4H0VB

Crystal structure of nad+-ia(e378s)-actin complex
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
370
structure length
355
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
total genus 124
structure length 355
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0vB03
3VERA 3QFUA 1YAGA 4BRQA 4BRIA 3VPZA 2Q2RA 1S22A 1DGKN 4EFHA 3M1FA 3VEWA 5FPDA 4B1UB 4K41A 3O4WA 3ZX2A 4B1ZA 4H0VB 2A41A 1K8KA 4BR7A 3ATUA 4BRLA 4RTFD 4AM6A 5AQPA 3CETA 4B1YB 2QWPA 3O1BA 1RDWX 3W0LA 3AAQA 3MN5A 3WQUA 4M7YA 1EQYA 2D1KA 4BG8A 3DXKA 1MWKA 2YI1A 4J8FA 1MDUB 1BDGA 4AM7A 3CJ1A 2A5XA 1GLFO 5BRDA 4H5WA 3DAWA 3QFPA 3F9MA 3BEXA 4H0TB 3FZKA 2CH6A 3EL2A 2E2PA 1GLDG 3MN7A 2A6AA 2EWSA 3H3NO 1NGAA 4O5FA 4O8KA 3WXKA 4BR2A 2IVPA 2YJFA 3CIPA 4PL8A 4DQ8A 4H0XB 5ADXH 1RGIA 4JHDA 4Y0WA 5AQRA 1QQOA 4A62A 1OKJA 3WXIA 5AQGA 5AR0A 5AQJA 3CHWA 2P9UB 4IJNA 3FE1A 1V4SA 5AQQA 1HKBA 3L0QA 3VF6A 4BGBA 2P9KB 3LDNA 3U8XA 4L3QA 4FO0A 3O80A 3UB5A 4BR5A 4EIAA 4MLEA 1GLBG 2V7YA 4JD2B 2UYTA 5BRHA 1HLUA 3H6EA 3R6MA 1SZ2A 3DXMA 2Q97A 3LDOA 3WQTA 1JCGA 3SJHA 2Q0RA 3CJ9A 3VEXA 4BC2A 3TPQA 2P9SB 1YUWA 4K25A 4BRPA 3VESA 5AQXA 1H1VA 3CERA 1T6DA 4EAHD 4CZIA 4Z94A 2AA4A 2P9NB 3MN9A 3WEEB 4CD3A 4EHTA 1ZC6A 2F9TA 4IZ9A 5AQKA 1MWMA 5BR9A 4CZFA 2CH5A 5AZJB 3QBWA 4H0PA 1P8ZA 4FWRA 5EXWA 3O5BA 2GWKA 1KAXA 2OANA 2FF6A 5AQFA 3RSEB 4BROA 4XH1A 1U6ZA 4BC4A 2ASMA 4IXCA 3FZLA 4WQ4A 3S41A 1C0GA 3VF4A 2FSJA 4FWQA 2FSKA 2AP1A 4BRMA 4ISGA 3ENHA 2DPNA 4FWOA 2QWNA 5BREA 1JCFA 2ZGZA 4A2AA 4CZHA 2Q1NA 3A5NC 5JMVA 3VGKA 3UKRB 5AQOA 4C23A 1TUUA 3UE5A 5BN9A 2VYPA 5AQVA 4H0YB 3QB0A 2ITMA 3BUZB 3CI5A 3ATVA 5AQYA 3JS6A 3CJ7A 3A5MC 1XUPO 2QWRA 3ZX3A 1BA0A 3U9DA 1KAYA 4ISFA 3VGMA 3R8EA 5AQIA 1NWKA 2V51B 3MN6A 3U4LA 4CZMA 3HM8A 5EY4A 2D4WA 4IWVA 3UKUB 2BTFA 2YCHA 1DEJA 1ATNA 3VEYA 2P9UA 4WYBA 4DB3A 5KPZA 3CJBA 3IUCA 5BPNA 4A2BA 2CGJA 2P9KA 4FWNA 1XQSC 4CD1A 3SLCA 4BQZA 3L6QA 2V7ZA 3H45C 4H5RA 4JD2A 2I7NA 3C0BA 4CBXA 1NGIA 1NGDA 2P9IB 1ATRA 4ISEA 4BGAA 3O6WA 2GTDA 3CQYA 2YHYA 3MCPA 4DHYA 5F2RA 4YDUC 5JICA 1NLVA 2P9SA 5I9EB 4BRNA 2A40A 1WOQA 2GUPA 4I6MB 2YHWA 2ZWHA 3HTVA 5AZIB 5LJWA 5JLFA 2BUPA 2P9NA 3JXUA 3VGLA 3WEEA 5FPEA 4HWIA 3WT0A 1GLCG 2PBDA 4B9QA 2IIRA 3HBTA 5AFUA 1WUAA 2H3GX 1MA9B 2ZGYA 2E2NA 5AZJA 5F0XA 2I7PA 4BQLA 4F9OA 2IVNA 2QWOA 2GEMA 5KPTA 5JLHA 1HKGA 4GNIA 3ENOA 4CZKA 1DKGD 3RSEA 2Q36A 1U2VB 2CGLA 1HUXA 5TKYA 4BRKA 3A5LC 4BRGA 3FR0A 4QS7A 5F1XA 1X9JA 1S3XA 2J4RA 4YDUA 1T6CA 5CE3A 2A3ZA 5LJVA 1NGJA 3A5OC 3KZBA 4MLHA 3UKRA 4H5TA 3J8AA 3QMLA 3VF2A 3FZFA 3BF3A 1R59O 4WQ4C 5ELZA 4B1WB 3A8YA 2A42A 1T44A 3WUHA 3VEOA 1G99A 3DWLA 3LM9A 4EHUA 3ULEA 4DCHA 5BPMA 3O8MA 1J6ZA 3GOIA 3LM2A 4HTLA 3HZ6A 1KAZA 2QW9A 4BRCA 2E2QA 3OHRA 3MK6A 4IO8A 2ZF5O 1KXPA 3HI0A 3UKUA 3I8BA 3M3ZA 3R9PA 4LC9B 2GELA 4RCHA 1GLJO 3LDLA 4M7XA 2ASPA 1V4TA 5AQLA 3L4IA 5AQMA 4K42A 3H3OB 4MO5A 2P9IA 1QZ5A 1BO5O 1QZ6A 4BR0A 3EN9A 1E4FT 4H5VA 3ZEUB 4PKHA 4E1JA 1TYQB 3VETA 3VENA 3DJCA 3LDPA 1YXQA 2QXLA 3CJCA 4I6MA 5AZIA 4CI6A 5AQNA 1LOTB 2E20A 4BVPA 1QHAA 4FWLA 5ADXA 4NO7A 4CJ7A 3ULEB 5KPRA 3H1QA 2GWJA 2HMPA 2WUSA 2D0PA 3C7NB 3FZHA 1LCUA 2HF4A 5AQSA 2P9PB 3AAPA 3M6GA 4BREA 3WXLA 3QICA 3AY9A 3H1VX 1Z05A 5EVZA 1HPMA 4GY2B 4CBUA 3CJAA 3D7EO 1U2VA 3GBTA 3QDKA 2FSNA 1CZAN 5EOYA 2Q31A 5KQ8A 1NGCA 5E26A 2FF3B 4PKGA 1HJOA 4B1XB 3MDQA 2D0OA 3MMVA 4WQ5C 4JNEA 4RWTA 3EZWA 1BWFO 4FWPA 3B8AX 5BPLA 4PL7A 3O1WA 1Y64A 4CZGA 2W41A 4M63C 4QS9A 3KHYA 4BR4A 3AARA 4PKIA 1ZBSA 3FFKB 2VCPA 3TU5A 3QBXA 4FOEA 1Q18A 2KHOA 5E84A 3W3DA 3IDHA 1D4XA 2IVOA 4JAXA 1NMDA 1GLLO 4BVOA 4B1VA 2P9LB 1YVNA 2FXUA 4FPAA 4BG9A 4NB4A 5BN8A 2NLXA 3P4IA 3ID8A 1JCEA 3VEVA 3D2FB 1SAZA 1RFQA 1IJJA 3BF1A 4IJAA 2YJEA 1QQMA 4WQ5A 3O08A 3EKUA 5EX5A 5AQZA 1SQKA 3ZETB 2QWMA 3D2EB 1GLEG 3SK3A 4FWSA 5B8HA 3ZEUA 4FWKA 5FPNA 1TYQA 1ZXOA 5AQWA 4BC3A 4CZJA 1BOTO 5BRFA 4BRHA 1NM1A 3SMPA 4K43A 2E8AA 4KBOA 3GL1A 4QS8A 5AQHA 3SMSA 1QQNA 1K8KB 1NGBA 3IFRA 3IMXA 4H03B 3VOVA 4FOIA 3C7NA 4XEIA 1BUPA 3GDQA 1TUYA 2P9PA 2Q0UA 3LDQA 1HKCA 3DXKB 1NBWA 1X3MA 1XC3A 2NZTA 2E2OA 2F9WA 3FGUA 3CQXA 1HX1A 4H5NA 4CZEA 2QM1A 1ATSA 2CGKA 3FZMA 3H46O 1C0FA 4FPBA 4JN4A 4BR9A 2FLOA 5KQDA 2ASOA 4BRFA 4FL9A 4BC5A 4H0OA 5AQUA 1BA1A 2E88A 4FSVA 3G25A 1NGEA 3VEZA 3KVGA 3ZX0A 1Z6RA 1E4GT 3U9ZA 1BG3A 2HOEA 5LY3A 4JHDB 4A61A 5AFUH 3A0IX 4FWMA 3LL3A 3FLCO 2QWQA 2P9LA 4XH5A 4BRDA 4XH4A 3HSCA 3D2FA 2VWBA 2HF3A 2NRHA 1X3NA 3I33A 1IG8A 1NGHA 2V52B 3GG4A 1NGGA 3GE1A 3WXJA 2W40A 4BRAA 3EO3A 4MO4A 2YHXA 2E1YA 1NGFA 2QWLA 3DXMB 1GLAG 3ZETA 5FPMA 3D2EA 3EKSA 3BP8A 1BU6O 4CZLA 2PAVA 1ESVA 5AQTA 4CBWA 2E1ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LD0A 3QFUA 3ISNC 4KH5A 4B9TA 2LSNA 3M1FA 1YF5L 4E7KA 2O8BB 3TSPA 4JKGB 4B1UB 1JLFA 4FW2A 4M45A 4AHUA 1N8RO 4Z4EA 4L8RB 3J81O 4BRLA 4AM6A 5AQPA 4CEFA 3CETA 3O1BA 1RDWX 4LF6K 4KAZA 3AAQA 1XC9A 1BGXT 3WQUA 4BG8A 1WN7A 1MWKA 4RW9A 1BDGA 2HHHK 1VQ6N 4ICLA 5H1SQ 3DAWA 3QFPA 3O9UA 3RMDA 3RWUA 3FZKA 1X9SA 2E2PA 1GLDG 4CF0A 1NJWA 3MN7A 4JI7K 2A1SA 3AVAA 4O8KA 1N34K 2IVPA 5C25A 3AVHA 5FROA 4PL8A 4DQ8A 3KKRA 4H0XB 4GMJB 5FRNA 1VSFA 4DUZK 1VSEA 4Y0WA 3J7ZO 1TAQA 1OKJA 1B92A 4DU1A 1JJ2M 2P9UB 3FE1A 5AQQA 1HR0K 3AVGA 3L0QA 4N47A 3VF6A 2KKZA 1IG9A 3PUFA 1RBUA 3BY5A 4L3QA 4CJPA 4FO0A 4AHVA 3M8RA 4DFKA 3EYZA 4JD2B 2UYTA 1WLJA 4R5PA 4IKFA 4DSIA 2YNIA 2DFFA 3CC2N 3MECA 3CJ9A 4OO1J 2P9SB 4JKFA 4DSJA 3L2WA 5D3GA 1H1VA 2HHVA 5HL7L 3CCLN 4Z94A 3MN9A 4EHTA 1KVBA 4X65K 5M1OA 1QSYA 1RT4A 5BR9A 3SQ2A 4CZFA 1S6QA 2CH5A 5AZJB 3QBWA 4FJMA 1QHTA 2OANA 3RSEB 1U6ZA 2QEXN 4WQ4A 3VF4A 3CCSN 2KZMA 3U6FA 3KWIA 4FWQA 4K8XA 1IBKK 1DLOA 2DPNA 5BREA 4Q0BA 2Q1NA 4IDKA 5C10A 4BY9C 2IOCA 2OCEA 3E9PA 3VGKA 4JK8A 5M1PA 4O55A 2VYPA 3QB0A 2VWJA 4LFBK 2ITMA 1EXQA 3CJ7A 1XUPO 3SI6A 2YHBA 3BGRA 3SPZA 4BE7B 4B9VA 4MDAA 2NUBA 3TTFA 2VGMA 4AH9A 2Y1IA 4PY5A 4QOZB 1C1BA 5AQIA 3MN6A 3HM8A 2VWKA 4IWVA 4M3WA 3HXMA 1NK6A 4DB3A 2NRTA 5BPNA 1T05A 4A2BA 3PIPL 3OJSA 1VQ4N 4CD1A 2QI2A 4C1NK 3K5MA 4BQZA 3DRRA 3L6QA 3H45C 1HYVA 3C0BA 4QCLA 1NGDA 1ATRA 3O6WA 4A5BA 4EP5A 3CCVN 4FLXA 3CQYA 3ZSWA 3MCPA 4DHYA 3CM6A 4MFBA 1S72N 2OPSA 1NLVA 4CHNA 5I9EB 4ZHRA 2HHWA 4CFCA 1F21A 1D9DA 2F8TA 3JXUA 3KK7A 3VGLA 4DMNA 4OKEA 4HWIA 1GLCG 4B9QA 4M3ZA 5J2QA 3AGRA 1OVYA 1L3VA 1WUAA 2ZGYA 3MXIA 3DLGA 5KPTA 1VSIA 1NK7A 5JLHA 1HKGA 4GNIA 3I55N 3AO3A 1P90A 3NFAA 3CF5L 1L3SA 3O9SA 3SQ4A 2CGLA 1HUXA 5FLXO 3A5LC 3DRSA 3FR0A 5C0YA 2X78A 5F1XA 4CGIA 2J4RA 1K73O 4CHZA 4IFEA 2JWKA 2OYQA 5CE3A 4AHTA 5LMNK 3CXCM 5KRTA 5LJVA 3KZBA 1LAWA 3RTVA 2O8FA 4I7FA 3VF2A 4FW1A 4FJNA 4B1WB 4NLBA 3DWLA 4KTWA 4HHTA 3ULEA 3LM2A 2KTQA 5C12A 1B9FA 3CYGA 3NF7A 3NVMA 1NK4A 4IO8A 2E5LK 2ZF5O 3T19A 3HI0A 3MX5A 3G0ZA 4DTSA 3WNHA 4NXNK 3I8BA 3R9PA 3VQBA 4OLAA 2GELA 1M1KO 3ZSRA 4M7XA 3SYZA 1O1WA 3Q7BA 3OYIA 1JKHA 4MO5A 3NH1A 4FJ8A 3TSQA 4BR0A 5M1KA 3S9HA 4H5VA 1CXQA 4PKHA 1HPZA 1UOCA 1TKXA 5DMRA 3RVCA 3CJCA 4FM0A 4I6MA 5AQNA 3K9JA 2E20A 4BVPA 1QHAA 4FWLA 1IBMK 4NO7A 4CJ7A 5M1FA 1YJNN 2XY7A 5KPRA 3SCXA 3ZSQA 2KLAA 2XHBA 4K0KK 1UWBA 4O0IA 1NG9A 4JKDA 5AQSA 1KVAA 4NLCA 3AAPA 4OPAA 3WXLA 3QICA 4CJFA 4CBUA 2ITGA 2HNDA 3PO5A 4V19S 4E7LA 3VA0A 4E0DA 3SQ1A 4OPHA 3WNGA 1WSJA 2FSNA 1QE1A 4LFCK 5KQ8A 2FF3B 4DTUA 1HJOA 4J2EA 4CJEA 4JS5A 2D0OA 4JNEA 3C95A 3EZWA 4PHTX 3G6EN 1BWFO 1NJXA 4AHCA 4F3TA 5HROA 3K5NA 1KTQA 5BPLA 4W5NA 1VQ9N 3O1WA 4CZGA 4IOCL 4BE1A 2W41A 1VK0A 3NGIA 2BANA 4PKIA 3FFKB 3OYEA 5C15A 1FKPA 2X6NA 3W3DA 2HNZA 5KI6A 3V1RA 2P9LB 4FPAA 3CCQN 3SUOA 3ID8A 4E7JA 2W6KA 5I3UA 4CEZA 2YJEA 3FFIA 3O08A 1A5XA 3EKUA 4OGEA 2QWMA 1VSLA 3D2EB 4FWSA 4B3RK 1VAZA 3ZEUA 4FWKA 2F7TA 1ZXOA 5AQWA 4CZJA 3AVKA 4DTMA 4BRHA 1W9HA 1NM1A 3L3UA 2E8AA 3GL1A 4QS8A 1W7AA 4CEBA 5GINA 1NGBA 3TTDA 3IMXA 4H03B 3CPWM 3ZLJA 2DTUA 2EHGA 1BUPA 1S1WA 3GDQA 1VQMN 1TUYA 2P9PA 3PV8A 2OPQA 5FDLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2UXC K;  1SUQ A;  1HNV A;  2KFN A;  4YOY A;  1RT5 A;  1EWQ A;  2WON A;  3P5J A;  1BQM A;  3H1Q A;  1NJY A;  4CJU A;  2WUS A;  2Z1H A;  3K5L A;  3C7N B;  4OX9 K;  4DTP A;  2HF4 A;  3KIO A;  1FKO A;  3LAM A;  4BRE A;  3H1V X;  4G1Q A;  3QIP A;  1SV5 A;  1Z05 A;  2EX3 A;  4IEI A;  3CJA A;  3D7E O;  4PUO A;  3ZT3 A;  3GBT A;  3QDK A;  5EOY A;  1CZA N;  2XO7 A;  4Z0U A;  1RIL A;  4LSN A;  2PFU A;  2WOM A;  1NGC A;  5E26 A;  4B1X B;  4DKW A;  4FK2 A;  1I39 A;  1I3A A;  4RWT A;  5GAG P;  3WNE A;  3R3L A;  3ZT1 A;  4FWP A;  3C6A A;  4YOR A;  4E1M A;  3HRG A;  3LAN A;  3MEG A;  1BIU A;  4QS9 A;  4BR4 A;  3AAR A;  2VCP A;  3TU5 A;  4DSF A;  2HHU A;  2D5R A;  2UXD K;  2YNH A;  2IVO A;  3D0P A;  4JAX A;  1FW6 A;  1NMD A;  3L3V A;  3V6D A;  4B1V A;  2D0A A;  4BG9 A;  1IO2 A;  4OVL A;  3VQC A;  5BN8 A;  4LSL A;  4DG1 A;  1JCE A;  3D2F B;  2NRZ A;  3CCJ N;  1SAZ A;  3J7Y P;  4DQR A;  3VQ9 A;  3TAM A;  2ETJ A;  3HPG A;  4O5B A;  3TAR A;  5EX5 A;  3ZET B;  4CEQ A;  3SK3 A;  2FBY A;  4DQS A;  1WSE A;  5B8H A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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