4H34A

Crystal structure of the tyrosine phosphatase shp-2 with q506p mutation
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
534
structure length
486
Chain Sequence
RRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHSDYINANIIMPEFKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVPTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRRIEEEQKSKR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with Q506P mutation
rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
total genus 150
structure length 486
sequence length 534
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2012-09-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4h34A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4h34A02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4h34A03
1A1EA 1NO6A 4KI9A 2F6YA 2CFVA 1HCSB 4RDDA 2BIJA 3S3HA 4GL9E 3S4EA 4P9ZA 2MC1A 3D44A 3S8NA 2LNWA 1KC2A 2C9WA 4NWGA 2CNGA 4GWFA 1BZHA 2VEUA 1UURA 2H5KA 1YWFA 1SPRA 3IMDA 3O4TA 2C0OA 3RZ2A 5LXQB 1C86A 3ZNIA 3M7FA 4ZRTA 1BM2A 1RQQC 2QMSA 1YTWA 2I1YA 2BBUA 1A08A 3TKZA 3VS2A 2HY3A 3EAXA 3V0EA 3ZV2A 1P13A 1OEVA 3MOZA 5GTJA 4RH5A 1PYNA 4GE5A 2CM2A 4PYHA 2AOAA 1QCFA 3QCDA 3HCKA 2B49A 1WRMA 3K2MA 4M4ZA 3BUNB 2I4EA 1BF5A 4OHIA 1JYQA 2L4KA 3PS5A 4BPCA 3MXYA 1O47A 1H9OA 2ETZA 1Y1UA 2MRKA 3IMJA 2FH7A 4WTYA 5D0JA 1CWDL 5MMZB 3S3FA 4E93A 1SKJA 2EU0A 4R30A 5K25A 2IUGA 1BHHB 3N84A 1CWEA 2CMCA 5KA0A 1OO3A 1R1SA 1OEMX 1L8KA 2DLZA 2WGPA 3D9CA 4EY0A 2I6OA 1ZC0A 5EHPA 3BUOB 2H8HA 1U25A 1A81A 3GXWA 1Q1MA 3F9BA 1JWOA 3D1QA 5KADA 1HCTB 1M61A 1O41A 1QXKA 1A1AA 2B3OA 1ONZA 2H46E 2K79B 1G1GA 2HVLA 1YTSA 4RI4A 3AWEA 3T04A 1B47A 1A1BA 5EEQA 1O4JA 4MBBA 1ZFPE 1OEOX 2QCTA 2YDUA 3S4OA 2AUGA 2I42A 1SHDA 3NHNA 1RXDA 3VS1A 2F6FA 2F70A 1VHRA 2RORA 4QAPA 4TVVA 4D3RA 5J3XA 3VRYA 3VS3A 2VEYA 2PBNA 4JNBA 4OHEA 3QKPA 1Z3KA 4GE2A 2B4OA 3CBLA 1I3ZA 3OB1B 1GRIA 3VRQA 1SUGA 2CMBA 3O3LA 5J8RA 3I7ZA 3UF4A 2OUDA 1X6CA 4R0SA 1C83A 1O46A 2CI8A 1LYVA 3OP0A 1PTVA 1Q6SA 4K45A 1X27A 3KFJA 1AAXA 3MMJA 1F2FA 2J17A 1BKMA 2IZVA 1F1WA 2FJNA 2EO6A 5KABA 4NYHA 1AYCA 1R6HA 3N0AA 1A5YA 2EOBA 2CI9A 4DGPA 3RGOA 1K9AA 2H04A 5K22A 4DGXA 2ZN7A 3QCHA 4LUEA 2LQNA 4ICZA 1RJAA 2B07A 2QBSA 1G4US 5AXIA 1CSYA 2Q47A 2PTKA 2VEWA 1YGUA 2NT2A 1BLKA 5DF6A 2PI7A 5GJIA 2C46A 1OETA 3CWEA 2H4KA 3VGOA 1JYUA 1J4XA 1XXVA 2CNFA 3EZZA 2VIFA 2EO3A 1R1QA 1LUNA 1QG1E 5BO4A 1LCKA 1BFJA 2H02A 1O43A 1X24A 5HDEA 4WU3A 1YN9A 2QBRA 4JE4A 2RF6A 3QCEA 2QDPA 5KA3A 3BRHA 1BKLA 1FQ1A 4ZI4A 4RI5A 3MAZA 3OMHA 4JBCA 1XA6A 5KAZA 1CJ1A 4X6SA 2L3TA 3VRPA 3VRRA 1UUSA 2K7AB 2F6ZA 2IUHA 3QCJA 1G7GA 1QADA 4FL3A 1FPZA 1SPSA 1Q6JA 3VS6A 1KA6A 2QEPA 2BV5A 2OC3A 1NWEA 2LCTA 4R0TA 4K44A 2BZLA 3QCNA 2HC1A 3S3EA 4NX8A 1Q6MA 2L6KA 4L1BB 3QKQA 2Y1NA 2LQWA 1BZCA 1G83A 5KA7A 1LARA 2HCKA 3ZM2A 3BUWB 2G59A 3QCCA 1YVHA 1OESA 4GRYA 1TZEE 1WCHA 1O4DA 4U17A 3QWXX 5K9WA 3C7IA 4BJOA 3HHMB 5EG3B 3VROA 1BFIA 2G6ZA 4OHDA 1O4PA 3I36A 2OQ1A 3RO1A 3VRNA 2C7SA 2Y2FA 2P6XA 1LQFA 3NMEA 2EL8A 1O4LA 2PNBA 1D5RA 4GRZA 1RPMA 4U1PA 1V3AA 5M43A 1G1FA 4ERCA 5DC0B 1OO4A 4KYQA 4QUMA 1WAXA 5IBSA 2E0TA 4PVGA 1I9SA 1NNYA 4F59A 1G1HA 3IN8A 3ZMPA 2CM8A 5K23A 3LJ8A 4OHLA 1PXHA 1SHAA 2MBCA 1O4IA 1G4WR 3GQIB 1ZCKA 1BLJA 2LNXA 2ABLA 1PTYA 4XZ0A 1D1ZA 2RMXA 2I4HA 4IKCA 4LUDA 1AYAA 1PA9A 1NZVA 2M3VA 1TCEA 1OHCA 1ECVA 1G7FA 3BLTA 1O49A 1SHBA 4K2RA 4WOHA 2DM0A 4D3QA 1PH0A 1AYBA 2RVFA 4Z6BA 4F5BA 2CMAA 3A5KA 1BMBA 3QCGA 3MXCA 2VEXA 1FHSA 4J51A 3GXGA 4JMJA 1BHHA 2OZ5A 1KSWA 1KAVA 3A5JA 3B7OA 4WU2A 1XRIA 4A4CA 4Y2EA 2B4PA 2DX0A 2GP0A 3MOWA 3QCMA 2H4VA 1A1CA 1RPYA 3CWGA 5HKYA 4NNDA 5KA1A 2NZ6A 2HC2A 1O45A 2F6VA 1LKKA 4AZ1A 2IMGA 3CM3A 3OLRA 4YR8B 3OB2B 4K11A 2FO0A 3VS0A 2QDCA 3EMUA 3N7YA 1FPRA 2CM3A 1GFYA 2HXPA 2EKXA 2F6TA 3CXLA 3QCFA 1LUMA 4S0GA 3ZM1A 1JLNA 2PQ5A 4QBEA 3QCIA 2Y3AB 1X0NA 3VS7A 2PA5A 2GE9A 3VS5A 1EENA 2XP1A 3S3KA 4H1OA 3PSJA 4GFVA 2F46A 1O4QA 1OPKA 2DVJA 2AZRA 1YFOA 2EYVA 4WWQA 1ZZWA 2F71A 1FU6A 3PFVA 2NTAA 3SMEA 1C87A 1XXPA 2FJMA 3IN7A 1KA7A 1AYDA 2I5XA 1OHDA 5HKWA 1O42A 3S8LA 1MILA 5I6VA 5K9VA 3WA4A 2CR4A 3GXXA 1JF7A 2B4UA 1Q6TA 3TL0A 4P9VA 3HIZB 4A4BA 1AOTF 2AOBA 1KAKA 2PT0A 2HNQA 2I3UA 3EU0A 3US4A 3V0DA 2KK6A 1R1PA 5DC4A 1GHUA 3AWGA 1O4AA 4Y14A 5KA9A 1O4NA 3S8OA 1BG1A 1AOUF 4B04A 5KAAA 1MW4A 4E68A 4RHGA 1YVLA 2IUIA 2SHPA 1OHEA 4QUNA 2PLEA 1OEUA 2QBQA 1O4KA 1PICA 3ZMQA 2ECDA 2CIAA 2RSYA 3PSKA 4GFUA 5K24A 2J16A 3V0JA 1O4OA 3M4UA 4D8KA 1YPTA 1BHFA 1IS0A 2ESBA 2CRHA 2I4GA 1Y57A 1PTTA 2EYYA 1O4MA 2NT7A 1PA1A 2H4GA 2R0BA 4NWFA 1CSZA 1FBZA 1XBOA 1ONYA 2HB1A 2HNPA 4GPLB 1FU5A 2BGDA 2DCRA 2I6MA 5BX1A 5BZXA 2PSZA 1EEOA 3N8MA 1LUKA 1T49A 1I9TA 4GE6A 3D1HA 4YAAA 1D4WA 3EACA 5IBMA 3OV1A 4ROJA 1A07A 2NLKA 3V0IA 1QZ0A 1XM2A 2CNEA 1YGRA 3BLUA 2OZOA 1NL9A 5AWXA 2HDVA 2I3RA 2VEVA 2I6IA 3PLFB 2GWOA 1O4FA 2JJDA 3QCBA 1C84A 4F5AA 5KACA 1NWLA 1O4BA 3D42A 1C85A 3S9KA 3VRZA 2QBPA 2HUWA 3O5XA 1AD5A 4XZ1A 2GJTA 4QBWA 4ZN5A 2SRCA 1D4TA 3F41A 2AHSA 1YZ4A 1M3GA 4D3PA 2YSXA 4QSYA 2F6WA 2CBLA 3GXHA 2Y96A 2HDXA 3OVEA 3PQZA 3O4UA 5GJHA 2PLDA 2KNOA 2NV5A 3F81A 4QAHA 4H34A 5CDWA 4HRFA 2OOQA 2H03A 3ZM3A 3ZM0A 2PNAA 3PJPA 1ZCLA 5KA2A 2HMHA 1M27A 1O4HA 1O4GA 2CJZA 5BZZA 1U26A 2I6JA 1T48A 1LCJA 4TZIA 4JMKA 4GS0A 5HKZA 1YTNA 3U96A 1GWZA 1NRVA 4EIHA 2CNIA 1O44A 2GSBA 3QCKA 3EB1A 4HJQA 5EHRA 2I75A 2DXPA 2MQIA 1C88A 3EAZA 5KA4A 2A8BA 3I80A 2MK2A 1FBVA 1NZLA 1O4CA 2CNHA 3F9AA 5BUGA 3BM8A 1JU5A 4RH9A 3UYOA 3AWFA 1LUIA 4OHHA 2Q05A 1AB2A 2C0TA 1OPLA 3BUMB 2HCMA 3H2XA 3VS4A 1Q6PA 4HJPA 1LKLA 3CD3A 2CS0A 1JYRA 1L8GA 3QCLA 1WQUA 1P15A 1T4JA 4JGHA 3V0GA 5AULA 2JYQA 2C0IA 2EYZA 3F99A 5KA8A 3RGQA 1BZJA 1O4EA 4JEGA 2QCJA 4I8NA 2B4SA 1Q6NA 1PTUA 2QDMA 1NZ7A 1O4RA 3D1OA 3O4SA 1U24A 1FYRA 1I57A 2I6PA 2YU7A 3BKBA 2ZMMA 2MRJA 4FBNA 1MKPA 2J16B 2A3KA 2DLYA 2P4DA 3SR9A 2Y1MA 4RKKA 3BUXB 1A09A 1FMKA 4FL2A 5DC9A 3QWYA 2FCIA 3V0FA 4KYRA 3V0HA 1IJRA 5EELA 1O48A 2BGEA 2CM7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1A1EA 1NO6A 4KI9A 2F6YA 2CFVA 2JFFA 1HCSB 4RDDA 2BIJA 2AM1A 3S3HA 4GL9E 3UAGA 1O5ZA 3S4EA 4P9ZA 2MC1A 3D44A 3S8NA 2LNWA 4ZIYA 1KC2A 2C9WA 4NWGA 2CNGA 4GWFA 1BZHA 2VEUA 1UURA 2H5KA 2Y66A 1YWFA 1SPRA 3IMDA 3O4TA 2C0OA 1P31A 3RZ2A 5LXQB 1C86A 3ZNIA 3M7FA 3HN7A 1BM2A 1RQQC 2QMSA 1YTWA 2I1YA 4ZRTA 2BBUA 1A08A 3TKZA 3VS2A 2HY3A 3EAXA 3V0EA 3ZV2A 1P13A 1OEVA 3MOZA 5GTJA 4RH5A 1PYNA 4GE5A 2CM2A 4PYHA 2AOAA 1QCFA 3QCDA 3HCKA 2B49A 1WRMA 3K2MA 4M4ZA 3BUNB 2I4EA 1BF5A 4OHIA 1JYQA 2L4KA 3PS5A 4BPCA 3MXYA 1O47A 1H9OA 2ETZA 1Y1UA 2MRKA 3IMJA 2FH7A 4WTYA 5D0JA 1CWDL 5MMZB 3S3FA 4E93A 1SKJA 2EU0A 4R30A 5K25A 2IUGA 1BHHB 3N84A 1CWEA 2CMCA 5KA0A 1OO3A 1R1SA 1OEMX 1L8KA 2DLZA 4QF5A 2WGPA 3D9CA 4EY0A 2I6OA 1ZC0A 5EHPA 3BUOB 2H8HA 2Y68A 1U25A 1A81A 3GXWA 1Q1MA 3F9BA 1JWOA 2VTEA 2VTDA 3D1QA 5KADA 1HCTB 1M61A 1O41A 1QXKA 1A1AA 2B3OA 1ONZA 2H46E 2K79B 1G1GA 2HVLA 4CVMA 1YTSA 4RI4A 3AWEA 3T04A 1B47A 1A1BA 5EEQA 1O4JA 4MBBA 1ZFPE 1OEOX 2QCTA 2YDUA 3S4OA 2AUGA 2I42A 1SHDA 3NHNA 1RXDA 3VS1A 2F6FA 2F70A 1VHRA 2RORA 4QAPA 4TVVA 4D3RA 5J3XA 3VRYA 3VS3A 2VEYA 2LRAA 2PBNA 4JNBA 4OHEA 3QKPA 1Z3KA 2VOSA 4GE2A 2B4OA 3CBLA 2UAGA 1I3ZA 3OB1B 1GRIA 3VRQA 1SUGA 2CMBA 1UAGA 2Y67A 3O3LA 4CVKA 5J8RA 3I7ZA 3UF4A 2OUDA 1X6CA 4R0SA 1C83A 1O46A 2CI8A 1LYVA 3OP0A 3NRSA 1PTVA 1Q6SA 4K45A 1X27A 3KFJA 1AAXA 3MMJA 1F2FA 2J17A 1BKMA 2IZVA 1F1WA 2FJNA 2EO6A 5KABA 4NYHA 2JFHA 1AYCA 1R6HA 3N0AA 1A5YA 2EOBA 2CI9A 4DGPA 3RGOA 1K9AA 2XPCA 2H04A 5K22A 4DGXA 2ZN7A 3QCHA 4LUEA 2LQNA 4ICZA 1RJAA 2B07A 2QBSA 1G4US 3LYVA 5AXIA 1CSYA 2Q47A 2PTKA 2VEWA 1YGUA 2NT2A 1BLKA 5DF6A 2PI7A 5GJIA 3ZM6A 2C46A 1OETA 3CWEA 2H4KA 4UAGA 3VGOA 1JYUA 1J4XA 1XXVA 2CNFA 3EZZA 2VIFA 2EO3A 4BUBA 1R1QA 1LUNA 1QG1E 5BO4A 1LCKA 1E8CA 1BFJA 2H02A 3K2TA 1O43A 1X24A 5HDEA 4WU3A 1YN9A 2QBRA 4JE4A 2RF6A 3QCEA 2QDPA 5A5EA 5KA3A 3BRHA 1BKLA 1FQ1A 4ZI4A 4RI5A 3MAZA 3OMHA 4JBCA 1XA6A 5KAZA 1CJ1A 4X6SA 2L3TA 3VRPA 3VRRA 1UUSA 1FGSA 2K7AB 2F6ZA 2X5OA 2IUHA 3QCJA 1G7GA 4BUCA 1QADA 4FL3A 1FPZA 1SPSA 1Q6JA 3VS6A 1KA6A 2QEPA 2BV5A 2OC3A 1NWEA 2LCTA 4R0TA 4K44A 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 2MRJ A;  4FBN A;  1MKP A;  2J16 B;  2A3K A;  2DLY A;  2P4D A;  3SR9 A;  2Y1M A;  4RKK A;  3BUX B;  1A09 A;  1FMK A;  4FL2 A;  5DC9 A;  3QWY A;  2FCI A;  3V0F A;  4KYR A;  3V0H A;  1IJR A;  5EEL A;  1O48 A;  2BGE A;  2CM7 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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