4H0PA

Crystal structure of acetate kinase from cryptococcus neoformans
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
431
structure length
431
Chain Sequence
AEYLLAINCGSSSIKGKLFAIPSFELLANLAVTNISSSDERVKIKTTWEEGKGKDSEEEADYGDKIRYASLVPILLDHLTNSTHVKKEEIKYVCHRVVHGGMHDKGIRVVKGHEEGLMEMDKLSEFAPLHNHRAVLAVKSCIDALPHHTSLLLFDTIFHRTIAPEVYTYALPPPDTELTMPLRKYGFHGLSYASIVQSLAEHLKKPSDQINVVVAHLGSGSSSCCIKNGKSIDTSMGLTPLEGLLGGTRSGTIDPTAIFHHTEDAASDANVGDFTVSKAEIILNKNSGFKALAGTTNFGHIIQNLDPSKCSEEDHEKAKLTYAVFLDRLLNFVAQYLFKLLSEVPIESIDGLVFSGGIGEKGAELRRDVLKKLAWLGAEVDEEANNSNSGGAVKCITKEGSKLKGWVVETDEEGWMARMAKEEFGFLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords acetate kinase
publication title Crystal structures of acetate kinases from the eukaryotic pathogens Entamoeba histolytica and Cryptococcus neoformans.
pubmed doi rcsb
source organism Cryptococcus neoformans
molecule tags Transferase
total genus 141
structure length 431
sequence length 431
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2012-09-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0pA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0pA02
1H1VA 3FZHA 3H6EA 3VEVA 3QMLA 4I6MA 1YXQA 3R6MA 3LDLA 2P9PB 1X3NA 3ULEA 1NWKA 5AQMA 2P9IB 5KQDA 4I6MB 3U9ZA 1SQKA 1HUXA 4B1ZA 4B1UB 4H0PA 4CJ7A 4IO8A 4NB4A 4BR7A 3F9MA 5AQVA 2ZWHA 4GNIA 4BRNA 3VEOA 3IMXA 1S3XA 4FWKA 1HX1A 2HF4A 3LDNA 1T44A 3CJ9A 1V4TA 3WUHA 4BRDA 3LDQA 3QBWA 1NGBA 1MA9B 1Z6RA 3HI0A 1OKJA 2P9NA 4BR2A 1E4GT 2QWLA 2E2NA 1NMDA 4YDUC 3EKSA 4O8KA 4FWSA 3MN9A 3QICA 2H3GX 2P9NB 2W40A 5ELZA 3JXUA 1RFQA 2YJFA 3CQXA 3SMPA 3EL2A 4JN4A 3HZ6A 4QS9A 1ATNA 1S22A 4WQ4C 4CZEA 2A5XA 1TUUA 3VEYA 4WQ4A 2ZF5O 5BRDA 2P9SA 4RWTA 4RTFD 4BRMA 5AR0A 3H45C 3FFKB 5AFUA 4A2AA 4CBWA 5BN8A 3LL3A 2P9SB 1MDUB 2BUPA 4A61A 4H0XB 5AQTA 5TKYA 4BG8A 1P8ZA 3SK3A 3EN9A 2IVOA 5AZJA 1R59O 3WXLA 1NGJA 4MLEA 3M6GA 2CH6A 3O6WA 3BEXA 4BQZA 3HM8A 4IXCA 2Q36A 5AZJB 2FSJA 4FPAA 3DXKA 4CD1A 4EAHD 3CJBA 3G25A 2KHOA 2FF6A 5EXWA 4CD3A 2PAVA 4IZ9A 3EO3A 2OANA 5AQLA 3W3DA 4CBXA 5KQ8A 3O5BA 3UE5A 3O1WA 1RDWX 4EHUA 2D0PA 2ASOA 4M7XA 5EOYA 2NZTA 5CE3A 3VESA 4K43A 4BC5A 3FZMA 1HKGA 1V4SA 3VGKA 2D4WA 3MK6A 5BRHA 5AQWA 3FZKA 3QDKA 5AQZA 5AQPA 2F9WA 4Y0WA 4CZFA 3I8BA 3CHWA 1Y64A 1NGDA 1WOQA 1X3MA 3ENHA 2VCPA 4CZJA 4DHYA 4BRKA 1G99A 1D4XA 4LC9B 2A40A 4JNEA 4CZLA 3GDQA 2Q97A 2E2QA 2YHXA 1ATSA 2A42A 2F9TA 2GELA 3FR0A 2NLXA 4QS8A 3UB5A 1ATRA 2P9IA 4BVOA 2VWBA 3D2FB 1J6ZA 4EFHA 1EQYA 4BRPA 4GY2B 3WQUA 3HSCA 1DEJA 3KHYA 4FO0A 3VERA 1DGKN 4BC2A 5E26A 1BUPA 3CJ7A 2P9LA 3VEZA 5BREA 1T6DA 3WT0A 3UKRA 4BR5A 1QZ6A 3M3ZA 3IUCA 2DPNA 2E8AA 5FPEA 2P9LB 1TYQA 5AQYA 1YUWA 2E20A 2P9KB 2Q2RA 3VF2A 3UKRB 4ISEA 1NGIA 1ZC6A 3C0BA 4H0OA 1SZ2A 4B1WB 3M1FA 3SMSA 1TYQB 2Q0UA 2YCHA 3S41A 3DJCA 4K41A 3BUZB 3FGUA 1ZBSA 2CGLA 4MLHA 3U9DA 1QHAA 3GL1A 3L0QA 4BG9A 3GBTA 1KAXA 3O8MA 4BGAA 5KPRA 1NGAA 5AQIA 1E4FT 2I7NA 2QWRA 3IDHA 3O4WA 4KBOA 4YDUA 3R8EA 3KVGA 4WYBA 3O1BA 4CBUA 2Q0RA 2Q1NA 4BRIA 4FWQA 5LJVA 5FPNA 1ZXOA 2IVPA 2W41A 3WQTA 2PBDA 4A62A 3VOVA 4BQLA 4JHDB 5LJWA 2ZGYA 4H03B 4QS7A 2I7PA 2HF3A 3KZBA 4JD2A 2D1KA 3D7EO 4RCHA 3VETA 5BPNA 2J4RA 1BO5O 2ZGZA 2FLOA 2A3ZA 2YHYA 4JD2B 4J8FA 4FOIA 1KAYA 4NO7A 4BVPA 4EIAA 4BR9A 3HBTA 5AQXA 3MDQA 4K42A 2P9UA 1IJJA 4HTLA 5AQJA 5F1XA 2ASMA 1WUAA 1BA0A 3VGLA 3IFRA 5EX5A 3H1QA 3RSEA 2WUSA 4BRQA 2QWMA 2E88A 5I9EB 3BF3A 1NGGA 2P9UB 3O80A 5BRFA 1NGHA 1TUYA 2IIRA 3RSEB 4BC4A 4PL7A 3ATUA 3ATVA 1HKBA 5AQFA 1MWMA 2GTDA 4FWLA 3H46O 3VEXA 4AM7A 4H5NA 3VF4A 5ADXH 3UKUA 4FPBA 1T6CA 4L3QA 4IJAA 3SLCA 3EKUA 4C23A 2YJEA 4ISGA 4JAXA 3TU5A 3UKUB 5BR9A 5AZIA 4CZIA 1KAZA 2QM1A 2QWPA 3H3NO 3J8AA 5KPZA 1BG3A 1KXPA 4BRFA 4BRLA 2FSKA 4BRGA 5JLHA 3LM2A 4MO5A 5AZIB 3BP8A 2QXLA 4FOEA 3ZX0A 3OHRA 3DAWA 3R9PA 2IVNA 2VYPA 4XH5A 3VPZA 3AARA 5FPDA 3D2FA 4DCHA 1NGEA 1JCEA 1GLDG 3C7NA 3CQYA 1QZ5A 3CETA 3CJCA 3ID8A 5F2RA 3GE1A 1YVNA 3MCPA 1DKGD 3AY9A 3C7NB 4PKGA 1CZAN 4ISFA 3VENA 2HMPA 2ITMA 1C0FA 4FWRA 1NGCA 2BTFA 4BRAA 3H3OB 2P9KA 1NLVA 3VGMA 1NM1A 3D2EB 4BR4A 2FSNA 3W0LA 4Z94A 1IG8A 1GLCG 3DXMA 4BGBA 1LCUA 2FF3B 4H5RA 2CH5A 4FSVA 3MMVA 4H5WA 4F9OA 3H1VX 2V7YA 3QFPA 3DXMB 4WQ5C 2V51B 1QQOA 1JCGA 1K8KA 1ESVA 3ENOA 3ULEB 3QB0A 4WQ5A 4XH4A 2ASPA 5AQQA 2QWOA 1NGFA 3P4IA 2V52B 1K8KB 3QFUA 4CI6A 4CZHA 5JMVA 2QWQA 3LDOA 4CZKA 1LOTB 1BU6O 5BPLA 1SAZA 3U4LA 1RGIA 3CIPA 2V7ZA 4BRCA 3A5MC 4JHDA 5B8HA 1U6ZA 3A5OC 1U2VA 5AQRA 2D0OA 2GEMA 3A5LC 2QWNA 4FL9A 1QQMA 5AQNA 4BROA 5JLFA 3WXKA 4K25A 5F0XA 1BA1A 1U2VB 3FLCO 3CERA 2QW9A 4B1XB 1QQNA 5ADXA 3O08A 5LY3A 5E84A 3A5NC 1HLUA 3CJ1A 4BR0A 3A0IX 4H5TA 4A2BA 2E2OA 1Q18A 3CI5A 1GLFO 4AM6A 1HPMA 3EZWA 3LM9A 1JCFA 2HOEA 3U8XA 4H5VA 3ZX2A 4HWIA 2EWSA 3A8YA 4H0YB 4IJNA 5AQKA 3VEWA 1X9JA 3QBXA 4MO4A 5JICA 1GLBG 2YHWA 4O5FA 4EHTA 3TPQA 4DQ8A 3LDPA 3I33A 4PKHA 1HKCA 5BN9A 2NRHA 4BC3A 3ZX3A 2A6AA 4PL8A 3FE1A 3AAQA 3MN5A 1BDGA 2GWJA 3MN6A 1HJOA 1C0GA 4CZGA 3SJHA 3AAPA 3WXJA 3WEEA 1XUPO 3HTVA 2E1ZA 4M7YA 5FPMA 4PKIA 2FXUA 1MWKA 2GUPA 4DB3A 4FWNA 1NBWA 2A41A 4E1JA 3FZFA 3VF6A 4XH1A 3DXKB 3GG4A 3WEEB 1BWFO 2GWKA 3GOIA 4M63C 5AQHA 4BREA 3BF1A 4FWOA 2YI1A 3FZLA 3L4IA 2CGJA 3B8AX 4FWPA 5AFUH 4B9QA 1GLLO 1Z05A 3L6QA 1XC3A 5AQSA 3WXIA 1GLEG 1GLAG 3DWLA 4B1YB 3ZEUA 3ZETA 2E2PA 5BPMA 2Q31A 5AQOA 2E1YA 4IWVA 4H0VB 5AQGA 2UYTA 3ZEUB 3ZETB 4XEIA 3D2EA 5EY4A 3MN7A 4FWMA 2AA4A 5AQUA 1XQSC 4B1VA 3JS6A 1BOTO 5KPTA 1YAGA 2CGKA 5EVZA 2AP1A 4CZMA 1GLJO 4H0TB 3CJAA 2P9PA 4BRHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HHWA 2DY4A 3IS9A 3VEVA 2YV0X 3QMLA 4DR7K 3HSTB 3R6MA 3LDLA 1WSEA 1S6PA 3QLHA 3SNNA 5AQMA 2D0AA 2P9IB 5KQDA 4M3YA 3U9ZA 5HRNA 1SQKA 4B1ZA 3OYCA 1HPZA 3P31A 2PFUA 4NB4A 4DV1K 1RT1A 4M3ZA 4KRFA 4BRNA 3IMXA 1S3XA 5I42A 3LDNA 1RBTA 1WAJA 4JS5A 3LDQA 2XY6A 3QBWA 4AHCA 4Y1CA 3SUQA 3AA4A 3NVKA 3I56N 1Z6RA 4QCLA 4B3MK 1OKJA 1CZBA 3MXJA 2QWLA 1NMDA 1X9MA 3KK3A 4DFMA 2H3GX 3VQEA 2P9NB 5ELZA 2UXCK 4FK2A 3EZ5A 3SMPA 3CQXA 1ATNA 3K59A 3DI6A 1TUUA 3TTCA 4O55A 5KRSA 4UY8O 4JK8A 4DFPA 1WSHA 4KI4A 4RTFD 1NJYA 3SI6A 3FFKB 2Q3SA 2IS3A 4OGEA 1WSJA 3LL3A 4JI6K 1MDUB 2A1RA 5TKYA 3LDSA 1JLCA 3V9WA 1RDDA 3DMJA 1SV5A 4FXDA 1X1PA 3LAKA 2HHQA 3WXLA 1NGJA 4MLEA 4M3UA 3M6GA 3ID6A 4BQZA 4F8RA 3CYMA 4DV4K 3TI0A 5AZJB 2FSJA 4FPAA 3BDPA 3SBGA 3DLRA 1LWEA 5A2QO 1SKSA 1IBMK 4EAHD 3CJBA 3G25A 3ZSVA 1XNRK 2KHOA 3Q7CA 1JLBA 2FF6A 4MDBA 4IZ9A 3AGKA 5BR8K 4F4KA 5HL7L 4CBXA 3UE5A 3O1WA 1N36K 2D0PA 1NK8A 1JLEA 4CF2A 3VESA 4BC5A 2E6LA 3AO4A 2D4WA 2NRXA 4C8OA 1VK0A 4TSXA 4JKGA 3I8BA 5J2PA 1BIZA 4DV7K 2NRRA 3ENHA 4CGIA 1D4XA 2X74A 4JNEA 1SKRA 3AVBA 2Q97A 2YHXA 1FKPA 2KFZA 2A42A 4DQIA 1NK6A 1OH6A 2ATQA 4J2EA 3UB5A 1ATRA 3MEEA 3D2FB 1J6ZA 1A5WA 4GMJB 1Q86O 1U4BA 3HSCA 4B9UA 1BUPA 2Y1JA 2O8BA 4AHTA 2HBJA 3OBYA 3UKRA 4E7HA 4FVUA 4J2BA 4FJGA 2DPNA 3DLHA 2DFHA 4KFBA 1LV5A 1YUWA 2P9KB 3VF2A 2RE2A 1RDBA 1NKBA 1NGIA 1ZC6A 1ZBHA 3PLAA 4CEEA 4OKJA 1ZBSA 3HT3A 3M8PA 4X65K 3QINA 2HBLA 1QHAA 4C1NK 1Q9XA 2G8IA 1BQNA 1VSEA 1CZ9A 3QIPA 5HRRA 3LP3A 4FM0A 2I7NA 3IDHA 4LF9K 4YDUA 3L2RA 4U67L 4JV5K 3SUPA 3O1BA 2O8CA 4CBUA 3WNHA 3L3UA 4HUEA 2HVHA 1ZBFA 3O9TA 1C6VA 5LJVA 5FPNA 1ZXOA 3V1QA 4BQLA 4JK9A 4DU4A 4JHDB 3THXB 2EHGA 3NDKA 2VGMA 4HVJA 3HVTA 5HROA 2WBNA 2W6LA 4JD2A 4KTQA 1U48A 3IKMA 2KW4A 3LANA 3VETA 1RILA 4CJTA 3DLLL 1B9FA 1BO5O 3PX4A 3AVIA 5GAEP 4FOIA 1KSPA 3DYAA 3VA0A 3HBTA 4KH6A 5SZTA 5AQXA 4CECA 1BCMA 2O4GA 4GV9A 1S9EA 3V9SA 4HTLA 4B3OA 2OZMA 3CCVN 5CY4A 3VGLA 4OX9K 3J7AP 3H1QA 1TAQA 1X9SA 3C6UA 5I9EB 3BF3A 4E7LA 5BRFA 3TABA 4DSLA 1NGHA 1TUYA 2KLAA 5C25A 1U49A 4CHYA 4X66K 2O8FB 4JLHA 4BWMA 4FJ9A 4CF0A 4PWDA 4IJAA 3SLCA 1IKWA 3EKUA 4C23A 2YJEA 4ISGA 3TU5A 1C0TA 5AZIA 4RW9A 4CHZA 2QWPA 4F3TA 3H3NO 1UAXA 4BRGA 3MX5A 3PIOL 1BISA 5IT9O 3PX6A 4CF1A 4FOEA 3TSPA 3ZX0A 3MEGA 1B92A 3AARA 3TSUA 1BIUA 4CERA 2HVIA 4E7IA 1VQ7N 4LF6K 3C7NA 3PSFA 4CHNA 1QZ5A 2DFFA 3ID8A 4I7FA 1QSSA 3PSIA 3MCPA 4M41A 3SQ0A 4MDAA 4PKGA 1CZAN 2HMPA 4K0KK 2UUAK 3RMCA 2YKNA 1NGCA 3VQDA 1NLVA 1NM1A 2AJQA 2RPIA 3ZT4A 3SV4A 4DSEA 2FSNA 3NVMA 4Z94A 1QE1A 1IG8A 2VWJA 1GLCG 2HNDA 4CGFA 4KKOA 3E66A 3O9RA 2V7YA 5C24A 5I3UA 3QFPA 1D9DA 1RTDA 3ZSXA 4PHTX 1DTQA 4BE0A 1IBKK 4YOUA 4FJJA 3OYHA 2O4IA 1K8KB 4CI6A 4CZHA 2QWQA 3LDOA 4DS4A 1BU6O 4OVLA 4CJ4A 4KHNA 1RGIA 2WFBA 1GOAA 3A5MC 1QQMA 2QKBA 3SQ2A 1WSIA 4KHYA 4E7KA 1IKVA 4FK4A 1L3VA 4KV8A 4CFCA 3HK2A 5ADXA 3VTIA 5LY3A 4E7JA 1IG9A 4AHUA 2HHSA 4DSFA 4H5TA 5K14A 2HHVA 3AVGA 2B6AA 5GADP 4IDHA 1VSFA 1JCFA 4DU3A 5IWAK 1HRHA 4HWIA 2BDPA 4DFJA 1C1BA 5AQKA 1X9JA 1GLBG 2YHWA 2DFEA 4YNQA 4O5FA 4CJ5A 3ITHA 3LDPA 4DQRA 2JWKA 4PKHA 1HKCA 5BN9A 2XHBA 1WSGA 4BC3A 3ZX3A 1NK0A 3E9LA 3OTOK 1VQKN 1RT3A 1BDGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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