4H0VB

Crystal structure of nad+-ia(e378s)-actin complex
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
370
structure length
355
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
molecule keywords Iota toxin component Ia
total genus 124
structure length 355
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0vB03
4A2BA 4JN4A 2BTFA 1X9JA 4XEIA 3H3NO 3VGKA 2I7NA 5AZIA 3ENOA 2QW9A 1QQOA 5AQYA 3VF2A 3C7NB 4BRNA 3LDPA 4K25A 3L0QA 5AQNA 2ASOA 4EFHA 2D0PA 3QBXA 3R8EA 4B1ZA 4EHTA 2E2OA 3O08A 4RCHA 1GLEG 5AR0A 2CH6A 4FWNA 3UE5A 3GL1A 1MDUB 4BC5A 3H1QA 3A8YA 5AQXA 1E4FT 3HZ6A 3VERA 4BR5A 2HMPA 4CZLA 2VCPA 4CBWA 2P9LB 2QXLA 1X3NA 5BRHA 3KZBA 3DXMB 1DEJA 4DB3A 2NLXA 2AA4A 1MA9B 3FZLA 2BUPA 2Q2RA 3WQUA 1G99A 4I6MB 5AQSA 4J8FA 3CHWA 4FWRA 2P9UB 2W41A 1KAXA 3O6WA 4JHDB 3H6EA 3HBTA 1U2VA 4BR9A 1HKGA 1KAYA 1YVNA 2V52B 5AQKA 2GTDA 1V4SA 2ASMA 3BEXA 5LY3A 1X3MA 2W40A 5F1XA 1K8KB 2HF3A 5AQLA 1SQKA 4IO8A 3DXKB 4WQ4A 1ESVA 4EIAA 1YXQA 4BRGA 3HI0A 5AQRA 3FZKA 4JNEA 3FZMA 3WXJA 2P9KB 5EY4A 1BU6O 3VEYA 3IMXA 4F9OA 2EWSA 2WUSA 2V7ZA 3HM8A 3HSCA 4H03B 3WXIA 2F9TA 3WEEA 1RDWX 1NBWA 3SLCA 3MDQA 1J6ZA 4BG8A 1XQSC 3BF1A 2P9NA 2Q0UA 3SMPA 4BVOA 3D7EO 3ZX0A 1WUAA 2YJEA 1BO5O 4BREA 3VPZA 2QM1A 3MMVA 1QHAA 3LDQA 2QWMA 1GLLO 1TUYA 4PL8A 1EQYA 3FZFA 3O1BA 4HTLA 5I9EB 5BR9A 2QWRA 2UYTA 2QWOA 4K43A 2YHXA 1RFQA 3A5LC 3D2EA 3R6MA 4CJ7A 1NGFA 4B9QA 3A0IX 3SJHA 4FWOA 1BG3A 4DHYA 4BC2A 2GEMA 5AQOA 3CJAA 2E2PA 1IJJA 3KHYA 4B1VA 4JD2A 4K41A 2P9UA 1BUPA 2E2QA 1NGIA 3F9MA 4NO7A 2ZGYA 2YHWA 1K8KA 1ATRA 2P9PA 3AARA 1Y64A 2FSNA 2NZTA 2DPNA 4FPBA 1BA1A 4BRMA 4BR7A 2VYPA 4O8KA 5EOYA 5JMVA 3ZX3A 3EKUA 2ZWHA 2H3GX 2Q0RA 4K42A 3ULEA 5BREA 4H0OA 3O1WA 3ZX2A 4EHUA 5TKYA 1TUUA 2FSKA 2CGKA 4B1UB 3CJ1A 3CJ7A 2P9IB 2IVPA 4H0PA 4M7XA 5KPRA 2CGLA 1YUWA 3D2FB 3H1VX 4A62A 3VGMA 4B1XB 4FSVA 3S41A 2IVOA 4BRLA 5EXWA 3P4IA 3U9ZA 3ENHA 1TYQB 3WUHA 3LL3A 1BOTO 4H5VA 4KBOA 4GY2B 5AQHA 3W0LA 1LCUA 1MWMA 3A5NC 4H5WA 4QS7A 4BRQA 5AQVA 3UKUA 4L3QA 2YHYA 5EX5A 3CJ9A 5FPNA 3ATUA 3LDLA 4H0TB 1NGAA 3QB0A 2QWQA 4CBXA 1NMDA 3M6GA 4MO4A 5AZJA 1BDGA 3MN6A 4JAXA 3LM2A 3MK6A 3SMSA 3H45C 3GOIA 3MCPA 3BP8A 3M3ZA 4FWLA 1YAGA 3L4IA 5KQDA 4IJNA 3WXKA 4BR2A 5AQMA 1HX1A 2OANA 1MWKA 2FLOA 3BUZB 4RTFD 2A3ZA 3HTVA 3VEOA 5AQPA 5AFUH 4CZHA 2P9SA 2Q31A 2V51B 3O5BA 4BVPA 1T6DA 4IJAA 4C23A 1HPMA 4BC3A 3A5OC 1HJOA 3ZEUB 4DCHA 2QWLA 3ZETA 5BRFA 3VESA 1QQNA 5KQ8A 4IWVA 3O4WA 1S3XA 1HLUA 3CERA 2E2NA 1GLCG 2Q97A 5AQWA 5BPLA 3GG4A 3TPQA 2HF4A 3C7NA 1U6ZA 4H5NA 3UKRB 4CD1A 1TYQA 2ASPA 5JLFA 5AFUA 2GUPA 1NM1A 5AZIB 4BROA 4BRKA 1HKCA 1QZ5A 4PKHA 4CZGA 5FPEA 2P9LA 5AQFA 3DXMA 2A42A 1H1VA 4EAHD 4QS9A 4FL9A 2A6AA 1KAZA 1GLFO 3J8AA 4BRFA 4CZKA 5LJVA 3FZHA 3TU5A 1HKBA 1OKJA 1JCGA 4I6MA 4CZEA 3WQTA 1ZBSA 1QQMA 4ISGA 4BGAA 2GWJA 4JHDA 1XC3A 4H5TA 5B8HA 2J4RA 1GLJO 2E1YA 5AQGA 1CZAN 1NGCA 4FWMA 4AM6A 3DXKA 4FOIA 4CZJA 3CQYA 5BPNA 3EL2A 3QICA 2GWKA 1V4TA 2IIRA 2ZGZA 4PKGA 4BRDA 5BRDA 3KVGA 1GLAG 3QFUA 2CGJA 2KHOA 4FPAA 2P9KA 4FO0A 5EVZA 4XH4A 3CQXA 4MLHA 1DGKN 1NGGA 1JCFA 1C0FA 1U2VB 2I7PA 3JS6A 3C0BA 4BG9A 3LM9A 4H0XB 4E1JA 5AQIA 4BRPA 1R59O 3CJBA 3VGLA 3WT0A 5AQJA 4H0YB 1NLVA 1ZXOA 4PL7A 1NGDA 1KXPA 4CZIA 4O5FA 3UKRA 4FWSA 4MLEA 1C0GA 1QZ6A 2CH5A 4A2AA 2E1ZA 2YI1A 3IDHA 4ISFA 3I33A 5JICA 3EO3A 3GE1A 3WEEB 2A40A 3H46O 4BRHA 3L6QA 3O8MA 4B1YB 2E88A 4FWPA 2GELA 1GLDG 2P9NB 4RWTA 3VEXA 3EN9A 4XH1A 3AY9A 3CETA 3R9PA 5LJWA 5ELZA 4PKIA 4BRCA 4CZMA 3U8XA 1GLBG 5F2RA 3VEVA 5F0XA 4FOEA 3DJCA 1E4GT 4FWQA 4XH5A 2QWPA 3FFKB 2A5XA 1SAZA 1JCEA 3VF6A 4NB4A 3OHRA 3RSEB 2Q36A 3CIPA 2YJFA 3LDOA 1WOQA 2F9WA 3D2EB 4WQ5A 3VETA 4CZFA 2D1KA 3DWLA 5FPDA 1D4XA 1P8ZA 4BQLA 5AQZA 1SZ2A 4CI6A 5BN9A 4BR0A 4WQ5C 2ITMA 3VENA 2AP1A 1BA0A 4CBUA 5KPTA 4JD2B 3UB5A 2QWNA 3W3DA 3O80A 3IFRA 5AQUA 4AM7A 3A5MC 3WXLA 5BN8A 2FF3B 4IZ9A 1T44A 1XUPO 2NRHA 2E8AA 5E26A 2PAVA 2P9PB 2P9IA 2FF6A 4ISEA 4WYBA 4BRAA 3D2FA 4BR4A 4BQZA 3ID8A 3EKSA 5JLHA 3VF4A 2FSJA 3QFPA 4WQ4C 1DKGD 3FGUA 3G25A 3CJCA 4H0VB 4MO5A 3ULEB 5KPZA 3AAPA 3QBWA 3MN5A 4Y0WA 1NGEA 3BF3A 3EZWA 5E84A 3U9DA 1T6CA 5ADXH 3DAWA 1LOTB 4H5RA 5AQQA 3VEWA 3VEZA 3MN7A 1HUXA 3B8AX 4B1WB 2IVNA 1NGBA 1Q18A 3LDNA 2D0OA 4M7YA 3MN9A 1NGJA 4DQ8A 2E20A 3QDKA 4IXCA 4CD3A 5FPMA 2Q1NA 1NWKA 3FR0A 1Z05A 3UKUB 3RSEA 3CI5A 1IG8A 2YCHA 4A61A 2VWBA 1NGHA 1BWFO 5CE3A 3AAQA 3GDQA 4FWKA 4YDUA 3FLCO 3SK3A 1S22A 4GNIA 4LC9B 5AZJB 4BC4A 3ZEUA 1Z6RA 2V7YA 3I8BA 4YDUC 3U4LA 2D4WA 2ZF5O 4BRIA 1ATNA 3VOVA 1ZC6A 5ADXA 3H3OB 3QMLA 4M63C 4QS8A 2P9SB 3ATVA 1ATSA 4HWIA 2PBDA 3M1FA 4BGBA 2HOEA 5AQTA 3JXUA 3GBTA 3IUCA 2FXUA 3ZETB 3FE1A 1RGIA 4Z94A 5BPMA 2A41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4V19S 2W00A 1I94K 5SWMA 5CYQA 3PLAA 4CIFA 4NCAA 3K58A 3ENOA 2WOMA 4CJWA 4OVLA 5AQYA 4GW6A 4BRNA 3WXMB 1T8EA 3QBXA 4FJJA 3TAGA 3MWPA 1S5JA 3ZSRA 1C0UA 2E2OA 1B92A 1GLEG 5AR0A 2VWJA 5D3GA 1Q8IA 4BC5A 2EHGA 3C6TA 3BZKA 2HVIA 5AQXA 5C25A 1E4FT 2RN2A 1N32K 2HMPA 1RBRA 1RILA 3SYZA 4DR4K 4FJ8A 3ZT4A 3KZBA 3NDKA 3DXMB 1X9SA 5DK5A 2O8CB 1DEJA 3ZSXA 1Z26A 4DF4A 2BUPA 2Q2RA 1KVAA 1IO2A 1QSSA 2G8HA 4J8FA 3NHGA 3CPWM 3CCEN 3KLHA 3MX2A 4M3WA 3ZSOA 3O6WA 4HVJA 4IDHA 2OPPA 2NUBA 2KKZA 1KAYA 1YVNA 4WF9L 5AQKA 5LY3A 3CCSN 3HPHA 2HVHA 4IO8A 3DXKB 1C1BA 3PIPL 2JWKA 4WQ4A 2PY5A 3J7YP 2OPRA 4B3RK 5AQRA 1LWCA 3FZKA 4JKBA 4KB1A 3FZMA 1RT7A 4A59A 3CF5L 1ILYA 2X74A 2WUSA 3HSCA 3VQAA 3THWA 2PZSA 2PFUA 3WXIA 4DTJA 2F9TA 2BGGA 1OVQA 3PSIA 3SLCA 5C0YA 3OS0A 3MDQA 1J6ZA 4BG8A 4RW6A 5GAGP 1RDCA 4CW7B 1D5AA 1R0AA 3QIPA 1TKDA 2YJEA 1I3AA 2QWMA 1GOCA 3BY5A 5C24A 2O8EA 4LSLA 5I9EB 4IFVA 3TAQA 1TK0A 4DMNA 2UYTA 4KAZA 4B9UA 4K43A 1BCMA 3A5LC 3CM5A 4CFCA 1RDAA 1BHLA 2QXFA 4CJ7A 3K5NA 3SUNA 3CFOA 1S6QA 2OTLN 1RTDA 4BWJA 1NGFA 3N4PA 2O8DB 3SJHA 1BG3A 2GEMA 1L5UA 2X6NA 4CJUA 4CEAA 3MWTA 3AGKA 4JD2A 3F9KA 4IOAL 1RBUA 1HNVA 1ZBIA 3V1RA 4OX9K 3ZT2A 2YHWA 4DLEA 3V1OA 3AARA 3AGRA 1UWBA 1VQ6N 2NZTA 2VWKA 4FPBA 3O9UA 3I56N 3EYZA 3L2WA 3HPOA 1WSGA 2VYPA 2YHAA 4O8KA 2HBMA 5EOYA 1RTIA 3EKUA 4FVMA 3OYFA 5CR4A 5C2DA 4EHUA 4DSFA 3E66A 5A2QO 1VSLA 1YJ9N 3ID6A 4H0PA 4M7XA 5KPRA 2CGLA 1YUWA 2UXCK 3QERA 1I39A 3H1VX 3VGMA 3S41A 1HYSA 3IS9A 3P4IA 1Z25A 3N4QA 1TYQB 3WUHA 5C15A 3LL3A 5AQHA 4O0IA 1JJ2M 1LCUA 4H5WA 4E7JA 4AHRA 1T7PA 5CZ1A 3O3GA 1XNRK 1QVFM 5EX5A 4JK9A 1U4BA 4DV5K 3CJ9A 4H0TB 4PQUA 2ITGA 4RW4A 1VQKN 4CK2A 4QOZB 1BDGA 4JAXA 3MK6A 4JV5K 3M3ZA 3VQ7A 1K73O 1YAGA 3L4IA 2A1SA 1CLQA 2X6SA 4IJNA 3OYKA 5AQMA 3OYDA 3VQ6A 2OANA 4CGGA 4C8LA 2DFEA 2NRWA 2P9SA 1VQ4N 3O5BA 4IEIA 1HPMA 3M5RA 4BC3A 4DR1K 4MFBA 2HHUA 2QWLA 4NCGA 3THVA 1QQNA 2OTJN 3HYFA 5M1FA 1C0TA 4WE1A 4H8KA 4XIUA 3S3OA 4JS4A 2E2NA 3SUOA 5AQWA 3CCJN 3HPGA 1G15A 2G8IA 2B4JA 3CPEA 3GG4A 5KGXA 2ETJA 4KPYA 3HOSA 3SV3A 4OJRA 4DSJA 1GOAA 4DFPA 4DV3K 2GUPA 5AZIB 3ASMA 5E41A 4DV0K 3KJVA 3S9HA 3HXMA 1HKCA 1SL2A 4CZGA 5KI6A 3LPUA 5AQFA 5J2QA 3DXMA 2O8CA 2YNIA 4X66K 4IKFA 1HRHA 3U6FA 4EAHD 4A5AA 2A6AA 1KAZA 4CZKA 5J2PA 4DS5A 3TU5A 3MEGA 2KLAA 2HNDA 3DRSA 4BGAA 1TK5A 2GWJA 3VA0A 4H5TA 4CJ4A 4IOXA 4FYDA 4FWMA 1HNXK 3DXKA 4Y1CA 5BPNA 2IIRA 2QK9A 4PKGA 1N8RO 2XY7A 2KHOA 4XH4A 1NGGA 2HHHK 1U2VB 3JS6A 3C0BA 4E1JA 4IDKA 1U49A 4NLCA 2HHWA 1JLBA 3EEQA 2GX9A 4CZIA 4E0DA 1N33K 1C0GA 2CH5A 4LF8K 1VQ8N 2E1ZA 2YI1A 5JICA 3I33A 4DR3K 2HHVA 3H46O 4BRHA 2E88A 2GELA 1GLDG 3SQ0A 4RWTA 3VEXA 4JKFA 3EN9A 4XH1A 3AY9A 1LAVA 4JKHA 4W5TA 5F2RA 2HNZA 4JKGB 4FOEA 5C2FA 3DJCA 1E4GT 3OYBA 3FFKB 4JI7K 4NB4A 5KRTA 1KC8O 1NOZA 1VQ5N 4CEOA 3D2EB 4W5QA 4CZFA 4DTRA 1OH6A 1D4XA 3C6UA 4WFBL 5BN9A 3VQ8A 4FLWA 4CBUA 5KPTA 2E4LA 1K9MO 1IBLK 3UB5A 4F4KA 3K5LA 4YOUA 3IFRA 3QO9A 4JK8A 1KLMA 2NRHA 1XUPO 2FC0A 5E26A 1UAXA 4DU1A 4QAGA 4GMJB 3SAHA 2F8TA 2XHBA 3EKSA 4YOYA 4E7HA 4BE7B 2OZSA 4CHOA 1SKWA 1XMOK 4HCBA 3G25A 4H0VB 4MO5A 4N5SA 4DSEA 2O8BB 3T1YK 3EZWA 4FLTA 2YX6A 1RDDA 2Z1HA 3AV9A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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