4H0PA

Crystal structure of acetate kinase from cryptococcus neoformans
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
431
structure length
431
Chain Sequence
AEYLLAINCGSSSIKGKLFAIPSFELLANLAVTNISSSDERVKIKTTWEEGKGKDSEEEADYGDKIRYASLVPILLDHLTNSTHVKKEEIKYVCHRVVHGGMHDKGIRVVKGHEEGLMEMDKLSEFAPLHNHRAVLAVKSCIDALPHHTSLLLFDTIFHRTIAPEVYTYALPPPDTELTMPLRKYGFHGLSYASIVQSLAEHLKKPSDQINVVVAHLGSGSSSCCIKNGKSIDTSMGLTPLEGLLGGTRSGTIDPTAIFHHTEDAASDANVGDFTVSKAEIILNKNSGFKALAGTTNFGHIIQNLDPSKCSEEDHEKAKLTYAVFLDRLLNFVAQYLFKLLSEVPIESIDGLVFSGGIGEKGAELRRDVLKKLAWLGAEVDEEANNSNSGGAVKCITKEGSKLKGWVVETDEEGWMARMAKEEFGFLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of acetate kinases from the eukaryotic pathogens Entamoeba histolytica and Cryptococcus neoformans.
pubmed doi rcsb
molecule keywords acetate kinase
molecule tags Transferase
source organism Cryptococcus neoformans
total genus 141
structure length 431
sequence length 431
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2012-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0pA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0pA02
1ATRA 1BO5O 1HKCA 4L3QA 4DQ8A 4MO5A 5ADXA 4IJAA 3BF3A 4BGAA 2AP1A 2NZTA 5AQYA 1ZBSA 3H3OB 2ZF5O 1HUXA 1MWKA 2YJFA 4WQ5A 3UKUA 2QWNA 2H3GX 1QQNA 3MK6A 3BF1A 2P9KB 3AAQA 1KAYA 3IMXA 4BR9A 1LOTB 5FPDA 2BTFA 2UYTA 3GL1A 5FPEA 1Y64A 2FSKA 1XC3A 4BC2A 4EFHA 3H1QA 4IJNA 3EN9A 5KPTA 3WXJA 2FLOA 4Y0WA 2QWLA 1RFQA 3QB0A 5BN9A 4CZMA 3HM8A 3EO3A 4WQ4A 3U4LA 3W3DA 4MLHA 3VEXA 1NGDA 1XUPO 1NGHA 5AQMA 1K8KB 4BRIA 3A0IX 3QFPA 4B1VA 1IJJA 4EHUA 2Q97A 5LJVA 1Z05A 1NGJA 2V51B 1NLVA 2P9IB 4FWNA 4XH5A 3DXMA 1NGGA 3U9ZA 4M63C 4PKGA 1KAZA 3O5BA 4B1WB 1ZXOA 2P9SA 3HBTA 4FWOA 4ISGA 1NGCA 4BRDA 3AAPA 2QWOA 3H1VX 1MDUB 3WXLA 5FPMA 2QWMA 2V52B 4FWKA 1D4XA 1WUAA 3LDNA 4MO4A 2ZWHA 2I7NA 2YCHA 5AQVA 4JHDB 3EKSA 1NGBA 3WUHA 3UE5A 2HF4A 2VYPA 4NB4A 4HWIA 3HI0A 4FPBA 2P9KA 5LJWA 3VF4A 4BG8A 4MLEA 2QXLA 3CJ7A 1R59O 1E4FT 3WEEB 1QQOA 4BVPA 4BR2A 2GEMA 3VENA 3D2EB 2FSNA 5AQGA 5AZIB 3S41A 4CD1A 1JCFA 4EHTA 1CZAN 1RGIA 2ASMA 1GLCG 1TUUA 3WQUA 3RSEA 2P9LB 4E1JA 4CZGA 2E2OA 4K42A 5AQTA 4CZIA 3DXKA 2YHXA 1U2VB 4XH4A 3WXKA 5AFUA 2E88A 2P9IA 4K25A 3FGUA 1S22A 4AM6A 4BRCA 3KVGA 2YI1A 4QS7A 4BRPA 4H03B 1KAXA 5AR0A 2A3ZA 4FWMA 4H5RA 1EQYA 3CHWA 1C0GA 4BRLA 4BR0A 5CE3A 1TYQA 2Q31A 1V4SA 3DWLA 2E8AA 4IWVA 4H0VB 4WYBA 3TU5A 1YUWA 2GELA 4JHDA 4FWRA 5KQ8A 1NWKA 1BWFO 2A5XA 2ZGZA 3D7EO 2A6AA 2IIRA 3QBXA 4CZJA 3ULEA 1RDWX 3ATVA 3C7NB 3IDHA 3MN7A 1H1VA 1NGAA 5EX5A 3MMVA 5BRFA 2E2NA 3LDQA 4XH1A 5BN8A 3WEEA 1U6ZA 3FFKB 2V7ZA 3CJ1A 4YDUA 4I6MA 2WUSA 2GWKA 3DAWA 2W40A 5AZIA 4LC9B 3A5OC 2CGLA 2F9WA 3GBTA 4BRKA 4M7XA 3BUZB 5JICA 3CIPA 3O8MA 2P9LA 2FSJA 3JS6A 3R6MA 4WQ4C 2D1KA 2YJEA 5F0XA 3TPQA 3H6EA 1YVNA 3EL2A 3U9DA 4O8KA 2A41A 2W41A 4BRGA 2CGKA 4BROA 3GG4A 2Q0UA 3P4IA 5BPMA 2A40A 3LDOA 3EKUA 4B9QA 4FOEA 4BR5A 3A5NC 3L0QA 4FOIA 2IVOA 1BA1A 1JCGA 5E26A 3IUCA 2F9TA 1GLAG 4QS8A 4BRMA 1E4GT 5AQIA 3LM9A 3MDQA 1BUPA 3ZX3A 1GLFO 3SLCA 4FWPA 2CH5A 5AQFA 2VCPA 4PKIA 4BRFA 4RTFD 4B1XB 4PKHA 5EVZA 4GY2B 3H46O 3VGMA 4BRQA 4RWTA 1BU6O 1JCEA 4JD2B 4XEIA 3VGKA 2ZGYA 5FPNA 2NRHA 5BREA 2YHYA 1YXQA 3VETA 2NLXA 5JLFA 3UKRB 3HSCA 5B8HA 4FPAA 1X9JA 4BREA 2P9UB 5E84A 3VEYA 3F9MA 4ISFA 4CD3A 2E20A 3W0LA 5AZJB 4BQZA 1P8ZA 1MA9B 5AQWA 1QQMA 2E2QA 4F9OA 3H45C 3A8YA 1WOQA 4BG9A 4PL8A 2P9NB 1T6DA 3ENOA 3M3ZA 3A5LC 4M7YA 3VOVA 2HF3A 2HMPA 1QZ6A 1GLJO 4DHYA 4K43A 3ATUA 4BVOA 4CBWA 1NM1A 2Q36A 3KZBA 3QMLA 5AQRA 3L6QA 4B1UB 3FZHA 3GDQA 3FZKA 1K8KA 3CJAA 3O1BA 3MN6A 3B8AX 3CJ9A 5AQJA 3UB5A 2Q0RA 4FWSA 3U8XA 1NGFA 3FZMA 3AY9A 2PAVA 1NGEA 3R8EA 5AQOA 5BPLA 4H0TB 2Q1NA 3WXIA 3WT0A 4CZFA 4IXCA 3FLCO 3UKRA 1SAZA 5BPNA 2ASPA 4CBUA 5JLHA 3O80A 3CJCA 1TUYA 4BC3A 3G25A 4B1YB 1IG8A 4JNEA 4WQ5C 3ZX2A 4BRAA 5LY3A 4EIAA 5AQXA 4PL7A 3KHYA 1YAGA 3VEZA 4DB3A 3JXUA 2IVPA 2OANA 3D2EA 2P9PB 3LM2A 5I9EB 1DKGD 5AQNA 4A62A 1BOTO 1KXPA 3IFRA 4RCHA 3ENHA 3M1FA 1SQKA 4FWLA 4BRHA 5EXWA 4BR4A 3HTVA 4BQLA 1J6ZA 1HJOA 1HLUA 1U2VA 2CGJA 4CZHA 3DXMB 3CQYA 3I8BA 5ADXH 3EZWA 2QM1A 2I7PA 4DCHA 2GTDA 4FSVA 3LDLA 4H5VA 3SMPA 4ISEA 5BRDA 3SK3A 2ITMA 4O5FA 1T6CA 3D2FB 4JAXA 5F2RA 3VEOA 1ATSA 2A42A 3CETA 4CZEA 1NMDA 3VEWA 1T44A 1LCUA 3ZETB 4CJ7A 1DGKN 1GLBG 5AQHA 1DEJA 3FR0A 3VF2A 1HKBA 3LL3A 4CBXA 1OKJA 2GUPA 3R9PA 4C23A 2AA4A 4IO8A 2IVNA 3VF6A 3C7NA 2BUPA 5AQKA 1BA0A 3VESA 3MN9A 2P9PA 1X3NA 2FF3B 2FXUA 4GNIA 5BRHA 4H5NA 3O4WA 4B1ZA 3ZX0A 2EWSA 1NGIA 3RSEB 4BRNA 1Z6RA 4KBOA 3A5MC 2J4RA 3CJBA 2E1YA 5AQZA 5EY4A 3DXKB 4J8FA 2V7YA 3FZFA 4EAHD 1GLLO 3GE1A 1ESVA 3ID8A 2QWRA 3CERA 2Q2RA 5BR9A 1ATNA 5AQUA 3CQXA 5AQPA 1BG3A 3D2FA 4CZLA 1HPMA 3OHRA 5AQQA 1TYQB 3M6GA 5KQDA 5JMVA 3VGLA 3ZEUB 3ZETA 3FZLA 3LDPA 4H0OA 3O1WA 5TKYA 4FO0A 1XQSC 2DPNA 4H5TA 2VWBA 5AQSA 4BGBA 2QW9A 5KPZA 2ASOA 4FWQA 3ULEB 2D0PA 2PBDA 4CI6A 3QDKA 1QHAA 2YHWA 3GOIA 5F1XA 2QWPA 3VERA 4A2AA 4A2BA 4I6MB 3WQTA 4HTLA 5ELZA 3CI5A 4H5WA 1V4TA 4JD2A 3VPZA 5EOYA 1G99A 3I33A 4YDUC 3VEVA 2FF6A 5AFUH 2KHOA 4H0YB 3QICA 2E1ZA 3HZ6A 1HKGA 3AARA 4H0PA 1ZC6A 1X3MA 3QBWA 4NO7A 3UKUB 1GLEG 2E2PA 2P9UA 3O08A 3DJCA 2HOEA 5AZJA 5AQLA 4CZKA 4K41A 4A61A 1C0FA 1S3XA 1QZ5A 2QWQA 1Q18A 2GWJA 2CH6A 2D0OA 4FL9A 3QFUA 2P9NA 3BEXA 4BC5A 3C0BA 3ZEUA 4BR7A 3MCPA 3FE1A 4H0XB 4BC4A 3SJHA 1NBWA 1MWMA 3O6WA 2D4WA 3BP8A 4AM7A 1SZ2A 4IZ9A 3H3NO 3L4IA 3MN5A 1BDGA 4QS9A 3J8AA 1GLDG 4Z94A 3SMSA 5KPRA 1HX1A 2P9SB 4JN4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ATRA 1HKCA 4DQ8A 4G9ZA 4M3WA 4MO5A 5ADXA 3BZCA 4FM2A 4NCBA 2ZF5O 3VA3A 1HUXA 3A2FA 4IDHA 3TTCA 3BF1A 4HVJA 5K14A 1JLBA 1KAYA 4DTXA 2WC9A 4FLYA 4KTZA 3GL1A 2UYTA 5FPEA 4J2EA 1Y64A 2FSKA 1XC3A 4OKJA 3VQ8A 3JSMA 4GMJB 3WXJA 2QWLA 3PIPL 1RFQA 5BN9A 4GKKK 2HHUA 5SWMA 3U4LA 3W3DA 3VEXA 3SUQA 1L3SA 3RR7A 4GKJK 1K8KB 2O8DB 5HBMA 4DV3K 1NGJA 1HMVA 1J53A 4CFAA 4FXDA 1NGGA 4DQRA 5HRRA 4CJEA 3PUFA 5DM7L 4ILGB 4ISGA 4JKFA 3AA4A 2QWOA 4DR1K 4KHWA 3WXLA 3SJJA 1U04A 2JWKA 1ZYQA 5AQVA 4CGIA 3EKSA 1NGBA 3NE6A 1RT6A 4BDYA 3NF7A 4HWIA 3HI0A 3QEVA 1MU2A 3E1YA 4LH5A 4KI6A 4BG8A 4MLEA 2QXLA 3HRGA 3WEEB 4ELUA 1QQOA 4MFBA 3G0ZA 4BR2A 4FJXA 5GADP 4IFVA 4EHTA 3SQ2A 3ISNC 1WLJA 3KK1A 4B9VA 1O13A 3AGRA 4CZGA 5AQTA 3DXKA 3T1AA 1F21A 4U7BA 4AM6A 3RMCA 3KVGA 1QSLA 2YI1A 3ZYYX 3KLGA 4CJRA 4FWMA 1JLCA 1EQYA 2VG7A 1E3MA 3K59A 1TYQA 4B9TA 4FZXC 4IWVA 5C24A 4WYBA 4W5TA 2GELA 4CEAA 4DS4A 3IRXA 1FKPA 5KQ8A 2FBXA 1SS6A 3D7EO 3SPYA 4TSXA 4B3RK 4ID1A 2KW4A 2UUBK 3QBXA 4CZJA 4DMNA 3L3VA 3MN7A 3C7NB 5EX5A 3UIQA 3DI6A 2PYJA 3WEEA 1U6ZA 5FRNA 2HNDA 4FLTA 2OTJN 4DTMA 2F9WA 3BZKA 3TAEA 1SUQA 1NK4A 3HOSA 5C2FA 3MAQA 3MEGA 3K0SA 5A2QO 5F0XA 3E9PA 3H6EA 1YVNA 3U9DA 3DM2A 3VQPA 1D9DA 4BRGA 3D0PA 5BPMA 4X64K 3V9XA 4Z4GA 5JS2A 4EZ9A 2Z1GA 4B9QA 4BR5A 1WSGA 1J5EK 5IWAK 1J9AA 4I2QA 1E4GT 2ATQA 4N56A 4CF8A 3AO2A 5FRMA 4FWPA 3VQ5A 2VCPA 4HUEA 3P1GA 3CPEA 2RKIA 5EVZA 3NH2A 1EO1A 4CECA 4CHNA 2XHBA 3AVMA 5FPNA 2ZM6K 3KLFA 4JI2K 1W7AA 3SUOA 4DV0K 5BREA 1BCMA 3OYFA 1FK9A 3P31A 4CF9A 5B8HA 4FPAA 1X9JA 2P9UB 3VEYA 4JI0K 5C25A 4ISFA 3W0LA 5AZJB 1P8ZA 1MA9B 3OYNA 4HUFA 4W5RA 5AQWA 1S9EA 3H45C 1WOQA 4BG9A 1YJWN 3TTFA 2HBKA 1A5VA 1GLJO 2O8CB 3MCAB 3O3GA 4FJGA 5KI6A 1L3TA 4CBWA 1NM1A 2IS3A 2Q36A 3KZBA 4LY7A 3KJVA 4JKAA 1QVGM 2A1SA 1O1WA 1RDAA 4UY8O 2JWLA 2XY8A 5AQJA 1JLAA 3UB5A 3AVCA 2Z1JA 1IV0A 3OBWA 1KFDA 5DMRA 1X9WA 3ITHA 4DSKA 4LF8K 3P83D 4FJLA 3IAYA 4C8LA 4CFDA 1GOBA 4NYFA 4H0TB 3WXIA 4DLEA 2HHTA 5JLHA 3L2VA 3G25A 1OVYA 1IG8A 4JNEA 4KTWA 1I39A 3JAMO 3HVTA 4X66K 1TL1A 4EIAA 4X65K 2HB5A 4PL7A 3KHYA 1YAGA 4YOUA 5HRPA 2LSNA 4JRQA 5I9EB 1YTUA 5AQNA 4A62A 4LH4A 2KZZA 3IFRA 4RCHA 3M1FA 3K5MA 3P39A 4R79A 4CEZA 1NJXA 4AHVA 4AQYK 1HJOA 4PA1A 4OO1J 1U2VA 2CGJA 2G8HA 4YFUA 4JI3K 3DXMB 3CQYA 3I8BA 3HOTA 1QVFM 2QM1A 1TAQA 2I7PA 1HYZA 2GTDA 2X6SA 4FSVA 4H5VA 3LP2A 3SMPA 4O5FA 4JI7K 2ZJRL 3VEOA 3OJUA 4PQUA 2A42A 3CETA 4CZEA 3VEWA 1RBVA 1T44A 3ZETB 1S9GA 1XWLA 4FJMA 5C0YA 3AA2A 3PX0A 3FR0A 3NH0A 1DLOA 2UU9K 5M1FA 3C65A 5J2PA 1OKJA 3RVCA 3CF5L 3PIOL 5M1KA 4KKOA 4KB0A 5FDLA 3ZLJA 3K5LA 4GNIA 4H5NA 4WCEL 2GV9A 1NJIO 1RT7A 4BRNA 1Z6RA 4KBOA 5C12A 4WF9L 4JKHA 1R0AA 4QAGA 3THWB 3FZFA 4EAHD 3CC7N 4KHYA 4CHQA 1YT3A 4N47A 2QWRA 2Q2RA 3ZSWA 3CQXA 3OYMA 4DR4K 1C0MA 5C10A 4Z4EA 1XNQK 3V9UA 3C6AA 3ZETA 2NRRA 3OS2A 2DPNA 4F3OA 5SZTA 5I3UA 1YVUA 1S1XA 5KPZA 2ZE2A 1JL1A 5FROA 2PBDA 3AO3A 5F1XA 2WFBA 4ZTJA 1Y97A 4FK2A 4A2AA 4I6MB 4M41A 4RW8A 5M1NA 3CI5A 4ILHA 1XHXA 4NXNK 4CEDA 3G71N 1X9SA 4KREA 2KHOA 3CM5A 4DTSA 4DFMA 2KQ2A 1QQCA 1HKGA 4B8AB 4FJHA 4OVLA 1C6VA 4ZTFA 1ZC6A 3UKUB 2D0CA 4CHYA 3B6PA 3THWA 2KTQA 3LZJA 4F4KA 4NXMK 2UXDK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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