4FSVA

Crystal structure of a heat shock 70kda protein 2 (hspa2) from homo sapiens at 1.80 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
384
structure length
380
Chain Sequence
RGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of a heat shock 70kDa protein 2 (HSPA2) from Homo sapiens at 1.80 A resolution
rcsb
molecule keywords Heat shock-related 70 kDa protein 2
total genus 120
structure length 380
sequence length 384
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4fsvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4fsvA04
3H3NO 3VEOA 3D7EO 2W40A 5AZIB 3QFUA 3H45C 4BRMA 1T6DA 4K43A 1GLCG 3I8BA 2PAVA 4BRFA 2GELA 3U9DA 4B1UB 3DXMB 1NGHA 2E2OA 1RDWX 3VETA 3W3DA 1EQYA 1U2VA 3CJBA 4H5TA 5ELZA 4BR2A 2P9KB 3O6WA 5AQXA 3QB0A 3CERA 2FSKA 5AQLA 4FSVA 4BC2A 1BOTO 3A5MC 3DJCA 4CZHA 2YJEA 5CE3A 4H5NA 2ZWHA 3DAWA 2HF3A 4CZJA 3MMVA 2QWOA 1WOQA 4MO4A 3UKUA 2QXLA 1T6CA 5JMVA 4CZEA 2Q1NA 2IIRA 1NBWA 4BG9A 4PL7A 2ZGZA 2D0OA 2QWNA 2HMPA 5BPLA 1NGBA 2P9UB 1NWKA 1SAZA 4NO7A 5BPNA 4BG8A 1LCUA 3MDQA 5KQDA 2Q31A 3HZ6A 5AZIA 5AQWA 4H0PA 3J8AA 4M7XA 1MWKA 3DXMA 3O80A 4YDUA 1ATSA 5EXWA 2EWSA 5AFUA 3UE5A 1HKBA 1YXQA 2P9KA 3FGUA 2FXUA 4K25A 1Z05A 1NGJA 1HLUA 3U9ZA 3IUCA 3VGMA 1WUAA 3ZX0A 4BR7A 3O08A 4RCHA 2BTFA 3LL3A 3LDQA 3A5LC 1MA9B 4PKHA 1G99A 2QW9A 2F9TA 3VPZA 4C23A 4FOIA 1Z6RA 3MN5A 5AQUA 3O8MA 1NGDA 3AAQA 4H0TB 2P9UA 2CGJA 3IMXA 5JLFA 3S41A 4FWRA 1NGEA 4NB4A 4CBXA 3QBXA 2DPNA 4FWLA 1NGFA 5BRFA 4YDUC 3R8EA 5I9EB 3D2FA 4K42A 3EKUA 3G25A 3LDLA 3F9MA 3FLCO 1XC3A 4EHTA 3H1VX 3EL2A 3VEVA 3WXLA 1QHAA 4H5RA 4AM6A 3AARA 1YVNA 4B1ZA 3SJHA 3WT0A 1BA1A 4CD1A 4F9OA 1YAGA 3W0LA 3LM9A 1NGIA 1XQSC 4BRPA 2V52B 4Y0WA 4XH1A 1TYQB 5FPNA 2FLOA 4BC5A 4EHUA 2P9SA 1U6ZA 2A3ZA 5EVZA 4L3QA 5AQYA 4JNEA 5AQSA 3KVGA 4PKIA 3BF1A 3AAPA 1DKGD 3LDOA 2PBDA 5KPZA 3FZMA 4BC3A 3EN9A 3C7NA 2P9NB 2E1ZA 1R59O 3UKUB 4XH5A 5BRHA 4BVOA 3WUHA 3WEEB 2E2NA 4PL8A 4Z94A 3U4LA 4DB3A 1NGGA 3MN7A 1QQMA 2QWPA 4BRHA 5BN9A 3VF2A 1DGKN 3VENA 5AR0A 1KAXA 3GBTA 1ESVA 5AQZA 1K8KB 2Q36A 5ADXA 2BUPA 5AQNA 4GY2B 1TYQA 4O5FA 1GLLO 3UKRB 1T44A 4WQ4C 1V4SA 1MWMA 2FF3B 2Q0UA 5JICA 4J8FA 3WXIA 5LY3A 5FPDA 1S3XA 3VOVA 2A42A 3RSEB 3R9PA 3GE1A 2P9NA 1H1VA 5AQVA 1C0FA 1CZAN 4XEIA 1E4GT 1X3NA 3CJAA 3B8AX 1YUWA 3WEEA 1QQNA 3ZETB 1ZBSA 2OANA 4CZIA 3FZKA 1IG8A 5BN8A 4A62A 1BG3A 3LDNA 2CH6A 2GWJA 2NZTA 1X9JA 2I7PA 1KAZA 3ZEUB 1GLEG 2E2PA 4H0YB 4BR4A 3WXKA 1K8KA 4BR9A 3EKSA 3D2FB 3FZLA 2GEMA 2ASPA 5BRDA 4LC9B 4B1XB 3CJCA 3HM8A 3LM2A 1HUXA 4BROA 4H5VA 4PKGA 1HKCA 4H0OA 5TKYA 3UKRA 1ZXOA 1GLAG 3QBWA 2GUPA 3VEWA 4HTLA 2V7YA 1E4FT 3IFRA 4QS9A 3CQYA 2P9IB 3MCPA 3RSEA 4GNIA 4BRKA 2I7NA 2IVPA 3MN6A 4FPBA 1DEJA 2ZF5O 4B1WB 2P9SB 3ZETA 5AZJB 2HOEA 4CZFA 3CJ1A 5AQOA 3VESA 4FWPA 1LOTB 3C7NB 3WXJA 1TUUA 3ZEUA 2YHWA 2V51B 5E26A 3VF6A 1NM1A 4M7YA 3CETA 3QICA 4BRNA 2YI1A 3H3OB 1BA0A 1RFQA 1X3MA 3VGKA 5E84A 2A6AA 4FO0A 1C0GA 1TUYA 3MN9A 3VERA 3ULEB 4A2BA 2CGKA 4FWNA 1QZ6A 4CI6A 2Q0RA 1BDGA 2P9IA 3A8YA 4CZKA 4M63C 3HSCA 2QWMA 2ASMA 3EO3A 3WQTA 4BRQA 4I6MB 2P9LB 3DXKB 1SZ2A 3CHWA 3FR0A 3QMLA 5AQJA 5EY4A 2A41A 2P9PB 5AZJA 4H5WA 1BUPA 4JD2B 2QWRA 4IWVA 2E1YA 2FF6A 3HTVA 3FZFA 2NLXA 5FPEA 3MK6A 1GLBG 4WQ4A 3A5NC 2CGLA 3ULEA 2A5XA 3HI0A 3BF3A 1KAYA 1OKJA 3ID8A 5AQKA 3EZWA 4FL9A 1Y64A 1ZC6A 3ENOA 3DWLA 4FOEA 3VEXA 4WQ5C 5AQIA 4ISGA 5AQRA 3LDPA 4RWTA 3H1QA 1RGIA 3FFKB 2P9LA 4FWMA 3DXKA 4I6MA 1V4TA 3BP8A 3D2EA 4FWQA 4B1VA 2P9PA 1NMDA 4BQZA 4CZMA 4FWSA 4JD2A 3L6QA 1JCGA 3CI5A 3CIPA 4BRGA 4EFHA 5AQPA 3TPQA 4BRAA 5AQTA 2W41A 3JS6A 3O5BA 4H03B 2QWLA 4JHDB 3GL1A 4JN4A 3M3ZA 3JXUA 2D0PA 5KPRA 5F0XA 2FSNA 2VYPA 1BO5O 3A5OC 3M6GA 3ATVA 3L4IA 4MO5A 4IJAA 4CBWA 2NRHA 2AP1A 3FZHA 3KHYA 1D4XA 4ISFA 2VWBA 3KZBA 3R6MA 3OHRA 3O4WA 4BRLA 1QZ5A 4B1YB 1SQKA 3AY9A 1S22A 2E88A 3O1BA 4JAXA 1P8ZA 4EAHD 5AQFA 3CJ7A 4ISEA 3GG4A 5BPMA 2E2QA 5AFUH 4CJ7A 3WQUA 4B9QA 2ASOA 4CBUA 1Q18A 3GOIA 1ATRA 1KXPA 4JHDA 5JLHA 3BEXA 2J4RA 5FPMA 5AQMA 5LJVA 2E8AA 3CJ9A 5AQHA 3IDHA 2A40A 4DHYA 1QQOA 2IVNA 3VEZA 3HBTA 3SK3A 3VF4A 2YHXA 1BU6O 4H0XB 3VGLA 4BQLA 2F9WA 2CH5A 4QS7A 4EIAA 4IO8A 4MLHA 2UYTA 1XUPO 5LJWA 1NGCA 2KHOA 5F1XA 3C0BA 3L0QA 4RTFD 4IZ9A 5BR9A 3ENHA 2D1KA 4BR5A 2GTDA 5KPTA 3GDQA 4BRDA 3U8XA 2VCPA 1HJOA 5EX5A 1JCEA 2QWQA 4BGAA 1IJJA 1ATNA 4BREA 1BWFO 1MDUB 4H0VB 3VEYA 4A61A 4AM7A 1HX1A 3UB5A 3D2EB 1GLDG 4O8KA 4MLEA 3TU5A 3A0IX 4CZGA 3H6EA 4WQ5A 4DCHA 3SMPA 4BVPA 2H3GX 4BRIA 2GWKA 1NGAA 4WYBA 3I33A 1HKGA 4FWKA 4DQ8A 2IVOA 3QDKA 4IXCA 3ZX3A 2Q97A 2E20A 4BR0A 2WUSA 1GLFO 1GLJO 4QS8A 3ATUA 3QFPA 3H46O 1NLVA 4BC4A 1U2VB 4CD3A 5B8HA 4KBOA 2HF4A 1HPMA 2AA4A 5EOYA 2QM1A 4FPAA 5F2RA 4IJNA 3FE1A 4CZLA 4E1JA 3M1FA 3P4IA 2FSJA 4FWOA 2D4WA 2YHYA 4HWIA 3SLCA 2YCHA 5BREA 4A2AA 2ITMA 3BUZB 4BRCA 5ADXH 5KQ8A 5AQQA 3O1WA 1JCFA 4BGBA 3SMSA 2Q2RA 3CQXA 1J6ZA 4K41A 2YJFA 3ZX2A 2V7ZA 5AQGA 2ZGYA 4XH4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SYZA 4DQIA 3D7EO 3F73A 4CJVA 4DV3K 3QFUA 1EWRA 4K43A 3C6TA 4CJ3A 4CHZA 2ASCA 2GELA 3U9DA 3J7YP 4B1UB 1NGHA 3VETA 2F4VK 1T0ZA 5AQXA 1LW2A 3CERA 2LJMA 5AQLA 4FSVA 4BC2A 1RDCA 2YJEA 4FJMA 3MMVA 2UXCK 4MO4A 4KV8A 4FLWA 2QXLA 1YVUA 4AHCA 3R3LA 1ZYVA 5JMVA 4CZEA 4HHTA 2Q1NA 2IIRA 1SL2A 4HHFA 4PL7A 1KFSA 1ZVEA 2XY7A 4NXMK 4DLGA 3MXJA 2BGGA 3SPZA 1VSIA 5I42A 3L2VA 4DV4K 3HZ6A 5C24A 1VQNN 3DXMA 3O80A 1I2VA 2FBVA 1VK0A 4CFDA 1ATSA 5EXWA 1C1BA 4NCAA 2P9KA 2YIPA 1RT5A 4K25A 1A5VA 3F5TA 1NG9A 1S1VA 1C56A 4M41A 4CJLA 3KP1A 1WUAA 3O08A 4RCHA 1HYVA 3ZT2A 1MA9B 1T3VA 2X6NA 4PKHA 4DU3A 1VQ4N 4C23A 4FOIA 3HJFA 1ASUA 1NGDA 3QO9A 2P9UA 3HL8A 3NVMA 4GKKK 1NGFA 5J2QA 3CCJN 1HYSA 3KLHA 2HHWA 2PFUA 3EKUA 1VSEA 4NYFA 3CQ8A 4AM6A 1XMOK 1YVNA 1JJ2M 1RDBA 3O9UA 3WNEA 1Q9XA 3M8RA 2KZZA 5HRNA 2RF2A 4FLZA 3W0LA 3KC6A 3NH2A 4IG0A 1U04A 1TAUA 1KRPA 3KVGA 3TTCA 4CJEA 3BF1A 1DKGD 2YBRC 3FZMA 4BC3A 3EN9A 3VQEA 3V6DA 4JI4K 3OW2M 2P51A 4FK4A 4A5BA 2E2NA 4MDBA 4MQ3A 4I7FA 3U4LA 4DU4A 4CJUA 3BZCA 1CXQA 4DB3A 3MN7A 3IS9A 2YIOA 4FM0A 1NK6A 2O4GA 1NOZA 5AR0A 1CZBA 2PYLA 2HHTA 1B92A 4YOWA 3SBGA 3O9TA 2IS3A 3BZKA 1T44A 1NH5A 3T1HK 1DTTA 2FF3B 1WSGA 5FROA 1JLQA 5JICA 3DRSA 3U3YA 2NRRA 2A42A 3K0SA 1S72N 5D3GA 4W5RA 5DMRA 3P1GA 2FC0A 1HMVA 5CY4A 4OO1J 4R5PA 1C0FA 4XEIA 2WC9A 1E4GT 3NHGA 1RT4A 4AILC 4XIUA 3WEEA 1IKWA 4CHYA 3ZETB 1NNEA 3PSMA 4WFNL 1L5UA 3AV9A 4KFBA 1BQMA 4DKWA 4O44A 1BG3A 4IFEA 1BIUA 3AVGA 3VTIA 5LMNK 5M1QA 4B9MA 2UUAK 3ZEUB 1GLEG 2E2PA 2KKZA 5JS1A 1OVQA 2OYQA 4E7HA 1JZBA 1RT6A 2GEMA 1YF5L 4N47A 3TSPA 4FJ7A 3KK2A 1KLNA 4UAEF 3M8SA 4PKGA 2VQFK 4DTPA 1GLAG 1X9MA 1AYJA 2V7YA 3B6PA 3MXIA 3OYDA 2P9IB 2E4LA 3T7ZA 1T8EA 2I7NA 5BR8K 2IVPA 1DEJA 4B1WB 2HBLA 5C15A 2HOEA 5AQOA 5IWAK 1UA1A 3VESA 1DQ7A 5GIPA 1I6GA 5C12A 4M3WA 1TUUA 4I2PA 1HYZA 4CEDA 2LKBA 4IOCL 2KFZA 4ID1A 3PIOL 5E84A 4NLCA 1UAXA 3MN9A 3SAHA 3ULEB 3KIOA 1L3VA 1S1UA 4XJXA 1UA0A 2QEXN 3U3GA 3THXB 3VQ4A 3SJJA 4M42A 3A8YA 1JLAA 3H08A 3V1QA 3VQ7A 3CG7A 4CEFA 3E9PA 3SPYA 3NE6A 3EO3A 1P0AA 4A57A 1UOCA 1LAVA 4I6MB 3DXKB 1W0HA 5GAHP 4A5AA 4Z4GA 4DTXA 3PSIA 3P39A 4E7IA 4H5WA 1YHQN 3SUNA 1HR0K 2E1YA 2YX6A 4C8LA 3FZFA 2NLXA 4GV9A 2MN5A 2KSKA 3MK6A 1GLBG 3I55N 4JKHA 4WQ4A 2OPQA 3CFPA 1S1WA 4CW7B 4GV6A 4DTRA 2BRZA 4UAFE 3ULDA 3N4PA 3VTHA 1WBBA 4E0DA 1QVGM 1SN4A 3HI0A 3BF3A 4CIEA 1OKJA 1ZYQA 1C0UA 2NY8X 3KOXA 3ENOA 1ZC6A 4KHQA 4E89A 4ISGA 5AQRA 5GINA 4RWTA 1GOAA 1YT3A 2OPSA 1UWBA 2P9LA 3BP8A 3D2EA 2P9PA 1NMDA 1VQON 4J2AA 4ILGB 3MX5A 4DF4A 4EFHA 1JLBA 2FBTA 4IFYA 5AQTA 1ZBFA 4C1NK 2MZ0A 1XRSB 4CJSA 4KYPA 4DFJA 3JXUA 2D0PA 3ZYYX 3L56A 1BO5O 3T69A 5CR4A 3ATVA 3J7ZO 1OH6A 4R79A 2NRHA 3J80O 4Z4IA 3KHYA 1D4XA 3LAMA 3KD1E 3SV3A 5C10A 1WLJA 3DLHA 2O8FA 3O4WA 1XNQK 3V1OA 3NAEA 1SQKA 4JAXA 3O1BA 4N5SA 1WAJA 2AJQA 2KJAA 1J5OA 2OTJN 2G8KA 3HP6A 4DUZK 1B9FA 1LV5A 1VSMA 4CBUA 5M1NA 4JHDA 3BEXA 4KKOA 4OPKA 2J4RA 1RTIA 1YJWN 5LJVA 2A40A 2IVNA 1QHTA 3RR8A 4YOTA 3THVA 1N4NA 2ZJRL 1BU6O 3SUOA 4DG1A 3OYCA 4FM2A 4CEBA 4CJQA 4JV5K 4ELUA 4M3UA 1RNHA 4MDAA 4DV0K 3NMUA 2UYTA 2O8CA 2O8EB 1NGCA 4PQUA 1RBRA 5F1XA 3C6HA 1VRUA 2D1KA 1IO2A 2GBZA 4X66K 4BRDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3SYZ A;  4DQI A;  3D7E O;  3F73 A;  4CJV A;  4DV3 K;  3QFU A;  1EWR A;  4K43 A;  3C6T A;  4CJ3 A;  4CHZ A;  2ASC A;  2GEL A;  3U9D A;  3J7Y P;  4B1U B;  1NGH A;  3VET A;  2F4V K;  1T0Z A;  5AQX A;  1LW2 A;  3CER A;  2LJM A;  5AQL A;  4FSV A;  4BC2 A;  1RDC A;  2YJE A;  4FJM A;  3MMV A;  2UXC K;  4MO4 A;  4KV8 A;  4FLW A;  2QXL A;  1YVU A;  4AHC A;  3R3L A;  1ZYV A;  5JMV A;  4CZE A;  4HHT A;  2Q1N A;  2IIR A;  1SL2 A;  4HHF A;  4PL7 A;  1KFS A;  1ZVE A;  2XY7 A;  4NXM K;  4DLG A;  3MXJ A;  2BGG A;  3SPZ A;  1VSI A;  5I42 A;  3L2V A;  4DV4 K;  3HZ6 A;  5C24 A;  1VQN N;  3DXM A;  3O80 A;  1I2V A;  2FBV A;  1VK0 A;  4CFD A;  1ATS A;  5EXW A;  1C1B A;  4NCA A;  2P9K A;  2YIP A;  1RT5 A;  4K25 A;  1A5V A;  3F5T A;  1NG9 A;  1S1V A;  1C56 A;  4M41 A;  4CJL A;  3KP1 A;  1WUA A;  3O08 A;  4RCH A;  1HYV A;  3ZT2 A;  1MA9 B;  1T3V A;  2X6N A;  4PKH A;  4DU3 A;  1VQ4 N;  4C23 A;  4FOI A;  3HJF A;  1ASU A;  1NGD A;  3QO9 A;  2P9U A;  3HL8 A;  3NVM A;  4GKK K;  1NGF A;  5J2Q A;  3CCJ N;  1HYS A;  3KLH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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