4H0VB

Crystal structure of nad+-ia(e378s)-actin complex
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
370
structure length
355
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
source organism Clostridium perfringens
molecule tags Toxin/structural protein
total genus 124
structure length 355
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0vB03
1LCUA 2GEMA 3VF4A 5AQFA 3TU5A 1T6CA 2D4WA 4BG9A 3J8AA 2FF3B 1JCFA 4H03B 3ENHA 3KHYA 2A42A 2ASMA 4GNIA 3ZX0A 4F9OA 1IG8A 3FZHA 4NB4A 2ASPA 1Y64A 3GBTA 4PKIA 4BR5A 4DB3A 3LM2A 1NGJA 1QHAA 5AFUA 1C0FA 3O80A 3D2FA 1HLUA 3EN9A 4BRIA 2YHXA 2Q97A 3SLCA 2E8AA 4WYBA 2HF4A 4QS8A 2ASOA 3BP8A 4BGAA 4EHUA 3EZWA 5FPDA 2GTDA 4BRKA 1R59O 3LDPA 4RWTA 1TUUA 2P9IB 1NGCA 4BVPA 1MWKA 4BRHA 3ZETA 2I7NA 3BUZB 3QFPA 5AQQA 1NGBA 2ZF5O 5BPMA 4WQ5A 5AQLA 3VERA 4DHYA 5BRFA 3IUCA 5FPEA 2UYTA 2P9KA 2YI1A 1NGDA 2P9KB 2E20A 3VGMA 3SJHA 3W0LA 1T44A 4A61A 3O1WA 1HX1A 4C23A 2P9NA 4YDUC 2P9NB 3FZKA 2GWKA 5EXWA 3UB5A 3O8MA 1BWFO 4M7XA 1BU6O 4O5FA 5BRHA 2P9UB 1V4TA 4FL9A 1GLJO 4BQZA 4BRFA 3R6MA 4Y0WA 1K8KA 1Q18A 1K8KB 1DEJA 2VCPA 4GY2B 4H5VA 3I33A 3MDQA 4JN4A 3UKUA 1C0GA 3UKUB 2QWPA 1KAXA 1P8ZA 5AR0A 4FOIA 1S22A 4IXCA 3A5OC 5F0XA 3VGKA 3DXMB 3GDQA 1IJJA 3IFRA 4EAHD 1GLFO 2W41A 3FE1A 4BGBA 3WXJA 2CGKA 4BRDA 3CETA 3GE1A 3VPZA 2P9LA 2ZWHA 3SK3A 5E84A 2P9LB 3H1QA 3ZEUA 5BREA 1H1VA 3ZEUB 4FWMA 3FZFA 4K25A 3C7NA 3WQUA 4B9QA 4DQ8A 3KZBA 3H45C 2KHOA 4CJ7A 1ZC6A 4E1JA 3VEXA 3VGLA 4BROA 3EKUA 4BRLA 3HTVA 5KPZA 5ELZA 5AQTA 3O1BA 3U4LA 4YDUA 4CZIA 4MO5A 2GELA 2P9SA 3ATUA 1DGKN 5KQ8A 5F2RA 1ZBSA 3CHWA 1NBWA 1BUPA 3F9MA 2QWQA 2A41A 3H1VX 4H5TA 1KAZA 3VEZA 1YXQA 4AM6A 1E4GT 1NGHA 1ZXOA 5AQRA 5AQHA 2F9WA 2QWOA 4O8KA 2E2QA 3OHRA 4BC5A 1NM1A 4CZJA 2PBDA 1JCGA 3HZ6A 3CIPA 5EY4A 4PKGA 3CQXA 2Q0RA 3O08A 1U6ZA 2VWBA 1ATSA 3MK6A 3VEVA 2ITMA 5I9EB 1X9JA 4IWVA 5AQZA 3MCPA 4FWRA 3QICA 2D0OA 4ISEA 3HBTA 3WUHA 4Z94A 5KQDA 2W40A 4ISGA 1QZ6A 1NMDA 3U8XA 2Q36A 3FFKB 3A5LC 3R9PA 3FZLA 3GG4A 3LDOA 3WQTA 3BF3A 4WQ4A 2NZTA 3MN7A 2FLOA 2E1YA 3O5BA 2HOEA 3KVGA 4BC4A 1DKGD 4CI6A 2J4RA 2EWSA 2BTFA 1TYQA 1TYQB 3A5MC 4FWSA 4EHTA 4M7YA 3VF2A 3EKSA 4J8FA 5AQUA 2P9IA 3WT0A 3CJ7A 4PKHA 4ISFA 4RCHA 1QZ5A 2E2PA 2D1KA 4FWLA 1D4XA 3FR0A 2Q0UA 2YHYA 3CJ9A 2Q1NA 3WEEA 2GUPA 2E2NA 3WEEB 2F9TA 4L3QA 4K43A 3MN6A 2FXUA 3LM9A 5AQXA 2HF3A 4CZEA 1WOQA 3H3NO 3ZX3A 1BG3A 3DWLA 3DAWA 4XEIA 4PL7A 2WUSA 4H0VB 2P9UA 5TKYA 3VETA 2A5XA 4XH1A 4FWPA 5AQJA 5B8HA 5F1XA 3CJAA 4HTLA 4BRCA 2P9PA 2V52B 3GL1A 2P9PB 4XH5A 2QWLA 1HKGA 2QWRA 2CH6A 3HI0A 4MLHA 3L6QA 1YAGA 2YJEA 4K42A 1BA1A 4BR9A 4EFHA 5ADXA 4I6MA 3B8AX 4I6MB 4BRPA 4H0YB 3S41A 5BRDA 1NLVA 3DXMA 4BR0A 3O4WA 3EO3A 1YUWA 1V4SA 5AQVA 3BF1A 4XH4A 1RDWX 5AQSA 2NRHA 5JMVA 2GWJA 4CZLA 2A40A 2IVNA 4M63C 1S3XA 4CBUA 1HJOA 2IVPA 3UE5A 1NWKA 3D7EO 4H0XB 1T6DA 2FSKA 1XQSC 3CQYA 4CBWA 1MDUB 1Z05A 3AARA 3RSEB 4CZKA 4WQ4C 1XUPO 1NGAA 2V51B 2A3ZA 4JD2A 4BRNA 4CZGA 2Q31A 5JLHA 4JD2B 1RFQA 4CD3A 3LDQA 5EX5A 3I8BA 5AQKA 1KAYA 2Q2RA 1GLAG 3JXUA 4LC9B 5AQIA 3ULEA 3ULEB 2FF6A 5BR9A 2FSJA 2IIRA 2V7ZA 2CGJA 4B1WB 2VYPA 4FPBA 2QWNA 5BPNA 3ID8A 4FWOA 5LJWA 2QXLA 4FWKA 5AQNA 1MA9B 3H3OB 4CBXA 2E2OA 4FO0A 3VEOA 3TPQA 4BC3A 1NGEA 5LY3A 3L4IA 1HKBA 1GLDG 5EVZA 5KPRA 4B1XB 1HKCA 1HPMA 3CJCA 4BVOA 1X3NA 4CZFA 2NLXA 2DPNA 5JICA 3LL3A 3QFUA 1BDGA 3W3DA 4CZHA 2OANA 4FSVA 3VEWA 3P4IA 3H6EA 3VF6A 3EL2A 3O6WA 4NO7A 1XC3A 3D2EA 3VESA 4A2BA 1GLBG 3D2EB 2HMPA 5EOYA 3L0QA 4IO8A 2AA4A 3M6GA 1YVNA 2AP1A 3ENOA 4FWNA 3BEXA 4A2AA 5LJVA 5AQPA 3WXIA 3LDNA 4IJAA 1SZ2A 3WXLA 3JS6A 3AY9A 3AAQA 4HWIA 3MN5A 3VOVA 3LDLA 3D2FB 3IMXA 3WXKA 4QS9A 3FGUA 1U2VA 3QMLA 4H0TB 1U2VB 1LOTB 2FSNA 3HM8A 2QWMA 4JHDA 4JHDB 3ZX2A 1G99A 1NGGA 3VEYA 2QW9A 2ZGZA 2CH5A 3AAPA 1OKJA 3ZETB 4FWQA 4IZ9A 4BR4A 4DCHA 5AQYA 4QS7A 4BR7A 5CE3A 1ATRA 4PL8A 5AFUH 3R8EA 4JAXA 5KPTA 5AQMA 1NGFA 2ZGYA 4JNEA 4H0OA 4CZMA 1ATNA 3G25A 2E1ZA 3M1FA 5AQOA 3U9ZA 1BOTO 4B1YB 3U9DA 1KXPA 4H0PA 3UKRA 3UKRB 2CGLA 3ATVA 2D0PA 5AZJA 2IVOA 1QQNA 4AM7A 1NGIA 5AZJB 4BRAA 4CD1A 2V7YA 3SMSA 3FLCO 3C0BA 2YCHA 3DJCA 3DXKA 2I7PA 1JCEA 1WUAA 3DXKB 4KBOA 5FPNA 5E26A 1GLLO 5BN9A 4A62A 4BRGA 4H5WA 4H5NA 3RSEA 1BO5O 1QQMA 2YJFA 2E88A 4FOEA 5JLFA 3VENA 1ESVA 3IDHA 4B1ZA 1GLCG 4FPAA 3MMVA 1RGIA 3CI5A 4EIAA 2A6AA 2H3GX 3C7NB 3QB0A 2BUPA 3CJBA 5ADXH 4MO4A 3A5NC 4BQLA 5AQGA 1J6ZA 3QDKA 1TUYA 4H5RA 3A8YA 4IJNA 4BC2A 2P9SB 1HUXA 1GLEG 5AZIA 4BREA 5AZIB 3SMPA 1CZAN 1Z6RA 3FZMA 3MN9A 3QBXA 3H46O 3GOIA 2PAVA 4BRMA 4MLEA 1SAZA 1QQOA 3QBWA 4B1VA 5FPMA 4BRQA 3M3ZA 4BR2A 5BPLA 4K41A 3HSCA 4RTFD 4B1UB 5BN8A 4BG8A 4WQ5C 2QM1A 3A0IX 1EQYA 1SQKA 3CJ1A 1X3MA 1MWMA 1BA0A 2YHWA 1E4FT 5AQWA 3CERA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F4KA 4N76A 1HNXK 2G8HA 2VWKA 4DMNA 4BG9A 4E7LA 2HB5A 3J8AA 5GIPA 4TSXA 5JVHL 3KHYA 2A42A 1NK9A 1YT3A 1Z25A 4GNIA 1IG8A 4NB4A 2ASPA 3F73A 4PKIA 3I0RA 4ILJA 4DB3A 4G9ZA 2QTDA 1BIZA 5AFUA 1C0FA 4OGCA 4DKWA 1HLUA 3DLHA 1HNVA 1UOCA 4CHOA 3OYAA 1RCHA 4QS8A 4DR1K 3BP8A 3EZWA 3M8PA 3CD6N 4HCBA 4RWTA 3OYCA 4OJRA 4DV3K 5JS2A 3E9PA 3T1AA 4IG0A 3DLGA 3QFPA 1NGBA 4CJVA 5BPMA 3WNGA 5AQLA 3S9HA 1N8RO 5LMUK 3VGMA 1EWQA 4JRPA 4CJ4A 3QERA 1LWCA 2P9NA 1OH6A 2GWKA 5HP1A 4M7XA 1OH5A 4V19S 3IS9A 1IV0A 1GLJO 4BQZA 1XMOK 3NDKA 3AVIA 2ETJA 3L2QA 1RDDA 5EU7A 1K8KA 2LSNA 2R7YA 1WBDA 4GY2B 1C0GA 3UKUB 4AQYK 3KLHA 1KAXA 3TABA 1XMQK 3NVKA 3SUOA 5F0XA 3G0ZA 3SZ2A 3CPEA 3IFRA 4EAHD 5GAGP 2XHBA 1N33K 2W41A 3CM5A 3DLRA 4CF1A 3CETA 3DRRA 1S1WA 3GE1A 3VPZA 1C1AA 2P9LA 2ZWHA 3H1QA 3HPHA 3ZEUA 1H1VA 3C7NA 3WQUA 4CERA 4FLWA 1RDUA 3H45C 4JKFA 4CJ7A 3VQ6A 1FW6A 3ZYYX 3L3UA 3HTVA 4E1MA 1VQKN 1BI4A 4RG8A 4B3MK 5CR4A 4CZIA 4MO5A 1X9SA 2HHHK 1HYSA 3MAQA 1NBWA 2W00A 3F9MA 2HBMA 3PSFA 4U7BA 1RT3A 1S72N 3ZT0A 3M8SA 4AM6A 3HOTA 5AQRA 3KKSA 1TKZA 3L4QA 4CZJA 1JCGA 3T1HK 3HZ6A 3CIPA 4PKGA 4JI4K 3C6UA 1U6ZA 3SUQA 2W42A 1ATSA 3MK6A 2Z1JA 3KD5E 4IWVA 1QVFM 3QICA 3WUHA 4DWIA 4OPAA 1IG9A 2HNYA 4B3RK 5KQDA 5MLCQ 3CG7A 1QZ6A 3OYDA 1IKYA 2IGIA 1K9MO 1WSFA 2OPSA 3LDOA 3C95A 4Z4GA 1S1TA 4GVEA 3E1YA 4IOAL 4BWMA 4FLTA 4BC4A 2O8EA 4CI6A 3NF7A 4CEEA 1WLJA 4LF5K 1S6QA 1TYQA 2BTFA 4CGIA 2O8DA 2D5RA 3T19A 4FZYA 2X78A 4JI2K 2P9IA 4PKHA 4DFKA 3VTIA 4RCHA 1QZ5A 2E2PA 4UQGA 4E3SA 3WNEA 1J5OA 2Q0UA 2YHYA 1SL1A 3S3MA 1SKRA 2Q1NA 3TTCA 1EP4A 2GUPA 3CCJN 3ZSOA 2FBVA 3T69A 5AQXA 3HJFA 1BG3A 2WUSA 4KV8A 1BQMA 4E72A 4YNQA 3NF9A 4ZTJA 3DM2A 5AQJA 5F1XA 1T7PA 3CJAA 3SPZA 4PUOA 2QWLA 4OPHA 3M8QA 2YKNA 2QWRA 3KD1E 4LF6K 2YJEA 5ADXA 3PO5A 1YJWN 3B8AX 4I6MB 5FRNA 4BR0A 3AVKA 4LFBK 3CCEN 5AQVA 4W5RA 3OYMA 4LF9K 1RDWX 5JMVA 2A40A 1S3XA 3BZKA 1CLQA 3M5RA 4H0XB 2C1IA 4LSLA 4HUGA 3OY9A 1MDUB 4M3WA 4DR7K 1KQSM 4E89A 4G1QA 3L2VA 1N34K 4B9MA 4FM2A 4JD2B 2QI2A 1M90O 5EX5A 3BY5A 1WSJA 2VGMA 1KAYA 1J53A 4CW7B 4M3TA 1VAZA 1QSSA 1GOCA 1GOBA 3AGKA 4CIFA 1VQ6N 1GLAG 4B8AB 1QTMA 3ULEA 2VGNA 5BR9A 4X66K 2FSJA 1TAUA 2IIRA 3KK3A 4B1WB 3AVNA 2PYLA 3O4NA 5BPNA 3THXB 3VN5A 1NJIO 4FWOA 4KTQA 1C6VA 5LJWA 1NNEA 2QXLA 5AQNA 4CJEA 4FCYA 1RTIA 3V9XA 4C1NI 2NUBA 3HOSA 5HRNA 1NKCA 3P38A 5LY3A 2WFBA 5KPRA 4CFDA 3JSMA 2XY6A 3AVBA 2X6NA 4B3SK 3VQDA 5A2QO 1HPMA 5CHIA 4LFAK 4NXNK 1BCOA 4IFEA 4DS4A 3THYA 3P4IA 1D5AA 2RHKA 1XC3A 5FROA 1U04A 4DS5A 4EP4A 4CFBA 2AA4A 3AA4A 1YVNA 4DLGA 3IRXA 4FWNA 3VQ8A 4FW2A 4MQ3A 2B6AA 3VQ7A 3WXIA 1SZ2A 4E1NA 3WXLA 1BL3A 3AAQA 3VOVA 4JKGB 2B5JA 2C1GA 3TSQA 4B9LA 5HLFA 1LAVA 1CXQA 4K0KK 1LWEA 3HVTA 3TARA 4FJ9A 4JHDA 2G8UA 4HTUA 4JI7K 3ZX2A 4CECA 4CJRA 3VEYA 4FM0A 4MDAA 4KFBA 5E41A 4FWQA 1IH7A 3O9SA 2UXBK 1WAJA 3VMFB 5CYMA 4NCBA 4CEAA 4CIGA 2JWKA 4PL8A 3R8EA 1SKWA 5M1FA 1C1BA 4DFMA 3V6DA 5AQMA 1NGFA 2ZGYA 1QHTA 3U9ZA 5HROA 4AHRA 4DU3A 3B6OA 3OA9A 1VQLN 2YHBA 4H0PA 4RW8A 3VQCA 3UKRB 2CGLA 4KREA 5DK5A 1QQNA 1NGIA 3LPTA 1KC8O 4BRAA 4CD1A 2V7YA 3SMSA 2YCHA 1WSGA 2I7PA 3DLEA 4PHTX 5FPNA 4JV5K 4A62A 4NCAA 3RSEA 3S5TA 2YKMA 5JLFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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