4GBVA

Crystal structure of amp complexes of porcine liver fructose-1,6-bisphosphatase mutant a54l with 1,2-ethanediol as cryo-protectant
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
326
structure length
326
Chain Sequence
IVTLTRFVMEEGRKARGTGEMTQLLNSLCTAVKAISTAVRKAGILHLYGIAGSTNVTGDQVKKLDVLSNDLVINVLKSSFATCVLVSEEDKNAIIVEPEKRGKYVVCFDPLDGSSNIDCLVSIGTIFGIYRKNSTDEPSEKDALQPGRNLVAAGYALYGSATMLVLAMVNGVNCFMLDPAIGEFILVDRDVKIKKKGSIYSINEGYAKEFDPAITEYIQRKKFPPDNSAPYGARYVGSMVADVHRTLVYGGIFMYPANKKSPKGKLRLLYECNPMAYVMEKAGGLATTGKEAVLDIVPTDIHQRAPIILGSPEDVTELLEIYQKHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Water Structure of the Central Hydrophobic Cavity of Mammalian Fructose-1,6-bisphosphatase: a Potential Thermodynamic Determinant of Allowed Quaternary States
rcsb
source organism Sus scrofa
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Fructose-1,6-bisphosphatase 1
total genus 107
structure length 326
sequence length 326
ec nomenclature ec 3.1.3.11: Fructose-bisphosphatase.
pdb deposition date 2012-07-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00316 FBPase Fructose-1-6-bisphosphatase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.540.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Fructose-1,6-Bisphosphatase; Chain A, domain 1 Fructose-1,6-Bisphosphatase, subunit A, domain 1 4gbvA01
3.40.190.80 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4gbvA02
1FTAA 4GBWA 4KXPA 2F3BA 1BK4A 5EQ7A 1LEVA 3B8BA 5EYGA 2F3DA 1FBGA 1G0HA 2QVRA 1FJ9A 1NV0A 1NV2A 3RPLA 1RDXA 2BJIA 2FHYA 3A29A 5IZ3B 2Q8MA 5EQAA 1FPDA 4GX4A 5LDZA 1D9QA 4GWXA 5ET6A 1DK4A 1QGXA 1DBZA 1K9ZA 1IMBA 1FBHA 1NV3A 4HE1A 1LBVA 5T3JA 1IMEA 1KA0A 1IMDA 1JP4A 4GWSA 4AS5A 1FPLA 4GX6A 1FPGA 1SPIA 4MJOA 1IMCA 4HE2A 3FBPA 2WBDA 2P3VA 3LUZA 4GWZA 5J16A 1KZ8A 2PCRA 4I40A 1NV7A 1LBWA 4G61A 5IZ1A 1DCUA 1NV1A 2Y5KA 2FVZA 3D1RA 2OWZA 2R8TA 3KC1A 4AS4A 1CNQA 4GWUA 1FPJA 5EYHA 4GWYA 1XI6A 4H45A 4GWWA 2OX3A 1INPA 2QFLA 1NV6A 5A5LA 5F24A 1FBFA 1Q9DA 4HE0A 1FJ6A 5ET5A 2FIXA 1NV5A 3IFCA 2CZHA 1G0IA 1NUYA 2GQ1A 1EYKA 1LBYA 2FIEA 4GBVA 1FPIA 1YZ0A 1IMAA 2Y5LA 4QXDA 5I3SA 2FBPA 2CZKA 5IZ3A 2CZIA 4HXVA 5EQ8A 1FRPA 2DDKA 3IFAA 3RPLB 1YYZA 1FBEA 3BIGA 1FPEA 2WEFA 1FBPA 1EYIA 4I3YA 5EQ9A 3RYDA 1VDWA 3ROJA 2WBBA 1FBCA 1FBDA 1RDYA 1RDZA 1FPKA 3KC0A 2Q74A 5ET7A 2JJKA 3KBZA 4H46A 4IR8A 5FBPA 5ET8A 5ESYA 1IMFA 1FSAA 4FBPA 4I3EA 1NUWA 2HHMA 4O7IA 1FPFA 1K9YA 1LBZA 4N81A 2QVVA 2P3NA 1NV4A 1FPBA 1KA1A 2VT5A 1NUXA 1EYJA 4PTKA 3BIHA 1YXIA 1LBXA 3QMFA 5DW8A 4GX3A 1NUZA 3LV0A 3T0JA 2QVUA 1AWBA 1NI9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RNSA 2RCBA 2YPNA 2NVUB 2Y7IA 1JVXA 5H8HB 4YB7A 3S9MC 3JV9A 3OELA 4E0WA 4O3BA 4KYSA 4NMYA 3OSRA 4OERA 1VR5A 2FNCA 1B0LA 4F1UA 2V25A 2AIXA 4U4XA 3C33A 4I40A 2UVHA 1O64A 2KLFA 1A40A 1NV1A 4LP2B 5B70A 3HCQA 3JYRA 3IO6A 2YLNA 4DI3D 3K0VA 4PQJA 3ECRA 3B50A 3VDFA 3H6TA 4PC9A 2FIXA 4XFEA 4QFNA 1G0IA 1OMPA 1GTKA 4G2ZA 1YZ0A 1IMAA 3AXFA 2FA7A 1IITA 3C9HA 3IOUA 3IOWA 4JXIA 3LC8A 3N26A 1FBPA 1QKAA 3OSQA 4N07A 4DIGA 3T93B 1A8EA 1D3KA 3Q28A 2P0SA 2OJTA 1B3FA 3OD7A 1B6HA 2XWIA 4WEPA 2DYXA 3M3LA 3T22A 2XXUA 1YPNA 1MQHA 3KEIA 2PT2A 2GFEA 2QVUA 2X7PA 3TCHA 1QUJA 3T9XB 2QMXA 2KQZA 2BJIA 2PT1A 4PDHA 1T0KA 3TMGA 3SEVA 1B5IA 4GWXA 2DS9A 4GIZA 4OYVA 3RTFB 3IAZA 1L5TA 1R1NA 3K6WA 1GV8A 2A5TB 3SDFA 4GX6A 1SPIA 4MCOA 4ISUA 4OESA 3V83A 1SBPA 4P9KA 3B6TA 2V84A 2Z23A 3K01A 3HFUA 4H0WA 4G77A 4GWYA 1O63A 1CB6A 1HSEA 4ZDMA 1FW0A 4GBVA 2ONSA 4LZ5A 2RC7A 5CC2A 5KDTA 3M8UA 1LCTA 3TPAA 2I0CA 3RYDA 2O7UA 1LBBA 3RUMA 1B7UA 1RYOA 3O28A 5KDTB 4TQUQ 2QS1A 4EQ9A 3HSTA 1N04A 4DCYA 4EXKA 1LGBC 4MLQA 2DXRA 1Q1KA 4IY6A 4QFOA 4X48A 2DE4A 1AOVA 3IR1A 3MPLA 2XXHA 4GX3A 2OPEA 5HPQA 2QRYA 4ND9A 3LV0A 3PMWA 4JSDA 1H44A 3BBRA 4LVQA 2ZYMA 3DELB 3LSWA 2KR0A 2Q8MA 1D9QA 5ET6A 3PD9A 4JSOA 4JDFA 1KA0A 2H99A 4AS5A 4JBZA 5ICTA 3FJMA 2HPGA 4PF6A 3K6VA 5H8NA 4LONB 4HTGA 1OVTA 4XKNA 2ANJA 5L8DA 1YAEA 4KHZE 3KC1A 4AS4A 5EYHA 2RINA 1Q35A 4ECFA 3U93A 4ZE8A 1MQGA 2GRVA 3K02A 2XWKA 2CZHA 5AA1A 1N7WA 1LBYA 3JZJA 4QXDA 5I3SA 5TU0A 2CZIA 3MQ9A 4NGUA 3KFMA 3QK6A 2VP1A 5EQ9A 2F8DA 1FPKA 5ET7A 4JB7A 4RYAA 1SQYA 1P1NA 5KCJB 3HV1A 3ZKKA 3VVEA 4XEQA 1Y20A 3PUVE 1SVXB 4O3CA 3VVFA 3BIHA 1UIUA 4LQ2A 3H6UA 4NHBA 3U1OA 5F7VA 3FIRA 4YB5A 5DVJA 3MZBA 3VXCA 3SESA 5L9OA 2H25A 2Y7PA 3A29A 3C32A 1B9JA 2XXTA 4OTEA 1M5FA 2XXWA 1WVJA 2QS2A 3B7DA 4HE1A 1LFGA 3IL1B 4RK9A 1AL3A 4ZE9A 4MJOA 5K2XA 4NF4A 1NV7A 4BDOA 4G61A 4NE4A 4U23A 2ZNTA 2F6PA 4N6DA 4F22A 2I3VA 4LATA 4H1XA 1MDQA 4H67A 5IZZA 2OX3A 1PB9A 4GVOA 1LBCA 5ET5A 1WDNA 3FXUA 3HHFA 1PC3A 1FRPA 3MAMA 1QULA 3EF7A 3FD3A 1VDWA 2O68A 3RT8A 4P0GA 3PMVA 3KC0A 3UP9A 4KYEA 2DP8A 4WEDA 4TLLB 3BFUA 1AH5A 1GR2A 1ZJLA 4NAPA 1LAXA 2P2AA 1DTZA 3HPIA 2WX9A 1LBXA 4HS7A 3MZ1A 2DQVA 4G68A 2ESNA 2ZXTA 1VE4A 1FQBA 3TQLA 4IO2A 4P3LA 4F3GA 4FEDA 4OEVA 2QMWA 5I59B 1R6ZA 4UABA 3ONMA 1MY4A 5CM6A 1MQDA 1DBZA 4GXAA 2REGA 1N76A 3W9WA 5EHSA 4C1UA 1JEUA 2WKYA 1Y3NA 4NF5B 3Q27A 3EKIA 3V8XB 2Y5KA 5I56B 2QS4A 5EYFA 5JEIA 2G93A 2UVGA 3OMBA 4YZZA 2REJA 3IB1A 3IB0A 4M4GA 1ANFA 2CEYA 1FQEA 4XF5A 4EF2A 3C35A 3IX1A 3Q29A 4EUOA 1I6BA 4JVIA 1Y1ZA 4AB6A 2Z22A 2DVZA 2NWJA 3DLNA 1DOTA 3RPLB 1II5A 1QVSA 4R2BA 1FPEA 1USYE 4NF8B 4MAGA 4H8IA 1RDZA 4Q8RA 2R71A 4PFIA 5EHMA 5ESYA 4O3AA 3RN8A 2O51A 3H3GA 4EF1A 3VVDA 1FPFA 1K9YA 4DXCA 1JETA 2B3BA 3R26A 1I6AA 4P11A 1EYJA 3L6GA 2DE2A 5AA4B 5DW8A 1A7LA 2F36A 4JWOA 4QF9A 3G3GA 1HSJA 3MVWA 1LFHA 1EU8A 1AWBA 4ZEBA 1NI9A 4GBWA 2O1MA 3TODA 2QS3A 3KSXA 4FECA 5DVFA 1OQHA 1FJ9A 2B4MA 1CE2A 2PVUA 4OHNA 1NNKA 3BKIB 2OK2A 1FPDA 1P1QA 1ZIUA 3RTWB 2AL4A 3A3CA 4EXLA 5HBCA 1JP4A 4C0RA 3TCGA 1NNPA 4RA1A 3TKDA 3KN3A 4Z0IA 3O29A 1POTA 4NTLA 4BLAA 4DLDA 1SD3A 1LBWA 5BUUA 5FHOA 4JWXA 1QUIA 4X1DA 5I2NA 2ABHA 2HAVA 1B32A 2ZYNA 5DYHA 4X04A 1URGA 4ZEKA 1JQFA 5F24A 1QJMA 4HE0A 1FTKA 3E3KA 1Y1MA 1Z7ME 2F7BA 4N8GA 4MMPA 2THIA 4KQPA 1AMFA 4OVQA 4N91A 4EQ7A 1LAFE 3CSGA 4UACA 4O94A 2O69A 4ESXA 1MPBA 2PYYA 3C34A 1IXGA 1POY1 2F7CA 2VPNA 2V3UA 4GD5A 3K1PA 3USDA 4R2FA 3MWBA 5TP9A 3FVKA 4R75A 1BIYA 4FIMA 3OXNA 1Y4TA 1NUZA 1FQFA 4GLIA 2F3BA 2DSFA 3FV1A 3K4UA 3NOHA 3RNNA 5DTBA 4OENA 5DEXB 3FJ7A 2HQ0A 1RDXA 4KCCA 2XX8A 5IZ3B 5I57B 3IJXB 4C1TA 1PBQA 2HCAA 4U2RA 1J1NA 1PEBA 1LBVA 4KD5A 1BLFA 2UYFA 3W9VA 4ELQA 2I0BA 3FASA 4G8NA 1H43A 2AL5A 1N84A 3RQTA 4PGPA 3I6VA 1DPPA 2ONRA 5ICQA 2A5TA 4QSCA 3S9LC 2B4LA 2D21A 4F1VA 3KBRA 2VD2A 2RCAA 4KR5A 4HCYA 3TFLA 4F1YA 3UORA 1NV5A 1MY2A 3IFCA 3SERA 3MVXA 4YMBA 4MX6A 2FBPA 2DWHA 3EHUA 2OZZA 1YYZA 5CRYA 2WEFA 3Q25A 1JNFA 4N6PA 3FV2A 2XXVA 2H98A 2Q74A 4MH5A 4OQOA 2JJKA 1MXZA 4I3EA 4PFRA 2RKMA 3CRBA 2XD2A 5H8HA 4RPNA 1MM6A 2NOOA 2RC8A 1FTMA 3MZ9A 4MNCA 1VSOA 1ZU0A 1UTHB 3A3UA 4OEUA 3EPEA 2XXXA 4I1DA 3O6GA 3G3IA 4POWA 1LEVA 2E0SA 4U4SA 4PBQA 4E0XA 1PB7A 5I58A 1JW5A 4ELPA 3SEXA 4MHFA 4OMBA 1IMBA 2B65A 2XXQA 1F9BA 2Y7KA 5FHMA 2W7YA 4FE8A 3OEKA 1MXWA 4QFLA 1EZPA 5H8FB 3CFZA 3DP6A 3OO6A 3FVOA 3O66A 3D1RA 2OWZA 5I5PA 3KGCA 1B3EA 4BDRA 4R6HA 3EQ1A 3FVNA 1B40A 1GGGA 1FQDA 2ZNSA 4OVRA 3E78A 5JTYB 1QUKA 4F39A 3TAJA 4PE3A 5IZ3A 5EQ8A 4MNPA 2B3FA 2DDKA 3OOAA 2V4CA 1ZBMA 2Q8JA 3BIGA 2E1SA 3Q26A 3U65A 1SYHA 4YMAA 1LAHE 1FBDA 3KBZA 3QAXA 4RK2A 3UGWA 1EZOA 2HZKA 2HZLA 1NV4A 4F2OA 4R6YA 4NF8A 1KA1A 3CSBA 3SKPA 1EH3A 4DDDA 1LAGE 1NNTA 3K6UA 4UA8A 4QSDA 1SW2A 2VHAA 3MC2A 1PB8A 4KXPA 4WXJA 2O7IA 3LSLA 4OWDA 2QVRA 1IXIA 1NV0A 1NV2A 1UQWA 4ZEDA 3ISPA 1LB8A 4GX4A 3N94A 3LSXA 5AA2D 4N15A 4NWCA 4PP0A 2Q9TA 1IUDA 4YKPA 5L9SA 4NF6B 4H6DA 1OIBA 1NKXA 3PMXA 2GH9A 2AYSA 3N5LA 2X7QA 3UA8A 4OVSA 1I6QA 2HXWA 2L5VA 3LUZA 1AIVA 5J16A 5H8SA 2I58A 3W15C 4YB6A 5IZ1A 4XKQA 2F7AA 4GOTA 2H5YA 2R8TA 1YCJA 4PF8A 4QRZA 3TYHA 4XIGQ 5AE4A 1M5DA 3CG3A 4F3BA 1XI6A 1B3LA 4H45A 2Q89A 2Z8EA 3PGFA 3SZPA 4BDMA 1XVYA 1Q9DA 1SI1A 4L17A 2UXAA 3TTMA 1NNFA 1NUYA 4FAJA 4IO3A 4IGTA 1XHYA 2LAOA 2CZLA 3E13X 5TP9B 1MY0A 3VFJA 1FQAA 3ROJA 3FJGA 2QSXA 3M3FA 4THIA 2VOZA 4GF8A 2R6GE 5ET8A 4OFJA 3QSLA 2OWTA 2HHMA 3PPQA 3LUYA 2RF1A 3FGSA 5J1DA 3R7XA 4QFPA 1OVBA 1B3HA 2I3WA 2I48A 3FXRA 1NH8A 4PDDA 4O7MA 3VLUA 5A5XB 2F78A 1B51A 3GZGA 3TTRA 3IOVA 3EHSA 4TOZA 4ZZEA 2GHAA 1LFIA 1MG1A 1P99A 1N3XA 4IB2A 4H8JA 3VV5A 3RT6B 2Q88A 3QUJA 3GYYA 3IJOB 4NQ8A 3CFLA 3H6WA 2OCUA 1JEVA 4ELOA 5I57A 1IMDA 3PPNA 3U94A 1MXYA 1FPGA 5K2YA 4HW8A 3G3FA 1IMCA 4TLMB 1IEJA 5FHNA 1LSTA 1FCKA 2PCRA 2BJJX 4AQ4A 1USYH 1S50A 2ONKE 2I49A 3PPOA 1MPDA 1FTJA 1FPJA 3DM0A 3MJNA 1KWHA 1FJ6A 4N13A 2IA4A 4U22A 1B7HA 2XD3A 1ZKBA 3DP8A 1B2HA 3KOTA 3I3VA 2A5SA 1EYIA 4I3YA 1SW5A 3PUZE 3VLWA 5FTHA 3G3HA 3UIFA 3MP8A 4IO5A 2O6AA 1ZMGA 4Q30B 2ZYOA 5IM2A 4ZEFA 1LBZA 4GQOA 2ZYKA 2QVVA 1JVYA 3MSTA 5TPAB 2ZZVA 1FPBA 1RYXA 1B58A 2D5WA 2F35A 4LA9A 4PTKA 2FYIA 4X9TA 5ELVA 5DVIA 5CBSA 5HM4B 2UVJA 4POXA 3T0JA 5F1QA 2HFBA 4NF4B 2XXKA 3ZKLA 5B7DA 3B8BA 3PD8A 5ITOA 4ELRA 1GVCA 2VGQA 3EHTA 3SEUA 4X8RA 2XHDA 1HSLA 3PTYA 2H9BA 3C31A 3IOTA 4MF3A 4RJZA 4GWSA 2HXRA 3KZGA 4NF6A 1XOCA 4OZ9A 3FBPA 2WBDA 3OENA 4LUBA 4GWZA 1JW1A 4R9FA 1SI0A 4PE5B 1A54A 3MPKA 5H8FA 3LSFB 4MBPA 3FVGA 5LOMA 5H8QB 1FBFA 3TQWA 4OFOA 3EN3A 5I56A 2Z8DA 3H4ZA 5KCJA 1FPIA 1A8FA 4DCXA 2PMSA 3PPRA 2PFZA 2DOJA 1BP5A 2ZZWA 4YU0A 2NUVA 2VPOA 3HHGA 4DXBA 4FATA 3K2DA 3TTNA 5CMBA 2DXYA 1LB9A 1NUWA 3TELA 3OEMA 4OXVA 1MH3A 4EDPA 4OA4A 1SYIA 1S7YA 3MP1A 2ZMBA 1PBPA 2OPDA 4G8HA 1M5CA 4JWYA 4FORA 4PFBA 4NF5A 1BK4A 4I9DA 1XT8A 4NF0A 3QYTA 3TTKA 1S9TA 5ITPA 1MQJA 2QL3A 5AA4A 3SEWA 1DK4A 3TTLA 3ILTB 1NV3A 3VE1B 4QSEA 4PAIA 3PV0E 1IQ7A 4LN5A 3CR9A 1FPLA 3KN8A 3B6QA 3QUFA 4DZ1A 1B46A 1R9LA 4QBAA 1DCUA 3PPPA 1ZLQA 3KJ7A 3MBPA 4GRKA 3HN0A 4OFLA 1N0TA 1A55A 1IIWA 5CMCA 4RPOA 4WKMA 4P47A 3TDJA 5A5LA 1SW1A 3TCFA 1MXVA 2UYEA 3E9XA 1Y9UA 5AA3A 1B4ZA 4FJPA 1TWYA 4OVTA 1XC1A 3OO9A 4EQBA 1LLSA 4PFTA 4OANA 4P1LA 5DEXA 5BWJA 3IO4A 1FBEA 4O8MA 4F3PA 1P1OA 1OLAA 1FQCA 3H6VA 1ZTYA 4BDQA 1FBCA 2PBWA 4Q0CA 3TEPA 1A99A 4PFYA 2HAUA 2DWJA 2P1SA 4N81A 2P3NA 1B7ZA 3FUZA 4U1ZA 3V5AA 3RY3A 1QW0A 4N6KA 5CMKA 3P7IA 2DE3A 4MFIA 4NX1A 1UTBA 5A5XA 4JVDA 1VFEA 1MRPA 3K00A 2QPQA 4H5GA 1B1HA 4XKRA 5EQ7A 3S9EA 2ZZXA 1H76A 2I6EA 2PFYA 3C36A 2YJPA 2FHYA 1B1XA 1Y3QA 1I69A 5EQAA 3RLFE 3UK4A 5LDZA 1B3GA 5JTYA 4F19A 1B4HA 3I5OA 2HEUA 4LQ5A 3MVYA 2VD3A 4GL8A 4KI0E 1DTGA 3M3KA 1Z7NE 3QIMA 1SW4A 4JVCA 1R9QA 1EZ9A 2ZNUA 3MW0A 4PBHA 5I84A 1NMUA 4BDLA 4NN3A 5I59A 4R74A 5JK4A 2WYKA 1US4A 5ISUA 1O7TA 1SDXA 1QKBA 3R6UA 4MEVA 1IZ1A 2GHBA 1BTJA 4PAFA 5CI5A 4GWWA 4ZECA 2QFLA 1NV6A 3G7WA 3U8QA 3U72A 5IKBA 2CEXA 5I2KA 3KOSA 1EYKA 5CBRA 4IGRA 5TPAA 3FZVA 1MPCA 3KG2A 5DT6A 2XA5A 1DMBA 4P8BA 4NWDA 5I7IA 1RDYA 4H46A 2F5XA 4FBPA 3BFTA 4DE8A 3S9NC 3CG1A 3ILUB 3MP6A 1URSA 3FATA 4F29A 2F6GA 2Y84A 5KZTA 2XXRA 2XX9A 1B5JA 3N6UA 4ZEIA 2F97A 3CI8A 2Q2CA 4QFKA 4K3FA 1ELJA 2D3IA 1TFAA 5I2KB 2WYPA 1B0HA 5M2VA 1MY3A 4Q5TA 4KFQA 1FBHA 3O2AA 1B52A 1IMEA 4I62A 4YKIA 3UN6A 2QJEA 3VXBA 3FXQA 4HE2A 4NEDA 3GBAA 4ONYA 2P3VA 3PU5A 4GWOA 3T9UA 4OVPA 3VLVA 3RGYA 1MQIA 2XWVA 2IEEA 3U92A 1BKAA 2FVZA 1IXHA 1MXXA 4PFWA 2X26A 3FXBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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