4H0VB

Crystal structure of nad+-ia(e378s)-actin complex
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
370
structure length
355
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
total genus 124
structure length 355
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0vB03
4A2AA 4AM7A 3VENA 3ZETB 4CJ7A 3MN5A 4CZFA 4DCHA 1K8KA 4CZHA 4BC3A 3HI0A 1OKJA 4CZJA 4FWQA 1D4XA 2BTFA 3CJ9A 2P9LA 2D0OA 1QQMA 3BF1A 2J4RA 3WQUA 2QWRA 3FZMA 4BC5A 5FPEA 4FWRA 5E26A 2E1ZA 3MN9A 2KHOA 4BVPA 3CJAA 2P9LB 4H5TA 3IDHA 3ZX0A 4KBOA 4A2BA 2YJEA 5BR9A 4EIAA 1QQNA 4C23A 3R9PA 1RDWX 5EY4A 4M63C 3FGUA 2E2PA 4WQ4A 2PBDA 4IO8A 3CETA 3C0BA 4H0OA 5JMVA 1GLJO 2DPNA 5BPLA 5AZIB 1T44A 2QWNA 3TPQA 1EQYA 1YUWA 3MN7A 2CGJA 2QM1A 3UKRB 2ASPA 3H1QA 4BRNA 4I6MA 3QMLA 1TYQA 3FZFA 3EO3A 2IVNA 4BQLA 3HM8A 4FPBA 4B1VA 5JLFA 2Q36A 4XEIA 2QW9A 4CZGA 2CH6A 1H1VA 4H0TB 4BR7A 1MWKA 3RSEA 2FF6A 3O6WA 2UYTA 3LM9A 1T6DA 2D4WA 2EWSA 4BQZA 1U2VA 1YAGA 3FE1A 3RSEB 1HUXA 4E1JA 1Y64A 2V7ZA 5FPNA 4CBWA 5CE3A 3UB5A 1KAXA 2AP1A 2GTDA 2QWOA 4RWTA 4CD3A 5AQSA 3WUHA 5I9EB 5AQXA 3UKUA 1NBWA 3HZ6A 3QICA 2A40A 3A5MC 1LCUA 5AQUA 3FZLA 5BPNA 3LM2A 4K41A 2HF4A 4CBUA 5BREA 3DAWA 2BUPA 3CIPA 2Q97A 5AZJA 3ATUA 3MDQA 5BRHA 4B1YB 3L6QA 3VESA 3P4IA 2IIRA 2P9SA 1GLDG 3F9MA 4QS9A 3A5NC 4ISFA 3WXIA 1ZXOA 3O1WA 4O5FA 4RCHA 3VGKA 3QFPA 4XH5A 4M7YA 3WXLA 4PKHA 2E88A 2E2OA 4CZLA 3EKUA 3FR0A 2ITMA 3DWLA 3L0QA 3ENHA 4J8FA 4PKIA 3U4LA 1SZ2A 5FPDA 4Z94A 1ZC6A 3AARA 2GEMA 2QWPA 1NM1A 1T6CA 1NGBA 1SQKA 2FXUA 3M1FA 4AM6A 2YHYA 4CI6A 1NGDA 3SMPA 4H0YB 4IZ9A 1JCFA 3FZHA 1V4TA 3CHWA 3AY9A 3VGLA 3VOVA 1MDUB 3U9ZA 4BRIA 3DXKA 3GE1A 4NB4A 5AQIA 1DEJA 1LOTB 2GELA 2P9IA 2V7YA 4JHDA 2CGKA 1ATNA 4YDUA 2FLOA 1BWFO 1K8KB 1C0FA 3O1BA 4EFHA 3EN9A 4HTLA 4IJNA 2A41A 4H03B 4EAHD 3QDKA 5LJWA 1ATRA 3QFUA 4DHYA 3LDLA 2I7NA 3DXMA 1ZBSA 4F9OA 2V52B 4FL9A 4EHUA 1ATSA 2CH5A 1S22A 4FWMA 1HKCA 3AAQA 2ZGYA 3VF4A 4JN4A 3BF3A 3CERA 2D0PA 2GWJA 3JS6A 2H3GX 4BG9A 2PAVA 3GL1A 3CQYA 3LL3A 1IJJA 1NMDA 2ASMA 4CBXA 1X3MA 4FSVA 5AFUH 1HKGA 3VEYA 5ADXH 3L4IA 1NGJA 5AQVA 3S41A 1BA0A 1Z6RA 5KPZA 3ZX3A 3LDPA 3IFRA 3KZBA 4BR5A 4CZEA 4FWOA 3M6GA 4H5NA 3VF2A 4CD1A 2D1KA 2HMPA 4I6MB 1TYQB 2AA4A 4XH1A 3H6EA 4A61A 2WUSA 4H5WA 2E2NA 3SMSA 1YVNA 4BRMA 4BREA 2HF3A 3FFKB 5F0XA 2A5XA 3R8EA 5AQJA 3D2EA 2P9NA 4B1XB 2I7PA 1WOQA 4DQ8A 2FSKA 2E20A 1SAZA 1U2VB 4JAXA 3SJHA 5BN9A 5AQNA 4FWNA 4L3QA 1GLEG 3FZKA 4JNEA 5AQOA 5EOYA 2Q31A 3LDNA 3A5OC 2E8AA 3O80A 4A62A 1E4GT 4WQ5C 3D7EO 3ZEUA 4BGAA 2YI1A 2F9WA 4K43A 1NGEA 2F9TA 3UKUB 3VEOA 2YCHA 1BOTO 5AQHA 4QS7A 4RTFD 3I8BA 3A8YA 2FF3B 3CQXA 4H0XB 1GLBG 3OHRA 4FOIA 5AZJB 4K42A 2P9KA 3WEEA 3HTVA 2P9SB 2P9PA 3EKSA 3ENOA 3H3OB 5AQMA 2OANA 1BUPA 3QB0A 2FSJA 1E4FT 1V4SA 2P9KB 4BROA 3G25A 4H5VA 4FPAA 2A6AA 2V51B 3O4WA 3CJ7A 4BRHA 1TUYA 3C7NA 4H0VB 4XH4A 3IMXA 1GLAG 5AFUA 5ADXA 2YHWA 2ZGZA 4FWSA 3HSCA 3MN6A 4HWIA 5EVZA 5F2RA 3VEXA 1TUUA 4JD2A 4MLHA 5AQZA 1GLLO 4WQ4C 5FPMA 3WXKA 1HX1A 3HBTA 2Q2RA 3M3ZA 5AQQA 4B1WB 5EX5A 4B9QA 3MK6A 4BRQA 5LY3A 3SLCA 3CJCA 3GDQA 3WQTA 4ISEA 3JXUA 4CZIA 1BO5O 1CZAN 4BRPA 3I33A 4FOEA 5AQLA 1WUAA 1XC3A 4GNIA 2E2QA 3DXKB 3AAPA 3EL2A 3ZETA 4BRCA 3VEVA 3VGMA 2P9IB 1DKGD 4JHDB 5LJVA 1Q18A 2ZWHA 2QXLA 3W0LA 1R59O 1J6ZA 3EZWA 3H1VX 2FSNA 1X9JA 3LDQA 3DJCA 4IWVA 3CJ1A 3CJBA 3DXMB 3ID8A 4CZKA 1XQSC 4MLEA 3WT0A 4BRAA 1NGGA 3GOIA 5KPRA 5BRFA 5JICA 2ZF5O 4H5RA 4O8KA 5ELZA 4WYBA 4FO0A 1HLUA 1KAZA 1XUPO 4BRKA 3QBXA 3H46O 5AZIA 3VEWA 3VERA 2IVPA 5B8HA 3GG4A 3UKRA 3FLCO 3W3DA 3IUCA 5AQRA 1BU6O 3BEXA 4BGBA 5F1XA 1P8ZA 2QWMA 2VYPA 1KAYA 4BRFA 3O5BA 4BR9A 3R6MA 3H3NO 1RFQA 4PKGA 5AQTA 4BRLA 1NGFA 4H0PA 3WXJA 4EHTA 1NWKA 3ZX2A 4NO7A 3UE5A 4B1UB 4BC2A 3D2EB 2P9NB 3TU5A 3ATVA 3BUZB 3GBTA 5E84A 4BG8A 4BC4A 3VEZA 4LC9B 5KQDA 1C0GA 3VPZA 1MA9B 1QZ5A 1MWMA 4FWPA 2W41A 5BPMA 4MO5A 3MCPA 3O08A 5AQWA 2W40A 4FWKA 4IXCA 1X3NA 1DGKN 2A3ZA 3ZEUB 4FWLA 2IVOA 3D2FA 4DB3A 1QQOA 1QZ6A 2GUPA 3U8XA 3KVGA 3LDOA 4GY2B 4YDUC 3WEEB 3A5LC 3D2FB 1HKBA 1HJOA 1NGAA 4BRGA 3KHYA 2QWLA 2P9PB 1YXQA 2Q0RA 3BP8A 4PL8A 1HPMA 3B8AX 1NLVA 3CI5A 2A42A 2CGLA 4BR4A 3MMVA 2GWKA 4PL7A 3J8AA 5KPTA 1S3XA 5AQGA 1BA1A 2HOEA 2Q0UA 2YJFA 2VCPA 1U6ZA 2ASOA 1BDGA 1QHAA 3VF6A 4CZMA 2NLXA 5AQFA 1NGIA 3QBWA 4Y0WA 1NGHA 3C7NB 4IJAA 1BG3A 3H45C 4ISGA 3SK3A 4QS8A 4BR2A 1IG8A 3A0IX 4MO4A 2QWQA 5BRDA 5BN8A 2Q1NA 2YHXA 4JD2B 5AQPA 3ULEA 5AR0A 3VETA 2E1YA 1JCEA 2NRHA 3O8MA 5AQKA 3U9DA 2P9UA 1JCGA 5KQ8A 2VWBA 1ESVA 1RGIA 2NZTA 1GLFO 4M7XA 4B1ZA 1G99A 4WQ5A 5AQYA 3ULEB 1Z05A 4BR0A 4K25A 5JLHA 2P9UB 1GLCG 4BRDA 5TKYA 5EXWA 1NGCA 1KXPA 4BVOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AM7A 2RE2A 3MN5A 3ZSRA 4BC3A 4HVJA 1Z26A 5C2DA 1T7PA 2YHAA 4Z0UA 1OKJA 4FWQA 3QEIA 3SUOA 4CF9A 3C6TA 2D0OA 3AO5A 4KHNA 3BF1A 5M1NA 4DSFA 2QWRA 3CCMN 5FPEA 3QINA 3J80O 4FWRA 3MEEA 3MXIA 2E1ZA 3MN9A 3JSMA 3ENBA 4BVPA 1RDCA 4DTJA 3BGRA 1C0TA 4IOXA 4CEZA 5BR9A 1QQNA 4C23A 3R9PA 4MDAA 1DT9A 4F3TA 4UQGA 3FGUA 1UA0A 4E72A 3V1QA 3J81O 1MU2A 2E2PA 2PBDA 5IWAK 1SKWA 3CETA 1RILA 1S6PA 1LWFA 3AO1A 5BPLA 5AZIB 3LP1A 4JKBA 2ZE2A 1JLBA 3MN7A 4FLYA 2CGJA 1TK0A 3CQ8A 5J2NA 1HNZK 4FLZA 4AILC 4CF2A 4KAZA 1C6VA 4N5SA 4Z4EA 4BQLA 4FPBA 3OTOK 2Q36A 2QW9A 2JGUA 1H1VA 4H0TB 3V9ZA 2QXFA 1VSIA 4B9UA 4OPKA 1W0HA 1IKYA 3VQ7A 1WAJA 4N47A 1RT4A 3LM9A 4FW2A 3RSEB 4BWJA 1HUXA 4AHCA 2FBXA 3VQEA 1OVYA 4B8AB 1Y64A 3CCRN 5CE3A 1S1WA 2GTDA 4F8RA 2RPIA 2HNYA 1YJ9N 2W6LA 3MX2A 2ZJQL 3KJVA 3BDPA 2W6KA 2HF4A 4CBUA 5BREA 3DAWA 4CHQA 2Q97A 4C1NI 3WNGA 1RNHA 3ATUA 4FLTA 1NKEA 1WSFA 3TAGA 3L6QA 3P4IA 2P9SA 4J2AA 1GLDG 4C8KA 3CPWM 4QS9A 3AA2A 1RDDA 3SQ4A 3AVNA 1TKDA 4ISFA 5KRTA 3SCXA 4DKWA 3KK7A 3VGKA 1NK6A 4ELUA 2QEXN 2HVIA 4CZLA 2ITMA 3TTCA 3L0QA 4FZZA 1C0MA 4FYDA 1VSJA 3OYBA 1DLOA 3AARA 2XY6A 3V1RA 1NM1A 2FXUA 1Q82O 2G8WA 1TK5A 4F3OA 2YHYA 3NAEA 1JLCA 1NGDA 1B9FA 3SQ2A 3CC7N 3C6HA 1W2BM 4Y1DA 1V4TA 2RN2A 4JKFA 2O8CA 3VGLA 2GX9A 3VOVA 2HVHA 1RT1A 1JL1A 1MDUB 3U9ZA 2JWLA 4BRIA 3V9WA 3DXKA 5HP1A 3GE1A 1RBRA 4AHRA 2R7YA 1YJNN 4NXNK 4ILHA 2E4LA 3EE8A 1ATNA 4IKFA 4KB0A 5FRMA 2FLOA 2ZD1A 4UY8O 3VQCA 4JI0K 3KLGA 3O1BA 1RT7A 1BQMA 4IJNA 2A41A 4DUZK 4DV7K 1WSEA 3WNEA 3OYDA 4CW7B 3QFUA 2I5JA 3CCEN 2G8VA 2ATQA 3TSPA 3KTQA 3MEGA 4GVEA 4FJJA 3K2PA 3AAQA 1QTMA 1EP4A 4ELTA 2GWJA 3OA9A 4K8ZA 2PAVA 3GL1A 1VSKA 5GINA 3CQYA 4JRPA 4OLBA 4KHSA 1NMDA 2ASMA 2IAJA 4FSVA 5AFUH 4CEEA 3ZT0A 4CJ5A 3IFRA 3I0SA 4BR5A 5TKWA 1BGXT 4H5NA 4CD1A 2HMPA 1YI2N 4DV5K 3H6EA 3TI0A 2WUSA 4H5WA 3SMSA 4BRMA 4BREA 4M45A 1C1BA 4Z4GA 1IG9A 2GBZA 5AQJA 3G10A 1WOQA 2IS3A 5CY4A 4BE1A 2HHWA 4FJ5A 4PQUA 4CIEA 1ITGA 5BN9A 2OZSA 1NG9A 4JNEA 4ZTFA 5J2QA 3RTVA 3A5OC 4YOXA 1E4GT 4WQ5C 3ZEUA 4E7JA 3S5TA 3VEOA 3ALYA 1KTQA 3HPGA 5AQHA 3HRGA 4QS7A 4RTFD 4FJ9A 3T3FA 3CD6N 1K6YA 4CHZA 2XHBA 4H0XB 4FVUA 4FW1A 3NCIA 3FFIA 4DLGA 3HTVA 2P9SB 2P9PA 4HHTA 3ENOA 4DTRA 4B9VA 3QB0A 4NCBA 1WNSA 2FSJA 3V81A 2KTQA 4E19A 2O8DA 4BROA 3SUQA 3LANA 1YVUA 3QESA 4YY3K 2A6AA 3U3YA 3CJ7A 3NVMA 4BRHA 3JYTA 1TUYA 5AFUA 3T69A 1KSPA 5D3GA 2ZGZA 4IBNA 4FWSA 3MN6A 5F2RA 4DMNA 3QEPA 4FCYA 4CESA 3OYKA 5FPMA 4CHYA 1HQUA 3NF8A 3WXKA 2OPPA 1J54A 5AQQA 5EX5A 3OYEA 3WXMB 4DR3K 1N6QA 1EWQA 3I33A 4FOEA 2P1JA 3C95A 3TSQA 2Z1JA 3PIOL 4DR1K 1BI4A 3DXKB 3EL2A 3ZETA 4HUEA 3VEVA 4YNQA 4CF1A 1WN7A 4CJTA 3K5NA 3OYCA 3P38A 4LFAK 3EZWA 4RW9A 4DFKA 1RT6A 3LDQA 1TAUA 4EP4A 3L4QA 4IWVA 2HMIA 1C1CA 1ZBHA 4M42A 1VSEA 3OBYA 2RHKA 3ID8A 4X66K 4MLEA 3WT0A 3J7ZO 3GOIA 4FJGA 2HBLA 4HCBA 4IO9L 2ZF5O 1ZYQA 2E5LK 4RW4A 3F9KA 4C8LA 2G8IA 4FM2A 1RBTA 3VN5A 4B9TA 2ITGA 2IVPA 1Q9YA 5HL7L 3IUCA 1RCHA 1U47A 1BU6O 5GADP 4JI6K 4LD0A 3SI6A 3K9KA 2VYPA 4BRFA 3O5BA 5CHIA 5HRNA 4E7HA 3F5TA 2E6MA 1RDAA 4Y1CA 1RFQA 4GVMA 4GKKK 3S3OA 1NWKA 2QA4N 3S3NA 1K9MO 4DTOA 1YHQN 3SNNA 3ATVA 3BUZB 3M8QA 4CJRA 4OVLA 3HPHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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