4GQFA

Aeropyrum pernix peroxiredoxin q enzyme in the locally unfolded conformation
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
KGLVELGEKAPDFTLPNQDFEPVNLYEVLKRGRPAVLIFFPAAFSPVCTKELCTFRDKMAQLEKANAEVLAISVDSPWCLKKFKDENRLAFNLLSDYNREVIKLYNVYHEDLKGLKMVAKRAVFIVKPDGTVAYKWVTDNPLNEPDYDEVVREANKIAGELVA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mapping the Active Site Helix-to-Strand Conversion of CxxxxC Peroxiredoxin Q Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol peroxidase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Aeropyrum pernix
total genus 45
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2012-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4gqfA00
1OKDA 2F8FA 2XHFA 4HJ2A 2K8VA 2GGTA 1SKWB 2VD0A 3ISOA 1VF2A 1NM3A 1TW9A 3GNJA 1GLQA 2M46A 2OJLA 2LS5A 2AJQB 4OFTA 4OO4A 3D5JA 2B7KA 3CRUA 4NAXA 1SU9A 2HSYA 22GSA 1ZYQB 3DKSA 3IOSA 12GSA 4POLA 4XS4B 3H4KA 1O8WA 5IOWA 2H0IA 5J9BA 2GZPA 3W6GA 2P31A 2PMTA 3W8SA 2L57A 1BYEA 3RHBA 4AJ6A 3BBYA 3EE2A 5DAKA 4LLRA 3N5OA 4K7NA 2PGTA 3M8NA 2FHEA 3MSZA 1XBSA 1AQWA 2GS3A 3TKSE 4J2FA 1K3OA 4YH2A 3C8EA 4KCEA 4K2DA 1JZRA 4WBJA 1TKDB 3PINA 1GSDA 2IMKA 4HJMA 3E9JB 2H74A 4PNGA 5ECRB 3UMAA 2E2MA 4EDZA 2LNTA 3CSHA 4L0UA 2P0GA 4EF0A 6GSYA 5COHA 4BA7A 3HDCA 4BWQA 1F2EA 2AAWA 1B8XA 1M9AA 4ZL7A 2BMXA 3R2QA 1PX7A 3A3TA 1GUHA 3D21A 5EL8A 1G7EA 1FAAA 1WRYA 3L78A 4GSNA 4MH3A 2B6MA 1PD21 1OKTA 1LJRA 5FWGA 4JEDA 4YQUA 3QDNA 3AY8A 2DLXA 2VCQA 5CAXA 5HR1A 1K3YA 1AQXA 4TVEA 3TGZA 4AJ8A 2IMDA 1SKRB 4Q5FA 1OC8A 2K18A 2K9FA 1A8LA 1WP0A 2IPAA 9GSSA 1EEJA 5F8BA 4I5QA 1Z5YE 3BD2A 2VLVA 1OC9B 2GQLA 3KGKA 4V2LA 3HYPA 1Z3EA 4XS1A 3CTGA 1SKSB 1Y6EA 2BTOT 3ME8A 2YWMA 2DMMA 2X64A 2IMIA 3K8NA 4EDYA 5G30A 1ACVA 5H5SA 3DWVA 4FIWA 2LJRA 1WE0A 2PUKC 2K6VA 5JCGA 5CRHA 2RM5A 5ECOB 1TRUA 3GTUA 4DSQA 2WZ9A 5ECKB 1KEBA 1VGLA 4MPFA 1YJ6A 4PXOA 3EWLA 2D2ZA 1GSYA 4TXOA 4MP4A 4NWYA 3FHKA 5DCGA 1M9BA 2JSYA 4EKZA 4EXJA 1TDIA 1X5EA 2N5BA 3DVXA 4MJCA 4KUNA 4AGSA 1OC9A 2AHEA 1XIYA 4I8BA 5HQPA 2ZNMA 4F03A 2KUCA 1PGTA 1TTZA 3H1NA 2OE0A 1XW6A 1BEDA 5ECQB 2NPBA 4PUFC 3EURA 5AISA 1FW1A 5J4UA 3TKSA 3D6IA 4ECJA 3HHVA 2VD1A 2WGRA 1MD4A 2RLIA 2KP1A 3QFBC 2HFDA 2LRTA 1MDJA 1QGVA 2GSSA 5IMDA 2XPDA 3M0FA 2GZYA 4X1UA 3MNGA 3WGEA 3D22A 5IQYA 3EVIA 2G0FA 4IKHA 3ZIJA 2K8SA 4BVYA 2C80A 1H75A 4XTSA 2A2SA 3TB2A 3ZTLA 2GLRA 1MEKA 2P5QA 2O7KA 5D9TA 4GSTA 4K9ZA 2MBSA 2LRNA 1EV9A 2OKAA 4OD7A 2I3YA 5J9CA 1FB0A 1GH2A 3ZIVA 1Z7RA 3TRPA 1ML6A 4KW6A 2YZUA 4PUAA 4MF7A 4YQVA 3FZAA 5JWRB 4K6XA 1WPIA 1VRSD 2FUG2 1R26A 4KSMA 4TR3A 2C1YA 4TR1A 5D8IA 2PU9C 1IYHA 5L71A 5AIXA 1BQ7A 3DYRA 1AUCA 1X0RA 4NPBA 1SK1A 4HZ2A 4TKYA 1ERWA 5A5KA 1PN9A 3FKFA 3GURA 1U3AA 2KOKA 2CV4A 2HRNA 5D93A 1GTAA 4MDCA 2QSIA 1G6YA 1ERTA 3IK9A 1WWJA 1X9WB 1Q4JA 1ABAA 4IJIA 4PX1A 2PBJA 6GSWA 1XFLA 2MMAA 5D96A 4XRDA 3F63A 1TK0B 6GSSA 1M7TA 2YOIA 3A5WA 2HYXA 2AUVA 2KHPA 4MZBA 5DQSA 5LNKe 3F0IA 3RBTA 3EC3A 4XHMA 1UVZA 3J7Yb 1SK0A 2WULA 2FWEA 5G5FA 4KA0A 3QCPA 5H5RA 2H30A 2ON7A 2N5FA 3UBKA 19GSA 2CAIA 1AIUA 3D0ZA 1HNBA 4EUYA 3KMNA 3GN3A 3PH9A 4JR4A 1SL2B 3VI7A 3KTLA 4V1Ag 4JE1A 5EVOA 1OVNA 1B9XC 1R7HA 20GSA 4HUAA 5IM9A 16GSA 2R37A 1KBNA 1C72A 1TOFA 2QC7A 3US3A 2OE3A 3QMXA 1M99A 3VLNA 2H19A 3GKXA 1K0CA 5ECMB 4WF4A 4WEYA 1BAYA 3TKSC 5CRGA 3QAGA 3IAS2 3ZL5A 4LL4B 2NBSA 5DCHA 1OE8A 2C0GA 4ML1A 3D4TA 2BJXA 3VWXA 4XS6A 2HXKA 4G19A 1V2AA 3OR5A 1A23A 4K7IA 5J3RA 3VWUA 4E8HA 3DVWA 2B1KA 4K8MA 3ZFBA 1A24A 1K3LA 2C3TA 2HZEA 3GX0A 1EZKA 2JSZA 2LUSA 2VL2A 3O3TA 4H86A 2O87A 2H72A 2H70A 1XOAA 4PQIA 2E2GA 4V2NA 2LNSA 2YWOA 2CZ3A 3TOTA 3KEBA 2L5LA 3TRQA 3C1SA 1SJ6A 4KDUA 1NSWA 2X8CA 3HD5A 5CNWA 3ZVJA 1XWKA 2Z9SA 2VCZA 2VOCA 2DJ1A 3E0UA 2NVLA 4FYBA 1U3IA 4IP1A 4LMWA 3V1WA 4DEJA 4KGIA 3ERWA 4ZB8A 1A0FA 4CHSA 2M80A 4TOPA 4KCAA 4X43A 2H71A 4ACSA 1T1VA 1S3DA 3UVTA 5G31A 2PVOC 1ZYEA 3MDKA 1GP1A 1TRVA 2XC2A 3RDWA 5H5QA 3GIXA 2GVPA 1TJDA 5AGYA 4EE0A 5A4WA 1TI3A 3CXGA 4IP6A 2YP6A 1V57A 2MBTA 1TP9A 2H01A 4RQXA 1FHEA 1MDIA 1THXA 3M3MA 4ZILA 1SJIA 4Q5NA 1V58A 4O92A 4GTUA 5IMVA 4G9HA 4HOJA 4IHUA 3C7MA 5G5EA 1PMTA 3IC4A 1KTEA 1K0DA 3KP9A 1ZCPA 4XCSA 1AAZA 1YQ1A 2WRTA 2IFQB 1EGOA 3KTBA 1YF0A 2R6KA 5ECIB 4GSSA 4ULXA 1F6MC 3IDVA 2V6OA 3F6FA 3F4SA 1Z9HA 3APSA 2MZCA 3FW2A 1PSQA 5F05A 2REMA 5JWQB 2JZTA 2WS2A 3FR6A 2AV4A 4IQAA 3F4RA 3IAM2 3KP8A 2V6KA 2WB9A 2EIRA 2EIQA 2LRCA 3IK7A 4K0NA 2LV3A 3LWAA 2TRXA 2H75A 2M72A 4RI6A 1HNCA 3IR4A 4GQCA 4TN8A 2GDRA 3QFAC 4XS4A 4FYUA 1GTUA 1PX6A 1JFUA 1Z6NA 2L6DA 2DMLA 5DDLA 1FG4A 3UJ1A 1JZOA 2AB6A 2V32A 4CDOA 2I9HA 1XXUA 1USBA 5HR0A 4GF0A 1PRXA 2VL2C 5CYYA 4NV5A 4WBRD 2L59A 4ZXGA 3EINA 3FEUA 1JZDA 1ON4A 4XIHA 2H8LA 2TIRA 2GTUA 4IBPA 10GSA 3PGTA 3W8JA 4JRRA 4ID0A 3TKQA 1YEXA 3HVVA 4IS0A 2FWHA 1E6BA 3FRCA 4KNDA 1PKZA 1S3CA 3CRTA 3ZLPA 4DSRA 1T7PB 1TRWA 4D73B 3TJKA 1EWXA 2JZRA 5IO2A 1O85A 1K0OA 3UBLA 1XW9A 2J9HA 3GMFA 2HE3A 2V41A 4POKA 3VWWA 1FVKA 2TRCP 1GSQA 4ECBA 4JR6A 2ES7A 3H8QA 2CQ9A 3F6DA 3NIVA 4TR4A 1EV4A 1O73A 2VL9A 2QKEA 3GRXA 5ELGA 2DJ2A 3LGCA 18GSA 4MZCA 1K0NA 4OCFA 1WMJA 1XOBA 1VF3A 2XPEA 5KN3A 4POMA 5ENUA 2CVDA 6GSTA 1WJKA 2FGXA 2H66A 1LU4A 1U6TA 3P8WA 2GQMA 5DALB 1R5AA 1R5PA 3HZ4A 2H6ZA 7GSSA 3N9JA 4BVXA 3LXZA 1FO5A 1WIKA 1OC3A 3A2VA 2MYGA 5CRWA 2B5XA 1XCCA 5IMAA 4V1Ap 1GSFA 5DBQA 4IJ3A 2YV7A 2PVQA 1PA3A 1O81A 3E3EA 3M1GA 1T4YA 3HKRA 4F0CA 3S9FA 2O8VB 4MJEA 4N0ZA 1SD9A 2OACA 5DJLA 1YKAA 4HU9A 1H4OA 3WYWA 3TKRA 1AQVA 1ERVA 3TJFA 3LFLA 1V9WA 2GSQA 1PQNA 2YNXA 4ML6A 1TXXA 1O8XA 1FB6A 3TJGA 2H6XA 2YANA 1ZOFA 3TKPA 1VF4A 2C3NA 4J57E 4J56E 3CSJA 3HZ8A 3A2WA 3UOMA 2IWTA 3HJOA 1Q98A 2RUFA 3BCIA 3G9BA 5ELAA 5F07A 2WJUA 3BCKA 2FNOA 1F37A 1K0BA 3KMOA 4FYCA 4MMMA 5F0GA 1TI1A 2HSHA 3LXTA 4G2EA 2YPMA 4N10A 2RIIA 4Q5RA 4DSSB 1GNWA 1SYXA 2DJ3A 2B5YA 5D9XA 4IGJA 2MMZA 2H0GA 5GAND 4MJBA 2A4VA 4HS1A 2H73A 1ZMAA 5G1KA 2O89A 2IJYA 3IE3A 2KP2A 4ILFA 3Q6OA 2VCTA 2AYTA 4JZQA 5F06A 4KDYA 2FCHA 1R4WA 5EY6A 4OO5A 4O32A 3U6VA 1U88A 1EOGA 2G2QA 2GSTA 3FY7A 4WR5A 5C00A 2JACA 2RM6A 5JCUA 2L6CA 5ID2B 1TU8A 3IPZA 1J0FA 3TRXA 3EMXA 5IPHA 2CVBA 1GL8A 2X99A 4KB3A 3M9KA 1MDKA 5LD0A 2RUEA 3C1RA 4I2TA 2MMOA 2XBIA 4BL7A 1TK8B 2IMFA 17GSA 2OBIA 5FHIA 3EYTA 1PKWA 2FWGA 3I69A 2H1GA 4LL1B 2CZ2A 5E59A 4G10A 1FVJA 4ZBBA 2O85A 2DIZA 3ZREA 4IVFA 3L9UA 5IO0A 2HT9A 2ON5A 3UEMA 1W89A 3EU4A 3WGXA 3FZ4A 2FWFA 2C0EA 5B8BA 3DMLA 1YEPA 1QFNA 4K0GA 2YWIA 4MLYA 5IMZA 4HDEA 1LBKA 3ZITA 4AJ7A 1IYIA 3U5RE 3M9JA 2YZHA 2F8AA 1XWCA 4EC0A 2LJKA 4AF2A 1O6JA 3GKNA 1XZOA 2VCXA 5B6NA 1GUMA 5D9VA 2FLSA 3WT2A 3KJYA 1NHOA 4KSOA 4QQ7A 4I2UA 2YWNA 3FYGA 3RAZA 2GQKA 2F9SA 4N0VA 2VLUA 3WD6A 4ZL8A 5ECLB 4WETA 3Q74A 1TK5B 2YCDA 3I6AA 2N5AA 8GSSA 5IOXA 2H76A 1O7UA 4MF5A 3GA4A 1JLWA 5GSSA 1N8JA 4YAPA 1SL1B 2VLTA 2LQOA 5DVBA 5KN2A 2B1LA 4QL7A 2H1AA 1JLVA 2R5GA 1K0AA 1DUGA 2NTOA 3ZMLA 4BWSA 1T3BA 3P90A 6GSXA 2HLSA 1EP8A 2VIMA 3ZMKA 3ZRDA 1PL2A 4LA1A 1SL0B 1BJXA 1ZGNA 1MD3A 1GSSA 1GTBA 3DXBA 2EIOA 1A2JA 4GQFA 3LG6A 4CW9A 2KLXA 5IMFA 1GLPA 4L5OA 1CQHA 4YQMA 3KH7A 4EO3A 1ZL9A 2B5EA 4PQHA 1M2AA 2L4QA 3GL3A 4MZWA 5KN1A 2JU5A 4RUVA 4ISDA 1XVWA 5HFIA 3FR9A 2PPTA 1NW2A 3QAVA 1RW1A 3FK8A 3C73A 1W4VA 4ZB9A 4HQZA 1Z7PA 3GKKA 3LYKA 3DRNA 3CMIA 2VO4A 3IXRA 3UVHA 1T8EB 2MMNA 3LORA 3APOA 3GYKA 4XRAA 3GX8A 3JCML 4PNFA 1CQGA 4EVMA 4QL9A 3WGDA 2B7JA 4K1FA 1OYJA 3LJRA 2I1UA 3TDGA 4F82A 1SJZA 3RHCA 3J7Yk 1YY7A 5FT3A 1G6WA 2C8UA 5J5NA 5CRDA 4ECIA 2VCVA 5KEJA 4DVCA 2LJAA 1K0MA 1HD2A 4Q5QA 1GUKA 2HZFA 2EC4A 3TJBA 2IFQA 1M2BA 2WDUA 2HI7A 2DSAA 3L9SA 4P3YB 5JWOB 3G7JA 5ECPB 4MPGA 1X9SB 4MH2A 1M2DA 1SD8A 4FH8A 1ERUA 3LSZA 4NHZA 2A2RA 3WT1A 1F3BA 5B8AA 3FZ5A 4MJAA 5ECHB 5KN0A 3ME7A 1BX9A 3Q19A 4WR4A 5G2ZA 5A4UA 2CT6A 1A2MA 4GRFA 5J41A 3KM6A 3ED3A 2YV9A 2VM2A 4WF5A 4KH7A 4KDXA 3HCZA 3ZVJD 3QR6A 3ZFLA 3HY2A 1F3AA 2WCIA 1GSEA 1U87A 3GTUB 3L4NA 2LKUA 2VAFA 4FO5A 4TXOB 2H1DA 3SWLA 2ZCTA 3KZQA 4NHWA 1SENA 4HU7A 3RPPA 2IL3A 1XWAA 4WXTA 4N30A 3HJPA 4TXVA 3IBHA 5LCZA 4MF6A 3KXOA 3TCOA 13GSA 2V2GA 5GZZB 5HR3A 2GSRA 1F9MA 4V2MA 2C0FA 3F9UA 4OFNA 1WOUA 1XW5A 3CTFA 4TW5A 5HFKA 2FY6A 2QGVA 3P2AA 1EP7A 4Z7XA 5IPGA 2B3SA 4ECCA 2X8HA 5C04A 3KD0A 4MA9A 3CYNA 1YKCA 4HZ4A 4OWYA 3ZYWA 4I6XA 2FD3A 3VPTA 4MK3A 3VFIA 4ZL9A 1AC1A 1J9BA 2OADA 4OCEA 4F9ZA 4MABA 2WFCA 3GV1A 1GNEA 5AN1A 2GZZA 1E2YA 3MWHA 3UIWA 2FA8A 3DGQA 3VWVA 1J08A 1SK2A 4JU5A 3BOAA 4D73A 1ILOA 1AXDA 2OA7A 2FA4A 1Y25A 4YAVA 1B48A 4OFMA 5B7CA 2P5RA 3QPMA 3G7YA 5E4WA 1GULA 3PR8A 4ZBDA 3P7XA 2IMEA 2ZUPA 3DD3A 3TOUA 3APQA 1X5CA 2JL4A 1SYRA 1JZWA 3NZNA 3FZ9A 4MCUA 5IIZA 4TR1B 4KX4A 2VUPA 1B9YC 4JBBA 1XPVA 5CO3A 4IW9A 2OE1A 1EGRA 3VURA 1A8YA 5G1LA 1UA5A 5DALA 3LYPA 3IHQA 5GSTA 4HEA2 2GT6A 2H1BA 2PERA 1RQMA 3O6TA 2VL3A 3KH9A 3QOUA 4F2IA 2PN8A 2JADA 2HRFA 1EOHA 1A0RP 2LEGA 1XWGA 2DIYA 4PURA 3H79A 4O5RA 1JHBA 3GH6A 3MAKA 3F3QA 2DJ0A 1QUWA 1HQOA 2J23A 2VCWA 4HQSA 2H0HA 4BPYA 4GWRA 5GAPD 2VM1A 1UC7A 1GTIA 2L4CA 1G0TA 3GHAA 4O7HA 4PGTA 1DE1A 4N11A 2L5OA 1UN2A 1YZXA 2DC5A 5AIVA 4RQRA 4KE3A 5EPFA 1V40A 1FOVA 1G7OA 4EL1A 3QD9A 3EMPA 5DQYA 3EU3A 2CA8A 4NV2A 1VF1A 3HVXA 2NDOA 3GSSA 1QMVA 3F4TA 6GSUA 3TJJA 1XWBA 1QXHA 3L0HA 4K7OA 1I9DA 1PL1A 3I9V2 4IELA 2CVKA 3KIJA 1XVQA 5IMCA 3QAWA 3GL5A 4DSSA 1HNAA 3ERGA 1THOA 4KAEA 4I97A 3LQ7A 2R3XA 1KNGA 4ZIJA 2DBCA 5CREA 3ZZXA 1A2LA 1TRSA 3BJ5A 1QK8A 1X5DA 3HJMA 4HI7A 3CBUA 3IV4A 4OMVA 4F0BA 4GXZA 4ZBAA 3VI5A 3RPNA 4LMVA 2IIYA 5ECSA 1QQ2A 3NOFA 1X9MB 2GT5A 2OBKA 5INYA 4POBA 1GWCA 4L8EA 5D73A 2HZEB 3VK9A 2JZSA 3KCMA 3C71A 3O76A 5ID2A 3ERFA 2CX3A 1YDKA 2C3QA 1N2AA 3LEFA 2YN1A 5ABRA 2HNLA 5DJMA 3A2XA 1DBYA 5A4VA 1V98A 2F51A 3Q18A 3SBCA 2R2JA 3GSTA 3IA1A 1Z6MA 4L0WA 3F3RA 2LTKA 3DIEA 2X8GA 5HFGA 5D9WA 3I43A 2ALBA 2LSTA 1TU7A 4TR0A 4WKWA 1GRXA 2YJHA 3HVSA 3L9VA 2XBQA 3GUSA 3UAPA 1T4ZA 4NMUA 11GSA 3D4MA 3G7IA 4RI7A 3IRAA 1B4PA 2V1MA 1DE2A 2F3MA 3TUEA 2DJJA 5ECNB 2DJKA 4GCIA 4IN0A 3HXSA 1YF1A 1DSBA 1T00A 2LQQA 5B6MA 2C0DA 1GSUA 4GLTA 1BG5A 1HYUA 2IN3A 3GFKA 3HA9A 4TRXA 1RK4A 1OAZA 1I5GA 4IQ1A 4L5LA 1OE7A 2E7PA 1S3AA 3VPQA 5HR2A 3H93A 2R4VA 4PQ1A 2PWJA 14GSA 4ZB6A 3CSIA 3UARA 1EEMA 2CX4A 2E0QA 5CP1A 2C4JA 3DEXA 4NXIA 2H6YA 3GKMA 6GSVA 2YJ7A 4E8EA 4X0XA 1M0UA 1B4QA 1ST9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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