4GJ6A

Crystal structure of renin in complex with nvp-ayz832 (compound 6a)
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
339
structure length
333
Chain Sequence
TLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title The Discovery of Novel Potent trans-3,4-Disubstituted Pyrrolidine Inhibitors of the Human Aspartic Protease Renin from in Silico Three-Dimensional (3D) Pharmacophore Searches.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 333
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2012-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4gj6A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4gj6A01
5P0QA 4R91A 5P7RA 4Y9WA 5DR1A 4S1GA 5P6KA 2HPEA 4TVHA 4J17A 3EKWA 3BGCA 3IA9A 4YOAA 5OZHA 1HTGA 3LZVA 4PEPA 2Q15A 3NDTA 2NNKA 4GJ9A 3VFAA 3TPRA 4K8SA 5P6JA 2WF1A 4M8YA 1G35A 4PZXA 4AA8A 4U8WA 1ME6A 5P1BA 2A1EA 5P1AA 5P7SA 5P4HA 5P59A 3OHFA 5P18A 4MC1A 5P73A 1FQ4A 3D91A 5P7GA 1BDRA 2RKGA 3VYFA 4FL8A 2WHHA 4Y3MA 5P2XA 5P8HA 1EPME 4Y44A 4PPHA 5P38A 2NXLA 3KDCA 1HIVA 3RTHA 5I70A 3LIQA 5P1VA 5P4SA 2BPZA 1SDUA 4J0YA 3DJKA 5ENMA 5P3FA 5P6LA 5P22A 3Q6YA 3HAWA 4FM6A 3KFNA 5P71A 2QNPA 5P0MA 1SH9A 2FMBA 2AVQA 2R3WA 5HDZA 1AM5A 1IZHA 4Z50A 2RKFA 4YOBA 3NUJA 5P2RA 4EJLA 2QNQA 5P4QA 3FNSA 4OBZB 2ZHUA 5P33A 1GVVA 2R38A 4NJUA 3H5BA 4YD7A 3CIBA 1ER8E 4OBDA 3PM4A 5DQ4A 5P32A 3LZUA 3FNTA 3PCZA 3Q5HA 5P5QA 1DW6C 5OZIA 3ZPUA 4DQCA 1B11A 3EKTA 2HPFA 4RVIA 5OZAA 1RV7A 2Z4OA 5P7EA 4E43A 1APVE 5P7LA 3MSKA 4RYCA 3OU3A 5OZPA 5P6GA 4I0JA 4TVGA 2IENA 3TPPA 5P8RA 3APPA 5P2HA 3ER3E 2ZJJA 2CEMA 5OZMA 1FEJC 1C6XA 5P3EA 4H3JA 5P17A 5P3GA 4LC7A 3QRMA 2J9JB 1FQ6A 3UDYA 1BDQA 1D4LA 5HE7A 3OGQA 4YCYA 1ZBGA 1M0BA 2IGYA 3SA8A 3UFNA 4DVFA 3PRSA 4GJ7A 1MT9A 1PSAA 3OXCA 3VF7A 1WBMA 3VLAA 1YTJA 1E5OE 1BVGA 2H6SA 4MC9A 4RROA 1BAIA 5P1NA 1SMRA 5ER2E 5KR0A 4Y3TA 3EL1A 4QJ6A 5P1DA 2QMPA 3HVGA 3O99A 3PWRA 3D3TA 2G1SA 1BXOA 1A8KA 5KR1A 4I0HA 1MSNA 3K5FA 3ST5A 3O9DA 5IVQA 4KE0A 5P6HA 5ISJA 3S2OA 4DQGA 3RVIA 1J71A 2IL2A 5P4CA 3BUFA 5P2TA 3NU5A 4Y4DA 5IE1A 4CPSA 1YTIA 1ZLFA 5F01A 5P1JA 4EYRA 5P70A 2I0DA 3OXVA 3O9GA 5DGWA 5P0XA 5I3VA 1AJXA 3R4BA 5OZ9A 5E5KA 2OAHA 5P4TA 1FGCC 2NTRA 3NYGA 5OZCA 5P2NA 5P04A 5OZ5A 1MTBA 5P4UA 1HVLA 5P8CA 4DJPA 3L5DA 5P2FA 5SY2A 2ZHTA 5PEPA 5P5ZA 5P83A 1W6HA 3PJ6A 2J9KA 5P65A 3PEPA 3O9LA 4Y3AA 2P3BA 5OZ3A 2G94A 3GGAA 4I0DA 5P8JA 4X7IA 5P7ZA 3UDJA 5OYQA 5P3LA 4HVPA 5P43A 4B0QA 2XFJA 8HVPA 5P5HA 5P3HA 4RGHA 3VV8A 4L7HA 2EWYA 4GJAA 4Y48A 1RNEA 3OUBA 1CMSA 5P0IA 4ER4E 4B1DA 1LS5A 5P1PA 4F76A 5JFPA 4ZSQA 4OBGA 2VIEA 3IN3A 3CICA 5KOSA 3O9BA 4Y3LA 3RSXA 4EJ8A 4GJ5A 5OYVA 5P30A 1B6LA 3EKVA 5P46A 5P57A 4RCEA 5P6WA 5P00A 1IDBA 4HA5A 1FFIC 5OYZA 5P3ZA 5P0FA 3TLHA 1T7IA 2WEAA 5P4JA 5P7IA 5P5LA 5HTZA 5P40A 1K2BA 2BPVA 2G20A 5KR8A 1VIKA 4JECA 1W5XA 1IZDA 4CPUA 4CKUA 3OY4A 3SA7A 2JJJA 4DJVA 5P45A 3N4LA 2BKTA 3MSLA 4HDPA 1G0VA 3QS1A 4QJAA 5P5DA 2ASIA 3NXNA 2AOJA 3Q70A 5P27A 4J1IA 1FFFC 4J1FA 5P8KA 5P3RA 4Y38A 5P5WA 4YBIA 5P7JA 5P1OA 3EL0A 5OZTA 5P5AA 3SQFA 5P19A 3SLZA 3VLBA 1YM2A 3S7MA 4OC6B 2FXDA 1F7AA 1HVCA 2VKMA 4JP9A 4Y4AA 2ZHRA 4QJ8A 3HVPA 2VIJA 3EXOA 3O9CA 2I4WA 5P3DA 1MUIA 5P6UA 2ZJKA 3OQDA 4Y3NA 4EJDA 4CMSA 5P4FA 5P5FA 3QRVA 2BPYA 3O9FA 5P1CA 5P6XA 5HCTA 4CPQA 3WB5A 1SGZA 5P5IA 1EPPE 5P4MA 5T4SA 2BKSA 1NPWA 3APRE 3RU1A 3L5FA 4R93A 4GIDA 3KDBA 3SA6A 5P5EA 1TQFA 3U6AA 5P6RA 4Z2ZA 4ZSMA 4DH6A 4OBZA 4Z22A 1BVEA 5P63A 2AVVA 3OK9A 2AVOA 5P2AA 5P5BA 5COPA 3ZKQA 1A9MA 4F73A 5P47A 4I0GA 4EP3A 3ZKMA 3ZMGA 3EL4A 5P5GA 3INEA 1DPJA 3QPJA 1KJ4A 2F80A 4Q5MA 3VSWA 3PCWA 2V11C 1NSOA 1XE6A 1D4YA 1BBSA 5P6CA 3IVHA 4RRSA 3QN8A 3SACA 4GMIA 4FSLA 5P8MA 1MSMA 4OD9A 4Y3XA 4YA8A 3EM6A 5C9DA 1FIVA 3AUPA 3MWSA 3BC4A 5HU1A 1DIFA 1K1UA 2ER6E 2NMZA 2UXZA 2BJUA 1FMBA 2PSUA 3I6OA 1B6MA 1QBUA 3NU6A 4ZE6A 1K2CA 5P4BA 3R0WA 4HLAA 5OZ2A 1HIIA 1MRXA 2QZWA 2J9JA 3TTPA 2P3BB 4I0IA 4DJQA 4A4QA 4XXSA 4FE6A 1IZIA 2B42A 2ANLA 5DQCA 5P15A 2B7ZA 4J0PA 4RLDA 4FRKA 5P0ZA 5C9FA 5I3XA 5P8IA 3SAAA 4I10A 2IGXA 1HVJA 1AVFA 3GGUA 2QZLA 5P2WA 3RTNA 3KT5A 1EC3A 3Q3TA 4DJOA 4XX3A 4UPJA 3TOGA 5OZJA 1C70A 1SMEA 3VEUA 4AZYA 2O4LA 3ZKGA 5P49A 2ZJHA 3KDDA 5OZOA 3I8WA 3GW5A 3OTYA 3IVIA 2ER7E 4J1HA 4GB2A 4AUCA 4K4QA 2AVMA 5OZVA 1PPKE 1XS7D 4D83A 3VF3A 2AZ9A 5P53A 1IIQA 1KJ7A 5P4AA 3T7XA 2IEOA 2R5PA 4COEA 1SIVA 1LF4A 4GJDA 3PSYA 1DP5A 4H1EA 5FIVA 4I1CA 2ZJLA 1M4HA 1YM4A 2WF4A 1SIPA 4LHHA 4YCKA 5KOQA 5P12A 3UDRA 4DQFA 1EPLE 3SABA 1GVXA 2HC0A 4Y4EA 3WB4A 3JVYA 3VSXA 2WF0A 5P4NA 1HIHA 3F9QA 1NH0A 4GYEA 3EKQA 2O4NA 3M9FA 3NDWA 3OQ7A 5P01A 4Y35A 3LPIA 5P3VA 2Q5KA 3LIZA 4ZLSA 5P2SA 4DFGA 5KAOA 4EP2A 5P6EA 1A30A 4XX4A 3KFPA 1BIMA 4Q1YA 5P6ZA 2R5QA 3PMYA 1FB7A 4BELA 4RVJA 1HEFE 5HVPA 3LHGA 2B8VA 1K6PA 1HSGA 3L59A 2P3DA 1HRNA 1W5YA 1ZSRA 3TH9A 3KYRA 3LIXA 4LP9A 1EPQE 4MC6A 3K4VA 5P52A 4DV9A 3LPJA 4Y51A 4KUPA 5P1GA 3ECGA 3U71A 1D4HA 4OBHA 1FMUA 4DUSA 1KJHA 5HDUA 2HS1A 5DR0A 4YDFA 4NJVA 4Y4ZA 5P0JA 3BVAA 3PSUA 1YTGA 5KQXA 2AZBA 2AOGA 5AH9A 1ZTZA 3GGXA 2P3CA 2QMGA 4AA9A 5P4YA 5P1KA 4WTUA 5P60A 2O4KA 4OBKA 3ZPSA 1C6ZA 2V12C 5P11A 3PSGA 5P7PA 5P3BA 5P4VA 4CPRA 3A2OA 5P0PA 5DQ2A 5P0UA 2VJ9A 5AHCA 1PSOE 2F3KA 3BHEA 5P4KA 2AQUA 4OD9B 3L58A 3U7SA 5P16A 1QS8A 2HB2A 3EBZA 5P06A 5P7BA 5ER1E 4Y5PA 4M8XA 1F34A 2QI0A 1FQXA 4ZPFA 3SPKA 3KF0A 3LITA 4OBJA 4OC6A 5P8SA 5P0AA 1LF2A 3OQKA 5P28A 1OHRA 2G24A 7UPJA 2NXMA 3QBFA 4FGXA 4J1CA 5DPZA 3WSJA 4Y3PA 5OZWA 5I3YA 5OYUA 4D85A 2H6TA 5P5UA 4FS4A 1TCXA 2ZDZA 5P80A 3DM6A 3KFSA 3PLLA 3SKGA 2PWCA 1SDTA 4Y3GA 4A6CA 3D1XA 5J25A 4YD3A 4U7VA 5OYWA 5P61A 5P84A 5P5NA 5P6YA 5OZNA 5OZUA 3RSVA 2HB3A 5OYRA 5SZ9A 1K1TA 5P7VA 3OWNA 3OOTA 5P8BA 3S7LA 1ODXA 5JFUA 1AZ5A 5P67A 2R3TA 2OF0A 1TSUA 3G70A 3UQRA 2PK6A 4J55A 1DAZC 1MEUA 3BUHA 1D4KA 3VV7A 2IQGA 3EL9A 2OHRA 4ACXA 2Q64A 5DR8A 4Y3RA 3CKRA 4EQJA 3G72A 2QHYA 1KJFA 4FM8A 4QLHA 3TKWA 5CONA 2VS2A 1FG6C 4EXHA 4Q1WA 5P58A 2ER9E 3UQXA 5P87A 1UH7A 5P66A 5P4RA 5P4OA 4Y3DA 5P56A 3INHA 2FNSA 4OBFA 5P6DA 3OU1A 1IDAA 1KJGA 4ZSRA 1XN2A 3NXEA 3B7VA 1HTRB 1Z1RA 2ZJIA 2F3EA 5IS4A 5COOA 4Y3ZA 1QBTA 3MXEA 4CP7A 3I7EA 5P8UA 1FMXA 2G26A 5P1IA 3SA3A 1K6VA 3PI5A 4J5JA 5C9BA 5P68A 3QROA 4YHQA 2P8HA 2WF3A 2Z54A 4RZ1A 1GVTA 1PPME 1HXBA 4H3FA 4ER1E 2AOFA 2VA5A 5P5YA 5P7QA 4H3IA 9HVPA 4Y41A 3PMUA 5AH7A 1JLDA 4TRYA 5P64A 4PZWA 5P8DA 1EC1A 2QNNA 5BWYA 1W5WA 1T7JA 2JXRA 3OOZA 5P4GA 5P8TA 4NJTA 5P76A 1T6GA 2AOHA 1HVKA 5P2BA 3UHLA 1LZQA 1GNMA 5P35A 3OGPA 5P77A 4B78A 1HEGE 4LL3A 5P4PA 5P5JA 2IKUA 3ZKNA 4Y6MA 2WJOA 1TCWA 4BEKA 4FCOA 3RTMA 3HDKA 2XFIA 5P0LA 2ER0E 2G27A 2V10C 4D8CA 2QCIA 3BVBA 4I11A 3ZKSA 1QDMA 5P1XA 4WY1A 1W50A 3O9EA 5P2JA 4RCFA 4Y3FA 3SFCA 1EPRE 2QHCA 3OHHA 1MESA 1FQ7A 1BV7A 4DJXA 5P03A 5P0CA 3NU3A 2NPHA 5I3WA 2WEZA 3PBDA 2SAMA 4ACUA 5HE5A 3BRAA 2JE4A 2HS2A 4Y54A 1T7KA 2R8NA 5KR2A 7HVPA 5P0VA 4J0TA 3D1ZA 5P54A 1ENTE 2BB9A 5OZQA 5KQZA 5P1HA 3OADB 4GJ8A 2PYMA 2QI3A 6UPJA 3T3CA 2I4UA 4HDBA 1HTEA 1C6YA 3UDPA 1YTHA 3CYXA 2I4VA 5P3AA 4I0ZA 4QJ9A 4B70A 1ZSFA 5P08A 1HPXA 3L3AA 1XN3A 2OHLA 2QAKA 2G1NA 4I0EA 2QMDA 2AOEA 2JYSA 3R2FA 5BRYA 3T7PA 1E82E 1HPVA 1LYWB 3ZOVA 5P0SA 4ZPEA 1OEXA 4R92A 2O4PA 5P2UA 3KA2A 4ZIPA 3TOFA 1BDLA 1EBWA 5OYSA 1PSNA 5P2CA 3PBZA 2ZGAA 5P3NA 3VG1A 1MTRA 5P3PA 2ZJNA 5P6SA 1GVUA 1MVPA 1UH8A 5IVSA 1GNOA 3BUGA 4Y3HA 4I8ZA 1LYBA 2PH6A 4B72A 2OHUA 3OUCA 4B1CA 3C9XA 5DGUA 4Y45A 2Q63A 5P1WA 4CPTA 3HW1A 3OU1B 5P7NA 1HTFA 5P5CA 3LZYA 2UY0A 1HPSA 4J0ZA 5P8FA 2FXEA 4J0VA 5P6PA 5P1MA 3OU4B 5P26A 5P51A 2FNTA 1HVIA 3K5GA 5P1SA 3SO9A 1K6CA 1RPIA 2G22A 5P2VA 2HM1A 3NU4A 5P85A 1B6JA 2PC0A 5P39A 5P37A 2R43A 3LZSA 4Y53A 2G1YA 2P83A 5P5PA 2ZHVA 5P7AA 1FKNA 2P3AA 5SXNA 3BXRA 2VJ6A 5HD0A 3PB5A 5OZ6A 5P4ZA 1UPJA 2WL0A 4I0FA 2XYFA 3KT2A 5HU0A 5AGZA 3NLSA 5DQ1A 3OXXA 1BXQA 3QP0A 1AAQA 3UCBA 3LNKA 3NDXA 1HHPA 5P3WA 1W6IA 5P2EA 2AOIA 1BWBA 1Q9PA 1A8GA 5AH8A 5P10A 5DR3A 3S8IA 2VJ7A 4HEGA 2G21A 4GJBA 1IBQA 3DUYA 4J1EA 3DOXA 5P50A 3IGBA 1RQ9A 5P7YA 5OYTA 5BS4A 3L5BA 5P2QA 4Y36A 3FX5A 5P5VA 5P0OA 4FM7A 1HPOA 2QU2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P0Q A;  4R91 A;  5P7R A;  4Y9W A;  5DR1 A;  4S1G A;  5P6K A;  2HPE A;  4TVH A;  4J17 A;  3EKW A;  3BGC A;  3IA9 A;  4YOA A;  5OZH A;  1HTG A;  3LZV A;  4PEP A;  2Q15 A;  3NDT A;  2NNK A;  4GJ9 A;  3VFA A;  3TPR A;  4K8S A;  5P6J A;  2WF1 A;  4M8Y A;  1G35 A;  4PZX A;  4AA8 A;  4U8W A;  1ME6 A;  5P1B A;  2A1E A;  5P1A A;  5P7S A;  5P4H A;  5P59 A;  3OHF A;  5P18 A;  4MC1 A;  5P73 A;  1FQ4 A;  3D91 A;  5P7G A;  1BDR A;  2RKG A;  3VYF A;  4FL8 A;  2WHH A;  4Y3M A;  5P2X A;  5P8H A;  1EPM E;  4Y44 A;  4PPH A;  5P38 A;  2NXL A;  3KDC A;  1HIV A;  3RTH A;  5I70 A;  3LIQ A;  5P1V A;  5P4S A;  2BPZ A;  1SDU A;  4J0Y A;  3DJK A;  5ENM A;  5P3F A;  5P6L A;  5P22 A;  3Q6Y A;  3HAW A;  4FM6 A;  3KFN A;  5P71 A;  2QNP A;  5P0M A;  1SH9 A;  2FMB A;  2AVQ A;  2R3W A;  5HDZ A;  1AM5 A;  1IZH A;  4Z50 A;  2RKF A;  4YOB A;  3NUJ A;  5P2R A;  4EJL A;  2QNQ A;  5P4Q A;  3FNS A;  4OBZ B;  2ZHU A;  5P33 A;  1GVV A;  2R38 A;  4NJU A;  3H5B A;  4YD7 A;  3CIB A;  1ER8 E;  4OBD A;  3PM4 A;  5DQ4 A;  5P32 A;  3LZU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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