4H1XA

Crystal structure of a phosphate abc transporter, phosphate-binding protein (sp_2084) from streptococcus pneumoniae tigr4 at 1.77 a resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
GTIEVISRENGSGTRGAFTEITGILKKDGDKKIDNTAKTAVIQNSTEGVLSAVQGNANAIGYISLGSLTKSVKALEIDGVKASRDTVLDGEYPLQRPFNIVWSSNLSKLGQDFISFIHSKQGQQVVTDNKFIEAKTETTEYTSQHLSGKLSVVGSTSVSSLMEKLAEAYKKENPEVTIDITSNGSSAGITAVKEKTADIGMVSRELTPEEGKSLTHDAIALDGIAVVVNNDNKASQVSMAELADVFSGKLTTWDKIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Phosphate-binding protein pstS 2
publication title Crystal structure of a phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein (SP_2084) from Streptococcus pneumoniae TIGR4 at 1.77 A resolution
rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12849 PBP_like_2 PBP superfamily domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h1xA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h1xA02
2XXQA 2UVIA 4XKRA 4N13A 3IOUA 5KCJB 4NTLA 4QSCA 2NWJA 1A54A 2H98A 4GL8A 3N5LA 3R7XA 3HPIA 2E1SA 4PFYA 1IIWA 4EF2A 3E3KA 3W15C 3ZS6A 1YCJA 4G68C 2ZYOA 1Q1KA 4GL0A 4OTEA 5K2YA 4RPOA 3UP9A 1JNFA 4LZ7A 1D3KA 1L5TA 4U2RA 4G4PA 1MQJA 1N84A 3K00A 1OQHA 1JVXA 1KWHA 3G3GA 2XXRA 5H8QA 3KBRA 3KG2A 1YPNA 2QPQA 5EHMA 1MXZA 3FVNA 3MPKA 2V3UA 2YJPA 1PB8A 4BDNA 3S4UA 3ONMA 4RK2A 3ZSFA 3O97A 2O51A 3TTKA 4U21A 2FNCA 1CE2A 4YB6A 3EN3A 5ELVA 1QKBA 1B3FA 1A8EA 4NEDA 5JTYA 2OJTA 4YICA 4ECFA 2XXYA 1FQBA 3D4GA 1Y4CA 4FATA 3MZBA 5I56B 2DS9A 1M5BA 4JBZA 1B58A 2F7CA 2DVCA 3KJTA 1O64A 5I58A 3EHTA 4PFUA 3IB1A 1B4HA 1USYH 5I2NA 5FTHA 3A3CA 4Q5TA 3PGFA 4RXLA 4QF9A 4TLMB 5TP9B 3V83A 1S7YA 4GD5A 5I57B 1MPBA 3N6UA 5AA2D 3UN6A 1URDA 4RJZA 4G68A 4LZ5A 2R71A 3OO8A 2XXTA 3I6VA 3T9UA 4F31B 5H8FA 4R9GA 2D21A 3CFXA 2Z22A 1OVTA 3N6TA 4PFTA 3TYHA 4NF5A 3P7IA 1B6HA 4I1DA 3O29A 4H5FA 1II5A 1AL3A 1POTA 2REGA 3IOTA 1GV8A 2ONRA 1GTKA 1N7WA 3B6WA 5K2XA 1N3XA 3FJ7A 1MDQA 3SEXA 3IK6B 3SESA 5AA2B 3O2AA 1IXIA 1OMPA 2HZLA 1LAGE 2QS1A 4HCYA 1P1OA 3KOSA 3PPPA 4HCWA 1B4ZA 1PBPA 1FTLA 2IA4A 1IZ1A 1MXYA 4ZEIA 1URSA 3SEUA 2IEEA 2F7BA 1UTBB 1LLSA 1A55A 1PEBA 3RN8A 3BKIB 1AH5A 3GXAA 1TFDA 4G8NA 4C1UA 3PUYE 1B1XA 2Y7RA 4I9DA 1WDNA 4XKPA 2Y84A 4F18A 3IAZA 4KYDA 3Q28A 4BDLA 1MPCA 2ANJA 4HW8A 1PB9A 1WVJA 4JDFA 1XC1A 2ONSA 5FHMA 1B40A 4XXUA 1US5A 3QK6A 3TZAA 3OMBA 2RKMA 4U4SA 2B3BA 4NF8A 2F34A 3RPWA 1XVYA 3PMXA 1EU8A 5DVIA 3TQLA 3S9MC 3IB0A 4I62A 1I6QA 1URGA 2QS4A 1B3EA 3E9XA 3MWBA 4EF1A 2Y7KA 1QUJA 4ZE8A 2H99A 5KCJA 5IAIA 3U8QA 1UIVA 2RCAA 5CBRA 4Q0CA 3VV5A 3RT8A 3H4ZA 3N26A 3JYRA 1LFIA 4DIGA 2F5XA 3UK4A 4F19A 3C4MA 3G3FA 3H6TA 4R6HA 2PX1A 4ELQA 3SEYA 2NOOA 3TTMA 4F29A 1JW5A 3MVWA 3G3JA 1Y3NA 3CRBA 3W9WA 3QUJA 3RY3A 5I59B 1S50A 1VR5A 4QSEA 3MVXA 4GVOA 1LCTA 4QSDA 3CIJA 2PMSA 5JK4A 4R2FA 1EZPA 1JETA 1Y1MA 1FTJA 3KEIA 4M1VA 2I3WA 3CG3A 1BKAA 5I84A 4N07A 2GFEA 1XT8A 3MW0A 3UA8A 4KYEA 1LBBA 4KD5A 1B51A 1NL5A 4GXAA 3E13X 1D9VA 3VDFA 3LC8A 1SYHA 1EH3A 1LFGA 5I56A 4GF8A 4C0RA 5BUUA 2OBGA 1P1QA 3PMWA 1B7ZA 5TPAB 3U93A 4ZEFA 3I3VA 1USYE 4O3BA 1M5EA 1A99A 4YU0A 1MG1A 3IB2A 2QL3A 3GBBA 3FASA 5TP9A 1SW5A 1IXGA 4GXSB 4AB5A 1IUDA 5I57A 2UYEA 5CMBA 4XKQA 3E4RA 3LUYA 4EQBA 1YAEA 1T0KA 1I69A 2PT2A 3KSXA 4XIGQ 2VOZA 4MLVA 4F3PA 1NMUA 3G3KA 3IL1B 1N04A 2ZYKA 1LFHA 4R72A 1NNPA 3RT6B 4NF6B 2XD2A 4HS7A 3LBSA 2ZYMA 4FE8A 2B65A 3CR9A 3DP8A 5AE4A 1FQAA 5AA2A 1ZTYA 1LCFA 2NUVA 4YKKA 1ZKBA 3V8XB 5ICTA 3HSTA 1XOCA 3TTLA 4R9FA 2NXOA 3FVKA 2NVUB 4KYSA 2I4BA 2RCBA 3OELA 1A40A 1MH4A 1Z7NE 3L6HA 1GVCA 5DEXB 2UXAA 3K0VA 3U72A 1UTBA 5H8HA 3PU5A 5A5XB 2A5TB 1FCKA 4QFOA 2ZMBA 2FA7A 2Q9TA 4ZEKA 3VXBA 4NWCA 4OXVA 2P0SA 2I58A 4F1YA 5LOMA 3KGCA 4YAHX 5KZTA 2VGQA 1MQIA 1ZBMA 3VVDA 4NWDA 1Y4TA 4F22A 1MY3A 2XXWA 4H1XA 2Z8DA 1FQFA 4R6YA 3I5OA 3IO6A 1IITA 3TELA 2G29A 1ANFA 3PUWE 1BTJA 2F8DA 3TPAA 4LVQA 1TXFA 2UVGA 1P1NA 3UIFA 1P99A 2XX7A 3EQ1A 5F1QA 2I49A 4IO5A 3BFUA 1MH3A 4PFWA 2Y7PA 5CRYA 3RLFE 3IOWA 4L17A 1GR2A 2CZLA 1OLAA 2RC8A 1IEJA 1NNKA 4F3GA 1MXXA 3QAXA 4OFLA 2O84X 4XTCQ 5HBCA 3TMGA 2XXIA 2QS3A 1R9LA 1DSNA 2XXUA 1XVXA 4POWA 1BLFA 4DCYA 2F97A 1LB9A 5BWJA 4MF3A 2DXYA 4P0GA 2Z8FA 1NFTA 5I59A 3T96B 4FEBA 2UYFA 2ZNTA 3OEMA 3TQWA 3CSGA 3EHSA 4WKMA 5F7VA 1M5FA 3H7MA 3VLUA 3M3FA 4ZS9A 5FHNA 1P1UA 4LUBA 4OERA 4ELRA 4OZ9A 3K6UA 1JQFA 4O3AA 1H76A 1B32A 3B6QA 1NNFA 2DVZA 4Z0IA 3C33A 4ESXA 3VLVA 4ZE9A 3MPLA 4ND9A 4DZ1A 3R26A 2V3TA 1O63A 2O1MA 3CG1A 4OENA 2H25A 1CB6A 3KZGA 2LAOA 1FTOA 3C32A 5TPAA 1LGBC 4QRZA 3PUXE 3IORA 4PP0A 1SW2A 2E0SA 3CFLA 3TFLA 4IY6A 4X1DA 5EHSA 2R9JA 3OSQA 1RYXA 3IR1A 4YKIA 1N7XA 3FIRA 5DVFA 2D3IA 4X48A 4E0XA 3K02A 1D9YA 2I0BA 3C9HA 3IJXB 1SQYA 3IJOB 4H8IA 1GGGA 1DMBA 2GHBA 4N6PA 3F11A 4OHNA 4NF6A 4JWYA 3RTFB 1Y9UA 1DTGA 3FUZA 2HFBA 2O1LA 2XXHA 2F36A 3PD9A 3FV2A 3SKPA 3M3KA 4OFJA 4FEDA 1R6ZA 3IO4A 4LQ2A 3O28A 3K1MA 2Y7IA 2V25A 3M3LA 4R75A 3MVYA 1M5DA 1Y20A 3DLNA 5DEXA 2DXRA 1HSLA 3RUMA 1B3HA 3TTRA 3EPEA 3MQ9A 5A5XA 4U4XA 1BIYA 4IO2A 4LQ5A 3UORA 4WEDA 2A5TA 1PBQA 2BJJX 2DE3A 1TFAA 3UGWA 3GZGA 1EZ9A 4EQ7A 3T66A 1QUKA 3SDFA 1IQ7A 1Y3PA 1H43A 4PETA 4JSDA 2ONKE 3PPNA 5CM6A 4U1ZA 1IXCA 3OSRA 2V3QA 4GQOA 1B7UA 1NH7A 3H6UA 4U22A 3RNNA 1PC3A 1M5CA 1ZMGA 3K01A 1ZLQA 1HSEA 4FORA 4ZEBA 2DSFA 1B2HA 1EZOA 4NE4A 5JEIA 1AMFA 2XX8A 2OWSA 1PB7A 3G3HA 4P0IA 3V5AA 2V84A 3K4UA 2B3FA 4EDPA 2WKYA 2QSXA 1MQHA 3PUZE 4F1UA 3O6IA 4KCCA 5AA3A 2I3VA 4QFNA 3FZVA 2ABHA 3TKDA 4FECA 3SERA 1S9TA 4DDDA 1FQEA 3PD8A 4F2QA 4OWDA 1J1NA 3HCQA 1TWYA 2YPNA 4GWOA 4YB5A 3VE1B 3KJ7A 3T9HB 3OENA 4YKPA 3C36A 3TUSA 5L9MA 5B7DA 1B3GA 4ZECA 5TU0A 4OYVA 2X26A 4AQ4A 3H3GA 3ILUB 4Q8RA 4PQJA 1JVYA 4M4GA 1RKMA 3C31A 1LAFE 1A7LA 4O3CA 1POY1 4IY5A 3TEPA 2OZZA 2D5WA 3JV9A 5ISUA 4LZ8A 2V93A 4JXIA 3OXNA 3RQTA 1H44A 3S9NC 1QKAA 3LSWA 3C35A 3FXRA 3Q29A 1IXHA 4FAJA 5CBSA 2Q2CA 1QW0A 1B5JA 4F2OA 2DE4A 1MXWA 2QMWA 1B5HA 4RNSA 1YTVA 3DP4A 1D4NA 3ILTB 2I4CA 4F1VA 4EXKA 1UTHB 1ZJLA 1RYOA 3DELB 2AL4A 1VFDA 5I2KB 4OETA 2HAVA 2PVUA 1AOVA 5AA4B 1B9JA 1LAXA 1B0LA 2RC9A 2M8CA 4KI0E 1TT1A 4IO7A 5M2VA 1QUIA 1DOTA 4QFPA 3ODBA 3PUVE 2P1SA 1Q35A 4H67A 1B52A 4YKJA 3O9PA 4AB6A 5HM4B 2DP8A 1SI1A 3O6HA 4OVJA 4ISUA 4QHQA 1I6BA 5ITPA 4ZEDA 4OEVA 3QYTA 2VD2A 1B3LA 4XKNA 5J1DA 3VXCA 5DYHA 1SVXB 2DWJA 4DXCA 3KFMA 2QJEA 2RF1A 1PDAA 4KCDA 4G2ZA 1UIUA 1A8FA 4KR5A 2ZNUA 3K6XA 3O66A 4E0WA 4PE5B 3VVEA 4BDRA 2UVJA 1Y1ZA 2RC7A 3H6WA 3U92A 4H8JA 1MDP1 4NF4B 5DTBA 3HN0A 3HHGA 3H03A 1MM7A 2OCUA 1WODA 3W9VA 1FQDA 3H06B 3VFJA 2XX9A 3OEKA 2XXXA 3LR1A 3WAFA 4JSOA 3SEVA 3KOTA 4F3SA 2DOJA 1MY1A 1Z7ME 2R6GE 3U94A 2XHDA 1R9QA 2Q89A 3TCHA 1LB8A 1DPEA 2O7UA 1JW4A 2I6EA 2O7IA 2ESNA 3U1OA 2G93A 3HV1A 3CI8A 5DT6A 3C34A 4GLIA 2F6GA 1FTKA 4F3BA 5CMMA 3VLWA 1ATGA 3FXQA 4KQPA 1MM6A 2ALUA 3FGSA 3K1PA 1B0HA 3LSLA 4DXUA 3TCFA 1MQDA 4H65A 4ESWA 1B46A 4JB7A 4G8HA 3MP1A 1OQGA 3RTWB 1F9BA 1VSOA 3EF7A 1OIBA 4JWOA 3SEWA 4GRKA 1SDXA 4DCXA 2ZNSA 4X1BA 3T9VA 1R1NA 4YMBA 4H5GA 2DWIA 1ZIUA 1MY4A 3Q25A 4R73A 3T22A 3MAMA 4BLAA 3FATA 4QFKA 4WXJA 3HHFA 4MFIA 4UACA 3LSXA 4FIMA 3QUFA 4BDQA 2UVHA 1MPDA 1VFEA 1QVSA 3K6VA 3MJNA 3V89B 4I8CA 3PPOA 5EYFA 2HCAA 4LA9A 3OOAA 3L6GA 4G77A 4TOZA 2F7AA 3MVZA 4K3FA 3CFZA 2Y7WA 5KDTB 2ZXTA 2GH9A 3FD3A 4OESA 2DYXA 4ONYA 3FXUA 2O6AA 1SYIA 1UTHA 3Q26A 2HQ0A 4OMBA 5HPQA 2X7PA 3FVGA 5B70A 2F6PA 1H3DA 3AXFA 3LSFB 5I2KA 3GBAA 2F78A 4OEUA 5AA4A 4EUOA 4OQOA 3G7WA 3MC2A 3EHUA 2I48A 2OLBA 3MP6A 5H8NB 3IX1A 4LP2B 3FJMA 3QSLA 1SI0A 1OVBA 5IKBA 2I0CA 5L9SA 4NMYA 4LATA 2O68A 2P2AA 2XXPA 1NH8A 3CSBA 2OK2A 3RGYA 3T9XB 3B7DA 5H8HB 4UA8A 2Q8JA 4X9TA 1AIVA 2PYYA 2H4IA 4IGTA 2Z23A 4GIZA 3G3IA 2RINA 1BP5A 3PMVA 2A5SA 1JW1A 2PT1A 1Y3QA 2Q2AA 3DM0A 5ITOA 2QRYA 4GOTA 3Q27A 2O69A 1QJMA 1NNTA 1JEVA 4G8MA 3HO7A 4GFRA 3S9LC 2FYIA 2QS2A 3FJGA 4ZZAA 5L8DA 3TCGA 2XXVA 1B5IA 4EQ9A 4LONB 4OFOA 4DXBA 1B1HA 4U23A 2YLNA 4HTGA 3OD7A 2GRVA 4NF4A 4MBPA 1MQGA 3MZ9A 5ICQA 4RK9A 4KFQA 4ZDMA 4H0WA 4R6KA 4RPNA 3TODA 3MZ1A 1HSJA 5H8QB 3B6TA 4QFLA 3OO7A 4H6DA 5FHOA 4ZZEA 3FV1A 2ZYNA 2H5YA 1MXUA 4Q30B 4RY1A 1DPPA 2HEUA 3K2DA 1MY0A 1XHYA 3BFTA 2Q88A 5H8SA 1FQCA 5JTYB 3OO6A 4IGRA 3FVOA 5FTIA 4BDMA 1MS7A 3MP8A 3TDJA 3KSJA 2VP1A 4C1TA 1OLCA 2DWAA 5CC2A 2VD3A 3QXMA 5I58B 2DE2A 3BBRA 4POXA 2XD3A 3DP6A 3TTNA 3T93B 3K1NA 3A3UA 1N3WA 4YMAA 5I2NB 3JZJA 2HAUA 1FW0A 2REJA 4ELOA 2AIXA 3THIA 3N94A 5AA1A 3ZKKA 5CMKA 2Z8EA 1LBCA 1ZU0A 5CMCA 2KLFA 2THIA 4G68B 1MY2A 3A09A 3S9EA 4FJPA 2H9BA 4P11A 5CI5A 4JWXA 2HZKA 5H8FB 1UQWA 1SD3A 1O7TA 4NF5B 1DTZA 4TQUQ 3KN8A 2VHAA 2GHAA 4IO4A 4RA1A 4WEPA 3PV0E 4MLQA 2OWTA 2CMOA 4ELPA 1SW4A 1SW1A 5KDTA 2PBWA 1FTMA 3IOVA 4DE8A 4Z7EA 3ZKLA 4THIA 3M8UA 3D4CA 3S2VA 3GLBA 4MH5A 1ELJA 5L9OA 3H6VA 3MBPA 3K6WA 4IO6A 3CVGA 2DWHA 4YZZA 2X7QA 4IB2A 1LAHE 4DLDA 3SETA 1B7HA 3R6UA 5H8NA 4KPTA 2HXWA 1VE4A 1H45A 1P1WA 1QULA 2AL5A 1SBPA 1I6AA 4R2BA 2F35A 4R74A 4TLLB 4IO3A 1N76A 3KN7A 4F39A 3PPQA 3KN3A 4RYAA 3QIMA 2AYSA 3MUQA 3OO9A 2W7YA 3PPRA 3ECRA 3VVFA 2QMXA 2DQVA 1US4A 1NKXA 4KHZE 4NF8B 1JEUA 1MRPA 1XS5A 4EXLA 1MXVA 3O6GA 1LSTA 4U1OA 3USDA 3WAEA 5DVJA 1B05A 4YB7A 1N0TA 4BDOA 3TAJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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