4GJAA

Crystal structure of renin in complex with nvp-ayl747 (compound 5)
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
340
structure length
337
Chain Sequence
LTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title A novel class of oral direct Renin inhibitors: highly potent 3,5-disubstituted piperidines bearing a tricyclic p3-p1 pharmacophore.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 89
structure length 337
sequence length 340
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2012-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4gjaA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4gjaA01
4GJ8A 5P18A 4I0IA 4ZEAA 1Z8CA 3T6IA 4GJBA 2QHZA 2G27A 2OHNA 5HTZA 1BILA 2QD7A 2PWCA 1YX9A 3EKWA 5P2IA 5KOSA 3EKTA 3KDCA 5ENMA 4PPHA 5P7QA 2B7FA 2UPJA 1YT9A 5P2ZA 5AHAA 3U71A 2I4VA 3EKYA 2NR6A 2FDDA 1MTBA 1K2CA 5OZMA 5OYZA 4BFBA 5P1QA 5P1ZA 2VS2A 1FKNA 1B11A 4DI2A 3VF3A 4DQGA 5P0MA 4ZIPA 7UPJA 5P1MA 3WZ8A 3HAWA 2FIVA 5P3BA 5P43A 5P5LA 5KR0A 5BWYA 5I3VA 1IDBA 1K6CA 1SP5A 2Q63A 3BUFA 4Y6MA 3UPJA 3D1XA 1MERA 3RTNA 5P26A 3ER5E 3S2OA 5DR0A 5OYYA 3PM4A 1SGUA 2NNKA 2J9KA 4GJ7A 2B8VA 4Y3SA 4OBZB 1NPVA 1OEWA 5OZGA 1J71A 1DW6C 3OQFA 4QJAA 4Q1WA 4YHQA 1LS5A 1ZTZA 3DV1A 4J17A 2HS2A 3M9FA 1IZDA 6FIVA 3LZYA 3DCRA 3TL9A 4QGIA 3SABA 1EPLE 5P8CA 4DH6A 4XX4A 4RVXA 2V11C 2I0AA 3NXNA 3K5GA 1HSGA 5P2OA 5KQYA 4Y5MA 2AZ8A 5P8KA 3PWRA 4DQFA 3I25A 4X2LA 4IVSA 3OTYA 1IBQA 3PGIA 1RPIA 1XL5A 5P4KA 2NMZA 3C9XA 4KE1A 4MC9A 3U6AA 4RCFA 2OHRA 5HDXA 2OHPA 3EXOA 3MXEA 4R8YA 3L38A 5P37A 4TRWA 5OYXA 4DV9A 5HU0A 2WECA 3QP0A 5P4WA 5P3XA 3IN4A 3UFLA 4H1EA 5DR3A 4B1EA 5DR4A 2HPFA 5OZNA 3QS1A 2HC0A 5OZLA 5P2VA 3URLA 5P6WA 1YTHA 5P2QA 5P6BA 4B0QA 5AGZA 1CPIA 1EC2A 4L7GA 1HIIA 1TSUA 3VSXA 5P4LA 2V13A 3OU4B 5P4CA 5P6RA 1M4HA 5P12A 1T6GA 1EPOE 4GZFA 1HOSA 3Q4BA 4Y5EA 3PWWA 2G1YA 3NSHA 5I70A 4Y5BA 3QIHA 3LIZA 2B42A 5P1VA 1B6LA 2QZKA 1AJXA 5P64A 3PWMA 1BDRA 3S43A 1FQ5A 4FM6A 5P0KA 5P14A 4GJDA 5P5UA 3BGCA 5P7YA 4YD5A 2IENA 1GNMA 4M8YA 2F8GA 4R93A 5P6JA 1LEEA 4RYCA 4A6CA 4D88A 4AA8A 5P4QA 3L58A 1AJVA 5P34A 2R38A 2QNPA 5KQFA 3SLZA 4MC1A 4NJVA 4RCDA 5P47A 3ZMGA 3VV7A 4AMTA 4LXKA 5IS4A 3BUHA 1ZSRA 5ISJA 4EJKA 2G1SA 4Y4JA 2B8LA 3PSGA 4FM7A 1N49A 3R0YA 5P42A 2I4DA 5PEPA 5P36A 4QLHA 5P1UA 1E82E 8HVPA 5P6CA 3EBZA 5COKA 1SH9A 4Y44A 3WZ6A 1FG8C 1HTEA 4J1EA 5P0EA 5P2DA 3LINA 4I0FA 3TPRA 5OZ5A 4FRJA 4J55A 1QDMA 2AOIA 5P61A 4WY6A 3B80A 2WF0A 4YDFA 3TKGA 1TSQA 5P8NA 5DPZA 3NWQA 3NXEA 5P4RA 5P5NA 3SA8A 2I4QA 4Y3HA 1SMEA 5P3GA 1ZSFA 3SKGA 2F3KA 3CIBA 2P83A 5P1NA 4F75A 5IVSA 4Y3GA 5P7WA 5P1KA 3FX5A 3UHLA 4OBKA 3ZKXA 1BVGA 2UY0A 5P51A 5JFUA 4EP3A 3LPIA 5P06A 5C9DA 3K4VA 5P0XA 4Y4DA 1C70A 4CPXA 2BKTA 4D83A 3FSMA 4Z50A 2PWRA 5P4EA 4QJ2A 4Y5KA 3O9AA 5P2CA 4OD9A 2G26A 5P0PA 2P3BB 5P5RA 4Q1XA 2UXZA 1APTE 1FQ7A 3VF5A 2OHSA 2XFIA 3GI0A 5P4GA 4YD3A 1ZJ7A 2ZHSA 2ZE1A 2QHCA 1W5VA 5P3EA 5P4ZA 3CKRA 5P7AA 1Z1RA 5P1SA 5JFPA 2I0DA 5OZBA 1HPOA 5P2BA 5HDUA 3URJA 5SXNA 5P8LA 2WEZA 3OU3A 1XN3A 4JOOA 3QI1A 5P81A 4DJPA 4Y54A 5P3NA 2Q11A 4L7HA 4LC7A 5P3YA 5OZUA 4HDPA 4Y4ZA 4ZSRA 4Y37A 5P8HA 1T7KA 3KN0A 2I4WA 3QAAA 4YD4A 5KOQA 1HVIA 1BVEA 2PH6A 3T7PA 3QRSA 5P75A 5JG1A 3LIQA 3SAAA 2VJ9A 4J0YA 1FFFC 2PC0A 3LIVA 4B00A 4AZYA 5AH9A 4I0DA 3VSWA 3KFPA 1SGZA 3VV8A 2BPZA 4BEKA 4K4PA 3UDHA 3KF0A 3LHGA 3UQRA 4I11A 4L6BA 4JPEA 4H3FA 4D89A 1ER8E 2HM1A 4B78A 3R1GB 3MXDA 3O9LA 1GVUA 4D8CA 2SAMA 3K5FA 5P44A 4Z4XA 1KJGA 4Y3YA 1QBTA 3O9BA 1A8KA 1GVVA 5P5JA 3GI6A 1MIQA 3VUCA 4JPCA 1HVLA 4XX3A 3KFRA 2ZJHA 2FLEA 4CMSA 5F01A 3L5FA 4B1CA 3S56A 4ER2E 3EL1A 4Y3QA 5P4FA 5E5JA 5P84A 1HTRB 4MC6A 2Z54A 3NDWA 4Z2ZA 2HPEA 4XKXA 2VA7A 3IXOA 5P0HA 4I0GA 2P4JA 5COPA 3OGQA 1E5OE 4GYEA 4OD9B 3D20A 2QI0A 1HPSA 5P17A 5P5EA 4ACXA 4DFGA 5COOA 3D1ZA 5P78A 5OZ0A 2WF3A 4I12A 1MPPA 2OHTA 3RSXA 5P60A 6APRE 3GGVA 3QVIA 3SA3A 3PHVA 3KMXA 1Z1HA 5P28A 4CPRA 5P1AA 1EPRE 3SKFA 1LYBA 4EQJA 5KAOA 2R9BA 2ER6E 2G1NA 4J1FA 2G94A 2PSUA 3PI5A 3OXWA 5DQCA 1JLDA 1IVPA 1LF2A 1BDLA 3GW5A 4J1CA 3OUDB 5HCOA 4Y3TA 2FDPA 4F76A 5P77A 5P4YA 1FEJC 2AVVA 5P6GA 5P4JA 4Y58A 3NLSA 5P0RA 3FNUA 4JP9A 1PSNA 1D4SA 5P86A 5KR1A 3MSJA 1HSIA 9HVPA 3SM1A 4ZSMA 4B70A 1MTRA 3EMYA 4B05A 3PBDA 4CKUA 4Y3FA 3UTLA 2NXLA 5P0OA 5P22A 4DPFA 5P46A 2APRA 2G20A 5P1BA 3VEUA 2CEJA 4PZWA 5P0DA 4QJ7A 1M0BA 4ZE6A 2I4UA 5C9BA 5P8EA 2QZXA 5P7NA 1EBWA 5P8SA 4Y48A 5P88A 5P3TA 1AZ5A 3PVKA 3DM6A 3NU6A 2G21A 2WEDA 1LYWB 5P04A 1HPXA 5P20A 5KQZA 1TCWA 3O9LB 4M8XA 5P02A 5P6IA 4APRE 3Q3TA 5OZHA 1FLHA 2OAHA 4BFDA 4GJAA 4Y4EA 5OZKA 5TOLA 5P7OA 5OZXA 3OAGB 3CYXA 1UH9A 4GB2A 2ZJKA 2WF2A 5DQ5A 5P50A 4HA5A 3N4LA 2JJIA 3TNEA 3IA9A 5HCTA 1B6KA 2BQVA 1F34A 2PSGA 2H6SA 5OZFA 5P32A 2G1RA 1ZPAA 4CPSA 2NNPA 4OC6B 5P1HA 5P8UA 1ODWA 5ER1E 4Y3EA 5P83A 1D4IA 5DR8A 1HEFE 3L3AA 3OUCA 4EQ0A 4Y4BA 5OZWA 3HD8A 5P11A 4KUPA 3LNKA 2WJOA 3WB4A 5P10A 5P3UA 5P3OA 5P72A 1VIJA 5P3QA 4Y3PA 3HZCA 4GJCA 5P5XA 3EKPA 4Y3WA 5OZ6A 3CKTA 1EAGA 1FQXA 4B77A 2PH8A 5AH7A 5P5QA 5OZVA 1MEUA 3T7QA 3NDXA 1OEXA 5P01A 5OZRA 1FQ4A 2G69A 4Y3DA 2ER7E 4LAPA 5P3AA 3ZPSA 3K5DA 4HVPA 2O4SA 1MT9A 5P8AA 2ZHRA 1QRPE 5CONA 3EL9A 3Q70A 3VFAA 1NPWA 2HB3A 2VNMA 1MRXA 1E81E 1TZSA 3OQAA 5ENKA 5P5HA 4OBGA 3MSLA 5P23A 5OYUA 5OZTA 4Y3JA 1KJFA 3ZKGA 5P3PA 5EZXA 5P85A 4K4RA 4Y4AA 4Y5CA 4GMIA 1AIDA 4X7IA 5P2SA 5P4MA 1META 1EBZA 4EJ8A 1HPVA 2BJUA 4FCOA 3OQKA 5P2NA 5P39A 1CMSA 5P30A 3LZUA 4LXMA 5P1XA 2AZ9A 3QROA 2B60A 3SA5A 4DJVA 3SPKA 5P7RA 1ZAPA 4FM8A 3TH9A 3RVIA 5I3YA 1W6IA 3UQUA 4Y56A 4B72A 5IVTA 2IGXA 4YDGA 3IAWA 1W51A 2QP8A 5P0GA 5P8BA 5P1JA 4HDFA 4APEA 1WBKA 3TLHA 3OUAA 5P1IA 1GKTA 5P4PA 5P49A 5P5FA 3H0BA 1HIHA 2NMYA 3TPJA 4J0TA 5P5OA 1HTGA 4R95A 3ZOVA 4K4QA 4Y43A 5EZZA 5IE1A 2R8NA 3OHHA 3OQDA 4DJXA 3SA7A 4Q1YA 4FLGA 3TPPA 3MSKA 3KA2A 4Y41A 1XS7D 3HVGA 3NU9A 2VJ6A 3NR6A 2FGUA 2O4LA 2CEMA 3L5EA 1K2BA 4YCKA 5P2XA 2OHLA 5P7LA 1XE6A 1EC1A 3OOTA 5P62A 2FXEA 3G72A 5P2AA 4ZLSA 2AOHA 2QD6A 4YD7A 1G2KA 3QRVA 1QBSA 1KJHA 4L1AA 1ZP8A 3DCKA 1ENTE 3SFCA 1YTIA 1OHRA 4BELA 2Q64A 5P4HA 2B7ZA 5P6AA 2AZCA 2FNSA 5BRYA 2QMFA 1GNOA 1C6ZA 1ZPKA 1TQFA 2EWYA 5P0TA 3T7XA 3PCWA 5P56A 4ZSPA 4ZPFA 2PYNA 1KJ4A 2PK6A 4H3JA 5P0YA 1LV1A 4KB9A 1AVFA 5P3DA 2Q3KA 1HXWA 5P27A 5P1OA 1T3RA 1EEDP 3O99A 1WBMA 4CPQA 3G6ZA 1RQ9A 4DQEA 3TKWA 3L5CA 5P45A 3HLOA 2O4NA 3S45A 4RRNA 3A2OA 4Z22A 3QN8A 3LZSA 3EC0A 4QJ6A 1NSOA 5OZDA 7HVPA 1PSOE 2O4PA 2NTRA 5P1FA 1B5FA 1FQ8A 2ZHTA 3O9IA 5P07A 4R92A 2HS1A 5P6EA 2OHMA 4EHCA 3ZKSA 1RV7A 3URIA 3GI5A 2QK5A 5P1DA 2WL0A 4Y3XA 1XL2A 4J0VA 5P7DA 3PEPA 2AOJA 4JECA 3BXRA 2RENA 5P1LA 1HRNA 5DGUA 3SA9A 3IVIA 5HD0A 3R2FA 3AIDA 3FNTA 3DUYA 2JXRA 1HXBA 3O9GA 3OU1A 2BPWA 1YTGA 4YCYA 3BC4A 3JW2A 3K1WA 4B1DA 1SDTA 5P5WA 1W6HA 5P7VA 5P1TA 3O9CA 2HAHA 3BVBA 4OBDA 3GGXA 5P65A 2AVOA 4I10A 3S43B 5P2RA 4OBJA 5P4OA 2NXDA 5P71A 5FIVA 5P5KA 3ZL7A 3KT2A 4RRSA 4K9HA 2H6TA 5P0UA 4PZXA 5P0AA 4DQBA 4YOBA 5P5TA 4N00A 3LIYA 3OHFA 4TVGA 5DR1A 5P4IA 4RROA 4EJDA 5P6VA 1MT7A 2IEOA 1LYAA 2XYEA 2Q55A 5P1PA 3EKVA 5P6UA 5P7XA 1MVPA 1BBSA 2WF4A 2WEBA 4Y3NA 2NPHA 4GJ6A 2BPYA 4EXGA 2VIJA 4GJ5A 3Q6YA 4Y9WA 1RNEA 3RTHA 3TPLA 1W50A 2QAKA 4ZSQA 4Y3MA 1U8GA 4EXHA 3INEA 1EPNE 2VKMA 3SM2A 2P3CA 5OZ4A 3ZPTA 1HVSA 1QBRA 3OXVA 5OZIA 5BS4A 5P0LA 4U7VA 1HVJA 4Y57A 2HIZA 2IKUA 3RSVA 2VJ7A 2AVSA 5SZ9A 3O9DA 1IZIA 1A30A 3NDUA 4Y4TA 4YA8A 5P5MA 3HAUA 5OZJA 4CPTA 5P7CA 5P6OA 5P8QA 5P6KA 4NPTA 1C6XA 4R91A 1UPJA 3OXXA 5P2GA 3PB5A 3ECGA 3FIVA 3PJ6A 3I8WA 4WTUA 2RKGA 3HBOA 4GIDA 1BDQA 3IXKA 1SMRA 3TOFA 1KZKA 1K6TA 2XYFA 4EPJA 4NJTA 5AHCA 5P70A 4EYRA 3K4VC 2F80A 1SIPA 1NPAA 5P8MA 2VA6A 1HVCA 5P15A 2IDWA 4YBIA 5OZ1A 3HDKA 3OGPA 1XN2A 5P1WA 4I0EA 3IVHA 4HE9A 5P7SA 5P4BA 1TW7A 5P16A 1G6LA 5P6NA 5KR2A 2VIEA 3O9EA 4Y50A 2A1EA 1SIVA 3D1YA 1PROA 4Y5PA 4TRYA 2ZJLA 3SQFA 2AODA 5DQ1A 5P3FA 5C9FA 2NXMA 1QBUA 4Y39A 5UPJA 1DMPA 1EPPE 4CPWA 5OZSA 3QRMA 5OZ9A 2Q54A 4YE3A 5P58A 3UDMA 1M43A 5P54A 5P55A 1LZQA 2ZHUA 4AA9A 2QHYA 5ER2E 1BWAA 3R4BA 4GJ9A 3NYGA 1HHPA 4COEA 5P82A 1YG9A 3LPKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4GJ8 A;  5P18 A;  4I0I A;  4ZEA A;  1Z8C A;  3T6I A;  4GJB A;  2QHZ A;  2G27 A;  2OHN A;  5HTZ A;  1BIL A;  2QD7 A;  2PWC A;  1YX9 A;  3EKW A;  5P2I A;  5KOS A;  3EKT A;  3KDC A;  5ENM A;  4PPH A;  5P7Q A;  2B7F A;  2UPJ A;  1YT9 A;  5P2Z A;  5AHA A;  3U71 A;  2I4V A;  3EKY A;  2NR6 A;  2FDD A;  1MTB A;  1K2C A;  5OZM A;  5OYZ A;  4BFB A;  5P1Q A;  5P1Z A;  2VS2 A;  1FKN A;  1B11 A;  4DI2 A;  3VF3 A;  4DQG A;  5P0M A;  4ZIP A;  7UPJ A;  5P1M A;  3WZ8 A;  3HAW A;  2FIV A;  5P3B A;  5P43 A;  5P5L A;  5KR0 A;  5BWY A;  5I3V A;  1IDB A;  1K6C A;  1SP5 A;  2Q63 A;  3BUF A;  4Y6M A;  3UPJ A;  3D1X A;  1MER A;  3RTN A;  5P26 A;  3ER5 E;  3S2O A;  5DR0 A;  5OYY A;  3PM4 A;  1SGU A;  2NNK A;  2J9K A;  4GJ7 A;  2B8V A;  4Y3S A;  4OBZ B;  1NPV A;  1OEW A;  5OZG A;  1J71 A;  1DW6 C;  3OQF A;  4QJA A;  4Q1W A;  4YHQ A;  1LS5 A;  1ZTZ A;  3DV1 A;  4J17 A;  2HS2 A;  3M9F A;  1IZD A;  6FIV A;  3LZY A;  3DCR A;  3TL9 A;  4QGI A;  3SAB A;  1EPL E;  5P8C A;  4DH6 A;  4XX4 A;  4RVX A;  2V11 C;  2I0A A;  3NXN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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