4GXSB

Ligand binding domain of glua2 (ampa/glutamate receptor) bound to (-)-kaitocephalin
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title The structure of (-)-kaitocephalin bound to the ligand binding domain of the (S)-alpha-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA)/glutamate receptor, GluA2.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4gxsB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4gxsB02
4GXSB 3PD9A 4JWXA 3PPRA 1BTJA 3EN3A 3TTLA 3QIMA 3MBPA 2AL4A 5ELVA 4EXKA 1FTJA 1MH4A 4PE5B 4Q30B 3TTMA 4YB5A 4LZ7A 3RLFE 3N6UA 4C0RA 3H6VA 3KJTA 4X9TA 3CG3A 1A54A 1A7LA 3OEKA 2VD2A 3IOTA 2XXXA 3LUYA 3A09A 3VLVA 4EF1A 3RTWB 4AQ4A 1B0LA 3ZKLA 1AH5A 1LAGE 1GR2A 3LSFB 3GXAA 4YKJA 4AB6A 2I0CA 1Y3QA 4YB7A 3TEPA 4QSDA 3UN6A 1SQYA 3ILTB 3SKPA 2O68A 3PPPA 1O63A 3PMWA 3T9XB 1LAXA 1DPEA 1MXYA 4JBZA 4YAHX 4U4SA 3KG2A 2ZNSA 4GXAA 3CIJA 2H5YA 3CRBA 1MY0A 4U2RA 3MWBA 2NOOA 4NE4A 1MQDA 4O3CA 2HAUA 2V84A 2RC7A 5HPQA 3RT6B 1M5EA 3PV0E 2ANJA 4GFRA 3SEXA 5H8HB 2AL5A 3FGSA 5L9MA 4Q8RA 3U8QA 1SVXB 2R6GE 3LSLA 1OLCA 4I62A 2ZYOA 2NVUB 1MDQA 3SERA 4M1VA 1EZPA 5HBCA 1A8EA 3K1MA 2P0SA 3MVZA 2H25A 3IORA 1OVTA 3MVWA 4FAJA 3KFMA 4X48A 2O7UA 3V83A 1LBBA 3SETA 3PUYE 3O6IA 4OFJA 1Z7ME 3D4CA 1IZ1A 5I56A 1PB9A 5FHOA 3BBRA 4ELPA 2Q89A 3HSTA 1YTVA 3C32A 3FZVA 4NWDA 1ELJA 4XIGQ 5TP9B 1LGBC 2ZYMA 3GLBA 1R9QA 4PFYA 3TFLA 3PUWE 3RY3A 5H8HA 5I84A 3CR9A 1MXZA 4QFOA 1FTOA 4NEDA 3PMXA 1UIVA 3B6QA 1BKAA 3VLUA 3HHFA 4C1UA 4ELRA 2IA4A 3RPWA 1URDA 1N7XA 4R9FA 1Y4TA 1NFTA 4G68C 1IXCA 2RKMA 4G8HA 2I3WA 1GV8A 3VE1B 3IOUA 1FCKA 4HS7A 1IEJA 1NH7A 3O28A 1XVYA 2IEEA 3K2DA 4IO6A 1N7WA 4ZEBA 1B2HA 4G68A 1SYIA 1D9VA 1MQIA 2HQ0A 1HSJA 1BIYA 4F2OA 4JDFA 5CRYA 3MUQA 1SBPA 4H8JA 3OELA 1T0KA 2OK2A 1P1WA 4Q5TA 1N76A 5TP9A 3QSLA 3K1PA 1B52A 4KHZE 1S7YA 3V89B 5F1QA 5ICQA 1AIVA 4ELQA 1XC1A 1Y1ZA 2OCUA 3FUZA 1IQ7A 1JNFA 4EQ9A 2DWAA 3CSBA 3OENA 4OERA 3O66A 4LONB 2XXQA 3T66A 5H8NB 1H45A 4ZEDA 4F1UA 1N84A 3K1NA 2PYYA 4F39A 3G3HA 4QFLA 2GRVA 3QUJA 2XXTA 5FTIA 1MY3A 1MY4A 4IO2A 4TLMB 3M3FA 1O7TA 3VLWA 3EQ1A 3IB2A 5CMBA 2F7AA 3O29A 5FHNA 2XXYA 4O3AA 4F3PA 3U94A 1QUKA 5JTYB 3U92A 5B7DA 4L17A 2DE2A 4GIZA 3HHGA 1VR5A 4FJPA 1QVSA 1WVJA 4HCWA 3AXFA 4ND9A 4RPNA 4IO5A 5I2NB 3IL1B 4FIMA 1IXGA 4N6PA 3DP6A 1YPNA 3MP1A 4U22A 4GD5A 3VXBA 4M4GA 5KCJA 1B9JA 1EZOA 2UVIA 4DCXA 3R6UA 3KBRA 2ONSA 5H8NA 2YPNA 2CZLA 1PDAA 4HW8A 1NNTA 2Y7KA 4ZE9A 3LR1A 4ZZEA 5JEIA 2I0BA 2V3QA 1N0TA 3IOWA 2F6PA 4R6KA 3VVFA 2DWIA 1IUDA 1Y20A 5TU0A 1OQHA 2WKYA 1URSA 2RC9A 1M5BA 5JTYA 1ZU0A 2Y7PA 4ESXA 4R2FA 3UORA 5A5XA 4GLIA 2DSFA 1QUIA 1SD3A 3V8XB 3OOAA 4OFLA 3FATA 1QKAA 2BJJX 3MZ9A 5I2NA 3DP4A 3T93B 1TFAA 2F34A 2QJEA 2DVCA 4ECFA 2VP1A 2Y7RA 3KZGA 3O97A 3FJMA 4OMBA 4IO4A 3FVGA 2D3IA 1LSTA 3U1OA 2Q8JA 1LLSA 4LVQA 1US5A 3FD3A 4PETA 1SI0A 2LAOA 1EZ9A 1OQGA 1MPBA 5FTHA 4F3GA 4ZE8A 2O7IA 3VV5A 4QRZA 4P11A 4RK9A 1MH3A 5HM4B 3DELB 5AE4A 1LAHE 5CM6A 3GZGA 1UTHA 4OWDA 3UGWA 1MPCA 2VGQA 3PGFA 2A5TA 5CBRA 2I4CA 1JW5A 2I58A 1MRPA 4BLAA 4QFNA 1ZJLA 3E4RA 4OETA 3FJGA 3B6TA 4Q0CA 3G7WA 2KLFA 2E1SA 5K2YA 3G3IA 2GHAA 4O3BA 1VFEA 5BWJA 5I2KA 3BFUA 3Q26A 5DYHA 1TFDA 4BDLA 1ZLQA 1I6QA 3MP8A 3OO6A 4Z7EA 5H8FB 3RT8A 3KOTA 4YKPA 1MY1A 1IXIA 4JWOA 2A5SA 2HAVA 2HEUA 4OHNA 4TOZA 2VOZA 3IJOB 5L8DA 3WAEA 4ELOA 3T22A 5AA2A 2I48A 4OQOA 1JW1A 2ALUA 4R9GA 2E0SA 4GL8A 5TPAB 1VFDA 2Y84A 1IXHA 5IKBA 4KPTA 2O51A 4THIA 4GRKA 3A3UA 2DWHA 3QAXA 3TTKA 1QULA 2DE3A 1MM7A 2I3VA 4RPOA 3FVNA 4LUBA 2REJA 1TXFA 2XXVA 4BDMA 3TAJA 1S9TA 4U1OA 1N04A 3UK4A 3S9LC 2V3UA 4ONYA 1B5IA 1B3LA 3CFZA 5CC2A 3TUSA 5H8FA 3HCQA 4R6YA 3VXCA 2Y7WA 1D3KA 3TCHA 4G4PA 3A3CA 3HO7A 1M5FA 2YLNA 4NTLA 3K6UA 1P1UA 3EHSA 4PFUA 1Y9UA 1ZKBA 5BUUA 4FORA 1FQAA 1H43A 3SEWA 1JVXA 3P7IA 2ESNA 3C36A 4ZZAA 1RYXA 5I57B 2I49A 2HCAA 3CFLA 3C4MA 1UTBB 5ITOA 3O6GA 1HSEA 5TPAA 5DVJA 4IY6A 4PFTA 5DTBA 5K2XA 4TLLB 3FV2A 2Z8DA 3ODBA 2UYEA 1JQFA 3ZKKA 3FASA 1D4NA 1B40A 1NKXA 4LATA 2Q2CA 1I6BA 3FVOA 3TPAA 4OXVA 1PEBA 1B7ZA 2Q2AA 1B58A 2V93A 4JWYA 4BDNA 1ZIUA 3GBAA 4TQUQ 2PT2A 3PUVE 1A8FA 1LB9A 2ONRA 4ZS9A 3RTFB 5H8SA 3IR1A 4DXUA 2ZNTA 3THIA 3K01A 3OO7A 3W9WA 1FQDA 4F18A 3TKDA 4BDOA 4R75A 2VD3A 4KI0E 2RINA 3ZSFA 1XOCA 2XXPA 3RQTA 2XHDA 4MFIA 3CG1A 4XXUA 2HZKA 4NF5B 2Z22A 4RJZA 2O1LA 1POY1 3I6VA 2ONKE 4ISUA 2XX9A 3VDFA 2F7CA 5CBSA 1LB8A 4DZ1A 1HSLA 3FXUA 1RKMA 2B3FA 4YZZA 3S9MC 3TCGA 1B6HA 2QMXA 5H8QB 3SDFA 1B4HA 3DM0A 3PUXE 3M3KA 5I58B 1MXUA 5I59B 4QHQA 1H3DA 4U23A 5CI5A 4UA8A 3RUMA 4LZ8A 1Q1KA 2XD2A 2UVGA 3F11A 2H99A 1O64A 4ZEKA 2Z8FA 3OSQA 5J1DA 5AA4B 3IAZA 4ESWA 1XVXA 1ATGA 1B7UA 2OWTA 3OO9A 1QJMA 3R7XA 2B65A 2DXRA 2XXIA 3MZBA 2HZLA 1DOTA 3CFXA 3QK6A 3TQLA 4IO3A 4YKKA 2ZNUA 3OXNA 2ZXTA 4RXLA 3SEYA 4OZ9A 2DYXA 1TWYA 2UXAA 4IY5A 3H6UA 3IX1A 4PP0A 3BKIB 1USYE 4NF5A 3ONMA 3TYHA 4X1DA 3ZS6A 5ISUA 1LFHA 1YAEA 2NUVA 3JZJA 2PT1A 5DEXB 2PX1A 4OEUA 2QS4A 4IB2A 2PMSA 2O1MA 1S50A 4N07A 1FQEA 3T9HB 4DCYA 4IGRA 1J1NA 4MBPA 5H8QA 4NF8B 2DQVA 3IOVA 4MLQA 1H76A 1R9LA 1PC3A 4POXA 4KYSA 3Q27A 3RGYA 1GGGA 3VFJA 3N26A 2P1SA 2I4BA 4F19A 3TTRA 3PMVA 3K02A 3C34A 1N3XA 3H6TA 1AMFA 2F35A 4U4XA 2QL3A 1FQCA 4P0IA 1I69A 1ZMGA 4KFQA 1XT8A 3DLNA 3O6HA 1BLFA 4YICA 3SESA 2F78A 3G3JA 4RYAA 2GH9A 1CE2A 4XTCQ 2OZZA 3PU5A 4JB7A 2FNCA 3RNNA 4OFOA 4F1VA 3B6WA 5DEXA 4QFPA 3IB1A 1JEUA 1OVBA 2THIA 1EU8A 4JSOA 2H9BA 3C33A 1Y3PA 1ZTYA 1VE4A 4AB5A 1II5A 4P0GA 3TTNA 3K4UA 1KWHA 1YCJA 2F36A 1Y1MA 1SW2A 2QPQA 4LA9A 4OTEA 4XKNA 1UQWA 4GOTA 4XKPA 3IO6A 2OWSA 4H1XA 4WEDA 2VHAA 1AOVA 3EHTA 3FV1A 1PBPA 1QKBA 1M5CA 1B1HA 2XXHA 3O9PA 4H5FA 1F9BA 1B3EA 3H7MA 2RF1A 1LBCA 1GVCA 5FHMA 1JEVA 2REGA 4EQ7A 4RA1A 3IK6B 4H67A 2G93A 1PB8A 1LAFE 3MW0A 3UIFA 1FQFA 4HCYA 2B3BA 5L9SA 4G8NA 3TQWA 2ABHA 2DP8A 1PBQA 4FEDA 4X1BA 2DXYA 3HV1A 3K0VA 5L9OA 3O2AA 2UYFA 3KN3A 4F3SA 2X7QA 4OVJA 3I3VA 4N13A 3LC8A 3N6TA 1MY2A 2OBGA 4ZEFA 3TMGA 4EQBA 3FXRA 4GVOA 1XS5A 3DP8A 3K6WA 3SEVA 1MQJA 3KN8A 4GL0A 4QFKA 2HFBA 1NMUA 2DE4A 3N94A 4ZEIA 4H65A 1ANFA 3G3GA 1DPPA 5KDTB 1A55A 2H98A 1SW5A 3Q29A 4YMAA 1B3GA 4QSCA 4KCDA 4R2BA 4OYVA 1BP5A 4DIGA 4POWA 3S4UA 2F6GA 4E0WA 3H06B 1XHYA 3MAMA 3E3KA 1NL5A 2YJPA 4PQJA 4RY1A 1OMPA 1OLAA 2Y7IA 1P1OA 4DDDA 1B7HA 5CMCA 3IJXB 3K6VA 1B5JA 4DLDA 1NNKA 1DTGA 3VVEA 3KN7A 5CMKA 3CVGA 4WXJA 3HPIA 3BFTA 3KJ7A 1DTZA 3MC2A 2CMOA 4E0XA 4R73A 4YB6A 5I56B 1TT1A 4DE8A 5B70A 1B46A 4GF8A 1US4A 1FTMA 2OJTA 3MVYA 3PPNA 1JW4A 4FECA 5ITPA 3S2VA 3IB0A 5KDTA 3TODA 4MH5A 1NH8A 1IIWA 5DVFA 3M8UA 4I1DA 1LCTA 1ZBMA 4F29A 3KGCA 5EHSA 1N3WA 2QS3A 2ZMBA 4G2ZA 3G3KA 1MDP1 4JSDA 3EF7A 4ZECA 5DVIA 1FQBA 3KSJA 4UACA 4DXCA 3ILUB 3QUFA 1M5DA 4WKMA 1SW4A 3C9HA 3K6XA 2NWJA 2V3TA 2QS1A 4MLVA 5KZTA 5F7VA 4KD5A 1P99A 4H0WA 4XKQA 3B7DA 4G68B 4G77A 3H03A 1SYHA 1FTKA 3OEMA 2XXWA 4GQOA 2D21A 2F8DA 2H4IA 5JK4A 4KYEA 3UA8A 2Q9TA 2W7YA 3OSRA 4H5GA 4NF6B 2RCAA 4F22A 1PB7A 3K00A 4WEPA 1R1NA 4YKIA 3UP9A 2XXUA 3ECRA 3LSWA 1R6ZA 5LOMA 1MXXA 2UVJA 2DWJA 3C35A 2ZYKA 1WODA 1VSOA 3M3LA 2NXOA 5I57A 3MQ9A 3E9XA 2M8CA 1UTBA 1JETA 4BDQA 3JV9A 3MPKA 1USYH 3PUZE 3H3GA 3D4GA 3TDJA 3GBBA 4KYDA 4XKRA 3FXQA 3CI8A 1B4ZA 4LZ5A 2Q88A 1RYOA 2G29A 4G8MA 3TELA 3QXMA 3V5AA 3HN0A 1EH3A 1SDXA 4LQ5A 1LFIA 1B1XA 3L6HA 3KOSA 4OENA 1A40A 5M2VA 3T9VA 2QRYA 5IAIA 4NF4B 3T96B 1B05A 2QMWA 2GFEA 2QS2A 3Q28A 1B51A 1MPDA 2X26A 1D9YA 1B3FA 3H6WA 4NF6A 2HXWA 3FJ7A 1LCFA 4GWOA 5KCJB 5DT6A 4QF9A 5CMMA 4F3BA 1MG1A 2R71A 3TCFA 3H4ZA 3USDA 1CB6A 5EYFA 5AA2D 3TZAA 1B32A 3R26A 3RN8A 1FW0A 3I5OA 2X7PA 1LFGA 3Q25A 1NNFA 3MVXA 2GHBA 4I8CA 2PVUA 2F5XA 2XX8A 3E13X 5ICTA 3WAFA 4I9DA 4BDRA 5I58A 5I59A 4JXIA 4OEVA 3MJNA 4R6HA 2AYSA 3T9UA 4ZDMA 3PD8A 2OLBA 4DXBA 4IO7A 3FIRA 2AIXA 5A5XB 1MXWA 5AA4A 4NF4A 2D5WA 4EXLA 1FTLA 2ZYNA 4IGTA 4PFWA 1B0HA 4U1ZA 2XD3A 1AL3A 3SEUA 2P2AA 1Y4CA 4F2QA 2O6AA 2R9JA 4EDPA 3LSXA 4EF2A 3EHUA 4H6DA 1MQGA 4QSEA 4LQ2A 4R74A 3L6GA 1OIBA 3S9NC 1MXVA 1UIUA 3MP6A 1I6AA 1DMBA 1JVYA 3U93A 2O69A 1P1NA 3PPOA 2Z23A 1GTKA 3EPEA 2FYIA 1MS7A 4YMBA 3QYTA 1A99A 2QSXA 3KSXA 5AA1A 2UVHA 3KEIA 4HTGA 1Q35A 5EHMA 1UTHB 1B5HA 2A5TB 5AA3A 4NF8A 4EUOA 2I6EA 4R72A 4F31B 4H8IA 4KCCA 3IO4A 4KQPA 4LP2B 4OESA 1URGA 1L5TA 4FE8A 3OMBA 1SW1A 2F97A 3U72A 3MPLA 3W15C 2DS9A 3VVDA 1IITA 3S9EA 2FA7A 2V25A 4Z0IA 3MZ1A 4U21A 4F1YA 4FEBA 5I2KB 4K3FA 4NMYA 3C31A 4RNSA 2DVZA 4NWCA 1P1QA 1POTA 1QW0A 2RCBA 2XXRA 1Y3NA 3CSGA 1QUJA 4YU0A 1NNPA 3FVKA 4FATA 1Z7NE 2PBWA 5AA2B 1DSNA 3JYRA 3N5LA 2O84X 3OO8A 3LBSA 3G3FA 3W9VA 4RK2A 2DOJA 4MF3A 2RC8A 1H44A 2Z8EA 1SI1A 1MM6A 1B3HA 4KR5A 3OD7A 3PPQA 2F7BA 4C1TA 1WDNA 1MQHA 2XX7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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