4GXAA

Crystal structure of sulfate free form of cysb, a member of lysr family from salmonella typhimurium lt2
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
239
structure length
239
Chain Sequence
EHTWPDKGSLYIATTHTQARYALPGVIKGFIERYPRVSLHMHQGSPTQIAEAVSKGNADFAIATEALHLYDDLVMLPCYHWNRSIVVTPDHPLAATSSVTIEALAQYPLVTYTFGFTGRSELDTAFNRAGLTPRIVFTATDADVIKTYVRLGLGVGVIASMAVDPLADPDLVRIDAHDIFSHSTTKIGFRRSTFLRSYMYDFIQRFAPHLTRDVVDTAVALRSNEEIEAMFQDIKLPEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of Sulfate free form of CYSB, a member of LysR family from Salmonella typhimurium LT2
rcsb
molecule tags Gene regulation
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium str. lt2
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator CysB
total genus 61
structure length 239
sequence length 239
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4gxaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4gxaA02
2AIXA 3RQTA 2XXRA 1OLCA 1P1NA 3D4GA 2XXYA 4G4PA 3KOSA 5LOMA 5H8SA 1LSTA 1B52A 4XXUA 4WKMA 2DYXA 2NXOA 4KHZE 1MH4A 4GOTA 4NWDA 4H5GA 4F3SA 1B4ZA 3L6HA 3TPAA 2H4IA 4NWCA 3SEUA 2XXIA 1LAXA 3OSRA 3T9UA 4E0XA 3LUYA 2RC9A 3SEWA 1P1QA 3KJTA 1A8EA 1XS5A 4ELQA 2R71A 3C34A 4IO4A 3K00A 3HO7A 2Q88A 4U23A 1MY3A 1PEBA 3PPRA 2H99A 3R7XA 4U4XA 3N26A 3C33A 4KCDA 5CRYA 4QRZA 3KSXA 2I3VA 2F7BA 2Y7KA 4DE8A 3LSLA 3V89B 1J1NA 1NL5A 3PUXE 3G7WA 3TKDA 1B5HA 1M5FA 2GRVA 1B6HA 2D21A 2HAVA 1A7LA 3HHGA 2ONRA 2O7IA 4KPTA 4EUOA 3TCGA 3SERA 3TTNA 3ILTB 4F22A 2DWAA 4F31B 3MVZA 1F9BA 4YKKA 4HCWA 1FQDA 3GBAA 3TEPA 1H44A 1US4A 4F2QA 1MY0A 5H8FA 1URGA 3C31A 1MDQA 3FJMA 3K6VA 3G3JA 4DCYA 1B5IA 1S50A 4GXSB 4LP2B 2Z22A 3OOAA 1LBCA 1IIWA 4F1UA 4Q5TA 2I6EA 5AE4A 4PP0A 2DE4A 3O6IA 3TDJA 1CE2A 4U21A 3S9NC 1HSEA 4BDNA 4TLMB 4C1TA 3IO6A 2VP1A 4POXA 4U1OA 5H8FB 2BJJX 5HBCA 2HEUA 4UA8A 2Y7PA 4LZ5A 1DTZA 5H8NA 1NNTA 1MY4A 1SYHA 3KEIA 2XD2A 3PPQA 4G8MA 4HCYA 1B7HA 3TTRA 3TZAA 4OERA 4QFKA 1XC1A 4NF4A 5KDTA 4P0IA 1FTLA 4LQ5A 4NF5A 1SW1A 4C1UA 4RY1A 4DCXA 3RLFE 2XXUA 3RGYA 5ISUA 3SEYA 3QK6A 1VFDA 1A54A 5CMKA 2ABHA 3KG2A 4XKQA 1EU8A 4OWDA 2UVGA 3OO6A 1B58A 1LLSA 5H8NB 4GWOA 3FV2A 3HSTA 1MXXA 1QULA 4OZ9A 3VDFA 3K1MA 4E0WA 4QFPA 2DS9A 3H03A 3PU5A 2HAUA 4NF4B 5KDTB 3U8QA 4NF5B 2V3UA 1FW0A 1P99A 4R6KA 4GFRA 1MPCA 4YKPA 2QPQA 1RKMA 1B40A 1H43A 1M5BA 3UN6A 1R6ZA 2X26A 2V84A 5FHOA 4NMYA 3ZS6A 2XXTA 1B3FA 3H6WA 4X1DA 4R2FA 3MP8A 3MVYA 4F2OA 3M8UA 3FXRA 2REGA 3PD9A 3T9VA 1MH3A 1GV8A 1FQCA 4MLQA 2FYIA 3DLNA 2V25A 2GFEA 2DP8A 1QUJA 3B6QA 3VXBA 3O6GA 3PMWA 3FVGA 5A5XA 4ONYA 5IAIA 1CB6A 2O69A 5FTHA 1SI1A 3PPNA 2PBWA 5TP9A 4UACA 3U72A 2H9BA 2ZNUA 4G68C 2F6GA 3FZVA 4KYDA 4ZEDA 1XVXA 1Y3PA 4YB7A 3FATA 1UTHA 5KCJA 3MZ1A 3FJGA 3IOUA 3EHTA 2DXRA 1R9QA 3K6UA 4KCCA 4LZ7A 2Q9TA 3E9XA 1N7XA 1FTKA 1B3LA 4U22A 4TLLB 5BUUA 3ZSFA 2OWSA 3A09A 5CBRA 4OVJA 3U93A 4RK9A 3C32A 2F36A 2PT2A 2P0SA 5A5XB 1P1UA 3MPLA 5FHNA 5TP9B 2UYEA 3HN0A 3MP1A 3T93B 4MF3A 5AA3A 2PMSA 1FTMA 1QW0A 2XX8A 4H0WA 1UTHB 5KCJB 3O6HA 5K2XA 3SDFA 1D3KA 2P2AA 1OIBA 1MY1A 3WAFA 3PV0E 1PC3A 4KR5A 4XKNA 1GGGA 3W15C 2RCAA 1LAHE 3USDA 3V8XB 2W7YA 4LONB 3K4UA 3EHUA 2KLFA 4IO5A 4O3AA 2X7QA 4KYSA 3MWBA 1PDAA 4NE4A 2QMWA 3H3GA 2QS2A 4L17A 4N6PA 4AB6A 3Q25A 1MQDA 1A99A 1OVBA 5HPQA 4AQ4A 4HTGA 4TOZA 4P0GA 1USYH 5CC2A 3C36A 4ESWA 3WAEA 4FECA 1B05A 3LR1A 2OJTA 4F18A 1URDA 3ZKLA 3PMXA 4QFNA 2XHDA 4G77A 1RYOA 1Q1KA 1MQJA 1AIVA 3PGFA 5B7DA 4NEDA 3UIFA 3DP8A 2XX9A 3OEKA 2CMOA 3SKPA 3K6WA 1B3HA 2O1MA 4OFLA 4IO7A 5L9MA 2I0BA 3BFUA 1M5EA 5ITPA 3O9PA 3IL1B 1HSLA 1LFGA 3Q29A 2QS3A 1H3DA 1EZ9A 2ZMBA 3G3KA 2ZYNA 1QVSA 1LCTA 1OMPA 1WDNA 2F6PA 1BP5A 1UTBB 2G29A 4GQOA 5I59A 3FGSA 2F5XA 3BKIB 3MW0A 3PUVE 3N6UA 2DE3A 3KFMA 4NF6A 3Q26A 4ZS9A 3CR9A 2F34A 5DT6A 3DM0A 1NH7A 4DLDA 3K1NA 3PUYE 3HV1A 1JETA 2VD2A 1Y1MA 2DXYA 2DSFA 4R73A 1FTJA 1B9JA 5JEIA 3H06B 3ONMA 5L9SA 3MPKA 3CFLA 4R2BA 3QIMA 4GRKA 3CG1A 1SW2A 3O2AA 3MZBA 4Z0IA 1LGBC 4I9DA 1H76A 5I59B 2XXXA 1UQWA 1GTKA 4NF6B 3MUQA 4MBPA 1MM7A 1DOTA 3K02A 2OZZA 1Y3QA 1VR5A 3MAMA 4YKIA 4DXUA 3H6VA 4PFYA 3MC2A 3KBRA 1PB8A 3A3UA 3K2DA 3IK6B 5TPAA 5DTBA 3Q28A 3PPPA 1XOCA 3TTLA 2E0SA 4Q0CA 1YPNA 4GD5A 3LSXA 2FNCA 1LBBA 2Z8EA 3QSLA 4H6DA 4H65A 1SW4A 3RTWB 3VVDA 1D4NA 1QUIA 2RC7A 1TWYA 1OQHA 1Z7ME 4R6HA 1URSA 3GLBA 4OENA 2UVIA 4FIMA 1SI0A 1XVYA 1XHYA 1H45A 2UYFA 1MQIA 2E1SA 3HCQA 5JTYB 3TTKA 4LQ2A 2HXWA 3CG3A 2YLNA 4M4GA 1BKAA 2RF1A 4G2ZA 3MP6A 4Z7EA 5DVIA 1B3GA 1S7YA 5TPAB 1N3XA 1M5DA 4LATA 3FXQA 1B7UA 2Y7IA 5IKBA 3E13X 3RNNA 1PB9A 1JVYA 4PFWA 3H6UA 4ELOA 3BBRA 3T9HB 2RC8A 1R9LA 3VXCA 4ZEFA 1POTA 3KN8A 2QSXA 3I5OA 4KD5A 2R9JA 4M1VA 2O6AA 4JSOA 3TMGA 4GLIA 4F1YA 1MQHA 4QSCA 2PT1A 2ANJA 5I56A 2A5SA 3S2VA 4YAHX 4LUBA 4F19A 1JW5A 4NF8A 2HQ0A 4BDMA 1GR2A 1ANFA 5ELVA 3TCFA 3I3VA 5L8DA 4Q30B 4X9TA 3K1PA 4ZEKA 4DZ1A 3OO8A 4R6YA 1B7ZA 3FV1A 3I6VA 1B3EA 1NNFA 1B46A 2HZLA 1FQAA 3GBBA 1N3WA 2IA4A 5AA1A 1ZIUA 4BLAA 4F3GA 3IORA 4IGTA 3CFZA 3T96B 3E4RA 3TAJA 5AA2A 3O66A 1ZJLA 3ODBA 4QFLA 1QJMA 5I56B 1SYIA 1AMFA 4H5FA 4NF8B 1FQEA 1UIVA 3W9VA 4C0RA 1VFEA 2DWIA 4GXAA 3UK4A 2HCAA 1I69A 1LB8A 2VGQA 3UP9A 2F8DA 1AH5A 4DIGA 3TELA 3G3FA 2F7CA 3FVOA 1FCKA 5CBSA 1SDXA 2DWJA 2YJPA 4OMBA 2Y7RA 3E3KA 4ECFA 4JBZA 2QL3A 4YB6A 5CMCA 5AA2B 4PETA 2QMXA 1B2HA 2XXVA 3QUFA 5I57A 4H8JA 1TFDA 5EHSA 1ZMGA 1POY1 1Z7NE 2OCUA 4PFUA 4GF8A 5DVJA 5ITOA 3Q27A 1DMBA 3IB1A 4F3PA 1B51A 3ZKKA 2NUVA 1JVXA 3VVFA 4IO6A 4R9GA 4DXCA 3N94A 1IXIA 3GXAA 5BWJA 1P1WA 3T66A 4MFIA 4EDPA 1OLAA 1MG1A 2LAOA 1I6QA 1SVXB 2NOOA 1ZKBA 4XTCQ 1LAFE 2D3IA 1EZPA 1B1HA 1YCJA 3P7IA 3SETA 1LAGE 2DVZA 3VE1B 1D9YA 4Q8RA 3LSFB 2GHAA 3H6TA 5I57B 2ALUA 4XKPA 4GL0A 3IOWA 2THIA 2VHAA 1PB7A 1FTOA 4GL8A 3M3FA 5F7VA 2GHBA 2V3QA 3IJXB 3TTMA 4YICA 3EN3A 4JDFA 4PQJA 2DVCA 3IX1A 1UIUA 2AL4A 3HHFA 3DP6A 1YAEA 3KZGA 3OELA 4KFQA 3QYTA 1RYXA 4ELRA 3IO4A 4O3CA 2F78A 3FVKA 1MXVA 1MPBA 2DWHA 5DEXB 2I0CA 4JB7A 4JWYA 1ELJA 3PMVA 2I3WA 2D5WA 3TODA 2G93A 2B65A 4GIZA 2OBGA 1M5CA 4IB2A 1JEVA 4EQBA 5CMBA 3B6TA 3D4CA 1IUDA 4H67A 4OEUA 4FAJA 2OLBA 2Q89A 4ZEBA 3OEMA 1ZTYA 2VOZA 3TYHA 2I4BA 4KI0E 1B1XA 5DYHA 3PUZE 3UA8A 4YB5A 1JW4A 1SBPA 3K0VA 1AOVA 1UTBA 2XXQA 2ZNTA 4YMAA 3MBPA 1WVJA 2O7UA 4RPOA 1IITA 2RCBA 4QF9A 4JXIA 4JWOA 1A8FA 1N84A 1ZBMA 3EF7A 1SD3A 2UVHA 2M8CA 2ZYOA 2XXPA 3S9EA 4RYAA 1N0TA 1B5JA 3SEXA 5AA4A 3RTFB 3VVEA 1USYE 4TQUQ 3VLWA 1Y4CA 4RPNA 3DP4A 4RJZA 4POWA 1LCFA 2RKMA 3JZJA 4RA1A 3MVWA 1BIYA 3EPEA 1JNFA 1TFAA 2Z23A 2REJA 1O63A 1IXCA 2I49A 3IB0A 1Y1ZA 5H8QA 4QFOA 1DSNA 1SQYA 1DPPA 1PBPA 2O84X 1I6BA 5CI5A 1B0HA 4ISUA 4FE8A 4R74A 1ZU0A 4K3FA 2XD3A 5AA4B 1MPDA 4IGRA 3N6TA 5EHMA 3FJ7A 4DDDA 3THIA 4OETA 1N04A 1US5A 2NVUB 3MJNA 5H8QB 2I58A 1IEJA 4WEPA 3CVGA 4MH5A 3RY3A 2F97A 1N7WA 2IEEA 1B0LA 1MDP1 2HZKA 1O7TA 2H25A 1MXWA 4YMBA 1R1NA 4OEVA 2DQVA 1EH3A 3V83A 5JTYA 1B32A 2Z8DA 3OO7A 1VSOA 1ZLQA 3TQLA 2CZLA 3K6XA 4ZDMA 1Q35A 5TU0A 4IO2A 3U92A 2ZNSA 3RUMA 4RXLA 4G8NA 2ZXTA 4I62A 3RT8A 2OK2A 1LFHA 4OFJA 2I48A 4DXBA 4ND9A 3TUSA 1YTVA 1QKBA 1T0KA 2QS4A 4HW8A 4WXJA 3VLVA 2PX1A 1OVTA 1A40A 4RNSA 4EF2A 4OFOA 2AL5A 2X7PA 3KGCA 3SEVA 3ILUB 1QKAA 4ZEIA 4F29A 1BTJA 4O3BA 3VV5A 1S9TA 4QSDA 3JV9A 4LVQA 4OTEA 5I2NA 4X48A 4EXLA 3GZGA 4H1XA 4FJPA 4N07A 4XKRA 4KQPA 3U94A 3C9HA 2XXWA 3IB2A 4H8IA 4ZECA 3OO9A 3KN7A 2O68A 3H4ZA 4HS7A 4FEBA 3JYRA 1Y9UA 3U1OA 3S9LC 4ZE8A 4ESXA 5AA2D 3AXFA 1NMUA 3MZ9A 2QRYA 3LBSA 3R6UA 1AL3A 3O97A 1IXGA 4QSEA 3VLUA 2ZYMA 3FXUA 4R72A 3V5AA 4OYVA 4EQ7A 3CRBA 3RT6B 3W9WA 1QUKA 3KN3A 3FUZA 4G8HA 4JSDA 5I2NB 1NH8A 1XT8A 4PFTA 2XX7A 4LA9A 3B7DA 5JK4A 3RN8A 1O64A 5EYFA 2ONKE 5FTIA 3EQ1A 1EZOA 3TFLA 4NTLA 4ZZAA 3LSWA 4ZZEA 4YU0A 3G3HA 1LB9A 1FQBA 3F11A 2WKYA 4X1BA 4XIGQ 1KWHA 4N13A 3FIRA 5ICQA 5J1DA 1MQGA 2VD3A 2Z8FA 2QJEA 2DE2A 5HM4B 3EHSA 1DPEA 3C4MA 1JQFA 5CMMA 1HSJA 2Y84A 2A5TA 1I6AA 3L6GA 1BLFA 4IO3A 1MXYA 4EXKA 3UGWA 2ESNA 3FD3A 3QAXA 3KOTA 3KSJA 3G3IA 4MLVA 2UVJA 1A55A 5FHMA 3UORA 5L9OA 4FORA 4ZE9A 4F3BA 1IXHA 2B3FA 3KJ7A 4U2RA 1D9VA 3T22A 3MQ9A 1IQ7A 3K01A 3OENA 1N76A 2F7AA 2HFBA 5I2KA 4F1VA 3OSQA 4LZ8A 1II5A 2PYYA 3FVNA 5F1QA 4IY6A 2Y7WA 5ICTA 4OESA 2PVUA 3PUWE 3R26A 2A5TB 2Q2AA 4OXVA 3QUJA 1MM6A 2O51A 4WEDA 3PD8A 1NKXA 4BDOA 5DEXA 5CM6A 4YZZA 4R75A 3OXNA 2R6GE 3IJOB 1GVCA 3BFTA 3ECRA 2I4CA 5I84A 1WODA 4THIA 4BDQA 4PE5B 2V93A 1MRPA 3SESA 2H5YA 4JWXA 5I2KB 4OQOA 3S4UA 4YKJA 3IOVA 3C35A 4G68A 3OMBA 2XXHA 1L5TA 3DELB 4U4SA 2OWTA 3VFJA 3CFXA 4EQ9A 2AYSA 2QS1A 3IR1A 3O29A 2V3TA 3QXMA 1NNPA 2O1LA 3S9MC 1IZ1A 4I1DA 2YPNA 2FA7A 4OHNA 3RPWA 2ZYKA 4R9FA 4ELPA 3G3GA 3CI8A 1Y3NA 1Y4TA 1MXZA 1LFIA 2F35A 4FATA 3FASA 4IY5A 3A3CA 1ATGA 3OD7A 2UXAA 3MVXA 3B6WA 3HPIA 3O28A 5DVFA 1JEUA 4GVOA 4P11A 3CSGA 1NNKA 4FEDA 2RINA 4QHQA 4G68B 3TQWA 2P1SA 5I58A 1Y20A 5H8HA 1MS7A 2H98A 1TXFA 3LC8A 2Q8JA 4EF1A 1P1OA 1SW5A 1JW1A 1MY2A 1MXUA 5M2VA 5B70A 2ONSA 5K2YA 1B4HA 2NWJA 4F39A 3PPOA 4I8CA 2GH9A 3M3KA 3IOTA 3CIJA 2Q2CA 1TT1A 4AB5A 2B3BA 3N5LA 3M3LA 2DOJA 1DTGA 1OQGA 1NFTA 1FQFA 3H7MA 1VE4A 4RK2A 4U1ZA 4BDRA 3CSBA 3IAZA 1PBQA 3T9XB 5I58B 5KZTA 4BDLA 3TCHA 5H8HB 4KYEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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