4H8JA

Structure of glua2-lbd in complex with mes
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structural basis of an artificial photoreceptor
rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Signaling protein
total genus 80
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8jA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8jA02
3GZGA 4F2OA 1B2HA 5DVIA 1DPEA 3TTRA 3QXMA 1B32A 4HW8A 4FECA 3TTLA 3UORA 3R6UA 2QS2A 2FYIA 2QSXA 4YB5A 1AMFA 4MF3A 1XVXA 3HN0A 3PUXE 1BIYA 3N26A 2XD3A 3H03A 3T9UA 3TCGA 4P0GA 2HXWA 2RCBA 1B52A 1IXIA 1FQCA 2ZXTA 1MG1A 1LSTA 1LAFE 2VOZA 1B58A 1DPPA 2NOOA 1DTGA 3T9HB 5BWJA 5I2NA 3PUVE 4OERA 3MP1A 1R1NA 1EZ9A 4ZEDA 4MBPA 2NVUB 1TXFA 3B7DA 4RK9A 4F1VA 1B1XA 2F8DA 1A40A 2GHAA 5KDTA 4F3SA 3Q29A 3IX1A 3ODBA 3RNNA 1I6BA 3RPWA 1T0KA 2HZLA 1B40A 4NF8B 3O29A 2UYFA 1B51A 4RA1A 5TP9A 1SI0A 1WVJA 1BTJA 2ZYOA 2VD3A 3A3CA 1M5CA 5I2KA 1FQEA 1PBPA 2A5TB 1FQBA 3IAZA 2O84X 4GF8A 3RN8A 2F36A 3H4ZA 4GIZA 5B70A 1ZTYA 2PYYA 4PFYA 2DE4A 1NH7A 5I56A 4ECFA 3DP6A 4YMAA 1JETA 1B7ZA 4F1UA 4NF4A 2DP8A 2OWSA 3F11A 3FXQA 3DLNA 1Y3NA 2QJEA 4GXSB 3O2AA 1LCFA 1A55A 1KWHA 4FEBA 4IY6A 3U94A 1XVYA 2DWHA 4OETA 1JW1A 2XXUA 5BUUA 3H06B 5K2XA 3O6IA 2XX8A 4G8NA 3OELA 2I49A 1UIVA 1UQWA 3FV2A 1GR2A 5KZTA 2DVCA 3MP8A 2Y7PA 2XXQA 4RJZA 2UVIA 3SEXA 4GL0A 2HZKA 3EF7A 2E1SA 3KBRA 4OWDA 2A5SA 1PB7A 3QK6A 4PQJA 1ZBMA 3H3GA 4R2FA 3VXCA 1PBQA 3QAXA 1N04A 3KFMA 3BBRA 1MPBA 3TQWA 1MY4A 2XXPA 3K1NA 1S50A 5AA2B 4NF5B 2VD2A 1LFIA 3H6VA 1Y20A 4WKMA 4JBZA 1MPDA 4RYAA 5F7VA 1PB9A 2O7UA 2G29A 1O63A 1B6HA 3VVEA 5M2VA 2AYSA 1XT8A 4R6HA 5DEXA 1SW4A 4DXBA 1H3DA 1N3XA 3ZS6A 1YTVA 4AQ4A 4F19A 1B5IA 2HAVA 3DP8A 2DOJA 1TFDA 4QFPA 3VLUA 4C0RA 4ONYA 1QULA 4IO5A 3RT8A 4GLIA 5L9SA 3TPAA 4QFLA 3MWBA 3SERA 3JYRA 2O1LA 2R9JA 5L9MA 3EHSA 3JV9A 3MVYA 1ATGA 3MC2A 4ESWA 3KJ7A 3A3UA 1ANFA 2F6GA 3VDFA 5FHMA 1P1NA 3K1PA 1ZMGA 2HCAA 1UTBA 4KYDA 4G68B 1P1WA 4GVOA 3W9VA 2QS1A 1IXCA 1UTHA 1Y4TA 3SEYA 1SW5A 2O68A 1II5A 3HO7A 3H6TA 3MQ9A 5H8FB 3BKIB 1LAGE 1B1HA 2F5XA 3U8QA 1SQYA 1Y3QA 4JSDA 3BFTA 4R75A 3P7IA 2QMWA 3KOSA 2Y7WA 4I9DA 4XKNA 2PT1A 1MY2A 2I58A 3LSLA 1B05A 3TKDA 3FVGA 3PUWE 5I58A 4NF6B 3PUZE 1MH3A 4R9GA 4IGTA 2UXAA 4RNSA 4BDRA 2Q89A 2YJPA 3T93B 3MVXA 2X26A 4DXCA 1HSEA 4X1DA 2REJA 5AA2D 4I1DA 4FE8A 3SDFA 2ZYNA 4QFOA 2Z23A 3MBPA 4F18A 1N3WA 5AE4A 1FQFA 3KG2A 4KQPA 4ZE9A 5A5XB 3CRBA 4R74A 4H6DA 4EF2A 1MY0A 3FVNA 1POY1 4EUOA 1EH3A 2IA4A 2I0CA 4PFUA 3BFUA 4U21A 2O51A 4KR5A 1ZIUA 3MVZA 2UVHA 4DIGA 1S9TA 4OYVA 3SEVA 3OMBA 4ZDMA 1NNPA 4YKJA 3O6HA 4OEVA 4PFWA 4RPOA 4LUBA 3MPLA 2OK2A 4RK2A 1FQDA 5IAIA 1SYHA 4OFOA 1YCJA 2YLNA 3SESA 4I62A 3OO6A 3TELA 5ICQA 4GD5A 4ELOA 5CMKA 1NH8A 1MXZA 2XXHA 4MLQA 3CVGA 1Y4CA 2ESNA 3L6GA 4G68C 5CMCA 3CFZA 3TFLA 2HAUA 5JTYA 3UGWA 3TCHA 1D4NA 1SDXA 1IUDA 1TFAA 3IOWA 3S9MC 3PPQA 4U1ZA 1Z7ME 3N94A 3K0VA 3QYTA 4KHZE 4F29A 1POTA 5I57B 1B7UA 4XIGQ 2QPQA 3TQLA 2RC7A 3S4UA 1IIWA 1N76A 1MY3A 4ZEBA 1SW2A 5EHMA 3TZAA 4U22A 3OOAA 2O6AA 3QUFA 1QUIA 5TPAA 5DTBA 3QUJA 3G3KA 4Q5TA 1L5TA 1B9JA 1XS5A 1A8EA 3IOUA 3SKPA 4X9TA 4ZZEA 1LCTA 3LBSA 3O6GA 3IJXB 4ESXA 4FATA 5F1QA 1MM6A 2H98A 2OWTA 3KN3A 2ONSA 1H45A 4H65A 3RTWB 1URSA 3HPIA 1PDAA 1Q35A 4PFTA 3M3LA 3SETA 2H5YA 2IEEA 2ZYMA 3C32A 3EN3A 4DE8A 1VSOA 4YICA 2RC9A 4QFKA 2G93A 1JVXA 3CSGA 2PVUA 4R6KA 3CG3A 4L17A 1USYE 3T9VA 1SD3A 3UN6A 1N7WA 3RQTA 3MZBA 4M4GA 3PPPA 4OQOA 5I2NB 3T9XB 3O9PA 3CSBA 4Z0IA 4H5GA 1LGBC 2R71A 3Q27A 3AXFA 4R73A 5L8DA 2B3FA 2V3QA 1R9LA 2DXRA 3Q25A 2XXIA 3LC8A 1B3EA 2VHAA 3CFXA 3M3KA 1JEVA 5EHSA 1MRPA 1PC3A 3K1MA 1MH4A 5HM4B 2QMXA 3C35A 1NNKA 3ECRA 1FTKA 5TP9B 3OD7A 4HS7A 2F7BA 2Y7RA 2QS4A 3C33A 3MZ1A 4LQ2A 3LSFB 4E0WA 4MFIA 4HTGA 2Q8JA 5I2KB 1N84A 3HHGA 2OJTA 2DWJA 1SI1A 4FAJA 3M8UA 4QSDA 3M3FA 3ZSFA 1OQHA 3EHUA 5I56B 1TWYA 4BDOA 1M5DA 5H8HA 5K2YA 3IO6A 1M5FA 2P2AA 3CR9A 1NNFA 1JW5A 4X48A 2B3BA 2XX9A 1B3FA 1B4HA 2F7AA 1B5HA 4ELRA 5CM6A 1AH5A 1UIUA 3D4CA 4F2QA 4KCDA 4G8MA 4YZZA 2CZLA 4DCXA 2RF1A 4GRKA 2ZYKA 2RKMA 4FJPA 4OESA 1ZLQA 2H9BA 3IOVA 3U72A 3LSXA 3VXBA 2XXRA 1H44A 1B0LA 4NF5A 4P11A 1AOVA 3PMVA 3OXNA 4PP0A 2WKYA 4UACA 1MQIA 4OZ9A 4I8CA 4QSCA 5DVJA 2AIXA 2FA7A 4EXKA 1MQJA 1US4A 2NXOA 1FQAA 1D9YA 2D3IA 4LZ7A 2R6GE 3O28A 3QIMA 4ISUA 5I84A 4WXJA 1URDA 3V8XB 4YB7A 3E4RA 4OFLA 2I4BA 2XD2A 3C34A 4EQ9A 1LAHE 2OLBA 2I4CA 4H5FA 1LBCA 4POWA 1GVCA 3N6TA 3FD3A 3MJNA 1Y1ZA 4H8IA 2D21A 5DVFA 4YAHX 3O66A 1MPCA 5ITPA 3V83A 4NEDA 4IO3A 4RXLA 5AA3A 2Q88A 3OEMA 1NFTA 4YKKA 3K2DA 4F3GA 2QL3A 3OENA 3TMGA 3PD8A 5KCJA 1HSLA 4GFRA 4H1XA 2DE2A 3MW0A 2O7IA 4EXLA 4G4PA 1H76A 1MXXA 3CI8A 1MXUA 5ICTA 1MDP1 4RPNA 2Q2CA 2Y7IA 3RTFB 4PETA 4ZECA 4P0IA 3TTMA 1QKAA 3PV0E 3FASA 2ANJA 2VGQA 3PGFA 2V84A 3IR1A 4MLVA 2CMOA 4IO6A 3I3VA 1O7TA 1VR5A 5AA4B 4IY5A 2GRVA 1B3HA 3TUSA 3K01A 4FEDA 1UTHB 2ZNTA 4IGRA 2O69A 3QSLA 4OMBA 1DOTA 4G8HA 3WAEA 2ZNUA 4OTEA 1S7YA 3R7XA 4Q0CA 1O64A 2Z8DA 3MZ9A 1IEJA 2PX1A 3GBBA 2DWIA 4EF1A 4F31B 1I6QA 3FIRA 2AL5A 4N07A 3O97A 3UP9A 5JK4A 1QJMA 1IZ1A 4O3BA 4NWCA 3CIJA 5CBSA 1XOCA 4QF9A 4KFQA 3N5LA 5I59A 4TOZA 4EDPA 1QVSA 4XKPA 4KCCA 2HFBA 3PPNA 4EQ7A 4U4SA 3HSTA 3C9HA 1I69A 1B4ZA 2Z8FA 1USYH 5EYFA 3D4GA 4GL8A 4DCYA 1P1UA 5A5XA 2XXVA 4Q30B 1LB8A 1JW4A 3FV1A 3OO8A 4U2RA 1IQ7A 4DDDA 1P1OA 3E13X 1MQDA 1SBPA 3KOTA 4R72A 2E0SA 2H99A 3PMWA 3FJ7A 3ZKLA 1DSNA 1Y9UA 2F97A 1RYOA 2ONKE 3PU5A 1IXHA 3VE1B 1LAXA 2RCAA 3USDA 3UA8A 2V25A 1IITA 1SVXB 4FIMA 5L9OA 2D5WA 1FTJA 4IO2A 2I0BA 2QS3A 2XX7A 1N7XA 5H8NA 3LSWA 3DELB 1A99A 2W7YA 4JWXA 5HBCA 1ZU0A 4XTCQ 1OIBA 1NNTA 1ZKBA 4JWOA 3VLVA 3IB0A 3EHTA 2AL4A 3T96B 1Y1MA 4GQOA 2Y84A 4IO7A 2DYXA 2QRYA 5JEIA 2V3UA 4GWOA 2YPNA 1LB9A 3MUQA 1YAEA 1OLCA 4BDQA 5CC2A 4KYEA 5JTYB 1GV8A 5H8QA 1JVYA 1NKXA 4OVJA 1D9VA 3CG1A 5CBRA 3UK4A 1FTLA 1Y3PA 3MPKA 4NTLA 2UYEA 2PMSA 3KZGA 4ZEIA 4LP2B 3N6UA 3G3JA 3CFLA 1BKAA 3H6UA 1MM7A 3OO7A 4X1BA 4BDNA 3SEUA 3PPRA 3UIFA 4YU0A 4GXAA 3Q28A 2PBWA 1JEUA 4MH5A 3ILUB 3DP4A 3TAJA 1ELJA 1CB6A 4QFNA 5TPAB 2NWJA 4C1TA 4RY1A 3FGSA 1I6AA 1B3GA 1AIVA 3I6VA 1D3KA 1WDNA 3PUYE 4N13A 4THIA 3I5OA 1YPNA 2UVJA 3E3KA 3OSQA 2VP1A 4QHQA 3FATA 4EQBA 2Q9TA 2RINA 3IB2A 2BJJX 2H4IA 3GBAA 4U4XA 4WEDA 3OEKA 2THIA 2F7CA 1P99A 4F1YA 5ISUA 1M5EA 2P1SA 3RUMA 1SYIA 3V89B 1OVTA 1Z7NE 4NF8A 5DT6A 3ILTB 5KDTB 4LA9A 4JDFA 1B5JA 1OVBA 4LZ8A 4OFJA 3A09A 3U1OA 3C36A 4ND9A 3S9EA 1QUKA 1LLSA 2ONRA 1MXWA 4YMBA 3KSJA 1RKMA 3EQ1A 4F39A 3K4UA 5H8SA 2A5TA 4IB2A 3FXRA 2B65A 3TYHA 3OO9A 3VV5A 4H67A 4R6YA 3VLWA 5ITOA 2OCUA 4NMYA 3G3HA 2Y7KA 3C31A 2F34A 3G7WA 3HV1A 3MVWA 3LUYA 1CE2A 3W15C 3G3GA 2I3WA 4ZEFA 1SW1A 3W9WA 3G3FA 3IOTA 4GOTA 4NF4B 3FJMA 1FCKA 2Z22A 4YKIA 4XKQA 4F22A 3TODA 1GGGA 3MP6A 5H8HB 3S9LC 3IK6B 4POXA 3IORA 4LVQA 1OLAA 1B46A 2ALUA 2F6PA 3E9XA 2F35A 4ELQA 4KI0E 3LR1A 2NUVA 3S2VA 4YB6A 1MQGA 3B6WA 1VFEA 3ONMA 1F9BA 3ZKKA 1QUJA 2RC8A 4BDMA 5FHNA 4F3BA 3KEIA 3KJTA 5AA2A 1LFGA 2FNCA 4ZE8A 3T22A 2ZNSA 4OEUA 2DXYA 4BDLA 3L6HA 4IO4A 1MS7A 3FVKA 2GFEA 1A54A 1IXGA 1QKBA 3FUZA 4JSOA 3IO4A 4DLDA 4Q8RA 3KSXA 4JWYA 3TCFA 4H8JA 3C4MA 4JXIA 4R9FA 2DS9A 4N6PA 1URGA 1A8FA 4LATA 4G2ZA 1DMBA 1FTMA 1OMPA 2XXTA 5CMBA 1EZOA 5DEXB 2HEUA 1GTKA 3K6WA 1JNFA 3FXUA 1VE4A 4LZ5A 3B6QA 3K6UA 5CRYA 1LFHA 2KLFA 3FZVA 3GXAA 2REGA 4PE5B 1B0HA 1BP5A 3THIA 4R2BA 2OBGA 4XKRA 4G68A 5KCJB 2Z8EA 2X7PA 1MXVA 2DWAA 2O1MA 3MAMA 4KD5A 2XHDA 1UTBB 4NWDA 4C1UA 4O3CA 5AA4A 4AB6A 4QRZA 1Q1KA 1FW0A 3G3IA 5TU0A 1NMUA 3KN8A 4OXVA 2GH9A 5H8FA 4ZEKA 3FVOA 4LONB 3IB1A 1EZPA 1MDQA 1M5BA 1R6ZA 1B3LA 4OHNA 4NE4A 4O3AA 3GLBA 1WODA 2M8CA 3SEWA 2OZZA 4DZ1A 3TDJA 1B7HA 1H43A 1A7LA 5CI5A 1AL3A 2XXXA 4UA8A 3V5AA 4NF6A 1MQHA 3VVFA 5CMMA 4YKPA 3K6VA 4LQ5A 3K02A 1EU8A 1FTOA 4U23A 5FHOA 2DVZA 3RT6B 5I58B 4G77A 4TLMB 4H0WA 1XHYA 3H7MA 2HQ0A 1XC1A 1J1NA 4ELPA 1MXYA 5I59B 3Q26A 2LAOA 4TQUQ 5AA1A 5LOMA 1LBBA 1JQFA 4U1OA 3TTKA 4FORA 4E0XA 2I3VA 3DM0A 4M1VA 4BLAA 3K6XA 3RGYA 1N0TA 5DYHA 3TTNA 3PMXA 3FJGA 4HCWA 1VFDA 4KPTA 3U93A 1TT1A 4Z7EA 5FTIA 2GHBA 1ZJLA 4ZZAA 3PD9A 2H25A 3RLFE 5J1DA 1PEBA 4F3PA 3KGCA 2V93A 3U92A 4DXUA 3WAFA 5ELVA 3T66A 2I6EA 2Q2AA 1QW0A 3PPOA 2F78A 2I48A 1RYXA 5H8NB 4K3FA 5HPQA 4TLLB 2DE3A 3H6WA 2DSFA 2XXWA 3KN7A 2P0SA 3RY3A 1DTZA 1P1QA 4WEPA 2V3TA 5B7DA 1HSJA 4ZS9A 2DQVA 2UVGA 4OENA 5IKBA 1PB8A 2X7QA 4XXUA 4QSEA 3EPEA 2ABHA 2ZMBA 1R9QA 1OQGA 3TEPA 3VVDA 3K00A 2XXYA 4AB5A 1BLFA 1NL5A 5I57A 5FTHA 5H8QB 4KYSA 4JB7A 3OSRA 3VFJA 3R26A 1US5A 3JZJA 3IJOB 3HHFA 3B6TA 4HCYA 3S9NC 3HCQA 2PT2A 1MY1A 3IL1B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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