4G10 | Genus

Total Genus 89

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	89
sequence length	263
structure length	263
Chain Sequence	b'AEPQELTIYHIPGCPFSERVEIMLELKGLRMKDVEIDISKPRPDWLLAKTGGTTALPLLDVENGESLKESMVILRYLEQRYPEPAVAHPDPFCHAVEGMLAELAGPFSGAGYRMILNREIGKREEMRAAVDAEFGKVDAFLKRYATGSDFLFDDRFGWAEVAFTPMFKRLWFLDYYEDYEVPANFDRVLRWRAACTAHPAAQYRSKEELLKLYYDYTQGGGNGRIPEGRSISSFSPDVDWRTRPMPPRDKWGHAATDAELGLT'

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Sphingobium sp. SYK-6 LigG involved in lignin degradation is structurally and biochemically related to the glutathione transferase omega class. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Glutathione S-transferase homolog
source organism	Sphingomonas paucimobilis
molecule tags	Transferase
total genus	89
structure length	263
sequence length	263
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-07-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF13417	GST_N_3	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A	PF16865	GST_C_5	Glutathione S-transferase, C-terminal domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1050.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	4g10A02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4g10A01

1VF1A 1VF3A 4IP1A 2C3NA 1MEKA 3QDNA 5HFKA 2NBSA 1X5DA 2LEGA 1OC3A 1AC1A 5BMUA 2XBQA 1PL2A 4POLA 2C8UA 2H1BA 3QAWA 2YOIA 5G30A 4XS6A 4KCAA 5CRGA 2CAQA 3LSZA 5AGYA 4POKA 3FZ5A 3CSJA 4K2DA 5EL8A 1X9MB 2H1GA 4V1Ap 1XPVA 2CVDA 4G10A 4EL1A 3APQA 3ERWA 2FGXA 3IC8A 1RK4A 4Z7XA 4PQHA 4LMWA 1ZCPA 3LXTA 2EC4A 3GIXA 1SYXA 2H6YA 4ZB9A 3GA4A 4MCUA 1Q98A 4XTSA 2E2GA 1TOFA 1YEXA 2PERA 4N11A 3RAZA 2GQKA 1K3OA 1SJ6A 2H6XA 14GSA 1V2AA 2HQTA 2QKEA 1K3YA 1UN2A 2OACA 2CVKA 5J4UA 2DSAA 1TRVA 4K7NA 1WP0A 5HR3A 4MJCA 2L5OA 4KE3A 4F2IA 5ID2A 1S3CA 2DIYA 1WWJA 2D2ZA 3ERGA 4ACSA 3CXGA 2GSTA 3CSHA 3GNJA 2LQQA 5DALA 1Z7PA 1MDKA 1ON4A 3H1NA 4XCSA 2VLTA 3WGXA 3GSSA 5KN2A 5ID2B 2X8CA 1JLWA 3M0FA 2AUVA 1FVKA 2HSMA 5B8AA 4EKZA 3BCIA 2LS5A 18GSA 5DALB 2R3XA 2LRTA 2KP1A 1LBKA 4RQXA 3ZZXA 1U6TA 1BX9A 1ACVA 3BBYA 2I9HA 4GQFA 2HSMB 3F3RA 1Z3EA 4I97A 1KEBA 3HZ4A 5AISA 4HU7A 4RQRA 5ELGA 3VWVA 3ZIVA 2NPBA 2VCWA 2VCZA 5J9BA 1HNBA 3D6IA 1V57A 2PVQA 3I69A 3TB2A 5F8BA 3BCKA 1SU9A 2YNXA 4PQIA 3C73A 4FO5A 3U6VA 3WGDA 3Q18A 2LNSA 4TOPA 1TKDB 3CRTA 3GL5A 3F63A 3DRNA 3KP9A 4TKYA 10GSA 1HQOA 4MP4A 3HCZA 2FCHA 3GL3A 1TRSA 1K0MA 3EURA 1GUKA 3M8NA 2V6KA 3R2QA 3F4SA 2ALBA 5JCUA 4V2MA 3ZYWA 3ZVJD 1GRXA 4BL7B 2JL4A 2I4AA 3IXRA 4ID0A 2VOCA 4OO4A 2FLSA 2PVOC 3HVVA 2F8FA 1F37A 2H6ZA 4EXJA 1G6YA 3G7IA 1OE7A 1FVJA 4L5OA 2E2MA 2AHEA 1K0NA 5ECQB 1T1VA 2N5FA 3UJ1A 1B48A 1T4YA 3HDCA 3H8QA 3IBHA 3APOA 1EP8A 1OYJA 3HVXA 4IKHA 1EGOA 1AQVA 2QC7A 3FEUA 2FA8A 3SBCA 2LRNA 5C04A 2LJKA 3GKMA 3F0IA 2IN3A 3V1WA 5EVOA 4GCIA 2DMLA 1GUHA 1SL2B 1MD4A 5LCZA 1TJDA 3TJJA 1SJZA 1O7UA 3FR9A 3EU4A 1ABAA 5J3RA 2GQLA 2GTUA 4EUYA 7GSSA 4TR0A 1TW9A 4HU9A 4ZB6A 1LU4A 5ECHB 5F0GA 1LJRA 4ZB8A 2MMNA 2TRCP 3HHVA 3QD9A 3TJGA 1S3AA 1HNAA 3TKSE 5LNKe 5CO3A 3FZ9A 2NVLA 2WCIA 1YKCA 3RPNA 3M9JA 3A3TA 5IMAA 3IC4A 4HEA2 2H75A 1BJXA 4MPGA 5E59A 4MZWA 3ZFLA 1R5PA 4N30A 1JZOA 1GTBA 3TKSC 1ERVA 3TJKA 1XCCA 1SK1A 2OKAA 2H0GA 2H8LA 5AIXA 1GWCA 2VD0A 4YAPA 1N2AA 2H66A 4RI6A 2C1YA 5DQSA 4MA9A 5ECIB 2TRXA 1HD2A 4OFTA 4BPYA 3EINA 1MDJA 4NV2A 4OWYA 1SL1B 5LD0A 3KMNA 1A0RP 4LLRA 5CAXA 2LV3A 4K8MA 2HFDA 4ZL7A 2O87A 1JZDA 2DMMA 2GDRA 4NHZA 2V2GA 2VUPA 1WRYA 2BMXA 3ZLPA 1N8JA 2IMFA 1DE2A 1TI1A 3QMXA 3BJ5A 1TRWA 4PXOA 3UBKA 2VCVA 1MD3A 3O76A 3D4TA 5HFIA 3GKXA 1QUWA 3RDWA 2H30A 4KB3A 3QR6A 5D9XA 1GP1A 1JZWA 4WR4A 5DDLA 1H75A 1TXXA 4L5LA 3AY8A 2V6OA 1O8XA 2M72A 1NM3A 2PBJA 4ECIA 1OVNA 1XWCA 2FHEA 2G0FA 3HD5A 2OBIA 3ZTLA 3GX8A 4CDOA 4ECBA 2GT5A 2IMIA 4F9ZA 4PTSA 5G5EA 5IO2A 4HZ4A 1A8LA 2DBCA 4KA0A 1NHOA 4J56E 1K0CA 4O5RA 1ZL9A 1QQ2A 4N0ZA 3MWHA 4OCEA 4WF5A 4N0VA 3UARA 1T4ZA 5IM9A 2WRTA 3ZRDA 3UOMA 4FYBA 3E3EA 1M2BA 1T3BA 4AJ8A 1K3LA 1Z7RA 1U3AA 1V58A 4EO3A 3LGCA 3I6AA 3LQ7A 3TOUA 4RI7A 5L71A 2K8VA 1F3BA 1SD9A 1EV4A 4MJEA 1B9YC 3UAPA 4L0UA 3IK7A 2C0FA 2H76A 5B6NA 3FYGA 1XBSA 4XS1A 3A2XA 1PRXA 3GTUA 4MF7A 2IFQB 2YV7A 2F9SA 1AQXA 2XPEA 1THXA 1J9BA 1E2YA 4EDYA 3O3TA 5F06A 4TXVA 1X5CA 1W89A 1T8EB 1HNCA 2OBKA 20GSA 3M1GA 3GTUB 4GWRA 4MLYA 3HA9A 3F6DA 2X8GA 2P31A 4MZCA 2RLIA 2VM1A 5GZZB 3TRPA 1BEDA 2L4QA 3FZ4A 2JSYA 1X9WB 3C1SA 5GSSA 5G1KA 8GSSA 1WPIA 1EOHA 2OADA 1JFUA 3J7Yk 2DC5A 3U5RE 2L5LA 4MF5A 1AQWA 6GSWA 5KN0A 3LFLA 2VM2A 1TP9A 4BVXA 2H1DA 1PL1A 4NMUA 4TRXA 3H79A 4YQUA 1K0DA 4TN8A 3TOTA 3BOAA 2JSZA 2X8HA 4MJAA 2HZEA 3DMLA 4KSOA 1G0TA 4DEJA 2YWOA 3QFBC 2IJYA 6GSUA 1EZKA 3UVHA 1SJIA 2YV9A 3PGTA 4PUFC 4BVXB 3FY7A 1X0RA 5D9WA 3ZFBA 3TKPA 2AV4A 4AF2A 5GAPD 4GTUA 1YY7A 3ED3A 3GUSA 5CRWA 1V9WA 2HZEB 2PGTA 1T00A 1PMTA 5F05A 1PQNA 1TU8A 3VI5A 3EE2A 1G6WA 1PN9A 2AYTA 2HSYA 4O32A 2C3TA 3UBLA 3KD0A 1XWKA 3D4MA 4E8HA 2AAWA 1A0FA 5D9VA 5JCGA 2HRNA 2YP6A 2R5GA 2PPTA 2H1AA 4ZBDA 3CTGA 3TCOA 2N5AA 2RUFA 2O85A 3ME8A 3W8SA 3FK8A 4NAXA 3LORA 4EDZA 1XVWA 3F4RA 3VWUA 3VWXA 2LUSA 1SK0A 3EVIA 1BYEA 1OKDA 1VF4A 4JR6A 4ECJA 4ECCA 1GLPA 1T7PB 3IA1A 4HDEA 3FR6A 4HUAA 4USSA 3ZMKA 1XW9A 2YWIA 3NIVA 2O89A 4XS4A 2M46A 4Q5NA 2VAFA 4KAEA 3P8WA 2QGVA 2UZ8A 1J0FA 2PU9C 3APSA 2YJ7A 2R37A 1TRUA 1SKRB 2HZFA 4OD7A 1OC9A 4FYCA 2ON5A 5A4WA 3F8UA 3GV1A 4XS4B 3LXZA 4HZ2A 3GX0A 5DQYA 1U88A 4ZBAA 5F07A 2WZ9A 3MAKA 1PD21 2JADA 1BQ7A 3IV4A 3FW2A 1GNWA 4JBBA 1F3AA 2MBSA 3QPMA 1OC9B 2MMZA 2OE0A 4AGSA 3KGKA 5DCHA 2P0GA 2JZRA 4KSMA 3D0ZA 5FWGA 3HY2A 2MZCA 3GFKA 4EF0A 4ZXGA 3L78A 3W8JA 4BL7A 2GLRA 2REMA 4MPFA 1M0UA 1B9XC 2MMOA 1I9DA 5IIZA 4IJIA 1RW1A 1DSBA 2YJHA 5J5NA 2B5EA 4MH2A 3NZNA 4DVCA 3K8NA 2VCXA 2I81A 3DIEA 4F0BA 1FB0A 3LJRA 4IVFA 3ME7A 5IPHA 1WJKA 1NW2A 3ERFA 2XBIA 4XRDA 4KDXA 1VRSD 4DSSA 2IWTA 2XHFA 4ZBBA 3J7Yb 2GSQA 4OFNA 3KEBA 2HSHA 3A2WA 2PUKC 2YZHA 1EEJA 1SKSB 2B3SA 4MF6A 4FH8A 2F51A 2VLVA 5H5RA 3MNGA 1VGLA 3CMIA 2Z9SA 4PQ1A 2VIMA 4DSSB 2B5YA 5G1LA 2JU5A 4EVMA 3TKSA 1FG4A 1AAZA 3GN3A 2L59A 2ON7A 1I5GA 1Z9HA 3IAS2 11GSA 1UVZA 2RM5A 5DJLA 3QCPA 12GSA 3GRXA 1R7HA 4ZL8A 1A2JA 1OE8A 5H5QA 5ABRA 1A24A 2ZNMA 3KCMA 4WR5A 5IQYA 4KUNA 1U87A 3KTLA 4J57E 4RUVA 5CYYA 1UC7A 4MMMA 1YF1A 4Q5QA 1OAZA 3P2AA 3W6GA 3MDKA 4K0GA 1M9AA 3ZIJA 2V32A 1QXHA 2H0HA 3OR5A 1X9SB 3HJMA 4HQZA 5E4WA 4JRRA 1YKAA 5H5SA 3FR3A 3DKSA 4P3YB 4V2NA 5AIVA 5JWQB 1XXUA 1Y6EA 4GXZA 1GNEA 1M7TA 2WS2A 2VL2C 3C71A 1ZOFA 1XVQA 1YZXA 3M9KA 4JEDA 1JHBA 1HYUA 1XOBA 2H72A 3P7XA 2PN8A 2GZZA 1GULA 2HXKA 3MSZA 1A23A 1YEPA 3UEMA 3KP8A 1XZOA 4EC0A 1XWGA 4AJ7A 2P5QA 1MDIA 2M80A 3KTBA 4QL9A 3RBTA 3KMOA 3CBUA 3PH9A 2GSRA 2H19A 1GLQA 1F6MC 3WGEA 1UA5A 2DJ3A 1Z6MA 1XWBA 1KBNA 4HS1A 5G5FA 3WT2A 2I3YA 4IGJA 4FYUA 3VURA 5B6MA 2DJKA 1ST9A 2LJAA 2LQOA 3EC3A 2KOKA 1R4WA 3DVXA 4KGIA 2HSNB 2DJ1A 6GSXA 4IQ1A 5IMFA 3TGZA 3F3QA 4IN0A 2O7KA 3N5OA 2TIRA 2CVBA 4QQ7A 4IS0A 1M99A 2EIOA 2V41A 3A2VA 1PX7A 2EIQA 2NDOA 1GSQA 1QK8A 5ENUA 5IMDA 1QFNA 4IHUA 3L0HA 1PKZA 1QGVA 1SENA 4Q5FA 1ZMAA 4D73A 3Q74A 1MTCA 4K7OA 5IPGA 4IJ3A 4K0NA 4AJ6A 2K18A 5ECKB 2FY6A 3P90A 1SD8A 2IFQA 1S3DA 3G7JA 2FD3A 6GSYA 17GSA 3Q6OA 3HKRA 3VLNA 3DXBA 1GSDA 2YZUA 1R5AA 2F3MA 2LJRA 4DSQA 5COHA 2GGTA 2XC2A 1GSUA 5ECPB 4D73B 1ZYEA 2C0GA 2LKUA 2YCDA 2G2QA 3C1RA 1ILOA 4MK3A 2YANA 2IMEA 3UIWA 2CX4A 3R3EA 3ZITA 2B5XA 1Z6NA 1B8XA 13GSA 4QL7A 4HJ2A 3IRAA 2IPAA 4IP6A 3GMFA 1PGTA 3RHCA 2LTKA 4BWQA 2GZPA 3EMPA 4FIWA 1GL8A 2GZYA 4CHSA 2OE3A 1M9BA 2HRFA 4I2UA 2FNOA 2O8VB 2A4VA 2WJUA 2F8AA 1ERUA 5ECSA 2FA4A 1W4VA 1M2AA 1CQGA 3ZVJA 2KP2A 4MDCA 2L57A 3A5WA 5G31A 2GT6A 1YF0A 1B4QA 3D21A 22GSA 4XRAA 2MBTA 5JWOB 2IMKA 3GSTA 1ERTA 1TK8B 4GLTA 3GHAA 2DIZA 3DVWA 3EWLA 3RHBA 3SWLA 1EWXA 2MMAA 4ML6A 3BD2A 2GQMA 1GSEA 6GSTA 4GQCA 2HRKA 1GH2A 3I43A 1EOGA 3IHQA 2PMTA 4HJMA 3WYWA 1TK0B 4ML1A 2CAIA 3PR8A 3HVSA 2C80A 5EY6A 4PUAA 1SK2A 2ES7A 3C7MA 2B6MA 1JZRA 1EGRA 1RQMA 3G9BA 1BAYA 2FWEA 2J23A 3VI7A 2R4VA 2HRKB 1FAAA 5JCWA 2HT9A 5GSTA 3L9VA 5JWRB 3F9UA 2AJQB 2ZCTA 1GSFA 2C0DA 4G19A 4G0LA 2I1UA 3LEFA 3TRXA 2VL3A 4WKWA 5A4VA 3GH9A 1Y25A 4ILFA 2MYGA 3IOSA 4F0CA 5D96A 4GSSA 4G9HA 3GKNA 1NSWA 4TR1A 4NXIA 2HI7A 5D8IA 1TTZA 1FOVA 5D93A 3C8EA 1FO5A 3D5JA 1GSSA 2B7JA 4CW9A 2ZUPA 2C3QA 1M2DA 5DVBA 4WETA 3N9JA 2R2JA 3DYRA 3PPUA 4PURA 5GAND 1GTUA 5EPFA 2RM6A 4TR1B 2B1LA 2HLSA 2CZ2A 1GSYA 1QMVA 2JZSA 4XIHA 2CT6A 1Q4JA 4TVEA 3QAGA 4YAVA 2VL9A 2QSIA 4LMVA 2DJJA 5ECMB 2JZTA 2CQ9A 4WBJA 2BTOT 2C0EA 2B7KA 4GSNA 3KXOA 4IW9A 1FW1A 2V1MA 3FKFA 2A2SA 2YWMA 1WE0A 2K8SA 2YWNA 3VPQA 3QFAC 2VO4A 4XHMA 1KNGA 4NHWA 2GSSA 4K9ZA 1TK5B 3GH6A 5CREA 5HFGA 3GYKA 1VF2A 2KHPA 3S9FA 2IIYA 3PINA 4BWSA 1K0BA 3IE3A 19GSA 4WBRD 1DBYA 3GKKA 1B4PA 5IOXA 9GSSA 1AW9A 1O6JA 2H74A 5DAKA 3CYNA 4MZBA 2E7PA 3QOUA 2DLXA 4NPBA 1ML6A 1R26A 4N10A 5HR1A 3DWVA 1URMA 3IPZA 2H70A 4TR3A 4OCFA 1AUCA 1CQHA 3FHKA 2J9HA 2YPMA 2K6VA 2CV4A 1THOA 4KDYA 3VK9A 6GSVA 2L6CA 1PKWA 5DAKB 4MJBA 2X64A 2PWJA 3TKRA 1ZYQB 1FHEA 4KCEA 3IR4A 3TKQA 4EE0A 2CX3A 5D73A 4L0WA 1XFLA 4ZL9A 1GTIA 2RUEA 4K7IA 5D9TA 4V1Ag 1DUGA 5CRDA 2LRCA 1AIUA 3M3MA 4POMA 4GF0A 5HR0A 1K0AA 2JACA 3JCML 5ECLB 2VLUA 2IL3A 5A5KA 1ERWA 2EIRA 6GSSA 1F2EA 2VCQA 4KNDA 5KN3A 2H01A 5IMVA 3H4KA 4F82A 3EYTA 3KM6A 1AXDA 3WT1A 1XOAA 2H0IA 4G0KA 1A2LA 4BA7A 1O85A 3EMXA 4X43A 2VL2A 4TW5A 5HR2A 2XPDA 1ZGNA 1A8YA 3D22A 4LL1B 1G7OA 1EV9A 3DEXA 4G2EA 4LA1A 4G0IA 3DGQA 1KTEA 2KLXA 1TDIA 2BJXA 4L8EA 1PSQA 2RIIA 3ZL5A 1O81A 3IAM2 2N5BA 4K6XA 3ZREA 1O73A 2GVPA 3Q19A 4TXOA 3TDGA 3G7YA 1K0OA 3WD6A 3IK9A 2C4JA 3KIJA 2HE3A 3L4NA 4GRFA 2CA8A 2OE1A 4BVYA 4JE1A 1WMJA 3TUEA 3ISOA 5J9CA 2HRAA 4IBPA 1YDKA 3LWAA 4TXOB 3UL3A 3VPTA 5IO0A 2CZ3A 3ZMLA 2KUCA 1Z5YE 4ISDA 3HJOA 3CRUA 2WB9A 1SL0B 4BVYB 2WFCA 4K1FA 5B7CA 5HQPA 1SKWB 2FWGA 2OA7A 3HYPA 4LL4B 1GTAA 1DE1A 2HYXA 2H71A 2IMDA 2L6DA 4POBA 3UMAA 1ZZYA 1SYRA 3HJPA 2VD1A 4KF9A 4TR4A 2P5RA 1PX6A 3KJYA 1OKTA 4I8BA 1H4OA 4YQMA 3F4TA 5DCGA 3LG6A 2GS3A 3EU3A 2NTOA 4WF4A 4O7HA 1X5EA 2OJLA 3DD3A 5ECNB 2LNTA 4PNGA 3HZ8A 3KH9A 1JLVA 4OMVA 5ECRB 3L9SA 4JR4A 4PX1A 4KX4A 1V98A 2H73A 1WOUA 1GUMA 4O92A 1J08A 2LSTA 4WEYA 5IMCA 1XW5A 2DJ0A 1EEMA 3NOFA 1XW6A 5CP1A 5FHIA 3FZAA 2VCTA 1TU7A 1EP7A 1YQ1A 4KH7A 4MH3A 4OFMA 1F9MA 4H86A 2WGRA 4DSRA 3KH7A 2K9FA 2AB6A 2HNLA 3CTFA 2R6KA 5KEJA 2WULA 1E6BA 3F6FA 2E0QA 4ZILA 4NWYA 4PNFA 3E0UA 1FB6A 5DBQA 1G7EA 1C72A 3IDVA 2FWHA 3VFIA 4I5QA 4X1UA 5C00A 4F03A 2FWFA 1TI3A 4ZIJA 5J41A 5ECOB 4J2FA 4X0XA 4JU5A 4GSTA 5INYA 3UVTA 3L9UA 3HXSA 4I6XA 4JZQA 1U3IA 2WDUA 3O6TA 4MABA 1V40A 1XWAA 1BG5A 1IYIA 4HOJA 4NV5A 5ELAA 3QAVA 3LYKA 5G2ZA 4I2TA 4Q5RA 1USBA 2X99A 4KDUA 2FUG2 1WIKA 5CNWA 5IMZA 2A2RA 3RPPA 1YJ6A 2B1KA 5A4UA 1A2MA 5FT3A 1OC8A 1IYHA 3FRCA 4IQAA 3KZQA 5DJMA 4V2LA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4G10A

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations