4GT5A

Crystal structure of the inactive trka kinase domain
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
296
structure length
290
Chain Sequence
SDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPDKMLVAVKALKESESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Assessing the range of kinase autoinhibition mechanisms in the insulin receptor family.
pubmed doi rcsb
molecule keywords High affinity nerve growth factor receptor
total genus 89
structure length 290
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4gt5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4gt5A01
4V01A 5FGKA 5CNNA 2XNOA 1OBDA 3COHA 2XRWA 2GTNA 3FAAA 4F1TA 2HXLA 5EYDA 4Y95A 3KL8A 4BDBA 5CF5A 5IMXA 2UW3A 4FSTA 2GQRA 4AGDA 4FSZA 3VS4A 2XJ1A 2GU8A 2XIXA 2YDJA 3I7CA 5I0BA 5DFPA 3VUGA 4C3FA 5HBEA 4RWIA 5JFXA 1XBBA 4XHKB 2E2BA 1QPJA 2C3IB 2UUEA 2X6EA 4FV7A 5A4TA 3W8QA 3G6HA 3U6HA 4RRVA 5IUGA 4BDAA 3NIEA 5DGZA 3WZKA 5TR6A 4KBKA 1FVRA 2OK1A 3OCTA 3T9IA 3NUXA 2ITUA 4NW6A 1KE9A 4HYIA 4DN5A 4JI9A 4L00A 2HK5A 4RVMA 3CXWA 2R9SA 3U87A 3WIKA 4U3ZA 5HCZA 4PRJA 5TOZA 3KVWA 4H36A 4JG8A 3II5A 2P55A 2BIKB 2WQOA 3EFKA 4O7VA 2XF0A 3DZQA 3PLSA 3R83A 3LCKA 2F57A 2OGVA 4AOJA 5FXRA 3NUNA 1E1VA 3DNEA 3W2RA 2F7ZE 4UX9A 2J90A 2BKKA 1VEBA 3R8PA 1OIRA 3ZUVA 4YHFA 3ZUTA 4F0GA 1JSTA 2W9FB 2ZDUA 3ZFYA 4S34A 4RVKA 4D0XA 3EL8A 3Q6UA 5AADA 4FVRA 3UPXA 3QAME 2CCHA 4YPDA 3VUIA 4O1PA 3S95A 4ZSJA 2R3JA 3REPA 5IA0A 1RW8A 3CP9A 3ZRMA 5I9ZA 3HMMA 3MIAA 5CANA 3HV7A 4FZ6A 4MQ1A 4D5KA 3GCUA 2W05A 3K3IA 4XH6A 3KGAA 5KHWA 1ERKA 1R1WA 1MUOA 1WAKA 3CKWA 3FI3A 3R7GA 4XP2A 4F6SA 5IA3A 3A4PA 5CAPA 3QRIA 4E6AA 4C33A 3EKKA 3U4WA 3DOGA 4L67A 3AC4A 5DE2A 4C8BA 3I1AA 2BZKB 2XNEA 4JXFA 4YZNA 5EW3A 4E6QA 3LMGA 4RJ5A 1GNGA 1QMZA 3C5IA 4MWIA 2VTPA 4R7IA 4GG7A 2OIQA 4XBUA 4AT5A 2VO3A 2C6OA 3RK9A 3LJ1A 2X4ZA 2X9FA 2JFLA 2YM7A 4UZHA 2NO3A 2PMLX 4Q2AA 2W1DA 3NCGA 2O0UA 2O5KA 3VBVA 4IADA 4DC2A 4EK5A 2OFVA 5K4JA 5LWNA 3FL5A 2IJMA 2QVSE 5JKGA 5H8BA 3UMXA 1Q4LA 2C6IA 3O0GA 3QGYA 4BI2A 4ZY5A 5H3QA 2ZM3A 5E1EA 4RZWA 1H0WA 2XRUA 4RLLA 4FTNA 3WF5A 4DH7A 4PMTA 1AGWA 5IF1A 3IKAA 2VTRA 1ZXEA 4JLCA 4OAUC 4I92A 3RALA 4BHZA 3TI1A 4QYHA 4GUBA 3ZLYA 4QRCA 5ACKA 4DBNA 3BLQA 4FKSA 3GB2A 2HELA 2R7BA 3RZFA 4WUNA 3ZO4A 3SG8A 3UO5A 3DZOA 4PWNA 2G1TA 4L43A 3ZSIA 2R3KA 5GZ9A 5D41A 5HE1A 3UIUA 5CF4A 4O86A 2JIVA 5AUYA 4OBOA 2XKCA 1O6LA 5BVOA 4JBQA 3WZJA 2IVVA 5IEYA 4DG3E 2WQMA 1YKRA 4YTHA 4MVFA 3BLRA 5FDPA 5CVGA 2W9ZB 3LCTA 4K8AA 3A61A 4V05A 3P23A 5E8VA 2FYSA 4XOZA 3BE9A 3BEGA 4YZDA 3FDNA 3ROCA 2JEDA 1PRYA 4J53A 5F95A 4JIAA 3LLTA 4QMXA 1KE8A 2OZAB 3KMUA 4WA9A 3L1SA 4DEDA 4EOQA 1XWSA 1XH8A 3LFBA 1YI4A 3QALE 5F1ZA 4HVHA 1WZYA 3SOAA 4MXOA 1S9IA 4RBLA 4XG4A 5L2QA 2GCDA 2VTIA 3KY2A 3VQUA 4O2ZA 3QCYA 3ZLXA 1SNXA 2I0VA 4Q5HA 2W5AA 4MKCA 1URCA 4AN9A 3OHTA 2X2LA 3FMJA 2UZBA 4MNEA 4RIXA 5BMSA 2HENA 2XP2A 3TG1A 4FA2A 4LRMA 4HNIA 3LFEA 5IQEA 4DTBA 2B7AA 3CR0A 5HTCA 5I3RA 2B52A 3NUSA 5BVEA 4UMPA 5IA1A 2VO0A 2WZJA 3OXIA 3H0ZA 3HECA 4FNYA 2QHNA 1CKJA 4JVGA 5F94A 5EDQA 1WVXA 1PXJA 4ALWA 4DG0E 2ZV9A 2XK3A 3RTPA 1JOWB 2B1PA 3F3TA 4BCIA 4QP1A 3UJGA 3PDTA 4TKSA 4M97A 3KF4A 4IC8A 4CKRA 3BU5A 5AX3A 3AGMA 2UVZA 4UWYA 3RAKA 4D4VA 4WBOA 4G5JA 3FEGA 3VQHA 2O8YA 4HPUE 3R22A 3FBVA 4O2PA 3MFRA 1B39A 1U54B 3EB0A 3NIZA 3RJCA 3OZ6A 2R3RA 3KKVA 4YURA 2VAGA 5EQPA 4AS0A 2OU7A 5IA4A 4MXCA 3Q04A 2XS0A 3GU8A 3MPAA 4FICA 3QRUA 4NM5A 3C0IA 2RSVA 1BMKA 3I5ZA 3QQLA 1L3RE 4OT6A 4X3FB 4P2KA 4C02A 4ACHA 1KE7A 4BCMA 2F7XE 5HICA 5FTGA 1W7HA 2UVYA 1REKA 4TY1A 5FLFA 3VNTA 4EH3A 3LXLA 4RZVA 3DA6A 4J1RA 1GY3A 2CGWA 3FV8A 3UODA 3W55A 4E6DA 3KU2A 2OIBA 3GFWA 4GJ3A 4M12A 3E3PA 3IDPA 4FC0A 3F82A 4JJRA 4PP9A 3VO3A 4YZBA 3WF8A 3DFAA 3U51A 2FSTX 1Q3DA 4EBVA 4FX3A 2PMOX 1IAJA 2YIRA 3UIMA 1IRKA 1ZZLA 1PMNA 4N4SA 4ASDA 4ZLYA 2XK7A 4DFXE 2UVXA 4BCJA 5AIRA 5CI6A 1CMKE 5JT2A 5AR3A 5HE3A 4MD9E 4EWQA 5CEOA 2JBOA 4F9AA 4U45A 4D9UA 2C6KA 2ETKA 3CCNA 4FK3A 4FTRA 4ZTRA 3AMYA 5I5ZA 1JNKA 1YXTA 2PVHA 4DFZE 3O8PA 3NYXA 4BCQA 2F4JA 4UY9A 3RKBA 3ZBFA 2PUNA 3S1HA 3P7AA 5KBRA 2WTWA 4MXYA 4YNOA 4UV0A 5EH0A 3ZU7A 1BI7A 1SMHA 4LOOA 4A9UA 3RK5A 3B2TA 3FXZA 3KXGA 4ZTSA 2Y6OA 4O0VA 4OR5A 3R7YA 3UYTA 2P33A 4BYJA 4O7ZA 4WG5A 2ERZE 1Q8ZA 5FRIA 5IMEA 4BCNA 4EL9A 4O96A 3PXZA 4YJNA 3HP2A 4UXQA 4Y5HA 4F9WA 2EU9A 2ESMA 4FKQA 5M4CA 3MIYA 4O1OA 3LCDA 2A0CX 4X2GA 5EYMA 1YWRA 5EKOA 1TQMA 1UNGA 2I6LA 3A2CA 3MJ2A 4JX3A 5FDXA 2OO8X 3TV7A 3WF6A 4CT2A 3EYHA 5HESA 4PNKA 4ZOGA 3MVJA 3UBDA 5EKNA 5L2TA 4U6RA 3MTFA 5CEPA 2R3PA 2XCKA 1LEZA 4D2TA 2BKZA 4E7WA 3OT8A 1UNHA 2CGUA 2YAAA 5AP1A 3K5VA 3IONA 4XS2A 3CPBA 4E1ZA 4YLKA 2HY0A 4ZZNA 5CAVA 1F5QA 5M4IA 1STCE 1YOJA 3DJ5A 4IX3A 5CQWA 2C6TA 3ZLSA 3I5NA 4AXAA 2XUUA 2WOTA 3QX2A 3D7ZA 5HE2A 2P4IA 4BB4A 4O0UA 3SXSA 3BWJA 4MXZA 1FVTA 2CN5A 5L3AA 3MV5A 3PYYA 3OW4A 4W4VA 3BV2A 4BDHA 5L6PA 5HD7A 3OROA 4YZ9A 3RWQA 4ITHA 5KX8A 4M68A 4NWMA 3CGFA 4R78A 4WOVA 4IAAA 3H0YA 4FT9A 1OITA 4D2PA 3FKLA 5HU3A 3BZ3A 1FQ1B 2FA2A 3O7LB 5E91A 5H2UA 1OL6A 3M2WA 5JFWA 3CQUA 4RLKA 2BALA 4FV2A 5GIPE 4IX4A 4I3ZA 4U43A 4HJOA 3ALNA 3ZM4A 2ZDTA 1GZNA 4C4GA 4F09A 2HZNA 1VJYA 4QMZA 4R7HA 5JK3A 3ID6C 4IJPA 3PVBA 3BI6A 3GQLA 4QQTA 5IA2A 3N4TA 3AD6A 3W16A 3VUHA 1IAHA 3SLSA 4JAJA 3AGLA 5CT7A 3I0QA 4F64A 1YXXA 2YLEA 2C0TA 1GZOA 1PYEA 2Y0AA 4FZ7A 3ZXZA 3MESA 3W2QA 2GFCA 4KKEA 5TT7A 1Q8TA 5HTIA 3MTLA 3FSKA 4TYJA 1YWNA 2VWYA 5LVMA 2YDKA 2NNWB 5A14A 3AC2A 3PIYA 4X6RA 3G2FA 3FY2A 3MBLA 2XNBA 4M69A 4RPVA 4IZ5A 2ZMDA 3Q2MA 4QP3A 3IS5A 4JG7A 4FL3A 5AR8A 3VS1A 4AGWA 3NW7A 4WT6A 2XYNA 3RBWA 1IG1A 1UU8A 3COKA 3U55A 1J1BA 2EUFB 4NK9A 4JQEA 2ZJWA 3GC9A 2ITOA 2A2AA 1KE6A 2O65A 4J98A 3F3WA 4C3PA 3S00A 1PHKA 4MAOA 3MI9A 3QGWA 2QO9A 4LI5A 2YM6A 4Y73A 1PKDA 3P79A 2FB8A 4YBKA 2C6MA 3ALOA 3QTWA 4YJTA 1ZARA 2YM5A 4V0GB 4BIEA 3NNXA 4RJ6A 3E7VA 3LZBA 4DLJA 5AP7A 2QG5A 4LL5A 4DITA 5J79A 1GZKA 4UYAA 3NNUA 1NA7A 3NUPA 5KHXA 3ZO2A 1BLXA 2VTLA 2E9VA 4KB8A 3ZCLA 2I1MA 3OXTA 3EN4A 4Z7HA 3LXPA 2QHMA 2RFEA 1F3MC 4ITIA 1JBPE 2FSLX 2OZAA 4G1WA 1ZAOA 4GSBA 4JL9A 5C27A 2QI8A 1S9JA 3L8SA 2H34A 3RAIA 2PWLA 4KBAA 4CFUA 1SVEA 4GYGA 4X21A 3BGQA 3HUCA 5TO8A 4FEWA 4IDVA 2GNFA 1J7LA 3KREA 4GW8A 3PUPA 4UB7A 2WTJA 1PMVA 4F9BA 5IQCA 4ERKA 4QTEA 3HMIA 4EOPA 4X2NA 4CV8A 4E8AA 4ZZMA 3ENHA 5LMKC 5HBJA 4AGUA 4XV1A 3KCKA 2ITNA 4J52A 5AFVA 4GUEA 1UV5A 3C4WA 4DT9A 5L2IA 1SM2A 4LUDA 3QFVA 3QX4A 4J71A 5B2LA 3ZONA 5LARA 4XYFA 5CSPA 1ZWSA 4IC7A 4XG2A 3R01A 2GMXA 5EM6A 4ACDA 4C4JA 5L8KA 3BU6A 3D14A 1G8AA 4NT4A 2XNMA 5JFSA 4FSWA 4DEBA 2XEYA 3BWFA 5CAUA 4L01A 5BVDA 3TN8A 3GU5A 5EOLA 2ITVA 3FSFA 2GQSA 2WMXA 1IA8A 1M2PA 4G34A 4EWHA 3ITZA 5IZFA 3CEKA 3LM0A 2XK4A 4O0WA 5FTOA 4IB3A 4E5WA 4Y5QA 3V8SA 4EUTA 5L8LA 5IKWA 4IB5A 2PVYA 4D1SA 4BGGA 5J7HA 2PTKA 3V6SA 4W8DA 3BBWA 2I0EA 2OW3A 4FIGA 4FV9A 5A4CA 5KMJA 3B2WA 4TZRA 3NUYA 4IW0A 2WD1A 3G90X 3NW6A 4BTFA 3GCSA 2BRNA 3NS9A 3ANRA 3LXNA 3O71A 4LM5A 3FMNA 3ZTXA 3TM0A 3F61A 5HD4A 3AD4A 3LE6A 2V22A 3DKGA 1NVQA 2ZM4A 5M51A 5J9ZA 4EH2A 2CNVA 1Q3WA 5CASA 3GOPA 3VRZA 2Y6MA 4AP7A 4R5SA 5BUIA 4BDKA 1J7UA 5D1JA 3PJCA 2UW8A 4G3GA 4NH1A 3NLBA 4RIWA 4QYYA 3TKUA 4BCKA 4D58A 2F7EE 2OBJA 5IEXA 2C47A 3LW0A 2HW7A 3WARA 2CCIA 5C8MA 4U0IA 4BFMA 3D5XA 3LCSA 4WNPA 2GDOA 4EK8A 3S0OA 1ATPE 4E5AX 2IZTA 4HGTA 4H3QA 2C69A 1WVWA 3MH1A 1CSNA 4WUAA 3VBTA 3R7VA 4AN2A 5IH5A 3LM5A 1V0OA 4FKUA 4EOKA 5M06A 2QOBA 4JDKA 4M67A 3SQQA 4R7BA 2YIQA 3SA0A 1MQBA 4TYGA 5ANKA 3ATTA 4AW0A 4BKZA 5CAOA 3C0HA 3K5UA 3KRWA 3NUAA 2HZ0A 4JR7A 1YXUA 4I23A 5BPYA 3NAXA 2WTKB 5LCKA 4YJPA 4KABA 4BDFA 3QHRA 4FG7A 5DG5A 3PXYA 5A4LA 2VNYA 3RNIA 4B7TA 4YJQA 3HA8A 3MFSA 4K33A 1CTPE 4IWQA 2VWZA 3F69A 2E9NA 2IVUA 3LQ5A 5DNRA 5LMAA 3FLSA 1W84A 4EEVA 5JRSA 3Q52A 4TYHB 4D55A 4DCAA 4M8TA 5KBQA 5GINE 4FUXA 3TIZA 4BYIA 3QCXA 1R0PA 5M56A 3RPVA 4UMUA 4U97A 3PTGA 3FJQE 5HX6A 5DT0A 3LFNA 5K9IA 4WRSA 4S33A 3E88A 4QYFA 1SVHA 3RK7A 3BV3A 3HMPA 3KF7A 3RM7A 4PL3A 2YCQA 3R28A 2EVAA 3A99A 5AAEA 2PUUA 3OY1A 1YHWA 2VWWA 4FV4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4V01 A;  5FGK A;  5CNN A;  2XNO A;  1OBD A;  3COH A;  2XRW A;  2GTN A;  3FAA A;  4F1T A;  2HXL A;  5EYD A;  4Y95 A;  3KL8 A;  4BDB A;  5CF5 A;  5IMX A;  2UW3 A;  4FST A;  2GQR A;  4AGD A;  4FSZ A;  3VS4 A;  2XJ1 A;  2GU8 A;  2XIX A;  2YDJ A;  3I7C A;  5I0B A;  5DFP A;  3VUG A;  4C3F A;  5HBE A;  4RWI A;  5JFX A;  1XBB A;  4XHK B;  2E2B A;  1QPJ A;  2C3I B;  2UUE A;  2X6E A;  4FV7 A;  5A4T A;  3W8Q A;  3G6H A;  3U6H A;  4RRV A;  5IUG A;  4BDA A;  3NIE A;  5DGZ A;  3WZK A;  5TR6 A;  4KBK A;  1FVR A;  2OK1 A;  3OCT A;  3T9I A;  3NUX A;  2ITU A;  4NW6 A;  1KE9 A;  4HYI A;  4DN5 A;  4JI9 A;  4L00 A;  2HK5 A;  4RVM A;  3CXW A;  2R9S A;  3U87 A;  3WIK A;  4U3Z A;  5HCZ A;  4PRJ A;  5TOZ A;  3KVW A;  4H36 A;  4JG8 A;  3II5 A;  2P55 A;  2BIK B;  2WQO A;  3EFK A;  4O7V A;  2XF0 A;  3DZQ A;  3PLS A;  3R83 A;  3LCK A;  2F57 A;  2OGV A;  4AOJ A;  5FXR A;  3NUN A;  1E1V A;  3DNE A;  3W2R A;  2F7Z E;  4UX9 A;  2J90 A;  2BKK A;  1VEB A;  3R8P A;  1OIR A;  3ZUV A;  4YHF A;  3ZUT A;  4F0G A;  1JST A;  2W9F B; 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