4GQCA

Crystal structure of aeropyrum pernix peroxiredoxin q enzyme in fully-folded and locally-unfolded conformations
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
b'LVELGEKAPDFTLPNQDFEPVNLYEVLKRGRPAVLIFFPAAFSPVCTKELCTFRDKMAQLEKANAEVLAISVDSPWCLKKFKDENRLAFNLLSDYNREVIKLYNVYHEDLKGLKMVAKRAVFIVKPDGTVAYKWVTDNPLNEPDYDEVVREANKIAGELV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mapping the Active Site Helix-to-Strand Conversion of CxxxxC Peroxiredoxin Q Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol peroxidase
source organism Aeropyrum pernix
molecule tags Oxidoreductase
total genus 43
structure length 160
sequence length 160
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2012-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4gqcA00
4BVXA 4XS6A 5D96A 3ZREA 2K8VA 3M1GA 1R5PA 4N0ZA 2HSHA 4GLTA 4KGIA 5IIZA 3C1RA 1QK8A 3GKMA 1K0MA 2N5AA 4OO5A 3HKRA 1B48A 9GSSA 5G31A 5F07A 5HFIA 2O87A 4K0GA 3TDGA 1HYUA 2N5BA 4MLYA 3ME8A 2C3QA 1U6TA 2IN3A 3FW2A 3L9SA 6GSVA 3W8JA 2HXKA 1ST9A 3UBLA 1GTIA 3D22A 5CNWA 1FOVA 3GFKA 3UBKA 3H93A 1TJDA 3DEXA 2RUFA 2KLXA 4PNFA 4L0UA 5H5RA 1QGVA 3UVTA 4HQSA 2F8FA 2FHEA 1GUKA 3ZMKA 4Q5NA 4GSNA 2HE3A 4IELA 3H8QA 5CAXA 2GSTA 4JR6A 3G9BA 1CQGA 3GSSA 3QMXA 4FYCA 2H19A 4N0VA 2O85A 3UEMA 2H1GA 1ZOFA 3I69A 2DJ2A 3FK8A 5GAPD 3FZ9A 5A5KA 2DSAA 3BCKA 6GSXA 5D9TA 3DMLA 5G5FA 1QQ2A 3FZ5A 2GSSA 2LJRA 3GIXA 1XXUA 2O8VB 3ZVJD 1PGTA 1C72A 2X99A 1K3YA 3WYWA 3H4KA 3H79A 4HZ2A 1PRXA 1A8LA 3CYNA 2GS3A 2H1AA 3VPQA 1SJIA 3I6AA 4EUYA 1KEBA 3IDVA 1RQMA 3SWLA 1FO5A 2L6DA 2YCDA 3TB2A 2G2QA 4FO5A 3F6FA 1PKWA 5HFKA 1PKZA 1TDIA 3DVXA 3F9UA 1MTCA 5CREA 1A2JA 2LJKA 2M72A 1B4QA 4POKA 3D5JA 1XZOA 2R6KA 1QXHA 3V1WA 3KH7A 2F3MA 4GRFA 2IJYA 4MH3A 1VF4A 2D2ZA 1N2AA 1FW1A 1X9SB 3ZRDA 1LBKA 2AUVA 2FY6A 1WE0A 4L5LA 1PN9A 2I81A 1G0TA 3GTUB 2OA7A 3DWVA 2YWOA 3F63A 1AAZA 2VM2A 1FVKA 3HA9A 3HYPA 2WDUA 4XHMA 2PVOC 3P7XA 1TXXA 2HZEA 5FHIA 4HI7A 1HQOA 1NHYA 5HQPA 4GQFA 1THOA 4IHUA 3AY8A 2F9SA 2GSRA 2YANA 4ECIA 1Z9HA 1SJZA 2DIYA 4IP1A 3P90A 3JCML 5EPFA 2RLIA 4WXTA 3DRNA 2YJHA 1O7UA 3LEFA 5KN1A 1GTUA 3L0HA 2H6ZA 1XVQA 2A4VA 3GH6A 4OO4A 4ZBBA 2NVLA 1SL0B 11GSA 2VLTA 3Q18A 3HJPA 2E0QA 4D73A 3WGDA 2H74A 5G5EA 3P8WA 3TRPA 1AQWA 4MJEA 1O8WA 2H72A 4CDOA 1K0AA 3UJ1A 2VOCA 1I5GA 1XVWA 2YWMA 4G9HA 2B7JA 2GTUA 4JBBA 3HVXA 2L59A 2V41A 4CHSA 2KHPA 2H1BA 2XBQA 2CAQA 3FY7A 6GSUA 2B7KA 4TR4A 5COHA 3IAM2 3GL5A 1YKCA 2NPBA 2FUG2 4TXOA 5IO2A 1A0FA 2CAIA 4BVYA 3CSIA 3GN3A 4J56E 1YDKA 4PGTA 5FT3A 1NM3A 1TW9A 2H6XA 2IMFA 4XCSA 2ZNMA 4Q5QA 5DQYA 3HJMA 2GGTA 4KAEA 4KW6A 1M9AA 4KDXA 2LRNA 1OAZA 3OR5A 1EOHA 2FWHA 5FWGA 1TU7A 3GURA 4TRXA 3RHBA 2CVDA 5F05A 4O7HA 4MDCA 3K8NA 1Q4JA 3QDNA 1SK1A 3N5OA 10GSA 3DKSA 4KB3A 4K7OA 2JSZA 2HI7A 2TIRA 2X8CA 2ALBA 1PL2A 2JZRA 3IHQA 2CZ2A 1UC7A 3TKQA 4PURA 1PMTA 5JCUA 2GQKA 2X8GA 1ABAA 5IO0A 1B4PA 5ECLB 5IOWA 4ZB8A 5C04A 2K8SA 5IQYA 4K8MA 2WULA 3TJJA 3APQA 1OVNA 1YEPA 3EU3A 2B5YA 3F4SA 2DIZA 4BA7A 5D9VA 5ECPB 4EO3A 2I9HA 2DJKA 1EEJA 2XBIA 4HDEA 3HZ4A 1YF1A 16GSA 2VCXA 1GTAA 5DDLA 5B6MA 3CBUA 2KOKA 2VD1A 3F3RA 2ZUPA 5ECRB 3GRXA 1K0BA 3BJ5A 2AJQB 4WBRD 1EGOA 5H5QA 4LMWA 4KNDA 2VCWA 2C4JA 4HJ2A 4D73B 1O73A 1VRSD 3A2VA 3ZFLA 3RPPA 5ECSA 2KUCA 1GSUA 3TJFA 4IJ3A 3KTLA 3UOMA 4NV2A 1PX6A 1OE8A 4MF6A 2OBKA 1O85A 2LQOA 1AW9A 1CQHA 2OJLA 2VUPA 2WS2A 2R4VA 3KIJA 1E2YA 1ZYQB 4MABA 5B8AA 2V6KA 5LCZA 1EOGA 3ZFBA 2F8AA 4DSSA 5D73A 2F51A 1A24A 4AJ7A 1F37A 2L4QA 3Q6OA 4IQ1A 1WJKA 4YAPA 2NDOA 4KH7A 3APSA 1V2AA 4GXZA 3EINA 3EURA 4LMVA 2WRTA 4NV5A 4Q5RA 4RUVA 20GSA 3IK7A 4G19A 1B8XA 4MK3A 3TUEA 2REMA 3R2QA 3TOUA 1TI1A 1ACVA 3FYGA 3CXGA 3O3TA 4PQIA 1OC9B 2FCHA 6GSWA 2FNOA 3D21A 4TR1A 3D4MA 3FR9A 3TJKA 13GSA 1XIYA 1SD9A 2GZYA 2LTKA 5DVBA 4I97A 1KTEA 1TRWA 1IYIA 1GH2A 5IMAA 4MJCA 4WKWA 3F4TA 2QSIA 4ECBA 1BYEA 4H86A 4YQVA 3CTGA 3WT1A 1B9XC 2I1UA 4MF5A 1A8YA 4WR4A 2OKAA 1A2MA 3O6TA 1F2EA 2CX4A 5KN3A 1XW9A 2CVBA 4NHWA 2PGTA 4V2NA 3ME7A 1FB0A 1VF3A 2FA4A 4EL1A 4TOPA 1ZCPA 3Q19A 3FR3A 2G0FA 3UAPA 2C80A 3EWLA 4MH2A 5JCWA 3QAVA 2YJ7A 1W4VA 3QAWA 3TJGA 3QFBC 4TVEA 1FHEA 3F8UA 1OE7A 1HNBA 4YAVA 1ML6A 2DJ0A 4L5OA 1MD4A 1ZGNA 1T4ZA 5DAKB 1Z6NA 4ZL7A 2VD0A 3LYPA 2ON7A 4PUFC 3PGTA 3L4NA 4XTSA 5F06A 5ENUA 2YZHA 3D6IA 4ZB9A 3ZVJA 2VCVA 4I8BA 5HR2A 1BJXA 1X0RA 2V1MA 4IBPA 3TKSE 4LA1A 1T00A 2MMOA 3GH9A 1YQ1A 2NTOA 5H5SA 1JHBA 1ZMAA 5J5NA 1H4OA 1ERTA 1XBSA 4AJ6A 3VI7A 1I9DA 1G7EA 3GMFA 3I9V2 1MEKA 4ML6A 2P5RA 3ERWA 4HEA2 4NMUA 1M9BA 2YPMA 3PINA 1GSQA 3GKNA 2IMDA 1W89A 6GSYA 3O76A 4KDUA 3TRXA 3ZIJA 2FWFA 4X1UA 1T1VA 4IN0A 2GDRA 3WGEA 4I2UA 5D93A 3S9FA 5EY6A 4TN8A 3SBCA 2MYGA 1WRYA 1EZKA 5ABRA 4ACSA 2PWJA 1TK8B 2L4CA 2H1DA 2RM5A 1S3DA 2KP2A 5J3RA 1J08A 5ECHB 1R7HA 1FAAA 1VF2A 1PSQA 4P3YB 5E59A 3ZTLA 1PL1A 2P31A 1Z7PA 1LJRA 1TP9A 2DJ3A 3RAZA 4BWQA 2HNLA 2GT6A 2P0GA 1TRVA 4ZL9A 1PD21 5KN2A 1M2AA 2OE3A 3GUSA 2CQ9A 3A3TA 2PERA 1XW5A 3GA4A 4OMVA 4FIWA 1B9YC 2FGXA 2R5GA 4ZL8A 3HVVA 2FLSA 2RM6A 1M2BA 5G1LA 3GX8A 4N11A 2LQQA 5IM9A 3VWWA 4BPYA 4F82A 1O8XA 2GQLA 3N9JA 1HNCA 5B8BA 4POBA 2YWNA 1JFUA 1FVJA 2L5OA 3EE2A 3KP8A 4ZXGA 4O5RA 4Z7XA 1OYJA 5HR0A 1SKSB 1K0OA 18GSA 4K1FA 4AJ8A 4BWSA 1X5DA 3M8NA 2WCIA 5DBQA 1MD3A 2B1KA 1EP8A 1JZRA 3EYTA 1SK2A 3A5WA 1AXDA 2C0GA 3UARA 1ERVA 5D8IA 2C0FA 1Z5YE 1THXA 3KEBA 5J9BA 1M7TA 4ECJA 1ILOA 4XRAA 2VL2A 1OC8A 2IFQA 4MZBA 1SU9A 3LQ7A 3GL3A 3ZIVA 2HYXA 3DD3A 1LU4A 1NSWA 5F8BA 1QFNA 2PUKC 1EGRA 5ID2A 4KDYA 1A23A 2VO4A 3DIEA 4AGSA 1WMJA 4PX1A 5A4VA 2H6YA 1U88A 4ID0A 1GLPA 3TGZA 3TKRA 1GSYA 2LNTA 4NPBA 4MZWA 5DJLA 3VWUA 4QL7A 1XPVA 4XS4A 5CRGA 1XW6A 4PXOA 2JADA 2EIOA 4I5QA 1EEMA 1U3IA 3EMPA 3ZLPA 1F6MC 1SENA 4NXIA 1H75A 2CVKA 1VF1A 2IIYA 2JACA 1GL8A 2HSYA 3MWHA 1V57A 3J7Yb 3G7IA 2IPAA 3TKSC 2VM1A 3MSZA 3A2XA 2C3NA 3F0IA 4ML1A 1BQ7A 2XC2A 3LORA 2O7KA 4G2EA 4YH2A 3QPMA 4PQ1A 1SYRA 1TOFA 2IL3A 2A2RA 3GKKA 4HU7A 1SL1B 3I43A 4LL4B 1NHOA 1JLVA 1BEDA 3H1NA 4TR0A 1NW2A 4K0NA 2AAWA 1WP0A 4QL9A 5A4WA 4EDYA 2DJ1A 1K0CA 2C3TA 1JZOA 1YY7A 4HU9A 4KSMA 3FRCA 1S3AA 3HXSA 3CRUA 2GVPA 2R3XA 5F0GA 2VAFA 1J0FA 4MP4A 4IP6A 5G1KA 4ZILA 1MDJA 3LG6A 3QCPA 4AF2A 1M0UA 3BBYA 1PQNA 3IXRA 1HD2A 3LXTA 4OD7A 2HZEB 2H0HA 3HZ8A 1GRXA 1XWBA 2LJAA 3MNGA 4EDZA 2LUSA 1U3AA 2LKUA 3G7YA 3FR6A 4JR4A 3EU4A 1Z7RA 4IGJA 3G7JA 4ECCA 2FD3A 3LFLA 5LD0A 3M9KA 2TRCP 1F3AA 3ZITA 3EMXA 5HR3A 3KH9A 3P2AA 2K6VA 1V98A 2B1LA 1GSSA 2VCQA 4V2LA 2VCTA 2GLRA 3L78A 3ZMLA 4JU5A 5GSSA 4FH8A 4XRDA 1GP1A 5IMFA 3W8SA 3DYRA 1R26A 1SYXA 4PQHA 2PPTA 2AHEA 4PUAA 3KCMA 5ID2B 3IRAA 1KNGA 2C1YA 3PH9A 2WGRA 4HJMA 5DALA 2MMZA 1WPIA 3IAS2 5AIVA 1O6JA 2B3SA 3C7MA 4K2DA 2BJXA 1G7OA 1UVZA 3WD6A 2L6CA 1XOBA 4DVCA 4GSTA 5L71A 4RI6A 2H76A 3DXBA 1UA5A 3RDWA 4ZIJA 4I6XA 3UMAA 4TXOB 5ECQB 5DJMA 5DCHA 2VCZA 4N10A 1ZL9A 2PU9C 3Q74A 4MJAA 4TKYA 2IMEA 3HDCA 5CRDA 4X43A 5ECOB 1G6YA 5CYYA 5HFGA 1X9WB 5GSTA 4RQXA 4KA0A 3IC4A 4BL7A 2CA8A 4NWYA 1J9BA 3VWVA 3LWAA 4GQCA 4RQRA 1Z3EA 3L9UA 4K9ZA 3FHKA 4WR5A 4N30A 1YZXA 1GULA 1TKDB 3IV4A 1Q98A 3LXZA 1V58A 2YV7A 1T4YA 4NAXA 1GUHA 4WEYA 5IOXA 4GCIA 3IA1A 2FWEA 5IPHA 2AB6A 3VK9A 4L8EA 2JU5A 3LGCA 4FYBA 1UN2A 2WB9A 2CX3A 4KCEA 4G10A 5A4UA 2H0IA 4IQAA 1Z6MA 2XPDA 5DQSA 1VGLA 3QR6A 2H75A 1TU8A 5AN1A 3VLNA 1IYHA 1XCCA 3M0FA 4MPGA 4F0CA 1M2DA 2CV4A 1K0DA 2LEGA 3NIVA 3GV1A 3DGQA 3GTUA 1ERWA 5EL8A 5JWRB 2GQMA 1SKRB 3F6DA 2B5XA 2DMMA 1X5CA 2A2SA 4POMA 3CSHA 3CRTA 4LL1B 3KJYA 2VL9A 4J2FA 2DC5A 3MDKA 1RW1A 2OACA 2MBTA 3RPNA 3RBTA 3L9VA 1TTZA 1HNAA 3QFAC 4IJIA 6GSSA 2HRNA 1X9MB 4WF5A 2KP1A 5CO3A 1EV9A 1XWKA 1ZYEA 1T7PB 4ZBDA 2GSQA 2VIMA 4F03A 1TK0B 12GSA 3GHAA 1QUWA 4ISDA 4OFMA 4GWRA 5DALB 5ECMB 4IS0A 1YEXA 1ERUA 4E8EA 2ON5A 2H73A 3ZL5A 2MMAA 1EV4A 3FKFA 2AV4A 1BAYA 4MA9A 17GSA 1V40A 3US3A 2PVQA 4LLRA 3KGKA 4DSSB 4EC0A 1Y25A 1WWJA 4K7NA 2C0EA 3GYKA 1MDKA 2P5QA 2EIRA 4E8HA 2X64A 3ERGA 3ZZXA 3C71A 3C73A 2GZZA 1BX9A 3CMIA 1DUGA 1R4WA 2M80A 1GSEA 1GSFA 5D9XA 2JZTA 1S3CA 4OWYA 2YWIA 1SK0A 4CW9A 1GWCA 4IW9A 5ELGA 4XS1A 1AIUA 2IWTA 1ON4A 4F9ZA 2HZFA 3D4TA 4IVFA 3VI5A 2QC7A 2JZSA 5IMCA 4MF7A 1SL2B 1U87A 1GNEA 4IKHA 4TR1B 4TR3A 2CT6A 2GT5A 4DSRA 3EC3A 8GSSA 5IMDA 5LNKe 5AGYA 3IBHA 3VFIA 4DEJA 3KTBA 4XIHA 2V32A 4QQ7A 1TRUA 3GNJA 4ZB6A 1TK5B 3FEUA 1AC1A 2E7PA 5IMZA 1F9MA 1DE1A 2IMKA 3BOAA 3PR8A 2IMIA 5JWOB 2HLSA 1T8EB 1DBYA 3LSZA 3HCZA 4KSOA 1EP7A 4JZQA 2H66A 5J4UA 1SKWB 4KE3A 3U6VA 1KBNA 5J41A 2CZ3A 3W6GA 2YN1A 3NZNA 3TJBA 5ECIB 3TKPA 3TOTA 1WOUA 4HOJA 5CRHA 4V1Ag 2H71A 3HD5A 1FB6A 5G30A 4L0WA 1A2LA 2HFDA 4WF4A 1X5EA 2XHFA 1T3BA 2H01A 3GX0A 4OFTA 3EVIA 3FZAA 4KCAA 2LSTA 3M9JA 2PN8A 1XWGA 2L57A 4EVMA 4PNGA 1TRSA 4ILFA 2RUEA 3UVHA 3BCIA 4HS1A 3MAKA 2OBIA 2BTOT 3M3MA 4OFNA 5INYA 3HJOA 5GZZB 1MDIA 4F2IA 1PA3A 1E6BA 5JCGA 2DMLA 1ZZYA 14GSA 1SD8A 3ED3A 3IOSA 4POLA 2BMXA 7GSSA 2EC4A 3D0ZA 2DBCA 1A0RP 1RK4A 2N5FA 3A2WA 3DVWA 2MZCA 3U5RE 2R37A 4NHZA 2LS5A 2I4AA 4GTUA 2DLXA 2MMNA 4V1Ap 2L5LA 2JL4A 2LV3A 4ZBAA 1AQXA 3IR4A 3WT2A 2PMTA 2H8LA 1GUMA 2H70A 3GKXA 2LRTA 2ZCTA 3ISOA 3UL3A 4J57E 2B6MA 4JRRA 19GSA 4V2MA 3RHCA 4TXVA 2HT9A 4F0BA 5D9WA 5C00A 4TW5A 1AUCA 2OE1A 5B6NA 3C8EA 1G6WA 5G2ZA 4EF0A 3ERFA 3KMNA 3IK9A 2VL3A 3VWXA 5ECNB 4DSQA 2H30A 1OC9A 3QAGA 1AQVA 2FWGA 3VPTA 4OCFA 1V9WA 3APOA 5IMVA 1K0NA 4EXJA 3KM6A 4MMMA 2J9HA 4K7IA 1Y6EA 1DE2A 1M99A 1GTBA 1YKAA 2V2GA 2VLVA 4KUNA 5KN0A 1GLQA 3E0UA 3HY2A 4YQUA 2OE0A 4K6XA 4MPFA 3FZ4A 3KD0A 5ELAA 2AYTA 2NBSA 2K9FA 5DCGA 1YJ6A 2H0GA 3IPZA 1K3OA 2OADA 2DJJA 5J9CA 2XPEA 3KP9A 4JE1A 5JWQB 2IFQB 3LJRA 3J7Yk 2FA8A 2E2MA 3QOUA 4I2TA 4MJBA 2R2JA 3VURA 1N8JA 2QKEA 5DAKA 4MZCA 5EVOA 5E4WA 2WZ9A 1R5AA 2M46A 3QD9A 4GF0A 4ULXA 2YV9A 1OC3A 3GSTA 4O32A 5CP1A 4X0XA 5AIXA 1XWCA 1PX7A 4KX4A 2YZUA 1K3LA 4RI7A 4XS4B 2MBSA 2LRCA 1F3BA 1OKDA 3IE3A 1EWXA 3HVSA 1WIKA 4EE0A 4GSSA 1TI3A 3BD2A 4O92A 2V6OA 1QMVA 4MCUA 5HR1A 4HQZA 2HRFA 6GSTA 2VLUA 2JSYA 2PBJA 2QGVA 3F4RA 1URMA 1GNWA 1USBA 1JZDA 5GAND 3UIWA 1JLWA 2RIIA 1GSDA 1OKTA 3NOFA 1XWAA 2C8UA 3HHVA 4HZ4A 3TRQA 2YOIA 3LYKA 1SJ6A 2X8HA 3CSJA 2C0DA 4Q5FA 2LNSA 5KEJA 3CTFA 3WGXA 2E2GA 5AISA 3C1SA 2EIQA 2GZPA 2WJUA 5B7CA 4WETA 1XFLA 3E9JB 4HUAA 1FG4A 2TRXA 2ES7A 3E3EA 4JEDA 1YF0A 3KMOA 3KZQA 2WFCA 1DSBA 4FYUA 2J23A 5IPGA 1O81A 22GSA 3KXOA 2B5EA 2VL2C 4YQMA 2Z9SA 1JZWA 2O89A 3ZYWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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