The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
63
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDIHIRLYKSHPETLEKHDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A Designed Functional Metalloenzyme that Reduces O(2) to H(2) O with Over One Thousand Turnovers.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transport protein
|
| source organism |
Physeter catodon
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| total genus |
63
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-07-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2R80 B; 4MQC B; 3S48 C; 3RJN B; 3PT7 A; 2G0V A; 1VXA A; 1Y8K A; 2HHB B; 1VWT B; 3OJ1 A; 2G11 A; 4FH6 A; 1Y7Z A; 1Y8I A; 3GQG A; 4MQJ B; 1GLI A; 3ODQ A; 3E5O A; 1UVX A; 5CN9 A; 4N8T A; 4HSW A; 1A4F B; 2ZT2 A; 4DWT A; 3WHM B; 102M A; 1BIJ B; 3GKV B; 4TWV A; 5CNB A; 1OR4 A; 2R4Z A; 1YVT B; 1A3O B; 1HDS B; 2HBG A; 1I3E A; 3QJC A; 1ECA A; 2HBS A; 2VM0 A; 1U7R A; 4MQK B; 2GKN A; 2MGH A; 5EV5 A; 4M4A A; 3WI8 A; 2ZT1 A; 1NWI A; 1H1X A; 3ZJL A; 3OVU C; 3PI4 A; 2EKU A; 1Y7C B; 1Y83 B; 4KMW A; 3UHD A; 1LH5 A; 1J7W A; 3A5B A; 1OUU A; 1O1J A; 1A00 B; 1MOC A; 1O1N B; 3UH5 A; 5E6E B; 4LPI A; 2MGF A; 1J3Z A; 1C7B A; 1MYJ A; 2ZS1 B; 1FN3 A; 2R4X A; 3WCV B; 1YGD B; 1GZX A; 3PEL B; 1CQ2 A; 2RI4 A; 3VRG A; 1JP6 A; 4U8U B; 1JP8 A; 1H97 A; 2OLP A; 2GNW A; 1QI8 A; 3DHR B; 110M A; 1DXT B; 3ZJI A; 1YHU B; 1B86 A; 3PT8 A; 2DHB A; 1WMU B; 2FRK X; 1Y8W B; 2XKG A; 5SW7 A; 1G08 A; 1JZM A; 1HHO B; 4JYQ A; 3BA2 A; 1YDZ B; 2D5X A; 1DXD A; 1Y5J A; 2G12 A; 2D2N A; 103M A; 3VRE B; 2R50 A; 3UHK A; 1YCA A; 1URV A; 5E83 B; 4F6I A; 3TLD A; 5CNE A; 2E2Y A; 1HDB A; 101M A; 1HBS B; 1HDA B; 3WCP A; 1Y4B A; 3K9Z A; 1EBT A; 1O1I B; 3ZJJ A; 2SPL A; 3UHU A; 1JW8 A; 1FHJ B; 4MXL A; 3UHY A; 2PGH A; 1QXE B; 1CH2 A; 5JDO D; 3GKT A; 3DR9 A; 1CH5 A; 3AQ5 A; 3OZW A; 1QXD A; 2MGA A; 2ZS0 B; 1CBM A; 3GQR B; 4ODC A; 4FH7 A; 1Y4F A; 3UH7 A; 1CO9 A; 3DHT A; 1GDL A; 3PI9 A; 4ZVB A; 2ZLV A; 1Y35 B; 6HBW A; 1MNI A; 1JZK A; 2G0R A; 1A6N A; 1HLM A; 2MGL A; 3WR1 A; 3PIA B; 2HBF A; 3UBV A; 1O1L B; 1MOA A; 1MLF A; 1JF4 A; 4IT8 A; 1Y45 B; 5HU6 A; 4HBI A; 1CH9 A; 1HGB B; 2OH9 A; 3ZJO A; 3D4X B; 1LFL B; 1EBC A; 1JZL A; 3MKB A; 1BZ1 B; 1HBB B; 4NI0 B; 2D2M B; 2DC3 A; 3UH3 A; 1XYE B; 5M3S A; 4MBA A; 1G0A B; 108M A; 1Y4R A; 3OZU A; 1FAW B; 2Z6T A; 1HBH B; 3QJB B; 1X9F D; 3FH9 B; 1XXT B; 3BJ1 B; 5CN8 A; 3KUO A; 1OFJ A; 1LFY A; 2V1I A; 1Y7G B; 1ABY B; 1SHR A; 1J3Y B; 109M A; 2ZFO C; 1DKE B; 5E29 A; 1GJN A; 2LH5 A; 2G0Z A; 1Y4P B; 2MGK A; 1OFK A; 1YZI B; 1HAC B; 1DO1 A; 3ZOL A; 1NIH A; 2HHD A; 2G10 A; 3PI8 B; 1MBD A; 2BW9 M; 4ILZ A; 2W72 C; 3SDN A; 1FSX A; 1YGF A; 2ZST A; 4O2G A; 1Y0A A; 1A0U A; 1AJ9 B; 3NL7 B; 3MJU A; 4G51 A; 1DXU B; 3D1A B; 2AA1 B; 2KSC A; 1FSL A; 4KN3 A; 1LA6 B; 1J3F A; 4HRT B; 1Y0C A; 1S5Y A; 1KD2 B; 4ROM A; 4O35 A; 1W92 A; 1YIE B; 5ILP A; 1FCS A; 1M9P B; 4WJG 1; 2CMM A; 1HJT A; 2SPN A; 2D6C A; 1C40 A; 3UHW A; 4FWZ A; 2GTL C; 3G52 A; 1XZ7 A; 1J40 A; 1UIW B; 1MYT A; 3MYM A; 2G0X A; 3ONZ A; 1YEU A; 1O1P B; 1Y0W A; 5CN5 A; 2BKM A; 4YU3 B; 1XZU A; 2O5L X; 3QM7 A; 5EQM A; 3WCT D; 2ZSR A; 3PI1 A; 1LFT A; 2HBD A; 1J41 A; 2H8F A; 1HBA A; 2Z85 A; 1Y4V B; 1UC3 A; 3BJ2 B; 3UHN A; 1JL6 A; 3G53 A; 1MWD A; 3M39 A; 1YG5 A; 4QAU A; 1WLA A; 2Z6N A; 2GRH A; 1YHE A; 1MLR A; 2FAM A; 2RAO A; 1RQ4 B; 1NEJ A; 3GQP A; 3GYS A; 1ECN A; 1HV4 B; 1YH9 A; 3ECL A; 2AUQ A; 2LH6 A; 2V1J A; 1YMA A; 1IBE A; 2NSR A; 4OF9 A; 1MBA A; 1N9H A; 1JPB A; 1DXV B; 2QSP A; 3HRW A; 3ZJM A; 1LJW A; 2QMB B; 2YRS B; 1GDJ A; 1IWH A; 3E5I A; 5EYS A; 1MLK A; 1YEN A; 3WFT A; 2DN1 B; 1YCB A; 5CNG A; 1R1X A; 5AZR A; 1QPW B; 1CBL A; 1O1M B; 3QM5 A; 2ZLU A; 1MZ0 A; 2HCO B; 5CND A; 3RGK A; 2BLI A; 2OIF A; 2FRJ X; 3WCU B; 1F65 A; 2QSS A; 2D60 A; 1GDI A; 1BZZ B; 3UHR A; 4F4O A; 1J7Y B; 5EE4 C; 1VXH A; 4MQI A; 1HGC A; 1VRF A; 2VYW A; 2O58 X; 3BOM B; 5JDO F; 1RPS A; 3HEP A; 4MAX A; 1MBC A; 1G9V B; 2GLN A; 5CNF A; 5C6E A; 4MPM A; 1MLS A; 1DTM A; 3MJP A; 1A0Z B; 1VXD A; 1MNK A; 1IT2 A; 2W31 A; 2EB8 A; 4UIQ A; 1SPG B; 1XY0 A; 2O5S X; 1YVQ B; 1HBR B; 1LFQ B; 1Y4G A; 1RTX A; 1JY7 A; 4PQC A; 1BVC A; 3HYU A; 5F0B A; 3EU1 A; 3S66 B; 3D7O B; 4L7Y B; 3NML A; 2HZ1 A; 1GCV B; 3W4U A; 2HHE A; 3ORD A; 3QJD B; 1COH A; 1Y7D B; 1MOH A; 1V75 B; 3ECZ A; 1MLU A; 3PI2 A; 3A59 A; 1A3N B; 1K1K B; 1XZ5 A; 1SDL A; 3K3U A; 1VXF A; 5HY8 B; 1YHR A; 1ITH A; 3CIU B; 2GKM A; 3LB2 A; 3UHC A; 1MKO B; 3EDB A; 3O89 A; 2IN4 A; 1MLO A; 1R1Y A; 1VXG A; 3PT7 B; 3AT6 B; 1SDK A; 4F6J A; 1G0B A; 1L2K A; 1Y8K B; 1MTJ A; 3ZJP A; 1Y7Z B; 1Y8I B; 3GQG B; 2IG3 A; 4N7P A; 2MYE A; 3ODQ B; 1LHT A; 3WFX A; 1CP0 A; 2BLJ M; 2LH3 A; 4N8T B; 1MLQ A; 1DM1 A; 2VLZ A; 1Y8H A; 3ECX A; 3A2G A; 3LR9 A; 3WFW A; 3QMA A; 5AZQ A; 1IRD A; 1YE0 A; 2M6Z B; 1LFZ A; 4UUR A; 2LH1 A; 4NK2 A; 2EF2 A; 3QJC B; 2HBS B; 1THB A; 1V4U A; 4UZV A; 2W6V B; 1NAZ A; 1M6M A; 4HHB A; 1NGK A; 1AZI A; 1X9F A; 4M4A B; 3GLN A; 1Y22 A; 1NS6 B; 2VHB A; 1Y09 A; 4H0B A; 1S5X A; 3IC2 B; 2GL3 A; 3UHQ A; 1J7W B; 1OUU B; 1HLB A; 3ARK A; 5CMV A; 3HEO A; 4NXA A; 4F69 A; 2DN3 A; 5ILE A; 5KER A; 1J3Z B; 4JAC A; 4ZVA A; 4SDH A; 4X0L A; 1Y5F A; 1C7B B; 2ZFO D; 1GZX B; 4XDI A; 4NS2 A; 2RI4 B; 104M A; 4H07 A; 1QI8 B; 3UHB A; 5CN7 A; 1RTE A; 1MLJ A; 1Y5K A; 4MU5 A; 1FDH G; 1MWC A; 1B86 B; 2DHB B; 1Y4Q A; 2ZLT A; 3MVC A; 1NZ2 A; 1G08 B; 2ZS1 C; 1SWM A; 2B7H B; 2ZFB A; 3WCV C; 2D5X B; 3A0G A; 1Y5J B; 1DTI A; 2AV0 A; 2D2N B; 2ZLW A; 4U8U C; 1CQX A; 1MLN A; 5D1V A; 1MTI A; 3UH6 A; 1JWN A; 1YHU C; 1DO4 A; 3WCT A; 2HHB A; 1NZ4 A; 4VHB A; 1IOP A; 3ZJS A; 4C44 A; 2GTL D; 1CG5 A; 1YOI A; 3WCP B; 1Y4B B; 1S0H B; 1UFJ A; 3ASE A; 3NG6 A; 5B84 A; 1Y0T B; 1ABW A; 5JGG A; 1LHS A; 3GDJ A; 4B3W A; 1BUW A; 2PGH B; 2QLS A; 1XCH A; 3WHM A; 1RSE A; 4ODC B; 1MGN A; 1Y4F B; 3NFE A; 3DHT B; 2EVP A; 1SI4 A; 4N7O A; 3PI9 B; 1CLS A; 4O4Z A; 3PI3 A; 3UHX A; 3UGZ A; 2NRL A; 6HBW B; 5HAV A; 2XKI A; 1X3K A; 3U3E A; 2MYB A; 2ZWJ A; 2V1G A; 3WR1 B; 1GBV A; 2D5Z A; 2ZS0 C; 2HBF B; 3M38 A; 1RQA A; 3WFU A; 1GBU A; 5C6Y A; 1V07 A; 2GDM A; 5HU6 B; 1A00 A; 1BAB A; 3UHV A; 1A6K A; 1LH7 A; 2HBE A; 3MKB B; 4GZG A; 106M A; 107M A; 111M A; 3UHI A; 1OUT A; 1Y4R B; 3PEL A; 2G14 A; 3G46 A; 4YU4 A; 1CG8 A; 3DHR A; 1MNH A; 1LFY B; 3H58 A; 3HXN A; 1PBX A; 1SHR B; 3HHB B; 1HAB B; 5E29 B; 2AUO A; 1UX8 A; 2D2M C; 3UBC A; 1NIH B; 1T1N A; 2HHD B; 5EE4 D; 2ZSY A; 2H8D A; 2HZ2 A; 3P5Q A; 2Z6S A; 1XZ2 A; 1Y46 A; 1FSX B; 1YGF B; 1Y0A B; 3VRE A; 1A0U B; 1MLL A; 2VLY A; 3B75 A; 4G51 B; 3ED9 A; 3UHZ A; 3ZJN A; 1LH2 A; 1BZR A; 2EVK A; 3K8B A; 1MBN A; 1IRC A; 2O5T X; 1S5Y B; 3KMF C; 1O1I A; 4G1V A; 3AQ7 A; 1CP5 A; 4F6G A; 1FHJ A; 5MBN A; 2BNL A; 1HGA A; 4FWX A; 3GQR A; 1J40 B; 4M4B A; 3G4R A; 2MGB A; 3GOU A; 1HBG A; 1YEU B; 1Y0W B; 5D5R A; 1MYF A; 1HBI A; 2OHB A; 3ZH0 A; 1RVW B; 4AVD A; 2ZT4 A; 3HF4 B; 2HBD B; 1J41 B; 2HBC A; 1HBA B; 1MNJ A; 1BZ0 A; 1C7C A; 1LFV A; 1MYZ A; 3IC0 A; 1BBB A; 2MYA A; 2VLX A; 1UX9 A; 1YG5 B; 2Z6N B; 4XS0 B; 2JHO A; 5HLX A; 2V1E A; 1V4W A; 3GQP B; 3GYS B; 3OK5 A; 1C7D A; 1HSY A; 4F68 A; 1QSI B; 5KDQ A; 1YE2 B; 1NPG A; 3OO4 B; 2QSP B; 3HRW B; 4N7N B; 1V4X B; 2VEE A; 3AG0 A; 1ABY A; 2O5O X; 1LJW B; 1DKE A; 2EB9 A; 1DUO A; 1IWH B; 1HAC A; 3UHT A; 1O16 A; 1YEN B; 1KR7 A; 1MYH A; 1R1X B; 2V1H A; 1GVH A; 2R4Y A; 1CIO A; 1A6G A; 1O1O A; 2ZLU B; 2LHB A; 1GDK A; 3AQ6 A; 2NRM A; 3D1K A; 2QSS B; 112M A; 1YEV A; 2ZFO A; 3WCW B; 4F4O B; 1A6M A; 1XZ4 A; 3D17 A; 4MQI B; 1HGC B; 1NZ3 A; 3OO5 A; 2QU0 B; 1RPS B; 1K0Y B; 4HRT A; 1F63 A; 2MYD A; 3BJ3 A; 4PQB A; 1YIE A; 1ASH A; 1M9P A; 2W72 A; 1YMB A; 3QM8 A; 1G09 A; 5C6E B; 1CH4 A; 4TYX A; 1PMB A; 3WCU C; 1DUK A; 3MJP B; 4OOD A; 2MGD A; 1FLP A; 2W6Y A; 1XY0 B; 2DXM A; 1Y4G B; 1JY7 B; 5EUI A; 3HYU B; 3EU1 B; 2H35 A; 1MYI A; 4ROL A; 3W4U B; 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1F5P A; 4G1B A; 2QFN A; 4MQH A; 1CMY A; 1Y4Q B; 2ZLT B; 1A3N A; 2MGE A; 3S65 A; 3R0G A; 4DC8 A; 5JDO E; 1YEQ A; 3LB3 A; 4FC3 A; 4MQG A; 4KMV A; 3G4V A; 2OHA A; 3A0G B; 2ZLW B; 1O1J B; 2XYK A; 3E4N A; 1MKO A; 1Y01 B; 1OJ6 A; 1S56 A; 3AT6 A; 1MDN A; 5HBI A; 3WCT B; 3HEN A; 2HZ3 A; 5B85 A; 1Y31 A; 1FN3 B; 1MBI A; 1CG5 B; 1BVD A; 1Q1F A; 3A5A A; 4C0N A; 1Y0D A; 1NQP A; 1MYM A; 4ESA A; 1MLM A; 3V2V A; 1Y2Z A; 3EDA A; 2ZSO A; 3NG6 B; 3VRG B; 1ABW B; 5JGG B; 3TM3 A; 3GDJ B; 1BUW B; 2D2N C; 3QJE A; 2VEB A; 2QLS B; 3BCQ A; 2M6Z A; 1I3D A; 3M3B A; 2VYZ A; 3PT8 B; 3VAU A; 3NFE B; 1A01 A; 1SI4 B; 3OGB A; 5SW7 B; 3NMM A; 4N7O B; 1DXC A; 1CLS B; 3ZHW A; 1BZ6 A; 2FRF A; 3DUT A; 2ZSN A; 2W6V A; 1GCW A; 1MCY A; 2MHB A; 3KUN A; 1LH6 A; 2R80 A; 4MQC A; 1A9W A; 1GBV B; 1NS6 A; 4L2M A; 2D5Z B; 1VWT A; 5JOM A; 1RQA B; 3IC2 A; 1HDB B; 2GRZ A; 1GBU B; 4MQJ A; 1EW6 A; 3MBA A; 1BAB B; 2BK9 A; 2LH7 A; 1A4F A; 5AB8 A; 2HBE B; 1UVY A; 2V1F A; 1BIJ A; 1QXD B; 3GKV A; 3WCW D; 1OUT B; 1YVT A; 1A3O A; 1HDS A; 4DC7 A; 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