4G8NA

Crystal structure of the kainate receptor gluk3 ligand-binding domain in complex with the agonist g8m
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
TNRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Pharmacological and structural characterization of conformationally restricted (S)-glutamate analogues at ionotropic glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein/agonist
total genus 83
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8nA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8nA02
4POXA 5DVIA 2XXTA 1OQHA 3VLWA 1SQYA 2PT2A 3TTMA 1FTMA 2DYXA 1B0HA 1FQCA 1ZU0A 3U92A 1AOVA 2BJJX 4Z7EA 1B5HA 1LAXA 2W7YA 3O97A 3CI8A 2Y7IA 4R9GA 1YTVA 2ZYMA 1PB7A 3AXFA 2I6EA 4X48A 1QUIA 1NKXA 3D4GA 1FTOA 3K1NA 5L8DA 1S50A 3FXQA 3W15C 3O28A 5IKBA 4Q8RA 5FHNA 3MZBA 1P99A 1UIUA 2Q2AA 3OOAA 3B7DA 4I62A 4JXIA 1M5EA 4R9FA 3TKDA 4N13A 1AH5A 4MH5A 4ND9A 1O64A 4LQ2A 5DEXB 2XXVA 1LCTA 1MPBA 4OETA 4NF5B 2P0SA 1FTLA 3B6QA 5JK4A 1Q1KA 3RTFB 1B9JA 3W9VA 4G8NA 4NF4B 3FJGA 3MJNA 4F3BA 3IO4A 3FXRA 5CRYA 1EZ9A 4MF3A 1XT8A 5J1DA 1UTHB 1VE4A 4GRKA 4IB2A 3I3VA 4RNSA 4YZZA 2VD2A 3HCQA 5ISUA 1EZPA 1SYIA 1B3LA 1P1OA 3FVKA 2ZXTA 5I2NB 1OVTA 1Y4CA 3OENA 1LBCA 1URSA 4MBPA 2RC9A 3U94A 2UVIA 4KYSA 3CVGA 3IORA 4O3CA 1QW0A 3VFJA 3UGWA 1XVXA 1B7UA 5CBRA 2QSXA 2OWTA 3PUZE 2FYIA 2UVJA 5CMBA 3PUWE 2NVUB 4H6DA 1AL3A 4NF8B 1SBPA 1SW5A 1AMFA 4YB7A 2YLNA 2V3UA 4U4XA 2HEUA 4ELQA 4F31B 3B6WA 3IB1A 5H8FB 2FA7A 5F1QA 4RY1A 2F34A 2XHDA 2M8CA 4BLAA 2F6PA 1WVJA 4GXSB 1MQIA 2DVZA 4L17A 1QVSA 1MH4A 2QL3A 3V89B 1M5DA 2ALUA 3MWBA 4EXLA 3H3GA 3C32A 3GBBA 3PUYE 1YPNA 3R26A 4NE4A 4AQ4A 4H5FA 4R73A 3U1OA 4C0RA 1ZBMA 3FJ7A 3QIMA 4G68A 1A8EA 4OESA 3MVZA 1FQAA 3TUSA 3ILTB 1LB8A 3OSRA 2V93A 4ZS9A 3EHSA 2REJA 1LB9A 4F1UA 2D3IA 4U1ZA 3QK6A 4FEDA 1TFDA 4R2FA 1VFDA 2ZNSA 1BTJA 2XXWA 4C1UA 4Q5TA 3CIJA 5A5XA 1FQEA 2I3WA 5JEIA 4LQ5A 1QJMA 2HZLA 1GTKA 1A54A 1LLSA 1MM6A 1B2HA 3IX1A 2UVHA 2V84A 5I56A 1T0KA 2F6GA 4RYAA 1B3HA 2ZYNA 3S9MC 1FQBA 2Q89A 3S9LC 1A55A 1DTGA 3TCGA 2F97A 2QS4A 2RCBA 2A5TA 4GD5A 4GF8A 4ZEDA 2VOZA 2RF1A 4GXAA 3T22A 3JV9A 4DCYA 3VLVA 3TCHA 3T9XB 5FHMA 2V3QA 4RK2A 5BUUA 4FEBA 5H8NA 2F7AA 2P1SA 5FTIA 4YKIA 2ONSA 1NH8A 4IO6A 4DE8A 3TMGA 3UK4A 3HHGA 3MVYA 2RINA 1R9QA 3RN8A 4U2RA 3SERA 3H4ZA 5I57B 1UTBB 3MVWA 4G77A 2GHAA 3KFMA 1BLFA 3T9VA 3S9NC 3CFLA 1IXIA 2O1MA 3TELA 1DMBA 1EH3A 1MY2A 2H98A 3K00A 3MP6A 4QSEA 4QFOA 3T9HB 1IITA 3THIA 3E3KA 4RXLA 1Z7ME 2XXIA 4F39A 3GZGA 3K01A 1JEVA 5H8SA 2PX1A 3IJXB 5DYHA 3TEPA 5TPAA 5ICTA 3MZ1A 1MXUA 3M8UA 3IO6A 1VSOA 2OLBA 3P7IA 3G3JA 3MPKA 1Y3PA 3HO7A 1CB6A 2HXWA 1DSNA 2ESNA 3CG1A 4U22A 1H76A 2XD3A 1MQGA 3MW0A 1B3FA 1SW2A 1IXCA 2F36A 1GV8A 4MLVA 2R9JA 2UXAA 3RQTA 5KZTA 4YKJA 2RKMA 3K4UA 3S4UA 3W9WA 5H8QA 2HCAA 4F3PA 4IO2A 4OVJA 4ESXA 2NOOA 2XXHA 4ZEKA 5H8HB 2GRVA 1RKMA 4GL8A 2Y7RA 4FECA 5I58A 3MPLA 1F9BA 4JSDA 2AL5A 1LCFA 2PT1A 1IUDA 2B3FA 3GLBA 3OMBA 1PBPA 4ZE9A 2DWJA 4ZDMA 4LVQA 3FVGA 4M4GA 1MH3A 3FUZA 1D4NA 2H25A 1B0LA 4G8HA 3FV1A 5KCJA 3K1PA 5LOMA 4KR5A 2Q8JA 3K2DA 4QFKA 2NWJA 3R6UA 4NWDA 1CE2A 3EF7A 4BDOA 4LUBA 4EQ9A 4Q0CA 2F8DA 3LUYA 3E4RA 3IK6B 4KCDA 1IXGA 3PMWA 2ANJA 2R6GE 4EUOA 3O2AA 5KDTB 2H4IA 4HCYA 3IOUA 1A40A 3IAZA 4LONB 1OQGA 1P1QA 3HV1A 4MLQA 1II5A 3TYHA 3IOTA 3D4CA 3MBPA 4WXJA 3CSBA 3MZ9A 2I4BA 3GXAA 4DIGA 1B46A 1N3WA 1LAGE 4QFLA 3KZGA 4LZ7A 2NXOA 5ICQA 1P1UA 1M5FA 1US4A 1MXYA 2HZKA 2O7IA 1TXFA 3JYRA 5AA4A 5F7VA 1O63A 5FHOA 4YMBA 1H44A 1HSLA 4THIA 5L9MA 1UQWA 1P1NA 2GH9A 1B32A 4I9DA 1B5IA 3CFZA 1SI0A 1H3DA 3DP8A 3SEUA 4FJPA 4IO3A 3M3LA 4IGRA 2AYSA 4OWDA 2DXYA 1B7ZA 5TP9A 1FTKA 2XXPA 1WODA 3T9UA 3QUJA 2H5YA 3EN3A 3K6VA 1EZOA 3HSTA 3WAEA 1N04A 4YU0A 4N6PA 4OTEA 3VLUA 2Y84A 4DLDA 3ZS6A 4YMAA 3H7MA 3LSXA 4X1BA 4OENA 1SW1A 1I6BA 3RT6B 3PD8A 3IB0A 3KGCA 4ECFA 3PUVE 3B6TA 2YJPA 1R9LA 3O66A 5FTHA 3C33A 4JWYA 4O3BA 3UP9A 3TQLA 3EPEA 4EF1A 2KLFA 1IEJA 4XKQA 3SEXA 2H9BA 3MAMA 5TU0A 4G4PA 2P2AA 3LC8A 3PMVA 3TPAA 3KN8A 4HTGA 5DVFA 4HS7A 4G68B 4JBZA 4PFUA 4UACA 1FW0A 1GVCA 4M1VA 2DE2A 1B05A 3DP4A 2ONRA 1JQFA 4YB5A 4F1VA 4I1DA 2PYYA 1N7XA 3I6VA 5DEXA 3FGSA 3HN0A 3C35A 3QXMA 4KHZE 5A5XB 4R75A 4BDQA 4KYDA 3CRBA 3QAXA 4LZ5A 1ATGA 4H8IA 2AL4A 3ONMA 2B65A 4P0GA 2HFBA 3DP6A 4JWOA 1Y1ZA 2XX8A 4KYEA 5HM4B 4IY6A 4BDMA 5L9OA 3KJ7A 3MQ9A 4RA1A 4WEDA 3V5AA 2OCUA 4XKNA 4YKKA 1OLAA 1OMPA 2A5TB 3FASA 3VDFA 1B5JA 4G8MA 1J1NA 1PC3A 4QHQA 4NF6A 3K1MA 4GFRA 4JB7A 1TT1A 2IA4A 3IR1A 1MXZA 4F22A 4KPTA 5IAIA 1SVXB 3LSFB 5I59A 3KSJA 2I3VA 4NF8A 2DS9A 2HQ0A 4IO5A 3H06B 3H6VA 1NL5A 4BDRA 1NNKA 1D3KA 2G29A 3OO8A 4U4SA 4KFQA 1YCJA 3N94A 4F2QA 1QUKA 1ZJLA 1B3EA 1URGA 4TLMB 1LSTA 1JVYA 4LP2B 4FATA 5B7DA 4KCCA 3TFLA 1PDAA 3OD7A 1S7YA 5CMKA 2QS2A 3N5LA 2O51A 5TPAB 4ZECA 3EQ1A 1QKAA 3IJOB 3ZKLA 2F7BA 4QRZA 3DELB 3FZVA 2NUVA 3LSWA 3OO7A 3FD3A 4XKRA 1BKAA 2AIXA 3KN7A 1Y20A 1UIVA 1B58A 1IIWA 4JWXA 3KBRA 4N07A 4BDNA 2D5WA 5ELVA 4PP0A 3A3UA 4P0IA 1XHYA 1JVXA 1VR5A 5ITOA 1US5A 4OMBA 4PFYA 4EDPA 1OLCA 3IOWA 5JTYA 2A5SA 3OEKA 5I2KA 4DXUA 3KG2A 5H8QB 2ZYOA 1M5CA 1MXVA 2DWAA 3MVXA 3RNNA 1TWYA 1NH7A 5I58B 1HSJA 3PGFA 3OELA 3PPNA 3PPOA 3KSXA 2ZMBA 4FIMA 1FTJA 4LA9A 3H03A 3KOTA 5AA2A 3E13X 2VHAA 2O7UA 1SDXA 4HW8A 1B51A 4RPOA 4ESWA 4F18A 5KCJB 3UN6A 4RPNA 4POWA 4H8JA 2DP8A 2E1SA 1NNPA 1XS5A 1QUJA 2XXRA 2V3TA 1B6HA 2QS1A 4E0XA 1MG1A 3N26A 3TTNA 4AB6A 1I69A 3DM0A 4IO4A 3BFUA 1RYOA 3OXNA 3PV0E 3C4MA 1P1WA 2QMXA 2DQVA 2HAUA 5I57A 4RK9A 1M5BA 1B3GA 4YAHX 1JW5A 3I5OA 4LZ8A 2Q9TA 2Y7WA 3WAFA 1ZTYA 2DSFA 2X7QA 4H67A 3T96B 3SEYA 3SESA 1LAHE 1JNFA 4ZEFA 2PVUA 3FV2A 4QFPA 1SYHA 1PB8A 1O7TA 3FATA 4OFLA 1KWHA 4X9TA 5HBCA 4DXCA 5CI5A 5AA4B 1ZMGA 2UVGA 4PFTA 1IXHA 2ZNTA 2QRYA 3RUMA 1S9TA 4KI0E 3TCFA 2F35A 1JW4A 3OSQA 3C31A 4C1TA 1NMUA 3O6IA 1I6QA 3HPIA 1GR2A 5CMMA 3EHTA 2THIA 3SEVA 2WKYA 4TOZA 4OERA 4DCXA 3L6GA 1PB9A 5TP9B 4GVOA 2D21A 5DTBA 4ZEBA 5AA1A 1LFIA 5K2YA 4QFNA 4RJZA 3CSGA 4F3SA 3PPPA 2PBWA 2DWIA 4ELPA 3MP1A 1N76A 4E0WA 4EQ7A 3ODBA 5H8HA 3RY3A 3PU5A 2XX7A 1YAEA 4JDFA 5EHSA 1MPCA 3A09A 2VGQA 3RTWB 4IY5A 2RC8A 4OZ9A 5AA3A 1MDP1 1GGGA 4K3FA 4HCWA 3FXUA 1JW1A 1MPDA 1ANFA 4F3GA 4OYVA 5HPQA 1BP5A 1FCKA 3TZAA 3H6TA 2O84X 3DLNA 4DXBA 3TAJA 1POTA 2X7PA 2G93A 2E0SA 2CZLA 3H6WA 3TODA 4JSOA 2RCAA 4R74A 4WKMA 4OFJA 4QF9A 2F5XA 2HAVA 4ISUA 1A99A 1D9VA 2QJEA 3TTRA 1QKBA 2YPNA 2Q2CA 4KD5A 3V83A 4MFIA 4YB6A 4OQOA 4NEDA 5KDTA 2QS3A 3KEIA 3GBAA 4P11A 1DPPA 1N3XA 1DPEA 1DTZA 3G3HA 2OK2A 1H43A 2O68A 1MXWA 3PPQA 2V25A 2XXQA 5BWJA 4ELRA 4TLLB 5M2VA 3G3FA 4U21A 1BIYA 3KN3A 2FNCA 3S9EA 4EQBA 3SKPA 4NMYA 5DVJA 1ELJA 1R6ZA 3UIFA 2Y7KA 4FAJA 2O69A 2QMWA 4F29A 2XX9A 2OJTA 1Y3NA 5K2XA 4IGTA 1LFHA 4EXKA 3H6UA 3M3KA 4OEUA 4NF6B 3JZJA 1IZ1A 2XD2A 4OEVA 4H65A 4PE5B 3Q25A 4ONYA 1USYE 3C36A 2X26A 3EHUA 3VVEA 4OHNA 1MM7A 3SEWA 2OZZA 4NF5A 2I0CA 1B4ZA 5I59B 1PEBA 3LBSA 5I56B 4ZZAA 4NF4A 3K0VA 5EHMA 2Q88A 3TDJA 3TTLA 1PBQA 1Q35A 1UTHA 3PPRA 3K6WA 1N0TA 2I48A 1B1HA 3LSLA 2F7CA 4GWOA 1QULA 3S2VA 1JEUA 1XC1A 3M3FA 5I2NA 1MY0A 2H99A 3K6UA 3V8XB 4R6HA 3PUXE 3CFXA 5H8NB 4PETA 4GLIA 3E9XA 2ONKE 1NNFA 3HHFA 3FIRA 3VVFA 1TFAA 3OEMA 4TQUQ 3R7XA 1LFGA 4GOTA 2VP1A 4GQOA 5B70A 3N6UA 1N7WA 1NFTA 4BDLA 4XXUA 3ECRA 2B3BA 5JTYB 4R2BA 3SETA 5I2KB 3L6HA 2I4CA 2UYEA 3Q26A 3VXBA 5H8FA 4Q30B 3K6XA 3IB2A 2XXYA 2PMSA 3CG3A 2DE3A 3OO6A 4X1DA 3C34A 4XIGQ 3RLFE 3OO9A 4Z0IA 1ZIUA 5CC2A 5AA2B 1MRPA 1B40A 4R6KA 2DOJA 3PD9A 3K02A 4NWCA 1A7LA 2OWSA 1FQDA 4G2ZA 2R71A 1I6AA 3IL1B 3A3CA 4H0WA 3FVNA 4NTLA 3RT8A 1B52A 4ELOA 2QPQA 3LR1A 1LGBC 3TQWA 2Y7PA 4YICA 4GL0A 2GFEA 5AA2D 4I8CA 4F19A 2ABHA 4QSCA 1XVYA 1Y9UA 1DOTA 4U1OA 4ZEIA 4XKPA 1Y1MA 4DDDA 1B7HA 1WDNA 2XXUA 3USDA 3FVOA 1Y4TA 3VV5A 5ITPA 4H1XA 4IO7A 4XTCQ 4PFWA 1SD3A 5CBSA 1H45A 5EYFA 1MY3A 5CMCA 1LAFE 2GHBA 4FE8A 1MY4A 1L5TA 2Z8DA 2ZNUA 4OXVA 1MXXA 3MC2A 1POY1 1Y3QA 3G7WA 2ZYKA 2DXRA 3N6TA 1OVBA 2Z23A 4WEPA 1SW4A 5L9SA 3O29A 1MY1A 3O6GA 1D9YA 1JETA 3Q28A 3BBRA 1Z7NE 2Z8FA 3O9PA 1ZLQA 3RGYA 5I84A 1RYXA 2OBGA 1A8FA 2IEEA 2DWHA 3QSLA 4AB5A 3FJMA 4O3AA 2Z8EA 1URDA 4GIZA 1N84A 3Q27A 4KQPA 3UA8A 1HSEA 4H5GA 3SDFA 3ZSFA 3U72A 1ZKBA 1VFEA 3ILUB 2I0BA 4U23A 2F78A 3G3GA 1UTBA 1LBBA 4PQJA 4F2OA 3G3KA 3TTKA 3MUQA 2VD3A 3C9HA 2O1LA 1AIVA 2CMOA 3ZKKA 5CM6A 1MQHA 1MS7A 4ZZEA 3T93B 4F1YA 3BKIB 3VVDA 3VE1B 2Z22A 3VXCA 1USYH 4OFOA 3U93A 2UYFA 3QYTA 1OIBA 4YKPA 3KOSA 1NNTA 2RC7A 3QUFA 2REGA 4EF2A 3U8QA 3T66A 1MQJA 3UORA 1FQFA 4R72A 2DE4A 2XXXA 3CR9A 3MP8A 3O6HA 3RPWA 3KJTA 1MQDA 1EU8A 3BFTA 2I49A 5DT6A 5AE4A 2O6AA 3F11A 3IOVA 1R1NA 4LATA 4R6YA 4G68C 3Q29A 1B1XA 2DVCA 1XOCA 1B4HA 2LAOA 4QSDA 4UA8A 4DZ1A 3G3IA 1MDQA 1IQ7A 4ZE8A 2I58A 3PMXA 4FORA 1SI1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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