4GXAA

Crystal structure of sulfate free form of cysb, a member of lysr family from salmonella typhimurium lt2
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
239
structure length
239
Chain Sequence
b'EHTWPDKGSLYIATTHTQARYALPGVIKGFIERYPRVSLHMHQGSPTQIAEAVSKGNADFAIATEALHLYDDLVMLPCYHWNRSIVVTPDHPLAATSSVTIEALAQYPLVTYTFGFTGRSELDTAFNRAGLTPRIVFTATDADVIKTYVRLGLGVGVIASMAVDPLADPDLVRIDAHDIFSHSTTKIGFRRSTFLRSYMYDFIQRFAPHLTRDVVDTAVALRSNEEIEAMFQDIKLPEK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of Sulfate free form of CYSB, a member of LysR family from Salmonella typhimurium LT2
rcsb
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator CysB
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium str. lt2
molecule tags Gene regulation
total genus 61
structure length 239
sequence length 239
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4gxaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4gxaA02
5CMCA 1P1WA 4NWCA 3IR1A 4ESXA 1LGBC 4EF2A 1Y4CA 3KFMA 1XVYA 4Q0CA 1UTHB 1AH5A 4Z0IA 1M5CA 1LAGE 2XXRA 2XXHA 3RGYA 4X9TA 2Q2AA 2DOJA 4OVJA 1A8EA 1XS5A 4I1DA 3QXMA 3H4ZA 1OIBA 3Q28A 2XHDA 4R6HA 1IZ1A 4IY6A 4QHQA 2I0BA 1B7ZA 5CBSA 2KLFA 3HHFA 4RY1A 1D9VA 1ATGA 4G68A 4R2FA 2HCAA 3IB1A 3EF7A 3ZKLA 1R9QA 1LFGA 3RT6B 2DVZA 3FASA 5I57A 4OFJA 4OZ9A 3TZAA 4F39A 3I6VA 2OBGA 3K1MA 4BLAA 4ISUA 2Z8FA 3PD8A 2XX8A 3JYRA 4U4SA 3UN6A 3TTKA 3K1NA 2DXYA 4PFTA 5CM6A 2VD2A 3T93B 3F11A 4WEDA 3U92A 5IKBA 2UVGA 2XXVA 3JV9A 3TCGA 1SW5A 1US5A 3G3JA 4LUBA 3FV2A 1B9JA 4FJPA 2ONKE 1FQBA 3FVNA 3CG1A 2AIXA 3CIJA 3TCHA 1OVBA 5KCJB 5DTBA 5A5XA 4PFYA 1N76A 3OO6A 2QS1A 5CI5A 4BDOA 2Y7RA 3PPQA 4IGRA 2H5YA 3U93A 3SERA 5AA2D 5H8NA 2X7QA 4KYDA 1MPCA 5AA2A 4QRZA 1II5A 3QIMA 3IOWA 3H6UA 1I6BA 4JB7A 1POY1 3L6HA 2BJJX 4Q5TA 1SW2A 3U8QA 1FCKA 4H6DA 3CR9A 4WKMA 4XIGQ 3K6WA 4BDNA 4F19A 4OWDA 3TUSA 4H8IA 4DLDA 4EQBA 1PB7A 2V84A 3TTRA 3KSJA 1FTLA 3O66A 1NNPA 4F3GA 5I2NB 1Q35A 1N84A 1ZTYA 4LQ2A 4XXUA 3QYTA 2H9BA 1XVXA 4PP0A 1N7WA 3M3KA 3IB0A 4I9DA 1MXZA 1D9YA 1B3GA 2HXWA 2QRYA 3KZGA 3M3LA 3MVXA 3TELA 3VXCA 5HPQA 1QULA 2DSFA 4LONB 3PUZE 4MF3A 1TXFA 4HS7A 5H8QA 4F18A 4U1OA 1LCTA 1SI1A 4R72A 3OO9A 4KQPA 3VVDA 1MY4A 2R6GE 1LBBA 3S9NC 3PPNA 1QW0A 2DWJA 3H6WA 2V93A 1RKMA 2X26A 4RPOA 3C35A 1FW0A 4EXKA 1N0TA 2I49A 4O3CA 4F29A 1NKXA 1VFDA 4NF8A 3SEVA 1MY0A 3V5AA 4YB7A 4TLMB 3E4RA 4X1DA 4R9FA 3CFXA 4TOZA 1JW5A 4G68B 1QKAA 1AIVA 3ILUB 4IY5A 4YKJA 4QFNA 3BKIB 3IOTA 4ECFA 1B32A 1POTA 4JBZA 2UVJA 2VOZA 2PBWA 3VDFA 4RA1A 5JTYA 4ELOA 5I59B 3FATA 3OSQA 4MFIA 5DVJA 4ZDMA 5CMBA 5JEIA 5ITOA 3FXQA 4OHNA 1Y3NA 4H5GA 3ONMA 3FJ7A 2D5WA 4G68C 1QUIA 4OTEA 1UIUA 4U21A 1MH4A 3S4UA 4F3SA 3H6TA 1VSOA 4XKPA 3PUWE 2VP1A 3FVGA 1IXIA 1ZIUA 4AB5A 2UVHA 3DP6A 5KDTB 3K1PA 4ZEDA 4BDQA 4GRKA 2PYYA 1AOVA 4IGTA 2F35A 1MXVA 5DEXA 5FHOA 5AA2B 4GFRA 3U1OA 4MH5A 2FA7A 5AE4A 1Y1ZA 3MVWA 1JETA 2Z22A 4GOTA 1LAFE 2FYIA 3HSTA 4FECA 3QSLA 2O68A 3K4UA 4KR5A 1M5EA 4MLQA 2ZYMA 2QL3A 3N26A 3KBRA 4TLLB 4TQUQ 4YB6A 4F2QA 4IO3A 4KPTA 2P2AA 4FE8A 2I3VA 4R2BA 3HV1A 3L6GA 1B3EA 1OVTA 5I58A 3EHTA 4WEPA 3PUYE 3SESA 1LBCA 4OERA 1VE4A 4H5FA 1B3HA 3WAFA 1A55A 1HSLA 5FTHA 1PC3A 5H8QB 3KEIA 1BKAA 1CE2A 1NFTA 3MP1A 4GD5A 2E0SA 4HW8A 1B3FA 5H8HB 4RYAA 2F7BA 5DYHA 1B46A 3VV5A 4EQ7A 1QUKA 3M8UA 4C0RA 5EHMA 5BUUA 1J1NA 4DXBA 4QFKA 3C36A 4F3BA 1EZ9A 1H44A 4NF8B 5H8FA 3D4GA 1P1OA 3DP8A 2F97A 3ECRA 4R75A 4IO7A 4EQ9A 4QSCA 1Y20A 4FATA 1O7TA 4H8JA 1NH8A 1MPBA 4YMAA 2H25A 4GL0A 4FIMA 2OWSA 4DCYA 3UP9A 5CRYA 4IO2A 2QMXA 3Q27A 2ZYNA 2OLBA 4Q30B 5JTYB 2NOOA 4NWDA 4C1TA 5AA1A 3EN3A 3FZVA 1PB9A 3RQTA 4R6KA 3T9VA 2DYXA 1B4HA 1SI0A 4OXVA 2DWHA 2I4BA 1UTBA 1EZPA 3MZBA 3S9LC 3VVFA 4KD5A 1MY3A 4XKQA 3UA8A 3MAMA 4IO5A 2I48A 1BIYA 4QF9A 1D4NA 1XHYA 1YCJA 3RY3A 4EUOA 4E0XA 3TYHA 3SEYA 4EDPA 4ZEIA 5HBCA 1USYH 2NXOA 2GFEA 3AXFA 4GXAA 3KJTA 4OMBA 2Q89A 2XX9A 4ZE8A 2GH9A 3UIFA 3FVKA 4ZEBA 2H98A 1DTZA 3A3CA 1RYOA 3O29A 2Y7WA 2F7CA 2G93A 1N3XA 4RK9A 5TP9A 1EH3A 3MVZA 2W7YA 4ZEKA 2DP8A 1ZMGA 2CMOA 1LSTA 4YB5A 5L9MA 1SW4A 4ZZEA 3VFJA 2DWAA 3A3UA 3R26A 3O2AA 3T96B 4HCWA 5I58B 3MP6A 3BFTA 3FJMA 3U94A 3MUQA 3UGWA 2PVUA 5KZTA 2UVIA 5I56B 1N04A 3MJNA 1BTJA 4R74A 3T9XB 1NNTA 3EQ1A 3B6TA 2RCBA 2CZLA 3W9VA 1JEUA 4Q8RA 5I2KB 3OELA 4NF4A 1ZLQA 4ZE9A 1B51A 1WVJA 2THIA 3JZJA 1QJMA 3TCFA 4QSEA 4M4GA 3FJGA 4K3FA 3PPRA 2DXRA 5H8FB 3N6TA 1ZBMA 1YTVA 2REJA 3O6IA 2A5TB 1MXUA 3H03A 2YJPA 3QUJA 3G3FA 3G3GA 2NVUB 4NMYA 4P0GA 4KCCA 2UYEA 2UYFA 3FXRA 1TWYA 3FGSA 1LAXA 3VE1B 3USDA 4F1YA 4HTGA 2Y84A 4H67A 5ISUA 4G4PA 1NH7A 3UK4A 4YAHX 1WODA 4GLIA 1A8FA 4ELPA 1OMPA 2I58A 3IJOB 1N3WA 3GBAA 1B1HA 1H43A 1MQHA 3TDJA 4N6PA 2QMWA 1OQHA 2ONSA 1KWHA 2O84X 1B6HA 3ZSFA 1URSA 1NNFA 2HZKA 3GXAA 1IEJA 1FTKA 3GBBA 5ITPA 1MRPA 5FHNA 4N07A 2Q9TA 3HCQA 1OLAA 1PBQA 1LAHE 2XX7A 3MZ1A 3OEMA 3PPPA 5DVFA 1B7HA 2PT1A 4XKRA 4OFOA 4C1UA 3TMGA 3N6UA 1FTMA 4U4XA 3IX1A 3KOTA 5AA4A 2PX1A 3THIA 4RK2A 1IXCA 2Y7PA 3K6UA 5EHSA 1DSNA 2HEUA 5BWJA 4PFUA 3TTNA 4UA8A 1I6AA 1ZU0A 3TTMA 1Y3PA 5TP9B 1T0KA 5F7VA 5I57B 1SD3A 3DM0A 2OZZA 5LOMA 1H76A 2RC7A 2LAOA 3DLNA 1LFHA 2F6PA 3CFLA 2F6GA 3IJXB 3MVYA 1GTKA 4OESA 4O3AA 5AA3A 5FTIA 2RF1A 1Z7ME 2PT2A 3K00A 3CVGA 3T66A 3FVOA 4U23A 3OSRA 3TQWA 3FV1A 1US4A 2HAUA 2GHBA 2O1MA 4DIGA 2O7IA 1MXYA 3I3VA 4LVQA 5EYFA 2B3BA 4EXLA 4R6YA 3KN7A 1JVXA 1UTHA 3S9MC 4OQOA 2GRVA 4FEBA 3S2VA 1MY2A 3O6GA 3KGCA 5A5XB 4NTLA 4G8HA 4PE5B 4XTCQ 4IO4A 3O28A 3DELB 5IAIA 4ZZAA 1B58A 5H8NB 4DDDA 2X7PA 1PDAA 4F3PA 2DQVA 4KCDA 1NNKA 4IB2A 4F1VA 4YKPA 3WAEA 2R71A 3W9WA 3PGFA 5DT6A 3D4CA 3E9XA 4P0IA 4KFQA 3H6VA 4R73A 1P1QA 5TU0A 2Y7IA 4DZ1A 1BLFA 4RPNA 1P1NA 4GXSB 2DVCA 2HAVA 1HSJA 3RPWA 2I6EA 3K02A 5J1DA 2B3FA 3DP4A 1WDNA 4M1VA 2P1SA 3K2DA 4LA9A 1B3LA 1YAEA 1MM7A 2QPQA 4U2RA 3CFZA 2O1LA 1IXGA 4NF6A 1FQAA 1B5IA 4GL8A 4LP2B 1GV8A 2OK2A 3OEKA 3VVEA 3SEUA 4DXCA 1I6QA 3EPEA 1DPPA 2HQ0A 4THIA 4PETA 2ANJA 4U1ZA 4ELRA 4YU0A 3CG3A 4AQ4A 2H99A 3KG2A 3S9EA 3LC8A 4YKKA 3RN8A 3QAXA 1B0LA 3VLVA 2AL4A 2AL5A 2XXQA 3TODA 1PB8A 1FQCA 1B7UA 4GVOA 3TEPA 5KCJA 3TAJA 4JDFA 1QVSA 3O9PA 2OWTA 4KYSA 1B2HA 5AA4B 1H3DA 3C32A 2ESNA 5CMKA 3LSLA 4IO6A 2PMSA 4OETA 5FHMA 2UXAA 2QS3A 2M8CA 2Z23A 4JWXA 4NF5A 3FD3A 1B52A 5HM4B 4O3BA 1FQEA 3OXNA 4ONYA 1SBPA 3T22A 3IOVA 5CBRA 3IOUA 2XD2A 4OFLA 2F8DA 4X1BA 5L9SA 3CSGA 4X48A 3GZGA 3P7IA 1DTGA 1Y4TA 2ZYKA 1S9TA 3KOSA 2D21A 5I2NA 1MM6A 4LATA 2DWIA 4JXIA 4I8CA 2IA4A 1A54A 4EF1A 4ELQA 3HN0A 2XXPA 4E0WA 1IIWA 1R6ZA 4F1UA 1M5DA 2DE3A 1M5FA 1TFAA 1UQWA 3BBRA 1SYIA 4GQOA 1MH3A 3KN3A 3PPOA 4HCYA 3TFLA 3V8XB 4U22A 3QUFA 1MQGA 4G77A 1LFIA 5DEXB 3SDFA 1ANFA 2V3TA 1XOCA 1I69A 4XKNA 2F36A 3T9HB 1M5BA 1VR5A 1F9BA 1JQFA 2Z8EA 3GLBA 1A7LA 1MQJA 3O6HA 4G8NA 1R1NA 5ELVA 4ZECA 5CC2A 3H3GA 1LCFA 1B5JA 3FUZA 3OENA 3R7XA 2P0SA 2QS2A 2RCAA 2QJEA 4QFPA 1S50A 3QK6A 1IXHA 2XD3A 5F1QA 3RLFE 3V83A 2ZYOA 3G3HA 4NF6B 4QFLA 3LR1A 2NUVA 5TPAA 5I59A 1A40A 1SVXB 2V3UA 4JSDA 1P1UA 3RT8A 1MDP1 4F31B 2Q88A 3VLUA 1JNFA 1AL3A 2IEEA 1D3KA 4FEDA 1QKBA 1B40A 4R9GA 3G3IA 4G2ZA 1MY1A 3T9UA 3ILTB 2I3WA 3CRBA 3LSXA 1NMUA 1SYHA 1S7YA 3G3KA 1MQIA 3IK6B 1MXWA 2ZMBA 2I0CA 3VLWA 3Q25A 4NEDA 4WXJA 3A09A 2Q2CA 2DE4A 3K0VA 2RINA 5ICTA 3PMXA 4F22A 3N94A 5KDTA 3IO4A 1BP5A 2REGA 1RYXA 2ABHA 1ZJLA 1USYE 1URDA 3MWBA 1IUDA 1MQDA 4NF5B 3EHUA 3KJ7A 2OCUA 2HFBA 2O69A 4GF8A 5M2VA 1XC1A 4JWYA 3W15C 2QS4A 3SETA 3TQLA 1LB8A 3IO6A 3H7MA 4JWOA 3MP8A 3C33A 2VGQA 1IQ7A 1NL5A 5K2YA 2HZLA 4N13A 3MPLA 3HHGA 1UTBB 4MBPA 3N5LA 1XT8A 2O7UA 2F7AA 3ZS6A 4DCXA 4ND9A 4POXA 4LZ7A 1Y9UA 1DMBA 4UACA 4RXLA 1DOTA 2ZXTA 2RC8A 1B0HA 1OLCA 3PUXE 5H8HA 1Y1MA 2VHAA 4LZ8A 4L17A 2QSXA 1SW1A 1O63A 3ZKKA 1FTOA 2YLNA 3VXBA 5DVIA 3SEWA 5K2XA 2F78A 1UIVA 2WKYA 2R9JA 3E3KA 4H65A 4Z7EA 1P99A 1B4ZA 1O64A 3UORA 3C31A 1FQDA 1MDQA 3C4MA 3PD9A 5L8DA 4BDMA 2DS9A 5CMMA 3OO8A 1URGA 3MC2A 5ICQA 1VFEA 3LSWA 4BDLA 1MG1A 2VD3A 2G29A 4ZS9A 1CB6A 1Q1KA 5TPAB 3RTWB 4DE8A 2NWJA 2XXIA 2Q8JA 4ZEFA 4I62A 1B1XA 2E1SA 4KYEA 3HO7A 3LBSA 4OEUA 1JEVA 4ESWA 4YZZA 3B6WA 1ZKBA 2O51A 2Y7KA 4POWA 3CI8A 3PV0E 2A5SA 3RUMA 4RJZA 4OYVA 3C34A 1R9LA 3FIRA 2Z8DA 4GWOA 1N7XA 2H4IA 1FQFA 4NF4B 2OJTA 2D3IA 2O6AA 2ZNTA 3FXUA 3O97A 4QSDA 3I5OA 2XXUA 3LUYA 1TFDA 3BFUA 3CSBA 2XXTA 1JW4A 4GIZA 5B7DA 3MPKA 5H8SA 3TPAA 3PMVA 1Z7NE 3R6UA 4QFOA 3TTLA 1HSEA 2ONRA 1AMFA 3OOAA 1L5TA 4FORA 5B70A 2ZNUA 3PU5A 4OENA 1OQGA 3M3FA 1DPEA 1MS7A 2XXWA 2DE2A 3KN8A 3V89B 3B6QA 4RNSA 3TKDA 2V25A 1B5HA 2ZNSA 4F2OA 3OO7A 3H06B 3IB2A 5JK4A 1TT1A 1Y3QA 4PFWA 3PUVE 2F5XA 2AYSA 1GGGA 1QUJA 3MZ9A 1SDXA 3RNNA 1GVCA 3Q29A 4YMBA 1MPDA 2GHAA 2V3QA 4FAJA 4AB6A 4JSOA 1PEBA 4PQJA 2XXYA 2RKMA 1LLSA 2XXXA 5I56A 4BDRA 3KSXA 3IORA 3SKPA 4YKIA 1H45A 1SQYA 2FNCA 1JW1A 3LSFB 1A99A 5I2KA 3OMBA 4OEVA 4P11A 3E13X 4LZ5A 3EHSA 3MBPA 3K01A 5L9OA 4DXUA 3G7WA 3K6XA 4KHZE 2YPNA 2B65A 4H0WA 4MLVA 1ELJA 3MQ9A 4G8MA 3ODBA 2RC9A 4H1XA 2A5TA 3IL1B 3RTFB 3MW0A 1IITA 3K6VA 1GR2A 1EZOA 3HPIA 3Q26A 1MXXA 2I4CA 3OD7A 4YICA 3U72A 3IAZA 1FTJA 5I84A 1B05A 3PMWA 2ALUA 3SEXA 4NE4A 2F34A 1LB9A 3C9HA 4KI0E 1PBPA 1EU8A 3B7DA 4LQ5A 1JVYA 1YPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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