4H8JA

Structure of glua2-lbd in complex with mes
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis of an artificial photoreceptor
rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Signaling protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 80
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8jA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8jA02
1B3EA 2IA4A 3WAEA 3SEVA 2FYIA 3D4GA 2HFBA 3ECRA 4YAHX 1HSLA 5KDTB 2ZYNA 4YICA 4U21A 1MXZA 2Z22A 4R75A 3T9HB 4H67A 1TFAA 1URSA 2OWSA 4I8CA 3USDA 1LAFE 1MPDA 5CI5A 1BP5A 4LQ2A 3BKIB 2HEUA 2UVGA 4UA8A 3OXNA 1FQDA 3QAXA 1YAEA 1VR5A 3R7XA 2Z8DA 3RLFE 1B6HA 1N0TA 3RTWB 2OJTA 3RY3A 4EF1A 1MPCA 2A5TB 3O97A 1Z7NE 3K02A 4KPTA 4XXUA 3FD3A 1TWYA 2QS3A 1XOCA 4QFOA 4FECA 4ZE8A 4ZEKA 5L9MA 3MPLA 4JXIA 3Q25A 2DYXA 4DDDA 3UN6A 1B46A 4JBZA 5ITPA 2H5YA 3GZGA 2O6AA 2P1SA 3ZS6A 5CBRA 1JETA 2I3VA 3FVGA 4R9FA 3VLUA 1LFIA 3C33A 3CFLA 4DXUA 3THIA 1P1NA 4TQUQ 4YKPA 2VGQA 4KQPA 5A5XA 1D4NA 1FQFA 4WEDA 5DT6A 2ONRA 1A8EA 5BUUA 1IXGA 1PEBA 1ZJLA 1MQGA 3G3GA 4XTCQ 4PFUA 3VVDA 3KZGA 1JW5A 3OD7A 1FQEA 1MQJA 3KOTA 5AA4B 3LUYA 1A99A 3VLWA 3VV5A 5AA1A 3MVXA 4NEDA 3S9NC 2I0BA 3FUZA 4R6KA 4YMBA 3SKPA 3IB0A 1USYE 1S9TA 2CZLA 2V3QA 1N84A 1NH7A 3N6UA 1LAXA 4ZEDA 1B1XA 5ELVA 2VP1A 1TFDA 2F7AA 4I9DA 5EHSA 1AH5A 1P99A 1SW1A 4JSDA 2Z23A 3HO7A 5KDTA 1MY4A 4KCDA 1PB9A 4WXJA 1IXHA 3TPAA 1GVCA 1OLCA 1WVJA 2AYSA 2NOOA 2REJA 3TODA 3VLVA 3MQ9A 2AL4A 3OELA 4NF4A 5EHMA 4BDLA 3S9EA 3B7DA 3PUYE 4F31B 4BLAA 2UYFA 1PDAA 4IO4A 4JB7A 3VXBA 3K1MA 3ZKLA 2D21A 3FZVA 3CFZA 4LATA 4Q30B 4DXCA 3CI8A 1XVXA 4U1ZA 1Y4TA 2UVHA 3AXFA 3C36A 2RC7A 3K1NA 4FIMA 4OEVA 2QSXA 3FATA 1DTGA 4YU0A 1ATGA 1J1NA 1POTA 2F34A 1N7XA 2ONSA 3MVWA 3OENA 4TLMB 2ABHA 2DQVA 3MBPA 3S2VA 3PGFA 3G3FA 1ANFA 2PVUA 2GHBA 2HXWA 1IIWA 2F36A 4PFYA 1LFHA 4GXAA 1YPNA 3UP9A 2ZNTA 2OK2A 3O29A 4N6PA 4QFNA 3RQTA 1MXUA 4XKRA 4F3SA 3ILTB 2G93A 3TFLA 2NVUB 4H5FA 4GQOA 5CBSA 4KHZE 2Y7IA 4PETA 2DE4A 1MH3A 4G68B 5FHOA 3IOVA 1MXXA 3BFTA 2I58A 4MFIA 2GHAA 4ZEFA 2R6GE 3IO4A 4R73A 4ECFA 1I69A 1ZU0A 1FQBA 3KN3A 3PUVE 1DPPA 4KD5A 3KG2A 3IX1A 3HHFA 5H8NA 1OVBA 4BDOA 4EXKA 4EUOA 1JW1A 3QXMA 4OYVA 3G7WA 4F3GA 3HV1A 3VE1B 1H3DA 1SI0A 3M8UA 4OFLA 3EQ1A 2E0SA 1DOTA 3JV9A 1FCKA 4F3PA 2BJJX 1B2HA 2PMSA 1DMBA 1FTKA 1N76A 1VFDA 3UORA 4ZZEA 4NF5B 1SYIA 1LLSA 1FTJA 5K2YA 1OLAA 3HHGA 2Y7KA 1FQAA 4O3BA 2ALUA 3FVKA 4OWDA 1JEVA 4ELPA 3TTRA 3MZ1A 4YB5A 5HPQA 1XVYA 3K00A 5H8HA 4R9GA 3IOWA 3B6WA 1Q1KA 1UTBA 1UTBB 3PPOA 2PYYA 3LC8A 3T93B 5JK4A 1LBCA 3B6QA 3TYHA 1XHYA 2ZYKA 1SVXB 3G3HA 3Q29A 2QS4A 3QSLA 2I0CA 4GD5A 4WKMA 2OLBA 5M2VA 5DEXA 3TCHA 1EZOA 1ZTYA 2F6GA 1NNKA 3QUJA 3RNNA 3O9PA 3S9MC 4NF8B 3F11A 4DE8A 2NUVA 4JWYA 1B7UA 1VE4A 1LGBC 3HCQA 3FASA 2RCBA 3U72A 3EF7A 4KYEA 1Y3QA 3IAZA 2HCAA 1N3WA 3FGSA 3W9WA 3K6VA 2QRYA 3UK4A 3PPQA 2XXUA 3MVYA 2Z8FA 1US5A 4ELQA 3IJOB 2F78A 1FTOA 4YZZA 3N94A 1Z7ME 2QL3A 2Q89A 4OERA 1B0LA 2E1SA 4U1OA 3DP4A 2XXHA 1YTVA 1NL5A 2XXYA 2XXIA 2YPNA 3E4RA 4IO5A 1IZ1A 3IOTA 4F29A 1JVYA 1B0HA 3H3GA 4ZZAA 1B4HA 2ESNA 1ZIUA 1A54A 3IK6B 3FXRA 3IJXB 4OETA 4UACA 1FTLA 5H8QA 2LAOA 3O6GA 1MXYA 2FA7A 4G8HA 2H4IA 3U8QA 1XS5A 1B32A 1D9YA 1N7WA 2O7IA 2WKYA 3Q28A 4JSOA 4YKJA 5B70A 2DVCA 3QK6A 4DIGA 4F18A 3MPKA 1NMUA 4RNSA 4R2FA 4RPOA 1AOVA 4IO6A 4QSEA 1A55A 1A40A 2Z8EA 3KOSA 1D3KA 4H5GA 3C31A 2Q8JA 5TP9A 1EZPA 3L6GA 2X7PA 1MG1A 4NF4B 1JVXA 3ONMA 3H6VA 3T9VA 3KN8A 4U2RA 3CVGA 1SQYA 4AB5A 1QVSA 2UXAA 2I6EA 4NF8A 1GGGA 5ISUA 5I57A 4RYAA 1NKXA 1CE2A 2YLNA 4OFJA 4H0WA 3A3CA 2QMXA 2F5XA 2HAUA 1YCJA 2HQ0A 3O6HA 4IY5A 1LBBA 2DWJA 3FV1A 4KI0E 3SETA 3PD9A 4XIGQ 4EQBA 5HM4B 5L9SA 1T0KA 4IGRA 1S7YA 4HS7A 1F9BA 2NWJA 1LAHE 3Q26A 4BDMA 5BWJA 2DP8A 3OEKA 2P2AA 2XXRA 4ONYA 1OIBA 3TAJA 4QFLA 1Y1MA 1NNTA 3MC2A 4OESA 2DVZA 1S50A 3OO8A 1D9VA 4OENA 4F2QA 3SEYA 2I4CA 4JWXA 2Y7RA 3U1OA 4FJPA 1B7ZA 3KSXA 3EN3A 3HN0A 3G3KA 2QS1A 2V3TA 1LFGA 3CFXA 3QYTA 3TTLA 2KLFA 1HSJA 1LSTA 1R6ZA 1ZLQA 4DLDA 3EHSA 5AA3A 1WODA 2A5TA 4ELRA 1B4ZA 1MXWA 4NF6B 2F97A 2ANJA 1MQHA 1QUJA 4R72A 2XX7A 3JYRA 5I59B 4DCXA 3I5OA 2DS9A 2R71A 3CG1A 5I2KB 5K2XA 4Z7EA 4C1UA 5I2KA 1RKMA 5I59A 3ODBA 3FJGA 3T9XB 1P1UA 1LB8A 3FV2A 3RN8A 2V25A 3M3FA 5DYHA 2I4BA 3LR1A 3TQWA 5H8QB 2H25A 3MP8A 5AA2B 4E0XA 5KCJA 2O1LA 3O6IA 4U22A 4ZE9A 5LOMA 3V83A 2I49A 3GBAA 3TMGA 5JEIA 1B3FA 1L5TA 4KCCA 4H8IA 5TPAA 4G8NA 3T22A 5IAIA 4G8MA 4P0GA 3Q27A 4R74A 4MH5A 1Y20A 1MQDA 1Y3NA 5FTIA 1LCFA 1N3XA 1NNFA 5ICTA 4DZ1A 2VOZA 3LSXA 4KR5A 4YKIA 1DTZA 1SW4A 2DWHA 3MAMA 3TCGA 4BDNA 4I1DA 1UTHB 4ISUA 2HZKA 2VHAA 1A7LA 1ELJA 3TZAA 2QPQA 4O3AA 3U92A 1FW0A 3PMVA 1B5HA 1PC3A 1URDA 2OBGA 4Q0CA 5CRYA 4RJZA 2CMOA 3TKDA 2O69A 1IUDA 1O64A 2GH9A 1Y1ZA 2THIA 4RK9A 3RPWA 3RT6B 3RUMA 5H8NB 1LAGE 1MY1A 3LSWA 4H8JA 4E0WA 4FATA 4U4SA 2FNCA 1QUKA 1BLFA 4MF3A 2PT2A 3QIMA 4NE4A 4OVJA 1XT8A 1MDQA 3E9XA 4YKKA 3TDJA 4YB7A 4POWA 5DVIA 1USYH 4WEPA 1B7HA 3PUXE 4HCWA 1MPBA 3SEUA 3SESA 3OO7A 2ZXTA 2REGA 3MP6A 4QFPA 3VVEA 1QKBA 1QJMA 1B40A 1IXCA 1MY3A 2QS2A 4QSCA 1JW4A 4LA9A 2XD2A 5H8HB 3N26A 4OQOA 4IO3A 2DXRA 4RPNA 1IEJA 3KBRA 4PFWA 4RA1A 2ONKE 1SYHA 4Z0IA 3H4ZA 3GXAA 1UTHA 5FHNA 2D5WA 3FIRA 3N6TA 4MLQA 5A5XB 1XC1A 3TTNA 3K2DA 5L9OA 3R6UA 4LONB 4AB6A 3CG3A 3GBBA 3T66A 3MUQA 4OTEA 3TELA 3K0VA 3VDFA 2RC9A 3BFUA 4R6HA 3M3KA 1LB9A 2RINA 4G2ZA 2Q88A 4NWDA 2XX8A 3PUZE 4QRZA 3PUWE 2F7BA 1BKAA 1SD3A 2AL5A 2I3WA 2DOJA 4LVQA 1N04A 1KWHA 2A5SA 2ZMBA 3RT8A 2OCUA 1AIVA 1AL3A 2UVJA 5AE4A 1M5CA 1IXIA 1FQCA 2YJPA 2H99A 5CMKA 2PT1A 3FXUA 2XXWA 2RCAA 2DSFA 4LUBA 3T9UA 3C32A 3R26A 2ZYOA 2F6PA 2Y84A 5FTHA 4PE5B 3TCFA 1Q35A 5EYFA 3SDFA 3HPIA 3L6HA 3C9HA 5CMMA 5F7VA 3UA8A 4NF6A 5I57B 3OMBA 1B1HA 1UQWA 5JTYB 4M4GA 5AA2D 5H8FA 5AA4A 3EHTA 3CSBA 3K6XA 3N5LA 5TP9B 3SEXA 1POY1 4F22A 5ICQA 3O66A 1VFEA 3ILUB 4X1DA 3U94A 4K3FA 4GVOA 4O3CA 3TEPA 2F8DA 2Y7WA 2B3BA 5JTYA 3EPEA 3W9VA 2UVIA 4OMBA 1IQ7A 3KJTA 3OSQA 4R6YA 4RXLA 3MJNA 5CMBA 2XXPA 5TU0A 1I6AA 4IB2A 1GV8A 3ZKKA 4GWOA 4NF5A 1QUIA 1DSNA 4U23A 2Q2AA 3O28A 4GFRA 3OO9A 3C4MA 4LZ8A 1Y3PA 1MXVA 2O84X 4C1TA 3IR1A 3A09A 3FJMA 1ZKBA 1QW0A 4QF9A 4ESWA 3CSGA 1HSEA 1SW2A 1B9JA 1B5JA 1M5BA 3H7MA 2PBWA 3OOAA 4GL8A 2X7QA 2I48A 3E3KA 4AQ4A 2XXXA 4M1VA 1SI1A 1UIUA 1LCTA 2ZYMA 3FJ7A 4PFTA 1OQHA 2XD3A 4POXA 5FHMA 2VD2A 3I3VA 3OEMA 4OEUA 2OWTA 2GFEA 3BBRA 4G68A 4KYSA 4NTLA 4U4XA 2XXVA 4XKNA 4LP2B 5IKBA 2RKMA 4H6DA 4DXBA 4GLIA 5CC2A 3V89B 3TUSA 3QUFA 5H8FB 1B58A 3LSLA 4F2OA 2O1MA 2HZLA 2ZNSA 4YB6A 3HSTA 4H1XA 3MVZA 4GL0A 4X48A 3H6UA 3LSFB 2QMWA 4QSDA 1WDNA 4FE8A 4ND9A 1OQGA 1PB8A 4G4PA 3K6WA 1O7TA 1QULA 4R2BA 2M8CA 4TLLB 3SEWA 2F35A 3DP6A 4BDQA 4X9TA 4ELOA 1M5FA 1Y9UA 1SW5A 2F7CA 5DEXB 5I56A 4GXSB 2DWAA 1OVTA 3GLBA 5TPAB 4F3BA 2D3IA 4XKPA 4RY1A 3W15C 1SDXA 3TTKA 3JZJA 1RYXA 2G29A 3C35A 5I58B 1BIYA 5I58A 3P7IA 2ZNUA 3FVNA 4EF2A 3H6TA 3CR9A 1M5EA 4P0IA 3FVOA 1RYOA 1IITA 1MRPA 1I6QA 4OFOA 4GIZA 1B05A 1P1WA 1MY0A 1GR2A 1TT1A 3DP8A 3FXQA 5I56B 1EZ9A 1DPEA 3EHUA 1TXFA 1MY2A 3RTFB 3MP1A 2W7YA 4PQJA 3H06B 4ESXA 1QKAA 2GRVA 1M5DA 2O51A 2V3UA 5L8DA 3PPPA 4MBPA 2RF1A 3I6VA 3MZBA 1CB6A 3MWBA 4THIA 3TTMA 5DTBA 2PX1A 5I2NB 5I2NA 3S9LC 4JWOA 5DVFA 4LQ5A 2XXQA 3H03A 3LBSA 5F1QA 3UGWA 1B3LA 1NH8A 4ZEBA 4F19A 4GOTA 4Q8RA 3TQLA 1ZMGA 1US4A 3PV0E 3K01A 3CRBA 4EQ7A 1H45A 3PPNA 2AIXA 2UYEA 3PU5A 4GF8A 5B7DA 4LZ7A 2B65A 1H76A 1MH4A 3G3IA 1B3GA 2H9BA 1JEUA 1PBQA 2V84A 4MLVA 4Q5TA 4ZS9A 3OO6A 5KZTA 3V8XB 2DWIA 4G77A 2Y7PA 4H65A 4IO7A 5ITOA 5HBCA 3A3UA 3T96B 3WAFA 1B51A 4F1VA 1H43A 2XX9A 3IORA 4FEBA 4OZ9A 1R9QA 4HW8A 2QJEA 2Q2CA 1II5A 4X1BA 2O7UA 3KFMA 1MM7A 3KN7A 3MZ9A 4NWCA 4YMAA 3PMXA 1B3HA 1FTMA 2OZZA 3KJ7A 4PP0A 3O2AA 1ZBMA 4F1YA 2XXTA 4G68C 4EXLA 1AMFA 3KGCA 1R9LA 4NMYA 4QHQA 3CIJA 3KEIA 5CMCA 3VVFA 4HCYA 1MM6A 4GRKA 1NNPA 3C34A 3B6TA 4TOZA 2X26A 3PD8A 3M3LA 3RGYA 4L17A 5AA2A 3OSRA 5KCJB 2DXYA 5DVJA 2P0SA 3IO6A 4EDPA 5CM6A 3IL1B 3K6UA 4FEDA 4BDRA 1PBPA 2B3FA 3VXCA 3DLNA 3PMWA 3H6WA 4KYDA 1B52A 2DE2A 2R9JA 3U93A 4KFQA 2IEEA 2HAVA 1UIVA 1P1OA 1MDP1 1R1NA 4IY6A 1NFTA 1H44A 4LZ5A 3UIFA 4F1UA 1Y4CA 1GTKA 4C0RA 4JDFA 5H8SA 1VSOA 3E13X 4DCYA 3K4UA 2RC8A 1JQFA 3K1PA 1SBPA 2V93A 4XKQA 4RK2A 1MQIA 3DELB 2O68A 4FORA 4IGTA 3MW0A 2NXOA 3V5AA 3ZSFA 1B5IA 1OMPA 3IB1A 3IOUA 4IO2A 1O63A 1A8FA 5J1DA 4P11A 4FAJA 1BTJA 3G3JA 3KSJA 2VD3A 4N07A 4N13A 3D4CA 4OXVA 4ZEIA 2DE3A 3IB2A 1EH3A 4F39A 3DM0A 3S4UA 1MS7A 2Q9TA 4OHNA 1EU8A 1I6BA 2H98A 4I62A 4QFKA 3PPRA 3SERA 1JNFA 3VFJA 4EQ9A 4ZECA 4ZDMA 1PB7A 5I84A 1P1QA 2XHDA 4HTGA 1URGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WAEA 2P3VA 4GWXA 5IGAA 2FYIA 3ECRA 4YAHX 5KDTB 2ZYNA 4YICA 1MXZA 5JTYA 4R75A 4MCOA 2OWSA 1URSA 3USDA 5I7IA 4PC9A 4UA8A 2Z8DA 4KPTA 4XXUA 3FD3A 5L9MA 3Q25A 2FBPA 5ITPA 3GZGA 2P1SA 3ZS6A 2R8TA 3QMFA 3C33A 3CFLA 3THIA 4TQUQ 2VGQA 4WEDA 4PBQA 5BUUA 1IXGA 1MQGA 1JW5A 1FQEA 1MQJA 5AA4B 3SKPA 2XWOA 1EYIA 1S9TA 4XFEA 2CZLA 1N84A 1LAXA 4P1EA 1P99A 4PE3A 4KCDA 1IXHA 3MQ9A 4BDLA 4MNCA 1NV0A 3B7DA 3PUYE 2UYFA 4IO4A 4JB7A 2D21A 3CFZA 1XVXA 1Y4TA 3AXFA 4FIMA 2QSXA 4YU0A 1DTGA 1ATGA 1J1NA 4TLMB 1IIWA 2ZZWA 3UP9A 2ZNTA 2OK2A 4I40A 3B8BA 3RQTA 3ILTB 3TFLA 4H5FA 1FPEA 4GQOA 4PTKA 3IOVA 4MFIA 4R73A 2BJIA 1I69A 1ZU0A 3MSTA 4OYVA 1SI0A 3JV9A 1FCKA 1B2HA 4ZZEA 1LLSA 1FTJA 5K2YA 2Y7KA 4OWDA 1JEVA 4YB5A 4I3EA 1XVYA 2FIXA 1UTBB 3T93B 4PCDA 1LBCA 3TEPA 4GD5A 5M2VA 4GX6A 1EZOA 1ZTYA 3O9PA 2NUVA 1G0HA 3IAZA 5FBPA 1YXIA 2XXUA 1FPIA 3MVYA 4XEQA 1FTOA 4YZZA 2QL3A 4MHFA 1NL5A 4F29A 5ESYA 1NV1A 4O7MA 5IM2A 2ESNA 4OETA 3O6GA 1XS5A 1B32A 1D9YA 1EYJA 2DVCA 4IO6A 2Z8EA 2Q8JA 3C31A 3L6GA 1FTAA 1MG1A 3H6VA 3KN8A 2I6EA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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