4H1XA

Crystal structure of a phosphate abc transporter, phosphate-binding protein (sp_2084) from streptococcus pneumoniae tigr4 at 1.77 a resolution
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
GTIEVISRENGSGTRGAFTEITGILKKDGDKKIDNTAKTAVIQNSTEGVLSAVQGNANAIGYISLGSLTKSVKALEIDGVKASRDTVLDGEYPLQRPFNIVWSSNLSKLGQDFISFIHSKQGQQVVTDNKFIEAKTETTEYTSQHLSGKLSVVGSTSVSSLMEKLAEAYKKENPEVTIDITSNGSSAGITAVKEKTADIGMVSRELTPEEGKSLTHDAIALDGIAVVVNNDNKASQVSMAELADVFSGKLTTWDKIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of a phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein (SP_2084) from Streptococcus pneumoniae TIGR4 at 1.77 A resolution
rcsb
molecule keywords Phosphate-binding protein pstS 2
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF12849 PBP_like_2 PBP superfamily domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h1xA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h1xA02
4YICA 2UVGA 3C4MA 1B7HA 2V3UA 2V93A 4U21A 1NH8A 4HCWA 1CB6A 2XXHA 2AIXA 1SQYA 3CR9A 4G8HA 5KZTA 1B4ZA 4ESXA 3R26A 4DCYA 3RT6B 1SI0A 3KOTA 1I6AA 3KN8A 5BWJA 1MY0A 1UTBA 1FCKA 3PU5A 4KR5A 2F34A 3TFLA 3H6VA 4RK2A 2B3BA 2XXXA 4ZEDA 3VVFA 1PC3A 2I6EA 4QHQA 1JW5A 1VE4A 3LC8A 1ZKBA 3HO7A 1UIUA 5I58B 3RY3A 1NNFA 3G3JA 4MF3A 2D5WA 4ESWA 3O9PA 4U4SA 1QUJA 5KDTA 2D21A 2W7YA 3VFJA 3H6UA 3VV5A 2NUVA 2QSXA 4LATA 2DWAA 3TQLA 4JB7A 3B7DA 3G3IA 3O6IA 2ZMBA 3RLFE 4IO2A 4NMYA 2IEEA 2Z8FA 2FYIA 3GLBA 2O51A 1MXYA 1QKBA 1II5A 4IO7A 2Q89A 1YAEA 3MW0A 1ZU0A 3B6WA 1L5TA 4QSEA 4LZ5A 3TTKA 2UYFA 2DQVA 1Y9UA 1POTA 2WKYA 5H8NB 4XTCQ 1Q1KA 2QMWA 2O7IA 1R6ZA 2DE3A 4DXCA 3UN6A 4ZS9A 3MC2A 1IEJA 4GFRA 3H6WA 1B7ZA 1D3KA 3K6XA 1XVXA 3PGFA 1SW1A 3FUZA 1B5HA 4RK9A 3FJMA 4U2RA 4KFQA 4QRZA 1LCTA 4G4PA 4GWOA 4WEPA 4LVQA 1ANFA 1JVYA 4P11A 3FIRA 3MZBA 5I56A 3VLUA 4RXLA 4PFWA 2XXWA 4RPOA 1FTKA 2XD2A 2YJPA 4Q30B 2UVJA 1N3XA 3MAMA 3U92A 4UACA 3HN0A 1PB8A 1B3FA 3O29A 5DEXA 1B0LA 5CC2A 2Q2CA 4ZEFA 3T9HB 1MQHA 5A5XA 4KI0E 3P7IA 3VXBA 1OVTA 4G68A 3N94A 3O6GA 5I2NB 2R71A 4NWCA 4Z0IA 4X1DA 1B3GA 4EUOA 4I8CA 1D9VA 1MPCA 3VXCA 1LGBC 3TCHA 1YPNA 4U4XA 1HSJA 4GXSB 1N04A 3KSXA 4KQPA 1SVXB 4LP2B 1PB9A 5TP9B 5AA2B 1N76A 1IITA 3N6TA 1MDQA 5AA4B 2F7CA 1HSEA 3PUXE 3LUYA 1MQIA 4KYDA 2Q88A 2QS1A 3RPWA 2X26A 2NWJA 3E4RA 1GV8A 4QFLA 2O1MA 4YB7A 3U1OA 3O6HA 4TQUQ 1ZLQA 4F22A 1NL5A 2ZYOA 3EN3A 3RGYA 4PFTA 3HHFA 2F6GA 4FATA 4FIMA 3MVWA 2DWIA 4BDNA 2R6GE 4DZ1A 1B3LA 1I6BA 4ZE8A 1H44A 4GL0A 1IUDA 3PPQA 1B6HA 1P99A 4MLQA 3V8XB 3KOSA 2OZZA 4ECFA 3DELB 4NEDA 3K1MA 1B51A 1B1HA 3RTFB 1LAHE 2P1SA 2Q8JA 4F3GA 3EHSA 3B6TA 4YZZA 1SYIA 4XKRA 3CG1A 4H5FA 4PQJA 3FD3A 3FJGA 3ILTB 2I0CA 3T9VA 5H8QB 1PEBA 2NOOA 4Q8RA 1I6QA 4N13A 2XD3A 3MJNA 2ONRA 4XKPA 2QL3A 3Q29A 2VD2A 1DMBA 1MQGA 2UYEA 1OQGA 4DLDA 3CFXA 1A54A 2VD3A 4EXKA 3H3GA 4YKIA 2Y7PA 3IJOB 3K0VA 3LSWA 5CMKA 3S9LC 4QF9A 3CFZA 1LCFA 2Y7KA 4YU0A 3EQ1A 3IL1B 4R74A 2Z22A 5FHNA 3K1PA 4ELOA 1SD3A 3MWBA 5IKBA 1HSLA 2QS4A 4QSDA 5FHMA 1B46A 4TLMB 3IX1A 5JEIA 2PT1A 3DLNA 3FATA 1BIYA 3MP1A 4DDDA 3KG2A 4OFOA 4BDOA 4LZ7A 4KCDA 3KSJA 5FHOA 5TPAA 2KLFA 2AL5A 1N7WA 3OO8A 1N7XA 5AA3A 3QSLA 4OEVA 4H1XA 3PPOA 2DYXA 4FE8A 1PB7A 3PMXA 4H6DA 1FTMA 4DIGA 3SESA 2CZLA 2O84X 3KN3A 1XS5A 1B58A 3MP8A 4QSCA 4FECA 4JSDA 1LLSA 2UVIA 4Z7EA 5CMCA 3RTWB 3C33A 1OLCA 4QFPA 2H5YA 2PMSA 2DOJA 3TTLA 4RPNA 1YCJA 1FTOA 4I9DA 2REJA 1TFAA 2FA7A 4OTEA 2HAVA 1MH3A 4O3CA 3CRBA 1RYXA 3JYRA 1NFTA 3T22A 3K6WA 4C1TA 1LB8A 4AB6A 2QMXA 3V89B 5H8FB 2X7PA 2HCAA 3D4CA 3IO4A 2X7QA 4GXAA 5JTYB 3M8UA 4DCXA 2Q2AA 3TMGA 4H8JA 1PBPA 5KCJA 2YLNA 2RC9A 1MXWA 2HEUA 3N26A 3ECRA 1M5CA 3EHTA 5HBCA 5ITPA 1MG1A 2ONKE 1DTGA 1UIVA 2Q9TA 3FV2A 3A3CA 3OOAA 2M8CA 3UK4A 2UXAA 3G3FA 2V84A 1H76A 4PP0A 1LBCA 1JEUA 3ZKLA 3UIFA 5FTIA 3PPNA 4K3FA 3GZGA 4ZE9A 4YMBA 3GBBA 4P0IA 5H8HA 2PVUA 1DTZA 5DYHA 2ZNTA 4FEBA 3K6UA 4EF1A 4KYEA 3CVGA 1B0HA 1LAFE 3G3KA 5HPQA 2DXYA 2YPNA 2F7AA 1O7TA 3FVOA 3K6VA 1P1QA 3IOWA 2O69A 1ZTYA 3SDFA 3K00A 3TTNA 3TKDA 5J1DA 4KHZE 4F3BA 4ZECA 5L9MA 4R2BA 5L9SA 4PFYA 3IB1A 2DS9A 2H25A 3ONMA 4DE8A 1SW2A 4DXUA 3S9EA 2ZXTA 4F18A 5TU0A 2RC7A 2HXWA 4U1OA 1JVXA 4LZ8A 1JW1A 3C35A 3HV1A 2F97A 4MBPA 3MP6A 4ZZEA 3MUQA 4PETA 4KCCA 3L6HA 2OBGA 3SEVA 1MQJA 3CFLA 2I48A 4F3SA 4FJPA 3TEPA 3QUFA 3IO6A 1SW5A 4LQ5A 3TDJA 1QKAA 2AYSA 1Y4TA 2H99A 1MM7A 4IO3A 3FV1A 1S50A 3I5OA 1H45A 2HZLA 4POWA 2QS3A 3U72A 1MXZA 3LSLA 2XX8A 2B65A 4ONYA 3PMWA 2GFEA 4IB2A 3IOVA 3R7XA 1XHYA 5EHSA 4BDLA 1URDA 4G8NA 1OLAA 4XIGQ 3C31A 1OIBA 5EHMA 1VFEA 2ABHA 4X9TA 4YKKA 1SBPA 2V25A 4R6HA 5IAIA 3T93B 3LBSA 1B9JA 3MZ1A 4RY1A 3IB2A 2Y7RA 3PD9A 5DVFA 3C9HA 2GHAA 3WAEA 1YTVA 1Z7ME 4GQOA 4AB5A 3T66A 1B7UA 1JW4A 1A8FA 1POY1 4QFOA 3TTMA 3BKIB 4ISUA 3S9MC 4H65A 1UQWA 1B32A 3Q25A 5I2KB 1RYOA 3IORA 4BDMA 2XXVA 2XXRA 1JEVA 4MH5A 4OERA 3QUJA 2I3WA 4GVOA 5K2YA 4ELRA 1MY3A 3PPPA 4NE4A 1M5EA 4ELQA 3USDA 4OENA 5ISUA 2I4BA 1VR5A 2THIA 4MFIA 3OELA 4BLAA 4WEDA 3TTRA 2IA4A 4DXBA 2DVZA 1EZOA 3ODBA 4H67A 3T96B 2OCUA 4FORA 2F8DA 3K1NA 4C1UA 3MPKA 1WVJA 1QW0A 1MXUA 5AA2D 5M2VA 2PT2A 3KN7A 5CBSA 4YB5A 3C34A 3W9VA 4NF8B 1H43A 3ZS6A 1BP5A 2H9BA 3FXRA 1JETA 4R2FA 5I58A 3UORA 1B05A 1US4A 4GLIA 5ICQA 1USYE 1DPPA 1GGGA 4OMBA 1Q35A 1QUIA 4P0GA 1FQBA 4OQOA 2RINA 1FQFA 1XVYA 3U93A 2O6AA 5CBRA 2OWTA 3K01A 1EH3A 2GH9A 3I3VA 3M3KA 3ZSFA 4IGRA 4R73A 4PE5B 1Y1MA 2ONSA 1PDAA 4FEDA 5H8HB 5ICTA 3UGWA 5CMMA 3GXAA 1NNTA 1NKXA 4HW8A 4L17A 1UTBB 3TPAA 3IOUA 4POXA 3PUZE 3FVKA 5I84A 3IR1A 5H8NA 1ZIUA 4NF4A 2XXTA 2XX9A 1IXGA 1I69A 3OEMA 3PUYE 3FGSA 3T9XB 3OO6A 2VHAA 2QRYA 5KDTB 3O2AA 5JK4A 1O64A 4ZEIA 1ZBMA 1PBQA 2H4IA 4XKNA 3I6VA 3CSGA 5I57A 1QJMA 4R75A 1MY4A 2D3IA 2I58A 1JQFA 1H3DA 2Z23A 2P0SA 4EXLA 3VDFA 3N5LA 4KYSA 2Y7IA 4GIZA 4F29A 4F1YA 1Z7NE 3CG3A 4JWYA 3V5AA 2FNCA 4F3PA 1M5FA 3VVDA 1A8EA 5B70A 1MS7A 4ELPA 1URSA 4YMAA 1XOCA 2ANJA 1BKAA 3F11A 3IJXB 3QXMA 2HAUA 1GR2A 4E0WA 5I2NA 2ZYKA 4OETA 1B5JA 2VOZA 2V3TA 3KJTA 2QJEA 2HQ0A 4ND9A 4E0XA 2RCAA 1TT1A 2AL4A 4NTLA 2O68A 1SI1A 1USYH 4IGTA 4M4GA 1Y3QA 4EQBA 1LFGA 5TP9A 5AA2A 4X48A 5AA4A 4NF5A 1MM6A 1TWYA 1ATGA 4U22A 3BBRA 3QIMA 5I56B 1B40A 3TCGA 3G3HA 2F78A 1QULA 3SETA 2RKMA 2A5TA 4PFUA 2O1LA 3FXUA 4YKPA 1T0KA 1ZMGA 4LA9A 1QVSA 1O63A 5DEXB 3FVNA 2DE2A 3ZKKA 1Y1ZA 1P1OA 1N84A 1S9TA 5A5XB 1WODA 3S4UA 3KBRA 4G68B 2DE4A 3LSXA 3CSBA 2G29A 3V83A 3MBPA 3TYHA 2F36A 1MQDA 1P1NA 4OEUA 2HZKA 1F9BA 4EQ9A 1Y20A 4TOZA 2BJJX 4R9GA 3N6UA 2B3FA 4HCYA 2V3QA 3SERA 4F19A 3KGCA 3EF7A 2Y84A 2E1SA 1N0TA 1GVCA 1AMFA 5ITOA 3MQ9A 1NMUA 5H8QA 1NH7A 3OO9A 3E3KA 3H7MA 4Q5TA 4OXVA 3FZVA 1MRPA 4ZZAA 3PMVA 1OQHA 3PPRA 3T9UA 2ZYMA 1Y4CA 4LONB 1FQEA 3W9WA 1VFDA 1UTHA 3PV0E 2RC8A 1IQ7A 4H8IA 4IY5A 5I59A 1IZ1A 1SYHA 3AXFA 2OK2A 3SEUA 1JNFA 3M3FA 2XXIA 1A55A 4I62A 1RKMA 2Z8DA 4GL8A 3SEXA 5F1QA 4KD5A 4THIA 1EZPA 1LAGE 4F1UA 3QK6A 1R1NA 1DOTA 2E0SA 3H06B 4EDPA 4F1VA 1SW4A 5BUUA 4OZ9A 2XXQA 1FQDA 1A40A 2DVCA 4OVJA 3IOTA 1OMPA 4JDFA 3IB0A 2I3VA 2QPQA 4QFKA 1MDP1 3OSRA 4X1BA 1NNKA 3FJ7A 1LAXA 1B52A 4KPTA 3SKPA 1B2HA 2ZNUA 2PBWA 3MZ9A 2PYYA 5FTHA 3U8QA 3VLWA 3OEKA 1BLFA 4TLLB 4IO5A 1FTJA 2GHBA 4NF4B 3TUSA 5LOMA 1SDXA 3OXNA 2Z8EA 3KEIA 2ZNSA 3VE1B 3MVYA 4YKJA 3Q28A 4RYAA 4RNSA 4NF6A 4H0WA 3JZJA 4HTGA 1TFDA 2DP8A 3A3UA 5I57B 3K4UA 1VSOA 1EU8A 3OENA 5H8FA 2A5SA 3RQTA 4MLVA 5JTYA 3IAZA 3GBAA 3VLVA 3QAXA 2XX7A 3S9NC 3RN8A 3THIA 1XC1A 4QFNA 4IY6A 3A09A 3RT8A 5L9OA 5TPAB 2ZYNA 5AE4A 1AOVA 3MVXA 1GTKA 1R9QA 2XXUA 5CM6A 2CMOA 4G68C 4HS7A 3QYTA 1DPEA 4IO4A 2LAOA 1D4NA 4YB6A 2F35A 3VVEA 3SEYA 3O28A 2F7BA 5HM4B 4G8MA 4F31B 3WAFA 2VP1A 2OJTA 4LQ2A 2OLBA 4OESA 3FASA 2GRVA 1B3HA 1Y3NA 2OWSA 4U23A 3TODA 3H03A 5DT6A 3LR1A 4OFJA 4NF5B 4GRKA 4AQ4A 1LSTA 3K2DA 4GD5A 3FVGA 3OD7A 1AL3A 2XXPA 3Q26A 4I1DA 5KCJB 3DP4A 3BFUA 2A5TB 1ZJLA 4FAJA 1MH4A 1MXVA 1NNPA 1N3WA 1M5DA 2ESNA 2PX1A 5L8DA 4M1VA 3DP6A 3TELA 2DWJA 4RA1A 3FXQA 3MPLA 5CI5A 4JXIA 1M5BA 5CRYA 3TQWA 2G93A 4WXJA 3O97A 1FTLA 5CMBA 4YAHX 3EPEA 3C32A 1QUKA 2P2AA 5ELVA 3PD8A 5DTBA 4GF8A 1A7LA 1B5IA 1Y3PA 3Q27A 4EQ7A 2I0BA 2O7UA 4XXUA 1B4HA 3R6UA 1DSNA 1B3EA 4H5GA 3C36A 1TXFA 4O3AA 1EZ9A 3OSQA 4G77A 4OHNA 4N6PA 2F5XA 3M3LA 5AA1A 1LFHA 2DXRA 1P1WA 3G3GA 2VGQA 1R9LA 3HCQA 1OVBA 2XHDA 3U94A 3PUVE 1MPBA 4LUBA 1UTHB 1WDNA 3EHUA 4C0RA 4R6KA 4F2QA 3OMBA 3RUMA 4JWOA 3UA8A 4N07A 3TAJA 5I59B 2I49A 3KJ7A 4G2ZA 4UA8A 1MXXA 2DSFA 3IK6B 4JSOA 5DVIA 3E13X 5EYFA 4OWDA 1IXCA 3H6TA 3ILUB 2Y7WA 3OO7A 1FQAA 1ELJA 1URGA 1LBBA 2QS2A 1D9YA 1S7YA 5I2KA 2REGA 4R6YA 1US5A 4R72A 3TCFA 4BDRA 2NVUB 1FQCA 4OFLA 1B1XA 1P1UA 3H4ZA 1BTJA 4ZDMA 1FW0A 4F2OA 3KFMA 3W15C 1IXIA 2R9JA 2RF1A 3TZAA 4GOTA 4Q0CA 3UP9A 3HHGA 2H98A 1A99A 3L6GA 3HSTA 4EF2A 1MPDA 4BDQA 3SEWA 4JWXA 4RJZA 3DM0A 3CIJA 3CI8A 3K02A 5H8SA 4WKMA 4IO6A 2F6PA 4O3BA 2NXOA 3E9XA 3BFTA 3LSFB 4ZEKA 4NF6B 3MVZA 1XT8A 4U1ZA 4XKQA 1CE2A 1MY1A 2RCBA 4F39A 3KZGA 3O66A 4NF8A 3JV9A 2XXYA 3B6QA 4ZEBA 2ALUA 1IXHA 2DWHA 4NWDA 5K2XA 5B7DA 5DVJA 1J1NA 3PUWE 1IIWA 2I4CA 3DP8A 3G7WA 1KWHA 4R9FA 3RNNA 3S2VA 1MY2A 4JBZA 1AIVA 2HFBA 4OYVA 1LFIA 3D4GA 1AH5A 2UVHA 1LB9A 5F7VA 3HPIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YICA 2UVGA 3C4MA 3FBPA 1FBCA 1B7HA 2V3UA 4MNIA 2V93A 2HPGA 4U21A 1NH8A 4HCWA 1CB6A 2XXHA 2AIXA 1SQYA 3CR9A 4G8HA 5KZTA 1B4ZA 1KZ8A 3R26A 4DCYA 4ESXA 3RT6B 1SI0A 3KOTA 1I6AA 3KN8A 5BWJA 1MY0A 1UTBA 1FCKA 3PU5A 4KR5A 2F34A 3TFLA 3H6VA 4RK2A 2B3BA 2XXXA 4ZEDA 3VVFA 4GWWA 3U65A 1PC3A 2I6EA 4QHQA 1JW5A 1VE4A 3LC8A 1ZKBA 3HO7A 1UIUA 4N8GA 5I58B 3RY3A 5ET8A 3BIGA 1NNFA 1FBEA 3G3JA 2D5WA 4MF3A 4ESWA 3O9PA 4U4SA 1QUJA 5KDTA 2XWVA 2D21A 2W7YA 3VFJA 3H6UA 3VV5A 2NUVA 2QSXA 4LATA 2DWAA 2WEFA 3TQLA 4JB7A 3B7DA 3G3IA 3O6IA 2ZMBA 4P47A 3RLFE 4IO2A 1FPGA 4NMYA 2IEEA 2Z8FA 2FYIA 2CZHA 5ESYA 3GLBA 2O51A 1MXYA 1QKBA 4P3LA 1II5A 5ET7A 2WYKA 1RDYA 4IO7A 2Q89A 1YAEA 3MW0A 1ZU0A 3B6WA 1L5TA 4QSEA 4LZ5A 3TTKA 2UYFA 2DQVA 1Y9UA 1POTA 2WKYA 3GYYA 5H8NB 4XTCQ 1Q1KA 2QMWA 2O7IA 1R6ZA 2DE3A 4DXCA 3UN6A 2PFYA 2QVRA 2XWOA 4H46A 4ZS9A 3MC2A 1IEJA 4GFRA 3H6WA 1B7ZA 1D3KA 3K6XA 1XVXA 3PGFA 2Y5KA 3ROJA 1SW1A 3FUZA 1B5HA 4RK9A 3FJMA 4U2RA 4KFQA 4QRZA 2PCRA 1LCTA 4G4PA 4GWOA 4WEPA 4LVQA 1ANFA 1JVYA 4GWYA 1YXIA 1FPJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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