4H1OA

Crystal structure of the tyrosine phosphatase shp-2 with d61g mutation
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
531
structure length
496
Chain Sequence
b'TSRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGGYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTSNDGKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKQGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDSDYINANIIMPEFKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
publication title Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with D61G mutation
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 148
structure length 496
sequence length 531
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2012-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4h1oA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4h1oA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4h1oA03
4GFUA 1OETA 5CDWA 1LKLA 4FBNA 4QAPA 2EKXA 1O43A 2VEVA 2VEUA 3CXLA 1PXHA 4QBEA 4JGHA 3EAXA 3EB1A 1FBVA 4NNDA 2I6OA 2CI8A 3F9AA 4BJOA 1B47A 2DX0A 3CM3A 3OP0A 1JWOA 3BKBA 1BM2A 3OLRA 2DM0A 3QCEA 4HRFA 2HNQA 2SRCA 4M4ZA 4QUNA 1O4IA 3BM8A 4I8NA 2H4VA 1A1BA 1AYAA 2H46E 1OEOX 3D44A 2XP1A 1U25A 1O47A 2BZLA 1A07A 1NZLA 1RJAA 3T04A 2Y1MA 2H5KA 2IUIA 2BIJA 4ZN5A 2VEXA 1ZZWA 2DLZA 1I9SA 2P6XA 4WTYA 2HB1A 3ZM3A 1QXKA 1PTYA 1NO6A 4GFVA 3M4UA 3QCFA 2HCMA 3A5KA 3EAZA 3EU0A 1R1QA 4H1OA 4OHEA 1A1CA 3O4SA 1ZFPE 1G4WR 1WRMA 2B4OA 1GFYA 4KYQA 5KA3A 5LXQB 1LUKA 5GJIA 4NWFA 1UUSA 2FCIA 3HIZB 2HY3A 4ERCA 1L8KA 1O4MA 4GRYA 1EEOA 2CNGA 2VEYA 1JF7A 1O4DA 2I42A 3GQIB 2CM2A 1BZJA 2CS0A 3QKPA 4YAAA 3U96A 4GL9E 4JBCA 1OPLA 5BZZA 2BBUA 1X24A 1OO4A 4E68A 2FH7A 2AZRA 1NNYA 2EOBA 1PA1A 2PT0A 3MXYA 4F5AA 1Z3KA 2HDVA 1G1FA 3S3HA 2HDXA 4EY0A 1ECVA 1KSWA 1R6HA 2EYYA 2VIFA 3QWXX 3B7OA 4RHGA 2ESBA 4FL2A 2RORA 5GJHA 3BUMB 1G1HA 1OHDA 3A5JA 4LUDA 2I4HA 1I57A 3ZM1A 1PTVA 1YPTA 2A3KA 2JJDA 1A81A 3AWFA 1RQQC 2L4KA 5D0JA 4J51A 1XA6A 2CM8A 3QCKA 3QCMA 1XM2A 4XZ0A 3H2XA 1IJRA 1O4EA 1ONZA 2PQ5A 2CR4A 4RKKA 2P4DA 2QEPA 1Q6NA 4X6SA 1V3AA 1O48A 3US4A 1QG1E 1CWEA 1LUIA 1KAKA 2EO6A 5K9WA 1KA6A 5EG3B 1O4FA 3VRQA 2MQIA 1XXPA 1OPKA 5IBMA 4QSYA 1JYRA 2B4PA 1BFJA 3WA4A 1AB2A 5AWXA 1YZ4A 1RXDA 1G7FA 2L6KA 2H03A 1SPRA 4GPLB 1O4LA 4K11A 4HJPA 2CIAA 3OV1A 3V0GA 2MBCA 1F1WA 1PA9A 2GWOA 1NWLA 2NT2A 3BLUA 3RZ2A 1JU5A 2RSYA 3PQZA 5EHRA 1LUNA 3UF4A 3VS7A 1WQUA 2ZMMA 1O4HA 5HDEA 5K22A 1KA7A 2OZOA 3PS5A 4K44A 1YN9A 2ABLA 4TVVA 4BPCA 2CMAA 2EU0A 3GXWA 2Q05A 3VGOA 1PTTA 2QBPA 1SKJA 2BGDA 1A09A 1BG1A 1YVLA 2J16B 1R1SA 3MOWA 3ZNIA 3S3EA 3S8LA 5KA8A 2IZVA 2B4SA 1O4GA 3VS6A 2CMBA 4IKCA 1D1ZA 1F2FA 1X0NA 5DC9A 3VROA 2HNPA 2LNXA 1BKMA 1YWFA 3HHMB 1YVHA 1C84A 5AXIA 2DVJA 4GS0A 2QBRA 1UURA 1FQ1A 2NZ6A 1D5RA 1CSZA 3VS1A 3EACA 2VEWA 5KA9A 3V0DA 2FO0A 4YR8B 3LJ8A 4WWQA 2H4KA 3QCNA 2F6TA 3AWEA 1BKLA 2PLDA 2HCKA 2SHPA 1A1EA 1LCKA 4K2RA 3I36A 1D4TA 2I6PA 5J8RA 2EYVA 1D4WA 5K25A 2GE9A 4D3PA 2CRHA 1SHAA 4GWFA 2F70A 1C83A 2J16A 2PI7A 3QCGA 1CJ1A 3D1OA 3F41A 4TZIA 3VS2A 4K45A 1O42A 2AOAA 3QKQA 3QCDA 1Q6SA 2HMHA 3BUOB 3GXHA 4RH5A 2MC1A 3CWGA 3MOZA 1TCEA 2QCTA 2J17A 1I3ZA 2C46A 4D8KA 1J4XA 3V0JA 2CM3A 1C88A 5K24A 5KAAA 5DC0B 1LARA 2G6ZA 1BLKA 5KA7A 2CFVA 4DGXA 3PFVA 1YTSA 5J3XA 1HCTB 4XZ1A 4QUMA 4NWGA 1XXVA 1BF5A 4E93A 2I1YA 4Y2EA 3BUNB 3EZZA 1BHHA 2ECDA 1NZ7A 1G4US 4AZ1A 1BFIA 1JLNA 2F6WA 3IMDA 3O5XA 4ROJA 2CNFA 1M61A 4WU2A 2JYQA 3VRPA 1G7GA 1O4KA 1P15A 5K9VA 3VS0A 2C9WA 3CD3A 2MRKA 4F5BA 1ONYA 3ZM2A 2CM7A 3M7FA 1U24A 5KA2A 2PBNA 3MXCA 3O4TA 1NWEA 2WGPA 5BZXA 4RDDA 3S9KA 2I6MA 1ZCKA 3S8OA 3VS4A 4U1PA 3PSKA 3O4UA 1O4QA 3I7ZA 4NYHA 2LCTA 4F59A 3F81A 2FJNA 2I5XA 4PYHA 1RPMA 4KI9A 2GJTA 3S4OA 4GE5A 1A08A 4R30A 3KFJA 1G1GA 4ICZA 1GHUA 1I9TA 1O45A 2K7AB 1BMBA 1ZC0A 5GTJA 5BX1A 2Q47A 1O4RA 2GSBA 1OEMX 2IUGA 3QCBA 2K79B 4JMKA 1FU5A 4WU3A 2MRJA 2OZ5A 2ETZA 2CBLA 5KABA 1PTUA 3UYOA 2H04A 4L1BB 2C0IA 1U26A 3D42A 4D3RA 1O4NA 3IN8A 3QCCA 1RPYA 4D3QA 1A1AA 2PLEA 4ZI4A 5MMZB 1O49A 1TZEE 2I6IA 2AHSA 1OESA 4RI5A 2BGEA 4WOHA 3VRRA 1LYVA 1EENA 2CNEA 1BZCA 1SUGA 2IMGA 3F9BA 1Y1UA 3QCHA 4FL3A 2I75A 2HC1A 3V0FA 3VRZA 2A8BA 2IUHA 3QCJA 1O4BA 4OHIA 1O44A 2CMCA 4PVGA 2B3OA 1FMKA 1FU6A 2Y96A 2F6YA 2OUDA 1O41A 1C86A 3D1QA 2RF6A 4QBWA 1CWDL 2L3TA 2I4GA 3IN7A 2LNWA 1WCHA 1OEUA 3SMEA 3QWYA 5HKYA 4QAHA 4B04A 1T4JA 1AD5A 4OHDA 2YDUA 1Y57A 3MMJA 2HXPA 2KK6A 3F99A 2HUWA 1YFOA 2E0TA 2OC3A 3O3LA 3S3KA 1YTNA 3QCLA 3TL0A 1L8GA 1O4PA 2QDCA 3VRYA 3PSJA 2CI9A 1AAXA 2Y1NA 1AOUF 3NHNA 2QCJA 2Y3AB 1BHHB 3K2MA 4Y14A 3V0HA 1PH0A 2ZN7A 2B49A 2OQ1A 3BUXB 3VS3A 3V0IA 1T49A 2Y2FA 1JYUA 1P13A 1Q6JA 1XBOA 4ZRTA 1LQFA 2C0OA 4EIHA 2DLYA 4LUEA 1T48A 1BZHA 3S3FA 3BUWB 2KNOA 4JNBA 4A4BA 2QBQA 1Q6TA 1M27A 2F6VA 2QDPA 3PJPA 3I80A 1YGRA 2QBSA 1PICA 2I3UA 2R0BA 2LQNA 4R0TA 4NX8A 1H9OA 1C85A 2H8HA 2QMSA 3V0EA 5HKZA 5BO4A 1BHFA 5KA1A 1LKKA 2PNBA 2H4GA 2PSZA 1AOTF 2C7SA 1O46A 2GP0A 3VS5A 5KA0A 2CNIA 1AYBA 1GWZA 1NZVA 2PTKA 1O4AA 4MBBA 3D1HA 1MW4A 1GRIA 2C0TA 4OHLA 1QADA 4GRZA 3PLFB 2EYZA 1PYNA 4HJQA 2F6ZA 4S0GA 3S8NA 1OO3A 5AULA 1K9AA 5EELA 2BV5A 2B07A 2F46A 2HC2A 2PNAA 3SR9A 1BLJA 2DCRA 5EHPA 1ZCLA 1KAVA 3N8MA 2MK2A 5K23A 1MILA 2F6FA 4JE4A 1QZ0A 4P9ZA 1JYQA 2YSXA 1SPSA 2LQWA 4OHHA 1SHBA 2B4UA 2FJMA 5KADA 5KA4A 1FBZA 4GE6A 1Q6MA 1O4JA 5HKWA 5I6VA 4U17A 1Q6PA 2M3VA 3CWEA 5DF6A 1LUMA 2AUGA 4RH9A 3C7IA 3BRHA 3GXGA 1SHDA 1FPZA 4A4CA 3OMHA 1OHEA 2NTAA 3N84A 3RGQA 1OHCA 1QCFA 2H02A 1OEVA 2QDMA 3ZMQA 2OOQA 4GE2A 5M43A 5KAZA 2NLKA 1FPRA 2I4EA 4JMJA 4R0SA 3IMJA 1YTWA 2DXPA 5KACA 1A5YA 2RVFA 4Z6BA 5DC4A 1G83A 1Q1MA 2G59A 2CJZA 3ZM0A 4JEGA 3N0AA 3OVEA 3TKZA 1CSYA 2NV5A 1WAXA 1HCSB 5BUGA 2F71A 1IS0A 2I6JA 2EO3A 2NT7A 1YGUA 1O4OA 3EMUA 1C87A 3GXXA 3VRNA 2HVLA 1NRVA 3NMEA 4P9VA 3RGOA 3AWGA 4RI4A 2CNHA 1MKPA 3QCIA 1AYCA 2RMXA 1FYRA 4KYRA 2EL8A 4DGPA 1KC2A 3S4EA 5EEQA 3ZMPA 2PA5A 2YU7A 1NL9A 3BLTA 5IBSA 3ZV2A 1X27A 3CBLA 3HCKA 4H34A 2AOBA 2I3RA 3OB1B 1R1PA 3RO1A 1XRIA 1AYDA 1VHRA 3D9CA 1O4CA 3N7YA 1FHSA 1LCJA 3MAZA 1M3GA 1X6CA 3OB2B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GFUA 1OETA 5CDWA 1LKLA 4FBNA 4QAPA 2EKXA 1O43A 2VEVA 2VEUA 3CXLA 1PXHA 4QBEA 4JGHA 3EAXA 2GCBA 1FBVA 3EB1A 4NNDA 2I6OA 2CI8A 3F9AA 4BJOA 1B47A 2DX0A 3CM3A 3OP0A 1JWOA 3BKBA 1BM2A 3OLRA 2DM0A 3QCEA 4HRFA 2HNQA 2SRCA 4M4ZA 4QUNA 1O4IA 1E8CA 3BM8A 4I8NA 2H4VA 1P3DA 1A1BA 1AYAA 2H46E 1OEOX 2WJPA 3D44A 2XP1A 1U25A 1P31A 1O47A 2BZLA 1A07A 1NZLA 3QCZA 1RJAA 3T04A 2Y1MA 2H5KA 2IUIA 2BIJA 4ZN5A 2VEXA 1ZZWA 2DLZA 1I9SA 2P6XA 4WTYA 2HB1A 2Y66A 1FGSA 3ZM3A 1QXKA 1PTYA 1NO6A 4GFVA 3M4UA 3QCFA 2HCMA 3A5KA 3EAZA 3EU0A 1R1QA 3HN7A 4H1OA 4OHEA 1A1CA 3O4SA 1ZFPE 1G4WR 1WRMA 2B4OA 4BUBA 2GC5A 1GFYA 4KYQA 5KA3A 5LXQB 1LUKA 5GJIA 4NWFA 3MVNA 1UUSA 2FCIA 3HIZB 2HY3A 4ERCA 1L8KA 1O4MA 4GRYA 1EEOA 2CNGA 2VEYA 1JF7A 1O4DA 2I42A 3GQIB 2CM2A 1BZJA 2CS0A 3QKPA 4YAAA 3U96A 4GL9E 4JBCA 1OPLA 5BZZA 2BBUA 1X24A 1OO4A 4E68A 2FH7A 2AZRA 2UUPA 1NNYA 2EOBA 1PA1A 2PT0A 3MXYA 4F5AA 1Z3KA 2HDVA 1G1FA 3S3HA 2HDXA 4EY0A 1ECVA 1KSWA 1R6HA 2UUOA 2EYYA 2VIFA 3QWXX 3B7OA 4RHGA 2ESBA 3ZM5A 4FL2A 2RORA 5GJHA 3BUMB 1G1HA 1OHDA 3A5JA 4LUDA 2I4HA 1I57A 3ZM1A 1PTVA 1YPTA 2A3KA 2JJDA 1A81A 3AWFA 1RQQC 2L4KA 5D0JA 4J51A 1XA6A 2CM8A 3QCKA 3QCMA 1XM2A 4XZ0A 3H2XA 1IJRA 1O4EA 1ONZA 2PQ5A 2CR4A 4RKKA 2P4DA 2QEPA 1Q6NA 4X6SA 1V3AA 1O48A 3US4A 1QG1E 1CWEA 1LUIA 4CVLA 1KAKA 2EO6A 5K9WA 1KA6A 5EG3B 1O4FA 3VRQA 2MQIA 1XXPA 1OPKA 5IBMA 4QSYA 1JYRA 2B4PA 1BFJA 3WA4A 1GQQA 1AB2A 5AWXA 1YZ4A 3PYZA 1RXDA 1G7FA 2L6KA 2H03A 1SPRA 4GPLB 1O4LA 4K11A 4HJPA 2CIAA 3OV1A 3V0GA 2MBCA 1F1WA 1PA9A 2GWOA 1NWLA 2X5OA 2NT2A 3BLUA 3RZ2A 1JU5A 2RSYA 3PQZA 5EHRA 1LUNA 3UF4A 3VS7A 1WQUA 2ZMMA 1O4HA 2AM2A 5HDEA 1KA7A 2OZOA 5K22A 3PS5A 4K44A 1YN9A 2ABLA 4TVVA 4BPCA 2CMAA 2EU0A 3GXWA 2Q05A 3VGOA 1PTTA 2QBPA 1SKJA 2BGDA 5A5FA 1A09A 1BG1A 1YVLA 3ZL8A 1JBWA 2J16B 1R1SA 3MOWA 3ZNIA 3S3EA 3S8LA 5KA8A 2IZVA 2B4SA 1O4GA 3VS6A 2CMBA 4IKCA 1D1ZA 1JBVA 4UAGA 1F2FA 1X0NA 5DC9A 3VROA 2HNPA 5A5EA 2LNXA 1BKMA 1YWFA 4BUCA 3HHMB 2JFFA 1YVHA 1C84A 5AXIA 2DVJA 4GS0A 1GG4A 2QBRA 1UURA 1FQ1A 2NZ6A 1D5RA 1CSZA 3VS1A 3EACA 2VEWA 5KA9A 3V0DA 2FO0A 4YR8B 3LJ8A 4WWQA 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 1NL9 A;  3BLT A;  5IBS A;  3ZV2 A;  1X27 A;  3CBL A;  3HCK A;  4H34 A;  2AOB A;  2I3R A;  3OB1 B;  1R1P A;  3RO1 A;  1XRI A;  1AYD A;  1VHR A;  3D9C A;  1O4C A;  3N7Y A;  1FHS A;  1LCJ A;  3MAZ A;  1M3G A;  1X6C A;  3OB2 B; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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