4GBRB

N-terminal t4 lysozyme fusion facilitates crystallization of a g protein coupled receptor
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
NIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein/hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title N-terminal t4 lysozyme fusion facilitates crystallization of a g protein coupled receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor
total genus 50
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4gbrB00
2OTYX 1LYGA 1LGUA 256LA 231LA 4DKLA 4I7MA 3HT7A 3GUJA 1SX2A 1D2WA 2LCBA 130LA 1DYBA 1L11A 217LA 1L41A 1T8FA 1QTZA 103LA 1L88A 1LGWA 239LA 1C67A 3HWLA 1CV1A 1L36A 113LA 3HTBA 1L23A 1CVKA 1OVHA 1L20A 1OVJA 174LA 2B6ZA 2OE7X 3DN3A 1G0GA 3SBBC 166LA 1G0JA 1L22A 1L48A 1QT7A 3HTDA 3PDSA 1L84A 3CDRA 1L68A 201LA 1PQDA 2NTHA 1T6HA 2HUKA 223LA 221LA 262LA 1QT3A 1C68A 1OV7A 4I7NA 189LA 1C6LA 1P3NA 250LA 3FA0A 4W58A 1CU2A 2B72A 152LA 236LA 1L39A 1C6HA 2O79A 1L59A 1XEPA 140LA 4EKQA 4EPFA 1CV4A 1OWYA 216LA 1T8AA 1KW7A 1SX7A 4EPIA 169LA 1LPYA 1L34A 1P2LA 1C6TA 3RZEA 195LA 206LA 1L30A 4ARMB 2B6TA 2OU9A 175LA 4ARPA 3DNAA 160LA 1CU5A 3V2WA 4EKPA 1D3FA 3DN6A 171LA 1LI6A 1LLHA 261LA 1C6NA 145LA 1PQKA 2O4WA 3C82A 1DYAA 2Z6BA 1C6FA 4AQNA 220LA 2RH1A 1P2RA 163LA 187LA 114LA 2ANXA 1G0KA 1T8GA 260LA 199LA 3NY8A 1L67A 3C8RA 3HUKA 1L53A 2B74A 1C61A 3C8SA 123LA 1QS9A 1C62A 244LA 3C80A 1PQMA 1CU0A 1QT6A 1B6IA 3HT6A 1ZWNA 3GUIA 1C6CA 4W55A 1L79A 1L96A 1L18A 1PQIA 222LA 122LA 4I7KA 3DMZA 1L56A 148LE 233LA 1XJTA 3GULA 3V2YA 219LA 248LA 1DYFA 252LA 139LA 229LA 3HU9A 1QT5A 1L12A 1L97A 254LA 235LA 3CDOA 181LA 1NHBA 4EKRA 1L61A 258LA 3OE6A 4I7RA 2RAZX 1DYDA 4DAJA 1CV6A 1L49A 238LA 1L07A 1SSYA 1P6YA 1T97A 2OEAX 1C6EA 2B7XA 129LA 1G1VA 246LA 1CU6A 4I7LA 190LA 3SB7A 1D3NA 157LA 4YXAC 3OE8A 4W53A 1C6IA 1C6DA 1CUQA 3D4SA 1L02A 188LA 111LA 1L08A 1TLAA 3DN4A 1G0LA 1CX7A 1EPYA 213LA 1CV5A 1OWZA 259LA 1P5CA 102LA 4K5YA 1L29A 3G3WA 1L77A 3C8QA 2RBRA 2RB1X 3C7ZA 1LYDA 1D3MA 185LA 232LA 2RBQA 161LA 215LA 218LA 242LA 1JTNA 1L24A 1L46A 1L33A 2B73A 4EXMA 1L32A 1L0KA 3DN1A 1L50A 5LZMA 1OYUA 1C60A 1C65A 2B6WA 1L75A 4YX7C 2CUUA 1KY1A 3CDVA 115LA 1G0QA 4I7QA 173LA 3HT9A 146LA 2QB0B 230LA 3SBAA 1LWGA 2HUMA 1QTHA 4EJ4A 1L28A 4ARMA 1L37A 5I14A 1QUGA 3HTGA 3OE9A 1L45A 1L71A 4IAPA 2A4TA 1L43A 184LA 211LA 6LZMA 4I7OA 1I6SA 1L90A 191LA 1CX6A 1L54A 1P46A 1XJUA 1DYEA 4YXCA 1L73A 4EKSA 210LA 3F9LA 3RUNA 1L93A 1OVKA 1PQJA 4LDOA 4ARQA 1L35A 2RB0X 1DYGA 1KS3A 1L05A 1CV0A 186LA 4ARQB 3CDQA 1L65A 1L26A 3SB8A 3L64A 3QAKA 197LA 1P37A 4S0WA 1L47A 1L92A 1ZURA 3DN8A 3GUKA 1SSWA 1L27A 1L69A 4LZMA 1L19A 1L72A 1QSQA 1L31A 224LA 255LA 3HUQA 4W57A 4W54A 1QUOA 1LW9A 1SWYA 3DKEX 2RBSA 3C7WA 2Q9DA 141LA 1L0JA 1L80A 4W59A 3K2RA 159LA 4I7JA 126LA 3HU8A 1L06A 3F8VA 3HDEA 142LA 150LA 3DMVA 177LA 1C6PA 3HH5A 225LA 155LA 2RBNA 1L09A 4ZPUA 1CTWA 118LA 1L21A 3HT8A 241LA 4ARJA 1QTDA 1L16A 1L74A 3JR6A 182LA 165LA 3C83A 3ODUA 3GUPA 1LYHA 4W52A 1G07A 1OV5A 3SB5A 2ANVA 2RBPA 3GUNA 4I7SA 1QSBA 1DYCA 1G06A 3HH4A 2OU8A 227LA 1L99A 3SB6A 3C7YA 1L57A 253LA 1P64A 1QT4A 1L10A 1L60A 209LA 1L01A 1QUDA 4PJZA 2NTGA 1D9WA 196LA 128LA 2B6XA 156LA 3SB9A 183LA 3FADA 180LA 234LA 1LWKA 108LA 198LA 4W56A 1L62A 1L81A 237LA 243LA 245LA 2F2QA 3PBLA 2RB2X 228LA 4E97A 1P56A 167LA 1QS5A 110LA 1LYIA 1L55A 2Q9EA 3CDTA 131LA 3C81A 4I7TA 3NYAA 4W51A 2B70A 1C6BA 1JQUA 2OE9X 1C6MA 3G3XA 1QTCA 2LZMA 3DN2A 1WTHA 2OE4X 1C63A 1L91A 1CU3A 176LA 3G3VA 1L83A 3HDFA 1L42A 1QTBA 2B75A 1L82A 1L15A 1G1WA 1L40A 251LA 125LA 1D2YA 1L64A 147LA 119LA 240LA 7LZMA 1JTMA 109LA 1CUPA 4OO9A 3GUOA 1L76A 3HTFA 137LA 143LA 1C69A 4I7PA 1L89A 144LA 214LA 3EMLA 3HH3A 4PK0A 2RBOA 249LA 3SN6R 1C6QA 3NY9A 4LDLA 158LA 112LA 1QTVA 107LA 3DMXA 3L2XA 1L86A 4GRVA 1LYFA 1K28A 168LA 2IGCA 4DJHA 127LA 1L25A 1L00A 149LA 1C6JA 1C6KA 1L38A 1LGXA 4LDEA 192LA 1L04A 1L52A 3GUMA 3OE0A 1L70A 1L85A 1L14A 1L87A 164LA 1C6GA 1LI2A 226LA 3UONA 1C6AA 1QT8A 1QUHA 3HUAA 2L78A 3VW7A 1L44A 1LYEA 2OU0X 1L66A 1L95A 200LA 104LA 1KY0A 4GBRB 3HH6A 1L94A 2QARC 1CV3A 1L13A 1L51A 1PQOA 3FI5A 1LYJA 151LA 2RAYX 1KNIA 1P36A 1P7SA 120LA 3DN0A 1L98A 1L63A 1D3JA 1C66A 1L58A 1L03A 2OTZX 170LA 257LA 1C64A 1G0MA 2O7AA 1LI3A 1SWZA 172LA 3LZMA 1ZYTA 4ARLA 212LA 178LA 2LC9A 138LA 2F47A 1G0PA 205LA 162LA 247LA 1L17A 2HULA 1KW5A 2F32A 2B6YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LFPA 5LVKA 4I7MA 1LYZA 4WL7A 1WVUA 4XENA 3WXUA 1L41A 3WYHA 4OWAA 2H9JA 4EOFA 1B5UA 5HMVA 3HTBA 1AT5A 1L20A 4DD0A 1CKDA 1L48A 2BQIA 4II8A 3PDSA 2Z39A 262LA 1OV7A 4PRQA 1HNLA 2EPEA 189LA 1P3NA 1XGPC 3FA0A 3HBDA 4ET9A 1CU2A 1GFHA 152LA 4PJ2C 236LA 3IJUA 2O79A 3WW6A 1XEPA 2DQIY 140LA 1CV4A 1D6PA 216LA 2YDGA 1T8AA 4EPIA 169LA 4H9IA 1H87A 4YF2A 3GXRA 1GWDA 2BQHA 4ARMB 1GAYA 4LYZA 3DNAA 2YBIA 3DN6A 171LA 1LI6A 1LLHA 145LA 1PQKA 2O4WA 1BB7A 1B7NA 5E9RA 1GHLA 220LA 2I25L 187LA 1B5VA 1D9UA 2ANXA 5L3HA 1G0KA 1GD6A 1LJEA 1L53A 2W1XA 4FDYA 4J1BA 1OUFA 123LA 1QS9A 2Z18A 1C62A 4PPOA 4HV2A 1D0MA 1B6IA 4MR1A 3GUIA 3P64A 5KXNA 4W55A 1L79A 1L18A 1PQIA 1NBYC 248LA 1DYFA 1BB5A 229LA 3P4ZA 1NWGA 1REXA 2YBJA 1DZBX 4G4CA 181LA 1LHJA 2MEEA 1GF7A 5KXPA 4IASA 2Q0MX 1YKXX 1BQLY 190LA 1D3NA 3HBEX 1C6IA 1C6DA 1CUQA 1GAZA 2A7FA 3AJNA 3ZVQA 1G0LA 3WVYA 4AGAA 1C10A 1JWRA 259LA 2BQGA 3G3WA 1L77A 4B4IA 1IR8A 2RB1X 3TXDA 5KXOA 3EO5A 2DQEY 185LA 3LN2A 218LA 1L46A 2BQDA 4NG1A 2Z2FA 1L32A 3DN1A 1OYUA 1L75A 2HU3A 4J0LA 3CDVA 8LYZA 2Z19A 3W6BA 115LA 5APFA 1GFTA 1NDMC 1GE1A 4DQJA 230LA 1A4VA 5LAFA 4EJ4A 1L37A 4NHTA 1FN5A 1FKVA 1LJFA 4B4JA 2A4TA 5A3ZA 6LZMA 2D91A 4I7OA 1WQRA 4WM2A 1ZVYB 2BQAA 4H92A 5E4PA 4NHIA 4HJYA 5AMYA 3ATOA 1LSBA 1JUGA 1L54A 4BAPA 1DI5A 1L73A 3WU9A 4XYYA 3RUNA 1OVKA 1P2CC 1D0KA 1L35A 1DYGA 186LA 3L64A 4WLXA 1L47A 1L92A 5LYZA 1LMOA 3T36A 4H9CA 1L69A 2BAAA 4ETBA 1BHZA 4LZMA 1L19A 1L72A 4B0DA 1FDLY 4W57A 1LW9A 1LZ8A 1GF9A 3C7WA 2Q9DA 1B7SA 1HF4A 1LSEA 1A2YC 4HPEA 1FBIX 3F8VA 5KXYA 1EQ5A 3DMVA 4QGZA 225LA 1CJ6A 1FLUA 2Z37A 3BKVA 4Z3MA 1OUAA 1LZBA 193LA 3GXKA 4KPMA 1L21A 5IELA 241LA 3VWOA 4ARJA 2YBNA 4XADA 3M3UA 1LSPA 4TUNA 4WM5A 4LYMA 1INUA 1OV5A 2LZ2A 3TMWA 3GUNA 4I7SA 4TX7A 4ETEA 1VDTA 2OU8A 1P64A 3AZ4A 2D4JA 4PJZA 2NTGA 2ZNXY 1D9WA 2DQGY 3IWRA 4R0FA 3D3DA 1LZNA 1LWKA 4X3BA 237LA 3WPLA 245LA 5LXWA 1GF8A 1IORA 1GFAA 132LA 228LA 1P56A 3QY4A 2BQNA 1LYIA 1DQJC 3C81A 1NDGC 5IDDA 5HLLA 4I7TA 1TEWA 2B75A 1IO5A 4KXIA 4XN6A 1L40A 7LZMA 1VDPA 1BWIA 4YEOA 1GEZA 3GUOA 1L76A 137LA 5K7OA 3MGWA 1L89A 144LA 4WG1A 1YILA 3A67Y 3HH3A 2RBOA 249LA 1IVMA 1C6QA 3NY9A 5IHGA 158LA 112LA 1JJ0A 1WQMA 1HSWA 3WL2A 5KKIA 1IOSA 1QTEA 1LZ1A 149LA 1C6JA 1B7LA 1LGXA 1BB4A 4LDEA 192LA 3GUMA 3OE0A 1BB3A 4NWHA 1L85A 4DQ7A 3P68A 1C6GA 2IHLA 3UONA 1QT8A 1YL0X 1NMMA 1QUHA 3CT5A 5APCA 1OUBA 1L66A 1L95A 1G7HC 2QARC 5APDA 1L13A 4WO6A 2IFFY 1LYJA 4OWBA 151LA 4DQ5A 1HFYA 5FEKA 2G4QA 1DXJA 2OTZX 2O7AA 4G49A 1T6VL 1ZYTA 2F47A 1L17A 4BAFA 2B6YA 1LSMA 4H91A 4WO9A 3CSQA 3A6CY 4CJ2A 1IWYA 231LA 4NHQA 1LHIA 1AKIA 1IP2A 5FELA 4ET8A 1SX2A 5ILCA 1DKJA 1QTZA 1L88A 5F16A 3J6KA 2ZWBA 1L23A 1CVKA 174LA 3CSRA 3DN3A 3SBBC 1UACY 1QT7A 2LHMA 1WQQA 4NWEA 4NSGA 223LA 1B7MA 221LA 1OUEA 1C68A 1YQVY 4I7NA 250LA 4TWSA 1L39A 4ANRA 1OUJA 1JEFA 1GEVA 1OWYA 2EQLA 2ZYPA 2W1YA 1GF6A 4G4HA 4CFPA 1C6TA 2Y8PA 1C43A 3W6AA 1L30A 2B6TA 2OU9A 175LA 1GB3A 4ARPA 1FKQA 3A3RX 2ZQ3A 4EKPA 1BWHA 1D3FA 5DL9A 1W08A 1YIKA 1GB2A 3B0IA 1DYAA 2Z6BA 1JTTL 4I0CA 4DD7A 1P2RA 1LZ5A 4GN5C 1T8GA 4R6CA 3NY8A 1L67A 1IR9A 3C8RA 3HUKA 153LA 1J1OY 1C61A 1GBWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3VW7 A;  1L44 A;  1LYE A;  2OU0 X;  1L66 A;  1L95 A;  200L A;  104L A;  1KY0 A;  4GBR B;  3HH6 A;  1L94 A;  2QAR C;  1CV3 A;  1L13 A;  1L51 A;  1PQO A;  3FI5 A;  1LYJ A;  151L A;  2RAY X;  1KNI A;  1P36 A;  1P7S A;  120L A;  3DN0 A;  1L98 A;  1L63 A;  1D3J A;  1C66 A;  1L58 A;  1L03 A;  2OTZ X;  170L A;  257L A;  1C64 A;  1G0M A;  2O7A A;  1LI3 A;  1SWZ A;  172L A;  3LZM A;  1ZYT A;  4ARL A;  212L A;  178L A;  2LC9 A;  138L A;  2F47 A;  1G0P A;  205L A;  162L A;  247L A;  1L17 A;  2HUL A;  1KW5 A;  2F32 A;  2B6Y A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4LFP A;  5LVK A;  4I7M A;  1LYZ A;  4WL7 A;  1WVU A;  4XEN A;  3WXU A;  1L41 A;  3WYH A;  4OWA A;  2H9J A;  4EOF A;  1B5U A;  5HMV A;  3HTB A;  1AT5 A;  1L20 A;  4DD0 A;  1CKD A;  1L48 A;  2BQI A;  4II8 A;  3PDS A;  2Z39 A;  262L A;  1OV7 A;  4PRQ A;  1HNL A;  2EPE A;  189L A;  1P3N A;  1XGP C;  3FA0 A;  3HBD A;  4ET9 A;  1CU2 A;  1GFH A;  152L A;  4PJ2 C;  236L A;  3IJU A;  2O79 A;  3WW6 A;  1XEP A;  2DQI Y;  140L A;  1CV4 A;  1D6P A;  216L A;  2YDG A;  1T8A A;  4EPI A;  169L A;  4H9I A;  1H87 A;  4YF2 A;  3GXR A;  1GWD A;  2BQH A;  4ARM B;  1GAY A;  4LYZ A;  3DNA A;  2YBI A;  3DN6 A;  171L A;  1LI6 A;  1LLH A;  145L A;  1PQK A;  2O4W A;  1BB7 A;  1B7N A;  5E9R A;  1GHL A;  220L A;  2I25 L;  187L A;  1B5V A;  1D9U A;  2ANX A;  5L3H A;  1G0K A;  1GD6 A;  1LJE A;  1L53 A;  2W1X A;  4FDY A;  4J1B A;  1OUF A;  123L A;  1QS9 A;  2Z18 A;  1C62 A;  4PPO A;  4HV2 A;  1D0M A;  1B6I A;  4MR1 A;  3GUI A;  3P64 A;  5KXN A;  4W55 A;  1L79 A;  1L18 A;  1PQI A;  1NBY C;  248L A;  1DYF A;  1BB5 A;  229L A; 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