4H8JA

Structure of glua2-lbd in complex with mes
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structural basis of an artificial photoreceptor
rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Signaling protein
total genus 80
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8jA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8jA02
1LCTA 3VXBA 3I6VA 4ELPA 1Y20A 4LUBA 3E3KA 3MWBA 4OEVA 3H7MA 4BDQA 2VOZA 4ZZEA 1MY4A 1LFIA 1B4HA 4IY5A 2HCAA 3Q28A 3D4CA 2XXHA 3IORA 3MVYA 4DCXA 1S9TA 3R26A 3IK6B 4R6HA 3MZBA 1SDXA 3E9XA 3Q26A 1N7WA 2I0CA 1B3EA 2ONKE 3D4GA 5TP9A 3PMXA 4XTCQ 4K3FA 3MC2A 4KI0E 3PMVA 1DOTA 3VLUA 2DE3A 1NKXA 2ZYKA 3VXCA 5CBRA 1N04A 1GV8A 3G3KA 4OYVA 1IXHA 1MQGA 4ISUA 4NF5A 4U2RA 3MP1A 3H6UA 3T9XB 3KZGA 5BUUA 1PDAA 3FVGA 4LQ5A 5ICQA 4Q8RA 4XKRA 2B3BA 3HCQA 2DXRA 1MXWA 1DPEA 2Q2CA 3CFLA 3FGSA 3ILUB 1JETA 4Q5TA 2AIXA 1FTKA 3MVZA 3CRBA 1QULA 1OLAA 3LBSA 1B40A 3FD3A 4NF8B 3FVOA 4GL8A 2ANJA 1XS5A 2D21A 4IO5A 3RT8A 3KOSA 4RNSA 1MG1A 2I4CA 3GZGA 4XKQA 1N76A 3Q25A 4OMBA 1P1WA 3EN3A 4F19A 4NTLA 1GTKA 2ESNA 2XXVA 5I57A 4NF4B 5CMCA 2O1MA 3A3CA 1DSNA 1A54A 2ABHA 1D9VA 4JSOA 1FTLA 3OSRA 1ZIUA 1JW5A 4F3PA 3C4MA 2RC7A 4HCYA 5AA4B 4YB5A 1B3FA 5M2VA 2NWJA 1SD3A 1B1XA 2NOOA 3K00A 2Q9TA 4U23A 5L9SA 4OENA 3IAZA 2DP8A 5HM4B 2Z23A 4F3GA 3MUQA 4PFTA 5CMBA 3V8XB 5A5XA 1XVYA 4NF8A 3V83A 3FASA 2IEEA 4O3BA 2QS1A 1WVJA 4X9TA 4H8JA 3DELB 1EZPA 5JTYB 5F7VA 4BLAA 3KFMA 2Y7PA 3JYRA 1YCJA 4NF4A 1FQDA 3E13X 3T9VA 1IITA 1SI1A 3TPAA 4TLLB 3IR1A 3RY3A 1A7LA 4R6YA 2Q88A 2O7IA 3CSBA 3U94A 1QW0A 4PFYA 3FVKA 3TFLA 1IXIA 2F36A 1LB8A 1Y4TA 5K2XA 3CIJA 3G3HA 2G93A 1P1QA 4R2FA 3LR1A 2XXXA 1CB6A 1S50A 3OEKA 4WEPA 4PFUA 2UXAA 4NMYA 3T9UA 1Z7NE 3H6WA 2XD2A 3IOTA 4OTEA 2NVUB 4MLQA 3S9MC 1LGBC 2F34A 4P11A 5B70A 1GGGA 5IKBA 3HHFA 1MPBA 1ANFA 3I3VA 1ZKBA 3C35A 3PGFA 3FJGA 4I62A 1B0HA 4IGRA 3PUVE 2DQVA 4QHQA 3PV0E 1IXCA 3S9EA 1FQAA 2UVGA 2HQ0A 3K0VA 2F7CA 4OESA 1MY2A 1YTVA 4MLVA 3OMBA 4KD5A 4KR5A 3RT6B 1VFDA 2DOJA 2Q2AA 2CMOA 2GFEA 2QPQA 3U8QA 2F5XA 2DWJA 4KYEA 3SESA 4QFPA 3SETA 4HCWA 2VHAA 4OVJA 3GBBA 3C31A 4IO2A 3K6XA 4POWA 3RLFE 3PPOA 4WKMA 2XXUA 3TTNA 4FECA 4JSDA 5KDTA 3MPLA 4U4SA 4F1YA 4QFNA 2XX9A 1UIVA 4G8MA 1WDNA 2BJJX 1SW1A 2AL5A 3VLWA 2V25A 2F7AA 3QYTA 4MF3A 2OCUA 3QUFA 5H8NA 3KEIA 1OQHA 3OO7A 4HTGA 1BLFA 1N3WA 1PBPA 3FZVA 2QSXA 3UGWA 2O68A 3PU5A 4TQUQ 4XIGQ 1B52A 2H98A 1UTBB 4TOZA 2OLBA 3RPWA 2P0SA 1ZBMA 1RYXA 5KCJB 2B3FA 3KJ7A 5ICTA 3OO9A 2XHDA 1MY1A 3AXFA 5EHMA 1OQGA 4G68C 1O64A 1A40A 2VD2A 3U1OA 2PX1A 5AA2D 5I58B 4FIMA 4AB6A 4P0IA 3JV9A 4FE8A 4PP0A 3PUYE 3VE1B 3G7WA 4IO3A 2I48A 3TKDA 3KN7A 2HAUA 4EQBA 2FNCA 2B65A 4LZ7A 2OWSA 2GHAA 4R9GA 3RQTA 5L9OA 5JK4A 2UVIA 2DXYA 4U22A 4E0XA 3IB0A 4GWOA 4Z0IA 5CMKA 4Q30B 3PUZE 3TODA 4PFWA 4X1DA 1L5TA 2QL3A 4TLMB 4XKNA 4GLIA 2X7QA 1AH5A 3PUXE 3MP6A 3V5AA 3RUMA 5L9MA 4FATA 2E1SA 2GHBA 3UN6A 2XD3A 4YKIA 2ZYOA 4M1VA 2I0BA 2RC8A 2ZNTA 3EQ1A 3MJNA 2Y7WA 5IAIA 2VGQA 4C1UA 2HAVA 1B7UA 1EU8A 3IB1A 1JEVA 2XXTA 4ND9A 3EPEA 2RINA 1Y3PA 2HZLA 1FTOA 1EH3A 4N13A 2DYXA 4LZ8A 3B6QA 3K01A 1A99A 2QS3A 1QVSA 4NF5B 3LUYA 4I1DA 1XHYA 1BKAA 1EZOA 4RYAA 1SVXB 3ONMA 2ZNSA 3DP4A 4F3SA 4ELQA 4LA9A 1MM7A 3M8UA 3FV2A 2VP1A 3CSGA 1OVBA 4N07A 4BDNA 3CR9A 1NNKA 3FV1A 4OFJA 2O51A 3IO4A 4RPOA 4U1OA 1F9BA 4F18A 3FJMA 3UP9A 1FW0A 4MFIA 3H03A 3MVWA 3E4RA 4H1XA 4R2BA 3DLNA 3TTRA 1B32A 5I57B 2O1LA 3IJOB 3FJ7A 5H8HA 3K6WA 1TT1A 4IY6A 3KGCA 3M3LA 1MDQA 3RNNA 4OHNA 3CFZA 3UK4A 2PVUA 3KSJA 1SW4A 1MH4A 3OEMA 2A5SA 3BBRA 3SDFA 4R74A 4QF9A 1Y1MA 1USYE 1ZU0A 1GR2A 3KN8A 2ONRA 3FXQA 5A5XB 5CMMA 4UACA 3N5LA 4RK9A 3K1NA 2XX8A 1P1UA 2H5YA 3TYHA 1LAXA 1VE4A 3R7XA 2QRYA 2Y7KA 2PBWA 4X48A 4YMAA 4OQOA 3HV1A 2HFBA 2F35A 5I2NA 4NWCA 2DE2A 4M4GA 3GBAA 4QFLA 3K2DA 3VFJA 1NNTA 1QUJA 1S7YA 1MPCA 4F1VA 3USDA 4DIGA 5F1QA 4R75A 1OMPA 5DYHA 1PB9A 4U1ZA 2PYYA 4EF2A 1MXXA 3VLVA 5CM6A 4ZZAA 1AOVA 1UTHA 3HHGA 2F78A 2RCAA 4GIZA 3OD7A 3UORA 3ODBA 2REJA 1B5IA 1SBPA 3KJTA 1OVTA 4ELOA 4GL0A 2OZZA 4UA8A 2A5TA 3GXAA 3O9PA 3S2VA 2ZMBA 4QFKA 1XVXA 4OWDA 4EQ9A 3EF7A 4G68A 1JW4A 2QS4A 4RJZA 2UYFA 1A55A 5HBCA 4KHZE 1FTMA 5TPAA 5FTIA 5ITOA 3GLBA 1B4ZA 4C0RA 1QKAA 1R1NA 4BDLA 4KYDA 2ZXTA 2H25A 4MBPA 2O84X 3MVXA 3QK6A 1FQBA 3VDFA 1M5DA 4AQ4A 3JZJA 4YICA 5BWJA 2M8CA 4LVQA 3IL1B 3IB2A 4FORA 5DT6A 2PT2A 3BKIB 1JQFA 1H43A 2DSFA 2H4IA 5ELVA 5H8FA 4ONYA 3TCFA 2Q8JA 1LAHE 1FQCA 1BIYA 5AE4A 3C9HA 2F8DA 2F97A 3HSTA 4ESXA 1II5A 1TFAA 3I5OA 1B5JA 4HS7A 5KDTB 3MQ9A 1XT8A 3C36A 3C32A 1R9QA 5CRYA 1ZLQA 1YAEA 3LSXA 3TQWA 3N6UA 3HN0A 2O7UA 1NNPA 4YKKA 4C1TA 4F2OA 1ZJLA 3N6TA 5H8QA 3A3UA 5H8NB 4HW8A 1B05A 5K2YA 4JWXA 1P99A 2WKYA 4NF6A 4ZS9A 5I59A 1LBCA 3LC8A 3WAFA 3K02A 3O29A 1H76A 3QAXA 3RTFB 2P2AA 4QSCA 4X1BA 1UIUA 3W9VA 2H9BA 4H0WA 3RN8A 4YU0A 3G3GA 4JXIA 4GD5A 1ZMGA 4OZ9A 1LAFE 3U92A 1USYH 4R6KA 3G3FA 1HSLA 3Q29A 2HEUA 4WXJA 3TUSA 1POTA 2I3WA 3BFTA 2PT1A 4DXUA 4O3CA 4IO7A 1SYIA 3L6GA 2PMSA 3ECRA 5I2KA 1TXFA 1MDP1 1MPDA 2AYSA 1DPPA 2O6AA 2V3QA 1N7XA 1B7HA 4E0WA 1PB7A 1I6QA 3W9WA 3B7DA 1A8EA 4F22A 4GRKA 4JWOA 3N26A 4AB5A 3QIMA 1LAGE 2ZNUA 3CI8A 4NEDA 3DM0A 4ESWA 4G77A 4QRZA 3R6UA 3IX1A 4JWYA 5FHNA 3ILTB 5FHOA 1RYOA 3SERA 1B1HA 5FHMA 1JVYA 3EHUA 2V93A 1QUIA 2CZLA 4RXLA 4EF1A 4U21A 2UVHA 3UA8A 2I49A 5DEXA 3PPQA 1IZ1A 3FXRA 1B3GA 1NFTA 1XC1A 1AIVA 5JEIA 3M3FA 3OOAA 3G3IA 1AL3A 1TFDA 1PEBA 2F6GA 1WODA 5FTHA 4JB7A 3CG3A 1LCFA 3IJXB 3TTKA 4OFLA 3TCHA 5TU0A 1YPNA 4H67A 3OENA 1P1OA 4RPNA 2D3IA 1OIBA 2YJPA 4YZZA 4IO4A 1URSA 1LFHA 1MQDA 2X7PA 1B3HA 1M5FA 2O69A 1Y9UA 3RGYA 4KFQA 1MQJA 1VR5A 2DS9A 3SEWA 4LQ2A 1US5A 3MW0A 2XXIA 2Q89A 5LOMA 4YAHX 1DTZA 5H8HB 3TCGA 2LAOA 3BFUA 1A8FA 1NH8A 1POY1 5AA2A 2QJEA 4ZECA 4ZEFA 1B3LA 4DXBA 2AL4A 2ZYMA 3P7IA 1IXGA 4KPTA 1URGA 2R71A 4DDDA 2I3VA 1MXUA 4U4XA 3KG2A 2OBGA 4NE4A 2YPNA 4FJPA 1IQ7A 3B6WA 1Q1KA 2HZKA 1PBQA 5I56A 2DE4A 4DXCA 1D4NA 5DTBA 1N3XA 1O63A 3T66A 4EXKA 3O28A 1CE2A 3S4UA 1B2HA 4MH5A 3TELA 3K1PA 2XXRA 3KOTA 3QXMA 3OELA 2Z8FA 1FQFA 1B51A 1B58A 1URDA 5I2NB 4YMBA 3SKPA 3O6GA 4EUOA 4I9DA 5EYFA 3T96B 1GVCA 1MQHA 2DWAA 1SI0A 3FIRA 4XXUA 4G8NA 1LB9A 3ZS6A 1O7TA 1I6BA 4FAJA 4F31B 5CI5A 3FATA 1MRPA 2H99A 2NUVA 1UTHB 4GVOA 1M5EA 3O6IA 3T9HB 4H6DA 2ZYNA 4XKPA 4F29A 1UQWA 2E0SA 1MXVA 4G2ZA 4Z7EA 4L17A 5ISUA 4EDPA 2A5TB 5L8DA 4IO6A 1MH3A 1SW2A 4WEDA 4G68B 3O97A 3DP8A 3EHTA 2DWIA 3VV5A 4FEDA 3OO8A 4NWDA 4RA1A 2FYIA 5H8SA 5TPAB 2OK2A 4G4PA 4H5GA 3B6TA 4GXSB 3PD9A 4GXAA 4THIA 1ATGA 2UYEA 3WAEA 1LBBA 2THIA 4ZEIA 1SYHA 4LZ5A 4I8CA 3HPIA 2I6EA 2RCBA 4YB6A 2QMXA 2X26A 2IA4A 3SEXA 1FTJA 4LATA 1B6HA 5H8FB 4YKJA 1B0LA 4O3AA 1QUKA 3K4UA 4LP2B 3G3JA 5I84A 2P1SA 3VVFA 1LSTA 3K6UA 3OXNA 5CC2A 1NL5A 3UIFA 3MP8A 3FVNA 1I69A 1PB8A 1HSJA 3MAMA 1LLSA 1H44A 5H8QB 4QFOA 1DMBA 4ZE8A 3ZSFA 1MXYA 3F11A 3U93A 3VVDA 4GFRA 2V3TA 3DP6A 4NF6B 2UVJA 3OSQA 4ZEKA 1RKMA 1QJMA 4EQ7A 5I59B 3O66A 3MPKA 1US4A 1B46A 3SEUA 1H3DA 1N0TA 3IO6A 2DWHA 3QSLA 2KLFA 1JVXA 3HO7A 2REGA 5J1DA 2GRVA 1MQIA 1P1NA 1I6AA 3H3GA 5AA4A 1D3KA 4OETA 3S9LC 3PD8A 3W15C 4F1UA 2W7YA 4H8IA 3H6TA 2I4BA 1Y1ZA 3KSXA 3SEVA 4F3BA 1R9LA 2F7BA 4BDRA 1H45A 5DVIA 1JNFA 3H6VA 3PPNA 2DVZA 4LONB 4BDMA 4GF8A 3CG1A 1M5BA 1BTJA 1D9YA 2RC9A 4GQOA 4R73A 3MBPA 5JTYA 2Z8DA 4ELRA 1KWHA 5I2KB 3FUZA 4KCDA 3TMGA 1ZTYA 2XXWA 2R9JA 1SQYA 2QMWA 2ALUA 2YLNA 4F2QA 1JEUA 1LFGA 4ECFA 1Y3NA 4YKPA 5AA3A 2I58A 4OFOA 3K1MA 1SW5A 3TDJA 1Y3QA 1R6ZA 1AMFA 4Q0CA 5AA1A 5KZTA 1Y4CA 3T93B 1MY3A 3OO6A 1EZ9A 2R6GE 1TWYA 1NMUA 2QS2A 4ZEBA 2Y7IA 4G8HA 4DE8A 3TTLA 3L6HA 4FEBA 3IOUA 4P0GA 3ZKLA 4GOTA 1IEJA 2HXWA 4N6PA 4ZE9A 1PC3A 3PMWA 1J1NA 5DEXB 1VFEA 4QSDA 3PPPA 3MZ9A 3PUWE 3RTWB 5CBSA 1IIWA 4EXLA 4KYSA 1VSOA 1MY0A 2Y84A 4JDFA 1BP5A 1FCKA 4DLDA 4R9FA 3H4ZA 2Z8EA 2RKMA 3CVGA 1FQEA 3IOWA 4H5FA 3THIA 3TQLA 4PQJA 5B7DA 1B5HA 1OLCA 1B9JA 4KCCA 1Q35A 3TTMA 1N84A 4RY1A 3CFXA 5HPQA 4POXA 4OXVA 4QSEA 2Y7RA 3U72A 1ELJA 3C33A 2XXQA 2VD3A 2DVCA 2V84A 1Z7ME 3N94A 2F6PA 3Q27A 3ZKKA 4JBZA 4PE5B 4IB2A 5ITPA 4DZ1A 2OJTA 5DVFA 3EHSA 2RF1A 3TAJA 2XXYA 3H06B 4OEUA 3V89B 3KN3A 5AA2B 1B7ZA 3TZAA 3A09A 1MXZA 1MM6A 1JW1A 4IGTA 3O6HA 3K6VA 3VVEA 3O2AA 2FA7A 3TEPA 4F39A 3C34A 1NH7A 2XX7A 1UTBA 2OWTA 3QUJA 1NNFA 4H65A 2D5WA 3M3KA 1M5CA 3LSFB 3S9NC 1QKBA 5KCJA 4YB7A 4R72A 5I56B 3SEYA 1HSEA 2G29A 2V3UA 3PPRA 3IOVA 2GH9A 1DTGA 4RK2A 2ONSA 1T0KA 5I58A 2Z22A 5DVJA 2XXPA 3LSLA 4OERA 4ZDMA 4PETA 1MS7A 3T22A 3MZ1A 1XOCA 4BDOA 3LSWA 4ZEDA 1IUDA 5TP9B 4DCYA 3FXUA 2NXOA 3KBRA 4KQPA 5EHSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IMEA 1LCTA 4GX4A 3VXBA 3I6VA 4GBWA 4ELPA 1Y20A 4LUBA 3E3KA 3MWBA 4OEVA 3QMFA 3H7MA 1FPIA 4LN5A 4BDQA 2VOZA 1CNQA 1FJ6A 4ZZEA 1MY4A 1LFIA 1B4HA 4IY5A 2HCAA 3Q28A 3D4CA 4MX6A 2XXHA 1LBVA 3IORA 3MVYA 4P8BA 5LDZA 4FBPA 4DCXA 1S9TA 3R26A 3IK6B 4R6HA 3MZBA 1LEVA 1SDXA 3E9XA 3Q26A 1NV1A 1N7WA 2I0CA 1B3EA 2ONKE 3D4GA 5TP9A 3PMXA 4XTCQ 4K3FA 3MC2A 2ZZWA 4KI0E 3PMVA 2XXKA 1DOTA 3VLUA 5FBPA 2DE3A 1NKXA 2ZYKA 5LTCA 3VXCA 5CBRA 1N04A 1GV8A 3G3KA 1DBZA 4OYVA 1IXHA 1MQGA 4ISUA 4NF5A 4U2RA 3MP1A 3A29A 3H6UA 3T9XB 3KZGA 5BUUA 1PDAA 3FVGA 4LQ5A 4MNCA 4XFEA 5ICQA 4Q8RA 4XKRA 4O94A 2B3BA 3HCQA 2DXRA 1MXWA 1QGXA 2QVUA 1DPEA 2Q2CA 3CFLA 3FGSA 1Q9DA 4MAGA 3ILUB 1JETA 4Q5TA 2AIXA 1FTKA 3MVZA 3CRBA 1QULA 1OLAA 3LBSA 1B40A 3FD3A 4NF8B 1IMFA 3FVOA 4GL8A 2ANJA 1FPLA 1XS5A 2D21A 1FBCA 4IO5A 1FPEA 3RT8A 3KOSA 4RNSA 1MG1A 2I4CA 3GZGA 4XKQA 1N76A 3Q25A 4OMBA 1P1WA 3EN3A 4F19A 4NTLA 1YXIA 1GTKA 2ESNA 2PFYA 2XXVA 5I57A 4NF4B 5CMCA 2O1MA 3A3CA 1DSNA 1A54A 1LBZA 1D9VA 2ABHA 4JSOA 1FTLA 3OSRA 1ZIUA 1JW5A 4F3PA 3C4MA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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