4H0VB

Crystal structure of nad+-ia(e378s)-actin complex
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
370
structure length
355
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Iota toxin component Ia
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
total genus 124
structure length 355
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0vB03
1ATSA 4MO5A 5AQUA 3LDNA 3TPQA 4EAHD 2QWQA 2QM1A 2UYTA 3LDOA 4H0XB 4JD2B 4JHDA 4BRHA 3C7NA 3VPZA 2J4RA 3ENHA 1QHAA 5BREA 2FF6A 4CZIA 1BO5O 1BA0A 4E1JA 4BC5A 2FSNA 2V52B 3QBWA 2P9IA 4BQLA 4FWSA 3I8BA 3HZ6A 1WUAA 3ZX0A 2A41A 4CBWA 2P9KB 4CZHA 1HKCA 5KQ8A 3ID8A 2CGKA 3JXUA 4GY2B 5AZIA 4PL7A 3L4IA 3WXLA 2E2OA 4A61A 2GWKA 5B8HA 1MWMA 5KQDA 2P9UB 2ZGYA 3SMSA 2YCHA 3CJ9A 5BRFA 4IJAA 3P4IA 3LM9A 4BVOA 3MCPA 3EKUA 4PKGA 3G25A 2Q36A 2VYPA 3H1QA 1JCGA 4DHYA 3FLCO 4RWTA 3R6MA 4CZGA 3GBTA 1YXQA 4A2AA 4B9QA 3J8AA 5BPNA 4WQ4A 5BN9A 4IO8A 4JAXA 4WQ4C 3VENA 3FZFA 4A62A 1R59O 3FZMA 4RCHA 2P9KA 3WXKA 4BREA 1MDUB 3ATVA 4DB3A 1OKJA 2HF4A 4NB4A 3VESA 4B1ZA 1GLEG 1K8KB 3AARA 2P9UA 2IVOA 2GWJA 3SK3A 5AZJB 1X3NA 4BC4A 4BRNA 1TYQB 2YJEA 3VGLA 1IG8A 1SQKA 1RDWX 3B8AX 1NGAA 2EWSA 2NRHA 2YJFA 3EL2A 3VGMA 1WOQA 2E2NA 4M63C 3MMVA 3L6QA 1ZXOA 3FR0A 2ASPA 3BP8A 1KAXA 2GEMA 2Q0RA 3VOVA 4CI6A 3VF2A 1BG3A 2D0PA 2I7NA 3GE1A 3DXMA 4XH4A 5AR0A 2QWMA 3VEXA 1NMDA 4BRIA 2P9NB 5E26A 5KPZA 4BC3A 2HMPA 2I7PA 3RSEB 4H0VB 2FLOA 4CZKA 1G99A 4IXCA 5F0XA 3O5BA 4CZLA 1TYQA 2IIRA 4BRFA 3VF4A 4B1VA 4AM6A 1TUUA 4A2BA 1NGHA 2Q0UA 5EVZA 3H6EA 3WUHA 5AFUH 3WQUA 1H1VA 2F9WA 3HTVA 2P9SB 3CHWA 3UKUB 5AQXA 1Z6RA 4AM7A 3U8XA 5KPRA 4JNEA 3EN9A 1SAZA 4Y0WA 1D4XA 1NM1A 4FOEA 1MA9B 3AY9A 3HI0A 4BRKA 1JCEA 4MO4A 5FPDA 1BDGA 3D2EA 4B1WB 3IMXA 4FPBA 2AA4A 4BRCA 1NBWA 3D7EO 5EX5A 1BWFO 3UKRB 3W0LA 3U4LA 1JCFA 3WEEA 3A5OC 3QBXA 5AQGA 1BU6O 2BTFA 3GG4A 5ADXA 4O8KA 3A0IX 4Z94A 3M6GA 1LCUA 1BOTO 2A42A 5AQKA 5AQLA 4IJNA 2KHOA 3KVGA 3SMPA 3S41A 4DCHA 3WXJA 2W41A 4BR9A 4WYBA 3CJAA 4EHTA 2H3GX 1GLBG 4H03B 4XH1A 5FPNA 3ZEUB 2PBDA 4BRLA 3FZKA 2YHWA 3CQXA 2FXUA 1E4GT 4PKIA 3CI5A 2F9TA 1NGGA 4JD2A 4ISFA 1ESVA 2P9PB 3A5LC 1HJOA 5AQZA 1V4SA 3FFKB 1T44A 3EO3A 5JMVA 3AAQA 3O1WA 3VEOA 4BR4A 2D1KA 2Q1NA 3C0BA 3ZEUA 5AQTA 2YI1A 2VCPA 2P9LB 1ATNA 4H0OA 3EZWA 4PL8A 3CQYA 3SLCA 4XH5A 1U6ZA 1NGEA 3H3NO 2CGJA 2OANA 3D2FB 3W3DA 1NLVA 4BR2A 4I6MB 1ZBSA 3R8EA 1U2VB 4K41A 1DKGD 1NGIA 2YHYA 4H5RA 1S3XA 4BG9A 2HF3A 2Q2RA 5LJVA 3CERA 3VETA 3DJCA 1E4FT 3MN7A 3WXIA 2A5XA 4BRQA 5TKYA 4H5VA 4PKHA 4CZEA 3ATUA 4M7XA 3BEXA 3VEWA 2A3ZA 2W40A 5AQQA 4CBUA 2V7ZA 2E20A 5BRDA 3QDKA 4XEIA 2ZF5O 3O08A 4CBXA 5AQNA 2YHXA 4BVPA 1K8KA 5JLFA 3H1VX 3A8YA 3BUZB 4I6MA 4WQ5C 3LDLA 1NGFA 1NGCA 4BQZA 2ASOA 5AZJA 4NO7A 5AQFA 4O5FA 1KXPA 2IVPA 4FWPA 5FPMA 5F1XA 1XUPO 3KZBA 1X3MA 4FWKA 3TU5A 3VGKA 2QW9A 2D0OA 1T6CA 1S22A 1GLJO 2QWRA 1Q18A 1ZC6A 2E2PA 2FSKA 1DEJA 2NLXA 3MN6A 4QS7A 3ZX2A 5AQYA 1NWKA 2NZTA 4FWMA 5AQPA 4MLHA 1ATRA 3MK6A 3WT0A 2IVNA 2V7YA 5KPTA 1NGBA 4IZ9A 3U9DA 3U9ZA 2P9NA 1C0FA 5BN8A 4EHUA 3RSEA 1LOTB 5LY3A 1EQYA 4EFHA 3MN5A 4KBOA 1QQOA 4H5TA 4L3QA 2VWBA 4BR7A 5AFUA 2ITMA 3VEVA 3VEZA 2QWLA 2P9IB 1HPMA 1KAZA 3VEYA 3DWLA 3ZX3A 4ISGA 1RGIA 4BR5A 1SZ2A 1DGKN 5AQHA 5AQIA 3MN9A 3FGUA 1GLLO 3GDQA 3JS6A 1GLDG 2CGLA 2V51B 4BRMA 2CH6A 4FL9A 2QWNA 2P9SA 2QXLA 3UKUA 4GNIA 4B1XB 5E84A 2GELA 3F9MA 3O80A 3A5NC 4FWOA 4CZMA 4F9OA 5EXWA 4EIAA 4BGBA 4HWIA 3FZHA 3SJHA 4FO0A 5JLHA 1CZAN 1J6ZA 1HLUA 3FE1A 3H3OB 3H46O 3L0QA 1XQSC 3O4WA 4IWVA 1HUXA 1NGJA 3UKRA 2BUPA 1Y64A 1YUWA 4BRGA 4HTLA 1YAGA 4FWLA 2AP1A 1T6DA 3QMLA 4ISEA 5AQJA 5EOYA 3R9PA 2DPNA 3UB5A 1TUYA 3ZETB 4CD3A 4H5WA 4CD1A 2ZGZA 2PAVA 1X9JA 2E1ZA 2A6AA 5AQOA 3QFUA 4FWNA 5AQSA 4BRPA 2CH5A 4DQ8A 3OHRA 3QB0A 1QZ5A 3CJ1A 3IFRA 4H5NA 2GUPA 3O1BA 5F2RA 4H0YB 2FF3B 4FOIA 1GLFO 2P9PA 4K43A 4B1YB 3CJBA 3AAPA 2WUSA 3DXMB 4BG8A 4H0TB 3ZETA 5AQVA 1QQNA 5AQWA 3CIPA 3CJ7A 2E1YA 3O8MA 3CJCA 5AQRA 4BROA 4C23A 3KHYA 4JN4A 3VF6A 4CZJA 3ULEB 2P9LA 1QQMA 3DAWA 1BUPA 3QICA 1QZ6A 5EY4A 3QFPA 4BRDA 2E8AA 1BA1A 1HX1A 1HKBA 2QWPA 3A5MC 3HSCA 3IDHA 4H0PA 3D2FA 4MLEA 3HBTA 4WQ5A 2Q31A 3IUCA 4FPAA 1KAYA 1U2VA 4BGAA 4K42A 1XC3A 1GLCG 3FZLA 4BR0A 3EKSA 1C0GA 3M1FA 2FSJA 3H45C 1GLAG 2A40A 1MWKA 4QS9A 1P8ZA 3BF3A 1RFQA 1NGDA 4K25A 5LJWA 4M7YA 1Z05A 4RTFD 3GL1A 3ULEA 1YVNA 2GTDA 3D2EB 1HKGA 3DXKB 3MDQA 5AQMA 2E88A 4CZFA 3ENOA 3VERA 3M3ZA 2D4WA 3LDQA 4JHDB 5JICA 3C7NB 2Q97A 3WEEB 4FWQA 2ZWHA 3LL3A 3WQTA 2HOEA 4LC9B 3CETA 5BRHA 4BC2A 4J8FA 4CJ7A 3O6WA 4BRAA 3I33A 5I9EB 2QWOA 1V4TA 3HM8A 4FWRA 5ADXH 4QS8A 3UE5A 5BPMA 5FPEA 4B1UB 2E2QA 3BF1A 4FSVA 5AZIB 1IJJA 5BR9A 5BPLA 5CE3A 2ASMA 3LDPA 3LM2A 4YDUA 5ELZA 3DXKA 4YDUC 3GOIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CGHA 1HNXK 2WBNA 3AVLA 4MO5A 3IKMA 4DWIA 2F8SA 2QWQA 1WSFA 3AGKA 4H0XB 2ZD1A 3MWTA 3VQPA 1JXEA 5BREA 2P5GA 3LPUA 2QKKA 4Y1DA 3HOTA 1RT2A 4FJNA 2O8EB 5JVGL 1RBVA 3AVHA 4CHOA 1S5JA 3SUOA 2OTLN 2P9KB 4KB0A 4KREA 3KWGA 4OGCA 5DM6L 1U47A 1VRUA 3THWB 2CGKA 1RTIA 4GY2B 4J2EA 3WXLA 2E2OA 4M3ZA 4A61A 1CLQA 5B8HA 3RVCA 3RMBA 3VN5A 2ZGYA 3VQBA 4E1MA 3OYCA 3ZT2A 5C15A 1EKEA 1JCGA 4DHYA 4CZGA 3OYDA 4HHTA 4N47A 3CCVN 3NVKA 2KZMA 2EX3A 4A62A 1T3VA 2P9KA 4DSKA 3ATVA 5E41A 4CJLA 2HHUA 5A2QO 4E1NA 3V4IA 4DF4A 1X3NA 1TYQB 3CCLN 1JLCA 2DFHA 1YITN 3I56N 4LFCK 4KFBA 3AA5X 4DTXA 2EWSA 3EL2A 4HTUA 5FDLA 3D45A 3T69A 1YTAA 3HVTA 1ZXOA 2GEMA 4CI6A 3RR7A 4OPHA 3L3VA 3LWMA 3M8RA 4B3TK 5E26A 1VQ4N 4BC3A 4CJ4A 3RSEB 4H0VB 4GKKK 1G99A 4IXCA 4CK2A 5F0XA 1ZBHA 1TYQA 4U7BA 1LAWA 3AGRA 1N32K 5J2MA 2C1IA 4KKOA 4LF6K 4BWMA 1NGHA 3DRSA 2HHHK 1VAZA 2VQEK 5EVZA 3H6EA 1BHLA 2FBYA 1DTTA 1YJWN 4CEEA 3HT3A 4F3OA 2F9WA 3MXIA 1EP4A 3K5NA 1L3VA 5D3GA 1A5WA 5AQXA 1Z6RA 3U8XA 3LAMA 4DQSA 1D4XA 1NM1A 1MA9B 1N6QA 1JCEA 3L4QA 4FPBA 5HP1A 1DTQA 2ATQA 4BRCA 4KI4A 3K5MA 4DFMA 4PUOA 5AQGA 3QBXA 4LD0A 3GG4A 1ITGA 1VSEA 4O8KA 1LCUA 3HL8A 5AQKA 3VA3A 4CIGA 5HRNA 4WFAL 4EHTA 4FVMA 3L2UA 1GLBG 5FPNA 3ZEUB 5FLXO 4JRPA 1D9FA 3AVNA 3NHGA 1YJ9N 4B3OA 3O3GA 3THXB 4M42A 3VA0A 4GMJB 5JVHL 3S3NA 4YOYA 3AVCA 3LP3A 3A5LC 1NK6A 4B08A 4BR4A 4OVLA 2D1KA 4B3SK 4CGDA 4M3WA 2NUBA 3RMCA 3ZEUA 4OPAA 5AQTA 3KKRA 1WAFA 4NXNK 4A57A 3TAFA 3CQYA 3H08A 3G6EN 1HYSA 5M1PA 5C24A 1WAJA 2HNZA 4BR2A 3HVRA 3DLKA 3LWLA 2PFUA 2G8UA 1DKGD 1NGIA 2HVHA 4H5RA 1S3XA 1IBKK 4JI7K 3CERA 4J2DA 4CJTA 5TKYA 4ILGB 4IO9L 4M7XA 2A3ZA 1NKBA 3SPZA 1TK5A 3VQQA 3VQEA 2X78A 5AQNA 1VQ9N 5JLFA 4F2RA 1NGCA 1RDAA 2ASOA 1VQMN 1C0UA 4NO7A 3V9UA 4O5FA 5FPMA 5M1NA 3AVMA 1KVAA 3HSTB 1B9FA 1S22A 1GLJO 1IKXA 3CCJN 3TSUA 1NK0A 1ZC6A 3PV8A 4QS7A 1ILYA 1IBLK 4I2PA 3V1OA 1TAUA 3CCUN 2IGIA 2IVNA 4XJXA 4C8MA 1UA0A 3U9DA 4KH4A 3U9ZA 2P9NA 2YNIA 4O0IA 3QERA 1S1TA 3EZ5A 4KBOA 4BR7A 3NE6A 5AFUA 4ELUA 2ITMA 3OYNA 1R0AA 2P9IB 4E3SA 1U49A 1D8YA 3S5TA 2KKZA 1RGIA 4M3TA 3NGZA 3NF9A 2DY4A 4IDKA 5AQIA 3JAMO 2BE2A 3FGUA 1CXQA 3AO1A 2V51B 2R7YA 1IV0A 2P9SA 2KZZA 1Y97A 4B1XB 3CPEA 4BECA 3PX0A 3F9MA 1B9DA 1C6VA 1XQSC 3CQ8A 4LSNA 3CCQN 3UKRA 4E0DA 1YAGA 4FWLA 4ISEA 3MAQA 4F8RA 3R9PA 3DRPA 5KGWA 1OH6A 3F2KA 3UB5A 3VTIA 3VQDA 4FW1A 4KHSA 2O8FA 4B8AB 4CD1A 1ZBFA 1G15A 1VSMA 2VGNA 4JS4A 1X9JA 4DR7K 4BDYA 5AQOA 4DTUA 1GOBA 3AVKA 3QFUA 1NK5A 4FW2A 1KRPA 3OYJA 4M41A 2CH5A 4DQ8A 3QINA 3OHRA 3ZSOA 3QB0A 1TK8A 4MQ3A 1QZ5A 4FM0A 4E89A 1FXXA 3IFRA 4H5NA 2GUPA 3O1BA 4DUZK 2FF3B 4FOIA 1TKTA 4K43A 4JKDA 3QO9A 4DKWA 2NRTA 5AJ3K 4BDPA 4FJJA 4BACA 2E1YA 4ILJA 3KHYA 2ZE2A 4JN4A 3CC7N 4CZJA 1NJXA 3KTQA 2P9LA 4B9LA 1KC8O 1T03A 1NG9A 3TI0A 4G1QA 3RWUA 2E8AA 1C1CA 2A1SA 4JKBA 4CJKA 1RT5A 3D2FA 4WQ5A 4DR1K 1FJGK 3FFIA 1U2VA 4FPAA 3DLBA 4IG3A 4M3UA 2YNFA 4BE7B 5CYMA 1C0GA 2O8DA 3M1FA 2NRXA 4CF2A 4BE2A 4QS9A 1P8ZA 3BF3A 3DMJA 5LJWA 3PX6A 4IFVA 1TKZA 1Z05A 1IKVA 3OYFA 1YVNA 2GTDA 3D2EB 5AQMA 1XWLA 3MDQA 2HW3A 4CZFA 3VERA 3CFPA 1N34K 4DLGA 5GAEP 2HHIA 4RW4A 2Q97A 3WEEB 2OPSA 4FWQA 5HRSA 3J7ZO 3I8DA 4OGEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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