4GXPA

Chimeric family 1 beta-glucosidase made with non-contiguous schema
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
456
structure length
456
Chain Sequence
KKFPEGFLWGVATASYQIEGSPLADGAGMSIWHTFSHTPGNVKNGDTGDVACDHYNRWKEDIEIIEKLGVKAYRFSISWPRILPEGTGRVNQKGLDFYNRIIDTLLEKGITPFVTIFHWDLPFALQLKGGLLNREIADWFAEYSRVLFENFGDRVKNWITFNEPLCSAIPGYGSGTFAPGRQSTSEPWTVGHNILVAHGRAVKVFRETVKDGKIGIVLNGDFTYPWDAADPADKEAAERRLEFFTAWFADPIYLGDYPASMRKQLGDRLPTFTPEERALVHGSNDFYGMNHYTSNYIRHRSSPASADDTVGNVDVLFTNKQGNCIGPETAMPWLRPCAAGFRDFLVWISKRYGYPPIYVTENGAAFDDVVSEDGRVHDQNRIDYLKAYIGAMVTAVELDGVNVKGYFVWSLLDNFEWAEGYSKRFGIVYVDYSTQKRIVKDSGYWYSNVVKNNGLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase Chimeric protein
publication title Chimeragenesis of distantly-related proteins by noncontiguous recombination.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 162
structure length 456
sequence length 456
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2012-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4gxpA00
4U3AA 1FHDA 2VR4A 3AZSA 1PJ9A 4P7LA 4W88A 2YOCA 1UWTA 1UA3A 2O9TA 4YHGA 3WD4A 1NARA 2CITA 2WHKA 1JAKA 3ZT7A 1CZ1A 1V02E 5C8BB 2QV4A 3IK2A 1CLVA 3A3HA 1ZBWA 1G9HA 4MNKA 4C7GA 4HOZA 5A2BA 1UKQA 3OA5A 3QR3A 5D8WA 4BQ4A 4N42A 4JCLA 1MW0A 3GXIA 4U2ZA 3ZSTA 3AZTA 4D72A 3IANA 2G3JA 5HBFA 3T2QA 1ZS2A 4PMOA 2EXOA 1F4HA 2Y8KA 3K8KA 3VGDA 4ACYA 3FHQA 1MWOA 4HZ7A 2J77A 1CGUA 4GXPA 4H8VA 1HJSA 1E71M 1Q6DA 1HJVA 5GQBA 3FAWA 1VIWA 4LQ1A 4CKQA 2FDMA 4KGLA 1QNRA 3GXDA 1M7XA 5M03A 5ABFB 2D0GA 5KZ6A 3EMQA 2A3EA 2BY3A 2VOTA 4XB3A 5BYWA 4B9YA 1C8XA 1BF2A 1XD1A 3ARPA 3WUGA 5AY7A 1MQRA 2PBGA 1QHOA 3AS3A 2C7FA 1C7TA 4E8CA 4Q7NA 1QOXA 1MXGA 3QGVA 1MXDA 3F5LA 4JCMA 2Y5EA 2W92A 2WNWA 3FAXA 3N17A 1JZ3A 5CPTA 2CCRA 4MB5A 3VIOA 1C90A 5CQ1A 4W5ZA 3VDHA 1VAHA 1BGAA 3ZM8A 2TAAA 3WF0A 1KR1A 4PCTA 4HA3A 1NWTA 3ZT6A 1MVYA 1NOUA 1V0MA 2YLAA 3ZMRA 2C0HA 3NCOA 1U33A 4LYRA 1KFWA 1PEZA 4U33A 1ITCA 3MSGA 4GZIA 3QHMA 1XCWA 8CGTA 3HJEA 5C70A 4D1IA 2D22A 3AHYA 1W9PA 1BYAA 4EAMA 1GHRA 1LJYA 2PWFA 2OSXA 3OGSA 3ZO9A 4ML4A 1EXPA 1E15A 4F8XA 5A3HA 1GQIA 4J3VA 3WEZA 5F7UA 4GINA 3EBVA 3K4AA 4HOWA 4EK7A 3PZUA 4GKLA 3CMJA 4UFKA 4UFIA 1TZ7A 4W8BA 1UG6A 4CCDA 3AMLA 5A6AA 1J18A 2FHCA 1UH4A 3LMYA 1HF6A 3O6AA 4MB4A 2ZXAA 1J0YA 5BXSA 1NM9A 4FF5A 4U2YA 3RILA 2ZX8A 1QBBA 2ZXQA 3UG5A 3VGEA 3DYMA 3PZMA 5A6JA 2EBNA 4FK9A 3PZTA 2DT1A 4TVCA 3VIPA 1HNYA 1HL8A 4QAWA 1WB0A 2ZUNA 3KZSA 3SUUA 1W3JA 1J10A 4JL1A 2YBTA 1SR0A 2GSJA 3AHXA 4LYPA 3BLKA 3II1A 1NP0A 3VGGA 2ZWZA 5M5DA 3CHFA 1XYZA 3PTMA 4UFHA 4X0NA 2XFYA 4XV0A 2VX7A 1PZ3A 4UZUA 2WC7A 4PUEA 5A6MA 3OLDA 1WDSA 4FLSA 1TVPA 2BY0A 4OJYA 4F66A 1OIFA 5DFAA 1UKSA 1E3XA 3VD3A 2GJXB 1CXIA 2OYLA 1GZJA 3VVGA 4PTVA 3BAJA 3MANA 1OCQA 4JFSA 2CKRA 2GJPA 4D6DA 1GVYA 4DUXA 1DTUA 2ZX6A 3BLPX 2WCAA 4MADA 1JDCA 3CBWA 1V08A 1OSEA 3WN6A 1KXHA 1UKOA 4ATLA 4AD5A 4XZBA 3BMVA 3EDDA 4MTVA 3WNMA 2YDRA 2WWDA 4M81A 1W9VA 3UCQA 3MV11 1KWKA 1JZ5A 1GCYA 2JIWA 3WBEA 5DF0A 2X05A 4J28A 2D3NA 3KL5A 2UY2A 2UWFA 5FIPA 1B30A 2GK1A 3SCUA 3WEOA 2GDUA 3QOMA 4M24A 4PMQA 1OBAA 3W29A 3ARXA 1O6IA 3AQUA 3T0DA 1NP2A 1QI3A 2WZIA 1V3JA 4IPLA 3SCSA 4EANA 4QCEA 3A4AA 1CBGA 1JXKA 4P7NA 3W53A 4OZOA 3W25A 2XM2A 4URIA 3AIRA 2Z1KA 1OGSA 4WKFA 1CWYA 1JYNA 3U57A 2D23A 4RL3A 4HZ6A 3AYRA 1OT1A 1XH1A 2WSPA 3WDJA 5A2CA 4PMXA 3VIJA 2VX5A 2WW5A 4AEFA 1JI2A 3WL0A 4CCCA 1R8LA 4BQ5A 1V0NA 2YA0A 3ECQA 1XSJA 3RM9A 4HMEA 1EIBA 1ZJBA 4TX6A 1FFRA 3CTTA 1J01A 4BS0A 3W27A 1B3VA 4CN1A 3LPFA 3N04A 1V6UA 2EQDA 3S6TA 2VZTA 3QHNA 1EGZA 2JIEA 5JUVA 4QLLA 2PF0A 4MPKA 4RE2A 5LA0A 4QFUA 4UQBA 2ESCA 2WCSA 3FHAA 2HISA 2VQTA 5LYRA 4HA4A 1JZ6A 2E0PA 4Z2GA 1PIGA 3AYSA 1Y7VA 7TAAA 3B9EA 1W3HA 1UR8A 1UHVA 2YL5A 1XSIA 4PMDA 1NWUA 1K9DA 1BYDA 3MMWA 2V3GA 4MNLA 4JKLA 2XGBA 3ARZA 1CXHA 2CBJA 5HPOA 3POHA 1JI1A 3QOKA 1RD6A 3MV01 4CD8A 2ZICA 4W8LA 2DT2A 3TOPA 4A3YA 1UD5A 3THDA 4P7RA 1E1FA 2E40A 2WKLA 4QCFA 4AD0A 4M56A 4GIAA 2WC4A 4V28A 4JFTA 2W67A 4AIUA 2F8QA 3N9KA 2WAGA 4XUYA 3WKZA 1QI5A 3AMKA 3KEHA 1WZAA 1V3KA 2GUYA 2EPOA 4IPNB 1CGTA 3CIVA 2GK1B 4QDMA 5LA2A 1UUQA 3RM8A 2YL8A 3I3DA 1C91A 3VX1A 5I6SA 5LA1A 1D2KA 5AC5A 2ZXBA 4NI3A 4WSKA 2WMIB 4M8UA 1N82A 2ZUUA 5DMYA 3BH4A 1EHAA 3CZKA 2UY4A 4LGXA 2WB5A 3PTKA 3TTOA 4TVUA 1LQ0A 1R7OA 1NWRA 4J3SA 5GNZA 5EFFA 1DWGM 2CHNA 3GNOA 3L2LA 2XJ7A 2YJQA 2XIIA 1C92A 4J7RA 5I23A 3W38A 4ZXOA 3VPLA 2YLLA 1JNEA 4ACZA 1FP9A 2VO5A 3N11A 2VRJA 2XWEA 1H1NA 1R87A 1E55A 1JYXA 1GOMA 4D71A 1ISXA 3WF4A 1WZKA 1VEMA 3VM7A 1UD8A 3KWXA 2WBGA 4F9JA 1Q4NX 4X9YA 3ARSA 3U7VA 1QI0A 1LG2A 3W37A 3AMDA 2WLYA 1EDQA 2A3AA 4OBSA 2OYKA 1LWHA 1CPUA 1G01A 5D9NA 2NSXA 1BG4A 4AZCB 1DWHM 4AXNA 3J7HA 4YPJA 4Z2HA 5CLWA 1LG1A 1B3ZA 2YBUA 4DUVA 1U30A 3BAIA 3WUEA 5CGTA 3IJ7A 4JZ5A 3G6LA 4KGJA 4UCFA 3CZEA 3IJ8A 3T0AA 2OSYA 4TTGA 4H2CA 3NUKA 3GNRA 1YQ2A 5I3DA 4D6IA 3IJ9A 4MB3A 5EB8A 2D1ZA 5I2UA 1W3LA 3HN3A 3AHZA 1CDGA 1SFSA 4AYSA 3B8SA 2XYLA 4UFMA 1B3YA 1VFMA 4OOUA 1W9BM 4LPCA 4U3CA 1UWUA 3WDHA 5D4YA 3EDFA 5CSYA 3MUAA 2X2YA 2VX6A 1ZB5A 1DHKA 3K46A 4JHZA 3TP4A 2J4GA 2OWWA 3N15A 3VD7A 1W91A 1HJWA 2CIPA 3VIFA 4P8UA 2WVUA 1V3IA 4DM1A 3DECA 5A6KA 4OBRA 4B3KA 1NWSA 3HMCA 1A3HA 2E9BA 2EPNA 1GW1A 1EOMA 3WFZA 4GI8A 5A8NA 3CH9A 2WK2A 3VIHA 3WF1A 1OWQA 5BXPA 2V5DA 1B3WA 2G41A 4JFVA 1UH2A 2OWCA 2WZEA 2YDQA 4B3LA 2V3DA 4NRRA 3CMGA 4E4PA 5M17A 1H5VA 1VFUA 2WC3A 2G3MA 1M03A 3WIJA 4NZCA 3FN9A 1UWRA 2Z1SA 1EDGA 2F2HA 1RH9A 6A3HA 1XSKA 4H41A 3N1AA 4KWUA 4JFWA 1J0KA 2ZWYA 4CD4A 1KGWA 4MB1A 2VT0A 2F61A 4W85A 2QPSA 4GQRA 3NDZA 3PZOA 4HZ8A 1XGZA 1M53A 4AZ7A 2BV9A 1V6WA 3MMDA 4K68A 4MDPA 1W32A 2Q8XA 1E6SM 2X09A 2GJRA 3FW6A 3GXMA 1KXQA 2G3NA 1US3A 2XGIA 5D9MA 2W63A 1EH9A 4XZWA 1W9XA 4AIOA 5E70A 1NH6A 1BHGA 4BQ3A 1HT6A 3MUZ1 4ZE5A 1CTNA 2J8GA 1ZBKA 3M6DA 3PTQA 1EO7A 5GPRA 1US2A 2XVLA 5C71A 4BA0A 2W62A 3AMGA 1ZBCA 3FY1A 3LPPA 5AYBA 2VI0A 2CBIA 4V2XA 4HOXA 3ZIZA 1K9EA 2W61A 3UEQA 1VBRA 2VL4A 3UETA 4J3XA 3OLGA 1B0IA 2JEQA 2UY5A 3AOFA 1CGWA 4QLKA 3TTQA 3MO4A 2EEXA 5BWFA 1H11A 2J47A 5JBDA 2FH8A 1KCKA 1UWQA 1UQZA 1CIUA 1W1VA 3N18A 1VFFA 2DSZA 6CGTA 5A8QA 2X0YA 3U7BA 4Z2KA 3BAWA 2XVPA 1CYGA 2E4TA 1QW8A 1E6PA 5A1AA 3ARWA 4LYQA 5EBAA 3RJYA 1O7AA 3UR7A 2PC8A 1WDRA 1KQYA 2WANA 3SUTA 3ALGA 4AEEA 5FCZA 3BAYA 1JF6A 5E0CA 1VENA 1E43A 1GOQA 3WDIA 4A3HA 3WH5A 1KBKA 1MFUA 3GTNA 3VNYA 1JF5A 1HKKA 3K8LA 1Q6GA 3HU7A 1GJWA 1H09A 2A3BA 2AMGA 3KE0A 2EJ1A 3CO4A 1TMQA 4GI9A 2XWDA 3GH4A 1AQHA 4W89A 1QNQA 4NRSA 4TXEA 2CETA 3OGRA 3GBDA 2J75A 3OLIA 3U5YA 2OYMA 1J9YA 1E4MM 3WDPP 1GQJA 4X0VA 2PB1A 4TOQA 3LPOA 3VGFA 3SUWA 2J7FA 1BGGA 2VVSA 2XSBA 2VZVA 3GH5A 3SCVA 2XHYA 2ZUMA 3AZRA 1K6AA 1UZ1A 3L4XA 4M82A 1V6XA 4JHOA 3B9DA 4S3JA 2WXDM 3ZR5A 1EDTA 3A4WA 2WHJA 1VJSA 1E56A 1UD3A 1WE5A 3PZGA 1L8NA 4Q22A 5CPSA 4W7WA 4BQ2A 4PTWA 3VX0A 1BTCA 2BXZA 1BYCA 4W84A 1MYRA 3WNKA 1CLXA 4FLOA 4B15A 3EMZA 1MW2A 5I0DA 2J7DA 3NDYA 4B16A 3WH9A 1HKIA 5HNNA 1B2YA 3MSDA 1QNSA 2EPLX 5FL0A 2X1IA 5BRPA 1X6NA 1QHPA 1NOWA 1UZ4A 3DC0A 3T09A 3SCPA 4IUGA 5E6ZA 2VURA 1KXVA 3CZJA 1E6NA 4CN6A 2O9PA 3L4ZA 3WQWA 1E4IA 1V03A 2FGZA 1JFXA 2OWXA 1W2PA 3UG3A 4CVWA 3WENA 1JZ2A 5HPCA 3UR8A 2CBVA 2Y8VA 1UR9A 1C8QA 4U5KA 1TE1A 4AD4A 2E3ZA 4WIWA 1TFVA 3GDBA 1UD4A 4UFLA 1XYFA 1E6QM 2WVVA 2DGAA 2IXUA 2ZUVA 4PTXA 3AFBA 1UR4A 2J78A 5CPQA 4UQCA 3VTRA 4QLJA 3RIKA 4M1RA 1SMDA 2EPKX 2RGLA 4D6GA 3AS0A 4UQ9A 2WMGA 4A4AA 1E5JA 5ABEA 5IXEA 2G8ZA 3OIHA 3MUY1 1OM0A 1DWIM 3CPUA 4CCEA 4PSPA 4DUWA 1ODUA 4UZSA 1JYWA 1E0VA 3MKKA 3PZQA 4AZGA 4DWSD 2BY2A 2VRKA 5HXMA 4TVDA 3RCNA 1WDQA 1CXFA 1KBBA 4W7UA 2XUCA 3FNDA 1HP5A 3ZJ6A 3GYCA 1I1XA 4ATDA 2XVGA 1HJXA 1ZBVA 4H8HA 1JL8A 4KMQA 2DH2A 3L4YA 3DYPA 2QLYA 1PPIA 5D9OA 3EDEA 5E6YA 5A6BA 4MJ4A 3GBEA 4HPGA 4CU7A 1FP8A 3M7SA 1V0KA 3WBAA 2CHOA 3WH8A 4WK9A 2DSKA 5HOSA 4PN2A 3U5UA 3WUBA 4GZJA 3AXHA 3VD5A 1BG9A 2WWCA 3WQVA 1B90A 1VBUA 1SMAA 1MW3A 5D8ZA 1MFVA 1ISWA 3SIMA 4DWSC 1GQKA 4WLCA 4Z2JA 1GHSA 1W1PA 2ZUWA 1B3XA 1VRXA 1IZJA 1OGBA 3WNLA 3KL0A 2BFGA 2O92A 5AYIA 1XD0A 2VZOA 1RP8A 2A3CA 3ZT5A 1CGVA 1G94A 1JZ8A 4CUCA 1GPFA 5IDIA 1OD0A 2Y24A 1ECEA 5FL1A 9CGTA 2CPUA 1Q6FA 1GJUA 1R86A 3W28A 4JIEA 3L2MA 2J8FA 3F5KA 1XHGA 3N13A 1OB0A 4AC1X 1XCXA 1ISYA 2WMFA 3BGAA 1V3HA 3CHEA 3AROA 1IT0A 4WSJA 1KWGA 1GOWA 1R7AA 5A8PA 3VO0A 4WKHA 3CUIA 1BLIA 1HXJA 1J0JA 1W3KA 4TUFA 1JYVA 1K9FA 1PZ2A 2DT0A 1FA2A 1QHZA 1UYQA 2PWHA 1C93A 2YL9A 3K1DA 1E5NA 3VU2A 2WHLA 2YA1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4U3A A;  1FHD A;  2VR4 A;  3AZS A;  1PJ9 A;  4P7L A;  4W88 A;  2YOC A;  1UWT A;  1UA3 A;  2O9T A;  4YHG A;  3WD4 A;  1NAR A;  2CIT A;  2WHK A;  1JAK A;  3ZT7 A;  1CZ1 A;  1V02 E;  5C8B B;  2QV4 A;  3IK2 A;  1CLV A;  3A3H A;  1ZBW A;  1G9H A;  4MNK A;  4C7G A;  4HOZ A;  5A2B A;  1UKQ A;  3OA5 A;  3QR3 A;  5D8W A;  4BQ4 A;  4N42 A;  4JCL A;  1MW0 A;  3GXI A;  4U2Z A;  3ZST A;  3AZT A;  4D72 A;  3IAN A;  2G3J A;  5HBF A;  3T2Q A;  1ZS2 A;  4PMO A;  2EXO A;  1F4H A;  2Y8K A;  3K8K A;  3VGD A;  4ACY A;  3FHQ A;  1MWO A;  4HZ7 A;  2J77 A;  1CGU A;  4GXP A;  4H8V A;  1HJS A;  1E71 M;  1Q6D A;  1HJV A;  5GQB A;  3FAW A;  1VIW A;  4LQ1 A;  4CKQ A;  2FDM A;  4KGL A;  1QNR A;  3GXD A;  1M7X A;  5M03 A;  5ABF B;  2D0G A;  5KZ6 A;  3EMQ A;  2A3E A;  2BY3 A;  2VOT A;  4XB3 A;  5BYW A;  4B9Y A;  1C8X A;  1BF2 A;  1XD1 A;  3ARP A;  3WUG A;  5AY7 A;  1MQR A;  2PBG A;  1QHO A;  3AS3 A;  2C7F A;  1C7T A;  4E8C A;  4Q7N A;  1QOX A;  1MXG A;  3QGV A;  1MXD A;  3F5L A;  4JCM A;  2Y5E A;  2W92 A;  2WNW A;  3FAX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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