4G9SA

Crystal structure of escherichia coli plig in complex with atlantic salmon g-type lysozyme
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
HHHHHHHMDITKVDTSGASEITARQDKLTLQGVDASHKLAEHDLVRMNKYKELITRVGQKHGLDPAIIAGIISRESRAGSALDHGWGDHGKGFGLMQVDKRYHKIVGAWDSEKHISQGTEILIEFIRRIQAKFPVWPKEHQLKGGISAYNAGDKNVRTYERMDVGTTGGDYSNDVVARSQWFKSQGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Salmo salar
publication title Structural basis of bacterial defense against g-type lysozyme-based innate immunity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Goose-type lysozyme
total genus 74
structure length 187
sequence length 187
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4g9sA00
1UUZC 5KXWA 1IP7A 2DQGY 2ZNWY 4ML7A 3WUAA 1GWDA 1JJ1A 4LT3A 1LJEA 2I25L 4YENA 3G3AB 1GF6A 1WTNA 9LYZA 3A6BY 1IR7A 1D0MA 4OWHA 2BQHA 4LYZA 5F14A 8LYZA 5DL9A 5APFA 1GFKA 2CGIA 5II3A 3TXKA 3WU9A 1KIRC 1IOTA 2LYZA 1IWXA 2MEEA 2XTHA 2BQCA 1GFVA 2H5ZA 5LYMA 1D0KA 1DI3A 1FKQA 2FYDA 1NBYC 1GBYA 2BLYA 1FBIX 1LZEA 3A8ZA 3WVYA 1B7SA 3LN2A 3P65A 4HJYA 3WL2A 5LXWA 1IIZA 1JIYA 1IP5A 1GXXA 1V7TA 4HPEA 5LAGA 4DD2A 4YF2A 4H8ZA 4H9BA 5B1FA 1LZNA 1WQMA 2Z18A 5B06A 1BWJA 1JUGA 4NFVA 4DDCA 1UIBA 4DYGA 2PC2A 1HF4A 3OJPA 4N8ZA 1LYOA 1CJ6A 2BQGA 1C7PA 1JITA 1IR8A 1NF5A 4U3XB 3WYHA 3TXJA 1BB5A 2Z38A 1LHLA 5LINA 3WUMA 4AXTA 1JWRA 154LA 2H9KA 4NG8A 1IC7Y 4H9EA 3WUNA 4DC4A 1FLUA 1UBZA 4NSJA 1G7MC 4WLTA 1LJKA 1B5VA 1GAYA 1QQYA 5L9JA 5APDA 2BQIA 2C8OA 4H9HA 5C6LA 1JTOL 4YOPA 1B5XA 1LKRA 1ZVHL 3F6ZA 3AGHA 4GLVA 4DD9A 4NGVA 2YBMA 4BS7A 2DQEY 4B4IA 1JEFA 1WQOA 2D6BA 4MSTA 3W6BA 5D5FA 1CKGA 3TMUA 3N9CA 1YQVY 3CT0A 1WVVA 4GN5C 4Z98A 1GF0A 2BQLA 2D4KA 3HBHA 1D0LA 2BQBA 4G49A 4GCEA 1LZTA 3K3TA 1GBXA 4LYMA 1AKIA 1JSFA 1QIOA 1OUEA 1UICA 5FHWA 1GHLA 3W6CA 1LZDA 1XSFA 1TBYA 1IC4Y 3HBEX 1HENA 4ZEEA 1GB8A 1BVKC 4CFOA 3A3RX 1C45A 4DDAA 4GCFA 4H1PA 1A4VA 1LMNA 2X0AA 4UWNA 4XJIA 4NSIA 1LMCA 1GD6A 4NEBA 3WULA 5HNLA 1B5YA 5I4XA 1LJ3A 1UC0A 4NGWA 1REMA 4OOOA 4LFXA 1VDSA 4HP0A 2W1MA 4QEQA 3WW6A 1VAUA 1D9UA 1LSAA 2BQEA 1WQNA 3GXRA 4W94A 3VWOA 1UIDA 2LYMA 2Z2FA 4XJHA 1YILA 2F30A 2HEBA 2I6ZA 2BQKA 2IFFY 1LPIA 3A92A 3CSRA 4LT1A 2DQIY 3P66A 1GF9A 2CJLA 1V7SA 3TXBA 1GB2A 1O23A 1QTKA 3M3UA 4O34A 4XJDA 2HEFA 1GF7A 194LA 1LYZA 4KT3A 1B7NA 2BAAA 4RW2A 5HMJA 5LVHA 4IATA 5FCPA 2HTXA 3AZ7A 4UWVA 1YROA 1HEWA 1I1ZA 1LJFA 3TXFA 1JJ3A 1I20A 3A3QA 5LVGA 5LVKA 4H9AA 1LZ9A 1I56A 1IP3A 2G4PA 3G3BB 2XJWA 1JKDA 1GFUA 4WM5A 1OUDA 1QSWA 4LYBA 1UACY 2ZIKA 5LA8A 2MEHA 5L3HA 1HEOA 1H87A 3EO5A 3WU7A 1OQMA 3HBDA 1C08C 2G4QA 2GV0A 5EBHA 3A94A 4PRUA 3WXTA 1AT5A 2BQMA 1XGUC 1YKYX 2CWIA 1OUGA 4LYTA 1REZA 4RW1A 1FDLY 2DQHY 1GDWA 3A67Y 1G7LC 1LJ4A 1IWYA 1HFZA 4XADA 1NKHA 1B7LA 135LA 2LZTA 3A95A 4DD3A 5KXLA 4NGOA 4ETDA 4N5RA 4NHTA 3ZEKA 3ATNA 4A7DA 1UIFA 4TSCA 1GEVA 1YAPA 4Z46A 1DPXA 3A6CY 4GN3A 4NG1A 2YBHA 4QGZA 3W6FA 4YEMA 1CNSA 1JHLA 4N0JA 1G7JC 1IEEA 1GFTA 5I54A 1FKVA 5HQ1A 5LVJA 1LZ5A 1YKXX 2XBSA 4PJ2C 4WG1A 5I53A 1WVUA 4ETCA 4H9FA 1DQJC 1RI8B 1IR9A 1SQ2L 5FELA 3B72A 1MELL 3P68A 4NGZA 1GB7A 2LHMA 3J6KA 3WXUA 1VDTA 1UCOA 4J0LA 5HMVA 4FJRA 4OOTA 1IVMA 1BWIA 4NY5A 4WM4A 2ZQ3A 3TXIA 4G4BA 4DDBA 1ZMYL 2HU1A 2AUBA 4TX7A 6LYZA 1VATA 2MEDA 3CQLA 3LYZA 4C3WA 5JENB 4MCKA 1BB7A 1C43A 4HTKA 1OUBA 1INUA 2Z2EA 4WOAA 3A96A 1GFHA 1ZV5L 1RCMA 3RNXA 3SP3A 3N9AA 1VDQA 1IWTA 3CT1A 3AYQA 3B0IA 4PRQA 2LZ2A 1CJ9A 5E9RA 1LSBA 1IOQA 1IORA 4HV2A 5LYTA 4N9RA 2LYOA 3FI7A 4P2EA 4CHXA 1FLYA 4Z41A 4OWAA 4OWCA 2HEEA 3M18B 4EMNA 2ZYPA 1GPQC 4OW1A 4NWEA 1LZ6A 5B1GA 1XEJA 1XEKA 2H9JA 3TXDA 1D6PA 5FSTA 3E3DA 5M1YA 4GCBA 4NGIA 1LJJA 1B9OA 1G7IC 1LMPA 5KXXA 1Z55A 1NBZC 2G4NA 2YDGA 4NHQA 1YAOA 3TMVA 3KAMA 1LZAA 4RLNA 4ET9A 5B59A 3GXKA 1LJNA 134LA 1BQLY 4RDSA 1GFRA 2RSCA 4J7VA 1YAMA 1FLQA 1LZCA 4ETEA 3LYTA 4TWSA 4H9IA 4XJFA 2CDSA 4GCDA 3AB6A 4NSHA 3A93A 1E8LA 1NDMC 1LHKA 3CT5A 1HERA 1MLCE 5AMYA 4CJ2A 1IWZA 4DD1A 4B0DA 1LCNA 4WG7A 3LYMA 5A3EA 5I5QA 1OUCA 1B7QA 1TEWA 1BVXA 4J1BA 1KIPC 4KPMA 5KXKA 1EQ4A 4NHSA 1JKBA 1AT6A 4WO9A 2B5ZA 4UWUA 4DT3A 1TCYA 2YSSC 1UIEA 2F4GA 1YIKA 4WMGA 1YANA 5APCA 4ZIXA 1AM7A 3RT5X 2A7FA 1CKCA 4XENA 5B07A 1B2KA 1JKCA 3WW5A 2YBIA 5APEA 4PGJB 2EPEA 2MEBA 5IHGA 1LHMA 4HTQA 1JISA 1P2CC 1JJ0A 3P4ZA 3CSZA 3T36A 5T3FA 1EQEA 1REYA 5IELA 207LA 1LYSA 1F6SA 2MEFA 1G7HC 3B0KA 3TMWA 1HEPA 1DPWA 1IP6A 1NQIA 2N5ZA 3WMKA 1J1OY 1LZGA 3ZVQB 1RFPA 3AZ4A 4WLDA 3W3EA 3CB7A 5KXMA 5C6JA 1LJIA 4ETAA 1LSMA 3ULRA 5F16A 1LHIA 1KXXA 3B0OA 1GFEA 1JTPL 3RU5A 4PPOA 1QDRA 1KXYA 1GF3A 153LA 4H92A 1IY4A 1NDGC 2BPUA 3AGGG 4YEOA 1LHJA 1EQ5A 1GFAA 4HJVA 5F9UA 4WM3A 1CKFA 1OUJA 1QUTA 1XGQC 5LYZA 2MEGA 2YBNA 5KXPA 2Y8PA 1LJHA 1DZBX 1LMQA 4X3BA 3TXEA 1BWHA 2MEAA 2W1YA 4I8SA 2Z39A 3B6LA 2YBLA 4TSBA 5J7CA 5F9XA 3ZVQA 2HEAA 5IDDA 1IX0A 1IY3A 1HEQA 1HHLA 4GN4A 5B05A 1WQPA 3W6EA 5ILFA 4G9SA 3BKVA 4QDNA 3QNGA 1D6QA 1EL1A 4LYOA 1HMLA 4D9ZA 7LYZA 4NSGA 1HSXA 1CKHA 2DQJY 4WLXA 4QY9A 5HLLA 1B7RA 2IHLA 2ZWBA 1GB0A 1YL1X 1GB6A 4H93A 4DD0A 2YVBA 3WVXA 1LSNA 4NGLA 4DD7A 3HFMY 1SLYA 1W08A 2ZIJA 2DQFC 4IJ4A 1HFXA 2BQAA 4NGJA 5LAFA 3BKHA 4H9CA 2ZQ4A 3W6DA 1GXV2 1JKAA 1ALCA 1IOCA 1UIHA 3MGWA 3QY4A 4KL7A 4L41A 3AZ5A 3CSQA 2MEIA 1DI4A 3WU8A 1LSGA 1LZ4A 2WARA 1QSAA 1TDYA 1LSEA 1UIAA 4LZTA 4HSFA 4G4CA 2HECA 3T6UA 3A34A 2DQCY 4NGKA 4LGKA 4M6DA 1F10A 3IJUA 4R0FA 1LZBA 4H94A 1IWWA 1LSZA 1GFGA 5KXYA 1UIGA 4N1EI 1BB3A 132LA 1BHZA 3WPKA 6LYTA 5KXZA 1PZYA 2ZNXY 1LAAA 3D3DA 4B49A 4I0CA 1W6ZA 4H91A 1DKKA 3RZ4A 1BGIA 1WQQA 4ETBA 1GE3A 2A7DA 5L3IA 1GB9A 2C8PA 1LOZA 1GAZA 2D4IA 2DQAA 4RLMA 1LYYA 4AGAA 1GBOA 4IASA 5A3ZA 5KXTA 4HV1A 5DN4A 1GFJA 2EQLA 5KY1A 5KXNA 2HUBA 5K7OA 1RE2A 4MR1A 4B1AA 1GBSA 2FBDA 3AZ6A 4BAPA 193LA 4WO6A 2DBTA 3EBAB 1IWVA 3AJNA 1IP1A 1HEMA 1BB6A 2DKVA 1HMKA 3A90A 3LYOA 5HNCA 1IOSA 1QTEA 1UA6Y 1AZFA 1GBZA 1LKSA 5KKIA 3AW6A 1NWGA 3AGIA 3RW8A 1GF4A 1KXWA 3J4GA 4WL7A 5F81A 4R6CA 3AW7A 1T6VL 5E4PA 3TXHA 1XGPC 1GDXA 4GCCA 4LT2A 1DI5A 2HU3A 3LZTA 1LMTA 5DLAA 4CFPA 4XJBA 2FBBA 4KXIA 1F0WA 1OUFA 1KIQC 1ZVYB 3LHMA 1GE1A 4WL6A 1J1XY 1LZYA 2YBJA 2BQNA 1JTTL 1RJCB 3LZ2A 4NIJA 4NHPA 1GB3A 1LMAA 1GF5A 1LZ1A 2BQJA 4J1AA 5KKJA 1B0DA 1VFBC 5LA5A 1TAYA 1B5WA 4NGYA 5LIOA 3P64A 2W1LA 1LSDA 1VDPA 5FDJA 1B7PA 4ANRA 2Z12A 1C10A 2EIZC 4WM6A 2HEDA 1HELA 4NHIA 1LSFA 2F4AA 5KXSA 3OK0A 4BAFA 2BQFA 4B4JA 4XYYA 4YM8A 1LTMA 4HTNA 4HJZA 1IP2A 2ZYCA 1YAQA 3WPLA 1XGTC 4LT0A 4B4EA 3N9EA 4E3UA 4XJGA 1NHEA 1B5UA 4G4HA 3TXGA 1FN5A 2D91A 1YL0X 1HFYA 4GLAA 2BQOA 1WQRA 3IWRA 4H90A 4BADA 5I4WA 2Z19A 1VEDA 1XFPL 5LVIA 4H8YA 4LFPA 2W1XA 1LSYA 1IC5Y 3D9AC 1T3PA 2EKSC 2D4JA 133LA 4NWHA 4II8A 1H6MA 1REXA 2Q0MX 4OWBA 1GB5A 3W6AA 1FLWA 5KXRA 1BB4A 1JSEA 2NWDX 4HPIA 1DKJA 1J1PY 1CKDA 1GEZA 4WM1A 1A2YC 1LJGA 1PS5A 1GBWA 1F6RA 4M4OA 2ZILA 2F2NA 3EMSA 3A91A 1IWUA 1YKZX 1XEIA 4ZFPA 1LZRA 1CJ7A 5DN5A 1HSWA 2BLXA 4LYCA 1IO5A 4OWEA 4WM2A 1WTMA 5C6IA 1CJ8A 3IJVA 5FEKA 4CGEA 1LSCA 1NMMA 4WLYA 1N4FA 3TMXA 5ILCA 1HNLA 4FDYA 1LSPA 1QDTA 208LA 1B7OA 1JPOA 5KJ9A 1OUAA 4C5FA 1B5ZA 3WPJA 1OUIA 1OUHA 1GE2A 4H8XA 1XGRC 1LHHA 2BQDA 3ATOA 4TTDA 4W96A 1HC0A 1B7MA 4N1CC 2XBRA 1GE4A 4ET8A 4Z3MA 1QUSA 1IP4A 2I26L 2VB1A 2DQDY 3EXDA 4DWXA 1LZSA 4EOFA 5DM9A 1DXJA 2FYCA 5D5CA 3WH1A 4TUNA 5I4YA 1C46A 1LZ8A 2Z37A 4XN6A 3FE0A 2MECA 5KXOA 3QE8A 4PHIA 1GE0A 1LMOA 1GF8A 1OP9B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1UUZC 5KXWA 3WUAA 1G0MA 3A6BY 4YXCA 2OE9X 4OWHA 3HH4A 2BQHA 5DL9A 3WU9A 1KIRC 1IOTA 2LYZA 1QUOA 189LA 2OU0X 2XTHA 1D0KA 1FKQA 231LA 1D3NA 1B7SA 4HJYA 1G1VA 1L96A 1GXXA 3SN6R 142LA 1BWJA 218LA 1JUGA 2BQGA 1IR8A 3SB6A 1L19A 1LHLA 196LA 2H9KA 3HT6A 1IC7Y 1G7MC 2BQIA 5C6LA 1SSWA 1ZVHL 3OE0A 3AGHA 4NGVA 4BS7A 1GF0A 2BQLA 3HBHA 1LZTA 1AKIA 1L24A 1L67A 1UICA 1OUEA 1EPYA 1GHLA 1XSFA 1IC4Y 1HENA 1L66A 1C45A 4GCFA 185LA 2X0AA 159LA 1LMCA 1GD6A 1UC0A 2RBRA 4OOOA 1L75A 4LFXA 212LA 1LSAA 2LYMA 2QARC 1YILA 2F30A 2HEBA 2B70A 118LA 1P2RA 2CJLA 1C68A 1L63A 1O23A 236LA 2OE4X 2BAAA 5HMJA 230LA 4IATA 5FCPA 2HTXA 4LZMA 1KY1A 1LJFA 3A3QA 2OE7X 5LVKA 1LZ9A 1D2WA 1JKDA 224LA 4PJZA 5LA8A 5L3HA 1HEOA 1H87A 2RBOA 3HBDA 1PQJA 2G4QA 4ET8A 1L21A 2BQMA 1XGUC 1YKYX 115LA 1GDWA 1G7LC 1P64A 3A95A 1QSQA 2LZTA 4DD3A 238LA 3K2RA 4NHTA 4A7DA 1GEVA 1T6HA 3HUQA 131LA 1JHLA 1OVJA 1IEEA 1P46A 5I54A 172LA 5LVJA 3HDEA 1LW9A 3SBBC 4ETCA 197LA 1IR9A 1SQ2L 1MELL 3P68A 4NGZA 1GB7A 2LHMA 1KW5A 3JR6A 4WM4A 2ZQ3A 4W57A 6LYZA 2MEDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UUZ C;  5KXW A;  1IP7 A;  2DQG Y;  2ZNW Y;  4ML7 A;  3WUA A;  1GWD A;  1JJ1 A;  4LT3 A;  1LJE A;  2I25 L;  4YEN A;  3G3A B;  1GF6 A;  1WTN A;  9LYZ A;  3A6B Y;  1IR7 A;  1D0M A;  4OWH A;  2BQH A;  4LYZ A;  5F14 A;  8LYZ A;  5DL9 A;  5APF A;  1GFK A;  2CGI A;  5II3 A;  3TXK A;  3WU9 A;  1KIR C;  1IOT A;  2LYZ A;  1IWX A;  2MEE A;  2XTH A;  2BQC A;  1GFV A;  2H5Z A;  5LYM A;  1D0K A;  1DI3 A;  1FKQ A;  2FYD A;  1NBY C;  1GBY A;  2BLY A;  1FBI X;  1LZE A;  3A8Z A;  3WVY A;  1B7S A;  3LN2 A;  3P65 A;  4HJY A;  3WL2 A;  5LXW A;  1IIZ A;  1JIY A;  1IP5 A;  1GXX A;  1V7T A;  4HPE A;  5LAG A;  4DD2 A;  4YF2 A;  4H8Z A;  4H9B A;  5B1F A;  1LZN A;  1WQM A;  2Z18 A;  5B06 A;  1BWJ A;  1JUG A;  4NFV A;  4DDC A;  1UIB A;  4DYG A;  2PC2 A;  1HF4 A;  3OJP A;  4N8Z A;  1LYO A;  1CJ6 A;  2BQG A;  1C7P A;  1JIT A;  1IR8 A;  1NF5 A;  4U3X B;  3WYH A;  3TXJ A;  1BB5 A;  2Z38 A;  1LHL A;  5LIN A;  3WUM A;  4AXT A;  1JWR A;  154L A;  2H9K A;  4NG8 A;  1IC7 Y;  4H9E A;  3WUN A;  4DC4 A;  1FLU A;  1UBZ A;  4NSJ A; 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 3WPL A;  1XGT C;  4LT0 A;  4B4E A;  3N9E A;  4E3U A;  4XJG A;  1NHE A;  1B5U A;  4G4H A;  3TXG A;  1FN5 A;  2D91 A;  1YL0 X;  1HFY A;  4GLA A;  2BQO A;  1WQR A;  3IWR A;  4H90 A;  4BAD A;  5I4W A;  2Z19 A;  1VED A;  1XFP L;  5LVI A;  4H8Y A;  4LFP A;  2W1X A;  1LSY A;  1IC5 Y;  3D9A C;  1T3P A;  2EKS C;  2D4J A;  133L A;  4NWH A;  4II8 A;  1H6M A;  1REX A;  2Q0M X;  4OWB A;  1GB5 A;  3W6A A;  1FLW A;  5KXR A;  1BB4 A;  1JSE A;  2NWD X;  4HPI A;  1DKJ A;  1J1P Y;  1CKD A;  1GEZ A;  4WM1 A;  1A2Y C;  1LJG A;  1PS5 A;  1GBW A;  1F6R A;  4M4O A;  2ZIL A;  2F2N A;  3EMS A;  3A91 A;  1IWU A;  1YKZ X;  1XEI A;  4ZFP A;  1LZR A;  1CJ7 A;  5DN5 A;  1HSW A;  2BLX A;  4LYC A;  1IO5 A;  4OWE A;  4WM2 A;  1WTM A;  5C6I A;  1CJ8 A;  3IJV A;  5FEK A;  4CGE A;  1LSC A;  1NMM A;  4WLY A;  1N4F A;  3TMX A;  5ILC A;  1HNL A;  4FDY A;  1LSP A;  1QDT A;  208L A;  1B7O A;  1JPO A;  5KJ9 A;  1OUA A;  4C5F A;  1B5Z A;  3WPJ A;  1OUI A;  1OUH A;  1GE2 A;  4H8X A;  1XGR C;  1LHH A;  2BQD A;  3ATO A;  4TTD A;  4W96 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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