4GF0A

Crystal structure of glutahtione transferase homolog from sulfitobacter, target efi-501084, with bound glutathione
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
208
structure length
208
Chain Sequence
MVMLTLYFTPGTISVAVAIAIEEAALPYQPVRVDFATAEQTKPDYLAINPKGRVPALRLEDDTILTETGALLDYVAAIAPKAGLVPTDPTAAAQMRSAMYYLASTMHVAHAHKMRGSRWAKQQSSFEDMTAQVPETMAACADFVESDILRGPYVLGEDFSLADPYLFVVCNWLDGDGVDTAAYPKITTFMQQMTARASVAAVKDKGML
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of glutahtione transferase homolog from sulfitobacter, TARGET EFI-501084, with bound glutathione
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase
source organism Sulfitobacter
molecule tags Transferase
total genus 76
structure length 208
sequence length 208
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-08-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4gf0A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4gf0A01
5ECPB 1JZRA 1TW9A 3KH9A 4EE0A 5J4UA 1PGTA 1DE1A 2XPEA 4NV5A 5J41A 4NHWA 2K9FA 3JCML 2REMA 2J9HA 2WGRA 3KH7A 1M9BA 3GH9A 2WZ9A 4POMA 3VPTA 3QAGA 1Q98A 5D8IA 2I9HA 4L5LA 3TKPA 20GSA 3RBTA 1B9XC 2L4CA 5HFGA 3LYPA 1K3OA 2JACA 2F51A 2YPMA 4DEJA 1PQNA 3DYRA 6GSXA 2O7KA 3A2WA 2VM1A 3ISOA 1GTBA 4ZL9A 4G9HA 3RPPA 1T1VA 2E2MA 3HYPA 1X0RA 2AYTA 2MMNA 4OFMA 3U6VA 3HJOA 4Q5FA 1TJDA 4GWRA 5KN3A 5G30A 2VL9A 4KA0A 1U3IA 3DVWA 4N0VA 5HFIA 3BBYA 5IM9A 3D22A 2MBTA 1PA3A 1SENA 2V1MA 5EVOA 2FUG2 3I9V2 2AB6A 2HSMB 2K6VA 4J57E 4KCAA 1Z5YE 3FRCA 5A4UA 5FT3A 1HNCA 4GF0A 3MWHA 1YZXA 2R4VA 4ZL7A 3M8NA 2ALBA 4MCUA 1WPIA 5H5SA 3IC8A 3LYKA 2E7PA 2QKEA 3TKSA 2FGXA 1R4WA 1T8EB 2LRTA 5CYYA 1SJZA 1R5AA 1E2YA 1TRWA 5ABRA 2LNSA 1FW1A 1XWKA 6GSTA 5G1LA 1FVKA 3DVXA 2XBIA 3VPQA 3L9SA 2GT6A 1MDJA 3KZQA 2CX3A 2VCTA 2N5BA 3CSIA 3K8NA 5G31A 5ENUA 3GURA 2KUCA 3WT1A 1SD8A 1YJ6A 2E2GA 1TK8B 4KE3A 1NHOA 3WGEA 1U6TA 5IPGA 3DRNA 2GSRA 5KN1A 2L57A 3CRUA 3DKSA 4MF7A 4JU5A 3CXGA 2I3YA 1GTIA 5F8BA 5J3RA 5J9CA 3HVXA 1K0CA 2M72A 2GSSA 4KCEA 4GSSA 2K18A 2QSIA 3WYWA 4DSSB 3PH9A 1EP7A 1SKRB 1LBKA 2ON5A 4PUAA 1Z6MA 2ZUPA 3FZ4A 3GMFA 4AJ7A 4XRDA 1IYHA 9GSSA 1DSBA 6GSWA 2WFCA 2ZCTA 5DALB 4MPGA 1JZDA 3LFLA 1V58A 1EOGA 2KP1A 2PVQA 3PR8A 3TRXA 2H1DA 3F6DA 2DJ0A 1GNEA 1K0DA 1T7PB 4GCIA 1AQXA 3QOUA 1OC3A 2JSYA 5B8BA 1G6YA 3UMAA 3BJ5A 3RPNA 1FO5A 1X9WB 4ZB6A 2H1GA 1AXDA 5J5NA 3C1SA 2DMMA 4IBPA 4ECIA 3DXBA 1VF2A 5DJMA 4KSOA 3TJBA 2IL3A 3ZLPA 1Z7RA 5ECKB 1OE8A 2WJUA 5IO2A 2N5AA 1G7EA 3LGCA 2IMIA 3UIWA 3KGKA 1GTUA 4HZ4A 2OJLA 2XPDA 4PTSA 4IP6A 2HSHA 2C0FA 4TXVA 4K2DA 4F0BA 1WMJA 2WRTA 1WP0A 1J0FA 4KW6A 2WB9A 5HR1A 1H75A 4JE1A 5G5EA 4ML6A 2R3XA 3IDVA 1NHYA 3QPMA 3TRQA 4RQRA 2C0GA 2VLVA 5GZZB 2NVLA 1O73A 3QCPA 2LTKA 3I43A 3IXRA 2N5FA 4I2UA 3UVHA 4ZXGA 3WT2A 12GSA 3GX0A 3EC3A 1JHBA 3FHKA 3FR3A 2LEGA 5FHIA 3EWLA 3ZFBA 1MDIA 3DEXA 1ZYEA 4MF5A 1AUCA 1SD9A 22GSA 2HYXA 5J9BA 4L0UA 3A2VA 2H72A 2VD1A 1TKDB 4G10A 2HZFA 2MZCA 4XS1A 1GRXA 1ZMAA 5DALA 1I9DA 4MMMA 1X5CA 4RI7A 4V2LA 2HRKB 2OE3A 2JZTA 2HI7A 4PQHA 3FEUA 1XWAA 1EEMA 2A2RA 4N30A 1XOBA 4KDUA 1M2BA 2LJAA 2YZHA 4LMVA 4LL1B 1K0AA 2K8SA 1Z6NA 2TRCP 4WBJA 4ULXA 1F9MA 1XCCA 1LJRA 4HJMA 2GT5A 2GS3A 4JBBA 4K9ZA 3WGDA 5IMFA 1OKDA 3EYTA 3TKSE 4O92A 2YWOA 5ECNB 2A2SA 2DLXA 1GSQA 2L59A 1SK1A 3Q6OA 3UBLA 11GSA 3OR5A 1OC9B 4AJ8A 1V98A 3A3TA 4GXZA 1AQVA 2V41A 3GL3A 1JLWA 4AGSA 3IK7A 2EC4A 2FNOA 4V1Ap 4BVYA 2M46A 2GQLA 1PX6A 5ID2B 2IFQB 2H30A 4XTSA 5IMCA 1XZOA 2YZUA 3EINA 2YWNA 1TXXA 4MDCA 4BL7A 2FLSA 2H73A 5IMVA 3Q18A 5HQPA 1XFLA 3AY8A 4EDZA 3TRPA 5G1KA 5LD0A 3NIVA 1V40A 2FHEA 1EP8A 4PGTA 4I2TA 2HRKA 3GSSA 4FYUA 1N8JA 2X8GA 2EIRA 3CRTA 4QL7A 3GH6A 1XWGA 1W4VA 5CAXA 3F6FA 2H70A 1GNWA 4HQSA 3HD5A 5IOWA 1PN9A 3UL3A 1NM3A 2XBQA 1HQOA 3IRAA 2FA8A 1O85A 2CVBA 5GAPD 4G0IA 3CSJA 1U87A 1YEXA 1V9WA 3DMLA 2DIYA 4IP1A 5F07A 4KUNA 4JR4A 4V2NA 2VL2C 2LQOA 2JADA 2LUSA 3GTUB 1WRYA 3HHVA 4YQUA 1PRXA 3KIJA 1YY7A 1OC9A 14GSA 3G9BA 3D0ZA 3H4KA 2CAIA 4IQ1A 3QD9A 3DWVA 3HZ8A 1TRUA 1QUWA 3HDCA 1QQ2A 19GSA 2XHFA 1TK5B 4KSMA 3RDWA 2DBCA 1THXA 1A23A 7GSSA 4G19A 3D4TA 1VF4A 4J56E 1DBYA 2FD3A 3SBCA 5CP1A 1R26A 5ID2A 1PX7A 2OBKA 3M3MA 3LWAA 3LG6A 2IFQA 4WEYA 4ISDA 3PINA 2DC5A 3F3RA 4XIHA 2BJXA 2O8VB 4IHUA 4IW9A 2C3NA 2V32A 4ILFA 5CO3A 1XPVA 4K0GA 3NZNA 5JCUA 2HRFA 1PKWA 3FKFA 3GN3A 4EKZA 3D21A 4GQFA 4IS0A 2MMOA 3V1WA 4GSNA 1M2AA 2E0QA 2YWIA 1VF3A 5DQSA 2AV4A 3WGXA 1O8XA 4TOPA 3MSZA 1BQ7A 1SK2A 1GH2A 5EY6A 1UVZA 1EV9A 3F4TA 4LLRA 2WS2A 3HCZA 1S3CA 4HS1A 3G7JA 4TR1A 2JZSA 1SL1B 3RHBA 4NPBA 1VGLA 2P5QA 3O6TA 3HXSA 3US3A 4MH3A 5DAKA 2PVOC 1AAZA 2FWHA 1OAZA 3GTUA 3IE3A 2B5YA 3G7YA 1SL2B 5INYA 1THOA 4MK3A 2DJ1A 5ECLB 3BCIA 2PGTA 4TRXA 4BWSA 1W89A 1KTEA 4Q5QA 4NXIA 1YQ1A 4ZB9A 2GDRA 1ABAA 4WBRD 1A24A 4IN0A 1JZWA 3GYKA 2WULA 2PWJA 3Q74A 3W6GA 4EDYA 4JRRA 1F37A 3TKRA 1GSDA 2PUKC 1B48A 1ZYQB 5JWOB 1FAAA 2C3QA 3FR6A 4ZBAA 5JCGA 4MF6A 5B7CA 4JR6A 1Z7PA 4K0NA 5A5KA 3KCMA 6GSUA 3IPZA 3LXTA 2IMKA 3GX8A 2R2JA 1SKWB 2LJRA 4V1Ag 4MZWA 5ECSA 4EXJA 2L6CA 3TJKA 2C80A 4HI7A 1K0BA 3TGZA 3HZ4A 3ZZXA 5F06A 4ACSA 5CRDA 2DIZA 2IJYA 3MAKA 4F2IA 1M0UA 1XWBA 1ON4A 1GSEA 4IVFA 2C8UA 1XW6A 2PERA 3KM6A 1SJ6A 2L5LA 3ZL5A 17GSA 5CNWA 4PXOA 4TR0A 2IWTA 1SL0B 1B8XA 3N9JA 3UEMA 3O3TA 4Q5RA 2H0GA 5ECOB 2HRNA 3ED3A 1M9AA 5LNKe 1ST9A 2A4VA 2PPTA 4GTUA 5KN2A 5EL8A 2KOKA 1A2JA 1R5PA 2DJKA 2B5XA 2PMTA 2TIRA 4TW5A 2IMFA 3W8SA 2VO4A 3CYNA 3MDKA 2FWEA 5JWQB 4NHZA 3EURA 5D96A 1TI3A 3BOAA 2OKAA 2RM5A 3KXOA 2FWFA 2HSMA 1YF1A 2H0HA 3G7IA 4RUVA 1GSYA 3RAZA 5DCGA 2P31A 1KNGA 1C72A 3CTFA 1CQGA 3SWLA 1TU7A 2H74A 5AIVA 1ZCPA 5GSSA 4XRAA 4MZBA 2KP2A 1T4YA 4CDOA 1TU8A 2BMXA 4NWYA 1HNBA 2YJHA 4RI6A 5AGYA 4EUYA 2LSTA 1ZL9A 3R2QA 2OADA 1GLPA 3A5WA 3ZREA 2G0FA 4E8HA 1F6MC 2RUEA 5F0GA 3IR4A 3L78A 1AIUA 3ZVJD 4F0CA 4MJEA 3FZ9A 1Y6EA 2YOIA 2F9SA 1PL2A 1RQMA 3PPUA 3GUSA 4HZ2A 4LA1A 3Q19A 3GA4A 1I5GA 1F2EA 4OCFA 3IC4A 2CT6A 3I6AA 2HXKA 1SJIA 3TDGA 4XCSA 2FA4A 1QFNA 4O32A 2HFDA 3ERFA 3VI5A 13GSA 4X43A 2PU9C 5ECQB 5B8AA 3P90A 3GIXA 1PKZA 1OVNA 1T00A 2BTOT 4DSSA 2CV4A 1ZGNA 3TCOA 2EIOA 2TRXA 3M9JA 3P8WA 4BVXB 1A2LA 3APSA 1WJKA 4YH2A 3HJMA 1G7OA 1PSQA 4WXTA 1GSFA 3C8EA 3TOUA 2VCZA 2HQTA 1FG4A 2LS5A 4MABA 1K0MA 3UBKA 3LJRA 4POKA 2LRCA 5HR3A 1V2AA 4MLYA 2P5RA 3TJGA 1EWXA 3GKKA 3S9FA 2JL4A 5ELGA 2I1UA 2MYGA 3TJFA 2H75A 2RUFA 3APQA 1M7TA 4ECCA 2DSAA 1GL8A 3TKQA 2C1YA 4BWQA 2WDUA 5D9VA 5CREA 3C1RA 3GNJA 4KH7A 3P7XA 4MH2A 4DVCA 4KDYA 3J7Yk 3DGQA 1OYJA 3P2AA 2FCHA 2V6KA 3M1GA 4WR4A 2F3MA 4N10A 4CHSA 5LCZA 4NV2A 3VFIA 2HZEB 5E4WA 1J9BA 4DSRA 2VL3A 1FOVA 4D73B 4O5RA 1U88A 3KP8A 4KGIA 1B9YC 3UOMA 3VWWA 2YANA 2J23A 2VAFA 4RQXA 4XS4B 4IGJA 1SYXA 4ECJA 3RHCA 4ZBBA 2CA8A 4PNGA 4EL1A 4BVXA 5DVBA 3M0FA 4KF9A 1O8WA 3EE2A 4HQZA 4KAEA 3GKNA 3EU3A 2OACA 4YAPA 2YJ7A 2LJKA 3TKSC 3HKRA 4K7OA 4TR3A 1K0OA 3HA9A 1GUHA 4I8BA 1O81A 5ECHB 3FR9A 1FB0A 1YKAA 4K1FA 1GLQA 1JFUA 4PX1A 3GFKA 2PBJA 3ZVJA 1A0RP 2H66A 4XHMA 3VK9A 2HE3A 1SU9A 3H79A 5E59A 1TI1A 3LORA 2CZ3A 3VWUA 1F3AA 4WR5A 3ZITA 1K3LA 2OE0A 3D4MA 1FB6A 2H19A 2H6XA 2VLTA 3MNGA 4IKHA 4GRFA 4TN8A 1G6WA 3IK9A 5DBQA 5AISA 2DJ2A 1YKCA 2VOCA 3QFAC 2DJJA 3ME8A 3QAVA 5CRWA 4OD7A 4KNDA 5C04A 1EGRA 2OBIA 2GVPA 3J7Yb 1ERWA 1U3AA 4PUFC 3F9UA 1PMTA 2B1KA 1Q4JA 3F4SA 1CQHA 1EGOA 4ECBA 4HJ2A 1EOHA 1SKSB 4HOJA 2XC2A 1TRVA 2MMAA 1H4OA 1KEBA 4F03A 4HEA2 1BEDA 1JZOA 2LKUA 2GZZA 4K7NA 1S3AA 3KJYA 10GSA 1A0FA 2KHPA 3ERGA 3CTGA 1HYUA 4X1UA 2HT9A 1MD4A 2IIYA 4IQAA 2H6ZA 5C00A 2AAWA 4ZILA 4CW9A 3FZAA 4ID0A 1GWCA 3HY2A 2IPAA 4HU9A 1PL1A 3KMNA 2YWMA 2K8VA 3VLNA 2DMLA 5IOXA 1Z3EA 1GTAA 4AF2A 3F0IA 4MJAA 2X8CA 3L9UA 1MEKA 2B5EA 2H76A 2LNTA 2PN8A 2C3TA 2R5GA 4L0WA 2AJQB 2IMDA 1TTZA 2B7KA 3E3EA 5HR0A 2B1LA 1X9MB 2O87A 3CBUA 2VD0A 1BG5A 1O6JA 2H1AA 1S3DA 3FK8A 3IAM2 2NTOA 1XXUA 3NOFA 1MTCA 3O76A 3HVVA 1WE0A 2NPBA 4MJBA 4YQMA 3IOSA 5ECIB 1R7HA 1GSSA 4POLA 2RM6A 2H0IA 4KX4A 4OO4A 3EMPA 2OE1A 1AQWA 1E6BA 5H5QA 1DUGA 2NBSA 4IJIA 2JSZA 3GL5A 3UAPA 1BJXA 3DD3A 3KEBA 1A2MA 1YEPA 1Y25A 3IA1A 4MZCA 3H1NA 2GTUA 2HNLA 3GHAA 2QC7A 4MPFA 2QGVA 2CQ9A 4WKWA 2GSQA 2IMEA 4EVMA 16GSA 2O85A 2OA7A 3C7MA 4HUAA 3BD2A 2H71A 2VL2A 2WCIA 2UZ8A 4YAVA 1URMA 1MD3A 1NW2A 5D9XA 5FWGA 4OCEA 2YV9A 1AC1A 2EIQA 2VUPA 4GLTA 5DQYA 1PD21 1BX9A 18GSA 4PQ1A 1ZOFA 1X5DA 1RW1A 4TXOB 4FH8A 2L4QA 1UA5A 4FYBA 2X99A 3KTLA 5JCWA 2F8AA 3IAS2 5IMAA 4LMWA 4K6XA 2YV7A 2H8LA 5EPFA 4J2FA 1VF1A 5IPHA 4OWYA 1RK4A 1ZZYA 2HRAA 3L0HA 4TR4A 2X8HA 1HD2A 1ERUA 3QR6A 2ZNMA 2Z9SA 4F82A 3KD0A 3IBHA 6GSVA 1WWJA 2CVKA 3GSTA 2AUVA 2DJ3A 4QQ7A 4PQIA 3DIEA 4QL9A 2H01A 5COHA 1X5EA 2VCQA 3LSZA 3KTBA 4N11A 3ZMLA 5KEJA 1VRSD 2JZRA 3F4RA 4PURA 2FY6A 1EV4A 2HLSA 2B7JA 5KN0A 1A8YA 2YP6A 5G5FA 3TUEA 2LV3A 3EMXA 3QDNA 4OFNA 3GKXA 1T4ZA 4I6XA 2YNXA 2B3SA 3PGTA 1N2AA 5AN1A 4MA9A 1GP1A 4NMUA 1XIYA 2C0EA 1WIKA 2GQKA 1XW9A 3VWVA 3ME7A 3FY7A 1GUKA 2VCVA 1USBA 1YDKA 4WETA 4WF4A 2C0DA 3VWXA 5D9WA 1XWCA 2GLRA 3E9JB 4ZL8A 3ZIJA 5IMZA 1QMVA 1O7UA 2LQQA 1QGVA 2AHEA 1T3BA 2G2QA 4BVYB 4X0XA 4G0LA 1K3YA 1SYRA 2X64A 3F8UA 5G2ZA 4I5QA 1QK8A 4DSQA 2RLIA 2CX4A 4TXOA 2VCWA 4ZBDA 1GULA 5CRHA 4YQVA 1EEJA 2M80A 1NSWA 1G0TA 4KB3A 2P0GA 1GSUA 4BL7B 2R37A 5ECMB 3QAWA 2RIIA 5A4WA 2GZYA 3HVSA 1JLVA 5DJLA 4I97A 1M99A 3C73A 1MDKA 2MMZA 4JEDA 2CVDA 2HSNB 5ELAA 1V57A 1F3BA 3TJJA 4FYCA 4OMVA 1B4QA 4GSTA 1X9SB 1IYIA 3LQ7A 4HU7A 4EC0A 4K7IA 2F8FA 2CAQA 3APOA 3D6IA 4H86A 3ZRDA 4ZB8A 2C4JA 3L4NA 3UJ1A 4OO5A 4TVEA 2VLUA 4E8EA 3UVTA 4EO3A 4FIWA 1KBNA 2H1BA 4MP4A 1BAYA 1ACVA 1ERTA 5IMDA 2GGTA 3IHQA 1TK0B 1WOUA 8GSSA 1ILOA 3ZFLA 5JWRB 3R3EA 2V2GA 2YN1A 1GUMA 1QXHA 3N5OA 3KP9A 2L5OA 1UC7A 5GSTA 5B6MA 3FZ5A 3I69A 4NAXA 3QMXA 3UARA 3U5RE 4IELA 5ECRB 3C71A 1XW5A 4WF5A 1ML6A 2L6DA 4GQCA 1J08A 4EF0A 5BMUA 3VI7A 5IO0A 5A4VA 4USSA 5HR2A 2O89A 3D5JA 1SK0A 3W8JA 3GKMA 1LU4A 5H5RA 2NDOA 4G2EA 1A8LA 1DE2A 3H8QA 3QFBC 5IIZA 3CSHA 2IN3A 1B4PA 4KDXA 3IV4A 3KMOA 4XS6A 2V6OA 3TB2A 1Z9HA 2ES7A 1OC8A 6GSSA 1M2DA 2I4AA 2HSYA 3ZTLA 1OKTA 4LL4B 6GSYA 3GRXA 4N0ZA 5AIXA 4HDEA 1TDIA 4PNFA 2KLXA 3TOTA 4ML1A 4TKYA 1AW9A 4P3YB 1OE7A 3FW2A 4FQUA 4V2MA 5CRGA 1HNAA 4G0KA 4Z7XA 4BA7A 2FWGA 4POBA 2GZPA 4TR1B 1XVQA 3F3QA 4AJ6A 5B6NA 1TP9A 4L5OA 1ERVA 4O7HA 5D73A 1XVWA 5DAKB 1EZKA 2HZEA 3F63A 4K8MA 2I81A 4Q5NA 4D73A 5HFKA 3BCKA 1TOFA 4L8EA 2VM2A 3EVIA 5DCHA 2JU5A 1FVJA 1K0NA 2VCXA 2CZ2A 4XS4A 4BPYA 5D93A 1FHEA 5DDLA 3ZIVA 2H6YA 1XOAA 3H93A 3ZYWA 3HJPA 3M9KA 3A2XA 4IJ3A 3L9VA 2VIMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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