4GRVA

The crystal structure of the neurotensin receptor nts1 in complex with neurotensin (8-13)
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
461
structure length
454
Chain Sequence
NSDLDVNTDIYSKVLVTAIYLALFVVGTVGNSVTLFTLARKSLQSTVHYHLGSLALSDLLILLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYATALNVASLSVARYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAIPMLFTMGLQNRSADGTHPGGLVCTPIVDTATVKVVIQVNTFMSFLFPMLVISILNTVIANKLTVMVNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLNNKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYGSGSVQALRHGVLVARAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTTFLFDFYHYFYMLTNALAYASSAINPILYNLVSANFRQV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of the agonist-bound neurotensin receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Neurotensin receptor type 1, lysozyme chimera
molecule tags Signaling protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
total genus 154
structure length 454
sequence length 461
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4grvA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4grvA01
4IAQA 1L66A 3VHZA 4S0WA 3C8RA 196LA 3HT6A 1L21A 1QUHA 161LA 1L89A 3CDRA 1IW9A 4UG2A 1G06A 1L62A 4XTLA 2RBSA 6LZMA 248LA 3ABWA 3QBGA 120LA 4OV0A 2HUMA 5H2IA 185LA 1L08A 1ZYTA 3HWLA 3C7ZA 114LA 3NYAA 1QT5A 1SWYA 4Y9HA 1P37A 169LA 1L05A 131LA 157LA 3ZEVA 3D4SA 1L01A 1L57A 4YXAC 2F93A 4E97A 4I7LA 1P46A 1L50A 1OWYA 129LA 4IAPA 4ARQB 1L97A 1PQMA 2HULA 5B6YA 1C6IA 1L38A 2F2QA 2YCWA 1KY0A 1LLHA 2LZMA 3QJSB 4EIYA 1C6HA 1DYBA 1D2WA 1L00A 4G70B 4QRYA 3HH4A 2HUKA 1F4ZA 1KNIA 108LA 3VW7A 238LA 1GZMA 1SSWA 130LA 3HTBA 118LA 1ZURA 150LA 1QS5A 3QJRB 2Y00A 5BR2A 1U19A 3NY8A 2QPEB 5DHGA 4EXMA 3ZPRA 148LE 1P56A 137LA 3QJQB 1OVKA 221LA 3EMLA 2KSYA 2ZFEA 1L17A 172LA 4W56A 4W58A 5ETZA 3NS0A 5G2AA 1L95A 3HH6A 110LA 1L59A 1L87A 2RB0X 3CAPA 1JTMA 1BRXA 3DNAA 1C6KA 4K5YA 1L76A 3EH3B 1L91A 1JV7A 3EH5B 5TGZA 5B6WA 5B6XA 1L77A 3SB9A 1L37A 2Y01A 1S52A 2B6YA 1L16A 3T45A 1L56A 2R4RA 181LA 1CU2A 215LA 164LA 1QT7A 2I35A 3NY9A 3ZPQA 3SBBC 1R84A 4XT3A 1L03A 5B35A 109LA 4FAAB 1L61A 2ANXA 1C68A 2EI4A 104LA 1CV6A 3PXOA 4FBZA 5JJJA 1C6NA 5AX1A 5G2DA 3S8FB 1P2RA 187LA 1C6GA 5BR5A 2Q9DA 3C7WA 1L80A 1LGWA 206LA 1EHKB 3QJUB 145LA 1L26A 1P5CA 115LA 5EN0A 4AQNA 4DJHA 255LA 1S53A 1TLAA 224LA 4N4WA 259LA 4J4QA 3DKEX 1C65A 228LA 256LA 241LA 3QDCA 4GBRA 1QT6A 3G3WA 3DMVA 2LCBA 5KKHA 2Y04A 1L44A 1CTWA 1L14A 1LN6A 1XEPA 3HUKA 1D3JA 234LA 1L68A 1L72A 2KSAA 4TL3A 5A44A 1G1VA 201LA 4I7PA 3X3BA 1L19A 3OE8A 5G53A 3G3XA 2QARC 178LA 2B7XA 1XJUA 1PY6A 1XMEB 2ZIYA 3QBLA 2A4TA 3QJVB 1LYDA 220LA 1L0KA 1KW5A 211LA 1H2SA 4ARLA 1L64A 5B0WA 4BVNA 1G0MA 217LA 2F32A 3SB6A 4ARMB 227LA 2KSBA 4PXFA 177LA 257LA 1MGYA 1L25A 1CUQA 1CU5A 3UTXA 4I7OA 1L06A 3DN6A 3GUNA 1L48A 4A4MA 1L53A 5H2NA 197LA 2B70A 3HAOA 3HUAA 184LA 1C3WA 1S51A 2NTGA 2NTWA 1C6LA 1D9WA 1L94A 198LA 3PBLA 3C7YA 3CDVA 2NTUA 1BRRA 1C66A 3UTYA 3VG9A 4BV0A 1G0JA 4DAJA 1L60A 3V2WA 1F50A 1L79A 1JFPA 4DKLA 2CUUA 1L45A 213LA 4MBSA 3UTWA 4ARMA 2LC9A 1UAZA 113LA 1G0KA 1KMEA 1QTDA 1C62A 4PJZA 3S3CB 2OTZX 3OE0A 2RAYX 2B6TA 3OE6A 4EA3A 1QUOA 3F9LA 1P8HA 1C6PA 1L86A 3DN8A 5LZMA 149LA 188LA 1L22A 1PXRA 1L43A 1L41A 1L42A 1L96A 2OE9X 189LA 5FJGA 171LA 1L15A 1DYFA 1CV3A 1CV1A 1QUDA 242LA 2B6ZA 3SB8A 5ITCA 1L71A 5JJNA 1AT9A 186LA 2I1XA 2R4SA 192LA 1I6SA 1LI2A 1SWZA 4LDOA 5H2JA 5B34A 1C8SA 3VI0A 2YDOA 1LYIA 3PQRA 4I7KA 1T8AA 4I7TA 250LA 1CU3A 3V2YA 1L23A 4G7RB 1OYUA 1L70A 3GUMA 4I7MA 162LA 229LA 3QBIA 1LYJA 4GP8B 1D2YA 4AMJA 1Q5IA 4LZMA 2L78A 4EJ4A 4GPOA 4XT1A 4GP4B 2B6WA 1NHBA 1QT3A 1QT8A 3DN1A 247LA 3HTDA 3JR6A 3EH4B 1KW7A 1OV5A 3CODA 1QTHA 2Q9EA 141LA 1X0I1 4FPDA 1L10A 218LA 1JTNA 3DN3A 4ARJA 1PQOA 1L98A 1L30A 4IARA 4NC3A 3DQBA 3AYNA 261LA 163LA 5H2MA 222LA 4EPIA 3VGAA 1C64A 2B74A 3SN6R 1C6FA 5AZDA 1CV4A 3HDEA 4L6RA 2F47A 3NSBA 4WAVA 1P2LA 1L36A 3SB5A 4OO9A 5G2CA 3UONA 1LYEA 1L99A 3GUIA 2LNLA 3HARA 138LA 212LA 2QPDB 3C8SA 3SBAA 146LA 4FA7B 1M0MA 122LA 1DYGA 1X0K1 5B6VA 1LWGA 2OU9A 2WJLA 1HZXA 1F88A 1L24A 2O7AA 225LA 2KS9A 3HANA 1E12A 1L75A 3S3DB 4GBRB 2ZZLA 156LA 1KS3A 170LA 142LA 1QKPA 4PXKA 1LGUA 3BVDB 159LA 1L46A 252LA 1L55A 5DYSA 1L32A 4EKRA 1QKOA 240LA 2QB0B 5AX0A 4XTOA 1XJIA 214LA 1D3FA 2O79A 3KJ6A 1IW6A 3GUPA 4XTNA 2M3GA 3DMXA 5C1MA 3G3VA 3C82A 3C81A 1CX6A 4WW3A 4YXCA 1UCQA 1S8JA 1L39A 1OWZA 1L04A 1C69A 1WTHA 5G28A 195LA 1XJTA 2RH1A 3MBVA 4N4YB 5A8EA 1C6BA 1P3NA 1B6IA 1G0LA 4X31A 152LA 4I7NA 4BEZA 3UZAA 5G54A 1SX7A 5AHYA 5B6ZA 2RAZX 1R2NA 235LA 3RFMA 1PQDA 3HH3A 2X72A 230LA 1L11A 1LW9A 1GU8A 127LA 1L49A 219LA 1LYFA 1CVKA 1L65A 4G72B 126LA 1L29A 176LA 1OVJA 2RBNA 3HTFA 2ANVA 1TN0A 4W52A 1SX2A 4MQSA 1QUGA 2I20A 3HT9A 4JKVA 4XXJA 5AHZA 4EPFA 4GYCA 1C8RA 128LA 166LA 1Q5JA 5H2OA 1S54A 4BEYA 1L90A 2NTHA 1L51A 210LA 1EPYA 4EKSA 5H2HA 3LZMA 3FADA 102LA 1C6EA 245LA 246LA 3CDQA 5I14A 1M0LA 103LA 1L09A 4W51A 119LA 223LA 4W53A 4KNFA 3RZEA 1P6YA 4W57A 1QT4A 1CWQA 1L47A 3C9MA 1P7SA 5DHHA 5LWEA 239LA 2I21A 2Y02A 3SB7A 1C6QA 1L27A 112LA 3QJTB 160LA 1G0GA 1LPYA 1FBKA 2B73A 1L83A 253LA 4ARPA 3FI5A 5F8UA 1E0PA 3PWHA 4PK0A 1C6TA 2OE4X 1C6DA 3DMZA 1L63A 2RBPA 1M0KA 2YCXA 151LA 1L35A 1QSQA 1D3NA 3ODUA 1BM1A 243LA 1L0MA 1L12A 1TN5A 1KY1A 165LA 1P8IA 2YDVA 1L74A 3F8VA 3HH5A 3HU9A 4G7QB 1OV7A 3HDFA 1CUPA 1LYHA 4BUOA 1D3MA 233LA 1L84A 3OAXA 2J4YA 1L9HA 147LA 3HU8A 2WJKA 3WQJA 167LA 5B2NA 1O0AA 1L82A 180LA 1QHJA 3DN0A 231LA 1KGBA 1L07A 3HT7A 1T6HA 1H68A 2Y03A 3L64A 1DYAA 1JV6A 237LA 3UG9A 4GP5B 1L81A 4GRVA 4BWBA 1L31A 1CX7A 1LI3A 1LI6A 2RB2X 260LA 1IXFA 123LA 3X3CA 3HUQA 1VGOA 1G07A 2B75A 3FA0A 2OU0X 1CU6A 1DYCA 2OEAX 1L20A 4I7QA 2JAFA 2BRDA 1PQJA 1T8GA 2IGCA 3GUJA 3OE9A 1DZEA 4X1HA 1L73A 3RUNA 175LA 158LA 4YX7C 3AM6A 199LA 205LA 1X0SA 1QM8A 2YCZA 1SSYA 1BRDA 1C61A 2RBOA 1AP9A 1PXSA 262LA 3PDSA 4MD1A 183LA 140LA 1L54A 2RB1X 3GULA 191LA 1KG9A 1QTCA 4ZPUA 1L33A 1T97A 4MQTA 4ARQA 2Z55A 1QTBA 1L69A 1P64A 4IB4A 1DYEA 139LA 1CU0A 1OVHA 3HT8A 4W55A 3QBKA 4EKQA 236LA 1L02A 209LA 1VJMA 2OTYX 3QAKA 3HAPA 4QIDA 1LYGA 3CDOA 1QSBA 1QTVA 1GUEA 3UZCA 1ZWNA 2O4WA 3GUOA 4EKPA 3L2XA 1L85A 3C80A 4JQ6A 4LDLA 2F95A 4HWLA 1L13A 258LA 182LA 190LA 1C67A 251LA 1C6CA 1L52A 1JGJA 1CV5A 1C60A 3DN4A 143LA 244LA 4LDEA 107LA 1C6AA 2RBRA 168LA 4AMIA 4W59A 1PQKA 173LA 3C9LA 3VVKA 3K2RA 2Z73A 3S3BB 125LA 1P8UA 5H2KA 226LA 2JAGA 1L18A 1LGXA 1FBBA 4HYJA 3CDTA 1L88A 2RBQA 1L34A 3HTGA 1L40A 249LA 3REYA 1LWKA 3DN2A 1K28A 1L58A 1L67A 4QI1A 174LA 2OU8A 3UTVA 4UHRA 3S8GB 5H2LA 2YCYA 4KLYA 155LA 232LA 1C6JA 1L93A 3C83A 3P0GA 4G71B 2HPYA 4X32A 2G87A 4W54A 5ITEA 1DYDA 3HAQA 5H2PA 3QAPA 4JR8A 3C8QA 4L35A 1C6MA 4I7RA 3AYMA 1C63A 5J7AA 1PQIA 1KG8A 5JJEA 1G0PA 4HYXA 3A7KA 5A45A 4G7SB 3HASA 4I7JA 1T8FA 1L92A 7LZMA 216LA 1L0JA 2B6XA 2VT4A 1G0QA 1QTZA 111LA 3DDLA 5AWZA 2AT9A 1QS9A 4MD2A 2Z6BA 1G1WA 1P36A 254LA 2B72A 1L28A 1JQUA 2PEDA 2OE7X 4I7SA 4N6HA 3GUKA 5G36A 1CV0A 200LA 1S8LA 144LA 3COCA 2L6XA 1XIOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MCKA 1W08A 196LA 3HT6A 1QUHA 5AMYA 5LVKA 2RBSA 3AGHA 3ABWA 3TMXA 4OV0A 2C8OA 2HUMA 1REXA 185LA 3C7ZA 4H94A 4H9IA 4L41A 1SWYA 1L05A 132LA 1L01A 3W6BA 4I7LA 1UC0A 1YKZX 4E3UA 129LA 3EMSA 1PQMA 5HNLA 5B6YA 1LHHA 1G7LC 2F2QA 4H9EA 1CJ6A 2YCWA 2LZMA 4EIYA 1LSCA 1NWGA 1OUFA 3HH4A 2HUKA 1KNIA 1CJ8A 4MSTA 4WLYA 1SSWA 2Y00A 1U19A 134LA 1DKJA 3AYQA 1P56A 3QJQB 3EMLA 2KSYA 1Z55A 4PJ2C 3NS0A 1GF6A 5G2AA 1J1PY 1LTMA 1CKDA 1L91A 3EH5B 4DDBA 3EH3B 5B6WA 3SB9A 1LHKA 1GF3A 4ETCA 1OUAA 1L56A 2R4RA 1CU2A 164LA 1QT7A 3ZPQA 3SBBC 3WXTA 1VAUA 1L61A 2EI4A 5LYTA 1C6NA 5G2DA 4FJRA 1L80A 1GB0A 1QIOA 206LA 4N8ZA 4B0DA 1B7LA 1I1ZA 6LYTA 4DJHA 1TLAA 4J4QA 3QDCA 3QY4A 4GBRA 5LIOA 1NF5A 2LCBA 1LN6A 1D3JA 1IOSA 1LJNA 2I25L 2KSAA 5A44A 2MEHA 4RW2A 3X3BA 3OE8A 5G53A 3G3XA 1XJUA 3QBLA 2A4TA 4H93A 1LMCA 1LYDA 1L0KA 2RSCA 3SB6A 2KSBA 4NWHA 1MGYA 3UTXA 1CUQA 1L06A 3G3AB 4XJGA 3GUNA 1L53A 197LA 184LA 1C3WA 2NTGA 1HMLA 1D9WA 1L94A 1BRRA 1C66A 4BV0A 1B7PA 1L60A 1LZBA 1L79A 1JFPA 4MBSA 3UTWA 4DD3A 3SP3A 1UAZA 4WM5A 4DD7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1OVJ A;  4DD0 A;  1OQM A;  4MQS A;  5KKJ A;  5A3E A;  3HT9 A;  4JKV A;  1EQ4 A;  3LYZ A;  5AHZ A;  4GYC A;  1C8R A;  1DPW A;  4LT0 A;  2G4P A;  4BAD A;  5KXM A;  1GFA A;  1EL1 A;  1BVK C;  1UIB A;  102L A;  1C6E A;  3E3D A;  1M0L A;  103L A;  1L09 A;  4W51 A;  119L A;  1W6Z A;  4NHS A;  2Z37 A;  3C9M A;  2B5Z A;  2I21 A;  2XBS A;  4H9H A;  4DC4 A;  4LYZ A;  2BQM A;  1IP4 A;  1LPY A;  1YIK A;  4B49 A;  2YCX A;  4A7D A;  1L35 A;  1L0M A;  1P8I A;  2YDV A;  4OWB A;  1IY4 A;  3HU9 A;  4G7Q B;  3HDF A;  1D3M A;  2J4Y A;  4KXI A;  2WJK A;  1LZT A;  1WTM A;  231L A;  4ETE A;  4IJ4 A;  1L81 A;  4GRV A;  4BWB A;  1L31 A;  1GB7 A;  1ZVH L;  1LI3 A;  2N5Z A;  1RCM A;  1VGO A;  1YL1 X;  2B75 A;  3LYO A;  3GXK A;  2DQF C;  4I7Q A;  1REM A;  2BRD A;  7LYZ A;  1UIH A;  2BLY A;  1T8G A;  3GUJ A;  1L73 A;  4NSJ A;  1F6R A;  4YOP A;  1B5U A;  5I54 A;  4ETB A;  1IR8 A;  3B0I A;  1X0S A;  1C61 A;  1PXS A;  3PDS A;  183L A;  5J7C A;  191L A;  1BB7 A;  1KG9 A;  1L33 A;  4WL7 A;  4MQT A;  5E9R A;  2Z55 A;  1GF0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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