4H0PA

Crystal structure of acetate kinase from cryptococcus neoformans
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
431
structure length
431
Chain Sequence
AEYLLAINCGSSSIKGKLFAIPSFELLANLAVTNISSSDERVKIKTTWEEGKGKDSEEEADYGDKIRYASLVPILLDHLTNSTHVKKEEIKYVCHRVVHGGMHDKGIRVVKGHEEGLMEMDKLSEFAPLHNHRAVLAVKSCIDALPHHTSLLLFDTIFHRTIAPEVYTYALPPPDTELTMPLRKYGFHGLSYASIVQSLAEHLKKPSDQINVVVAHLGSGSSSCCIKNGKSIDTSMGLTPLEGLLGGTRSGTIDPTAIFHHTEDAASDANVGDFTVSKAEIILNKNSGFKALAGTTNFGHIIQNLDPSKCSEEDHEKAKLTYAVFLDRLLNFVAQYLFKLLSEVPIESIDGLVFSGGIGEKGAELRRDVLKKLAWLGAEVDEEANNSNSGGAVKCITKEGSKLKGWVVETDEEGWMARMAKEEFGFLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of acetate kinases from the eukaryotic pathogens Entamoeba histolytica and Cryptococcus neoformans.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Cryptococcus neoformans
molecule keywords acetate kinase
total genus 141
structure length 431
sequence length 431
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2012-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0pA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0pA02
3WXLA 5AQNA 4A61A 1X3MA 3VF2A 3H45C 3FZLA 2IIRA 1C0FA 3LM9A 4JHDB 4I6MA 2KHOA 4FSVA 1QZ5A 3DJCA 3FE1A 1IJJA 2GELA 2GWKA 3A8YA 4H0VB 4HWIA 1QQNA 1MWKA 2NLXA 2AA4A 4FWRA 3R6MA 3R8EA 2ZWHA 3SK3A 2P9LA 4BC3A 1HJOA 4CZMA 3WUHA 4BREA 3S41A 1BO5O 4BRFA 4FWPA 2H3GX 4GNIA 3WXJA 4BRNA 5BR9A 1TUUA 3FLCO 4YDUC 4RWTA 3BF3A 2QW9A 4IJNA 2QM1A 2YJEA 5AQPA 2A3ZA 1XQSC 3MN6A 2P9KA 3O5BA 5BPMA 2A42A 3ZX0A 4H0OA 5BRDA 3MN7A 2BUPA 4I6MB 4B1VA 2E88A 3CQYA 1X9JA 1YVNA 4RCHA 3WXIA 5AQWA 2P9NB 2CGKA 3O4WA 5KQ8A 3CJBA 2PAVA 4WQ4A 4J8FA 2FXUA 3HI0A 4FWLA 1R59O 3O8MA 3A5MC 1JCEA 2GUPA 1ZBSA 1HKGA 1GLLO 3EKSA 5JLHA 4ISFA 1V4SA 3H3NO 2YHYA 4H0YB 1BUPA 4IJAA 1Z05A 4CBWA 3VGKA 1K8KA 1KXPA 3G25A 3ATVA 4PKIA 1Q18A 3QMLA 3ZETB 4PL8A 1GLAG 2V51B 4FPBA 4CD3A 1QQMA 4BRKA 2Q97A 3LDPA 4CZHA 3ENHA 4CZFA 3CJAA 2D0OA 3WT0A 4AM6A 4FWQA 5LJVA 1BWFO 3L4IA 1LOTB 4BQLA 1ESVA 5TKYA 4JD2B 4IWVA 4CBUA 1C0GA 4Z94A 1KAZA 4K43A 5AQIA 2QXLA 4EIAA 1NGFA 4B1UB 4XH5A 5AQSA 3DXMA 1LCUA 3DXKB 1S3XA 2P9IA 1NGEA 4WQ5C 4BR2A 2V52B 4BG8A 3A5NC 2FF6A 4LC9B 2QWOA 3IDHA 3LL3A 2P9SB 4BR5A 2D0PA 5AQTA 4EAHD 5EOYA 5FPEA 4FWSA 4BGAA 2NZTA 2ASPA 2QWPA 5AQUA 3GL1A 4EHUA 3SJHA 3VF4A 3GOIA 4BRQA 3VF6A 2P9PA 1RFQA 5AQMA 1XC3A 5FPDA 4B1ZA 2QWRA 4JN4A 3VEWA 3MK6A 4FOIA 5F0XA 2Q2RA 3GE1A 4BVPA 4XH4A 5BRHA 1GLEG 1E4GT 3JXUA 3WEEB 1U6ZA 4BC4A 4WYBA 1NGDA 3A0IX 4CZKA 2A5XA 5BN8A 3DWLA 2NRHA 3EKUA 1WUAA 3CQXA 5AQVA 1GLDG 1YXQA 4JNEA 3FR0A 2IVNA 4L3QA 3HZ6A 2E2PA 3JS6A 5KPTA 3QFUA 5BREA 3B8AX 2HF3A 3CJ7A 5JMVA 3IFRA 2Q31A 2YCHA 2Q36A 2F9TA 3HM8A 1U2VA 2WUSA 3IUCA 3VEVA 1Y64A 1ATRA 1Z6RA 2E2QA 2Q1NA 3RSEA 3O1BA 4QS9A 3ID8A 1RDWX 3P4IA 4NO7A 3KVGA 3QICA 3R9PA 2GWJA 5KPRA 5AQKA 1SQKA 4K41A 3O80A 3TPQA 4B1WB 5BN9A 3VPZA 1BDGA 1T6DA 1QZ6A 3LM2A 4H03B 4FWMA 4A2BA 5ELZA 4Y0WA 3AY9A 3VEOA 1NGAA 4FO0A 3UKUA 1HUXA 4MO4A 3C0BA 3H1QA 5BPNA 2P9LB 4FWOA 4M7XA 4BR9A 4MLHA 4QS7A 4EHTA 1E4FT 3RSEB 3UE5A 2CGLA 3W3DA 5CE3A 5AQLA 3M3ZA 1NMDA 2P9UA 4FWNA 1IG8A 3GDQA 3LDQA 3AAQA 4JAXA 2P9KB 3QB0A 3M6GA 4EFHA 3CIPA 1ATSA 3F9MA 3UKUB 2YHWA 4XEIA 3HTVA 1BU6O 3I33A 3D2EA 2BTFA 3ULEA 5EXWA 2VCPA 4H0PA 4H0TB 3VERA 4IO8A 2OANA 2I7PA 4BVOA 3ZEUA 3EL2A 3CERA 1D4XA 3MDQA 4GY2B 4CZEA 3H1VX 3CJ9A 4PKHA 1NBWA 5KPZA 4BC2A 4CZGA 4YDUA 3WXKA 3BF1A 4CZLA 4H5NA 4BG9A 4H5RA 1ZC6A 1NGBA 2FSNA 3D2FA 1K8KB 3MMVA 4DQ8A 3L6QA 3H3OB 3BUZB 3D2EB 3FGUA 2E1YA 3OHRA 2V7YA 1ATNA 2ZGYA 2CGJA 2V7ZA 5F1XA 1NGGA 3CJCA 2ITMA 3BEXA 4BRHA 2HMPA 3QBWA 3VEXA 2GTDA 3QFPA 5LY3A 5BPLA 4BRIA 3D7EO 3SMSA 3CI5A 3GG4A 2YJFA 1NGIA 4B1XB 1HKCA 3DXMB 5EX5A 5AZJA 1NGJA 1BA1A 4DHYA 3HBTA 4E1JA 1QHAA 2P9IB 2EWSA 3A5LC 5FPMA 1GLFO 3HSCA 4QS8A 5AQHA 5LJWA 3M1FA 3ZX2A 2E1ZA 2ASOA 3LDOA 2FLOA 4BRDA 3KZBA 4JHDA 3MN5A 2VYPA 3W0LA 2W41A 3CHWA 5ADXA 3H46O 1DKGD 3DAWA 3AARA 3J8AA 4PKGA 4A62A 4BROA 3SMPA 2A6AA 4H5VA 5AQXA 3CJ1A 2P9PB 4K42A 1YAGA 3VEZA 5AQOA 5AZJB 2GEMA 5JICA 1T44A 4KBOA 3EO3A 1GLCG 1MDUB 1TYQA 3WQTA 4MLEA 5AQQA 1HPMA 2J4RA 1GLJO 3SLCA 3VESA 2Q0RA 4M63C 4WQ5A 3U9DA 3FZMA 2FSJA 2CH6A 4A2AA 2ZF5O 1HKBA 1V4TA 5EY4A 3EZWA 3KHYA 3O08A 1MWMA 3MN9A 1YUWA 5AQRA 5I9EB 1MA9B 1RGIA 2D4WA 4BRAA 2P9NA 3FZKA 5KQDA 2DPNA 5EVZA 2HOEA 2VWBA 3UB5A 3MCPA 3U4LA 1JCGA 1HX1A 1S22A 1QQOA 2AP1A 3IMXA 1U2VB 1TYQB 5ADXH 1X3NA 4NB4A 1XUPO 4XH1A 4BC5A 3UKRA 2QWMA 1BOTO 5AQGA 4BRLA 1DGKN 4MO5A 3VGMA 1OKJA 3U9ZA 4FOEA 3CETA 5AQJA 4M7YA 3WQUA 3VETA 2D1KA 3TU5A 3ZETA 3FZFA 2FF3B 4F9OA 3AAPA 3GBTA 4CD1A 4BR7A 2FSKA 4BGBA 1ZXOA 1TUYA 3A5OC 4O5FA 1KAYA 2QWLA 4BR0A 4IXCA 3UKRB 4JD2A 3FZHA 1G99A 3LDLA 4BR4A 2P9UB 4C23A 3O6WA 5FPNA 5BRFA 4CBXA 5E84A 4BRCA 4BRMA 1NWKA 3H6EA 1GLBG 3DXKA 2E2OA 1NLVA 3EN9A 3I8BA 3C7NA 4CI6A 4BRGA 5E26A 2UYTA 1KAXA 2E20A 2QWNA 1T6CA 4FPAA 4ISGA 1BG3A 2QWQA 3ULEB 4H5WA 3VGLA 2E8AA 1P8ZA 5AQFA 2ZGZA 2P9SA 5AFUA 2CH5A 5AZIA 3QDKA 4AM7A 3ZEUB 4IZ9A 4FWKA 4DB3A 2Q0UA 1NGHA 3ENOA 1NM1A 4DCHA 2A41A 3D2FB 4CZIA 3C7NB 4HTLA 2IVOA 3ZX3A 4B1YB 1CZAN 4K25A 4H5TA 5AR0A 3WEEA 3FFKB 4CZJA 1SZ2A 4FL9A 5JLFA 3LDNA 2YHXA 4ISEA 3VEYA 1NGCA 3QBXA 1J6ZA 1WOQA 5AZIB 4BRPA 2A40A 1JCFA 5AQZA 2F9WA 1H1VA 3L0QA 4CJ7A 5B8HA 1EQYA 3VENA 4H0XB 2E2NA 1SAZA 4WQ4C 5F2RA 1BA0A 1DEJA 2I7NA 2W40A 5AFUH 2HF4A 1HLUA 2ASMA 4PL7A 2IVPA 3BP8A 4O8KA 4BQZA 2PBDA 5AQYA 2YI1A 4B9QA 3ATUA 4RTFD 3O1WA 3U8XA 3VOVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CCMN 1HNIA 3FZLA 1NU0A 3NVMA 2KHOA 1IJJA 2ZE2A 2XY7A 1QQNA 3AVHA 4FWRA 3I8DA 3DLLL 3THYA 3SK3A 1U4BA 2O8DA 4NCBA 2GX9A 2P9LA 1JLFA 3KJVA 1VQ5N 3WUHA 4BREA 1VSLA 4R5PA 5LMNK 1BO5O 5DM6L 1HJRA 4C1NI 1Y97A 3I55N 3AVKA 4JI8K 3LDSA 4M3RA 4DU3A 3R3LA 5I3UA 5SWMA 2QW9A 3T7ZA 2A3ZA 4WFAL 3TSUA 4BY9C 3ZX0A 4H0OA 3VQ7A 3MN7A 4BE1A 2BUPA 3HPGA 3G6EN 4GW6A 5AQWA 2P9NB 3AVBA 1UWBA 3V9SA 1YHQN 4DV5K 2WOMA 1WN7A 2D5RA 4FWLA 1T3VA 3VQBA 3HYFA 1XHZA 3VN5A 4FLYA 4YY3K 4KH5A 3H3NO 5BR8K 2YHYA 4AHUA 3SV4A 1OH6A 4DLGA 3VGKA 1K8KA 2IDOA 3ATVA 3HSTB 4PL8A 3ENBA 2XO7A 4FM1A 4IEEA 4NYNA 2NRWA 4FPBA 4CD3A 4LFCK 3DYAA 3LDPA 4CZHA 1IKVA 4CZFA 1U49A 1NG9A 1T8EA 5M1OA 3SUPA 3G10A 3ZSQA 3I0RA 4FWQA 1BWFO 1RDDA 4Y1CA 1LOTB 1FW6A 4B08A 4KB1A 4B9NA 1BL3A 3T1YK 3SV3A 4JD2B 1C0GA 1ASWA 2QXLA 2DTUA 1I3AA 4CGHA 4F4KA 3AA2A 4YOWA 4M41A 1JJ2M 3M8RA 4DV4K 4BR2A 2DFEA 2V52B 4B3SK 1MU2A 1HNXK 1L3VA 3IDHA 3DOLA 3LL3A 4ILHA 4BR5A 1CZ9A 4DMNA 4PQUA 3LAMA 2XY6A 5EU7A 1IKWA 4E7IA 4FK0A 1XHXA 3GL1A 5AQUA 4ELTA 3SJHA 3CM6A 2ZJQL 4LFAK 4FJHA 3P39A 1EETA 1KLNA 3DM2A 3VEWA 4O4GA 3GE1A 1K73O 1E4GT 3JXUA 1U6ZA 4BC4A 3NF7A 1NGDA 3KLEA 4CZKA 2HHQA 2NRHA 3EKUA 3J7YP 1WUAA 4MDBA 5TKWA 2UXDK 1GLDG 3T69A 4GV3A 1I94K 3F9KA 1LWEA 5CZ2A 3QFUA 5CYMA 4CF9A 3CJ7A 3LZJA 3ZCMA 4IEIA 4NXMK 2Q36A 3QINA 3VEVA 1HYVA 1Z6RA 2O4GA 1KTQA 3O1BA 4QS9A 3ID8A 3KWGA 5KRSA 1OH7A 1NK4A 4NO7A 3P4IA 3WNFA 3QICA 1GOBA 3TAGA 1RBRA 1SQKA 3CM5A 4Q5VA 3TPQA 4B1WB 4CEBA 5J2PA 1BDGA 1LAWA 1T6DA 1L5UA 3VTIA 2NRZA 3HRGA 4JKDA 4MO4A 4O55A 1IG9A 1D9FA 4DFJA 4NLBA 1S6QA 2YKNA 3RSEB 2QI2A 2Y1IA 4WF9L 1VQPN 4JI1K 5E41A 4CGJA 4E1NA 1HYSA 5M1PA 3GDQA 4E7LA 3AAQA 5HOOA 4BDPA 3M6GA 4EFHA 3TARA 1XMQK 1ATSA 3VQ4A 4CJLA 2YHWA 3EEQA 4E7JA 2BE2A 2BTFA 3O3GA 3CFRA 1JXEA 2B6AA 2VCPA 3AVAA 1HR0K 2OANA 3EE9A 3ZEUA 1D4XA 3CERA 4PKHA 5KPZA 4BC2A 2YX6A 1GOAA 4CIGA 4CZLA 1VQKN 1ZC6A 1NGBA 1F21A 4I2QA 3K58A 3RMCA 3L6QA 3D2EB 3FGUA 4KH4A 2Z1HA 3KLFA 2BDPA 4FVUA 5GAEP 3IKMA 4AILC 3M5RA 3J81O 1W9HA 2V7ZA 5F1XA 1NGGA 4BDYA 3BEXA 2KZMA 4YHHK 4JK8A 2GTDA 3QFPA 3OYNA 5BPLA 5FDLA 3HVTA 4JI2K 1RBSA 1NGIA 4C8LA 5AZJA 1BHLA 3OVNA 3ZSOA 1BCMA 1QHAA 3OBWA 3KLHA 5C24A 1TL1A 5LJWA 2G8FA 3M1FA 3DRPA 4OX9K 5MLCQ 3MN5A 3NF8A 4GKKK 3HPOA 1J53A 4W5TA 3JSMA 3DAWA 3V4IA 4W5RA 4A62A 4KHQA 2A6AA 2HNZA 4CGFA 3CJ1A 4K42A 3VEZA 4KFBA 1N33K 4FM0A 1C1BA 2J4RA 1GLJO 1ASVA 1NK7A 3RRHA 2Q0RA 3L3VA 4BACA 4WQ5A 5IT9O 3FZMA 1V4TA 4W5NA 2JWLA 1MWMA 3ZSZA 3VQEA 5AQRA 4CF0A 1MA9B 2P9NA 3MXMA 5KQDA 3OYKA 2HOEA 1D8YA 2IOCA 2KLAA 3OYAA 2AP1A 3MX5A 3OS0A 4ELUA 2F8SA 4HUGA 5ADXH 1X3NA 4BC5A 4E0DA 2QWMA 4E89A 3VA0A 4BRLA 1OKJA 4FOEA 4DU1A 1VQ6N 4YOUA 1JLQA 1SV5A 4YOTA 1BISA 4WCEL 4KHWA 2FF3B 1VAZA 4GVEA 4C8MA 1CXUA 3GBTA 4ICLA 3Q7BA 2HHSA 3HXMA 4O44A 2YHAA 1TUYA 4EZ6A 3PO4A 2O8FB 1YF5L 2HSTA 4IXCA 3UKRB 4JD2A 3PIPL 1VQ4N 2P9UB 4EP4A 4GV6A 1S1UA 4ID1A 5E84A 4JYAK 3H6EA 1VQ7N 5KRTA 4CI6A 4CIFA 3NDKA 4DSJA 3ITHA 4B9MA 4B9VA 4FPAA 2ZD1A 4O0IA 5C0YA 2E8AA 5AQFA 2WBNA 5AFUA 2X6NA 4BWMA 3ID6A 3QDKA 4AM7A 3DLKA 3SI6A 3OW2M 3NMUA 4IZ9A 2GUIA 3KD1E 3WNEA 3SZ2A 2PY5A 3E1YA 4OPJA 1RT5A 1NGHA 3ENOA 1NM1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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