4GWNA

Crystal structure of human mature meprin beta
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
533
structure length
533
Chain Sequence
NSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSESDQLNIYIREYSADNVDGNLTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSGASLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFIGSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLNLAHVTNAGIYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPFMTTDNGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYILLTVEDISHLNST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Meprin A subunit beta
publication title Structural basis for the sheddase function of human meprin beta metalloproteinase at the plasma membrane
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 152
structure length 533
sequence length 533
ec nomenclature ec 3.4.24.63: Meprin B.
pdb deposition date 2012-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00629 MAM MAM domain, meprin/A5/mu
A PF01400 Astacin Astacin (Peptidase family M12A)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4gwnA02
2.60.210.10 Mainly Beta Sandwich Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A Apoptosis, Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Protein 2; Chain A 4gwnA03
3.40.390.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Collagenase (Catalytic Domain) Collagenase (Catalytic Domain) 4gwnA01
5EYXA 4K1YA 1SLBA 3HBVP 4YW1A 2USNA 1D5JA 5I12A 1R1JA 1WLDA 1C3IA 3LJTA 1OM8A 1SRPA 1V00A 1VAVA 3WCRA 1WW4A 2ARXA 1XFZA 1C1FA 1XUCA 1GZWA 2LALA 1YRZA 1B09A 5B5PA 2GALA 1G4KA 2Y6DA 3HSVA 1LHNA 1AJOA 1SU3A 3UJOA 3O5SA 5GZEA 4FPLA 2SLIA 1WW5A 3VUOA 4PF5A 1W6PB 1Y8JA 2G4IA 4Q26A 3ZVSA 5EYYA 4AYKA 4C1WA 2XS4A 2DTYA 4H84A 2OVUA 3VV1A 2NM1A 4Y1XA 2OXWA 3NWKA 4YGEA 2NZ9A 1OS2A 3WG2A 2OW2A 2VW0A 1YQYA 5IUQA 2ZACA 4H76A 2FV9A 4HL0A 4FVLA 3KHIA 3U1RA 2DU1A 4GR8A 4AGRA 1QICA 1CA4A 2E7QA 2SBAA 3HY7A 4LBQB 3N36A 2OW1A 1G9AA 3ELMA 3HY9A 3AP6A 3USUA 4XTMA 3F19A 2MZIA 4J4MA 4P9WA 1IADA 1LEDA 4FQZA 5I0LA 1FAYA 1LOBA 2GNMA 3BIWE 1JN2P 1ONAA 2W52A 3WVJA 3Q2HA 5D3CA 1LTEA 4KBBA 3FFZA 4BLIA 3POWA 1DLLA 3RTTA 2O36A 1JK3A 1XFUA 4SLIA 1KUFA 2CLTA 1WW7A 2BQPA 1RIRA 2CL2A 1WLCA 3MQRA 2WLQA 4WZVA 4MYEA 4AIGA 1SLCA 2ZAAA 2ZABA 3AFKA 2DU0A 1LOEA 3C2UA 4GWNA 3LUNA 1LU2A 1J1TA 3V0AB 2OUJA 2MZEA 2ZHLA 1DQ5A 2VXRA 1CZZA 5IK5A 2ZZJA 4R9DA 2OW0A 4FPJA 4R3VA 3FLRA 4GA9A 1MMPA 1V6LA 1BQOA 4XZPA 1S0BA 3VKLA 1LHUA 5DXDA 2DVAA 5GZDA 2DVGA 3IPVB 2EXHA 4ATFA 1Q8PA 5T5OA 3W58A 5L7FA 5JOWA 1S0IA 4IUWA 2DURA 4Y22B 2ZGOA 3HU6A 4GKYA 5GLUA 1FV2A 2PJTA 4Y26A 4GALA 4GJHA 4PBPA 3BOPA 2YROA 1MACA 3CNAA 1OFSA 2CYFA 1BUDA 4R9BA 2R16A 2WJSA 2E6VA 3L0VA 4GWMA 1SLTA 1MS5A 1ZMSA 4G9LA 3ILNA 4DRRA 2CKIA 1Q8SA 1FLLA 1HQLA 1IABA 3VI1A 3RMXA 3HDAP 1CONA 1DQ0A 2CY6A 4YSIA 1G49A 5D1UA 2NN8A 2X3AA 3N7JA 1G7YA 3RRDA 5IK8A 1CAQA 2JD4A 2X7MA 2JE7A 2AGSA 2C5DA 4FP3A 1GLHA 3I4IA 1LB6A 4BOWA 3ZXHA 4A3WA 1BQQM 3MA2A 4ZKTB 1V6JA 3PMEA 5LABA 2Z42A 4YM0A 1RITA 2OXZA 2SRTA 3AIGA 3A4UA 3R05A 1A86A 1BXHA 1JUIA 1YZEA 4YW5A 1QOOA 2R1BA 4FPOB 1SMPA 1BIWA 1CR7A 1WBLA 4D69A 1GSLA 4UW4A 1CVNA 4JQGA 1LB5A 2OW9A 3AP9A 2MLRA 4XDQA 2D1OA 1WD3A 1ULFA 3KQRA 4GUYA 4M3CA 1MS0A 1CQRA 1CGLA 5GM0A 2VUAA 1UZZA 4RA0A 1U0AA 2W14A 2A6ZA 3OYWA 1ULDA 4FU4A 1D00A 5I3MA 4M3CF 1CXVA 5HCFA 2AR6A 3KM5A 1ATLA 1V6NA 3EDZA 4Y1VA 1XFWA 1LHOA 2WT0A 5HCBA 2DUPA 4YW2A 3AXDA 3ZSLA 1D01A 3INAA 1F5FA 2Q5TA 3LKAA 966CA 1G9CA 1WCSA 1JYCA 4LBJA 4P14A 2A3YA 1AVBA 5L79A 4FPEA 2D6MA 1GKBA 2ZGRA 4FP2A 1LODA 1LOFC 4ATEA 4Y1YA 5JMYA 3WOGA 2DVDA 5GLZA 4FQ4A 1O4ZA 4FXQA 1AF9A 5IT6A 1G12A 2ARBA 2Z2DA 1C4RA 3WDVA 3WV3A 1OKQA 1W6PA 4YGCA 3SITA 3D5OA 1EB6A 3SHIA 4XJ9A 2FOOA 5EXOA 1FBLA 3KECA 4FOVA 2WQZC 3MW4A 5JOXA 1DYKA 1JYIA 1GZCA 4XMAA 1LOFA 1PZ8A 2ZGLA 2EIGA 1H9WA 4H30A 1DQ1A 3LIKA 3PJQA 5E8AA 4X3GA 1IS3A 4GHUA 1GNHA 4R9AA 1BKCI 4RL7A 3SH4A 1GBGA 3LILA 1JKYA 4UW5A 1SBFA 4LBQD 2OY2A 4WVVA 2A6YA 5SV8A 1ENSA 4PBOA 4XM8A 2GDFA 4XYXA 1I1EA 1AKLA 3AJZA 1GXDA 4FPYA 4Y20B 4PKQA 1IS6A 5DUWA 1LGNA 5DZEA 1J7NA 1KBCA 3B00A 3O2XA 4WKEA 1WBFA 3UVCA 1CGFA 3T1MA 2ZHKA 4XM7A 1UPSA 3ZXLA 3NV1A 1Y0VA 1RMZA 5HCAA 4YFWA 3ASIA 1R1ZA 3Q9OA 2AYKA 1BZSA 4GR0A 2CNAA 2NYYA 3LEAA 1CIZA 5JVVA 1RF3A 3WHTA 2ZGMA 3AX4A 2FV5A 4BPZA 4DQAA 2PHFA 1KUIA 1CESA 2DTWA 1AX0A 1FATA 1N1TA 3B3QE 2D6OX 1WNIA 3AZYA 4AWDA 3HQMA 3EWJA 4FVVA 3ZPYA 1DMTA 1IAEA 1KJLA 3ZXFA 1FLSA 5IK7A 3M3EA 2EAKA 1HFSA 1MR5A 4KG9A 2GNDA 4YFZA 4K1ZA 1TEIA 3M1HA 3IVBA 5GZCA 2D43A 3WG3A 3IPVA 3V65A 2YY1A 1HOVA 2ZBJA 2A5ZA 1K7IA 4C9ZA 4R9CA 4Y22A 2ZGPA 4XHXA 5JLVA 1IS5A 3IMNA 1GNZA 1MVQA 1A3KA 3LQBA 4JP4A 4XJ8A 3M3CA 1S0EA 4PKRA 4XBLA 2D3PA 5JMCA 2JECA 2A8HA 5L73A 4UW6A 5CUHA 3F15A 4FOYA 1S4BP 3M3QA 2I47A 1JIZA 1QKQA 1K7GA 1EAKA 3WCSA 1HV5A 4K20A 3VKNA 2MZHA 1G9FA 1ULCA 4EFSA 1S0GA 4Q2FA 4XJUA 2EXKA 2GMEA 2PHXA 3TS4A 1HQWA 3KWVC 3AP4A 1MZ5A 3PVEA 1DTHA 2AYHA 2R49A 2W13A 5GZGA 4CTEA 4AUOA 1GV9A 1ZP5A 1QSCA 3B69A 2TEPA 3AP5A 3L2YA 2EALA 1FYUA 1GKCA 3WUDA 2D6KA 1I1IP 3TVCA 4ON1A 3BODA 5BOYA 2GNBA 3GALA 1QDOA 2R0HA 2ENRA 3SH5A 2F1YA 2A6WA 1LENA 4FPGA 3O12A 5CBLA 4Y24A 4Q8KA 1D8FA 3OHOA 2DW2A 3LK8A 3IN9A 1JXNA 3RQ0A 1IAAA 2XG3A 1UL9A 4YGBA 3IKWA 4H55A 3R4SA 1PWQA 3H0OA 3IM0A 1APNA 1SCRA 1BSWA 1DZQA 3IVVA 3MW3A 5BPAA 4Q8LA 3OBRA 3T2TA 3HR9A 2E7TA 1V6MA 4AGVA 4FXYP 1OS9A 4PKSA 1UMSA 4AGGA 4I35A 3VKOA 1USNA 3DPFA 1VAMA 2AH2A 2P34A 1DYPA 2WSUA 1L6JA 2UWCA 1JJ9A 1GICA 2RHPA 4YM1A 1YOUA 3AXEA 1CIWA 2ERFA 1VALA 5T5PA 4W65A 2V4BA 4XXPA 1Q3AA 1JAPA 1BM6A 1XFVA 2HU6A 4YG3A 2DW1A 5CB7A 2WSVA 4Q1LA 3WHUA 1MS4A 2WT2A 2D7FA 1JAQA 1NLSA 4GF1A 1AYKA 1Z0HA 1RINA 4TZDA 1H9PA 1ZM1A 3AYUA 1AF0A 4IQPA 2VY0A 4LBKA 5CZMA 2X3CA 1AX1A 2QPJA 2ZHNA 3UJQA 3EDIA 2VH9A 1G9BA 3N3HA 2GN7A 4Q1RA 4QKZA 2PELA 2A25A 3JUUA 3KRYA 1O4YA 2D6PA 1BJQA 2P2KA 2K9CA 1Q8VA 2JDZA 4FPHA 1XFYA 1WW6A 4L8QA 2XXNA 2NMNA 1XURA 5GJ6A 1BUVM 4OZXA 3D6EA 4I7BA 2PHTA 3WZ1A 1IACA 4L19A 1JIWP 4U2AA 1CPMA 1MS3A 4NO4A 1W6OB 4ASMB 1ZXVA 1S1AA 3HBUP 3PVOA 4JPAA 1LOGA 1LGCA 2FOJA 2R1DA 2ERQA 3APBA 1HY7A 4DFSA 4ZXKA 3AYEA 1MMRA 3HB2P 4M3CE 1BKZA 2UU8A 4FPKA 5IK4A 1Y7BA 1C7KA 1QMJA 5T52A 1JW6A 1JOJA 3TAYA 1JH1A 4Y20A 5DZGA 1JHNA 2JIHA 3SISA 1YXWA 2NP0A 3FUOA 1C8TA 3ZJBA 1ZVXA 1UEAA 1I76A 1YP1A 4L63A 1QNYA 2ZMKA 1EUBA 2P37A 4HX3A 2KRJA 2D44A 3RTSA 1LHVA 1GZ9A 4AXQA 2RJPA 5JOZA 3WDXA 3PVNA 1LOCA 3K7LA 5H8XA 4BMBA 4M00A 4GXLA 3P24A 5CAZA 2D1NA 1MNCA 2E2DA 4G0DA 4L6TA 4LBNA 3AZWA 1IAGA 3AZZA 1GANA 3LMCA 3OHLA 1VLNA 3BA0A 3M3OA 5CNAA 1Z3JA 1FNZA 1V6KA 3B92A 2ERPA 3MEPA 2WOAA 1SLIA 3K7NA 5CA6A 1H71P 830CA 1CJPA 5KXEA 2AIGP 2E53A 4YZ5A 2V5YA 4H49A 5B5OA 2CWMA 3N7LA 4FOQA 5GLVA 1XQNA 3N2VA 2ZKNA 1UN1A 3POYA 5DUUA 3D4KA 4WVWA 3ZVXA 3DUIA 4Z8BA 1MS9A 2UURA 3ZXKA 2EXIA 1UTTA 4YZ4A 1YI7A 2A70A 4CZSA 4PKWA 5E88A 1GYKA 4PCRA 3AP7A 2PHUA 3HN1A 2DDFA 2YB9A 2DVBA 1MS8A 1B8YA 4O1VA 1C1LA 2ZMLA 3AYCA 4H2EA 1W0PA 1S0JA 1URXA 2MLSA 1LESA 3DSLA 4DPEA 4YW4A 3F1AA 2CTVA 1ENRA 1QDCA 2X3BA 2XS3A 3NX7A 1N3QA 2DDYA 1UMZA 1QIAA 5GALA 2AUYA 1KDKA 1IOAA 2P3IA 1JANA 3TT4A 3WDYA 4LBQA 4GQLA 3O64A 3VTGA 1VIWB 1G9DA 3WUCA 2FHRA 4IN9A 4UW3A 2VW1A 3AZXA 1AX2A 4PQ9A 4Y1UA 1N1SA 5H9PA 4H3XA 4AVTA 4FOWA 1ZS0A 1MVEA 3QCWA 4DD8A 1N1YA 2XB6C 3WV1A 5D7WA 4XTPA 1MS1A 4XJAA 1FNYA 1ENQA 1CA9A 1UTZA 2A3XA 1AXYA 2A6VA 5F9TA 5DZFA 3WDTA 4ZR5A 1D2SA 1YY6A 1WD4A 2JT5A 1ND1A 2YZ4A 1HDKA 3GBOA 1HKDA 1YIFA 4NOTA 3ATGA 3L0TA 3SLIA 3EDHA 5T50A 1NXD1 2B7YA 1DQ4A 1QUAA 3VKMA 1SLNA 3M2MA 2ZGKA 5DUVA 5KXDA 2OUHA 3HMYA 5T5LA 2OVZA 3KEJA 3Q2GA 3OPZA 1KZZA 3V0AA 2ZGUA 4I7DA 1UMTA 1SBEA 4JA1A 2WKKA 1ZTQA 3G5CA 3OY8B 4TYSA 3A0NA 1UX6A 5CXAA 3HDBA 2JNPA 1MMQA 1OM7A 3G42A 1HFCA 2NMOA 2ZGNA 3V0BB 1N47A 1Q8OA 1CGEA 1DQ6A 3NV2A 2V73A 4BMEA 1G05A 1W6MB 4HANA 3WLUA 4P9XA 4XBQA 2Y6CA 3NV3A 2F1WA 1MZ6A 2DYCA 4GKXA 1IS4A 2DUQA 2OZRA 1H30A 1BQPA 3HQHA 2A3WA 1O0QA 3OJBA 4JRAA 3AYAA 4ILWD 2L0RA 2GKWA 3EHXA 4AVSA 5GZFA 1R1IA 3V96B 1KAPP 4M01A 4LBOA 4CA1A 3WDUA 1KUHA 2OI0A 1G8WA 3O0XA 1CZYA 4Y1ZA 4I7CA 3FLPA 1W6OA 1DBNA 1LCLA 2H0BA 1JAOA 3SNMA 1F3VB 2P3KA 3ZUKA 2JKBA 1SLLA 1ZXCA 3B9CA 4XMIA 1KQRA 5DG2A 2PHWA 4YW3A 4LBMA 2W08A 3F17A 1FV3A 1ULEA 1GE7A 1QJIA 5T55A 1KUKA 3KEKA 3BTAA 4XE9A 3W59A 4GR3A 1D0HA 3WG1A 1S0DA 5H9SA 3FUQA 3LQ0A 4C1XA 2ZGTA 5E89A 5BYNA 1KDMA 2JSDA 2D3RA 1OM6A 3O0VA 1I3HA 5D1TA 3RG0A 1QF3A 4PKVA 1C57A 4FPCA 3ZYRA 4LBLA 3DNGA 1IKPA 4DS0A 2I2SA 1N3PA 1QGLA 2AENA 1FLKA 3B8ZA 3ZSMA 1O0TA 2ZA9A 1F9KA 1QOTA 4ISQA 1JBCA 1YO8A 3N2UA 1AJKA 4WK7A 2KM2A 3LSEA 5FREA 3ZYPA 2W15A 1D8MA 1Z78A 1OO9A 4K21A 3POSA 2W0DA 3LUMA 3RSJA 5AVAA 3LJZA 2GMPA 2TCLA 3FLTA 2CWSA 3LE9A 3NV4A 2YXSA 4JIJA 1W6QB 2ZMNA 3U4XA 4Q27A 1GKDA 2P3JA 2WO8A 1W6NB 3WG4A 4YM3A 1QOSA 1RM8A 1LOAA 3AJYA 3AZVA 5T5JA 4XCTA 4YGDA 2OY4A 1Q8QA 4DV8A 1AXKA 1I73A 2VU9A 1BKCE 4YM2A 2YMZA 3I7IA 2CR2A 3DGTA 1QU0A 4XIOA 4U36A 1DGLA 1PWPA 1SLMA 3MPPG 2A6XA 4XIKA 1UKGA 1V6IA 1IKQA 2E3XA 4JCKA 5GLWA 1GZWB 2A7AA 4Z8MA 4DPNA 2JE9A 5JDBA 5T54A 4XOGA 2GMMA 4I03A 1OMJA 3ZSKA 1PWUA 1BKCA 4HMAA 4IJOA 2OVXA 2GNTA 1XUDA 3WNXA 4DRVA 1A78A 1QJJA 2D6LX 2DV9A 1SATA 4A7BA 3N7MA 1SCSA 1DFQA 5GLTA 2UWBA 1A8DA 1SBDA 1D7XA 3LIRA 1WUVA 2A75A 3UL2A 1G86A 4AYUA 1R1HA 4YG0A 3USNA 456CA 4BQ1A 1Q56A 1K2FA 3E8RA 3N7KA 2OW4A 4YG6A 1WLWA 1SACA 1GE6A 4XBHA 5I43A 1GE5A 2N8RA 3KMEA 5BOTA 3HQIA 1OQ1A 1CK7A 1CPNA 2HYKA 5KXBA 3IVQA 3I7GA 4YZ3A 3RS6A 1N3OA 4PKUA 3AK0A 3USUB 4F83A 3A0KA 4XBNA 1KUGA 2D3SA 1QIBA 3MW2A 3O0WA 2EROA 4XILA 4PKTA 5DG1A 1LULA 1BYHA 2O3EA 1S0FA 2A71A 1KJRA 4YZ2A 1G9KA 4WZFA 2ZGSA 1R55A 5I4OA 3SH3A 1S0CA 1L0AA 3DL1A 3B01A 3ZSJA 2POJA 3EHYA 1LU1A 3LJGA 3WV6A 1LEMA 3WDWA 1PZ9A 1DQ2A 2PHRA 3P1VA 1XFXA 5H9MA 3HYGA 5EWSA 3OY8A 3ILRA 1D0JA 2RJQA 3AYDA 4YZ1A 1LB4A 1HTDA 2LTNA 2ES3A 3GNEA 2W39A 4CTHA 4BLJA 3V0BA 2JT6A 1R54A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3B2Z A;  1C3H A;  1LEC A;  1UMH A;  4H1Q A;  1WKY A;  2DVF A;  4XFF A;  1ULG A;  4AFB A;  2VMC A;  3POG A;  1RMU 2;  4AVV A;  1CX4 A;  3MQS C;  2OKX A;  1AZD A;  4JDN A;  1OOP A;  2WNE A;  3I8T A;  1AR7 2;  3JU9 A;  4OHV A;  5JPM B;  1W6Q A;  2D5F A;  2JJ6 A;  1OLQ A;  2GN3 A;  1STM A;  3LDR A;  3T09 A;  3RJ2 X;  2HBU A;  2BEO A;  1W6N A;  1HQN A;  5FLH A;  1A8M A;  2ZJC A;  1F2N A;  2KXL A;  2DUO A;  1OC1 A;  2ZGQ A;  1KD7 A;  2Y38 A;  4ISR A;  1W0O A;  4CRQ A;  5LCW L;  5IYY A;  1GO7 P;  4RN5 A;  3MDP A;  5I8Y A;  2BU9 A;  5LAS A;  1H4G A;  2RJ2 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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