4G8NA

Crystal structure of the kainate receptor gluk3 ligand-binding domain in complex with the agonist g8m
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
TNRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Pharmacological and structural characterization of conformationally restricted (S)-glutamate analogues at ionotropic glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
molecule tags Membrane protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8nA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8nA02
2F5XA 4OEUA 3S9NC 2UYEA 1S7YA 3V89B 1VFDA 1JVYA 1Y3QA 3RGYA 4KPTA 4EF1A 4R75A 2NXOA 5L9SA 2NWJA 1A40A 3EHSA 5I2KA 1LLSA 3EQ1A 1N0TA 2F6GA 1KWHA 3GZGA 4OFOA 3GBAA 3H6UA 4ZEKA 1ATGA 2PX1A 1J1NA 5L9MA 3Q26A 3VVDA 1WDNA 3VLVA 3IAZA 3VFJA 3KJ7A 3UN6A 5HBCA 1MXXA 3MW0A 2XX9A 3W15C 4M4GA 1JW4A 3HHFA 2XXRA 1MM6A 3PPOA 3QXMA 5CMCA 5TP9B 2H5YA 3OSQA 3RN8A 4THIA 1SD3A 2F7BA 3PD9A 3K02A 3VLUA 4EUOA 3ILUB 2KLFA 3G7WA 4ZEBA 1SI1A 4U4XA 2DVCA 3FIRA 3PMXA 4ZEIA 5AA3A 3OO7A 4P0GA 1M5EA 1USYE 3RTWB 2ZYNA 2QS2A 3OO6A 2P0SA 3H03A 3K1NA 3FVKA 3OMBA 4YZZA 4TLMB 5B70A 3IK6B 3H4ZA 1MQIA 4NF6A 2FA7A 5DEXB 2Z22A 3GXAA 4ECFA 4FJPA 1QW0A 1TFDA 4GOTA 3MP1A 3TKDA 4IO4A 4LP2B 1R1NA 4HS7A 4OFJA 5HPQA 1FQFA 3LBSA 2OZZA 3TTRA 3UP9A 2V3UA 1MQHA 1USYH 4G77A 5FHNA 2I48A 3LSFB 1B3FA 1M5DA 4GFRA 4N6PA 2X7PA 2Z8DA 1US5A 2VD2A 1OQGA 1R6ZA 4RK2A 1EU8A 4ZZAA 3U94A 1LCFA 3C32A 2Z8FA 1AIVA 1N7XA 5I58B 5DVJA 1LBCA 3JV9A 5DT6A 4IY5A 1IZ1A 4DDDA 4Q8RA 5FHOA 3CIJA 4HCYA 1WVJA 1B5IA 4O3BA 1B6HA 5KDTB 1Y9UA 4ISUA 1NNPA 1TT1A 4FAJA 4ZEFA 2ZNTA 2H99A 4PETA 4MH5A 4PQJA 5KCJA 5TP9A 2D5WA 4GVOA 4RPNA 2DP8A 2XX8A 2B3FA 3N26A 5I56A 1NNFA 2YPNA 3RT6B 3LUYA 3VVEA 2DE2A 3FD3A 4TOZA 2XXHA 3BFUA 1GGGA 1N3WA 3HHGA 4YB5A 3TTMA 1JQFA 3PPNA 3S2VA 2HFBA 3O6IA 3CSBA 2PVUA 3C34A 3UORA 2I3WA 2Y7RA 2NUVA 4YKPA 1MPDA 4G68B 4PFYA 3MQ9A 4X1DA 4QHQA 2H4IA 2IA4A 4XIGQ 3PD8A 2CZLA 2DWHA 1UTBA 5CMKA 2M8CA 4F3PA 3PUZE 4M1VA 2AL4A 1WODA 1A99A 4R6KA 4GRKA 3WAFA 3RNNA 4U23A 3QAXA 4R73A 1MRPA 3ILTB 1NNTA 4ONYA 3ZKLA 1RYOA 2ZNSA 3RUMA 5TPAA 2QJEA 3PUYE 1B3GA 4ESXA 1R9LA 4F1UA 3R26A 2Y7IA 4QF9A 5DYHA 2Q9TA 4IGTA 4YAHX 4ELRA 1SQYA 3IO4A 2Y7KA 5K2YA 3HV1A 1O7TA 3CFXA 5ICTA 1YTVA 5I58A 4F3SA 4ZEDA 2V84A 3K00A 1H3DA 3DM0A 3A3UA 2HAUA 3FASA 2O68A 1O64A 3K1PA 2A5TA 3H6VA 3MPKA 1SYIA 4KYDA 4DCXA 1ZKBA 4RA1A 3Q27A 3PPQA 3C4MA 2F34A 3RT8A 4OQOA 3MVZA 2PMSA 3B6QA 1SI0A 4U22A 3SEXA 1SW2A 3V5AA 3V83A 2BJJX 2DSFA 3PGFA 3HSTA 3T9UA 4LZ7A 4XKNA 4F2QA 5FTIA 4E0WA 1VR5A 3TFLA 1JW5A 2CMOA 3TMGA 4XKRA 1UIVA 4ZZEA 1Y20A 1MH4A 1PBPA 4H67A 1QKBA 1VE4A 2OBGA 3FJMA 4BDRA 4YMBA 1MXWA 1DTGA 4KYSA 2DOJA 1LAHE 4ZS9A 1B4ZA 5FHMA 4BDQA 3B6TA 1UQWA 2QS4A 3M3FA 3O29A 3VE1B 1TWYA 3WAEA 3DP6A 2G29A 4DZ1A 3D4GA 4RY1A 2REJA 3KG2A 3DELB 1XT8A 4RYAA 3MUQA 2Q89A 3L6HA 1B32A 4F18A 3HO7A 2W7YA 2H98A 2F6PA 1UIUA 3O9PA 5H8SA 2IEEA 2GHAA 4H8IA 4DXCA 1QUKA 4PP0A 3TYHA 5I59A 4BLAA 4NWCA 3SEUA 1CB6A 5ICQA 3EHUA 3OD7A 1B58A 3PPRA 3U93A 2ZYMA 3QYTA 1P1NA 5BWJA 3T66A 4FORA 2VHAA 3TCHA 4BDNA 3SEWA 3Q29A 3N94A 3S9LC 4XKQA 1P1OA 2ZMBA 1N3XA 3ODBA 3VXBA 3O6HA 1ELJA 3C9HA 3KOTA 1MXVA 4EXKA 2QMWA 3VDFA 2NOOA 1LAFE 4DE8A 1EZOA 4BDOA 2PBWA 3Q25A 2X7QA 1POTA 4LUBA 2I0CA 3O6GA 1GTKA 1GV8A 1PEBA 1XHYA 3OEKA 5F1QA 1OIBA 2DXYA 1LFIA 4G4PA 4NF5A 1GR2A 2F7CA 4YICA 5H8QA 4OENA 4JWYA 1B7HA 2F7AA 3DLNA 4OXVA 1B3LA 2I58A 2V93A 2YLNA 3B6WA 3IB0A 2O7IA 4GXAA 2ESNA 3H06B 4LA9A 4N13A 1HSEA 4G2ZA 3T9XB 1MQDA 3OENA 2XXPA 1FTOA 1NL5A 5AA4B 3TODA 3KN8A 1YAEA 4F19A 1IIWA 2HEUA 2O1MA 3VXCA 3G3FA 2VOZA 5CI5A 3TUSA 3OOAA 3FJGA 1XC1A 3T93B 5CMBA 4QFLA 1FCKA 2XXTA 1QULA 4R6HA 2XD3A 4QSDA 3OO8A 4OTEA 5I2NA 2FYIA 3QIMA 2UYFA 4WEPA 4FEDA 1IEJA 1MM7A 3H6WA 2RCBA 5I57B 1L5TA 4NF4A 5JTYB 2H25A 4GLIA 4HCWA 5H8FB 4MLQA 4EDPA 3BFTA 5ITPA 1US4A 2AIXA 2B65A 3IX1A 1F9BA 1LCTA 1BP5A 3KGCA 3U1OA 1UTHA 4KYEA 3HPIA 3USDA 3CSGA 1GVCA 3O66A 2D3IA 2I6EA 1XS5A 2O51A 3LSLA 4BDLA 2I49A 4GL0A 1NKXA 3U8QA 1AOVA 3IOTA 1YPNA 4F2OA 1NNKA 2HQ0A 2XX7A 2QS3A 2F35A 5AA2B 3CVGA 2QMXA 4I8CA 5BUUA 4R74A 3S9EA 2RKMA 3FJ7A 1H43A 4XXUA 1M5CA 1QJMA 4I9DA 3IJOB 3T96B 4YU0A 2YJPA 2RC8A 1R9QA 1PB7A 4IO2A 2ZXTA 3UGWA 3FVNA 4EF2A 2R9JA 1A8EA 1SVXB 4NF8B 3MPLA 1QVSA 1OVBA 1H76A 2Q8JA 3OELA 3PPPA 2OWSA 5EHMA 3TAJA 3TDJA 3CG3A 4C1UA 2PT1A 1D4NA 1CE2A 2GHBA 3FXUA 3C36A 5H8NB 4R9GA 1MQGA 3R7XA 3FVGA 1SW4A 1N76A 4IO6A 3SERA 1MDQA 3KSJA 2OLBA 5AA2D 1JEUA 5DVIA 5ISUA 3N6UA 2Z23A 3TTLA 3IL1B 4UACA 3B7DA 3DP4A 3S4UA 5I57A 1D9YA 2V3QA 1B1XA 3CR9A 2Y84A 5CRYA 3PMVA 5DEXA 1Y3PA 1FTKA 1RKMA 3JZJA 3E13X 1B0HA 1OVTA 2ALUA 3T22A 1ZJLA 1DTZA 1Z7ME 2XXUA 4I1DA 4DCYA 2I4BA 4KI0E 4KR5A 1JEVA 3CI8A 4X48A 4OESA 4I62A 2WKYA 1JVXA 3W9WA 1DMBA 5JEIA 4WEDA 3HCQA 4DLDA 5EHSA 3MP6A 3F11A 1SW1A 4OMBA 1NFTA 4BDMA 2XXYA 3KEIA 1POY1 3IOUA 5CM6A 2UVHA 3MVWA 2XXVA 3SEVA 1I6QA 4LQ5A 4YMAA 3EN3A 3MZBA 3FV1A 1T0KA 1N04A 5KDTA 4XKPA 1MPBA 1MXUA 2HXWA 4TLLB 4U1OA 4OZ9A 2D21A 4KFQA 1LAXA 5H8HB 4U4SA 2QPQA 4OEVA 3V8XB 1MY2A 2I0BA 3C33A 1ZU0A 3D4CA 4G8MA 1PB8A 5F7VA 4E0XA 2E1SA 2QRYA 2RF1A 1MS7A 1OLCA 3KOSA 1LFHA 3O28A 2R71A 1FQAA 3K6VA 1DPPA 1H45A 2V25A 5CBSA 4G68A 1B3HA 3KJTA 1II5A 4Q0CA 3R6UA 3W9VA 2O1LA 2RCAA 5CC2A 1BIYA 3FXQA 2I4CA 4KD5A 2P2AA 5JK4A 2OCUA 1PDAA 4U2RA 2DYXA 3IO6A 4UA8A 2ANJA 2OWTA 4F1VA 3TQWA 2XXIA 2HCAA 2XXWA 1MG1A 3K1MA 2Q88A 4YKIA 3ZKKA 4F1YA 4OYVA 1XVYA 1URDA 2Q2CA 5EYFA 3TCFA 3H6TA 4R72A 3O2AA 2Q2AA 5I2KB 1LFGA 3H7MA 1FW0A 3T9VA 1D3KA 1IXIA 3P7IA 4RK9A 1AMFA 1AL3A 3IORA 1N84A 4OETA 4RPOA 1YCJA 3PU5A 4OHNA 4MF3A 4FECA 3TTNA 3OEMA 3K6UA 2DE3A 2I3VA 4G68C 4LATA 1URSA 3G3GA 2UVJA 3N6TA 2B3BA 3TQLA 1I69A 1LBBA 2F8DA 2ONKE 4FE8A 1N7WA 3QSLA 4IO7A 3MJNA 4OERA 4H8JA 4PE5B 4Z0IA 3K01A 3RY3A 4YKJA 4FEBA 2XXXA 4F39A 4JWOA 1B1HA 1Y3NA 3CRBA 1B9JA 3ECRA 4K3FA 1MY4A 3K6XA 4QFPA 4QFOA 2Y7PA 4EQ7A 1BKAA 3T9HB 4NF6B 3UA8A 4FATA 4IO5A 1EZ9A 1OLAA 4P11A 1LB9A 4H5FA 1MDP1 2HZLA 5DTBA 3JYRA 2G93A 2Y7WA 3S9MC 1QKAA 4YKKA 2VGQA 3TZAA 3U72A 5I84A 1IITA 3MC2A 3MZ1A 3EPEA 3PMWA 3M3KA 3TELA 3TCGA 4R9FA 1B46A 3OXNA 1LB8A 2PT2A 1Y4TA 2QS1A 3BKIB 3IOWA 3SEYA 2F97A 4R2BA 1Z7NE 5IKBA 1FQCA 5AA1A 4X1BA 5KCJB 2AYSA 1Y1ZA 2HZKA 1B4HA 4DIGA 1H44A 2A5SA 1QUJA 1IXCA 4JSDA 5J1DA 5I56B 3EHTA 4N07A 1M5BA 4FIMA 4TQUQ 4HTGA 4DXBA 1A8FA 2FNCA 4QSEA 2ZYOA 1FQEA 2GFEA 3KZGA 4ZDMA 3U92A 5KZTA 1B40A 5TU0A 3VVFA 3QUFA 1FQBA 1LSTA 5FTHA 2H9BA 4IY6A 3DP8A 3Q28A 2O6AA 1HSLA 4KQPA 3K4UA 4GWOA 1UTBB 5IAIA 5K2XA 2REGA 3E4RA 4QFNA 2XHDA 2NVUB 1B7UA 1MPCA 3A3CA 2OK2A 2GH9A 4C0RA 4F3GA 2F36A 4Q30B 3FUZA 1EZPA 1Y1MA 4POWA 4O3CA 1ZBMA 3MZ9A 2DE4A 2UXAA 3FGSA 3MWBA 4P0IA 4L17A 5TPAB 4EQBA 1FTMA 4EQ9A 3C35A 3KBRA 1SW5A 1URGA 3SKPA 2ABHA 4LQ2A 4LVQA 4XTCQ 5M2VA 3I3VA 3N5LA 3E3KA 4GIZA 4JB7A 1SDXA 5L8DA 4JSOA 4KCCA 2X26A 4IB2A 5AA4A 4R6YA 3K6WA 4ZE9A 2O7UA 2PYYA 2A5TB 1NH7A 4JBZA 3G3KA 3LSXA 2RC9A 4EXLA 4Q5TA 4H5GA 4GD5A 1IXHA 2UVIA 1NMUA 1ANFA 2XXQA 3L6GA 3GLBA 1QUIA 3VV5A 4POXA 4F3BA 2OJTA 3C31A 1B5HA 5LOMA 3UK4A 3MP8A 4KHZE 5A5XB 5JTYA 4OWDA 5H8FA 4C1TA 1ZMGA 4O3AA 2AL5A 2THIA 3PUWE 4PFUA 4ELQA 1FTJA 1VSOA 3FZVA 1ZLQA 5ELVA 3IJXB 1D9VA 4NMYA 3PUXE 4U1ZA 1B2HA 3OO9A 1Q35A 4G8NA 4ELOA 4WKMA 4YB7A 4X9TA 5B7DA 1TFAA 1IXGA 1JETA 4F31B 5L9OA 5AA2A 1B3EA 1I6AA 1Y4CA 5CBRA 3IR1A 4GXSB 1Q1KA 3ZSFA 4GF8A 2UVGA 4ELPA 3GBBA 3ONMA 3PV0E 1FTLA 2ONRA 4F29A 4NF8A 1LGBC 4ZECA 1PC3A 3G3IA 3BBRA 3K0VA 1MH3A 4GL8A 1I6BA 3EF7A 5I59B 3KN7A 4JWXA 4R2FA 1B7ZA 1P1UA 1IUDA 1B52A 2DVZA 3IB2A 5HM4B 1RYXA 2F78A 4QFKA 1XVXA 1JW1A 3SETA 3FATA 3CG1A 2RC7A 3O97A 1DPEA 1XOCA 3KSXA 5H8NA 4H0WA 3TEPA 4OFLA 1BTJA 2O84X 4QSCA 1LAGE 3TTKA 1B5JA 2DWIA 5CMMA 1EH3A 1JNFA 4PFWA 3KN3A 1OMPA 3CFLA 1B05A 4NEDA 3LSWA 3PUVE 2GRVA 4ESWA 1M5FA 4OVJA 5A5XA 3MBPA 4MLVA 2V3TA 1P1QA 3FV2A 3KFMA 1PB9A 3M3LA 2QL3A 4G8HA 1MQJA 5DVFA 4AB6A 2P1SA 2Z8EA 3SESA 4MFIA 4JDFA 2ZYKA 3HN0A 1ZIUA 1TXFA 3CFZA 3OSRA 3I5OA 2O69A 3IOVA 4F22A 2RINA 3MVYA 3G3JA 4MBPA 1MY0A 4RJZA 1B51A 3K2DA 3QK6A 3LR1A 3RPWA 2VP1A 4ND9A 4YB6A 3H3GA 2DXRA 4NF5B 2QSXA 3M8UA 3RTFB 3SDFA 4JXIA 5H8QB 1B0LA 3RLFE 2ZNUA 4NTLA 1HSJA 1S9TA 3MAMA 1MY3A 3E9XA 3THIA 1PBQA 4AQ4A 3LC8A 1A55A 1O63A 4H6DA 1MXYA 2VD3A 1P1WA 4PFTA 3ZS6A 4H1XA 2ONSA 4GQOA 4NWDA 5AE4A 1FQDA 1A54A 3MVXA 2DWJA 4KCDA 1BLFA 3FXRA 1MY1A 2DWAA 1ZTYA 1P99A 3I6VA 5ITOA 1DSNA 1VFEA 3RQTA 3TPAA 3VLWA 1OQHA 4HW8A 4LZ8A 5H8HA 1S50A 1AH5A 3QUJA 1SYHA 3G3HA 4AB5A 1MXZA 4WXJA 1SBPA 2R6GE 1NH8A 3IB1A 4LZ5A 4QRZA 5I2NB 4U21A 4ZE8A 1A7LA 4NF4B 4Z7EA 2DS9A 2XD2A 4DXUA 4IGRA 4H65A 3FVOA 3A09A 2DQVA 1UTHB 2E0SA 4RNSA 1IQ7A 1DOTA 4LONB 4NE4A 3AXFA 2HAVA 4IO3A 3UIFA 2LAOA 4RXLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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