4G5PA

Crystal structure of egfr kinase t790m in complex with bibw2992
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
321
structure length
299
Chain Sequence
GEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLIMQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERDVVDADEY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Target Binding Properties and Cellular Activity of Afatinib (BIBW 2992), an Irreversible ErbB Family Blocker.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
total genus 76
structure length 299
sequence length 321
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-07-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4g5pA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4g5pA01
3CQEA 4J53A 3GT8A 4M0ZA 1A9UA 3BZ3A 2XJ1A 4GMYA 3U4WA 2VGPA 5JN2A 2UW9A 2JDOA 5CEPA 3V04A 5EG3A 3LHJA 4RFZA 3R7IA 3K2LA 4ZMFA 1IASA 2XNOA 4AU8A 5KMIA 2VTLA 4I5PA 5IKWA 4B99A 4CMUA 2VWWA 4DG2E 3BEAA 3G6HA 3BEGA 4FI1A 2YACA 1ZZ2A 2X2LA 3ALOA 3FQEA 5CU4A 5EFQA 3BU5A 1R78A 1GOLA 4C59A 5J9ZA 2XRUA 3K54A 3G33A 3KRRA 4AN9A 2P3GX 4FT5A 3WZJA 4A4LA 2X2KA 1H1PA 4O82A 4IC7A 3EN6A 5FQDC 1H24A 4JLCA 2I0YA 3CGFA 2CCIA 1BL7A 2F7EE 4ZS4A 2CGVA 2C3JA 3CBLA 3D2IA 3U8WA 4FSYA 4NH1A 3RWPA 2HK5A 4IANA 2OWBA 4II5A 3IW6A 3UMWA 3N4UA 3AC5A 5D11A 3RAWA 4UWYA 4Y46A 4E1ZA 3HECA 2E9UA 4MNEB 5CSPA 3OCTA 3ZXZA 1LR4A 1OUKA 3QUEA 3OG7A 4W9XA 4BN1A 1YKRA 5EI2A 5CF6A 5AA8A 3D4QA 4C33A 1OL6A 4DITA 5AP0A 3Q52A 3NW5A 1XBAA 4FG9A 4EOOA 4RGJA 3AD6A 3SV0A 4YZMA 4IWQA 4FTOA 3P9JA 4DH7A 2YIWA 3NUYA 3UVPA 2YCQA 5CLPA 3AXWA 4OBOA 2EVAA 4ZY6A 2OIQA 5DLSA 3UMXA 2OJJA 3GCQA 4AZTA 4AW0A 3KULA 3N4VA 2YIQA 3DPKA 3MGYA 3U9CA 2CJMA 4FSNA 4X3FB 3GQLA 3UDBA 1YXSA 1XH9A 3MFTA 4WT6A 4WUNA 2YCRA 3FZOA 3DK6A 3EN4A 5BVWA 3R9DA 2PWLA 2P4IA 3Q4ZA 4BDGA 4G3GA 4IWDA 2C5OA 4QTCA 3TKUA 3GEQA 2C6LA 4Q9SA 5AWMA 1UVRA 4PF4A 3PE2A 4DCEA 2WQEA 4DBNA 5FM2A 5H2UA 3OD6X 4GFMA 3MS9A 5G6VA 3PVGA 2UZEA 4QTDA 1UU7A 4TYEA 4AXAA 3TM0A 1OPLA 1H01A 3ODZX 3Q5ZA 2RF9A 3HZTA 4NJDA 3TNIA 4MQ1A 3V5QA 5DT0A 3W2RA 5HLWA 4YMJA 2XKCA 3P7AA 4ZS0A 5A54A 5IG1A 3VW6A 5BMSA 3R7UA 1ZMUA 1S9IA 2JIUA 4NWMA 4L6QA 4ANSA 5LVPA 2GNHA 4D1XA 5IA1A 4JI9A 4DF3A 4BBMA 2B53A 2UZNA 3RPRA 4ACMA 3QHRA 5ANGA 3RVGA 2E9OA 1PJKA 2GDOA 2J0JA 3NGAA 4FNZA 4BCFA 1OBDA 4AX8A 3BI6A 3DGKA 3LCKA 5I9UA 3RK5A 5IQEA 1URCA 2XRWA 3UIMA 4NK9A 2BPMA 3E8CA 5GJDA 3ZFYA 4FGBA 5TKDA 5CSXA 4A9YA 5K4IA 4D2WA 1WMKA 2OJ9A 5FXRA 4FV5A 3RCDA 1JKLA 1NXKA 3CD8A 3E64A 3TTIA 3ZS5A 4BWPA 5CZIA 3ANQA 2SRCA 4FSRA 4I4EA 4EJNA 4RJ8A 1H28A 4RX5A 4EBWA 4PMPA 4YC3A 3T3VA 3QZGA 4FZDB 4GIHA 3QZFA 4LRMA 5C8NA 2VTMA 3QCSA 4LV5A 4RVMA 4CYJA 3EQPA 3SOAA 5AP3A 2XBJA 5AAEA 1R39A 1XBCA 3OMVA 3HMPA 4S34A 4D9TA 3QCYA 5DEYA 2VUWA 5J9YA 3UG1A 3UPXA 2WXVA 4AZSA 3HLLA 4YNEA 2HZ0A 2Y4IC 5HIBA 4ALVA 4UZDA 4HW7A 4M68A 2VN9A 4L45A 4C3PA 1KV1A 3ERKA 4FT9A 2HWPA 2FSMX 3HRFA 5EHLA 3PJCA 2J5EA 3DXPA 1JPAA 2JITA 2FSOX 3Q6WA 4D5HA 4I6HA 3CSVA 2W4KA 4BIBA 1PKGA 3E8EA 3NZ0A 3UP7A 4R1VA 1P2AA 3V51A 5BVNA 3DAEA 5C9CA 3VS0A 4AA4A 2BAJA 1REKA 3ZFXA 3EQDA 5GZ9A 4O7ZA 4DH5A 5L6OA 1ZYLA 3DTWA 3E63A 4XHKB 3CPBA 4BICA 2IJMA 3PY0A 5M53A 5ANOA 2WMVA 4EZ7A 4IBMA 3VUTA 3GVUA 3R1SA 3EWHA 4FSTA 4DLJA 4U43A 1VEBA 2GCDA 4G31A 4ACHA 2BZIB 4PDOA 2BRHA 5AR2A 3HDNA 4F7LA 2YWVA 3IW7A 1Q8TA 3HAMA 2QURA 1H8FA 2OF2A 3DY7A 4Z7HA 3PPKA 2UW0A 1OECA 3QLFA 4QP9A 4F7SA 2XYUA 2VX0A 4IQ6A 4NZWB 3SGCA 3QD2B 3BHTA 3MH3A 5KMOA 3LVPA 4RA5A 1JWHA 2IVSA 4M7IA 3MESA 3Q4UA 1SYKA 2ITXA 3ORXA 3CKWA 5EH0A 5IA3A 2ITZA 2OFVA 2OKRA 3TACA 4D0XA 2BVAA 4CRSA 4JR3A 4JL9A 4M66A 2AUHA 2IVUA 1FPUA 3TIYA 4L7SA 1YXTA 3EZVA 1IR3A 2BZJA 3DQWA 4BTKA 2UUEA 3OXTA 1SVGA 5A46A 4IEBA 4WNMA 1Z5MA 3QUDA 2XNMA 3BYVA 2W17A 4F7NA 4F09A 3PUPA 5I3OA 3TDVA 4GU6A 4QT1A 3Q4TA 4IADA 3O96A 3TZ7A 4PNKA 2FSLX 1U5QA 5HBHA 4BCPA 2YWPA 5T68A 5FBNC 3VHEA 4D55A 4ZJJA 4K18A 5J8IA 4DFUA 1CKIA 3BE9A 3ZCLA 2JC6A 2ZAZA 3JUHA 4JRNA 5LWNA 4FTUA 4C4JA 3CCNA 2CGUA 3GCSA 3K5UA 4HYHA 4P7EA 1SNXA 2F2CB 3CXWA 3E3PA 4EYMA 3VIDA 3H30A 2P0CA 2OF4A 4IAYA 3EMGA 1R1WA 3EN7A 1DAYA 3PYYA 4I20A 4PDPA 4QMQA 1A06A 3ORNA 4ZLYA 3BGPA 4FUYA 4FTIA 4DH8A 4H3QA 4M3QA 4EORA 4FGRA 3KXZA 4IIRA 5EW9A 3UZRA 3ETAA 2HAKA 3OW4A 4J1RA 2RFNA 1R3CA 4ARKA 4KA3A 2O63A 2XM9A 2YZAA 3PIXA 4DH3A 3ZRLA 1YDRE 1YXUA 4ZY5A 2XUUA 3ZEWA 4L44A 3MFRA 4L00A 4FZFB 4K33A 5FTGA 2QOCA 1M2QA 4WRSA 4Y85A 5HI2A 3PSCA 1CTPE 1ZYCA 3SDJA 3ZLXA 5DMZA 4TW9A 3R1NA 3ZOSA 5HEZA 4FMQA 2ONLA 4O0WA 3EN9A 4DG3E 3PG3A 4BYIA 3FMLA 4A9RA 4RVKA 4M14A 3PWYA 5LVLA 3B2WA 2JDVA 2XA4A 4A4XA 3AD4A 1XBBA 2WD1A 4QNAA 3UTOA 3BHVA 2P55A 3BYMA 4U8ZA 3PXQA 3ZLSA 5M08A 1Y57A 3PZHA 4MXXA 4OT5A 5FRIA 4GSBA 4AW5A 3RPYA 5K0XA 3OY1A 4BDEA 4IAIA 4FKQA 3NNVA 1AQ1A 3LFCA 3P7BA 3SLSA 1F3MC 2WAJA 3KF7A 4PWNA 4AE9A 4QMLA 4M69A 2JBPA 4R5SA 1GZKA 4D4RA 3NEWA 5HOAA 4FEQA 3D5XA 4AQCA 3WYYA 1OI9A 4M8TA 3ACJA 5CT7A 4QNYA 4TYHB 4FTNA 4AGDA 4QMNA 3ZO1A 5E90A 3G6GA 3P5KA 1PMNA 1K3AA 2UZTA 3FDNA 4XV2A 4UMUA 3QFVA 5BVDA 2UW4A 1H0VA 4IVDA 4D4SA 2JLDA 4KIKA 1NA7A 3H9FA 4FTMA 1OL5A 5HE2A 5A6NA 1HCKA 2WMAA 3F2RA 2VX3A 5AR3A 4GH2A 3E8NA 4G3EA 2VTRA 3VWAA 5BYLA 1JOWB 1XR1A 4FKJA 2RGPA 5HLPA 3ZBXA 4OAVB 3ZYAA 2IN6A 3AC8A 4C2WA 4PL3A 5C26A 5IH6A 3B2TA 4WG5A 3I7CA 2QO9A 2GHGA 4RZVA 1NVSA 3QQGA 3K5VA 4R78A 5IA2A 5HD7A 4MEDA 5TOZA 4BBEA 4HGEA 3O2MA 3MN3A 4K9YA 3VJOA 3ZLWA 4KBKA 4O0RA 4TXCA 1IRKA 2PVKA 3DS6A 1U59A 3ZUTA 3IECA 4Q5EA 3QRJA 4P90A 1PRYA 3DB8A 3RTPA 3DKGA 5DT4A 3SW4A 4L3JA 5CEIA 5IU2A 3L1SA 4BKJA 2R3KA 5TT7A 3W2PA 3TN8A 2C47A 2YHVA 5C8KA 3F3ZA 2R3QA 4ZJIA 1CSNA 1YI4A 3A7HA 3H10A 4NM5A 3ZM4A 4CLJA 3CJGA 5HTBA 5H9BA 3OCGA 3R9RA 3N4TA 4UMTA 4QMSA 2YLEA 3BLHA 3G9LX 3LIJA 3UC3A 3EYHA 3SXSA 3EIDA 2UZOA 4CV8A 2H6DA 1UV5A 3JY9A 3O8PA 2OZAA 3WARA 4AN3A 4CQEA 5HIEA 4DC2A 3LQ3A 1XKKA 2YDJA 4LM5A 3AC3A 4JIKA 4U6RA 3FZRA 1JBPE 5EQPA 5IA0A 4E5AX 4PRJA 1O9UA 4ZXTA 3DBFA 3TZ9A 3ZDUA 1ZOHA 2O8YA 4RX8A 1YOLA 4F9WA 2XIZA 2PE1A 2C5XA 4J95A 3V5PA 2X8EA 3UQFA 2GNJA 1KE5A 1AD5A 3DAJA 4YTIA 5AUTA 4K2RA 3BRBA 5DR6A 3GFEA 3S3IA 4MXAA 4N6YA 4E7WA 3KB7A 3O17A 5J9LA 4UWBA 3BYOA 4Y5QA 4YJTA 3ZLYA 4BYJA 4CKRA 5K4JA 2VTIA 4IB0A 4AA5A 1DM2A 2CHLA 2R3OA 4K0YA 5I3RA 3LLAA 4U42A 2BTRA 5FLFA 3PY1A 3OEFX 3DZQA 4AG8A 3JXWA 3VVHA 4EOKA 4ZJVA 2O3PA 1OL7A 4RG0A 5JGDA 3QTXA 3O51A 5E8UA 3SW7A 2WTWA 4D2RA 3I0OA 1OIYA 5CI6A 4ALWA 4C2VA 1K2PA 5M4IA 3EQBA 1UNHA 4BC6A 4DA5A 3O8UA 4CVAA 3OY3A 5DFPA 2JKMA 5LMAA 3FKLA 5L6WL 2XZSA 4RT7A 1OIRA 4TYJA 1PXMA 3POZA 3ZZEA 4BDDA 3NCGA 5LVOA 4NFMA 3S00A 2PMLX 1U54B 2ZJWA 1W0XC 2W1DA 2JD5A 1PF8A 1H27A 3E3BX 2W96B 5ANDA 5DGZA 4BKYA 2BDJA 5K5XA 4YZNA 5DN3A 2RFDA 5IQDA 1Y6AA 3DFCB 4TL0A 2WMUA 3E7OA 3VUKA 3ZSHA 5ACBC 4WG3A 2YCSA 4WBBB 4XP2A 3QA8A 2WEIA 5HHWA 1JQHA 4YTHA 3FQSA 3M1SA 4AW2A 3ZZWA 5EDRA 3OOMA 2W1ZA 4RIYA 4R3PA 4RC3A 3RAIA 4DEIA 1ZRZA 5CALA 3DBQA 4IH8A 2JKKA 3UVRA 2VWUA 2WTIA 4EUTA 4ZSAA 5CI7A 4A9TA 3LM5A 3RHXA 4Q9ZA 2VTPA 4ZTMA 5J79A 2PE2A 2QVSE 3PJ2A 3QRIA 3SHEA 4FYNA 4U45A 2CNQA 3R28A 2ITPA 4ZTQA 1YI6A 3VUHA 3I79A 3BWFA 2YLFA 3CTHA 5ICPA 3Q53A 2ERKA 5KMJA 1QPDA 2X7GA 3WF7A 3TDWA 2GMXA 2W0JA 4A4OA 1ZMVA 4U0IA 2G2HA 3HA6A 3K3IA 1Z9XA 1PW2A 2O64A 3RHKA 2R3IA 4G2FA 4DT9A 2F2UA 5HBEA 3WZEA 1ZAOA 2C30A 3VHKA 2PVFA 1Q8WA 4IAAA 4UWCA 3L8SA 4EQMA 5M06A 3A62A 4JJRA 4RJ6A 3TUBA 5JQ5A 5AJQA 4UY9A 2WO6A 2GS6A 4WNPA 4F0FA 4HPUE 1B6CB 1PKDA 1KE7A 4NIFA 2BKZA 1XH4A 3NYNA 5E92A 4C4FA 2W1FA 4HGLA 4YJRA 4WIHA 3R8LA 5L2QA 3IQ7A 2C1BA 3MYGA 4CFWA 1WBVA 2Z7LA 4V0GB 4JG8A 1STCE 2R3NA 3KQ7A 4MBJA 4RWLA 3KY2A 5HNBA 2ITQA 4HCTA 2QOHA 2XF0A 3DXNA 4ZZOA 4QMVA 2I0VA 3A7FA 4HGTA 4FEXA 4XBRA 2A1AB 4R3CA 3QU0A 4IC8A 5LMKC 2Z7SA 4MXCA 4RJ3A 2PVYA 4KBCA 3NMUF 4ZAUA 5AFVA 4D4VA 4E4NA 4MK0A 2GFCA 3ORKA 5CU6A 4QPSA 3AT3A 3E92A 4I3ZA 3QQLA 2ZV8A 3HGKA 3VC4A 3FUPA 3D14A 3F5PA 4CFUA 2DS1A 5HU3A 3EYGA 3TTJA 2X0GA 1PMVA 1JVPP 1GZOA 2YISA 3DK7A 3GU5A 3LFFA 3PIZA 3PJ8A 5CNNA 5HE3A 5BVEA 3R02A 4LL5A 4JBVA 4ZSGA 3PA4A 4S33A 4W4XA 4DEEA 2XCKA 4FKSA 4C37A 4EL9A 2ONLC 5AUZA 5HG8A 3C4EA 4FNWA 4F1MA 4BDAA 4U80A 3GU7A 5EYCA 4QMTA 3NUPA 4L01A 5AV4A 3F2AA 1J1CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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