4GL9A

Crystal structure of inhibitory protein socs3 in complex with jak2 kinase domain and fragment of gp130 intracellular domain
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
288
structure length
282
Chain Sequence
QFEERHLKFLQQLGKGNFGSVEMCRYDPLQDNTGEVVAVKKLQHSTEEHLRDFEREIEILKSLQHDNIVKYKGVCYSNLRLIMEYLPYGSLRDYLQKHKERIDHKKLLQYTSQICKGMEYLGTKRYIHRDLATRNILVENENRVKIGDFGLTKVLPQDKEKVKEPGESPIFWYAPESLTESKFSVASDVWSFGVVLYELFTYIEKSKSPPVEFMRMIGNDKQGQMIVFHLIELLKSNGRLPRPEGCPDEIYVIMTECWNNNVSQRPSFRDLSLRVDQIRDSI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title SOCS3 binds specific receptor-JAK complexes to control cytokine signaling by direct kinase inhibition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Mus musculus
total genus 78
structure length 282
sequence length 288
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4gl9A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4gl9A01
3OHTA 3DNEA 4FV6A 3VW8A 2IJMA 3UOJA 3V5WA 4FTRA 2ZAZA 5AX3A 2OSCA 3K54A 5ANGA 5HE0A 1PXIA 3E63A 1IA9A 2UZOA 3F9NA 5AADA 1XHAA 4LV8A 4JRVA 3THBA 3P7AA 4HYUA 1OITA 4QQCA 3F6XA 4EH3A 4ZLYA 4GYIA 4A9TA 4O0UA 4QMOA 1GNGA 3Q32A 3QZFA 5CT0A 2A1AB 4L52A 3T8OA 4C62A 4NUSA 4CXAA 3FMLA 4TWNA 4EOLA 2NNWB 3P0MA 2R3HA 3GC9A 4ASZA 1H07A 1SNUA 5EM8A 3JXWA 3R30A 4FKSA 3OP5A 4TW9A 5AM6A 2NPQA 1W83A 3EKNA 4Q9SA 4E7WA 2E9VA 4MF1A 5B2KA 4KKHA 2BTRA 3POOA 5DR6A 4EBVA 3TCPA 2WKMA 2PTKA 3MV5A 4MTAA 5B2LA 4L44A 2QR7A 1M2PA 4BTMA 5E4HA 3O0GA 4YJPA 4QP9A 4X2NA 4XV2A 3S3IA 3ACKA 4A4LA 4EOKA 4CRLA 3S00A 1IG1A 3DBFA 5DH3A 4OTGA 5ICPA 4Y85A 3V8WA 3BLHA 4G9RA 3ZH8A 3DFCB 4UMQA 4FG9A 4XV1A 3FMKA 3FMNA 5CSHA 4BZDA 4FSZA 4W4WA 4PPBA 3LVPA 2EXMA 4FIGA 2CPKE 4O7YA 2CDZA 4IM2A 4YLKA 4RJ6A 3UGCA 3QAME 3G0FA 4J8NA 3IDCA 4BTKA 4YMJA 3WE8A 4YURA 1MRUA 1ZRZA 2C3KA 2R3IA 2XZSA 2YA9A 2Y4IC 3OVVA 2F7XE 2P2HA 2V7AA 3ALOA 5BMMA 3TJCA 4DLJA 3I6UA 4EK6A 3PVWA 4ID7A 3VS7A 1YWNA 3GU7A 4AN2A 4O2PA 5JFWA 5AR5A 5DT3A 5CTPA 5FXRA 3O2MA 3PPZA 1YHSA 4GU9A 1J1CA 5J1VA 2WXVA 1NVRA 4ACHA 2R4BA 4HNIA 3UE4A 5AUXA 2GNIA 4QQTA 1YXXA 4J53A 2YCRA 5CENA 2X9FA 5JQ5A 3BQCA 3AT4A 3O8UA 3PXFA 3FLSA 3U87A 4AZSA 5CEKA 2XF0A 3DAJA 4CKRA 5LVOA 2OKRA 4IAZA 2OJJA 4E6QA 5IQGA 4H39A 3CBLA 4PPAA 4AE9A 1ZAOA 4YJTA 1GIHA 3K3IA 3BKBA 4O82A 2BRMA 4KSQA 2HXQA 4KIKA 4IC7A 3LIJA 3R7EA 4OR5A 4E6CA 1UKIA 3MVLA 3WZUA 5CEIA 3QHRA 4KSPA 1PRYA 2WU6A 1IASA 3AD6A 3GU6A 5GJGA 2V5QA 3LFNA 2C0OA 1OUYA 3LCSA 3TN8A 4O84A 1H1QA 3IDBA 4X7QA 3ZEPA 3LFQA 5E1EA 2H34A 1ZYDA 1Z57A 4FYNA 5D41A 4F0GA 1ND4A 5H2UA 3ZUVA 5A4TA 1JPAA 3RNYA 2WOTA 5AAEA 3TL8A 3JR1A 3PY1A 2FSOX 2FB8A 3MESA 2C1AA 1Q41A 3OT8A 3F5PA 3TZ9A 4DEBA 2FO0A 4GT3A 4P7EA 4DFUA 3BHYA 3BLRA 4KABA 4X21A 3DDQA 2J0KA 4C58A 5K5NA 4IX4A 4ZTQA 2O8YA 4AN3A 2OJ9A 3GQLA 2HW6A 3KMMA 5I5ZA 1YDSE 3FPMA 2I7QA 4JXFA 3NUAA 2V22A 3Q9WA 4FKUA 1KOAA 3ZU7A 4L43A 4NM0A 2YM8A 3NAYA 3GU8A 4ZY6A 2EB3A 3U9NA 4AFEA 1V0BA 3QTIA 3OCBA 5A4EA 3CE3A 3RM7A 3BEGA 2W1GA 4CVAA 3U54A 3FLZA 3H9FA 2QONA 4BCFA 4GK2A 2UV2A 1PKDA 1KE7A 3IW7A 4MWIA 2VRXA 4RWKA 2QOCA 3TTIA 4QPMA 2R3FA 4CSVA 5HLNA 4CKIA 3FQSA 4R5YA 3BBTB 1YXSA 1ATPE 4NU1A 5H3QA 5DA3A 3VHEA 4NFNA 3R63A 4BDBA 5ETAA 3Q4UA 3SLSA 2W99B 4XG8A 2VTPA 3KKVA 2E9UA 4D9UA 3K5VA 2VGOA 1J7IA 2UVXA 1ZLTA 2PHKA 4YBKA 1OI9A 2OLCA 3DTWA 3MPTA 3LM0A 5IKWA 3KK9A 4MNEA 4BTFA 5CQWA 4YZBA 2VTQA 3VJNA 3DKGA 4FTKA 1PJKA 2QOHA 3OMVA 4NIFB 4KIPA 3N4UA 2C0IA 2UZNA 4RQVA 2Z2WA 3EYGA 3HMOA 5E8UA 3H9RA 4O7TA 1OL6A 4KS8A 3UQCA 2H96A 4BI2A 2VO6A 4ZOGA 3C51A 3RHKA 1QPCA 3HP5A 4BBFA 1WBNA 4FSMA 4CD0A 1XH4A 3I5NA 4PNIA 4TYJA 2IVUA 4NW5A 4RIWA 5IZFA 4BHZA 5AAGA 4KRDA 4WG4A 3RPOA 3ZM4A 1YOLA 2QOFA 3TI1A 3WYXA 2HXLA 1VEBA 3C4EA 3KGAA 4BKJA 2PMOX 4OAUC 1JKSA 5IA4A 5D10A 4FTNA 3MVJA 2C68A 3LJ0A 2BZJA 4F6UA 5CEPA 4O7VA 3ZOSA 5KBRA 3ZBXA 4F70A 5IDNA 3UQGA 3A2CA 2B52A 2YITA 1KE5A 4LFIA 4NM3A 3C13A 3NNVA 3FZSA 3DK6A 4FKVA 4UY9A 4J96A 3TNHA 3ERKA 4M7IA 3ANQA 1S9IA 1YXUA 3PLAE 3DQWA 3QWKA 2GHGA 2JDRA 3VS6A 3COMA 5HCXA 4CG8A 2YM6A 3U6IA 2F4JA 5AA8A 4AE6A 2XIZA 1PMUA 4F1MA 4GJ2A 3D5VA 5AR7A 4ZTHA 5CU2A 3TKHA 1Q8WA 1OZ1A 3C4FA 5K4JA 1BL7A 5CT7A 3TKIA 4MBJA 1H08A 1HCKA 2UVYA 3MN3A 5A6NA 2VD5A 4USEA 4CZUA 3VUDA 3PLSA 3R7YA 1H1SA 1PMEA 4U5JA 3QRJA 5K3YA 4KUJA 4CEGA 2HZNA 3EFLA 5FBNC 4EC9A 4FKOA 1IAHA 1H1WA 2IZSA 3LCKA 2R0UA 3BCEA 3BHUA 5KZ0A 4DFXE 4O0TA 3IW8A 3NWWA 4HGSA 3N51A 3P23A 3M11A 5D7AA 3RZBA 3VS5A 3DXQA 4RVKA 4YNEA 2C6OA 4QYYA 1WBVA 4U6RA 4U97A 5HBJA 4TNBA 4XMOA 4EH2A 5H8EA 3LFSA 4BL1A 1CM8A 2Z7QA 3R00A 4BZNA 4FT5A 4WRSA 3VBQA 4EZ7A 4ACDA 5M55A 3FSFA 2RFNA 2DUVA 3C7QA 4IVDA 4PQNA 1ZY4A 3DXPA 2C69A 3CXWA 4HGEA 4U45A 5HLWA 5JFXA 2RFDA 4QT1A 1H25A 2OF4A 3V3VA 3ZLWA 4AT4A 3QD0A 2HYYA 2PYWA 4R78A 4JAJA 4YO6A 4F1TA 4DEAA 5DLSA 4F7NA 3R2BA 3SA0A 4MQ2A 3AD5A 3ENHA 3DAKA 1DI8A 3BLQA 3BHHA 4R3RA 5AX9A 3QTWA 4IZYA 2P33A 2BKKA 5M44A 3BV3A 3MBLA 4JBPA 3ORXA 2YZAA 4J8MA 5IH5A 4AOIA 1PHKA 1OL1A 3G0EA 4QMZA 4YSJA 4ZEGA 2ESMA 5KKRB 3QXOA 5ACKA 3M1SA 4JR7A 3TNIA 2BRBA 3G9LX 5IQEA 2FYSA 3AC2A 2Z7RA 4CTBA 4DH3A 3BI6A 3W55A 5G1XA 2IZUA 4UXLA 4H1JA 5DNRA 2BDFA 3RK5A 3ZMMA 4YUQA 4MNEB 3LFFA 4KKEA 4PPCA 5BVWA 1WBWA 3HA8A 1BKXA 3A7HA 4V01A 5CAPA 5KHXA 5J5SA 4XRJA 5HG9A 4IFGA 3V5LA 1FBNA 4FIIA 4BB4A 4JNWA 2WO6A 5DHJA 3QD2B 3CP9A 5GZ9A 2VTMA 3FLNC 3UNZA 4M67A 4HCVA 1K9AA 4AT5A 4ERWA 3ZC6A 4IADA 4Q9ZA 3PE2A 2PVJA 2YABA 2GNLA 2QO2A 3MTFA 3QX4A 2CNUA 3VNTA 1ZYCA 5L2IA 4DH8A 2O64A 3FQEA 4FNYA 3PXRA 3FV8A 5KE0A 3RGFA 1OECA 2IG7A 5FEDA 4TWPA 4G5PA 5EW9A 4L67A 3HRFA 2QC6A 4O0XA 3HYHA 2WQEA 1LPUA 1M2RA 2JBPA 3MY0A 4FKTA 3ZZEA 3FL4A 4FTCA 3I6WA 5M56A 4YC8A 4MQ1A 1OKYA 5BYYA 3PZEA 5HD7A 4TYHB 5CASA 4Y8DA 3P9JA 2GHMA 4RSSA 3KMUA 4AA4A 3SC1A 4S30A 4XG4A 3L8VA 4C0TA 2YLFA 3KCFA 4F63A 4IZAA 1H27A 3ZZWA 2X39A 3BV2A 3F3UA 4MXAA 5E8XA 3P5KA 4BDGA 4BRXA 5KMLA 2W7XA 3PRFA 4RRVA 5FM3A 4BDCA 4HPUE 2KULA 4RFMA 3U8WA 5AA9A 3KXNA 4KBCA 1W0XC 1YW2A 4ACMA 5HX6A 2BVAA 3TNWA 1E1VA 3NSZA 4PP7A 3KXHA 4JR3A 4YBJA 2WEVA 5HQ0A 5GHVA 2CN8A 2XKDA 4M68A 1WCCA 2IN6A 3QHWA 3R9HA 3OOGA 3HRCA 2YAAA 3HV4A 3QQFA 4XUFA 2XNPA 3UIUA 3BYSA 4BICA 4PY1A 4XLIA 2RSVA 2YDIA 3WIGA 3IW5A 3KF4A 5AFVA 3IGGA 3QCYA 2BRGA 3KN5A 5FGKA 5GJFA 3VS3A 4IAKA 1JQHA 1SVEA 5JZNA 4QQJA 1URWA 2EB2A 2XP2A 4EH6A 3E8NA 4FZAB 4OAVB 4D4SA 4EH5A 3F5XA 3NNWA 1TQIA 2YM5A 5HG8A 2XNBA 3FSKA 3QTRA 4RJ5A 5FP5A 5DOSA 2W5AA 4FT3A 4IB5A 2VV9A 1MUOA 3QZGA 3HDNA 4YPSA 3PXZA 3AT2A 1DI9A 3O17A 1UNLA 4CCBA 3QRTA 4JBQA 3UOHA 4O38A 2X4FA 4D2RA 2R9SA 1XBBA 3PXKA 4PTGA 1MRYA 4QMYA 5BMSA 3DTCA 1OM1A 3E64A 2ZYBA 2VTJA 1TKIA 4DEDA 4JBOA 4AGCA 2WTKC 4CQEA 3C0IA 3Q53A 4BZOA 2W5HA 3ZXZA 4BDHA 5KMJA 4WD5A 4O7LA 2WTIA 3AGMA 3O8PA 3WI6A 5IQDA 4QMUA 5EYKA 3OD6X 4FT0A 5C01A 1UWHA 4D5HA 4BTJA 4FTOA 3VQHA 4M13A 2J5FA 2OJGA 4H36A 4NCTC 5AP7A 1R1WA 4ZMEA 2PVHA 3E5AA 3FC2A 3NYOA 4I3ZA 4GRBA 3VUMA 3ZLXA 4C37A 3IKAA 2HIWA 5IEYA 1SM2A 3CPBA 2OXXA 4RIXA 3RCJA 4B6LA 2IPXA 2WGJA 2W1IA 5IUIA 5I9WA 3RJCA 3H3CA 5AIKA 4AN9A 3FXXA 4BCNA 2A0CX 4BHNA 3QA8A 5LMKC 1YI3A 4M69B 4DGNA 5CF8A 2PZIA 2G1TA 1GJOA 2Y6MA 4S31A 3AGLA 3KK8A 4OBQA 2CGWA 2ITUA 4YLLA 2R3PA 3BRBA 3EOCA 1H28A 5CX9A 3VBYA 4UMRA 4GG7A 1H26A 4MF0A 1PXKA 4DGGA 3O8TA 3FKLA 3QWJA 4JQ8A 3VUHA 2R0IA 3PFQA 3TUDA 1Y8YA 4FV7A 3HA6A 4FSRA 2VWWA 1XH5A 3F2NA 4NM5A 1YDRE 1Q97A 3BGQA 4XNEA 2IW8A 3OG7A 5K9IA 4LGDA 2BZKB 5FXQA 1YDTE 3ZUUA 4ASDA 1OIYA 2W1HA 4BBMA 3L9MA 1Y6AA 4BGHA 4WNOA 2WTWA 5HG5A 4L01A 2JKKA 4MD9E 4X2GA 5F4NA 3R7VA 5IDPA 5LMBA 1AQ1A 4TL0A 3DZQA 1FVRA 2ETKA 3EIDA 2C6LA 5IQIA 2X2KA 2JD5A 2HELA 3QQJA 2QOOA 4IX5A 3WILA 3ULZA 5IISA 3UP7A 5L6WL 3ACJA 4RZVA 4DG2E 5I9YA 4LMNA 2JEDA 1JSUA 2VWIA 3PIXA 4L00A 4CTCA 4YJOA 2YWPA 1UKHA 3LXNA 3Q04A 4K18A 1U59A 5ETIA 2CGVA 4RX5A 5CANA 3RNIA 1R0EA 1Y57A 3JYAA 5DWRA 2W1ZA 2XK6A 4GCJA 3EN6A 5E92A 4W8EA 2C6IA 4E1ZA 5JGAA 5E90A 3MFRA 5E8VA 3ZRMA 4G6OA 3ATTA 5JEBA 1OKZA 3IONA 3SAYA 2ZM4A 1FMKA 1PXLA 2VTIA 1G5SA 4MCVA 4DG3E 5C1QB 2C4GA 3KVWA 5K0XA 4TYGA 4L9IA 5A3XA 4F9AA 5HORA 1KWPA 4FIFA 4V04A 4CNHA 4HGTA 2C5VA 3GC8A 3AT3A 3C5UA 3PA3A 5LVPA 4L45A 1FGIA 2CCIA 5GZ8A 5M06A 4E5AX 4EORA 2GS6A 3VUTA 4PMSA 1GZ8A 4OTQA 4C02A 5LVNA 1WBOA 5HGIA 3OBJA 4WOVA 4DGLC 5EKNA 4RWJA 2UW7A 4NT4A 3GNIB 2AC3A 4FKIA 4FOCA 4BCPA 1PY5A 4JLCA 1FOTA 4WHZA 5KX8A 4EH9A 3E7VA 3REPA 4RFYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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