4H4IA

Oye1-w116v complexed with the dismutation product of (s)-carvone
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
SFVKDFKPQALGDTNLFKPIKIGNNELLHRAVIPPLTRMRALHPGNIPNRDWAVEYYTQRAQRPGTMIITEGAFISPQAGGYDNAPGVWSEEQMVEWTKIFNAIHEKKSFVWVQLVVLGWAAFPDNLARDGLRYDSASDNVFMDAEQEAKAKKANNPQHSLTKDEIKQYIKEYVQAAKNSIAAGADGVEIHSANGYLLNQFLDPHSNTRTDEYGGSIENRARFTLEVVDALVEAIGHEKVGLRLSPYGVFNSMSGGAETGIVAQYAYVAGELEKRAKAGKRLAFVHLVEPRVTNPFLTEGEGEYEGGSNDFVYSIWKGPVIRAGNFALHPEVVREEVKDKRTLIGYGRFFISNPDLVDRLEKGLPLNKYDRDTFYQMSAHGYIDYPTYEEALKLGWDKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title X-ray Crystallography Reveals How Subtle Changes Control the Orientation of Substrate Binding in an Alkene Reductase
doi rcsb
molecule keywords NADPH dehydrogenase 1
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces pastorianus
total genus 155
structure length 399
sequence length 399
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4h4iA00
1TPC1 1UASA 3UXDA 2NLIA 3GXPA 4O1AA 1YXDA 4N9CA 4O12A 4QITA 3K30A 2X1RA 2CLLA 3TSMA 1QOQA 2NXIA 4BWLA 1UUOA 4RX0A 3QH2A 1OFQA 2RDUA 5EMUA 5K7JA 3CTLA 1YDOA 2CZFA 3S8HA 1L6WA 4YLWA 3L67A 4O53A 2QJIA 1ZAHA 3FYPA 2OX1A 4ZQPA 4ZVJA 3ZR4A 3F4WA 2A21A 4JNMA 3GR7A 3LHVA 3EX6A 3LLDA 4DF0A 1KM3A 3P8IA 4X2RA 4LV4A 4WJEA 1FWSA 5DBUA 3EX3A 3W85A 3VCRA 4UTTA 2VEPA 3OVRA 3VKJA 4AMAA 1ICPA 5F2IA 4ADSA 2C14A 2YFNA 4BI6A 1DHPA 3W88A 3W7GA 3M6YA 5FEWA 1ME8A 4GUIA 3V1PA 1SPQA 4HKPA 4UTWA 2ZZ6A 5K4XA 3HO8A 3NVTA 3NQ8A 5EL1A 1AW2A 2EGZA 3R5EA 2H3DA 1T99A 3QFEA 1LDCA 2GPTA 3MI2A 3OVPA 4JEQA 3BW2A 5HWNA 3CLMA 2Y7EA 3E96A 3L21A 3CU2A 3L5LA 3IIZA 3C2OA 4UTIA 3KOFA 3C2RA 1ME7A 3W71A 1BKSA 2YW3A 2WPBA 1GJPA 1OX6A 3LHTA 4FNSA 4WX2A 1PCWA 3S1XA 5DCEA 4NUWA 2C3ZA 1KLYA 3M41A 2TYSA 3W86A 4LNYA 5FEXA 1Y0EA 4DO5A 1TJRA 3JS3A 1SSDA 1RVGA 5I3IA 2BXVA 4LVFA 1PIIA 5HJLA 2YGYA 3W6YA 2CLFA 3M43A 4JX4A 2DZXA 3V75A 3NPWA 1GTHA 3W1LA 3LGEA 3DGRA 3WK2A 3HOJA 4QNEA 3G0XA 3W2NA 4ONVA 5AFDA 2ZZ7A 4N6FA 4AWSA 1AL7A 4Y90A 4K38A 1WYIA 2G5WA 4KKXA 2NXGA 3FS2A 4KWWA 3PC0A 1W3NA 3LCGA 1THFD 5G4EA 3TXVA 3CWNA 5AYZA 3QW3A 4YWIA 4UFMA 2CU0A 1W3IA 3CB8A 4A2RA 5AYYA 2Q8LA 1EB3A 2G95A 1OK6A 2WQPA 3L65A 2YZRA 5BMWA 4LT9A 3S5OA 1X1ZA 3UWYA 1J4EA 1XC4A 3R13A 2G96A 1OFOA 2HMCA 1M7PA 2VEKA 1T8XA 2G97A 4UR7A 4N4QA 5CZJA 3LRLA 1K7EA 2QJHA 3CIWA 3DENA 3T4CA 1JJKA 1ADOA 1K8XA 1KLZA 1ZHAA 3NO5A 4M7SA 1WOAA 3ZWTA 3OIXA 4LW7A 3EKZA 4OQVA 1ICSA 1DL3A 1G4TA 1QPRA 2ZQ0A 4FF7A 4UTMA 3QQ1A 5AOUA 4FX8A 4JTIA 1SR9A 1UCWA 1RD5A 3TH6A 5BNKA 4MIMA 1YDVA 1WQ5A 1XBYA 4O19A 3LRKA 1JCXA 3GYEA 2XN1A 4NVTA 3W2MA 4OBTA 4OHQA 4YCOA 1LLZA 4MZ1A 2X1SA 4BFAA 1KM4A 4QNWA 3USBA 1F6KA 1TYGA 3CQ0A 4R33A 5DCDA 3MWAA 2Q8ZA 4I7UA 4XTDA 4Y8FA 4FEZA 2QKFA 4GWEA 4X3ZA 1DVJA 3B8DA 4Y96A 3T78A 3DI1A 1FX6A 2FB2A 3G0SA 4AVFA 4UTUA 3LOTA 3NAVA 1F7BA 2E77A 4FB7A 2Z0IA 1O94A 2B0MA 5HQEA 1FDZA 1H51A 3Q2DA 1K02A 2YCEA 4GC4A 4QIUA 3W2KA 4P61A 1JRCA 4NJJA 3D0CA 1GPWA 3SW6A 4FX6M 1W37A 3B4UA 1OK4A 2Y6ZA 1R46A 4QSHA 3NQAA 3GDLA 5TBOA 1Q6QA 2Y7GA 5J5DA 3L68A 3PUEA 3T55A 4UMCA 2VELA 5G2WA 5BMXA 1KV8A 5D03A 4BF9A 2CLEA 1N8FA 5HWJA 4YXGA 3QMTA 3UPBA 5KINA 4POCA 3IIOA 3P84A 5CPOA 5ABTA 5HULA 2C13A 5E93A 4Z1DA 4OT7A 2B7OA 4UC5A 4A3UA 2EHHA 3TJXA 3FOKA 2V82A 3IGXA 4LVBA 1W54A 3IIXA 4HHPA 1SUXA 2B7QA 4O16A 3BGJA 3KAOA 5F4WA 1FQ0A 1W8SA 1X1OA 4JXCA 3TROA 1SO3A 1OYCA 1QOPA 3DKLA 4UTJA 1M7OA 3Q58A 1QPNA 4N6EA 4GRSA 3SFKA 3NPXA 5GVJA 4LY8A 1RR2A 1JQVA 3LHWA 3NQ2A 4DO4A 2JKEA 1TRIA 2QCNA 5LKYA 3MO7A 4FO4A 3O6CA 2QCDA 3BG3A 2EKCA 1LLWA 3TC7A 3KVLA 3U6WA 1FY6A 2H6RA 3QPZA 4UNKA 2W0UA 1W31A 3S5YA 3E9AA 3W1AA 2CZ5A 1FCVA 1ZAJA 4LOCA 2GVJA 4RZ5A 5D02A 1DOSA 3G8RA 3TXZA 1HUVA 3FKRA 1W5MA 4LVDA 4ADUA 1TO3A 4UNLA 1HG3A 1SZEA 2JGYA 3PUOA 3NZRA 4ZZ9A 3GK0A 3IEBA 2Z1BA 4QISA 1GVQA 1KFKA 3H55A 5G2IA 3N2XA 4LS1A 4KFNA 2ZYFA 1OFPA 3PM6A 3A9IA 4LVAA 1W5PA 3LCIA 1YPIA 2DZUA 3MW7A 4UR8A 4LUJA 3PB0A 1PS9A 3F4NA 5D32A 3I7RA 3IGSA 4N9EA 2EPHA 2A2IA 4Z1BA 3W7HA 2QUTA 3TFCA 5KMYA 4ML9A 2R8WA 1P0KA 3HG2A 4FX7A 2ZRUA 4N4PA 1G6CA 1TMHA 4A22A 3ELFA 1TPH1 5G4WA 1TV8A 2QR6A 5L6UA 2E6AA 4NQ1A 4UFJA 1VHCA 4FNUA 1IXOA 1JVNA 5D2YA 4AWTA 1K7XA 3C2EA 2A4AA 2HTMA 4BK9A 2QCFA 3TC6A 2GQ9A 1GYNA 3M5ZA 3W1PA 2LLEA 3FLUA 4WUIA 1Z41A 3TAKA 4FNPA 4L4MA 3BLEA 3DFOA 3RFAA 1LCOA 2V2CA 2PRMA 2GQAA 1FWNA 2E68A 3EEGA 3M47A 2BX7A 3NQDA 5I3KA 2FPTA 3LI1A 3P81A 4O0ZA 5KITA 2OCZA 1JQXA 4S2CA 5LGXA 1HO1A 1A50A 2ZRXA 3B05A 5K4ZA 4MY9A 3RF9A 3WJSA 2ZRZA 1X6UA 2QAFA 2Y70A 3MYPA 3I6RA 4NJHA 4UXDA 4O11A 2FPVA 1TTJA 1FWRA 3NEVA 1NVMA 5LZLA 2GJNA 2ISVA 3NXFA 4CCEA 2ZTJA 1SO6A 3NQEA 3BG5A 1VYRA 4JN6A 3PVFA 1W3TA 3P80A 4IPIA 1QPQA 1VHNA 4NNAA 3VE7A 1P5BA 1TV7A 3BLIA 3QF0A 3W83A 1ZAIA 2W79A 4MFEA 4BR1A 3NM3A 3P60A 1KFEA 1U83A 2YW4A 4NZFA 5CG7A 1VPXA 2EF9A 4JY8A 2J88A 2P0OA 4HPXA 2D73A 4JYFA 4I7VA 1JRBA 3NL2A 1O60A 1DV7A 4PH6A 1VLWA 3GKAA 4IMFA 1H7NA 3EX4A 2ZBTA 1TPEA 3UWWA 4O50A 3CIXA 4OGZA 5FEPA 1BWLA 4OV4A 1XDLA 1LORA 3W7CA 2E5DA 2FJKA 4EWND 5FI8A 1SW3A 4AF0A 3ZFHA 2JGQA 3TMQA 4ORIA 1KM0A 5D04C 4C1KA 1R2SA 4PEKA 2JBMA 1QPOA 4ZQCA 3M44A 1TSIA 4FNRA 3P82A 2R14A 4QM1A 3TKFA 4UFKA 3MP5A 2JK2A 3LM7A 3QRHA 4O1BA 3INPA 3W3OA 5DXXA 3N34A 1VC4A 3RNDA 3FIGA 4QQ3A 3THQA 1H60A 1YDNA 3LTYA 3S6DA 2J24A 4IUOA 3AO0A 3HG3A 2FPYA 1FBAA 4TX9A 3A5FA 4JTTA 1ML1A 2X1TA 2FQIA 1QNVA 1OX4B 3IGUA 4MVAA 3N9SA 3QQ0A 2J9XA 3PF3A 5D38A 1XDMA 3KRZA 5F1UA 1D3HA 5BRBA 1D9EA 4Z1CA 2VEIA 2WV8A 3G1YA 3TUUA 3B03A 4HIBA 4Q33A 1G4SA 3PSWA 4RV8A 2NX9A 3BV4A 3EWBX 1MEIA 3PS7A 3WK0A 5D09A 1Z48A 3QYQA 1JUBA 4IGHA 2X30A 3ATZA 3ABRA 1W5OA 4AEOA 2ZRYA 3GZ3A 1VCGA 3U2OA 4MFDA 5DY2A 3QC3A 4K7VA 3W76A 3TQKA 4LC8A 3A5VA 3ABOA 4LC6A 1Q6LA 2YFOA 2CZDA 5G2HA 5C5YA 3M0ZA 1PL9A 2H8ZA 4ZMGA 5FEZA 5BW6A 2VFHA 1LM1A 2QDHA 4O10A 3UPWA 4ZL1A 4ADTA 1X7FA 1OX5A 1CI1A 1CW2A 2VFGA 1MEHA 3KRUA 2NV1A 3Q37A 3W73A 1IIHA 4XKYB 5KZMA 4R7JA 2V9DA 1W5NA 3RLUA 1L6SA 2RKXA 3L0GA 3C3NA 2FFCA 2HSAA 1FCUA 1LRNA 1UUMA 4TIMA 4XBSA 5AHMA 1GWJA 5FF7A 3LBMA 3BPWA 3CT7A 2DJXA 3LHYA 4O57A 4CCDA 3HIJA 4LUIA 2QDGA 1S5WA 1ZENA 2FTPA 5AHEA 3ANYA 4O28A 3QMSA 3HMJG 3CWOX 3G24A 4Q32A 3PY2A 1F76A 1RPXA 5K9XA 2ATMA 2CLHA 1B3OA 1R47A 4NU7A 3ATYA 4MKNA 1AW5A 3W70A 5LNSA 2CLIA 2A85A 4EOUA 3O07A 4UMBA 2ZZ4A 1VLIA 5G1TA 1LTDA 4GFSA 2A1YA 2BSLA 3DAQA 4PC8A 1QR7A 3IV3A 1I2NA 3O06A 3LV5A 4P2VA 1H7PA 4UFHA 1JULA 3NG3A 2QAPA 3C4UA 1VRDA 2FIQA 2V81A 2DU2A 3LHZA 2W6RA 1F2JA 2DP3A 4ALDA 4NZJA 5K9CA 1DQWA 2ZA3A 1G4PA 2CFFA 3S1WA 4GNJA 4K6AA 2VENA 3PAJA 1TTQA 3P74A 2BLEA 2DZPA 2NZLA 1A5AA 3NPUA 5I3FA 5D33A 4RK8A 1FWTA 4FIRA 3HG5A 1SFLA 3QEZA 1OYAA 2TMDA 2X2GA 3E02A 4DPPA 3M9YA 4Z1AA 3HQ1A 3GDMA 5LNUA 3GB6A 3CC1A 4S2BA 1NAL1 2WNZA 2ZFAA 3OVQA 5CPLA 4MY8A 1L6YA 2I1OA 3L0NA 1FCBA 4DELA 1MO0A 1YADA 5KSWA 4JTKA 1GQNA 4TMBA 3P5YA 1SZFA 5K3VA 4X22A 4O15A 3W1QA 3NL6A 1M5WA 3HGJA 3PWAA 4WY0A 4AB4A 2QCMA 2Q3RA 8TIMA 1RV8A 3NQ7A 3WFAA 4AH7A 5HUOA 4JDBA 4Z08A 3W7NA 5AHIA 1EX5A 5EYWA 3P7YA 4GUGA 3A23A 4R34A 1P4CA 4FNQA 3KVJA 4AHOA 1QAPA 3PR2A 3RMJA 3WJXA 3NQMA 3LCXA 3S1UA 4U28A 3L2IA 1C29A 5HNRA 3F1QA 3G1SA 3EWWA 1W0MA 3B06A 4GXMA 3G0UA 4AWUA 3W07A 5IBXC 1T0OA 4KFOA 2J9ZA 3S5ZA 3MMTA 1DJQA 4AHPA 5LNVA 1G4EA 3LXBA 3P61A 4GUHA 1KFLA 2VKZG 4N9DA 4LRSA 1IXNA 2CW6A 3GDTA 5U4NA 5LSMA 1LROA 1VS1A 3M5XA 1DORA 4N02A 3DI0A 1SW0A 5CPMA 4Q4KA 1KFJA 4NJKA 5KTLA 3MP4A 4HNUA 1PCKA 3NNTA 1RQBA 2WO5A 1LYXA 3CEUA 4LU0A 2YYTA 3S5NA 5CSSA 2ZZ1A 4JX5A 4XTIA 4Z0SA 1XM3A 2E5CA 4JR5A 4M6QA 3H53A 2CZEA 2KZHA 3HGRA 3NQGA 2VFIA 3SY5A 3WK3A 1LP6A 4RXGA 4TR9A 3OBKA 1K3UA 4D2JA 3LCFA 4MOZA 1OHLA 2C19A 1F73A 3L5MA 4NX0A 5HWMA 1HL2A 2GUUA 4ORMA 3W84A 1V7YA 2GJLA 3H54A 2QJGA 4O13A 2TSYA 1C9DA 3STEA 2RH9A 1EWDA 3SIZA 1G69A 2PRHA 4HSOA 3W7PA 1B57A 4RZ4A 5K9DA 2DZTA 3W7OA 1FUYA 3VE9A 3LLFA 1H7RA 3M7WA 1I4NA 4S1FA 3EX2A 2PCQA 3QJAA 1PE1A 3CEPA 3W7LA 2HS6A 1H61A 3TW6A 1WBJA 1NF0A 5G1YA 4QJ1A 4CQ9A 4YMZA 2I9EA 3W7EA 4E38A 4A21A 1GT8A 1VCVA 1LBFA 1C8VA 3C6CA 2WNNA 3MHUA 1B4KA 5D37A 4C1LA 4YCPA 3MHGA 4IJBA 5FESA 1GVSA 3GAKA 1ONRA 5F1VA 3KX6A 2YXGA 4XWUA 3HBLA 5SWUA 1EP1A 2ZZ2A 2C1HA 3PULA 3W23A 4GUJA 1VR6A 3O8AA 1G7VA 3W72A 4BWLC 3GVGA 2ZZ5A 2V5LA 1UJPA 2BWGA 5DY3A 3VI2A 3BW3A 5DELA 1T96A 1O5KA 5J5RA 3QPYA 3UZ5A 4EIVA 5CZTA 4KFPA 1B4EA 4Y9AA 2J9YA 4BI7A 3IRDA 2C16A 3W7JA 2DZVA 3DFSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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