4GOTA

Crystal structure of a putative methionine-binding lipoprotein (bsu32730) from bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 at 1.95 a resolution
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
SGKKEIVVAATKTPHAEILKEAEPLLKEKGYTLKVKVLSDYKMYNKALADKEVDANYFQHIPYLEQEMKENTDYKLVNAGAVHLEPFGIYSKTYKSLKDLPDGATIILTNNVAEQGRMLAMLENAGLITLDSKVETVDATLKDIKKNPKNLEFKKVAPELTAKAYENKEGDAVFINVNYAIQNKLNPKKDAIEVESTKNNPYANIIAVRKGEEDSAKIKALMEVLHSKKIKDFIEKKYDGAVLPVSEM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Methionine-binding lipoprotein metQ
publication title Crystal structure of a putative methionine-binding lipoprotein (BSU32730) from Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 at 1.95 A resolution
rcsb
source organism Bacillus subtilis subsp. subtilis
molecule tags Lipid binding protein
total genus 75
structure length 247
sequence length 247
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03180 Lipoprotein_9 NLPA lipoprotein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4gotA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4gotA02
2I0CA 4GLIA 3MJNA 3FXQA 1MQJA 2DWJA 4QHQA 1N3WA 4IO4A 2OK2A 1OIBA 4Q0CA 1TFAA 1LFHA 3C9HA 1URGA 2F7CA 1Z7ME 2OJTA 4JSDA 3T93B 3PUXE 3TTRA 1UQWA 2QRYA 3C35A 2RC9A 4GOTA 5A5XA 3USDA 3MZBA 3M8UA 3VV5A 1NFTA 3K01A 3JZJA 3VLVA 1L5TA 4DXUA 3VLWA 5I56A 1FTLA 2OWTA 4MH5A 2GHAA 3FVNA 4NF5B 2OLBA 1DTGA 2I3VA 1DPEA 2ABHA 3IJXB 4YAHX 1NH7A 4HW8A 4R2BA 1Y1ZA 2Y7KA 3MVYA 4YMAA 2OWSA 1VFDA 5TP9B 2XXUA 1LLSA 4QFNA 4QSDA 3EN3A 4O3BA 4OHNA 3SEVA 4DCYA 2F7AA 2ONKE 4POWA 1Y3NA 2F8DA 5AA2D 5EYFA 5FTHA 3C4MA 4AB6A 1B3HA 4OQOA 3RUMA 5I84A 4ZDMA 4F1UA 1DSNA 1XHYA 5L9OA 1LB9A 4OMBA 3KN7A 1JW1A 5IKBA 1US5A 4KCDA 5FHMA 3S4UA 3R26A 4IO3A 3FJGA 4JBZA 2B3BA 4XKQA 1NNKA 4LQ5A 3B6TA 2IA4A 1A99A 4LZ7A 1PB8A 4KCCA 1MY1A 3O6HA 1S50A 3QUJA 4Q8RA 4GRKA 4LP2B 4H5GA 2HZLA 4OENA 1SYIA 4NF6B 4IO2A 1PC3A 1N7XA 3RT6B 2Y84A 2I4BA 3GBAA 3OO9A 4KYDA 1H43A 1MS7A 4MLQA 1NNTA 3FATA 2XHDA 2NWJA 4EF2A 4DXCA 4QFPA 4U22A 3ZKLA 5AA4A 3U92A 4H67A 2HXWA 3O97A 4DE8A 1MY2A 3FASA 2QMWA 1HSEA 1QJMA 2O1LA 4RA1A 3FXUA 2ESNA 1XVYA 4LQ2A 4HS7A 2Y7IA 1Q1KA 4RNSA 2QSXA 2VD2A 3PPRA 4H65A 5TU0A 4NWCA 3LSWA 1MY0A 2CZLA 4R74A 1FQAA 4F18A 4U21A 3TTNA 3HCQA 1SW4A 1R6ZA 1SD3A 1MRPA 3UP9A 4G2ZA 3S9EA 5CBSA 1B05A 1JEUA 3N6TA 2AL5A 4LATA 3EPEA 5H8HA 2NOOA 3PUWE 3LUYA 1B4ZA 4RK2A 1O63A 4N13A 1FQBA 1NMUA 3H6WA 4WKMA 3K6VA 4QFKA 2VOZA 4JWYA 4KQPA 3IB0A 1RYOA 1TXFA 5H8NB 3SEXA 4G68B 3E13X 1HSJA 4F22A 1SDXA 4BDRA 3UORA 2DWAA 3RT8A 2UVHA 2XXIA 3OMBA 4MBPA 1IXGA 5DVFA 3FIRA 1FTKA 3KSXA 5AA3A 5AA1A 2DVCA 3QUFA 2AIXA 4L17A 3U1OA 1MDQA 3MPKA 3D4CA 4XKNA 3LR1A 4DCXA 2Y7PA 3KFMA 3ILTB 4LZ8A 1OVTA 4YMBA 4RPNA 1ZU0A 1OLAA 3C34A 1PBPA 2V84A 3IOUA 3KBRA 2V25A 5FHOA 2DVZA 2D5WA 2HCAA 3JV9A 1GV8A 4QFOA 2XXYA 3U93A 1YTVA 4F3GA 2XXWA 4R2FA 4YZZA 2H9BA 4K3FA 2GH9A 3B6QA 4JXIA 3QSLA 3MVWA 2YPNA 4H8JA 1B32A 4ZEBA 1LAHE 1QKAA 1JETA 4QSEA 3D4GA 4U23A 2XXHA 3FXRA 3OO7A 4EDPA 3ONMA 2V3TA 4FJPA 3KJTA 4G8MA 1N04A 4GD5A 4F3SA 5JTYB 3CSGA 2B3FA 2G93A 2F35A 3O2AA 1ZLQA 3F11A 3SESA 3EF7A 2DE3A 2XXRA 4ELOA 4HCYA 2RCAA 3E9XA 2Q88A 1UTBA 2VHAA 1MH4A 4KFQA 1CB6A 2V3UA 5I58A 4OYVA 2V3QA 1IZ1A 2UVGA 3M3KA 5H8FB 2Q2AA 5L9MA 1H76A 5DVJA 3KSJA 2HAUA 3S9MC 3K1MA 3OELA 4I8CA 1P99A 4YU0A 3FD3A 4TLMB 2Y7RA 4NTLA 1UTHB 5CMBA 1P1UA 4JWOA 3EQ1A 3FJ7A 4NF5A 1MPDA 4X1DA 3TQLA 4AQ4A 1VE4A 3HO7A 3SEUA 1ZTYA 4U4XA 3TZAA 3E3KA 3TCFA 5B7DA 3RTFB 1N84A 1F9BA 3CSBA 3MWBA 3SKPA 3LSFB 3R6UA 4R6YA 3IOWA 3VFJA 4BDMA 3QXMA 3TKDA 2D21A 1TWYA 4XXUA 1MQDA 4DIGA 1QULA 4Q30B 1A55A 5CBRA 3K6WA 2G29A 4ZEIA 4OERA 1URDA 3CVGA 1IXCA 1B52A 4R6HA 4ND9A 1AL3A 3OSQA 3SDFA 4R9FA 2H98A 3PMWA 2RC7A 4EQ7A 4PP0A 2RCBA 3N5LA 1MY3A 4YB6A 4NF4A 1H3DA 1PBQA 1ZIUA 2KLFA 5I2NB 4QSCA 1XVXA 4Z0IA 4UACA 1AIVA 1JNFA 1VSOA 4OFLA 4ESWA 4NF6A 4RK9A 1MXXA 2A5SA 5K2YA 1B1HA 3K0VA 5KDTB 1B2HA 1ZKBA 3BBRA 2ZYOA 3CR9A 4ELQA 1LAXA 3TDJA 1YAEA 2XXVA 3K6UA 3DM0A 4I1DA 3WAEA 3MBPA 1XOCA 3O66A 4H5FA 3U72A 1EZPA 3IOVA 2DQVA 2QL3A 5F7VA 2B65A 5I2KB 4ZEFA 1NNPA 4OZ9A 2UVIA 2XX9A 2RC8A 2PVUA 1EU8A 4UA8A 4OVJA 4FIMA 5I59A 1QVSA 4MF3A 1LFGA 1M5DA 3KEIA 1SBPA 2WKYA 4F19A 2CMOA 1WVJA 3PD8A 2H4IA 3OO8A 3BKIB 3Q26A 1I6QA 4M1VA 5ITPA 4F1VA 2H25A 1B3GA 3K02A 5JK4A 4G77A 3P7IA 3TCGA 2GRVA 2V93A 1POY1 2ONRA 4MLVA 3C36A 2HAVA 3MP8A 5CMCA 4ESXA 1FQCA 1PB9A 4IO7A 4X48A 1IITA 3O6GA 2UXAA 1B1XA 1NL5A 2QS1A 2O6AA 3CIJA 1RKMA 1BKAA 5A5XB 1FCKA 1LAFE 1B5JA 2PYYA 5BUUA 2ZNUA 1URSA 4GVOA 4G68A 1POTA 3K4UA 2AL4A 4EQBA 3H06B 3TPAA 3PUVE 3UN6A 2Q9TA 1ZMGA 3QYTA 4OEUA 1Y9UA 3VDFA 2DSFA 3VVDA 1NKXA 2RINA 3KJ7A 3C31A 1SW5A 4PFYA 3MAMA 3C32A 1MXVA 3CI8A 2XX7A 5FTIA 1ZJLA 1IXIA 4PFUA 3Q28A 4F1YA 1JVXA 1T0KA 2I48A 4R72A 1FW0A 4MFIA 3KOSA 2Z22A 3DP8A 4RYAA 3IB2A 3DELB 4NF8B 3TTLA 1BP5A 4KI0E 1OQGA 4QRZA 4DLDA 1O7TA 1CE2A 4RJZA 3O28A 1AOVA 1LFIA 4P0GA 1MH3A 5CM6A 2OBGA 4LUBA 4XTCQ 1B0HA 2QS2A 1B0LA 3BFTA 2ZXTA 2FA7A 3TUSA 1QKBA 4H6DA 2Q2CA 4POXA 4IGRA 1ATGA 2I0BA 4PFWA 2REGA 1NH8A 3IOTA 2O1MA 4IY5A 2UVJA 3OENA 5JTYA 3MUQA 1P1QA 1B7ZA 1LCTA 2UYEA 4GXAA 5KCJA 5HBCA 1BTJA 2O51A 3CFXA 3LSLA 3H6VA 4OESA 3VVEA 5I57B 3HSTA 3G3IA 5H8QB 4FE8A 1LBCA 4THIA 3H6UA 4OFJA 5CMMA 1P1NA 3VVFA 1M5EA 2DXYA 2O84X 2REJA 3HHGA 4X1BA 2P2AA 3OO6A 4GFRA 2E0SA 5H8FA 1II5A 1VR5A 1SW1A 2HZKA 1SW2A 2PX1A 2F5XA 1A8FA 1Y4CA 3V5AA 2A5TB 3RPWA 4EXKA 3U94A 3CG3A 3W9VA 1UTHA 3T9VA 5HPQA 3GZGA 5DEXA 2QJEA 1DMBA 2XXXA 4ZZEA 4NE4A 1N0TA 1DTZA 3QIMA 3CRBA 5EHSA 3TEPA 3PGFA 3HV1A 4GL8A 2Q89A 1B9JA 4F39A 4C1TA 3DLNA 3ECRA 2E1SA 3RNNA 1P1WA 2I4CA 4FEDA 2FNCA 4E0WA 1RYXA 3ZS6A 2Z8DA 2PMSA 4PFTA 1N76A 4YKIA 2O69A 3DP6A 1PDAA 4G68C 5TPAA 2DE2A 3TTKA 4EQ9A 1B7UA 4U4SA 1AMFA 1USYH 3O6IA 3UA8A 3QK6A 3FJMA 2Z8EA 3CFLA 2R6GE 5DYHA 4ELRA 4F3PA 2O7UA 1MDP1 4RPOA 3K2DA 3TMGA 1A7LA 1QW0A 3PPOA 1JW5A 4XKPA 3KZGA 1LB8A 1B46A 3HPIA 5HM4B 4ZZAA 1MPCA 4F2OA 4YICA 1ZBMA 3FUZA 2F7BA 3FV1A 2O7IA 1IXHA 3L6HA 5L9SA 4O3AA 4LZ5A 1IQ7A 1LCFA 1GTKA 3RTWB 1FTJA 2DE4A 2ZYNA 1MPBA 1QUKA 3V83A 2XXPA 3S9NC 1Z7NE 1MQIA 2P1SA 4FORA 2HQ0A 4KYEA 1GGGA 3N6UA 4JDFA 5I2NA 2LAOA 1MM7A 3A3UA 2FYIA 3ILUB 3UK4A 3A3CA 3EHSA 2GHBA 1JW4A 3Q27A 3MZ9A 5JEIA 1N7WA 3MC2A 1MM6A 5TP9A 2XD2A 4ZE9A 4G8NA 3G3JA 3S9LC 3B7DA 3JYRA 4OTEA 1QUIA 4U1OA 4OETA 1A54A 2ZYKA 5LOMA 1M5FA 1Y1MA 3Q29A 2YLNA 4HTGA 2F97A 1OLCA 3IB1A 1B4HA 4C0RA 4FECA 1LBBA 3A09A 3H7MA 3G3FA 2Z8FA 3N94A 1UIVA 3RQTA 3SEYA 3W9WA 3PUZE 5FHNA 3THIA 3KG2A 5CRYA 3G7WA 3H4ZA 3PV0E 4GWOA 1D9YA 2AYSA 3FV2A 1I6BA 2QPQA 3MPLA 1LSTA 2P0SA 1H45A 2DP8A 3IAZA 2DXRA 2Q8JA 4DXBA 1N3XA 3TYHA 1BIYA 4C1UA 1S7YA 1Y20A 1BLFA 1MXUA 4R75A 3T22A 4LONB 3OEKA 1UTBB 3I6VA 3PPQA 4TQUQ 4F2QA 2I3WA 1J1NA 1XS5A 1R9LA 4BDOA 5AA2B 5I58B 3RGYA 1A40A 4P11A 3GBBA 1H44A 4N6PA 2BJJX 4EUOA 2ZNTA 3FVGA 1Y3PA 2HFBA 3IORA 1YCJA 3G3KA 1JEVA 1I6AA 3GLBA 3LSXA 1P1OA 1B6HA 4PQJA 2XXQA 2ZMBA 3BFUA 1M5CA 4BDLA 3T96B 3MZ1A 4I62A 1JVYA 4R73A 3O29A 2DYXA 3CFZA 1EZ9A 4YB7A 2F6GA 4R6KA 3TAJA 1FQEA 3PPPA 2F6PA 5H8SA 4FEBA 4EXLA 5BWJA 2F36A 3RLFE 2O68A 3LC8A 4BDNA 4NF8A 4QF9A 1IEJA 4LA9A 3H6TA 1B58A 3QAXA 5DTBA 3N26A 1R1NA 2R71A 1WDNA 4OXVA 3VE1B 1R9QA 3TQWA 3TTMA 1MXWA 3H03A 4P0IA 1S9TA 3IX1A 1SI1A 3EHTA 1YPNA 4IO6A 1QUJA 4NEDA 1OVBA 3OXNA 4LVQA 4WXJA 2QS3A 4IB2A 3OD7A 4O3CA 3KGCA 3KOTA 4TLLB 2THIA 4GL0A 4WEPA 2ONSA 5H8NA 1OMPA 4NF4B 1IIWA 2X26A 5I56B 2I6EA 3VXBA 1M5BA 4OFOA 2RKMA 1MQHA 2XD3A 5ICQA 3TODA 3V89B 5I57A 4KD5A 4OWDA 5ISUA 5H8QA 1UIUA 1USYE 1SQYA 1B51A 3UGWA 4GIZA 4IY6A 3WAFA 3U8QA 3I5OA 2DOJA 3R7XA 2ALUA 2DS9A 5L8DA 3RN8A 1B5HA 2F34A 5M2VA 2I49A 4ONYA 2A5TA 4GQOA 4Q5TA 4DDDA 5EHMA 5I59B 4ZS9A 3GXAA 4WEDA 3ODBA 4AB5A 4XIGQ 3MVZA 2F78A 1B3FA 3SETA 2PT2A 3IJOB 5DT6A 3RY3A 1B5IA 2RF1A 2I58A 2OZZA 1XT8A 2VD3A 1B3EA 4BLAA 4F31B 4TOZA 3K6XA 4JB7A 2ZNSA 3MVXA 4GXSB 1PB7A 1LGBC 4JWXA 3T9HB 1SVXB 4N07A 5ICTA 4KR5A 2M8CA 4E0XA 2QS4A 4DZ1A 3M3LA 3PD9A 5AE4A 3TCHA 2ANJA 3M3FA 3K00A 1Y3QA 3FVKA 3V8XB 3KN8A 4ELPA 4KPTA 2UYFA 1LAGE 3PMVA 3ZSFA 4BDQA 4R9GA 4F3BA 4IGTA 2PBWA 1B7HA 1XC1A 4KHZE 1TFDA 1MY4A 3FVOA 1OQHA 4RY1A 2X7QA 1O64A 1D4NA 2IEEA 3HHFA 3DP4A 4XKRA 1EZOA 3L6GA 3PU5A 1SYHA 5AA4B 2VP1A 3SERA 2QMXA 3FGSA 3TELA 2R9JA 3S2VA 2NUVA 4QFLA 1DPPA 3FZVA 3CG1A 4M4GA 3C33A 3MP1A 3PPNA 1SI0A 3HN0A 3SEWA 1JQFA 4H1XA 4FATA 3OEMA 5K2XA 5IAIA 3MP6A 4G8HA 1D9VA 1AH5A 3I3VA 3EHUA 4H0WA 1FTOA 5DVIA 1MG1A 2XX8A 5H8HB 2ZYMA 3MW0A 3T9UA 1FQFA 4U2RA 4OEVA 1PEBA 1DOTA 3G3HA 1ANFA 4YKPA 3IO6A 1Y4TA 4G4PA 4YKJA 3OOAA 4I9DA 4YB5A 5B70A 3AXFA 3IO4A 1ELJA 4RXLA 1NNFA 4ZECA 4NMYA 3KN3A 5J1DA 1IUDA 1WODA 2Y7WA 4ISUA 5KCJB 4H8IA 1B3LA 1GVCA 1MXYA 3TFLA 1Q35A 2DWHA 1HSLA 3G3GA 1FQDA 3O9PA 4KYSA 2H99A 1GR2A 1D3KA 1EH3A 3Q25A 2D3IA 4GF8A 3T66A 1US4A 2VGQA 5CMKA 4EF1A 4PE5B 3VXCA 3W15C 1MQGA 5AA2A 3VLUA 2Z23A 5CI5A 1A8EA 3PUYE 3B6WA 2W7YA 4IO5A 3UIFA 4ZEKA 5KDTA 3MQ9A 3ZKKA 2OCUA 1FTMA 5F1QA 4X9TA 1B40A 3PMXA 2HEUA 4HCWA 2NXOA 2NVUB 5DEXB 1KWHA 5ITOA 3IL1B 4JSOA 3T9XB 4FAJA 2GFEA 1TT1A 4NWDA 5I2KA 2X7PA 4ECFA 3K1PA 4YKKA 4ZE8A 3OSRA 5ELVA 3LBSA 3H3GA 2YJPA 5KZTA 4ZEDA 2H5YA 2PT1A 3E4RA 5CC2A 4Z7EA 5TPAB 3K1NA 3IK6B 2DWIA 1MXZA 1VFEA 4PETA 4U1ZA 2XXTA 4F29A 1I69A 3IR1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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