4GJDA

Crystal structure of renin in complex with nvp-bgq311 (compound 12)
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
339
structure length
335
Chain Sequence
TLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title A novel class of oral direct Renin inhibitors: highly potent 3,5-disubstituted piperidines bearing a tricyclic p3-p1 pharmacophore.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 335
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2012-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4gjdA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4gjdA01
4I0ZA 3SKFA 2Q63A 1EPLE 4GJ7A 3PBZA 4Y4DA 1HTEA 5P8SA 3VF5A 5COKA 3GI6A 4LXMA 3KFNA 1EBWA 4HA5A 4J1HA 5P49A 5P68A 1HSGA 2O4KA 4HVPA 1D4SA 5P1JA 1OHRA 4Y47A 3EL0A 2WF3A 3QI1A 5P2EA 1FB7A 1GVWA 2FNTA 1EAGA 4J1IA 2B8LA 4GJAA 3PI0A 4DQCA 1ENTE 4FRIA 5HU0A 1WBKA 5P5OA 1BDRA 3PWMA 2AOHA 5P7UA 5P42A 4LHHA 1F34A 3O9LB 2UXZA 5P6XA 3OU4A 1GVUA 1MESA 3FSMA 4Y57A 1TCXA 1WBMA 2FLEA 1DIFA 3ER5E 2QD7A 1VIKA 4Z22A 4Y4JA 3VV7A 1FG8C 5C9BA 4LP9A 3R2FA 1E81E 5OYUA 5P3JA 4QJ9A 1B6PA 5P1YA 2V00A 1HPVA 1MT8A 2IKUA 4GB2A 3NDXA 5DGWA 5P3WA 2JXRA 4J0YA 1LV1A 3EL1A 2IQGA 3OQKA 5P3DA 1B6MA 5P0KA 4Y3YA 4I8WA 1HWRA 2J9KA 4OC6A 5P7BA 2FGUA 1AIDA 5OZLA 4DFGA 3DCRA 2QNNA 4Y4EA 1DAZC 5P2ZA 3U71A 1GNNA 1ZBGA 1W50A 2ZHTA 2PWRA 5P6PA 4OBZB 5P58A 3EKTA 1RQ9A 4TVGA 1IZIA 4Y3JA 3VLAA 3HAWA 5OYXA 3D20A 3LIXA 2V16C 5P28A 2B7ZA 4WY6A 5P1OA 5P2YA 1OEXA 5P74A 3NXNA 2APRA 5P3QA 4HLAA 3PSYA 3OK9A 5P6RA 4KE0A 1KJHA 5P16A 5P75A 2O40A 1RL8A 4RRNA 5P43A 3H0BA 3TOGA 5AHBA 2BJUA 5P0RA 5P1GA 4GJ9A 5P0SA 1FQ5A 5P4JA 4Y9WA 4I0EA 2G22A 5BWYA 4EWOA 4RZ1A 5P6DA 1YTHA 2WECA 4B00A 1HVRA 1HOSA 2O4PA 1PSAA 3FV3A 2Q55A 2V10C 4PZXA 5P1AA 1HVJA 5P2AA 5P29A 1B5FB 4Y39A 5P5WA 1EPQE 3TNEA 1UH7A 1GNMA 5P1XA 3URIA 5P73A 4FAFA 5IVTA 5P37A 2AVSA 1SMRA 5P7NA 1B6KA 3ST5A 3HLOA 3EL5A 5P2KA 4DQGA 2O4SA 5P52A 3UFNA 4J55A 3TKGA 2PH6A 5P4BA 5OZ0A 5OZIA 5P2RA 3UF3A 1FQXA 2OHTA 3K1WA 1TSUA 2F3KA 3LPKA 3NSHA 4RCDA 2CEMA 5P2TA 1UPJA 3PMUA 5I70A 4FL8A 5P6CA 1ZPAA 2V12C 3PJ6A 2PMAA 5OZUA 3S45A 1B11A 2IKOA 5P3OA 4Y5CA 4J0TA 5P6WA 1QBRA 3B80A 3OUDB 1EPME 3T7PA 3ZKXA 5OZCA 1Q9PA 3EKPA 4D85A 4DQHA 3N3IA 5OZHA 1HVCA 1FGCC 1SDVA 4Q1NA 3T11A 3EKVA 1HXWA 4LXKA 5P3HA 5P3LA 5P30A 3TH9A 3OWNA 3WZ8A 3QRVA 3Q6YA 2ZJHA 2CENA 1D4HA 5KOQA 3QVCA 3EKXA 5DQ5A 4JECA 3UDHA 4Z2ZA 3G6ZA 2WEDA 4DPIA 5P4FA 5P48A 2ZJMA 5HCTA 1LS5A 4YDGA 4I0HA 1T7IA 5P6KA 4TRYA 2IDWA 1TW7A 2WEBA 5P2CA 3HAUA 2NTRA 4GJ6A 4U8WA 3ZPTA 5DR4A 4GYEA 4FSLA 4K4RA 4FRSA 4FRJA 4H3GA 1GVTA 4EJLA 5P2NA 5I3WA 4Y3RA 4FIVA 4Y53A 4CPRA 1AZ5A 5P7AA 2G21A 4HEGA 1BDQA 4COEA 1A8GA 4I0GA 4DI2A 1A9MA 4YD4A 2QZXA 4ACXA 5P7GA 3OUAA 4WTUA 9HVPA 5CONA 2QHYA 4RVIA 3VV6A 2Z54A 2FIVA 1BAIA 2XFIA 3DCKA 1HTFA 5JFUA 3VF7A 1HSIA 2AIDA 1HTGA 3BHEA 5P0XA 5P2UA 1TQFA 2QMPA 5P3NA 5P0FA 3LZUA 1Z8CA 4K4QA 2P3AA 1IZEA 2RENA 3EMYA 4Y4GA 3SAAA 5P59A 1MUIA 5DR7A 5P54A 3F9QA 5OZYA 3BVBA 5P0QA 4HDFA 4GJBA 3UQPA 3EM3A 3O9DA 4EYRA 3GGAA 3JW2A 1GKTA 5P4YA 5P10A 3OQDA 2FDEA 3IA9A 5P3CA 1E82E 1LEEA 1EC3A 2QMFA 4F75A 3URJA 4U7VA 4I0JA 1AJVA 2G1YA 3RU1A 2I4WA 4ZPGA 1IZHA 4Y50A 3EKQA 4DUSA 4B0QA 2HS2A 3PB5A 1LYWA 4K8SA 1YG9A 4Y36A 4HDBA 2ZJKA 5P2WA 3L5CA 4YHQA 2R3WA 3OU4B 4Y44A 1HIVA 3DJKA 2NMZA 1FQ8A 3PBDA 2BPZA 1FKNA 5KR8A 2H6TA 3G70A 2R3TA 2VNNA 5P8TA 3ZL7A 5P7DA 1EC1A 3CIDA 3I6OA 3PMYA 5P5YA 1OEWA 4Y3LA 2BQVA 2XFKA 4IVSA 5BRYA 3BUHA 5I3XA 4FM6A 4OC6B 5P1HA 2HM1A 1IBQA 2OHSA 2HC0A 3ZKNA 1MT9A 4R95A 1BVEA 4Y3GA 2A4FA 3Q3TA 5DPZA 4FLGA 3MSJA 5P2JA 3S43A 4CPQA 1T7KA 5P85A 4Y56A 1GVVA 3OTYA 1XN2A 5OZXA 1BIMA 4NKKA 3SA5A 3OADB 4ZIPA 5P8VA 1W5VA 5IVRA 2ZHUA 4ER2E 5P23A 5P3ZA 3BXRA 4TVHA 1T7JA 5P72A 1EBKC 2WF0A 4AMTA 4YDFA 5JFPA 1CZIE 4FCOA 4K9HA 5P11A 3UDRA 4L7HA 2QZLA 4CPXA 3QIHA 2WF4A 5P4OA 1LYAB 5P7JA 3TOHA 1HPOA 4Y3MA 5P4RA 5P3AA 5P5TA 5P17A 4PPHA 1HVKA 2QI4A 2F3EA 4RGHA 5J25A 5DQ1A 3LITA 5P0GA 3FX5A 2IS0A 4Y3AA 2G69A 5KQYA 5P55A 5P6GA 4Y4UA 5AH8A 5P08A 5DR1A 1ZTZA 5P19A 2B60A 5P6LA 4Y3XA 5HVPA 4ZSMA 5P2SA 2QMGA 3PVKA 4JOOA 4YBFA 5P5AA 5P57A 1GVXA 4DJRA 3UDYA 4U7QA 4DVFA 2P4JA 5OYQA 3VFBA 4DQFA 2QCIA 5P5KA 3EBZA 2WL0A 5P5EA 3IXJA 5OZQA 4F76A 2WEZA 2QD6A 4OBDA 3L59A 5P26A 4EXHA 4Q1WA 3FIVA 2P3CA 1TSQA 4B70A 5P6VA 5P67A 3VF3A 5IS4A 1YTGA 1AM5A 4ZEAA 3OOTA 2V0ZC 5P09A 4Y3QA 5P1NA 1LYBA 4J1KA 4XX4A 5P1MA 5P4QA 3N4LA 4Y4TA 3KN0A 1D4IA 3UHLA 3NR6A 4ACUA 4DV9A 3ZOVA 1FG6C 3VEUA 4DJXA 1LF2A 5P0CA 1SDUA 2HPFA 4EP3A 2QP8A 4OD9A 3PSUA 5P8IA 2PYNA 5P04A 3VSXA 5P00A 4Y51A 2AZ9A 3I2LA 4F74A 5HDUA 5P5BA 2J9JA 3BRAA 5P0AA 5P3KA 8HVPA 2NMYA 2R9BA 4I8ZA 5HE5A 4RVJA 3OUCA 3EXOA 5P3PA 1NPWA 2AOFA 5P7KA 4Z50A 2P83A 3BGCA 5P79A 2ZHSA 5OYRA 2NR6A 3B7VA 2AOGA 5P4EA 4I0DA 5P24A 4B72A 3NU4A 4R5NA 2AZ8A 3FNUA 4CPSA 5OZFA 5P5GA 2PK6A 5P5ZA 1ZP8A 2BB9A 4FSEA 4Y37A 5P2XA 3OGQA 1BV9A 3VSWA 1FEJC 4TRWA 1ZAPA 4LAPA 5P6IA 2ZJJA 1YM2A 3ZMGA 5HDXA 4L1AA 3NDUA 5P1BA 1HRNA 5COPA 3QN8A 3R0WA 4QJ7A 4I11A 5OZOA 5P0WA 3R1GB 4DJUA 3DM6A 3MWSA 2Q15A 5P4XA 4YCYA 2ER0E 5P7PA 5UPJA 2AOJA 1MTRA 5P71A 3ZKQA 5P31A 5P40A 4B05A 5P7SA 1MVPA 4Y43A 2QNPA 3INDA 5P38A 2VIJA 1F7AA 4MC9A 4XX3A 2VA6A 3S56A 3SM2A 5P2LA 5P18A 4BFDA 3OXCA 3NDTA 4AZYA 5P06A 4CKUA 4DQBA 5P7LA 1A94A 5P5UA 2IL2A 3LIZA 2ASIA 4EXGA 5KR0A 2R8NA 4RYGA 5ENKA 5P35A 4R93A 3QS1A 3OAGA 1NPVA 3AIDA 5OZKA 3PEPA 4J54A 5P15A 3TPRA 4Y4BA 5P64A 3BUGA 4YD7A 3LZYA 5P6BA 4PYVA 5HCOA 3LPIA 3AUPA 1FF0C 2FDDA 3DOXA 3HW1A 3LZSA 3WSJA 3LZVA 1RPIA 3VV8A 1EBYA 1QBSA 5P20A 3QBFA 1D4LA 2G20A 3IVIA 5P0OA 4CPWA 4A6BA 4CMSA 2HIZA 5P6NA 1C6YA 3BGBA 1UH8A 2P3BB 3KF0A 1KJFA 1SGUA 1HXBA 2ER9E 3KDBA 1G6LA 1EC2A 3SA9A 5OZVA 4NJVA 3INHA 3JVWA 5P22A 1U8GA 5P4SA 1IVPA 4AA9A 5DQ4A 4FM7A 4NJSA 2F8GA 1QS8A 5P83A 5P3IA 5P7OA 1M43A 3PCWA 3UDQA 4B1EA 3VCMA 3PHVA 4FAEA 4YD6A 5P0BA 1MRWA 2B8VA 3PSGA 2B7FA 2QU3A 1D4YA 3JVYA 4Y38A 1E80E 2QU2A 5P7IA 3TKWA 1AVFA 2OHMA 1VIJA 2QNQA 5P2VA 5P6HA 1T3RA 3EL4A 3PLDA 1W6IA 4J1FA 5OYSA 2ZJIA 1KJGA 3C9XA 5OZ2A 1LZQA 4Y3HA 1W51A 5P1SA 4ER4E 2OHNA 1RV7A 5P62A 1MSMA 1DPJA 5P1QA 5SXNA 3IVHA 3VLBA 3LIVA 1MT7A 5OZMA 3QVIA 3ZLQA 1KJ7A 4OBGA 1ODXA 5P77A 4RROA 2ZJLA 5P0LA 4GJ8A 5JODA 1G35A 3S7LA 1FIVA 3BXSA 5HDVA 3RTHA 5EZXA 2MIPA 1HBVA 5P5IA 2I4UA 4EJ8A 2P3DA 3UQXA 4J0VA 4LXAA 1M0BA 5OZ9A 1FMBA 2NXMA 2I0AA 3NU9A 4Y3DA 5KQFA 1PSOE 2AOCA 3SM1A 4ZSRA 1YT9A 2ER6E 5P8EA 3ZPSA 1HVSA 4Y3SA 5KOSA 2QI7A 2WHHA 3OQAA 2ANLA 1XN3A 4BEKA 5P8HA 1FFFC 1NPAA 5HTZA 3D1XA 3K5DA 5P33A 2PK5A 1EPPE 3UQUA 3LHGA 4JPEA 1PFZA 5AH9A 3D91A 1EPRE 5P76A 5P25A 4B78A 2QHZA 1KJ4A 4H3IA 4D88A 3O9CA 2V11C 3KYRA 3KA2A 3OY4A 2UPJA 3NXEA 5P5QA 1HEGE 5P3EA 4Y5PA 3Q70A 4Y41A 5P1EA 3D3TA 4Y5BA 5P5CA 3WZ7A 4Y4ZA 5CLMA 3HBOA 3ECGA 1SGZA 5OZPA 4L7JA 5ER2E 2AZCA 5P1UA 1ER8E 2HB4A 4H1EA 4FRKA 1ZLFA 4R92A 2Q64A 4K4PA 4D83A 4I1CA 2FXEA 2AVMA 2F81A 2OHPA 4ZSQA 5P7RA 4Y3WA 3QRSA 1M4HA 2FS4A 4DJVA 5P46A 4EJDA 5P8NA 3O9BA 2J9JB 4Y6MA 1HVIA 2RSPA 2NNKA 5P07A 1K6TA 2OHRA 4DJQA 1MERA 1N49A 3NDWA 4EPJA 5P80A 2I1AA 5P78A 4ZLSA 4EP2A 4B77A 1FQ6A 2IGXA 2UY0A 5DR3A 2F80A 4QJ2A 1PSNA 5P6FA 2HB2A 5P3XA 2ZHVA 4PHVA 4AUCA 5P41A 2NXLA 4Y35A 1BDLA 2HB3A 5P65A 5C9FA 1B6LA 3KFRA 2VA7A 5P3YA 2R5QA 4OBJA 4Y3FA 1ZPKA 5ISKA 5P8RA 4CPUA 3RSVA 3O99A 2G24A 3TPPA 4OBKA 1HPXA 4KB9A 1XL5A 5P02A 3MXEA 3CKPA 1FMXA 3HVPA 1AAQA 1TZSA 5P01A 5P70A 5P1VA 4D8CA 5DGUA 5P1LA 5P1TA 4MC1A 3INFA 2OHQA 5OZ3A 3OOZA 2PH8A 2Q3KA 5P7XA 4PEPA 3RSXA 3L38A 3KFSA 4E43A 5IVQA 4NPTA 5P6EA 3IXOA 2VS2A 3RVIA 4GJCA 4J1EA 1A8KA 5P8AA 1W5XA 2FDPA 3UDMA 2AZBA 5P8QA 2OHLA 3O9AA 4EQ0A 3K5CA 4YOBA 5P3MA 4TRZA 5P4LA 3T7XA 5OZGA 3HZCA 3S85A 5HD0A 2FGVA 3GGVA 4Y4XA 5P2BA 2A1EA 3VYEA 4YOAA 1CMSA 4FS4A 5SY2A 5P56A 4Y4WA 4CPTA 4DPFA 2VJ9A 3ZKSA 1SIVA 2WF1A 4Y5NA 3VUCA 2G1SA 5KQZA 5EZZA 3OHHA 2F3FA 1XS7D 1B6JA 5P5SA 3CYXA 1K6CA 5P1CA 3L58A 5ER1E 4MC2A 2VKMA 4HE9A 4A4QA 3SQFA 5P3RA 1QBTA 4Y5MA 5OZ7A 5BS4A 2ER7E 3CICA 1ZSRA 4I10A 3I25A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4I0Z A;  3SKF A;  2Q63 A;  1EPL E;  4GJ7 A;  3PBZ A;  4Y4D A;  1HTE A;  5P8S A;  3VF5 A;  5COK A;  3GI6 A;  4LXM A;  3KFN A;  1EBW A;  4HA5 A;  4J1H A;  5P49 A;  5P68 A;  1HSG A;  2O4K A;  4HVP A;  1D4S A;  5P1J A;  1OHR A;  4Y47 A;  3EL0 A;  2WF3 A;  3QI1 A;  5P2E A;  1FB7 A;  1GVW A;  2FNT A;  1EAG A;  4J1I A;  2B8L A;  4GJA A;  3PI0 A;  4DQC A;  1ENT E;  4FRI A;  5HU0 A;  1WBK A;  5P5O A;  1BDR A;  3PWM A;  2AOH A;  5P7U A;  5P42 A;  4LHH A;  1F34 A;  3O9L B;  2UXZ A;  5P6X A;  3OU4 A;  1GVU A;  1MES A;  3FSM A;  4Y57 A;  1TCX A;  1WBM A;  2FLE A;  1DIF A;  3ER5 E;  2QD7 A;  1VIK A;  4Z22 A;  4Y4J A;  3VV7 A;  1FG8 C;  5C9B A;  4LP9 A;  3R2F A;  1E81 E;  5OYU A;  5P3J A;  4QJ9 A;  1B6P A;  5P1Y A;  2V00 A;  1HPV A;  1MT8 A;  2IKU A;  4GB2 A;  3NDX A;  5DGW A;  5P3W A;  2JXR A;  4J0Y A;  1LV1 A;  3EL1 A;  2IQG A;  3OQK A;  5P3D A;  1B6M A;  5P0K A;  4Y3Y A;  4I8W A;  1HWR A;  2J9K A;  4OC6 A;  5P7B A;  2FGU A;  1AID A;  5OZL A;  4DFG A;  3DCR A;  2QNN A;  4Y4E A;  1DAZ C;  5P2Z A;  3U71 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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