4H5TA

Hsc70 nbd with adp and mg
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title New crystal structures of HSC-70 ATP binding domain confirm the role of individual binding pockets and suggest a new method of inhibition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 117
structure length 382
sequence length 382
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4h5tA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5tA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5tA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h5tA04
3LM2A 1TYQA 2HOEA 5JICA 5LJWA 1GLCG 1ATRA 1ATSA 4CD3A 2VCPA 3C0BA 3VEZA 4LC9B 3O5BA 5AQQA 3ENOA 1GLJO 4FWNA 3O80A 5KPRA 3KVGA 4PKGA 2P9IA 3CIPA 1HKCA 4M7YA 5AQMA 5BRHA 3AY9A 4M63C 4B9QA 4BRAA 3H6EA 3BEXA 1J6ZA 3I8BA 3UKUA 3VETA 5EY4A 5LJVA 3D2FB 3M6GA 4WQ5C 4Z94A 1C0FA 2ASPA 2IVPA 2GTDA 5AFUH 4H5VA 1P8ZA 4FWMA 3AAPA 4BREA 1ZC6A 4F9OA 1KAZA 4BG9A 3B8AX 3QICA 2ASOA 1DKGD 3DWLA 4BGAA 5FPDA 2QWMA 2V52B 3P4IA 3ZETA 2Q2RA 3FZKA 1GLDG 2E8AA 1HX1A 4BR9A 2P9PA 3VEXA 3MDQA 2GWJA 5AZJB 4BRCA 1NGFA 1LCUA 4BQZA 4CZFA 5EX5A 5AQKA 5FPMA 3A5OC 4CBXA 1DGKN 3DAWA 2P9IB 3IFRA 4CZEA 5AQRA 4E1JA 3A8YA 3GL1A 4H0OA 2A41A 3EZWA 1QZ5A 3H46O 3O6WA 5FPNA 3VEVA 4FWQA 3A5MC 5AQFA 2FLOA 4H03B 4H0YB 1G99A 4WQ5A 1RFQA 4BC3A 2J4RA 1KXPA 3MK6A 4CZHA 3ZX0A 2E2QA 1U6ZA 3MN6A 1QQNA 3VGMA 1RGIA 3EN9A 4JAXA 3H1QA 3QB0A 4H0PA 5F1XA 1YUWA 3VF6A 5AQYA 1NGGA 3H3NO 3QBXA 1RDWX 4BQLA 2P9SA 4H5WA 2WUSA 3CJAA 3H45C 4FWKA 5BREA 2Q0RA 5AZIA 3O08A 4JHDB 4EHUA 3DXKA 3LM9A 3ZETB 3FE1A 3CETA 5ADXA 2A6AA 1MDUB 3WEEA 4NO7A 3VF4A 1XQSC 2P9PB 4JD2A 3WXIA 3L4IA 3G25A 1GLFO 3KHYA 1ESVA 4IXCA 1GLLO 4WQ4A 1XC3A 2VWBA 3L0QA 3DJCA 3S41A 3CJ9A 2NRHA 3R6MA 5EOYA 1CZAN 2GEMA 4K42A 1Y64A 3VGKA 3R8EA 1U2VA 2V7ZA 5F2RA 4BROA 1SZ2A 2A42A 3BF1A 5ADXH 4IZ9A 1JCEA 3WXKA 4RCHA 2E88A 2P9SB 1BA1A 2CH6A 3WQUA 3A5LC 3EKUA 1BG3A 3DXKB 3KZBA 3RSEB 2ZGZA 3MN9A 4FSVA 4ISGA 4CZGA 3AARA 3JS6A 3SMPA 3J8AA 4FO0A 4FOEA 4BRQA 5AFUA 5BRDA 4JD2B 3UKRB 2HMPA 4ISFA 2E2PA 2FF6A 3D2EB 2ZWHA 4JN4A 4EHTA 1IJJA 1GLBG 1KAXA 1DEJA 1QZ6A 5EXWA 1NLVA 5AQIA 1HUXA 2GELA 3O1BA 3VEOA 1NM1A 1MWKA 3A0IX 1BUPA 1ZXOA 3TU5A 1HKGA 2IIRA 4M7XA 2I7PA 4BRPA 2E2OA 3D7EO 3H1VX 1BU6O 2F9TA 3FGUA 3ULEA 5FPEA 3MCPA 2KHOA 2QWPA 2E2NA 4MO5A 4BRDA 5AQUA 3DXMA 3VERA 3WUHA 4BC4A 3A5NC 4Y0WA 3FFKB 5AQGA 4PKIA 4A62A 1TYQB 5AQHA 2HF4A 5AQTA 5E84A 5JLHA 1S22A 1NMDA 1QQMA 2YHYA 2PAVA 4CJ7A 3WXJA 4BG8A 4HTLA 4IO8A 2Q0UA 4I6MA 3UE5A 3M1FA 1X3MA 1ZBSA 2PBDA 2VYPA 2OANA 1K8KA 5I9EB 4WQ4C 5E26A 3F9MA 3FZHA 2W41A 2YJEA 1H1VA 5AQXA 4CZIA 4DHYA 3M3ZA 3UKUB 2FSJA 3ZEUA 3L6QA 3U4LA 2A5XA 3EL2A 4AM6A 4EIAA 4NB4A 3VF2A 3LDLA 2BUPA 4XH5A 2YHWA 3QBWA 5CE3A 3GDQA 2P9KA 1NGDA 4DQ8A 3W3DA 4IJNA 2P9UA 1XUPO 1SAZA 5JLFA 3HM8A 2IVNA 5LY3A 4H0VB 1WOQA 1X9JA 1LOTB 2QWRA 1IG8A 2ITMA 3VEWA 1BWFO 1BO5O 3VESA 4BRNA 4I6MB 2P9LA 2YHXA 4O8KA 1YXQA 4MO4A 3GOIA 1X3NA 3CI5A 4RWTA 2F9WA 1Q18A 4H5RA 4XH4A 2Q36A 1C0GA 3O4WA 2QW9A 2DPNA 3MN5A 4FOIA 2QWQA 3ZEUB 1BDGA 2CGLA 5KQDA 3SLCA 4CI6A 1T44A 2Q31A 4CD1A 3HI0A 2A40A 1TUUA 3TPQA 3O8MA 4BRLA 3HTVA 4L3QA 1D4XA 1HJOA 3O1WA 2E20A 3VENA 5BPLA 5AQLA 2P9KB 3WQTA 2CGJA 3EKSA 5AZIB 4BR5A 5BRFA 2AP1A 4CZKA 3LDPA 2P9UB 4DB3A 3VGLA 4KBOA 4FWOA 4RTFD 4FWSA 3WEEB 3ENHA 3D2FA 5KPTA 4CZLA 4FL9A 4B1YB 4GY2B 5KPZA 3VOVA 4EFHA 2QXLA 2FSNA 2P9LB 3MMVA 4AM7A 1HLUA 4FWLA 3CJ1A 3CHWA 3CERA 2V51B 3ZX2A 4BRIA 2P9NA 2YCHA 4BRKA 1OKJA 4J8FA 4CBUA 3OHRA 1GLEG 4BC5A 2HF3A 3CQXA 4FPBA 3VEYA 4BRFA 5AQPA 1U2VB 3C7NA 2FSKA 5AQVA 1NWKA 3IMXA 4B1WB 5AZJA 2I7NA 3WT0A 2YI1A 3LL3A 4IWVA 1GLAG 4H0XB 3GE1A 3BP8A 4MLEA 5ELZA 4BGBA 1Z05A 4EAHD 2V7YA 5BN8A 2ZGYA 4GNIA 2NZTA 3CJ7A 5EVZA 3U9ZA 4BR4A 2D0OA 3FR0A 4JNEA 2IVOA 4B1ZA 1T6DA 4A2BA 3W0LA 1V4SA 2ASMA 3ID8A 3WXLA 5BPNA 4BRGA 1QHAA 4YDUA 4B1UB 2E1ZA 3SJHA 5BN9A 1HKBA 5AR0A 3U9DA 4A2AA 4HWIA 3UB5A 3MN7A 4CZMA 2FF3B 1QQOA 1NGEA 2ZF5O 4PKHA 1TUYA 3VPZA 2W40A 4PL8A 4JHDA 2QWNA 4WYBA 2P9NB 2D4WA 4IJAA 4DCHA 3HZ6A 5TKYA 1E4GT 4BR2A 2CH5A 3HSCA 4H5TA 3C7NB 1E4FT 4XEIA 4BR7A 1MA9B 3ULEB 3H3OB 2D1KA 3ATUA 3AAQA 3ATVA 3GG4A 1SQKA 4ISEA 1S3XA 4BR0A 1NGBA 2UYTA 3DXMB 4K43A 5JMVA 1R59O 3EO3A 4CZJA 1MWMA 4A61A 1JCFA 3FZMA 3BF3A 4BC2A 1NGIA 1BOTO 4FWRA 5AQSA 3QFPA 4B1XB 5F0XA 3CJCA 4BRMA 5AQNA 1HPMA 3LDQA 2EWSA 3SK3A 5BPMA 3FZFA 4FPAA 3LDOA 4QS8A 4BVPA 2NLXA 5AQJA 1KAYA 4BVOA 2A3ZA 1K8KB 4B1VA 1ATNA 4BRHA 3RSEA 4C23A 1EQYA 3JXUA 4FWPA 5AQOA 4K41A 3IDHA 3SMSA 3U8XA 3FZLA 2FXUA 3LDNA 5KQ8A 1WUAA 3UKRA 2BTFA 2QWOA 5AQZA 4QS7A 3D2EA 4O5FA 1NGAA 3QFUA 4H5NA 1V4TA 3ZX3A 1YAGA 2Q1NA 2YJFA 2QM1A 4XH1A 1YVNA 1BA0A 2H3GX 2GWKA 5AQWA 3GBTA 2Q97A 2E1YA 3FLCO 3I33A 3CJBA 5B8HA 3QMLA 1NBWA 4K25A 1JCGA 3R9PA 4PL7A 3BUZB 2D0PA 3HBTA 3CQYA 4H0TB 4CBWA 2AA4A 4MLHA 4YDUC 1T6CA 1NGCA 1NGHA 1NGJA 2QWLA 5BR9A 3QDKA 2GUPA 3IUCA 1Z6RA 2CGKA 4QS9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LM2A 3T69A 3SYZA 5LJWA 1OMYA 2NNWA 1NG9A 1ATSA 2YIOA 2VCPA 3AVKA 1VQON 1GPSA 3ENOA 4JYAK 4H8KA 4DSEA 2BANA 2ZD1A 4KI6A 3KVGA 4CGFA 5IWAK 4JI3K 3J80O 2X78A 1P00A 4PKGA 4AF1A 2P9IA 1NKEA 1S6PA 4E7JA 4M3XA 2MBKA 3VQ4A 3ZT0A 3E9LA 1HNZK 4B9QA 2IAJA 4NXMK 3H6EA 3SBTA 4FJHA 4JKGA 5HLFA 3VETA 4DTMA 3LAMA 1JKHA 2WTUA 4Z4FA 3AAPA 4RW4A 1ZC6A 1RBTA 4C8OA 1NE5A 4E7HA 3OYGA 4CJKA 3DWLA 3TAMA 3DRPA 3P4IA 2V52B 3ZETA 2Q2RA 2VG5A 3C94A 1HX1A 4BR9A 2G8FA 3SV4A 2P9PA 1MU2A 3OTOK 4BRCA 4CEBA 2OA8A 4BQZA 4CZFA 3NVMA 5AQKA 5FPMA 3A5OC 3DAWA 4CZEA 3F2KA 4LY7A 5HRRA 3A8YA 3GL1A 4H0OA 4IBNA 4BWJA 3M8RA 2A41A 3AVGA 3DLEA 3L2WA 3CQ8A 4BDPA 4HUGA 3A5MC 4WQ5A 4IG3A 3U3GA 3NF8A 3MK6A 5C25A 3ZX0A 3KK1A 4ZTFA 3ISNC 1U6ZA 3MN6A 3Q7CA 1EWQA 2QEXN 1RGIA 2EHGA 3EN9A 4JAXA 5KRTA 1VSHA 2R7YA 3OYEA 3NGIA 4DV3K 1U4BA 1NGGA 2HHVA 4ELUA 2FBXA 3CJAA 3H45C 5BREA 2O8FA 4JI6K 4CJRA 3THYB 3NCIA 4DV2K 3SI6A 4AHCA 4EHUA 4YOWA 4JV5K 3LWMA 3WNHA 1BCMA 4FJKA 3WEEA 4NO7A 3VF4A 1XQSC 2X6NA 4JD2A 4CW7B 3KLFA 4FLUA 3MX5A 4DU4A 1FKPA 4B9LA 2NRTA 3KHYA 3MX2A 1ESVA 4IXCA 1X9SA 4OPAA 4CGHA 3DJCA 1NH5A 1TKXA 3CJ9A 2RF2A 2QI2A 4W5RA 1CZAN 2GEMA 1RNHA 3NF6A 3D6RA 1Y64A 2OTLN 3MECA 1U2VA 4BROA 2D5RA 3OJUA 3CPWM 1F21A 4B9SA 2HNDA 2HBJA 1BA1A 2JDQD 3A5LC 3QEWA 3EKUA 3RSEB 4C8LA 3MN9A 4FSVA 4JKEA 3OYCA 1VSKA 4HHTA 3JS6A 4DFKA 3SMPA 4FO0A 4FOEA 3HVTA 3UKRB 5KGXA 3VQ6A 3VQ5A 4LSNA 2Y1JA 4JN4A 2O8BB 4EHTA 1CXQA 3TR8A 4KKOA 1IH7A 5EXWA 1WN7A 3O1BA 1MWKA 3A0IX 1BUPA 4TSXA 4CHNA 1ZXOA 4M3ZA 3TU5A 1HKGA 4GV9A 4M7XA 4RW9A 1VSDA 3L2RA 3K5MA 4UAFE 3D7EO 3FGUA 1REVA 4PHTX 1RDAA 3AA3A 4UQGA 1GOCA 4CHZA 4IO9L 3KOXA 2P5GA 1POIA 1DT9A 2QWPA 4X62K 1NOZA 4KHWA 3VMFB 3OYBA 1M90O 3KTQA 2N66A 4R79A 3M8PA 3OYHA 2B4JA 4FZZA 2A1SA 4NYFA 2ZJRL 3IG1A 4RW6A 3SQ1A 5E84A 4CJPA 2YHYA 1JLAA 1C1CA 2KQ2A 4BG8A 2E6MA 4CEQA 3M1FA 2KFNA 3G4SN 4CQKA 1ZYWA 2EX3A 2YJEA 1H1VA 3CD6N 4KB0A 1IKYA 4ILHA 3M3ZA 1YJWN 1NK4A 4FJ7A 1XMQK 4DTXA 3B6PA 4H4MA 3CYGA 4FJ8A 1BIZA 4JEPA 3MEGA 1EP4A 4CJ3A 5LMUK 2PYLA 4JRPA 2YHWA 5CZ1A 3GDQA 1NGDA 4FW2A 4DQ8A 1XMOK 1HMVA 3AO3A 1SN4A 2MN5A 2UUCK 1VQLN 1YVUA 1XUPO 3PIOL 5CYMA 3CMAN 1TI5A 3HM8A 4V1DC 3KWIA 4DF4A 1JL1A 4H0VB 4CJFA 4QOZB 1S1TA 1X9JA 2ITMA 3VEWA 2KBJA 1BHLA 2HHWA 2P9LA 4O8KA 1LAVA 4MO4A 1LAWA 1XRSB 1RT5A 3IKMA 1CLQA 1VQ4N 1D9DA 3O4WA 3CXCM 1X1PA 2DPNA 2KW4A 3DRRA 1CN2A 1RTHA 2QWQA 1O1WA 3ZEUB 4AAZA 2A40A 4FCYA 2NRRA 4R5PA 3DRSA 3TPQA 1J5EK 4BRLA 5HBMA 1LQHA 4FJJA 1HJOA 1WWNA 4DUZK 4DFJA 5BPLA 1N33K 5BRFA 2CGJA 4JKAA 3LDPA 4DB3A 1T7EA 3VGLA 4KBOA 1SN1A 3BGRA 3CCUN 5HRSA 5DM7L 2MZ0A 3DMJA 2O8DB 3B6OA 5KPZA 3HPOA 2VQFK 1RBVA 4OLBA 1W0HA 2FBTA 3L2VA 3QEIA 1HLUA 4FWLA 3CJ1A 1NK9A 3QNOA 1YJ9N 4I2QA 3MXJA 3R2VA 4AHVA 1OH8A 1VQNN 3OHRA 2HF3A 5AQPA 2FSKA 3HT3A 3SV3A 4QAGA 4UJ0A 2XY7A 1TVRA 3VA3A 1QE1A 3WT0A 3LL3A 4IWVA 3OJSA 5I42A 3GE1A 4JLHA 4MLEA 1WBBA 4CECA 2ZGYA 3J7ZO 3IAYA 4GNIA 2D0OA 4AILC 3FR0A 1LQQA 2G8WA 1JLFA 3T1AA 4LF7K 4KREA 4CJEA 4J2AA 4BRGA 4YDUA 3KK2A 2E6LA 3SJHA 5BN9A 3KKRA 1HKBA 3U9DA 3ZSWA 1VQ7N 1WT7A 3UB5A 5CZ2A 3SPZA 2ZF5O 3AV9A 4DSLA 1DTQA 2W40A 4PL8A 4BDYA 2QWNA 3AVJA 1D5AA 4IJAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3LM2 A;  3T69 A;  3SYZ A;  5LJW A;  1OMY A;  2NNW A;  1NG9 A;  1ATS A;  2YIO A;  2VCP A;  3AVK A;  1VQO N;  1GPS A;  3ENO A;  4JYA K;  4H8K A;  4DSE A;  2BAN A;  2ZD1 A;  4KI6 A;  3KVG A;  4CGF A;  5IWA K;  4JI3 K;  3J80 O;  2X78 A;  1P00 A;  4PKG A;  4AF1 A;  2P9I A;  1NKE A;  1S6P A;  4E7J A;  4M3X A;  2MBK A;  3VQ4 A;  3ZT0 A;  3E9L A;  1HNZ K;  4B9Q A;  2IAJ A;  4NXM K;  3H6E A;  3SBT A;  4FJH A;  4JKG A;  5HLF A;  3VET A;  4DTM A;  3LAM A;  1JKH A;  2WTU A;  4Z4F A;  3AAP A;  4RW4 A;  1ZC6 A;  1RBT A;  4C8O A;  1NE5 A;  4E7H A;  3OYG A;  4CJK A;  3DWL A;  3TAM A;  3DRP A;  3P4I A;  2V52 B;  3ZET A;  2Q2R A;  2VG5 A;  3C94 A;  1HX1 A;  4BR9 A;  2G8F A;  3SV4 A;  2P9P A;  1MU2 A;  3OTO K;  4BRC A;  4CEB A;  2OA8 A;  4BQZ A;  4CZF A;  3NVM A;  5AQK A;  5FPM A;  3A5O C;  3DAW A;  4CZE A;  3F2K A;  4LY7 A;  5HRR A;  3A8Y A;  3GL1 A;  4H0O A;  4IBN A;  4BWJ A;  3M8R A;  2A41 A;  3AVG A;  3DLE A;  3L2W A;  3CQ8 A;  4BDP A;  4HUG A;  3A5M C;  4WQ5 A;  4IG3 A;  3U3G A;  3NF8 A;  3MK6 A;  5C25 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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