4H8JA

Structure of glua2-lbd in complex with mes
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural basis of an artificial photoreceptor
rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 80
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8jA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8jA02
2Z8DA 1OLCA 2YLNA 1LFHA 2GHBA 4NEDA 4ZE9A 3QXMA 5TP9A 3MZBA 4FIMA 2QL3A 1MS7A 2GRVA 3Q26A 1XT8A 4HCYA 1RYXA 1B1HA 3UIFA 4ZECA 2YJPA 4GRKA 4EQ9A 3HN0A 2DOJA 2RC8A 2A5SA 2ZNUA 4X9TA 3K4UA 2E1SA 2Y7PA 4FECA 3PMXA 3RT6B 4XKQA 1VR5A 4RPNA 2R71A 3RTWB 4AB5A 4H8IA 3K00A 4FJPA 4FORA 3PMWA 2I4BA 1MPCA 1NNPA 3PUYE 3G3GA 1MXWA 2H25A 1MXUA 1FQCA 1JEVA 4KCCA 3OSQA 1SW5A 4ELRA 5AA4A 3QAXA 4DCXA 1D9YA 3M3FA 3TUSA 5A5XA 4JWXA 4F1VA 1P99A 4O3CA 3I5OA 1GTKA 4YKJA 4DXCA 4QSEA 3SKPA 3TMGA 1H45A 2F6GA 4YKPA 1NL5A 2RC9A 3LC8A 1SYIA 4EXKA 1SW4A 3GZGA 1JVYA 2QMXA 4IO6A 3W9WA 5H8QB 2ONRA 3ZSFA 2BJJX 5HPQA 1JW4A 4LZ5A 1DTGA 2ANJA 4OFOA 5DT6A 4YMBA 2O7IA 3H7MA 2V93A 4IY6A 2NXOA 1D4NA 1CB6A 1YAEA 1SD3A 5DVJA 4OZ9A 1DMBA 2HCAA 2X26A 3Q27A 1LAGE 4FAJA 4IB2A 4C0RA 1URDA 5H8HB 1FTMA 4ESWA 2Q8JA 4XTCQ 3MP8A 3K6XA 4ZEDA 4YU0A 4G8MA 3H6TA 3N94A 3RTFB 4U21A 5JTYB 2P0SA 3E9XA 1BP5A 3C4MA 3PUXE 1XHYA 4HCWA 2ESNA 3AXFA 1DPPA 4WEPA 2HEUA 4MH5A 1D3KA 3V83A 4FATA 1Z7ME 3T9UA 3E13X 5KDTB 3DLNA 4WEDA 4DLDA 3O6IA 5B70A 1GGGA 1H43A 3ILUB 3OEKA 1D9VA 3OO6A 3O66A 1PB7A 4PFUA 4OHNA 3CRBA 1BKAA 4KCDA 3UK4A 4POXA 1MXZA 4GL8A 3H03A 4M1VA 1FQBA 3JZJA 1UTBB 1ZIUA 1AL3A 4JWYA 4F3BA 1P1QA 3SEXA 3H4ZA 1MM7A 4G4PA 3PMVA 3IORA 3P7IA 3TCFA 4GLIA 4Q30B 2E0SA 4OFLA 5IKBA 2UVHA 2X7QA 2DS9A 4FEDA 1Q1KA 2G29A 2VP1A 2IEEA 1LAHE 4KR5A 1N76A 3B6WA 3T66A 3C33A 3TTKA 3IB1A 1SVXB 3N5LA 2NWJA 3O97A 1LB9A 2XX8A 2P1SA 4F3PA 1LBCA 1FTLA 4ECFA 1US5A 2F7BA 2YPNA 2XD2A 5I58A 1MXXA 4N6PA 4OERA 2DYXA 5I59B 2OWTA 1B1XA 3IOTA 5IAIA 4F1UA 4PFYA 3TKDA 1ELJA 3TEPA 2V3UA 1QUJA 2XXTA 1B7HA 4RJZA 2DXRA 1ZU0A 4LZ8A 1O64A 5ELVA 1NH7A 1P1UA 2I3VA 4LQ2A 4BDLA 2QMWA 5FTIA 4IO2A 1POY1 2O68A 2O6AA 4NF8A 3CI8A 1MXYA 1OQGA 1S9TA 3ZS6A 2UXAA 2OK2A 4G8HA 4EF2A 1H3DA 3PUVE 1Y9UA 1HSEA 4ISUA 3OXNA 3O9PA 3FXUA 2F8DA 3MBPA 1OVTA 3T9HB 4F39A 2XXPA 3SETA 2QSXA 3EQ1A 1JW1A 2QPQA 2DE3A 3OENA 4TLLB 1B3HA 5I57B 3FVGA 5I2KA 3PUWE 3TCHA 4QFNA 4QRZA 1URSA 1YTVA 5I2NA 1YPNA 3LR1A 3PV0E 2DVZA 3ONMA 3RQTA 3K01A 1SI0A 4RPOA 4F19A 2ABHA 4OEVA 5I56B 2DWIA 2V3QA 1I6AA 1A40A 1PBPA 4E0WA 3RT8A 3LBSA 4OFJA 3IR1A 2Z22A 5AE4A 1N0TA 1WODA 5DVIA 3W15C 2Q89A 3H06B 4ZEFA 3BFTA 4QFOA 2RC7A 3OO9A 1QJMA 3S9MC 5F1QA 3V5AA 3B6QA 4NF6B 4OESA 4OVJA 4ZEBA 4C1TA 5CBRA 3B7DA 3H6VA 3TYHA 2F7CA 1B2HA 2DQVA 1IXGA 1R1NA 3DP6A 4QSCA 4EF1A 1URGA 1SW1A 1P1NA 3HCQA 3HV1A 3BBRA 3C9HA 3JV9A 2D5WA 1CE2A 4R6HA 2RCBA 4O3AA 1WVJA 2A5TB 2I0CA 3TZAA 3BFUA 3KOSA 5HM4B 3FV2A 1T0KA 3GXAA 3FJMA 3GLBA 4N13A 4OTEA 1SI1A 1MY1A 3VFJA 1B7ZA 3MVWA 3KGCA 5HBCA 2HAVA 2REGA 2B65A 4R6YA 3PGFA 2PMSA 3V89B 1NH8A 1JNFA 4YB7A 1SQYA 3RY3A 5ICTA 5KCJB 2ZNSA 5K2XA 4H8JA 3MUQA 4ZEKA 4NWDA 5FTHA 1EZ9A 4GWOA 2H4IA 3H6WA 4PP0A 1MH4A 2DWHA 2W7YA 4XKRA 4PFTA 1A8EA 4KYEA 1MY4A 4NF5B 1B05A 3U94A 1SDXA 3PPRA 4EDPA 1IXIA 3MWBA 5H8QA 1JQFA 5DEXB 2X7PA 2AYSA 1HSLA 3MW0A 1FQEA 4JSOA 4F3GA 1WDNA 3IJXB 3PPQA 5ICQA 4F3SA 2F78A 1AMFA 3QYTA 5ITPA 4QFPA 4GOTA 1PB8A 2LAOA 3M3LA 2I3WA 2QS1A 3M8UA 3FD3A 3ODBA 5H8HA 4FE8A 2OZZA 4ONYA 4G68B 3E4RA 3FXRA 4IGRA 1MQJA 3VVDA 3LSFB 2PVUA 3IOWA 1BTJA 1QUIA 4I9DA 4H65A 2QRYA 1JVXA 4O3BA 3TTNA 2Z23A 4WKMA 5JTYA 1BLFA 5JEIA 2VHAA 4ESXA 4DE8A 1Y1ZA 3A3UA 3DM0A 1AOVA 3G3FA 3ILTB 2UVGA 1XOCA 4ZEIA 1M5BA 1TT1A 5H8FB 1ZKBA 2I4CA 3LSWA 2I48A 3OD7A 3FJ7A 4P11A 1PBQA 4WXJA 3K1MA 3TQLA 4KPTA 3LUYA 1YCJA 4EQBA 1OIBA 2XXUA 3TCGA 1LAXA 3SERA 5KDTA 4R2FA 1QKBA 3EN3A 4QSDA 3TAJA 3QUJA 1EU8A 4L17A 2Y84A 5CM6A 1N7WA 3WAFA 1UTBA 2P2AA 3IX1A 3C34A 1I6QA 4YB5A 3F11A 1PB9A 3ZKLA 1LGBC 3K1NA 3CVGA 2HZLA 1ZBMA 2QS4A 3RNNA 4ZE8A 1A99A 3FVNA 1VSOA 2PBWA 3UGWA 2AL4A 3VVEA 3IOUA 4G68C 2PYYA 1M5EA 3FIRA 1B4HA 2UVIA 4POWA 2QS2A 4PFWA 1LLSA 1HSJA 4RXLA 1MH3A 3HO7A 3M3KA 3T22A 1LFIA 2XXQA 1FCKA 2ZNTA 1Y1MA 3T96B 3FUZA 3U72A 1VFDA 3SEUA 1A7LA 3SDFA 1QW0A 4OWDA 4IO4A 3QSLA 3IO4A 4RYAA 3S9NC 3GBAA 5KZTA 2VOZA 5EHSA 3UP9A 5I59A 1B5JA 4KQPA 3EHUA 1B0HA 5FHMA 2Q2CA 4P0IA 1DOTA 5B7DA 3OOAA 2Z8EA 1TFAA 4PETA 4OMBA 1RKMA 1IITA 1NNTA 3UN6A 2O69A 5CBSA 4MBPA 4GL0A 3KOTA 4XXUA 3CSGA 2O7UA 3H3GA 4Q8RA 1B5HA 4GF8A 4OENA 1UIUA 3DP4A 4JSDA 1Y4CA 2RINA 3OO8A 4E0XA 1NNFA 5L9MA 3RPWA 4IGTA 1ZMGA 2DVCA 4GIZA 4YKIA 2Y7IA 2UYFA 1MG1A 1B3LA 3G7WA 3KSXA 4U2RA 2AL5A 1Y3QA 2F7AA 3Q29A 3D4GA 4X48A 3IJOB 3SESA 3FV1A 3B6TA 2F36A 3T93B 1Z7NE 4MLVA 4QFLA 5ISUA 4ELPA 4GVOA 5I57A 4TLMB 4X1DA 4H5FA 3I3VA 3QUFA 4DXUA 4YMAA 1IUDA 2HXWA 3R6UA 1FQFA 3CG3A 2XX9A 3TPAA 1R6ZA 3HPIA 3IL1B 4GFRA 1F9BA 1B3EA 3VE1B 2ZYKA 3CSBA 5H8SA 2OBGA 1VE4A 4M4GA 5I56A 3KN7A 5AA3A 1M5DA 4LVQA 3R7XA 3S4UA 2CZLA 2XHDA 1UTHB 1B7UA 4Q0CA 3PD8A 3HHFA 1LCTA 3KG2A 5L9OA 2RKMA 1FTJA 4U4SA 2R6GE 1KWHA 4JXIA 2DP8A 4R73A 2NUVA 5CMBA 1N3WA 4P0GA 5F7VA 2ALUA 4F2QA 4R6KA 3KZGA 1B32A 3Q28A 4JWOA 4NF6A 3Q25A 2DWAA 3V8XB 3UORA 1Y20A 3KN8A 2F35A 1EZPA 4UACA 4YICA 3S9LC 4GQOA 2H99A 5CI5A 3TDJA 3EHTA 2GHAA 4F1YA 3WAEA 1XS5A 1Y3PA 3O2AA 3CFLA 1UIVA 2G93A 3KN3A 1B58A 2CMOA 4U22A 3VLUA 2A5TA 5CMMA 5AA2B 5M2VA 2F6PA 3U92A 1IZ1A 1MQIA 4H6DA 4I62A 2D21A 5FHOA 1JETA 3U8QA 2I49A 1TFDA 3EHSA 3MVYA 1TXFA 3SEVA 3VLVA 1NFTA 5TPAB 1B9JA 4KHZE 4R75A 2Y7KA 4Q5TA 2DE4A 1JEUA 4DZ1A 4EQ7A 5KCJA 1MDQA 1QKAA 2DE2A 4RNSA 4NWCA 2IA4A 1EH3A 3MZ1A 3MVZA 5H8NB 2HFBA 3N6TA 3SEYA 1A8FA 3S2VA 1L5TA 1B4ZA 4NF5A 4DXBA 2H98A 4R9FA 3O29A 3THIA 3KJTA 3O6HA 3VVFA 4NF4B 4DIGA 3N26A 3TQWA 3L6GA 4LZ7A 1XC1A 3T9VA 5DEXA 3ECRA 4JDFA 3KSJA 1B46A 4ZZEA 2WKYA 1QULA 3D4CA 1MXVA 1MPBA 4YB6A 3A3CA 4EXLA 2ONKE 3IAZA 3K0VA 1R9LA 3MP1A 1GVCA 2REJA 3PD9A 3S9EA 2Q88A 3G3KA 4TQUQ 3FGSA 4QHQA 4IO5A 4ELQA 1S50A 4OEUA 2ONSA 2B3FA 1H44A 4RA1A 1PEBA 4U23A 4BDRA 4G68A 2RF1A 4BLAA 1B0LA 3O28A 1LBBA 1MQHA 3N6UA 4K3FA 1B5IA 2KLFA 4Z7EA 4F22A 4THIA 4I8CA 1LB8A 5BUUA 3OSRA 4XIGQ 4F18A 5H8FA 1O7TA 2AIXA 4R74A 4DCYA 3O6GA 4FEBA 2HQ0A 3G3HA 4G2ZA 4LP2B 2XD3A 1R9QA 4LATA 1M5FA 1FQAA 4R2BA 1DPEA 2OLBA 3IO6A 5TP9B 1NNKA 1OQHA 3IB0A 4MLQA 3G3JA 3K6VA 1B40A 2VD3A 1SYHA 3OMBA 2B3BA 4H1XA 1QUKA 4GD5A 1POTA 1B51A 2OWSA 2H5YA 1RYOA 1P1WA 5FHNA 2QS3A 3FATA 4MF3A 2XXWA 1A55A 3U1OA 3HHGA 1P1OA 1FTOA 3TFLA 1MPDA 2GH9A 3PPOA 5DVFA 3OO7A 4RK9A 1B3FA 5DTBA 3K6WA 5DYHA 5AA4B 2ZYMA 4PE5B 2XXHA 1MY2A 4N07A 2Q2AA 3C36A 4JBZA 3EF7A 2UVJA 5A5XB 2THIA 3K1PA 3K6UA 2V25A 2ZYNA 1BIYA 2VD2A 2O1MA 3KFMA 2FA7A 3IK6B 3KJ7A 2Q9TA 1I6BA 3RUMA 1MY0A 3LSXA 3ZKKA 3W9VA 2DWJA 2ZXTA 3MAMA 3TTMA 3G3IA 3HSTA 3K2DA 2PT1A 3VLWA 5EHMA 4IO3A 3PPNA 3MPLA 4R9GA 4HW8A 2V84A 1B3GA 3FZVA 1XVYA 4U1ZA 4DDDA 5CMKA 1ZTYA 2FYIA 2XXXA 2XXYA 2H9BA 3FVOA 2I0BA 3VV5A 3QIMA 4ZDMA 3R26A 3A09A 4PQJA 3MQ9A 1MY3A 1M5CA 2XXVA 1IIWA 1US4A 5JK4A 1LFGA 4YZZA 3FASA 1AH5A 3CG1A 4Z0IA 4BDQA 1ANFA 2UYEA 4G8NA 1UQWA 4BDNA 2DSFA 3CFZA 1A54A 5AA1A 1TWYA 2OJTA 1FTKA 3DP8A 4GXSB 3BKIB 5TU0A 4BDMA 4HTGA 4OYVA 2HZKA 3LSLA 3MJNA 1B52A 4F31B 4NE4A 5CMCA 4LQ5A 4KYSA 5LOMA 2XXIA 1N84A 1N7XA 2V3TA 1UTHA 4EUOA 3C31A 4I1DA 3USDA 5L8DA 4IO7A 1NKXA 1J1NA 3QK6A 3PPPA 4QF9A 4ELOA 4KD5A 1DTZA 4ND9A 4YAHX 3U93A 4X1BA 3TODA 3PUZE 2I58A 1SBPA 4U4XA 3TTRA 1II5A 1FQDA 5L9SA 1DSNA 2Z8FA 5CC2A 4HS7A 1QVSA 3IOVA 3L6HA 3MZ9A 3OELA 2ZYOA 4KI0E 2O51A 3SEWA 3TELA 2GFEA 5EYFA 3T9XB 4XKPA 1ZLQA 2R9JA 1Y3NA 3TTLA 4KFQA 3CIJA 1LAFE 4G77A 4LUBA 2VGQA 4IY5A 2FNCA 3FXQA 1N3XA 5AA2A 2Y7WA 2F97A 4TOZA 1MRPA 3MP6A 1IXHA 3PU5A 2Y7RA 5K2YA 3IB2A 1B6HA 1I69A 1PC3A 3C32A 4R72A 1FW0A 5TPAA 3H6UA 3RN8A 4F29A 2NOOA 1OMPA 4LA9A 5I58B 4OETA 3VXCA 1MM6A 3JYRA 1NMUA 1OLAA 3GBBA 1LCFA 4YKKA 2F34A 4F2OA 5H8NA 4C1UA 4BDOA 4QFKA 1Y4TA 1MQGA 4AQ4A 3MPKA 1N04A 1OVBA 2I6EA 1LSTA 3KBRA 4JB7A 3I6VA 1ATGA 4NF8B 4AB6A 2F5XA 3C35A 5AA2D 4NF4A 2XXRA 1IEJA 4ZZAA 2DXYA 1H76A 1GV8A 4H5GA 3MVXA 1XVXA 3EPEA 2D3IA 1JW5A 1IQ7A 2ZMBA 3MC2A 3CFXA 4XKNA 2XX7A 1USYH 3KEIA 4RK2A 3DELB 5J1DA 5BWJA 5I84A 4RY1A 4OXVA 3K02A 2RCAA 5I2KB 4OQOA 1USYE 2O84X 5I2NB 1AIVA 1SW2A 1MQDA 3VDFA 4LONB 1IXCA 4UA8A 1O63A 4H0WA 1EZOA 3RLFE 3OEMA 2PX1A 2PT2A 3CR9A 2NVUB 1MDP1 2O1LA 3FVKA 4ZS9A 2OCUA 4H67A 5ITOA 3FJGA 4KYDA 2M8CA 3VXBA 1VFEA 5CRYA 1PDAA 1S7YA 2HAUA 4NMYA 3E3KA 1Q35A 4U1OA 4GXAA 4MFIA 1ZJLA 1GR2A 3RGYA 2QJEA 4NTLA 3UA8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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