4FSVA

Crystal structure of a heat shock 70kda protein 2 (hspa2) from homo sapiens at 1.80 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
384
structure length
380
Chain Sequence
RGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a heat shock 70kDa protein 2 (HSPA2) from Homo sapiens at 1.80 A resolution
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock-related 70 kDa protein 2
total genus 120
structure length 380
sequence length 384
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4fsvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4fsvA04
2ZGZA 4BVOA 4BRPA 2P9NA 3FE1A 4NO7A 5LJVA 5ELZA 4DHYA 2HOEA 5EVZA 3IDHA 4FSVA 2GUPA 4H0YB 3R9PA 1RFQA 4E1JA 3ID8A 2D0PA 3RSEB 2P9KB 5AQIA 5AQGA 3MN5A 4BR2A 5BPLA 3CJ1A 2FLOA 4PKIA 2P9SA 4PL8A 2E8AA 2P9UB 4JHDB 4H03B 1KAXA 2GWJA 3VEZA 4CZEA 3A5MC 1HUXA 4BREA 2ZWHA 5AQJA 3VEVA 2D1KA 3LDPA 1ATNA 2YCHA 4BR0A 1X9JA 2UYTA 4FO0A 3VOVA 3EKSA 3MDQA 3LDLA 2CH5A 4IWVA 3H1VX 3UKUA 2E2OA 5AZIB 3ZEUA 4A2BA 5AQTA 3HI0A 2PAVA 1NMDA 3FFKB 5AZJB 5JMVA 3C7NB 1YUWA 3P4IA 4FWQA 4RTFD 2KHOA 1NBWA 4IZ9A 2BTFA 1KAYA 3OHRA 3VETA 1SZ2A 1HKBA 2D0OA 4BVPA 3QBXA 4WQ4C 3R8EA 3VESA 4K41A 2E1YA 3FR0A 3TU5A 2I7PA 3GDQA 4RCHA 4BRNA 1BA1A 4FL9A 4H0OA 4JN4A 3VEYA 5KPRA 3VENA 1SQKA 2CH6A 3C7NA 1YAGA 4BR9A 5AQXA 4HTLA 4CZFA 1C0GA 4H5WA 5AQFA 5AQPA 3CERA 4A61A 4A62A 3M1FA 2DPNA 1KXPA 4FWSA 5BPMA 2P9KA 2QWQA 1P8ZA 1U2VA 4CZIA 1NGHA 4PKHA 4I6MA 4PL7A 4IJNA 5AQSA 5FPDA 1BG3A 4A2AA 3DXKB 4H0PA 4BRCA 3MN7A 2YJEA 1DGKN 2YHXA 5BR9A 1Q18A 3C0BA 3BUZB 4DCHA 3CIPA 2H3GX 4I6MB 4XH5A 2AA4A 2ZF5O 4FWPA 4BC3A 2E2QA 3F9MA 1MA9B 3FGUA 3MN6A 4L3QA 2I7NA 3IMXA 1GLCG 1LOTB 3CJCA 3CJBA 3DAWA 2FF3B 3ZETA 4JHDA 3LDQA 2QWNA 3DXMB 3WQUA 1Y64A 4B1VA 4JAXA 4BR5A 4FWLA 3WEEA 2QWPA 5E84A 2W41A 3O5BA 4EIAA 1NGGA 1TYQB 5KPZA 1JCEA 1YVNA 1QHAA 2CGLA 2P9IB 3MN9A 4IO8A 4FWNA 2PBDA 3EKUA 1QQOA 4CJ7A 2YHWA 1NGAA 4CZGA 3QFPA 1X3MA 2P9PB 2YHYA 5ADXA 1CZAN 4LC9B 3HBTA 2A41A 3CJAA 3FZKA 2FSKA 5JLHA 1NGEA 3ATUA 4H5VA 1XQSC 3O8MA 3WXJA 3LDNA 3A5LC 1K8KB 3IUCA 4BRAA 4BRHA 4XH4A 4BRFA 1Z05A 1NM1A 2OANA 3J8AA 4BC4A 2ASPA 4YDUA 5F1XA 4B1ZA 2P9PA 1BUPA 4IJAA 4WYBA 4XEIA 4QS9A 5BN9A 5JICA 4BGAA 2FXUA 3D2EA 2QWMA 2ASMA 3U9ZA 1J6ZA 1ESVA 4O5FA 4FOEA 1QZ6A 5AFUH 4K25A 2J4RA 3CJ7A 2QWOA 4BRGA 2VYPA 1NGFA 1ZC6A 3A5NC 1D4XA 3IFRA 5E26A 4EAHD 5AQYA 4GNIA 4WQ5A 4HWIA 1BA0A 3JS6A 5AQMA 2P9LB 1BWFO 3HTVA 3CETA 1QZ5A 2YI1A 4BC2A 4F9OA 3GG4A 5LJWA 1TYQA 5F2RA 3BF1A 1SAZA 2Q1NA 4CBWA 4K43A 3S41A 3O6WA 1S22A 3WQTA 2A40A 5CE3A 2Q0RA 3D2FB 1XUPO 2P9LA 4BRMA 4BROA 4BR7A 1TUYA 4B1YB 4B1UB 3WT0A 4KBOA 4BRDA 4CZJA 4FWOA 3EN9A 3WXKA 4MO4A 3B8AX 5TKYA 2ZGYA 4M7YA 3D7EO 4B9QA 5AFUA 4MO5A 1LCUA 1QQNA 1HLUA 5AQQA 4BR4A 1V4TA 4AM6A 4H5TA 4MLEA 5AQKA 1NGCA 4M7XA 3FZHA 3A5OC 4FWKA 1E4FT 3W0LA 4B1WB 2WUSA 2VCPA 3ATVA 3H3OB 2A6AA 5LY3A 3L6QA 1OKJA 3H1QA 2QXLA 3DJCA 3ZEUB 3JXUA 4MLHA 5AZIA 5AQOA 5EX5A 3GL1A 2YJFA 5EOYA 4WQ4A 5KPTA 2HF4A 2CGJA 1GLBG 4FWRA 3HZ6A 5JLFA 3O08A 3BEXA 3AARA 3O1WA 1YXQA 5AZJA 3MCPA 3CI5A 4EHTA 2AP1A 2A5XA 3FZFA 3O80A 5BPNA 1S3XA 3TPQA 5KQ8A 2NRHA 3A0IX 3KVGA 3VEXA 4H0TB 1ATSA 4JD2A 4CI6A 5BREA 4H5RA 4H5NA 3WUHA 3BP8A 2W40A 3G25A 3D2FA 4CZMA 2BUPA 1V4SA 3SMSA 2HF3A 2F9WA 2IVNA 3WEEB 1ZXOA 4XH1A 3UKRA 3VEWA 2D4WA 4BC5A 1X3NA 1T44A 2CGKA 3ENHA 4EHUA 3VF4A 2GTDA 5B8HA 1BO5O 3SJHA 5BRHA 4BG9A 3QBWA 1C0FA 2FSJA 2QW9A 4ISGA 3R6MA 4BRKA 2E2NA 3SLCA 1HKGA 3ZETB 5I9EB 5FPEA 1XC3A 3M3ZA 3ULEA 1E4GT 1GLEG 4K42A 2HMPA 4CZKA 1MDUB 3EZWA 3I8BA 2ITMA 2GEMA 1H1VA 3AAPA 3DXKA 1HKCA 3UKUB 3CQXA 1HX1A 3M6GA 3O1BA 3QFUA 4YDUC 2A42A 3EL2A 3SK3A 3QICA 3VGLA 2F9TA 4CZLA 4JNEA 3VGMA 5AQNA 3MMVA 3O4WA 4FPBA 1GLAG 4CBUA 3QDKA 3L0QA 3W3DA 1QQMA 1IJJA 5BRDA 5F0XA 2VWBA 4CBXA 1GLLO 3DXMA 3UB5A 3L4IA 4CD1A 3EO3A 5BN8A 4H0VB 2GELA 3CJ9A 1ZBSA 2V7YA 3QMLA 2FF6A 2V52B 3I33A 4BQZA 3VF2A 5EXWA 1GLJO 4DQ8A 4BRQA 3FZLA 2E1ZA 1Z6RA 3ULEB 5AQHA 3HSCA 1JCGA 1TUUA 5AQZA 3GOIA 3QB0A 3VERA 5ADXH 1BDGA 3H46O 1MWKA 1NWKA 3LM2A 1RGIA 1EQYA 1DEJA 3VPZA 3ZX0A 3U4LA 4GY2B 3GE1A 4JD2B 3FLCO 2E88A 1DKGD 5AQRA 2P9NB 4NB4A 3WXLA 1HPMA 3ENOA 3GBTA 1MWMA 1NLVA 3LDOA 4AM7A 4ISFA 5EY4A 4H0XB 2A3ZA 1T6CA 5FPMA 4ISEA 2E2PA 1T6DA 5KQDA 4BRIA 4C23A 1BOTO 3ZX3A 2NZTA 3UKRB 3A8YA 2Q31A 2Q36A 3D2EB 3WXIA 1JCFA 1NGBA 4FWMA 2ASOA 2IVOA 3U9DA 3FZMA 2P9SB 1IG8A 4O8KA 2FSNA 1NGDA 1GLDG 4J8FA 3LM9A 2GWKA 2QM1A 1K8KA 3RSEA 2V51B 1U2VB 3H6EA 1WUAA 1BU6O 2IVPA 1G99A 3KZBA 3MK6A 5AQVA 4FOIA 2NLXA 1GLFO 1U6ZA 3HM8A 4WQ5C 4Y0WA 2EWSA 1HJOA 3LL3A 4QS7A 2IIRA 3H3NO 4CD3A 2QWRA 5FPNA 3H45C 4Z94A 3SMPA 4FPAA 2E20A 4PKGA 1NGJA 3CQYA 3ZX2A 3VEOA 5AQUA 2V7ZA 4CZHA 4BGBA 3UE5A 2Q0UA 2P9UA 3CHWA 3AAQA 4M63C 4B1XB 1KAZA 5BRFA 1ATRA 1WOQA 3VF6A 3BF3A 5AQLA 5AQWA 3KHYA 4EFHA 5AR0A 4RWTA 3U8XA 1RDWX 4BQLA 2P9IA 4DB3A 4IXCA 3VGKA 3AY9A 4QS8A 1NGIA 4BRLA 2Q97A 2QWLA 2Q2RA 4BG8A 3DWLA 1R59O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FBXA 3TSQA 4BVOA 4BRPA 1S1XA 3ZT4A 4NO7A 4FLWA 1ZBFA 2JLEA 4DHYA 2HHHK 1L3UA 5EVZA 4W5QA 4FSVA 2GUPA 4CJVA 3IKMA 5JS1A 5M1PA 4CHNA 3LPTA 2HHIA 1LWEA 3CJ1A 1WBBA 2P9SA 2ZD1A 1VSEA 3O3HA 3JYTA 1KAXA 2GWJA 4FLZA 4C8KA 1RT3A 3D6RA 1HUXA 4BREA 1RTJA 2D1KA 1DTQA 4FO0A 3EKSA 3MDQA 3V9XA 4E19A 2W00A 4IWVA 2JWLA 4Z4GA 4JK8A 4A2BA 5M1KA 4OX9K 4H4MA 2GX9A 5C2FA 1NK6A 1NK7A 3C7NB 4RTFD 1KRPA 3SV4A 3VETA 1SZ2A 4JK9A 5KTQA 3M8RA 4FJIA 3E7RL 5KRTA 3R8EA 2ATQA 1NRAA 4NXMK 2O8BA 1BA1A 4FL9A 4CECA 2ZQBA 3ZSVA 4H0OA 4CESA 3KOYA 4LFAK 3VENA 2B68A 1SQKA 4HCBA 4DF8A 4BR9A 1WLJA 1A5XA 2HHTA 2F96A 4CERA 4I9LA 3QEPA 3DLHA 1JLEA 4YNQA 1NGHA 4Z4CA 3NAEA 5KK4A 4GV3A 5AQSA 1RBSA 5J2PA 3MN7A 1DGKN 2YHXA 2O8EB 3OTOK 5SZTA 3AV9A 3TTCA 4MQ3A 1K9MO 4DQSA 1N33K 4I6MB 2AA4A 4X64K 2ZF5O 4BC3A 3FGUA 1MA9B 5I3UA 4LH4A 1XHXA 3ZETA 4CGGA 4DTNA 4OLBA 4M3TA 3DXMB 4OJRA 4CHQA 4E7HA 4FWLA 3WEEA 2B5JA 3AVGA 1NOZA 1C56A 4IO8A 2YNFA 3F73A 2DFEA 5CZ2A 4K8ZA 4CJ7A 2YHWA 3OYFA 4UAFE 5C15A 1CZAN 3NVKA 3HBTA 4DR3K 1FK9A 3FZKA 5GAEP 2N2RA 5JLHA 1WNSA 1C1BA 1BQMA 3OY9A 1JXCA 3ZSWA 1K8KB 1C0UA 1HJRA 4BRFA 3TAQA 1SV5A 1QE1A 3VQ5A 4B1ZA 3K5MA 1U49A 3DM2A 4WYBA 3OYNA 2E3GA 5BN9A 4OGEA 5JICA 2FXUA 1R0AA 5HRNA 4JKGB 4EP4A 2O8CA 3AVKA 3D2EA 2QWMA 1SN1A 3U9ZA 4R5PA 1X1PA 1K8AO 2Z1JA 1QZ6A 3CJ7A 4YY3K 1VSMA 1HQUA 2O4GA 4JYAK 3U3GA 1ZC6A 3KLHA 1XC9A 3QEVA 1NJZA 1EX4A 3IFRA 4U7BA 4LF9K 2GMOA 2I61A 1YF5L 4IDHA 2LT8A 1BA0A 1J9AA 3JS6A 4OKJA 1BWFO 3CETA 1BMRA 2B6AA 1J54A 1BK8A 3CC4N 1ICAA 3GG4A 2B3CA 3SBTA 2G8VA 2Q1NA 4WFNL 3GKUA 4DSFA 3O6WA 1VQ4N 3LP0A 2A40A 4DS5A 4BR7A 4BRMA 3C6TA 3SUQA 3AA3A 4B1YB 4B1UB 4YOXA 4JRQA 3WT0A 4FWOA 1JLAA 4E7JA 4OKEA 3B8AX 1SKRA 1VSKA 2QK9A 3C65A 5AFUA 4MO5A 2LY5A 1LCUA 2OPQA 3KK3A 5E41A 4CGHA 1HNVA 4L8RB 3SZ2A 2X6NA 3A5OC 4DSEA 4FWKA 3ZSYA 3N4QA 4BACA 1POIA 4CIEA 1E4FT 3W0LA 4LSLA 2VCPA 3H3OB 5M1OA 5LY3A 3G71N 4AQYK 5J2MA 3L6QA 4AEIA 2QXLA 4C8OA 3DJCA 3VA0A 3B6PA 4A59A 1W7AA 1YHQN 2O4IA 4LFCK 1RT7A 3OVNA 3HZ6A 4BWJA 1YXQA 4B8CA 1IKVA 3OYIA 2LKBA 4RW4A 3LDSA 3O9SA 4E72A 3RMDA 4O5BA 1S3XA 5KQ8A 4IG3A 4DUYK 5C12A 3A0IX 4UADE 3ZT0A 2VQEK 1JKHA 3OA9A 3VEXA 5BR8K 5CYQA 3KHWA 5BREA 3E9PA 4JKDA 4H5NA 3WUHA 4IFVA 1YITN 4GV6A 2BUPA 3SQ1A 3CM6A 4LF7K 1CHZA 1ZU3A 3ZSQA 1UOCA 3PX4A 4KI4A 3VF4A 3SJHA 2E4LA 3QBWA 1C0FA 3ZLJA 4IFEA 1S6PA 3VMFB 2E2FA 1XC3A 4J2EA 2YIPA 1C1AA 3ULEA 1CZ9A 5M1QA 2FBYA 3I8BA 1C1CA 3TARA 1H1VA 4A57A 1HKCA 3CQXA 2XY5A 4FVUA 2G8WA 3CCMN 3EL2A 2N66A 3QINA 1FKPA 3Q7CA 3C6HA 1KLNA 2QXFA 4GKJK 3O3GA 3QDKA 3W3DA 1ASVA 3WNEA 3AVAA 1GLLO 3DXMA 3DI6A 1RT4A 5EU7A 1B92A 3L4IA 5IWAK 4FJ9A 3IAYA 3IRXA 4E1NA 2V7YA 3PSMA 3QMLA 2V52B 3VQ6A 4E3SA 3HRGA 3MX5A 3PX6A 3CCLN 5AQZA 1NMNA 1L3TA 5J2NA 4O44A 3VERA 4B9UA 3VPZA 1CXUA 3OYEA 1T03A 3SUOA 4JD2B 4BDZA 1G15A 2E88A 1TL1A 1WB9A 2P9NB 1U45A 1KVAA 3WXLA 3S9HA 1IBLK 3K5OA 3LDOA 4ISFA 3D45A 4GVEA 1JZBA 5MLCQ 2Q3SA 4KO0A 1W2BM 2QI2A 1LWCA 4CK2A 3NMUA 5KQDA 3CCEN 3DLGA 4U67L 4I9QA 4FW1A 3QEIA 3VQDA 4GV9A 3PY8A 4FVMA 3B6OA 3D2EB 3WXIA 4AHUA 3KLEA 3LZJA 2NRWA 4PHTX 3U9DA 3CCJN 2N2QA 3FZMA 1IG8A 2BGGA 4K0KK 3CFPA 3AO5A 1FH3A 3V1RA 5LMNK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2FBX A;  3TSQ A;  4BVO A;  4BRP A;  1S1X A;  3ZT4 A;  4NO7 A;  4FLW A;  1ZBF A;  2JLE A;  4DHY A;  2HHH K;  1L3U A;  5EVZ A;  4W5Q A;  4FSV A;  2GUP A;  4CJV A;  3IKM A;  5JS1 A;  5M1P A;  4CHN A;  3LPT A;  2HHI A;  1LWE A;  3CJ1 A;  1WBB A;  2P9S A;  2ZD1 A;  1VSE A;  3O3H A;  3JYT A;  1KAX A;  2GWJ A;  4FLZ A;  4C8K A;  1RT3 A;  3D6R A;  1HUX A;  4BRE A;  1RTJ A;  2D1K A;  1DTQ A;  4FO0 A;  3EKS A;  3MDQ A;  3V9X A;  4E19 A;  2W00 A;  4IWV A;  2JWL A;  4Z4G A;  4JK8 A;  4A2B A;  5M1K A;  4OX9 K;  4H4M A;  2GX9 A;  5C2F A;  1NK6 A;  1NK7 A;  3C7N B;  4RTF D;  1KRP A;  3SV4 A;  3VET A;  1SZ2 A;  4JK9 A;  5KTQ A;  3M8R A;  4FJI A;  3E7R L;  5KRT A;  3R8E A;  2ATQ A;  1NRA A;  4NXM K;  2O8B A;  1BA1 A;  4FL9 A;  4CEC A;  2ZQB A;  3ZSV A;  4H0O A;  4CES A;  3KOY A;  4LFA K;  3VEN A;  2B68 A;  1SQK A;  4HCB A;  4DF8 A;  4BR9 A;  1WLJ A;  1A5X A;  2HHT A;  2F96 A;  4CER A;  4I9L A;  3QEP A;  3DLH A;  1JLE A;  4YNQ A;  1NGH A;  4Z4C A;  3NAE A;  5KK4 A;  4GV3 A;  5AQS A;  1RBS A;  5J2P A;  3MN7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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