4GRVA

The crystal structure of the neurotensin receptor nts1 in complex with neurotensin (8-13)
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
461
structure length
454
Chain Sequence
NSDLDVNTDIYSKVLVTAIYLALFVVGTVGNSVTLFTLARKSLQSTVHYHLGSLALSDLLILLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTYATALNVASLSVARYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAIPMLFTMGLQNRSADGTHPGGLVCTPIVDTATVKVVIQVNTFMSFLFPMLVISILNTVIANKLTVMVNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLNNKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYGSGSVQALRHGVLVARAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTTFLFDFYHYFYMLTNALAYASSAINPILYNLVSANFRQV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
publication title Structure of the agonist-bound neurotensin receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Neurotensin receptor type 1, lysozyme chimera
total genus 154
structure length 454
sequence length 461
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4grvA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4grvA01
1L59A 2PEDA 1KW7A 3HT8A 5BR2A 1XJIA 1JGJA 3C7ZA 1L73A 184LA 3HAOA 3UTVA 1MGYA 2RAYX 198LA 169LA 2ZIYA 1S53A 230LA 5LZMA 4WAVA 1UCQA 1L54A 4DKLA 173LA 1L20A 2WJKA 2WJLA 3HTDA 4DAJA 3QBIA 1L39A 4PJZA 5H2MA 1C6QA 253LA 2F47A 4GRVA 1QTCA 226LA 3HU9A 2KS9A 3VI0A 3S8GB 1P7SA 1L49A 1L06A 2KSYA 2X72A 4XTOA 1BRRA 236LA 3HH5A 4ZPUA 165LA 3S8FB 2HPYA 1L64A 4A4MA 235LA 111LA 2EI4A 1L72A 1CV6A 3DMXA 201LA 2F95A 1L81A 1LN6A 3L64A 1DYDA 160LA 1G0LA 2ANVA 152LA 1QUDA 142LA 1C6BA 1S51A 3HANA 1P56A 2LC9A 256LA 1X0SA 4G7QB 241LA 189LA 3QJQB 4W54A 4G70B 4AMIA 3VVKA 1C67A 221LA 1L80A 1QKOA 4J4QA 3EH5B 211LA 3QDCA 232LA 196LA 3VG9A 1L33A 4I7QA 190LA 1L09A 1JV7A 1L55A 1SSYA 2RH1A 4QIDA 130LA 3EMLA 4I7TA 1L08A 1LI6A 1XEPA 3SB8A 227LA 3QJRB 5LWEA 3GUPA 118LA 2B6YA 237LA 3QJUB 1LYEA 1L95A 2QPEB 3UONA 1L30A 1L74A 5AWZA 4BWBA 252LA 215LA 115LA 1FBKA 1P36A 1C68A 1L35A 3UZAA 1G07A 1OV5A 1QM8A 3QBKA 5B34A 3HTBA 222LA 1L46A 5H2HA 1L70A 1IW9A 4PXKA 1L71A 1L53A 5G28A 1L0KA 2OE7X 1VJMA 3AM6A 3S3BB 2RBPA 3PQRA 4I7SA 1G0PA 225LA 3DN3A 4MD1A 2B72A 220LA 1EHKB 146LA 2I35A 4IARA 1L29A 1CU6A 3HDEA 1CX6A 4X31A 131LA 1CU2A 1PQDA 3SBBC 1KW5A 1P6YA 3CAPA 3OE0A 2B6XA 5AX1A 4W52A 1FBBA 2B7XA 2LCBA 1X0I1 3DDLA 3GUKA 4XXJA 1D2WA 1M0MA 3DQBA 1B6IA 5G2DA 1NHBA 2HUKA 4IB4A 2Y02A 1L16A 1L92A 1PQOA 3UTWA 1LI3A 3HUKA 5H2OA 1C6TA 1S54A 1K28A 1C66A 2CUUA 3A7KA 4UHRA 2O7AA 5G54A 5B6XA 3PDSA 3V2WA 5BR5A 4MQSA 1PQIA 1DYFA 4LDEA 1CV4A 186LA 1DYBA 1P64A 1C69A 1C3WA 2QPDB 4GPOA 2QARC 3AYNA 185LA 251LA 2OTZX 1L90A 2B74A 1QKPA 3QAPA 4I7PA 1D9WA 247LA 212LA 5H2IA 4HYXA 1L00A 126LA 3V2YA 3EH3B 1L07A 182LA 1SWZA 1D3JA 3GUMA 1C6MA 4WW3A 1SX7A 4EKPA 4KLYA 159LA 3CDTA 1LGWA 1L23A 2O79A 3SBAA 4L6RA 3VHZA 1HZXA 2KSAA 2QB0B 167LA 1QHJA 2L6XA 2B6ZA 3DKEX 2AT9A 5A8EA 109LA 191LA 2HULA 3JR6A 1LYFA 3HH3A 1S8JA 5B6VA 2NTUA 259LA 3CDRA 1TN0A 1L04A 1CV3A 1L38A 3SB5A 1SX2A 1L93A 180LA 245LA 1PXRA 4EIYA 4W56A 1XJUA 224LA 5F8UA 1G0QA 164LA 3P0GA 3C8RA 1PQMA 123LA 3RFMA 4MQTA 3C7YA 1L88A 1QT4A 3FA0A 3HH6A 1GUEA 2YDOA 3CDVA 3KJ6A 1KS3A 3NYAA 1R84A 5EN0A 228LA 1L76A 4JQ6A 3GUNA 1L87A 2OE9X 188LA 1L45A 1OYUA 3G3WA 1CV1A 1L17A 1L97A 1AT9A 1L18A 1CTWA 1LYIA 1ZYTA 2JAFA 5JJJA 1KNIA 218LA 5H2PA 2RAZX 1L89A 175LA 1C6DA 2RBOA 4ARQA 1C6FA 217LA 4ARQB 3ZPQA 4W51A 2B73A 1P8HA 1C64A 5A44A 140LA 1CX7A 4ARMA 3UZCA 1P3NA 4JR8A 5B35A 156LA 3UG9A 1L85A 1LYGA 3X3CA 4XTNA 1UAZA 1LYDA 2Z6BA 3G3VA 1L12A 2A4TA 3QAKA 1GU8A 177LA 2R4RA 4LDOA 1R2NA 119LA 2JAGA 4AQNA 1CWQA 1E12A 1IXFA 3DMZA 4FBZA 1C65A 4ARPA 1QSQA 2F93A 249LA 1QUHA 1BRDA 3QJSB 239LA 1L13A 1QTBA 181LA 6LZMA 5AZDA 3HARA 1U19A 1L67A 3G3XA 4L35A 3PWHA 1QT5A 3S3CB 1L77A 1L56A 1L03A 243LA 248LA 3UTXA 1LGUA 1OV7A 3VGAA 108LA 158LA 223LA 1S8LA 4YXAC 1KMEA 1C6EA 1QT3A 2O4WA 1EPYA 1P46A 4K5YA 4TL3A 1L40A 2NTWA 5JJNA 1F4ZA 4QI1A 1C63A 1LYJA 162LA 1CU5A 1L41A 4IAPA 3OAXA 3GULA 1L47A 1CVKA 125LA 4IAQA 5AHYA 3DN4A 219LA 1C6HA 1P37A 4W58A 1P5CA 216LA 4GYCA 155LA 1SWYA 2Z73A 3F9LA 1DYCA 4EKQA 1JV6A 5DHGA 2YCXA 3REYA 1C6PA 5I14A 1OVKA 1L19A 3CDOA 3GUJA 2VT4A 3C8QA 1L66A 3DN2A 4EKSA 3F8VA 4MD2A 1QUGA 3DN0A 1T8GA 4GP8B 1L14A 2YCYA 143LA 5DHHA 151LA 1L52A 1QS9A 1OVJA 3ZEVA 242LA 1CUQA 2YDVA 127LA 1C6AA 3LZMA 5AX0A 5G36A 147LA 1D3FA 3HAPA 3QJTB 1P8IA 3C7WA 1QUOA 1D3NA 1O0AA 4XTLA 5DYSA 5JJEA 4E97A 172LA 3CODA 1VGOA 120LA 3X3BA 150LA 1JQUA 1L94A 1L82A 2B6TA 4FAAB 1L15A 3K2RA 4EKRA 1KG9A 2Y00A 3NY9A 1P8UA 2Q9EA 1X0K1 4W59A 1G1VA 1L32A 5B6WA 4BUOA 4LZMA 1L9HA 4MBSA 1Q5IA 262LA 2Q9DA 4EXMA 4GP5B 1L84A 3FI5A 1L05A 3HTGA 4BV0A 197LA 1CV5A 1L79A 2B6WA 4FPDA 4I7LA 1G0MA 3C83A 250LA 2F2QA 171LA 104LA 1LPYA 2NTGA 2F32A 3DN6A 2BRDA 3HTFA 1LW9A 3HASA 210LA 1QTDA 2LNLA 3ODUA 195LA 2OEAX 4I7MA 1C8SA 1L48A 1G06A 1P2LA 2I21A 1L91A 3FADA 4XT3A 1T8AA 4OV0A 2OU0X 3UTYA 1QTVA 1DYAA 254LA 1CV0A 209LA 3HH4A 3HT7A 1BRXA 5G2CA 3C81A 1L58A 4HWLA 1C6JA 231LA 1L50A 3HUQA 3C8SA 1L36A 5H2JA 1L28A 4N4WA 1L27A 128LA 2B70A 1XMEB 1M0LA 4QRYA 2R4SA 1C6IA 1G0JA 4X1HA 1C62A 1L24A 1C6NA 1DYEA 3PXOA 1CU0A 4HYJA 2ZFEA 1JTMA 2RBRA 3DN8A 1L51A 246LA 2HUMA 3QJVB 149LA 5ITEA 4I7RA 5H2NA 3HWLA 258LA 1KY0A 3C9MA 4BVNA 1OWZA 5C1MA 229LA 1G0GA 1IW6A 141LA 1C6GA 1E0PA 2LZMA 4ARMB 5AHZA 1L44A 3SB9A 4I7JA 5B6ZA 4YX7C 4DJHA 1LWGA 2RBSA 5J7AA 3HDFA 3SB7A 1L25A 4KNFA 2RBQA 4W53A 3RUNA 4EPFA 163LA 1M0KA 3T45A 1PXSA 233LA 1H2SA 3MBVA 1L11A 1C6LA 2KSBA 113LA 1G0KA 1L10A 1L65A 255LA 103LA 3RZEA 1F88A 3HAQA 161LA 2OU8A 1KG8A 5B6YA 1S52A 206LA 1KY1A 1TN5A 1CU3A 178LA 3SB6A 3C82A 4XT1A 2RBNA 1CUPA 1I6SA 1TLAA 5KKHA 1D3MA 200LA 4ARLA 2RB0X 3HT9A 3VW7A 1L01A 5TGZA 1Q5JA 1C60A 5G2AA 1QT8A 2OE4X 1L34A 3ZPRA 1QT7A 1T6HA 2RB1X 1L99A 4I7NA 3CDQA 3NSBA 1GZMA 4BEZA 1T97A 1L57A 1DZEA 2OU9A 148LE 1L0JA 4I7OA 2ZZLA 3EH4B 1L86A 2RB2X 4Y9HA 240LA 3OE8A 2I20A 1L63A 1L31A 1C8RA 4GBRA 4JKVA 4GBRB 4PXFA 5H2KA 238LA 2ANXA 3NS0A 1L42A 1L0MA 122LA 4ARJA 4FA7B 4W55A 5A45A 1LYHA 1JFPA 5ETZA 4S0WA 3OE9A 1LGXA 2M3GA 157LA 3BVDB 1D2YA 2YCWA 1LI2A 1L83A 3DNAA 2Z55A 139LA 3ABWA 1JTNA 2YCZA 5B0WA 1ZURA 1T8FA 5G53A 3C80A 4EJ4A 145LA 1PQJA 2I1XA 2J4YA 1L37A 4OO9A 3SN6R 4BEYA 257LA 1KGBA 192LA 2Y04A 1L60A 112LA 2IGCA 2Y03A 4G71B 3DN1A 138LA 3QBGA 3GUIA 1L68A 176LA 4PK0A 3QBLA 5FJGA 2Y01A 1QSBA 3OE6A 234LA 205LA 4G72B 1SSWA 1WTHA 1XJTA 1QTZA 1C6CA 4NC3A 4AMJA 1L75A 1L43A 3L2XA 107LA 1L96A 1L26A 1LLHA 1QT6A 1XIOA 2B75A 1P2RA 1H68A 1QS5A 114LA 214LA 2L78A 3D4SA 3PBLA 4N6HA 3WQJA 144LA 4N4YB 213LA 1L98A 3HT6A 1L69A 1G1WA 4W57A 4YXCA 1PY6A 5B2NA 2G87A 3DMVA 4GP4B 3AYMA 1LWKA 137LA 4G7SB 3HU8A 2OTYX 4I7KA 1OVHA 174LA 4G7RB 5H2LA 1AP9A 110LA 3HUAA 1QTHA 1F50A 4LDLA 3COCA 7LZMA 5ITCA 1L61A 102LA 1OWYA 1PQKA 2NTHA 1L22A 187LA 168LA 1L21A 3S3DB 3GUOA 3C9LA 4X32A 4EA3A 4EPIA 170LA 1ZWNA 1C61A 244LA 4UG2A 3NY8A 183LA 1DYGA 1L02A 1BM1A 260LA 129LA 261LA 166LA 1L62A 199LA 1C6KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XJIA 3C7ZA 1GFTA 4TWSA 2XJWA 198LA 2BQBA 1S53A 230LA 5LZMA 3A6BY 3AZ5A 1KXXA 1L20A 2WJLA 3HTDA 5FHWA 4DAJA 1L39A 3P64A 4ZIXA 4H91A 2LYMA 5B1GA 3RT5X 3J6KA 3VI0A 1P7SA 4XJHA 1L06A 2KSYA 2F4GA 4XTOA 4DC4A 1BRRA 1CKDA 236LA 3HH5A 165LA 1LJFA 4ZPUA 3S8FB 6LYZA 4A4MA 111LA 1TCYA 1GWDA 4BS7A 1L81A 3TMUA 3WPKA 152LA 1QUDA 1NF5A 4ANRA 1S51A 2LC9A 1HHLA 1X0SA 4DS7E 221LA 1GBZA 3B6LA 3EH5B 1JKCA 1L55A 1B5UA 4J1AA 1XEPA 1D6QA 1NQIA 3GUPA 237LA 3EMSA 1L30A 3W6AA 1RE2A 1AKIA 252LA 1P36A 3UZAA 1G07A 1QM8A 3QBKA 1KIPC 1L46A 5H2HA 4UWVA 1UA6Y 1L53A 5G28A 1OUGA 2W1MA 3S3BB 2RBPA 4OOOA 4CJ2A 146LA 4G9SA 4X31A 5KXSA 3SBBC 1GE1A 1P6YA 5AX1A 1FBBA 2B7XA 4XENA 1GBYA 2HEEA 3N9EA 3AZ6A 3GUKA 1OUCA 1FBIX 1UBZA 3DQBA 1B6IA 5G2DA 1NHBA 4R6CA 4IB4A 2G4PA 1L16A 3UTWA 1LI3A 3HUKA 4NHIA 1C6TA 1GFJA 2Z38A 2CUUA 1C66A 4UHRA 5EBHA 1BVXA 3A94A 1IWXA 3WU9A 3AB6A 1DYBA 2VB1A 1P64A 1C3WA 2QPDB 1QIOA 2QARC 1OUJA 3AZ4A 4QY9A 1EQ5A 2B74A 1NBYC 2HUBA 1D9WA 212LA 2DQAA 5H2IA 126LA 182LA 3GUMA 1C6MA 4WW3A 3N9CA 1SX7A 4EKPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1Q5I A;  262L A;  2Q9D A;  4EXM A;  4GP5 B;  1L84 A;  3FI5 A;  1L05 A;  3HTG A;  4BV0 A;  197L A;  1CV5 A;  1L79 A;  2B6W A;  4FPD A;  4I7L A;  1G0M A;  3C83 A;  250L A;  2F2Q A;  171L A;  104L A;  1LPY A;  2NTG A;  2F32 A;  3DN6 A;  2BRD A;  3HTF A;  1LW9 A;  3HAS A;  210L A;  1QTD A;  2LNL A;  3ODU A;  195L A;  2OEA X;  4I7M A;  1C8S A;  1L48 A;  1G06 A;  1P2L A;  2I21 A;  1L91 A;  3FAD A;  4XT3 A;  1T8A A;  4OV0 A;  2OU0 X;  3UTY A;  1QTV A;  1DYA A;  254L A;  1CV0 A;  209L A;  3HH4 A;  3HT7 A;  1BRX A;  5G2C A;  3C81 A;  1L58 A;  4HWL A;  1C6J A;  231L A;  1L50 A;  3HUQ A;  3C8S A;  1L36 A;  5H2J A;  1L28 A;  4N4W A;  1L27 A;  128L A;  2B70 A;  1XME B;  1M0L A;  4QRY A;  2R4S A;  1C6I A;  1G0J A;  4X1H A;  1C62 A;  1L24 A;  1C6N A;  1DYE A;  3PXO A;  1CU0 A;  4HYJ A;  2ZFE A;  1JTM A;  2RBR A;  3DN8 A;  1L51 A;  246L A;  2HUM A;  3QJV B;  149L A;  5ITE A;  4I7R A;  5H2N A;  3HWL A;  258L A;  1KY0 A;  3C9M A;  4BVN A;  1OWZ A;  5C1M A;  229L A;  1G0G A;  1IW6 A;  141L A;  1C6G A;  1E0P A; 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 4W55 A;  5A45 A;  1LYH A;  1JFP A;  5ETZ A;  4S0W A;  3OE9 A;  1LGX A;  2M3G A;  157L A;  3BVD B;  1D2Y A;  2YCW A;  1LI2 A;  1L83 A;  3DNA A;  2Z55 A;  139L A;  3ABW A;  1JTN A;  2YCZ A;  5B0W A;  1ZUR A;  1T8F A;  5G53 A;  3C80 A;  4EJ4 A;  145L A;  1PQJ A;  2I1X A;  2J4Y A;  1L37 A;  4OO9 A;  3SN6 R;  4BEY A;  257L A;  1KGB A;  192L A;  2Y04 A;  1L60 A;  112L A;  2IGC A;  2Y03 A;  4G71 B;  3DN1 A;  138L A;  3QBG A;  3GUI A;  1L68 A;  176L A;  4PK0 A;  3QBL A;  5FJG A;  2Y01 A;  1QSB A;  3OE6 A;  234L A;  205L A;  4G72 B;  1SSW A;  1WTH A;  1XJT A;  1QTZ A;  1C6C A;  4NC3 A;  4AMJ A;  1L75 A;  1L43 A;  3L2X A;  107L A;  1L96 A;  1L26 A;  1LLH A;  1QT6 A;  1XIO A;  2B75 A;  1P2R A;  1H68 A;  1QS5 A;  114L A;  214L A;  2L78 A;  3D4S A;  3PBL A;  4N6H A;  3WQJ A;  144L A;  4N4Y B;  213L A;  1L98 A;  3HT6 A;  1L69 A;  1G1W A;  4W57 A;  4YXC A;  1PY6 A;  5B2N A;  2G87 A;  3DMV A;  4GP4 B;  3AYM A;  1LWK A;  137L A;  4G7S B;  3HU8 A;  2OTY X;  4I7K A;  1OVH A;  174L A;  4G7R B;  5H2L A;  1AP9 A;  110L A;  3HUA A;  1QTH A;  1F50 A;  4LDL A;  3COC A;  7LZM A;  5ITC A;  1L61 A;  102L A;  1OWY A;  1PQK A;  2NTH A;  1L22 A;  187L A;  168L A;  1L21 A;  3S3D B;  3GUO A;  3C9L A;  4X32 A;  4EA3 A;  4EPI A;  170L A;  1ZWN A;  1C61 A;  244L A;  4UG2 A;  3NY8 A;  183L A;  1DYG A;  1L02 A;  1BM1 A;  260L A;  129L A;  261L A;  166L A;  1L62 A;  199L A;  1C6K A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3GUK A;  1OUC A;  1FBI X;  1UBZ A;  3DQB A;  1B6I A;  5G2D A;  1NHB A;  4R6C A;  4IB4 A;  2G4P A;  1L16 A;  3UTW A;  1LI3 A;  3HUK A;  4NHI A;  1C6T A;  1GFJ A;  2Z38 A;  2CUU A;  1C66 A;  4UHR A;  5EBH A;  1BVX A;  3A94 A;  1IWX A;  3WU9 A;  3AB6 A;  1DYB A;  2VB1 A;  1P64 A;  1C3W A;  2QPD B;  1QIO A;  2QAR C;  1OUJ A;  3AZ4 A;  4QY9 A;  1EQ5 A;  2B74 A;  1NBY C;  2HUB A;  1D9W A;  212L A;  2DQA A;  5H2I A;  126L A;  182L A;  3GUM A;  1C6M A;  4WW3 A;  3N9C A;  1SX7 A;  4EKP A;  3CDT A;  1B5X A;  2KSA A;  1QDR A;  2QB0 B;  167L A;  1QHJ A;  4DT3 A;  5A8E A;  191L A;  2HUL A;  1YKZ X;  3WUN A;  5B6V A;  133L A;  259L A;  2BQJ A;  3CDR A;  5E4P A;  3SB5 A;  1L38 A;  1LZ6 A;  4EIY A;  2BLY A;  1XJU A;  224L A;  4B0D A;  164L A;  1PQM A;  4MQT A;  1LJH A;  1QUT A;  1L88 A;  5APC A;  3KJ6 A;  2CDS A;  3BKV A;  1GF9 A;  3GUN A;  2OE9 X;  188L A;  1JWR A;  1GAZ A;  1AT9 A;  1L97 A;  1GFG A;  5JJJ A;  2YBI A;  2MEI A;  1C6D A;  2RBO A;  2AUB A;  4GN3 A;  4ARQ A;  3ZPQ A;  2BQG A;  1C64 A;  3UZC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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