4GJ9A

Crystal structure of renin in complex with gp055321 (compound 4)
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
338
structure length
333
Chain Sequence
LGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title A novel class of oral direct Renin inhibitors: highly potent 3,5-disubstituted piperidines bearing a tricyclic p3-p1 pharmacophore.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 333
sequence length 338
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2012-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4gj9A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4gj9A01
3NSHA 1LYBB 2WF3A 3S56A 1IIQA 1XE5A 1DIFA 2G1NA 2MIPA 2VIZA 3OOTA 4J0ZA 5P44A 5P86A 5P71A 3PCWA 3VCMA 3IVIA 4Y4EA 4DQFA 5P3KA 4QGIA 2ER0E 2XFKA 1B5FA 5P1YA 2VIEA 3VFBA 2ZJLA 1WKRA 1MTRA 3S54A 2I4XA 3D91A 3TOFA 1APVE 5P63A 5APRE 3WZ6A 4CPQA 2RENA 5P2DA 5P49A 3SABA 1XL5A 5OZSA 4JPEA 5P8KA 3K4VA 1HEGE 1T6EX 4Y3ZA 3BXRA 1HPVA 4A6BA 3GGUA 2P8HA 3URLA 3UF3A 1QBSA 1NPWA 3EM3A 3HVPA 2NMZA 5AH7A 4Y5CA 3CICA 5KQFA 5OZXA 3PVKA 5OZRA 5P7DA 2OHKA 4B70A 5P2JA 5P7SA 2BPWA 5P5NA 1FQ8A 4TVHA 4YCKA 1GVXA 5P6TA 3N4LA 1IZDA 5P34A 5OZUA 5P1BA 5P1QA 5OZ8A 5HE4A 1FF0C 2QI1A 3APRE 5OZKA 3SKGA 1LYBA 3EL9A 5P01A 4AZYA 3GI4A 5P14A 4I0HA 5P7YA 1F7AA 5P11A 5HCOA 3KN0A 5ER1E 4Y36A 5P6EA 4PHVA 5P6KA 1IVPA 5P17A 4EQ0A 5P1DA 2IKOA 5P3VA 1CPIA 3O9BA 1EPNE 1FEJC 1IVQA 5I3XA 2HS2A 5P7NA 4IVSA 3K5CA 3PWRA 4RYCA 2NNPA 1TCXA 4Y3HA 4F75A 2VIYA 5COOA 4B1CA 3DV1A 3TNEA 2QU3A 4DJXA 1K6CA 5P7IA 2ZGAA 4HDPA 4Q1WA 5P0RA 1EBYA 2F3EA 3H0BA 2B8LA 5P02A 3ZLQA 5HD0A 5P2SA 1RPIA 4FRIA 4Y48A 2PK5A 4R95A 2A4FA 1EAGA 1MIQA 4GJBA 1LYAB 1K1UA 2BPVA 1QRPE 3KDBA 4YBFA 4RVXA 3SA3A 4QJ7A 1SBGA 3KFPA 5P67A 5P6JA 5P3DA 5I70A 1D4KA 4Z4XA 2O4LA 4D89A 4FRJA 3LZVA 4Y5AA 5P0UA 3HW1A 4KUPA 2FMBA 4YA8A 5P00A 3PSUA 1UH8A 2HB4A 2JXRA 2AODA 4EXGA 4DJOA 2J9JB 4HA5A 3L3AA 4M8XA 5P6AA 3OUCA 5C9BA 2SAMA 1ODWA 3DM6A 1T6GA 2Q55A 3OQFA 4OBJA 5P24A 5P0SA 1D4LA 3VV8A 1TSQA 1TSUA 5P1AA 5BRYA 1K1TA 3QI1A 4Y3RA 3PCZA 5P4EA 4ACXA 3OXWA 3TPJA 3RU1A 3BGCA 3NU6A 4Y5NA 1MPPA 4YBIA 4H3FA 5P55A 2AZBA 2OHNA 5P7OA 5P4LA 2AOCA 2QK5A 5I3VA 2WEZA 1B6LA 4AA9A 1YTIA 3CKPA 5P64A 2G21A 3DV5A 2WF0A 1APWE 2RKFA 3LIQA 5E5KA 3JVWA 3OAGB 3OU1A 3I25A 5P1XA 3OQDA 2ZJKA 3UDQA 3EBZA 1RL8A 3FX5A 1SDTA 5P6FA 1AJXA 1MT7A 1FMXA 2PWCA 2V16C 5OZMA 2BB9A 2QHZA 5P5QA 3Q5HA 1MVPA 3MXEA 1HPSA 3VYDA 5P5VA 3PLLA 2VJ9A 1SGUA 2I4VA 2J9JA 1BV7A 4Y5MA 5P3LA 3VF7A 2ASIA 4ZSQA 3VEUA 5HU1A 5UPJA 2QCIA 5P30A 2AIDA 2QI4A 3SA4A 4RLDA 2PK6A 4Y5EA 1F34A 1HHPA 5KR8A 4XX4A 5P8CA 5P05A 1YTHA 4I8WA 4JP9A 5P3CA 4J5JA 3VFAA 1U8GA 5F00A 4YE3A 5P8QA 5P0QA 3ZKNA 3BC4A 4DVFA 3D1YA 3LIYA 4Y3AA 3K5GA 4DJVA 3G70A 1AVFA 3IA9A 4L7JA 3HDKA 3S53A 4Y5LA 3MSLA 2ZJHA 2AOEA 6UPJA 5HVPA 5P4BA 4CPXA 4K8SA 1OEWA 2HIZA 4FRKA 3EL0A 4Y51A 5P5MA 4Y4XA 3IXOA 4I0ZA 3UQUA 3PI5A 2R9BA 2NXMA 5C9DA 1EC3A 3OGPA 3UDHA 1LZQA 1EC1A 5P6GA 5P39A 2G26A 2HM1A 2R5PA 2I0DA 1XE6A 4OBHA 1TZSA 4KE0A 5P2ZA 5P1JA 2VJ7A 2WF2A 5P32A 4F74A 4GJCA 1T7IA 2ANLA 2ZHSA 3NWQA 3L5EA 3U6AA 4Z50A 2G27A 5P1VA 5P5DA 3S8IA 1GKTA 2FIVA 1SDVA 5P7WA 4KE1A 5P8DA 1FQ4A 5B18A 3OY4A 4COEA 1ME6A 1LYWA 4Y3FA 4NJTA 5ENMA 4H3JA 5CONA 5ENKA 3GGAA 5P1CA 1D4SA 1ZP8A 5OZ1A 2PSVA 4FM8A 5P7ZA 5P7LA 3WZ7A 4F73A 3OXXA 1VIKA 2P3BB 4FAFA 3NUJA 4Y4JA 5ISKA 2V12C 2PSGA 5P1UA 1LS5A 2R5QA 3U71A 3CMSA 3UDNA 5OYXA 2WEAA 5I3WA 3FNSA 5OYTA 3K4VC 2RMPA 1XN2A 4QLHA 5P73A 3OU3A 5KQZA 3OWNA 5COPA 4I0JA 5P7BA 4LXMA 4B1DA 1BAIA 1A94A 4J0VA 2QNNA 3QVIA 2VA5A 4U8WA 3TLHA 3UDKA 5P51A 3QAAA 1LV1A 3SM1A 3NU4A 5P6IA 5IVQA 1HOSA 1META 1ZPKA 4Y35A 3BUFA 5P3NA 3ST5A 4FAEA 1GNNA 2JJIA 3R0WA 1W6HA 3PM4A 4Q5MA 2WF1A 4DJQA 1M0BA 5P53A 2G69A 2A1EA 3T7XA 5P1EA 3PMYA 3UHLA 1FGCC 4OD9B 5OZZA 2RKGA 3R0YA 5DR4A 1OHRA 5HDUA 1E82E 5P6WA 5P8FA 1W6IA 5OZCA 3UFNA 4Y3WA 2AOIA 4GYEA 4ZPEA 2ZE1A 5P3YA 4I8ZA 2QU2A 5P61A 4F76A 1SP5A 3EKPA 5P2YA 5P81A 5OZAA 2P3BA 5P6YA 4QJ9A 1BVGA 3NU9A 4GMIA 5OZYA 5P3IA 1LF2A 3IVHA 5P88A 4XKXA 5OZJA 4ZEAA 1QBRA 1BWBA 1B5FB 3HAUA 4FIVA 5AHCA 5P6VA 1W51A 4J55A 4QJAA 2QZLA 4Y4GA 5P0KA 3T6IA 5P26A 5OYUA 3FNTA 1K2BA 5P5SA 3QPJA 4DQHA 3ZKGA 4Q1XA 2AQUA 2O4PA 2UY0A 3LHGA 4MC1A 2G1SA 4Y45A 4Y54A 3SFCA 3KMYA 4U7VA 5KR2A 1Z1HA 5JODA 3KMXA 3D1ZA 2AZ8A 5DR7A 3DCRA 4D88A 4EJ8A 3QBHA 2QI5A 2ZHUA 5P5PA 2VIJA 3KM4A 2IDWA 2I1AA 1EC0A 2Z4OA 1EC2A 4MC9A 2VA7A 4OD9A 5E5JA 4H1EA 5DR1A 3EM6A 2QMGA 2P3CA 5P4IA 4L6BA 2Q63A 3PI0A 5P6BA 5P15A 5P80A 3OUBA 1DW6C 3ZMGA 5P5IA 1SMEA 3TPPA 5OZ6A 4FSEA 2NMYA 4HDBA 6APRE 5P0EA 4K9HA 5P6NA 1G2KA 1T7KA 1B6KA 4GIDA 5P2XA 3EC0A 4WTUA 2BBBA 1BDRA 2QI3A 1UH9A 1FG6C 2NXDA 4EHCA 4OC6A 1HTEA 5P22A 1ODYA 5P4RA 1TQFA 3OU4B 4X2LA 1LF3A 5HDXA 5P8TA 4U7QA 4TRZA 4EYRA 3AUPA 5DQCA 4YDGA 5KOQA 1BXOA 4R92A 3M9FA 4Y3JA 1HBVA 2XFIA 5P59A 4LXKA 3IAWA 3G6ZA 5P6HA 5P0LA 5P83A 4DQBA 2QNQA 1NH0A 1KJFA 1FB7A 2V10C 3BUGA 5P6OA 3HLOA 5P52A 1EPPE 5P3HA 2OHLA 1GVTA 5P20A 3G72A 1D4YA 3TKGA 4Y3QA 1UPJA 4CKUA 1N49A 2QMFA 3O9DA 3GW5A 5OZ5A 5P62A 3O9EA 5P1NA 4MC6A 5P0CA 1CMSA 2OAHA 1EPRE 4YD7A 3SPKA 5SXNA 3O9GA 4BEKA 5P6XA 1G35A 4I0EA 4L7HA 4Y4DA 4R93A 1BV9A 1ZAPA 5AHBA 1C6ZA 4Y4ZA 2ER7E 3EKYA 5P2WA 3KT2A 4XX3A 3UQXA 2IKUA 3NUOA 2IQGA 3EKQA 3KFRA 2P3AA 5AHAA 5P3FA 5P1RA 3INEA 4ZLSA 4K4RA 3GGXA 3OU4A 3OXVA 1LF4A 5P82A 5P8OA 2I4DA 1ENTE 3TL9A 2IENA 4GJ7A 3O9HA 4ZSRA 4Y4TA 4FM6A 4Y3GA 2OHPA 5OZIA 5P1OA 1HTFA 2J9KA 5P6UA 4DFGA 4Y5GA 3QVCA 3FSMA 2XYFA 4EP3A 2VNMA 2BQVA 5P2NA 1FQ5A 2JJJA 5P0ZA 4LP9A 4GJ5A 3RTMA 5P5RA 1HVLA 5P2AA 1BIMA 1AJVA 1BILA 3GGVA 4HE9A 3HZCA 2WHHA 3FV3A 4YDFA 5DGUA 4YHQA 3L5FA 1PPME 3ZKIA 4EJLA 1FKNA 3WSJA 3LINA 5P50A 5HCTA 2JE4A 2O4SA 5IE1A 1HPXA 3OU1B 3VSWA 4RCEA 5P4ZA 3OTYA 1K6VA 3VYEA 5I3YA 5P7PA 3K5DA 1HIIA 4Y4WA 4A4QA 3JW2A 5OZGA 2IL2A 5P79A 1EBWA 4LAPA 1GNOA 1HVCA 2AOFA 2WJOA 5P2MA 3PGIA 2ZJJA 3UDPA 1DAZC 3OUAA 2NNKA 3I7EA 3SA6A 2FXDA 5P8NA 1QS8A 4B0QA 5P31A 4DPFA 3ZKQA 2B8VA 5P7FA 5OYSA 5P42A 5OYWA 5P3JA 1EPQE 5OZWA 2NXLA 1B11A 2G94A 3KT5A 4PPHA 4EP2A 5AH9A 3VLBA 3EXOA 2O4KA 4OBFA 4Y3TA 5P0GA 3AIDA 1YM2A 5P27A 1MESA 5P46A 1CZIE 5P4PA 5P1ZA 1K6PA 2ZJMA 3ZPUA 3K5FA 5P54A 2B60A 3ZL7A 4GJ8A 9HVPA 5P3RA 1K6TA 4J0YA 4CP7A 1PSOE 4JPCA 1MUIA 4Y57A 4PZXA 2NR6A 4GB2A 5P4JA 2ZHRA 3EKWA 5P5EA 3UFLA 3NR6A 2I4UA 2O40A 5HU0A 4YCTA 5P6SA 3A2OA 5P13A 3VV6A 2PQZA 3VYFA 4RRNA 1IZIA 3NXNA 4Y3DA 3BVAA 5IVRA 1HVRA 4D85A 5IVTA 5OZTA 3TPRA 1A9MA 3NWXA 5P7UA 2QD7A 5P10A 3R2FA 2HB2A 5P0HA 4FRSA 1HEFE 5P60A 5P4NA 3L5CA 1Z1RA 4ZSPA 3OUDB 5P3MA 5P1TA 4H3GA 5P1PA 2VNNA 5J25A 4NPUA 1LYWB 4GJ6A 2V0ZC 1D4IA 2R3TA 2QNPA 5P08A 1YT9A 1MRWA 4OBGA 2FNTA 5P8LA 2NPHA 5DQ5A 4FGXA 5P77A 3ZKSA 5P2HA 4B72A 2AZCA 4ZE6A 1ER8E 1A30A 4Y39A 4FLGA 1BDQA 5P3AA 4I1CA 4ZPFA 5P2RA 5P7JA 4CMSA 5OZNA 3TOGA 4ER2E 5P0TA 5T4SA 5KR0A 3R1GB 2CEMA 5JG1A 5P25A 2Q15A 4LC7A 5DR3A 3H5BA 5P28A 4LBTA 5KAOA 1AZ5A 5P23A 2ZYEA 5P1LA 1SGZA 5P5JA 1D4JA 2F3KA 2FGUA 3UQPA 3RTNA 4Y38A 5P75A 4EQJA 4NPTA 1LEEA 1ZSRA 4Y3NA 3SACA 1ODXA 3B7VA 3CIBA 5P07A 1HTGA 3EMYA 2V13A 2OHQA 1T3RA 5P5KA 4J1KA 5P3EA 5P0OA 1W5XA 3T7PA 4DUSA 2HPFA 1OEXA 3I8WA 5P2LA 1XN3A 5DR0A 2AVVA 3LPJA 4LHHA 2HB3A 5P0JA 3OUDA 4ER4E 4A6CA 4NJUA 5P72A 3ECGA 1QDMA 2FNSA 2CENA 4RGHA 5P47A 3VF3A 2UXZA 4Q1YA 1E5OE 3HAWA 1XDHA 1G6LA 4FSLA 4QJ2A 4TVGA 2AOHA 5P8HA 4EXHA 4Y53A 4J0PA 2APRA 5DGWA 4EJDA 4NJVA 3ER5E 2XYEA 4N00A 1HIHA 3IN4A 4GZFA 5P6PA 5P8JA 5P8AA 5P5ZA 2QI0A 3OGQA 1KZKA 5BWYA 4CPTA 2F81A 1FQ7A 3UPJA 2Q3KA 3OQKA 2AVSA 5P1IA 3HBOA 5ER2E 4LL3A 5P41A 5P2VA 1E80E 4B1EA 2PC0A 5P2OA 3FIVA 4CPWA 5TOLA 3CKTA 5P2UA 1MSMA 1BXQA 4TRWA 3IXKA 3MSKA 4HLAA 4CPSA 5P66A 5P87A 5P76A 4J1HA 1DP5A 1EEDP 2Q64A 5AH6A 4X7IA 5P8RA 1HVJA 3Q4BA 5P5UA 1JLDA 1FFIC 3UDMA 2R8NA 5P0DA 3TTPA 4Y4UA 2G1YA 4AA8A 1PSAA 2RSPA 1KJGA 1VIJA 5P19A 1PROA 4Y47A 2OHTA 5OZ9A 4J1IA 6FIVA 3LZUA 2VS2A 5IS4A 4J1EA 1GVUA 5DPZA 2O4NA 2P3DA 3L5BA 2VKMA 5P7RA 1IDAA 5KR1A 5P0MA 3WZ8A 5HDZA 2G24A 1EBKC 1W50A 5P7MA 5P2KA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3NSH A;  1LYB B;  2WF3 A;  3S56 A;  1IIQ A;  1XE5 A;  1DIF A;  2G1N A;  2MIP A;  2VIZ A;  3OOT A;  4J0Z A;  5P44 A;  5P86 A;  5P71 A;  3PCW A;  3VCM A;  3IVI A;  4Y4E A;  4DQF A;  5P3K A;  4QGI A;  2ER0 E;  2XFK A;  1B5F A;  5P1Y A;  2VIE A;  3VFB A;  2ZJL A;  1WKR A;  1MTR A;  3S54 A;  2I4X A;  3D91 A;  3TOF A;  1APV E;  5P63 A;  5APR E;  3WZ6 A;  4CPQ A;  2REN A;  5P2D A;  5P49 A;  3SAB A;  1XL5 A;  5OZS A;  4JPE A;  5P8K A;  3K4V A;  1HEG E;  1T6E X;  4Y3Z A;  3BXR A;  1HPV A;  4A6B A;  3GGU A;  2P8H A;  3URL A;  3UF3 A;  1QBS A;  1NPW A;  3EM3 A;  3HVP A;  2NMZ A;  5AH7 A;  4Y5C A;  3CIC A;  5KQF A;  5OZX A;  3PVK A;  5OZR A;  5P7D A;  2OHK A;  4B70 A;  5P2J A;  5P7S A;  2BPW A;  5P5N A;  1FQ8 A;  4TVH A;  4YCK A;  1GVX A;  5P6T A;  3N4L A;  1IZD A;  5P34 A;  5OZU A;  5P1B A;  5P1Q A;  5OZ8 A;  5HE4 A;  1FF0 C;  2QI1 A;  3APR E;  5OZK A;  3SKG A;  1LYB A;  3EL9 A;  5P01 A;  4AZY A;  3GI4 A;  5P14 A;  4I0H A;  5P7Y A;  1F7A A;  5P11 A;  5HCO A;  3KN0 A;  5ER1 E;  4Y36 A;  5P6E A;  4PHV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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