4H34A

Crystal structure of the tyrosine phosphatase shp-2 with q506p mutation
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
534
structure length
486
Chain Sequence
b'RRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHSDYINANIIMPEFKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVPTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQKSKR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
publication title Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with Q506P mutation
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 150
structure length 486
sequence length 534
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2012-09-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4h34A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4h34A02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4h34A03
2QBQA 2VEUA 3N0AA 1KC2A 3HIZB 3CM3A 1U25A 3EU0A 1A5YA 5AXIA 5MMZB 4LUDA 3NHNA 1BZJA 2I5XA 1BG1A 3RZ2A 1YTWA 1YVHA 1QADA 2ABLA 4HRFA 3QCDA 3QCKA 1KSWA 2VEVA 2AZRA 2J16B 5DF6A 5K23A 4OHHA 1PH0A 2K7AB 1AYAA 3QWYA 4PVGA 3CXLA 2I6PA 1JYRA 1T49A 5KADA 4DGXA 2IZVA 2H5KA 1D4TA 2LCTA 1LKLA 1OHDA 1X24A 2B07A 3AWEA 1D1ZA 4FL2A 5AULA 1FMKA 1OHEA 1WRMA 1BM2A 1ZFPE 2EYZA 3F41A 3PSJA 3F9BA 1AYBA 3OP0A 4QAHA 5KA0A 1JF7A 1A1BA 1JU5A 2F6TA 4QUMA 3MOZA 5J8RA 4GWFA 1TCEA 2FCIA 1C86A 1WCHA 2H4KA 3OMHA 2Y2FA 1SHBA 5CDWA 3H2XA 3O3LA 5KAZA 1O41A 3VRPA 1M61A 1H9OA 1OETA 1L8KA 4GL9E 1K9AA 1SPRA 1MILA 1WQUA 1O4PA 3EB1A 3TL0A 2YU7A 1ONZA 4NYHA 2SRCA 3CWGA 2C7SA 1LKKA 1B47A 1XXVA 4F59A 3MXCA 3WA4A 2NT2A 2CNFA 5K25A 1O43A 2QDMA 1ONYA 2Q47A 1NNYA 1HCTB 4MBBA 1GFYA 4RHGA 1XM2A 1LYVA 1HCSB 3M7FA 1R1SA 1RXDA 3EZZA 1MKPA 4BJOA 3S3HA 3AWFA 1X6CA 4U17A 1V3AA 5EEQA 4OHIA 4LUEA 1BLKA 3D44A 1O44A 3BLTA 1O4GA 2HC1A 2RORA 1PXHA 2A3KA 2CFVA 4K44A 3N7YA 2LQNA 2NLKA 5KA1A 2EKXA 2CM7A 1A81A 2BGDA 4FBNA 2I3RA 1YFOA 3O4UA 3VS5A 2NT7A 2PNBA 3N8MA 4F5BA 1LARA 3I36A 1XXPA 2AOBA 2EU0A 1C87A 1O45A 4QBWA 3V0FA 4ROJA 2GSBA 2CRHA 2GP0A 2BGEA 1KAVA 4EY0A 2J16A 2AUGA 3S3FA 1PYNA 3V0IA 2FJNA 2PTKA 2C0OA 1PTTA 1YWFA 1PTVA 4GS0A 3K2MA 1YN9A 2PT0A 5KA2A 1D5RA 5K22A 2H04A 2CIAA 2I4HA 5GTJA 5EHRA 3VGOA 2DXPA 1EEOA 1CWDL 4IKCA 3GXXA 1OO3A 1FPRA 2Y96A 2B4OA 1FYRA 1AB2A 2LNXA 1OEOX 4RDDA 3VS1A 2DCRA 5HKWA 2CNHA 2ECDA 5BZXA 2QBPA 3TKZA 2CMAA 2I6IA 2F70A 1NZVA 3F81A 1AOUF 2KNOA 3S8LA 4EIHA 3OB2B 1VHRA 2Q05A 3QCEA 2B49A 1BKMA 3ZM2A 1CJ1A 1SUGA 2L6KA 1BMBA 2F6WA 2EO3A 4M4ZA 1KAKA 1SHAA 3IN7A 3IMJA 2F6VA 4ERCA 5KA7A 1OPLA 3CBLA 2DX0A 4WWQA 1O46A 4GRYA 2FO0A 5HKYA 3BRHA 2QDPA 3N84A 3RGOA 4K45A 2CBLA 2AOAA 3B7OA 4R30A 2PI7A 4Y2EA 1RPYA 4L1BB 3VS6A 2F6YA 1XRIA 1O4LA 4QBEA 1O4MA 2MRKA 4NWGA 5EELA 3VS0A 5J3XA 3OLRA 2OZOA 4OHDA 2E0TA 1Z3KA 3S3KA 3PLFB 5IBSA 2DM0A 3IMDA 5HKZA 3OB1B 2OC3A 4ZN5A 1G1FA 3OVEA 5D0JA 4RI5A 2IUHA 1FQ1A 1I9SA 4X6SA 5HDEA 4Z6BA 3QCNA 3V0DA 2EYVA 4RH5A 2DLZA 2HNQA 2H8HA 4OHLA 1NO6A 1LUNA 2IUIA 3BUNB 2MRJA 1C83A 1QCFA 1O4BA 2F6FA 4YR8B 4ZRTA 1A07A 3US4A 2AHSA 2HVLA 2HCKA 3F99A 2C9WA 3QCCA 1RQQC 3S4EA 2JYQA 4K11A 1BLJA 2G59A 4XZ0A 3CWEA 2Y1MA 1NL9A 2R0BA 4K2RA 5KA4A 3O4TA 2P6XA 1X0NA 3EACA 2I6JA 2BBUA 2MC1A 1FU6A 1AAXA 1FPZA 2F71A 1KA6A 1O4FA 4E93A 2I4EA 3EAZA 2OUDA 3PSKA 2B4UA 4TZIA 1XBOA 1OPKA 4D8KA 1O4JA 4XZ1A 2RSYA 3PFVA 3BM8A 4H34A 2FH7A 2HY3A 3LJ8A 2CMCA 2HDVA 3U96A 2L4KA 1YPTA 1ECVA 3S4OA 3VS3A 4TVVA 1YTSA 2BV5A 3RO1A 2H4VA 4HJQA 3ZM0A 3C7IA 2NTAA 4JGHA 2VEWA 3CD3A 1SKJA 2F46A 1NRVA 2I75A 4NX8A 2HNPA 1ZCLA 4R0TA 1PA9A 4KYRA 2OOQA 1AYCA 1O42A 5DC4A 1M27A 1I3ZA 5I6VA 1LQFA 2B4PA 3QKQA 4GE5A 4JNBA 2RF6A 1AYDA 1R1QA 3GXGA 5M43A 2CM2A 1LUMA 2PBNA 1LCKA 1BF5A 2IUGA 2QMSA 2I4GA 2HDXA 2ZMMA 1OEMX 4QUNA 3RGQA 1IJRA 1RJAA 4JMKA 1FU5A 4D3RA 2QDCA 1YGRA 2L3TA 1Q6NA 3D1OA 1G4WR 5GJHA 1R6HA 2HCMA 2JJDA 3V0JA 4H1OA 3SR9A 3ZM1A 3A5JA 1BZCA 3F9AA 3D1HA 2HXPA 4DGPA 1NZ7A 2CNIA 2I6OA 5K24A 1O4OA 3S9KA 2RVFA 1LCJA 1C85A 1L8GA 3GXWA 2J17A 5IBMA 1PA1A 1JYQA 2Y3AB 1A1EA 1O4NA 1UURA 2SHPA 3O5XA 1JLNA 3ZV2A 3QWXX 5EHPA 3BUWB 1C84A 4B04A 3V0EA 1BKLA 1Y57A 1D4WA 2PQ5A 1P13A 2QEPA 1NWLA 1T4JA 1KA7A 3GXHA 1I9TA 3I80A 1A09A 1MW4A 1Q6TA 4P9VA 2QCJA 1O48A 4OHEA 4A4CA 2IMGA 4HJPA 3UF4A 1GWZA 4WOHA 1BHHB 1O47A 2CNEA 3QKPA 3VRRA 1NWEA 3D1QA 2FJMA 2CI8A 1GRIA 4JEGA 2VEYA 1FBVA 4R0SA 1PTUA 3UYOA 4U1PA 3BUXB 2H46E 3A5KA 2YSXA 3BUOB 1OESA 1WAXA 3V0GA 1ZC0A 2OQ1A 2LQWA 3QCGA 2LNWA 3VS4A 4F5AA 1O4AA 3S8NA 1O4CA 1C88A 1M3GA 4ICZA 2QCTA 2PA5A 5LXQB 4YAAA 1AD5A 1Q6SA 3VROA 1P15A 2C46A 2F6ZA 4PYHA 2EO6A 3GQIB 1G7FA 3D42A 3MMJA 3QCMA 3S3EA 2I1YA 3PJPA 3QCLA 1SHDA 1Q1MA 2K79B 4GPLB 1YTNA 2OZ5A 2BZLA 4RH9A 1X27A 2CM8A 1GHUA 1YVLA 2ESBA 5K9VA 1OHCA 3EAXA 1O4IA 5EG3B 4I8NA 3HCKA 3ZM3A 1OO4A 1BZHA 2WGPA 5KA9A 1BFJA 3VRQA 2H02A 2HB1A 5KAAA 1F2FA 5GJIA 1BFIA 4D3PA 1J4XA 4BPCA 2G6ZA 2I6MA 3IN8A 1R1PA 1CSYA 2C0IA 2MBCA 2I42A 1BHFA 1CWEA 1G1GA 3KFJA 2H4GA 3HHMB 3BKBA 1F1WA 1G4US 1RPMA 1OEVA 1O49A 2B3OA 2KK6A 3EMUA 4GE6A 1A1CA 3ZNIA 3O4SA 1I57A 4GFUA 3QCBA 4QAPA 3NMEA 2H03A 5BX1A 2PLEA 1OEUA 2C0TA 3SMEA 1O4DA 3I7ZA 1U26A 1G83A 3QCJA 3ZMQA 2CI9A 1EENA 2DVJA 2M3VA 1YGUA 3MXYA 2HMHA 4A4BA 1ZZWA 1IS0A 2GJTA 1A1AA 1O4HA 1T48A 1Y1UA 2ZN7A 1ZCKA 2NZ6A 4WU2A 4S0GA 2QBSA 4GFVA 1NZLA 1PICA 2RMXA 2PSZA 1G7GA 3S8OA 5BUGA 1YZ4A 5BZZA 4GRZA 2NV5A 1BHHA 2CMBA 1LUIA 2CR4A 2GE9A 4KYQA 1O4KA 1G1HA 1JWOA 4ZI4A 4JMJA 2CS0A 1XA6A 5BO4A 3M4UA 3VRNA 2Y1NA 1PTYA 2HC2A 1Q6PA 3OV1A 5KA8A 4AZ1A 3QCHA 3QCIA 2QBRA 3V0HA 5K9WA 2EOBA 2MQIA 5AWXA 3D9CA 4WTYA 1QG1E 2EL8A 2HUWA 2DLYA 4JE4A 1QZ0A 3QCFA 3VS7A 1A08A 1LUKA 2GWOA 4FL3A 3VRZA 2ETZA 4JBCA 3VS2A 1Q6MA 5KACA 1SPSA 3BUMB 1O4EA 2PNAA 2CNGA 2EYYA 4NWFA 4RI4A 2B4SA 4D3QA 1FBZA 1UUSA 5KA3A 1Q6JA 4E68A 1O4QA 3BLUA 5DC9A 3AWGA 4P9ZA 1O4RA 3PQZA 1FHSA 3T04A 2YDUA 1TZEE 1CSZA 2VIFA 2P4DA 4QSYA 1AOTF 1QXKA 4KI9A 3PS5A 5KABA 3MAZA 4NNDA 2I3UA 3VRYA 3MOWA 2PLDA 4Y14A 1U24A 4GE2A 4RKKA 3ZMPA 2VEXA 2BIJA 2XP1A 2A8BA 5DC0B 4J51A 2MK2A 4WU3A 1JYUA 2CM3A 2CJZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QBQA 2VEUA 3N0AA 1KC2A 3HIZB 3CM3A 1U25A 3EU0A 1A5YA 5AXIA 5MMZB 4LUDA 3NHNA 1BZJA 2I5XA 1BG1A 3RZ2A 1YTWA 1YVHA 1QADA 2ABLA 4HRFA 3QCDA 3QCKA 1KSWA 2VEVA 2AZRA 2J16B 5DF6A 5K23A 4OHHA 1PH0A 2K7AB 1AYAA 3QWYA 4PVGA 3CXLA 2I6PA 1JYRA 1T49A 5KADA 4DGXA 2IZVA 2H5KA 1D4TA 2LCTA 1LKLA 1OHDA 1X24A 2B07A 3AWEA 1D1ZA 4FL2A 3ZM6A 5AULA 1FMKA 1OHEA 1WRMA 1BM2A 1ZFPE 2EYZA 3F41A 3PSJA 3F9BA 1AYBA 3OP0A 4QAHA 5KA0A 1JF7A 1A1BA 2UUOA 1JU5A 2F6TA 4QUMA 3MOZA 5J8RA 4GWFA 1TCEA 2FCIA 1C86A 1WCHA 2H4KA 3OMHA 2Y2FA 1SHBA 5CDWA 3H2XA 3O3LA 5KAZA 1O41A 3VRPA 1M61A 1H9OA 1OETA 1L8KA 4GL9E 1EEHA 1K9AA 1SPRA 1MILA 1WQUA 1O4PA 3EB1A 3TL0A 2YU7A 1ONZA 4NYHA 2SRCA 3CWGA 2C7SA 1LKKA 1B47A 1O5ZA 3UAGA 1XXVA 4F59A 3MXCA 3WA4A 2NT2A 2CNFA 5K25A 1O43A 2QDMA 1ONYA 2Q47A 1NNYA 1HCTB 2GCBA 1GFYA 4MBBA 4RHGA 1XM2A 1LYVA 1HCSB 3M7FA 1R1SA 1RXDA 3EZZA 1GQQA 1MKPA 4BJOA 3S3HA 3AWFA 1X6CA 4U17A 4BUCA 1V3AA 5EEQA 4OHIA 4LUEA 1BLKA 1W78A 3D44A 5A5FA 1O44A 3LYVA 3BLTA 1O4GA 2HC1A 2RORA 1PXHA 2A3KA 2CFVA 4K44A 3N7YA 2LQNA 2NLKA 5KA1A 2EKXA 2CM7A 1A81A 2BGDA 4FBNA 2I3RA 1YFOA 3O4UA 3VS5A 2NT7A 2PNBA 3N8MA 4F5BA 1LARA 3I36A 1XXPA 2AOBA 2EU0A 1C87A 2KGYA 1O45A 4QBWA 3V0FA 4ROJA 2GSBA 2CRHA 2GP0A 2BGEA 1KAVA 4EY0A 2J16A 2AUGA 3S3FA 1PYNA 3V0IA 2FJNA 2PTKA 2C0OA 1PTTA 1YWFA 1PTVA 4GS0A 3K2MA 1YN9A 2PT0A 5KA2A 1D5RA 5K22A 2H04A 2CIAA 2I4HA 4CVMA 5GTJA 5EHRA 3VGOA 2DXPA 1EEOA 1CWDL 4IKCA 3GXXA 1OO3A 1FPRA 1GQYA 2B4OA 1FYRA 1AB2A 2Y96A 2LNXA 4CVLA 1OEOX 4RDDA 3VS1A 2DCRA 5HKWA 2CNHA 2ECDA 5BZXA 2QBPA 3TKZA 2CMAA 2I6IA 2F70A 1NZVA 3F81A 1AOUF 2KNOA 3S8LA 2JFHA 4EIHA 3OB2B 1VHRA 2Q05A 3QCEA 2B49A 1BKMA 3ZM2A 1CJ1A 1SUGA 2L6KA 5A5EA 1BMBA 2F6WA 2EO3A 4M4ZA 1KAKA 1SHAA 3IN7A 3IMJA 2Y68A 2F6VA 4ERCA 5KA7A 1OPLA 3CBLA 2DX0A 4WWQA 1O46A 4GRYA 2FO0A 4QDIA 5HKYA 3BRHA 1P31A 2QDPA 3N84A 3RGOA 4K45A 2CBLA 2AOAA 3B7OA 4R30A 2PI7A 4Y2EA 1RPYA 4L1BB 3VS6A 2F6YA 1XRIA 2WJPA 1O4LA 4QBEA 1O4MA 2MRKA 4NWGA 5EELA 3VS0A 2GC5A 5J3XA 3OLRA 2OZOA 4OHDA 2E0TA 1Z3KA 3S3KA 3PLFB 5IBSA 2DM0A 3IMDA 5HKZA 3OB1B 2OC3A 4ZN5A 1G1FA 3OVEA 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 1YGU A;  3MXY A;  2HMH A;  4A4B A;  1ZZW A;  1IS0 A;  2GJT A;  1A1A A;  1O4H A;  1T48 A;  1Y1U A;  2ZN7 A;  1ZCK A;  2NZ6 A;  4WU2 A;  4S0G A;  2QBS A;  4GFV A;  1NZL A;  1PIC A;  2RMX A;  2PSZ A;  1G7G A;  3S8O A;  5BUG A;  1YZ4 A;  5BZZ A;  4GRZ A;  2NV5 A;  1BHH A;  2CMB A;  1LUI A;  2CR4 A;  2GE9 A;  4KYQ A;  1O4K A;  1G1H A;  1JWO A;  4ZI4 A;  4JMJ A;  2CS0 A;  1XA6 A;  5BO4 A;  3M4U A;  3VRN A;  2Y1N A;  1PTY A;  2HC2 A;  1Q6P A;  3OV1 A;  5KA8 A;  4AZ1 A;  3QCH A;  3QCI A;  2QBR A;  3V0H A;  5K9W A;  2EOB A;  2MQI A;  5AWX A;  3D9C A;  4WTY A;  1QG1 E;  2EL8 A;  2HUW A;  2DLY A;  4JE4 A;  1QZ0 A;  3QCF A;  3VS7 A;  1A08 A;  1LUK A;  2GWO A;  4FL3 A;  3VRZ A;  2ETZ A;  4JBC A;  3VS2 A;  1Q6M A;  5KAC A;  1SPS A;  3BUM B;  1O4E A;  2PNA A;  2CNG A;  2EYY A;  4NWF A;  4RI4 A;  2B4S A;  4D3Q A;  1FBZ A;  1UUS A;  5KA3 A;  1Q6J A;  4E68 A;  1O4Q A;  3BLU A;  5DC9 A;  3AWG A;  4P9Z A;  1O4R A;  3PQZ A;  1FHS A;  3T04 A;  2YDU A;  1TZE E;  1CSZ A;  2VIF A;  2P4D A;  4QSY A;  1AOT F;  1QXK A;  4KI9 A;  3PS5 A;  5KAB A;  3MAZ A;  4NND A;  2I3U A;  3VRY A;  3MOW A;  2PLD A;  4Y14 A;  1U24 A;  4GE2 A;  4RKK A;  3ZMP A;  2VEX A;  2BIJ A;  2XP1 A;  2A8B A;  5DC0 B;  4J51 A;  2MK2 A;  4WU3 A;  1JYU A;  2CM3 A;  2CJZ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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