4GWFA

Crystal structure of the tyrosine phosphatase shp-2 with y279c mutation
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
534
structure length
497
Chain Sequence
b'TSRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEGQLKEVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRCKNILPFDHTRVVLHDGDPNEPVSDYINANIIMPEKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQKS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
publication title Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with Y279C mutation
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 157
structure length 497
sequence length 534
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2012-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4gwfA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4gwfA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4gwfA03
2CNFA 1CWEA 1LCJA 2P6XA 3V0EA 5K9VA 3O4UA 1BFJA 2OUDA 3N0AA 1JU5A 3KFJA 4H34A 1U25A 3EU0A 1SHDA 1D5RA 3V0GA 5BZZA 2DX0A 5DC9A 1FPZA 1NL9A 3VS4A 1OESA 2QBSA 2EL8A 1O46A 2H46E 3EB1A 3QCFA 5AWXA 2AZRA 3OV1A 2PSZA 3A5KA 4Y14A 3IN7A 1D1ZA 1O4NA 3MAZA 1FPRA 1M3GA 1P15A 4YR8B 1OO3A 2C0IA 1TZEE 2H4GA 1UUSA 3D44A 2I6IA 1T49A 2QMSA 1AYCA 2C9WA 3IMJA 2QBPA 3O5XA 2ABLA 5KACA 1FU6A 4J51A 2B4SA 2EOBA 1RQQC 2I4EA 5BUGA 5EHPA 2B4UA 2P4DA 1O4QA 1R1PA 2VIFA 3PFVA 4L1BB 4ZN5A 2I6JA 4RDDA 2CM7A 2VEVA 3S3EA 1G1HA 3F81A 4JBCA 2G59A 4OHDA 1R1QA 3MOWA 1QADA 3OMHA 3CWGA 2AUGA 1D4TA 2VEYA 1OHCA 1PA1A 3QCLA 2GWOA 3I80A 1A81A 2FJMA 2DXPA 3D42A 5KA9A 1Q6JA 3S3KA 2HDXA 5MMZB 2CMCA 4QUNA 5HKYA 5KADA 1FYRA 3IN8A 1G1FA 2CI9A 1R6HA 1O4IA 1O4GA 1LKLA 4HRFA 5BZXA 2CBLA 4JEGA 5K24A 1AOTF 1O4PA 1F1WA 2CJZA 2QCJA 1Y57A 2HB1A 3V0HA 4JGHA 4A4BA 1CSZA 4D3QA 2AHSA 4JMKA 2L6KA 3MXCA 4TVVA 1BMBA 2EU0A 1YTNA 4RH5A 2HCMA 3O4SA 3QKQA 2C0OA 2E0TA 1BHFA 2M3VA 2PNAA 1C87A 2OC3A 2Y96A 3M7FA 1NWLA 4DGPA 1OEMX 4QSYA 2QDMA 3ZV2A 1O4RA 4RHGA 5KA0A 1M61A 1O42A 3D1QA 1OPKA 3VS6A 1XRIA 2F70A 5I6VA 5KA4A 5AULA 3OP0A 1IS0A 2NZ6A 3D9CA 3QCCA 3QCHA 3VRPA 2CMAA 2KK6A 2I3RA 3SR9A 3EMUA 4PVGA 1Q1MA 1PTUA 4R30A 1Y1UA 2HC2A 1ONZA 3H2XA 1O4MA 5EELA 5J8RA 5M43A 2WGPA 1TCEA 2VEUA 2PLEA 4NNDA 4EY0A 1G4US 4GS0A 3CD3A 4KYRA 2I6MA 1LKKA 3ZNIA 2IUHA 1Q6MA 1G7FA 3OB2B 2CM8A 1LUIA 5HKWA 3UF4A 3BLTA 1O4LA 4BPCA 1FBZA 2PT0A 4P9ZA 3S3HA 2OZ5A 1L8KA 3VS0A 1A08A 1A1EA 5KA7A 1YGUA 2YU7A 4K44A 4I8NA 3MMJA 1OETA 1Z3KA 3QCNA 2B07A 3HIZB 1QXKA 1ZCLA 1ZCKA 1M27A 1BKMA 1Q6NA 2I3UA 2IMGA 2QCTA 5IBMA 2A8BA 4RKKA 2FH7A 3SMEA 1A1CA 4D8KA 4U1PA 1WCHA 4GFVA 4R0SA 3F99A 2EYZA 1OPLA 4JE4A 3N7YA 1U24A 3M4UA 1MKPA 4GE2A 4JNBA 1YTWA 2F6ZA 2HNQA 2CFVA 4RI5A 3BLUA 3VGOA 3VRYA 4OHHA 1SHAA 2NV5A 4R0TA 3PQZA 3VS5A 4GE5A 2QDCA 1YVHA 3ZMQA 4D3PA 2ECDA 1GFYA 2RORA 3S3FA 1OO4A 5GJHA 2OZOA 2F6VA 2CNEA 1SKJA 2HMHA 4OHLA 3QCGA 2SHPA 1C85A 2J16B 1YVLA 3OVEA 2FCIA 4GRYA 4BJOA 3ZM3A 1XBOA 3BUWB 1AYDA 1K9AA 1QG1E 3I7ZA 2BV5A 4WU3A 2C46A 3N8MA 2HXPA 1O4BA 2PI7A 5EG3B 1IJRA 2CR4A 4F5BA 1JLNA 2NT2A 2QBQA 5GTJA 1PTVA 3CWEA 1WQUA 2QBRA 1R1SA 1V3AA 1CWDL 1YFOA 1KAVA 1BFIA 1X6CA 1PXHA 1WAXA 4GRZA 3GXWA 1YTSA 5KA8A 1U26A 4KI9A 3ZM2A 2BBUA 1P13A 2QEPA 1AYAA 1O4OA 2IUGA 5K9WA 3AWFA 3GXHA 2EO6A 1QZ0A 2LQWA 1EENA 3VRRA 2LNWA 3EAZA 2ETZA 1CJ1A 1D4WA 1WRMA 2B3OA 1KAKA 2HUWA 2GSBA 2I6PA 3PJPA 1LUMA 4D3RA 2LCTA 3PS5A 1AYBA 3UYOA 1O4KA 4E68A 1NRVA 1G83A 4H1OA 3I36A 1KC2A 3VS3A 2HC1A 2GE9A 2CM2A 4F5AA 1BM2A 5K25A 1SUGA 3ZM0A 3GXXA 4E93A 1Q6TA 2H4KA 3F41A 2F6FA 1B47A 3MXYA 1BZHA 1Q6PA 5KABA 1C88A 2QDPA 4MBBA 1ECVA 2SRCA 1RJAA 2BZLA 3VS7A 1JYRA 1BHHB 1I9TA 2PBNA 3GXGA 4GFUA 1JWOA 1RPMA 3EZZA 1A1BA 1PYNA 2Y2FA 1LARA 3CM3A 1SHBA 3EAXA 2I4GA 3ZMPA 4YAAA 2NLKA 4QBWA 2DCRA 4GPLB 3CXLA 1YN9A 2JJDA 5GJIA 2PQ5A 1F2FA 1GRIA 3O4TA 3S4EA 3QCDA 2IUIA 2F71A 1BG1A 2I42A 3AWGA 5IBSA 4WU2A 1LQFA 3RO1A 1BZJA 4F59A 1XA6A 2J16A 2BGEA 4QUMA 3NHNA 2R0BA 5D0JA 4HJQA 1MW4A 1ZFPE 2I75A 2CNGA 4NYHA 2HCKA 5DC0B 4QAPA 1OEUA 3RZ2A 5EHRA 1O4AA 1NO6A 2B4OA 1VHRA 3OB1B 1HCTB 1O4CA 2K7AB 4ZRTA 1Q6SA 3QCJA 2HDVA 2BGDA 2LQNA 1KA7A 1YPTA 2GP0A 4U17A 3US4A 2H5KA 1PH0A 2LNXA 1BZCA 1FQ1A 3AWEA 3CBLA 3BRHA 2H03A 2Y1NA 3K2MA 1ONYA 1YZ4A 5BO4A 4DGXA 1PTTA 2ESBA 5CDWA 1FU5A 1NZLA 3TKZA 3VRZA 3V0IA 1G1GA 4XZ1A 5KAZA 2I5XA 1ZZWA 2CI8A 4K2RA 5K22A 2EYYA 2C7SA 5LXQB 3GQIB 1O4DA 4M4ZA 4NWFA 1RXDA 2C0TA 5K23A 3IMDA 3D1OA 1HCSB 3PSKA 1FBVA 1JYQA 3EACA 3HHMB 2MRJA 2A3KA 3QCKA 1O47A 1GHUA 2AOBA 2B49A 1KA6A 3ZM1A 1PICA 2Y1MA 1A5YA 1T4JA 2I6OA 1UURA 1BHHA 1AOUF 2EYVA 3U96A 3O3LA 1KSWA 2CIAA 1O45A 2Q05A 4EIHA 2MBCA 2CM3A 4GWFA 4Y2EA 4FL3A 3VS2A 3QWYA 1OHDA 2BIJA 2NT7A 2CNHA 1O4HA 3QCIA 4Z6BA 2EO3A 2YSXA 1AD5A 2PTKA 4A4CA 1LUKA 1X24A 4JMJA 4ROJA 3F9BA 2XP1A 3VRQA 4RI4A 1BKLA 2I4HA 3LJ8A 1G7GA 3RGQA 1O4FA 3NMEA 4XZ0A 2CMBA 3A5JA 4K45A 3V0DA 4B04A 4WTYA 2F6WA 2F46A 3RGOA 3BM8A 5DC4A 2CS0A 3BUMB 1OHEA 2DLZA 5AXIA 1H9OA 5EEQA 2ZN7A 1JF7A 2B4PA 1BLJA 3T04A 2PNBA 1LUNA 2MQIA 3S8NA 1RPYA 1AAXA 2EKXA 4ERCA 4HJPA 2DM0A 2DLYA 3B7OA 4AZ1A 1XM2A 1LYVA 4GL9E 3QWXX 1C84A 5HDEA 3VRNA 4LUEA 4ZI4A 5J3XA 1QCFA 2Q47A 4P9VA 2AOAA 1NZVA 1ZC0A 4S0GA 4NWGA 3WA4A 2Y3AB 3OLRA 5KA3A 1O41A 1GWZA 2H4VA 1PA9A 4QAHA 2ZMMA 1EEOA 1O43A 2KNOA 4LUDA 5KA2A 2HY3A 1O44A 1FMKA 2MC1A 2HVLA 4RH9A 3QCEA 2RF6A 4WWQA 2FJNA 2F6YA 5KA1A 2PLDA 3S8OA 3S9KA 2OOQA 4QBEA 2G6ZA 2MRKA 2DVJA 1J4XA 1O49A 1CSYA 1C83A 2RSYA 3TL0A 2F6TA 2L3TA 4NX8A 3QCBA 1BF5A 2PA5A 1SPSA 4X6SA 1MILA 4ICZA 5KAAA 4TZIA 3N84A 2CRHA 3BKBA 1A07A 2MK2A 1I9SA 3BUXB 2I1YA 4GE6A 3QCMA 2YDUA 3D1HA 1LCKA 2H04A 2HNPA 2K79B 2VEWA 2RVFA 1FHSA 2NTAA 1A09A 4OHIA 1O4EA 1T48A 1O48A 2CNIA 4WOHA 3F9AA 1SPRA 1YWFA 3C7IA 1BLKA 2J17A 1G4WR 3VS1A 2JYQA 1AB2A 1A1AA 4IKCA 4PYHA 2IZVA 1I57A 2RMXA 1NZ7A 5HKZA 1L8GA 1X27A 4FL2A 4KYQA 1PTYA 4FBNA 3BUOB 3BUNB 4OHEA 2GJTA 3V0JA 3QKPA 2H02A 1X0NA 1I3ZA 1O4JA 1C86A 3S4OA 5BX1A 4K11A 3MOZA 3VROA 1XXPA 1YGRA 2FO0A 1NNYA 2H8HA 3V0FA 3PLFB 3PSJA 1OEVA 2OQ1A 1XXVA 3S8LA 2VEXA 2L4KA 1OEOX 5DF6A 1JYUA 3HCKA 1NWEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2CNFA 1CWEA 1LCJA 2P6XA 3V0EA 5K9VA 3O4UA 1BFJA 3ZL8A 2OUDA 3N0AA 1JU5A 3KFJA 4H34A 1U25A 3EU0A 1SHDA 1D5RA 3PYZA 3V0GA 5BZZA 2DX0A 5DC9A 1FPZA 1NL9A 3VS4A 1OESA 2QBSA 2EL8A 1O46A 2H46E 3EB1A 3QCFA 5AWXA 2AZRA 3OV1A 1E0DA 2PSZA 3A5KA 4Y14A 3IN7A 1D1ZA 1O4NA 3MAZA 1FPRA 1M3GA 1P15A 4YR8B 1OO3A 2C0IA 1TZEE 2H4GA 1UUSA 3D44A 2I6IA 1T49A 2QMSA 1AYCA 3N2AA 2C9WA 3IMJA 2QBPA 3O5XA 2ABLA 5KACA 1FU6A 4J51A 1GQYA 2B4SA 2EOBA 1RQQC 2I4EA 4QDIA 5BUGA 5EHPA 2B4UA 2P4DA 1O4QA 1R1PA 2VIFA 2UUOA 3PFVA 3UAGA 4L1BB 1W7KA 4ZN5A 2I6JA 4RDDA 2CM7A 2VEVA 3S3EA 1G1HA 3F81A 4JBCA 2G59A 4OHDA 1R1QA 3MOWA 1QADA 3OMHA 3CWGA 2AUGA 1D4TA 2VEYA 1OHCA 1PA1A 3QCLA 2GWOA 3I80A 1A81A 2FJMA 4CVLA 2DXPA 3D42A 5KA9A 1Q6JA 3S3KA 2HDXA 5MMZB 2CMCA 4QUNA 5HKYA 5KADA 1FYRA 3IN8A 1G1FA 2CI9A 1R6HA 1O4IA 1O4GA 1LKLA 4HRFA 5BZXA 2CBLA 4JEGA 5K24A 1AOTF 1O4PA 1F1WA 2CJZA 2QCJA 1Y57A 3LYVA 2HB1A 3V0HA 4JGHA 4A4BA 1CSZA 4D3QA 2AHSA 4JMKA 2L6KA 3MXCA 2GC6A 4TVVA 1BMBA 2EU0A 1YTNA 4RH5A 2HCMA 3O4SA 3QKQA 2C0OA 2E0TA 1BHFA 2M3VA 2PNAA 1C87A 2OC3A 2Y96A 3M7FA 1NWLA 4DGPA 1OEMX 4QSYA 2QDMA 3ZV2A 2VTDA 1O4RA 4RHGA 5KA0A 1M61A 1O42A 3D1QA 1OPKA 3VS6A 1XRIA 2F70A 5I6VA 2Y66A 5KA4A 5AULA 3OP0A 1IS0A 2NZ6A 3D9CA 3QCCA 3QCHA 3VRPA 2CMAA 2KK6A 2I3RA 3SR9A 3EMUA 4PVGA 1Q1MA 1PTUA 4R30A 1Y1UA 2HC2A 1ONZA 3H2XA 1O4MA 5EELA 5J8RA 5M43A 2WGPA 1TCEA 2VEUA 2PLEA 4NNDA 4EY0A 1G4US 4GS0A 3CD3A 4KYRA 2I6MA 1LKKA 3ZNIA 2IUHA 1Q6MA 1G7FA 3OB2B 2CM8A 1LUIA 5HKWA 3UF4A 5A5FA 3BLTA 1O4LA 4BPCA 2WJPA 1FBZA 2PT0A 4P9ZA 3S3HA 2OZ5A 1L8KA 3VS0A 3K2TA 1A08A 1A1EA 5KA7A 1YGUA 2YU7A 4K44A 4I8NA 3MMJA 1OETA 1Z3KA 1FGSA 3QCNA 2B07A 3HIZB 1QXKA 1ZCLA 1ZCKA 1M27A 1BKMA 1Q6NA 2I3UA 2IMGA 2QCTA 5IBMA 2A8BA 4RKKA 2FH7A 3SMEA 1A1CA 4D8KA 4U1PA 1WCHA 4GFVA 2VOSA 4R0SA 3F99A 2EYZA 1OPLA 4JE4A 3N7YA 1U24A 3M4UA 1MKPA 4GE2A 2GCAA 4JNBA 2WTZA 1YTWA 2F6ZA 2HNQA 2CFVA 4CVMA 4RI5A 3BLUA 3VGOA 3ZM5A 3VRYA 4OHHA 1SHAA 2NV5A 4R0TA 3PQZA 3VS5A 4GE5A 2QDCA 1YVHA 3ZMQA 4D3PA 2ECDA 1GFYA 2RORA 3S3FA 1OO4A 5GJHA 2OZOA 2F6VA 2CNEA 1SKJA 2HMHA 4OHLA 2VORA 3QCGA 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2I42A 3AWGA 2JFFA 5IBSA 4WU2A 1LQFA 3RO1A 1BZJA 4F59A 1XA6A 2J16A 2BGEA 4QUMA 3NHNA 2R0BA 5D0JA 4HJQA 1MW4A 1ZFPE 2JFHA 2I75A 2CNGA 4NYHA 2HCKA 5DC0B 4QAPA 1OEUA 3RZ2A 5EHRA 1O4AA 1NO6A 2B4OA 1VHRA 4HV4A 3OB1B 1HCTB 1O4CA 2K7AB 4ZRTA 1Q6SA 3QCJA 2HDVA 2BGDA 2LQNA 1KA7A 1YPTA 2GP0A 4U17A 3US4A 1P31A 2H5KA 1PH0A 1P3DA 4C12A 2LNXA 1BZCA 1FQ1A 3AWEA 3CBLA 3BRHA 2H03A 2Y1NA 3K2MA 1ONYA 1YZ4A 5BO4A 4DGXA 1PTTA 2ESBA 5CDWA 1FU5A 1NZLA 3TKZA 3VRZA 3V0IA 1G1GA 4XZ1A 5KAZA 2I5XA 2KGYA 1ZZWA 2CI8A 4K2RA 5K22A 2EYYA 2C7SA 5LXQB 3GQIB 1O4DA 4M4ZA 2AM1A 4NWFA 1RXDA 2C0TA 5K23A 3IMDA 3D1OA 1HCSB 3PSKA 1FBVA 1JYQA 3EACA 3HHMB 2MRJA 2LRAA 2A3KA 3QCKA 1O47A 1GHUA 2AOBA 2B49A 1KA6A 3ZM1A 1PICA 2Y1MA 1A5YA 1T4JA 2I6OA 1UURA 1BHHA 1AOUF 2EYVA 3U96A 3O3LA 1KSWA 2CIAA 1O45A 2Q05A 4EIHA 2MBCA 2CM3A 4GWFA 4Y2EA 4FL3A 3VS2A 3QWYA 1OHDA 2BIJA 1JBVA 2NT7A 2CNHA 1O4HA 3QCIA 4Z6BA 2EO3A 2YSXA 1AD5A 2PTKA 4A4CA 4QF5A 3ZM6A 1LUKA 1X24A 4JMJA 2Y68A 4ROJA 3F9BA 2XP1A 3VRQA 4RI4A 1BKLA 2I4HA 3LJ8A 1G7GA 3RGQA 1O4FA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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