 2IVPA 4DB3A 3ENOA 3LL3A 3A5LC 2P9UB 5AZIA 2VWBA 3CIPA 5AQIA 5LJVA 3CJ1A 3SLCA 4A2BA 4HWIA 2VYPA 4H5RA 2A41A 3SMSA 3HI0A 4H5VA 1NGGA 2YHYA 5AQSA 2P9UA 3WUHA 2YJEA 3HM8A 5BRFA 2CH5A 1ATNA 3CJ7A 3AY9A 3SK3A 3GDQA 3VEOA 4NB4A 4BC3A 3P4IA 2ZGZA 3CJAA 2P9PB 1GLAG 3EKSA 3UE5A 5AZJA 4IXCA 4A2AA 2QW9A 3GL1A 3FZLA 2IVOA 4BR4A 2A6AA 4XH4A 2QM1A 4BRLA 4BRDA 2P9PA 3CHWA 3FE1A 1GLCG 5AQXA 2EWSA 3OHRA 2QWMA 2FF3B 2P9SB 4H0TB 1HJOA 3H1QA 4B1ZA 1U2VA 4B1UB 5EXWA 1X3NA 3QFUA 4H0XB 1BG3A 3UKRA 3U4LA 4WQ4C 3O8MA 3IFRA 4RTFD 3MN7A 2P9SA 3JXUA 2GWJA 2YJFA 3A8YA 1P8ZA 3ENHA 1NGJA 1R59O 3HZ6A 3QDKA 1JCEA 1NMDA 2W41A 5FPMA 1BDGA 3D7EO 3FGUA 4K25A 2OANA 5JICA 3A5NC 1NGCA 1DGKN 2Q0UA 5KPTA 3O08A 1H1VA 2YI1A 4AM6A 1TYQA 2QWLA 1YVNA 3UKUB 3FFKB 5BPLA 1Y64A 5AQFA 3W3DA 4CZLA 4CBUA 2FF6A 4FOEA 3AAPA 3U9DA 4BG9A 4F9OA 3MN9A 1E4FT 3BF3A 2A5XA 4EIAA 3M6GA 2GUPA 4FWRA 2QWQA 1T44A 3UKUA 1GLEG 4BR0A 2H3GX 4QS8A 3KHYA 4FWOA 4H5NA 1GLFO 4BR9A 3G25A 3W0LA 4BRIA 5AQMA 3MK6A 4BRFA 2ASMA 4H5TA 1RDWX 4FWNA 4AM7A 5JLHA 5LJWA 4JAXA 2CGKA 5F2RA 3VEYA 3D2FB 1LCUA 4H0YB 3GG4A 4WQ5A 4CZFA 1TUUA 1NGBA 3O80A 5KPZA 2P9LB 3EN9A 4H0OA 2Q31A 1Z05A 3I33A 3ZEUB 5FPDA 3VPZA 2A3ZA 1HKCA 4CI6A 4FO0A 4Z94A 3R6MA 1QQOA 2P9LA 4FWQA 2YHXA 5AQJA 4O8KA 1QZ5A 1KXPA 5AQYA 3CI5A 3D2EB 2P9IB 2Q36A 3A5OC 2A42A 1S3XA 1GLDG 3MMVA 4CJ7A 1NLVA 3GOIA 3QBXA 3DXMA 1GLJO 1K8KB 5TKYA 4BR2A 4JHDA 5AQZA 2D0PA 2GWKA 4E1JA 2UYTA 5AR0A 4CZMA 4BGAA 3DAWA 1IJJA 1NGEA 5JLFA 4K41A 3VF6A 3O4WA 4FPAA 5AQHA 1HKBA 4B9QA 4K42A 3M3ZA 1DEJA 4PL7A 3CETA 2GELA 4H5WA 4B1XB 4LC9B 3TU5A 4J8FA 4DQ8A 3H6EA 3L6QA 2GEMA 3FLCO 2AA4A 3ULEB 1HKGA 2HF3A 4DCHA 3O6WA 3EKUA 5AQTA 2P9NB 2NRHA 3WXKA 4PKIA 2E2NA 1YAGA 4CBWA 3VEWA 3ULEA 5BN8A 1BOTO 2BTFA 3QICA 4BC5A 2F9TA 1KAXA 1NGDA 3S41A 4EHTA 1KAZA 1WOQA 4CZJA 1YXQA 4RWTA 5EVZA 5BPMA 1WUAA 2Q0RA 5EOYA 1ZC6A 4WQ4A 4PKGA 3KZBA 2ZGYA 4BRQA 4EAHD 2YHWA 2E2OA 2E8AA 5ELZA 4B1WB 5F1XA 2V52B 4BRAA 3H46O 2Q97A 4FWKA 1NBWA 2V7ZA 4MLEA 3F9MA 2QXLA 5AQQA 3HSCA 3DXKB 3M1FA 2I7PA 3WEEB 3H3OB 3QMLA 3MCPA 4BR7A 1BUPA 2FLOA 2ITMA 3DXKA 3B8AX 1RFQA 2PAVA 3BUZB 3ATUA 1CZAN 1OKJA 2V7YA 4O5FA 1DKGD 2P9KB 4H03B 1IG8A 4C23A 3GE1A 4IJAA 2FXUA 3LDNA 2ASOA 1BA0A 3WT0A 4FPBA 1X9JA 3H3NO 3CERA 2NLXA 4ISGA 5KQ8A 2QWOA 3CJ9A 5AFUH 3VGLA 4BVPA 1ZBSA 1NGIA 2YCHA 4CZIA 1BA1A 4BC4A 3ID8A 3SMPA 5FPEA 4H0VB 4FWSA 4XH5A 2A40A 3MN5A 4K43A 3TPQA 5CE3A 4CZHA 3O1BA 3RSEB 3L4IA 2ASPA 2BUPA 4I6MB 1NGHA 2HOEA 1SQKA 1V4SA 4PL8A 3QBWA 3R9PA 3D2FA 4KBOA 1X3MA 4BRHA 3LM9A 3H45C 4BQLA 2D4WA 2Q2RA 3VESA 1XQSC 5BRDA 2DPNA 3RSEA 3SJHA 4JD2B 2E2PA 5JMVA 3CQXA 3ZEUA 1ATSA 1U6ZA 4FOIA 2E1ZA 4HTLA 5FPNA 2FSKA 4A62A 1G99A 4JD2A 5AQWA 4FWMA 4Y0WA 2Q1NA 1SAZA 3D2EA 2P9IA 1E4GT 1QQMA 5AQRA 2AP1A 5KPRA 3FZHA 4FL9A 4PKHA 1QQNA 1TUYA 1NGAA 1Q18A 4MO4A 1K8KA 5AQVA 1HLUA 5AZIB 5KQDA 4XH1A 4BRMA 5AQGA 2E20A 5AQKA 3DJCA 4EHUA 5E84A 4FSVA 4XEIA 2FSJA 4L3QA 3WXIA 3JS6A 4MLHA 4ISFA 4BRKA 5BN9A 3IMXA 5EX5A 3AAQA 2ZWHA 5EY4A 4M63C 3IUCA 2CGJA 2E88A 4QS9A 1BO5O 3WQUA 3WXLA 4CZEA 1NWKA 2D1KA 1HX1A 5AQLA 4BROA 3HTVA 2QWPA 3ZETB 1RGIA 2HF4A 2QWRA 5BPNA 3ATVA 4H0PA 5ADXH 1QZ6A 2P9NA 5AFUA 1NM1A 3U8XA 2ZF5O 5F0XA 3GBTA 1MA9B 4CBXA 5AZJB 3ZETA 5BR9A 4GY2B 3FR0A 4GNIA 5AQPA 2VCPA 2J4RA 3LDPA 4BREA 3C7NB 3EZWA 3U9ZA 2QWNA 4EFHA 3VEXA 4BRNA 2PBDA 3HBTA 4M7XA 1XC3A 3C7NA 1S22A 4BR5A 1U2VB 1MDUB 4BQZA 2CH6A 4BVOA 3O5BA 1MWKA 3UKRB 5LY3A 1QHAA 3EL2A 4WYBA 4IWVA 3LDQA 1EQYA 2WUSA 3VEZA 1HUXA 3O1WA 4YDUA 1YUWA 4B1VA 4BGBA 1C0GA 1T6CA 2V51B 4YDUC 2NZTA 3KVGA 4FWLA 4BC2A 3AARA 4CZGA 3IDHA 4CZKA 3J8AA 3QB0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NJWA 3A0IX 1SNBA 4OPKA 4IO8A 3WEEA 3WNGA 4FXDA 4DR1K 4DV2K 1JLCA 5BRHA 4CEOA 1XWLA 2CGLA 2ETJA 4DF4A 1X9WA 1NGFA 1GLLO 4NO7A 1LW2A 3KHWA 3G10A 2I5JA 2W40A 3DWLA 1XMQK 4M7YA 3KK2A 3QFPA 1ZYVA 5HBMA 1OH6A 2WC9A 4BEBA 1WSFA 3ASMA 1RTHA 4O44A 3HOTA 3QESA 2KKZA 3ZT0A 1T6DA 1KLNA 3AVLA 1VSEA 5FRMA 3QEPA 1JZAA 2BANA 4JKHA 1LOTB 5KI6A 3SQ1A 3AO4A 3T3FA 2LSNA 2KPYA 4CFCA 4CIEA 4M42A 3LDOA 1J53A 4IDHA 2FBVA 4JN4A 4CGDA 5BREA 1KQSM 3ZSWA 2G8WA 3E1YA 5M1PA 3AVMA 1Y97A 3EO3A 1RBTA 3WNEA 4CGFA 1LAVA 4CJEA 4Q5VA 1EO1A 3ZSVA 1GPTA 4JHDB 1VRTA 4FLUA 3R3LA 4PUOA 4DTXA 1SZ2A 4DS5A 4W5NA 3QNNA 2E5LK 1BMRA 2A7TA 1BGXT 1LWCA 2P9UB 2VWBA 4O5BA 5AZIA 2P5GA 3E66A 1IV0A 4A2BA 3SAHA 2VYPA 4H5RA 3HI0A 4H5VA 1NRBA 1NGGA 3NAEA 4ID5A 1DQ7A 2E6MA 3CFOA 4OGCA 1DT9A 2YJEA 3KTQA 3ZYYX 2JWLA 5BRFA 2CH5A 3AA3A 1ATNA 4CW7B 4C8MA 1NK8A 3HK2A 3SK3A 1B9DA 3VEOA 3AVNA 4DV4K 3SZ2A 4FM0A 3AA5X 3EKSA 3VQQA 1RT4A 4N5SA 1VQ5N 2O8EB 3GL1A 3FZLA 4BR4A 2QM1A 3CHWA 1GLCG 4B3OA 3RWUA 4J2EA 4UQGA 1U2VA 1Q7YO 4CCHA 4B1UB 5EXWA 3NF7A 3UKRA 4WQ4C 1X1PA 2VG6A 4A59A 4DFPA 3JXUA 4HHFA 5DMRA 2O4GA 2YJFA 1VSKA 1VSIA 4JKAA 3OJSA 4DFJA 4DR3K 3ENHA 1R59O 3HZ6A 4DTRA 1XNQK 3NH0A 1BDGA 3MAQA 3MWTA 1ITGA 1D8YA 1VSLA 4B08A 4R79A 3KWIA 2GL1A 3V1RA 1KVAA 1S72N 4IOXA 4O55A 2NNWA 4CJLA 3FFKB 4CZLA 4CBUA 4E3SA 2X78A 3U9DA 2HNDA 5J2QA 5DM7L 1FH3A 1YI2N 4JI5K 4KREA 1GLEG 1IO2A 3NH2A 4KTQA 4H5NA 4CFAA 3G25A 3W0LA 5AQMA 2NRVA 3VQPA 1TI5A 5LJWA 4JAXA 4DMNA 3VA3A 4EP5A 2VQEK 3K57A 3KOYA 4CZFA 1RDCA 1N32K 1FK9A 3QI7A 2P5OA 3O4NA 5FPDA 4I7FA 4FO0A 3C94A 4JI4K 3V9SA 4O8KA 5AQYA 2A1SA 4LD0A 1VQ4N 2EX3A 2NRXA 3O9TA 1S3XA 3U3GA 4E1NA 2RE2A 3LALA 5CZ2A 5AJ3K 5TKYA 4A5AA 4Z4GA 4BR2A 4F3TA 4JHDA 2GWKA 4E1JA 1NMNA 2UYTA 5J2PA 5BR8K 1YJNN 1KTQA 4DSLA 3NF8A 4K41A 4FPAA 5AQHA 3V81A 2FBXA 3DMJA 5GADP 1UAXA 2YKMA 1QS4A 3VMFB 2MBKA 3OW2M 3L6QA 4CEEA 4X65K 4ELTA 1YF5L 2OPRA 3O6WA 3EKUA 5AQTA 2NRHA 1EWQA 4CBWA 1W97L 1B9FA 3VEWA 3VA0A 5BN8A 1BOTO 5I42A 4BC5A 3TANA 3K9KA 3TSQA 1WBDA 3RVCA 1WOQA 4CZJA 4DR6K 1WUAA 4ZTJA 4A57A 3O3GA 1CZ9A 3WXMB 2Q0RA 1S6QA 2BRZA 1DTTA 2X6NA 4CEDA 4IEEA 1BQNA 1Q86O 2UUAK 2GUIA 4DUZK 1GOAA 2V7ZA 1C1BA 4MLEA 3KC6A 4CGJA 4LF9K 2XO7A 2Y1IA 2DFHA 4CGHA 4Z4HA 3SPZA 3MXMA 1QTMA 4KI4A 4RW4A 1IH7A 4M3WA 3RR8A 3B8AX 5KGWA 1T03A 1CZAN 2ZJPL 4O5FA 3LZJA 4B9VA 1IG8A 2QTDA 2YNIA 2UUBK 1A5WA 2ASOA 1NH5A 1IKWA 5H1SQ 3THVA 5TKWA 3H3NO 3OTOK 1WB9A 3CERA 3G6EN 4ISGA 3CCVN 3KP0A 3I0RA 5AFUH 1ZBSA 4N41A 4YOVA 4YHHK 3OYFA 1CZBA 3RMBA 4NLBA 2YV0X 1VQLN 3ID8A 3V9WA 4GV6A 1VQ8N 3LPTA 4I6MB 3IKMA 2BUPA 1NGHA 2HOEA 2G8UA 4FYDA 1U04A 2VGNA 3R9PA 4LF8K 4X62K 1S5JA 4BQLA 2MN5A 2D4WA 2FC0A 1XQSC 1SL1A 1K8BA 3RSEA 4KRFA 3SJHA 3J7AP 2E2PA 5JMVA 2UXCK 3TAMA 4CF1A 2ATQA 5CY4A 4LF5K 2E1ZA 4HTLA 5FPNA 2FSKA 4A62A 4YNQA 4FWMA 5AQRA 4CE9A 5HRSA 1QVGM 3T1YK 4FL9A 1WSJA 5SWMA 3BDPA 1Q18A 4MDBA 4H4OA 1BQMA 4FLXA 3HXMA 3ISNC 5AQGA 5CY0A 3TAFA 1TK0A 4HUFA 4FSVA 4CEFA 4XEIA 4DLEA 2MZ0A 3AO2A 4ISFA 4CJFA 4DU1A 1S1TA 3AAQA 4OPJA 4B9MA 2YNHA 3IUCA 1OZZA 4CK1A 2E88A 3IAYA 1YTUA 3HOSA 5CHIA 1CHZA 3AO3A 4C8NA 4DR4K 1HX1A 4DS4A 2KBKA 1DLOA 1KVCA 1RBSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1NJW A;  3A0I X;  1SNB A;  4OPK A;  4IO8 A;  3WEE A;  3WNG A;  4FXD A;  4DR1 K;  4DV2 K;  1JLC A;  5BRH A;  4CEO A;  1XWL A;  2CGL A;  2ETJ A;  4DF4 A;  1X9W A;  1NGF A;  1GLL O;  4NO7 A;  1LW2 A;  3KHW A;  3G10 A;  2I5J A;  2W40 A;  3DWL A;  1XMQ K;  4M7Y A;  3KK2 A;  3QFP A;  1ZYV A;  5HBM A;  1OH6 A;  2WC9 A;  4BEB A;  1WSF A;  3ASM A;  1RTH A;  4O44 A;  3HOT A;  3QES A;  2KKZ A;  3ZT0 A;  1T6D A;  1KLN A;  3AVL A;  1VSE A;  5FRM A;  3QEP A;  1JZA A;  2BAN A;  4JKH A;  1LOT B;  5KI6 A;  3SQ1 A;  3AO4 A;  3T3F A;  2LSN A;  2KPY A;  4CFC A;  4CIE A;  4M42 A;  3LDO A;  1J53 A;  4IDH A;  2FBV A;  4JN4 A;  4CGD A;  5BRE A;  1KQS M;  3ZSW A;  2G8W A;  3E1Y A;  5M1P A;  3AVM A;  1Y97 A;  3EO3 A;  1RBT A;  3WNE A;  4CGF A;  1LAV A;  4CJE A;  4Q5V A;  1EO1 A;  3ZSV A;  1GPT A;  4JHD B;  1VRT A;  4FLU A;  3R3L A;  4PUO A;  4DTX A;  1SZ2 A;  4DS5 A;  4W5N A;  3QNN A;  2E5L K;  1BMR A;  2A7T A;  1BGX T;  1LWC A;  2P9U B;  2VWB A;  4O5B A;  5AZI A;  2P5G A;  3E66 A;  1IV0 A;  4A2B A;  3SAH A;  2VYP A; 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