4H0VB

Crystal structure of nad+-ia(e378s)-actin complex
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
370
structure length
355
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Toxin/structural protein
source organism Clostridium perfringens
publication title Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iota toxin component Ia
total genus 124
structure length 355
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h0vB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h0vB03
4FWLA 3MN7A 4DCHA 2A6AA 2FF3B 1GLJO 5KPZA 5JICA 3HI0A 4FPAA 4JNEA 4H0XB 3FZFA 4ISGA 2KHOA 3O1BA 1QQNA 3MN9A 3VENA 3MMVA 3A5MC 3VEYA 2QWNA 2ASOA 4BRQA 3WT0A 4BRMA 5AQNA 3EZWA 5AQZA 5AZJB 3MN6A 3ZX3A 4CD1A 2E20A 4K41A 3FGUA 2FF6A 3KHYA 4MO5A 4H0OA 4GNIA 4BGBA 2ZGZA 1YUWA 2E2PA 5AQOA 5BN9A 2CGKA 3IUCA 5AQJA 4BROA 2YHWA 4Z94A 2QWQA 2P9LA 3UE5A 5AZIB 4BRFA 4GY2B 1ATSA 1KAXA 1U2VA 1J6ZA 1SAZA 5FPEA 3WXLA 2FSJA 3GL1A 4M7XA 1TYQB 2P9KB 4BR7A 4AM6A 1ATRA 4RTFD 4FWSA 3FZHA 3A8YA 4JD2B 4B9QA 4XH4A 5AQSA 4XEIA 5AQGA 3U8XA 3IMXA 2HOEA 2A5XA 1K8KB 2BUPA 3EL2A 3A0IX 3BP8A 4FWOA 4CBUA 4FWQA 4PKIA 2CGLA 4BR0A 1HPMA 1T6DA 4BC5A 1RFQA 2E2NA 1HX1A 4FWRA 5AQTA 4BVOA 3VGKA 3CQYA 4H0PA 1KXPA 4BRHA 3AARA 5E26A 1ATNA 3QICA 3C7NB 3H6EA 4K25A 2Q0RA 3HSCA 4K43A 2AP1A 1BUPA 3H1QA 2GWKA 1HKBA 4Y0WA 4CZLA 3ULEB 2GUPA 3W0LA 2ZF5O 3FLCO 4AM7A 4CZMA 5AFUH 1LCUA 3I8BA 3O1WA 4BRGA 4BRPA 3FR0A 2F9WA 3ZETB 4O5FA 1GLBG 2FLOA 4H0YB 4BC3A 4CI6A 1NGBA 4BQLA 3GDQA 2D0PA 2E1ZA 3R9PA 3VESA 1MDUB 5AZJA 4HWIA 5JMVA 3IDHA 4BQZA 5FPDA 4BGAA 4BC2A 3RSEB 2NLXA 2IIRA 3DWLA 5EVZA 2E88A 5LJWA 1MA9B 1QZ5A 2GEMA 4H5NA 2P9UB 2VWBA 5AQFA 4JN4A 3O80A 5AR0A 3F9MA 3VGLA 4BRAA 3H1VX 3JS6A 1YAGA 2CGJA 1Q18A 4BRDA 3O8MA 3CIPA 4H03B 5AQVA 5AZIA 3CQXA 2ITMA 3A5LC 3WXJA 1DGKN 1TYQA 1P8ZA 2P9KA 1BOTO 1JCEA 2IVPA 2A42A 3R6MA 2YJFA 3VEOA 1X3NA 5BRFA 3UKUB 4JD2A 4WQ5A 5BRDA 3AAPA 1GLFO 2E1YA 1KAYA 3IFRA 3O6WA 4XH5A 4BVPA 2VYPA 1NGGA 2EWSA 1K8KA 4CZIA 4DB3A 1CZAN 2A41A 3DJCA 4MO4A 5I9EB 2NZTA 1U6ZA 4CZFA 4QS7A 2ZWHA 4RWTA 3BUZB 3TU5A 4M7YA 2QW9A 2IVNA 1BDGA 1HLUA 3FZMA 2P9SB 4EHTA 3D2FB 4FWPA 4JHDB 4B1WB 3C7NA 5AFUA 1NGCA 3QFPA 3ENOA 3CJAA 5F1XA 1E4GT 5JLHA 4CZGA 1XQSC 3CI5A 4K42A 4FWMA 3ZX0A 5E84A 2D1KA 5EY4A 5LY3A 1V4TA 2Q2RA 3ULEA 2QWPA 4BR5A 2HF4A 2GWJA 3VEZA 3SK3A 2ASMA 3ZETA 1QQOA 2D4WA 3QB0A 3DXKA 1NGEA 5AQXA 2A3ZA 4FO0A 4JAXA 4A62A 1GLDG 2CH5A 1BWFO 3LM9A 1NGAA 3SMSA 2E2OA 3LDQA 2GELA 3MN5A 1NBWA 4QS8A 3A5NC 1SQKA 3RSEA 5CE3A 4B1XB 4I6MB 4BRNA 5AQIA 3VF4A 5B8HA 2D0OA 2P9UA 1Y64A 3H3NO 1HKGA 3M3ZA 4H5RA 3UKRA 3VF6A 2QWMA 1DEJA 1R59O 1YXQA 5KQDA 2YHXA 2ASPA 4IWVA 2I7PA 4EIAA 2YI1A 5ADXA 2UYTA 2W41A 4MLEA 1NGJA 2P9NB 1BO5O 4EFHA 3ENHA 1X3MA 4B1YB 1NGDA 2QWOA 4BC4A 4CZEA 5FPMA 4BRLA 2PAVA 3GG4A 1XC3A 3DAWA 4H5TA 3UKUA 1S3XA 3CJ7A 5AQYA 4WQ5C 3ATUA 1GLEG 1BG3A 4BR2A 1NMDA 5BREA 5TKYA 3EKSA 4IZ9A 5BPNA 2HF3A 3H46O 1OKJA 1NM1A 5LJVA 3EO3A 3U9ZA 4FL9A 2OANA 3VERA 4CBXA 3SLCA 1QHAA 2P9LB 1HKCA 2QM1A 3JXUA 5F0XA 4M63C 1QQMA 4H5VA 3M1FA 3MDQA 3VPZA 5ELZA 2PBDA 3LDNA 2P9SA 2FXUA 1BU6O 4PKHA 3D2FA 4JHDA 3J8AA 3BF3A 1X9JA 1XUPO 3I33A 4C23A 1V4SA 2P9IB 1Z6RA 2YHYA 2FSKA 3GE1A 1RGIA 1NLVA 2QWRA 1ZC6A 3L0QA 3EKUA 3D2EB 3TPQA 3LL3A 4NO7A 3FZLA 4H0TB 3VEVA 3FFKB 1QZ6A 1ZBSA 4BR4A 3WXKA 4IJNA 3U9DA 2Q0UA 1NGIA 1C0FA 1G99A 2V7ZA 3DXMB 3O08A 4YDUA 3VGMA 5ADXH 2DPNA 3R8EA 4E1JA 5BN8A 4CJ7A 5AQLA 4CZHA 1HUXA 3QBXA 1GLLO 4BRIA 3CHWA 3HBTA 3L4IA 1ESVA 4I6MA 4WQ4A 1D4XA 4CBWA 4F9OA 2QXLA 1NGFA 3FE1A 4IJAA 3SMPA 3QFUA 1E4FT 2H3GX 5AQUA 1WUAA 3WEEB 3O4WA 3BF1A 2P9PB 3EN9A 3SJHA 1GLCG 1WOQA 3ZX2A 3AY9A 3LDPA 2FSNA 5AQQA 3WXIA 2F9TA 1GLAG 1IG8A 3WUHA 4BR9A 2CH6A 2P9NA 3LDOA 4BG8A 5AQMA 3KZBA 3C0BA 4NB4A 2E8AA 3GOIA 3H45C 3ZEUB 1EQYA 2HMPA 2Q31A 1H1VA 4BREA 5AQWA 3FZKA 4KBOA 4FWKA 4BRCA 4RCHA 1YVNA 4HTLA 5EX5A 1T44A 5BPMA 5KPTA 2VCPA 3M6GA 3CJCA 3HZ6A 3QDKA 3QMLA 2V7YA 3CJBA 2V51B 2Q1NA 4PL7A 1JCGA 3VEXA 1MWMA 2NRHA 5FPNA 1MWKA 3AAQA 2YCHA 3GBTA 4DHYA 3LDLA 3S41A 4LC9B 5AQRA 2W40A 5AQHA 1BA0A 2E2QA 2P9IA 4A2AA 4B1UB 1LOTB 2GTDA 4XH1A 3P4IA 3D2EA 3KVGA 3B8AX 1TUYA 5F2RA 5BPLA 3L6QA 5AQPA 4O8KA 3G25A 1SZ2A 4J8FA 3UB5A 4PKGA 4IO8A 3DXMA 3ATVA 4IXCA 3MCPA 3CERA 3O5BA 4FPBA 4EHUA 4YDUC 2J4RA 4B1ZA 2I7NA 4DQ8A 4H5WA 4A61A 2WUSA 3VEWA 1T6CA 5AQKA 3ID8A 3LM2A 1TUUA 4CD3A 2ZGYA 4BRKA 3MK6A 3D7EO 1IJJA 5JLFA 4WQ4C 4FOIA 4ISEA 1HJOA 3WEEA 4FSVA 2P9PA 1JCFA 1U2VB 3OHRA 5EXWA 5BR9A 1Z05A 1BA1A 5KQ8A 1ZXOA 4EAHD 3DXKB 4MLHA 3WQTA 4BG9A 1DKGD 3CJ9A 1NWKA 2QWLA 3HTVA 4FWNA 3ZEUA 3VOVA 5KPRA 3VETA 4QS9A 4A2BA 4ISFA 1KAZA 5EOYA 3HM8A 3H3OB 4H0VB 5BRHA 3UKRB 2BTFA 2V52B 3WQUA 2YJEA 3CJ1A 4FOEA 3BEXA 3QBWA 4WYBA 1NGHA 3A5OC 3U4LA 2IVOA 3CETA 4CZKA 2Q97A 3VF2A 4B1VA 2Q36A 1C0GA 2A40A 4CZJA 3W3DA 1RDWX 2AA4A 4L3QA 1S22A 4PL8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5M1PA 4KFBA 4FLTA 3L2UA 3AGRA 4KI4A 1GLJO 4W5TA 2XY7A 5GIOA 1NK8A 3HI0A 3THXB 4JNEA 4IOXA 3CC4N 3MN9A 1W7AA 4DTNA 3A5MC 1HJRA 2IDOA 1ZBHA 3QNNA 3SUQA 5AQZA 2G8KA 2OPSA 3K2PA 1B9DA 3ZX3A 2XHBA 2IOCA 4CGJA 5C25A 1VQPN 4KO0A 4H0OA 4YOVA 4BGBA 3QLHA 1EETA 1RCHA 3IUCA 5AQJA 2P9LA 2QTDA 3UE5A 2P5OA 3SI6A 1KAXA 5FPEA 3M8SA 5C10A 1TYQB 4KHQA 4BR7A 4UQGA 3NVKA 3SBGA 4AHSA 2F8TA 1GOCA 4XH4A 5AQSA 5AQGA 1LWCA 3U8XA 3UIQA 2BUPA 3V6DA 2YKNA 4FWOA 3J81O 3KKSA 1TK0A 2D0AA 1HPMA 5DMRA 4DSKA 4EZ6A 4E7LA 1J54A 1HX1A 3DLKA 4FWRA 4YOUA 4OLAA 2VGNA 4BVOA 1ZBLA 1TK8A 1N32K 3CQYA 4DSEA 2EHGA 4BRHA 5GADP 1ATNA 3K5LA 3C7NB 3MEGA 4DFPA 5GINA 4HHTA 3OYIA 3VTIA 5HRRA 1BUPA 3H1QA 1HKBA 3OW2M 3ALYA 3ULEB 2ZF5O 4AM7A 4CZMA 4ELTA 3O1WA 2F4VK 3FR0A 1D9FA 4BECA 1DTQA 3ZETB 3ZSQA 4BC3A 4BQLA 1VSJA 2D0PA 5M1FA 2E1ZA 3CQ8A 1EP4A 3T3FA 2AJQA 1VSDA 3OYEA 3DRRA 5AZJA 4HWIA 4CJFA 4CJ4A 1QHTA 1HNVA 3P83D 3OYMA 4BGAA 4KHNA 2P9UB 3BY5A 4RW4A 5AQFA 2XY6A 4AQYK 3O80A 3VGLA 4GVMA 4CF9A 3JS6A 1OH8A 2CGJA 4CF8A 2IS3A 1WN7A 2F96A 1QVFM 3RMCA 1DTTA 5LL6Z 4DR2K 3A5LC 3WXJA 1P8ZA 2P9KA 4JLHA 4O5BA 2WOMA 1YTAA 3VEOA 1X3NA 3UKUB 4JD2A 4CHYA 4I9QA 3PY8A 1GLFO 3AO5A 3O6WA 3IFRA 5A2QO 4W5QA 4CZIA 3RRHA 3ULDA 3DJCA 3P5JA 4YOYA 3ZT2A 1Y97A 4CZFA 5J2NA 1KD1O 2HHXA 1OVQA 2ZWHA 3LP0A 3DRSA 1RT7A 3WNFA 2QW9A 1IH7A 5CHIA 1VAZA 1VQKN 1RTDA 2P9SB 3AO4A 4JKBA 3D2FB 1QS4A 3KK3A 3L3UA 4FJGA 3CI5A 1QTMA 4K42A 4FWMA 4R5PA 3AVKA 4DUYK 2OZMA 2KKZA 4BR5A 1KRPA 2HF4A 1C0TA 3M8RA 1QSYA 4JI6K 3AVCA 3VQAA 4FJ8A 4IEEA 2GV9A 5AQXA 1NGEA 2NRTA 2A3ZA 3C65A 4DSJA 4CGGA 3QEVA 4RG8A 1OH5A 3LM9A 1NGAA 5C15A 3LZJA 4Q5VA 2O8BA 4WE1A 3AV9A 4I6MB 2KLAA 2UUBK 3TWHA 1UAXA 1Q86O 1NK0A 2YHXA 1VRUA 3U3YA 1RBVA 2ASPA 1VK0A 1NKEA 4EIAA 4DLGA 1N34K 4J2AA 3RWUA 3CPWM 4DV2K 1NU0A 1P90A 3ENHA 1WSIA 1Q9XA 2NRRA 1YTUA 1EWQA 3ASMA 4JRPA 4CEZA 3GG4A 1XC3A 2ITGA 4C1NI 5J2MA 3OYCA 1S3XA 1W2BM 3NE6A 1VHXA 3RR8A 4BR2A 1NMDA 2HNYA 2XY8A 5BREA 2Z1JA 4FZZA 1YI2N 1C0MA 3F5TA 4DTXA 4IZ9A 1VQ8N 4M3ZA 5BR8K 1XMOK 3EO3A 1DLOA 4GKKK 3VERA 2OANA 3SLCA 4M63C 4EP4A 1CLQA 2Z1IA 1QQMA 4NYFA 1U47A 3ZCMA 4DR1K 2E6LA 4FYDA 1BU6O 3SCXA 4WCEL 3J8AA 3R3LA 1X9JA 2OZSA 2YNFA 4F2RA 1QSLA 4BACA 4C23A 4PQUA 1VSIA 1V4SA 3QEXA 5EU7A 1RGIA 1NLVA 1ZC6A 3OS0A 4GKJK 3EKUA 4H0TB 3FFKB 4LF4K 1QZ6A 1ZBSA 4IJNA 3KLGA 2Q0UA 1KTQA 4WFBL 3JSMA 3DXMB 5C0YA 5ADXH 4IEIA 5FDLA 2HVIA 4E7JA 4H8KA 5BN8A 2HHWA 3PX6A 2OYQA 3TABA 3CCQN 4JI1K 4B9VA 3RR7A 1NMNA 2YNGA 3OYDA 2QXLA 1RBSA 4IJAA 2X74A 2D0BA 3THYA 5J2QA 1E4FT 2H3GX 4ELVA 3O4QA 4B8CA 3BF1A 4B9NA 3QIOA 4HCBA 4BR9A 1GOAA 3LDOA 1HQEA 3EZ5A 2WTUA 3GOIA 1LAVA 2NRWA 4KV8A 3ID6A 4C1NK 3EEQA 1WSEA 4RCHA 1YVNA 4OGEA 3OYJA 4DTMA 3L2WA 3DLLL 4KHUA 4CHOA 3KLHA 2V7YA 1KFSA 1JCGA 1UA1A 4CK1A 4LSLA 3F9KA 4B9UA 3AAQA 1LW0A 3WNHA 1YF5L 3CFPA 4A57A 1RT4A 4LC9B 2BH1A 4JS5A 2GTDA 4CECA 2R7YA 1WSFA 3D2EA 3KVGA 3B8AX 4LF8K 3KLFA 5BPLA 4U7BA 3L6QA 5AQPA 3G25A 4JI4K 1TAUA 4J8FA 4PKGA 4OPHA 4IXCA 4FPBA 3ZSVA 4EHUA 4DQ8A 2HHHK 2G8FA 2WUSA 4DS4A 1NOZA 1T6CA 2X78A 2PZSA 3ID8A 1TUUA 4CD3A 3G6EN 1BCOA 1ASUA 3KWGA 3AVNA 5JLFA 5KGWA 1QSSA 4ISEA 1HJOA 4FLZA 3OYKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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