4H8JA

Structure of glua2-lbd in complex with mes
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structural basis of an artificial photoreceptor
rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Signaling protein
total genus 80
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8jA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8jA02
2I3VA 2I4CA 2DWJA 3TTRA 1O7TA 2OZZA 4EDPA 4FECA 4R72A 2P1SA 4DCXA 1TXFA 3TCHA 5I2NA 3BBRA 2RC9A 2DSFA 2YLNA 1MPDA 4LZ8A 1B3GA 5EHSA 2XXYA 1LAGE 1B9JA 4F1UA 3TTMA 4YKIA 4AB6A 1LBCA 3LSLA 4R74A 1MXXA 3K1NA 3OO9A 4DXUA 2VOZA 1AL3A 4ELRA 3KN8A 2PMSA 2QSXA 3KJ7A 4H6DA 3PMWA 1LB9A 2I0CA 3N94A 4XKQA 2ONKE 4WXJA 3TAJA 3IR1A 3O6HA 4KPTA 2PBWA 3RLFE 3KJTA 4LP2B 5AA2B 3BFUA 4U2RA 2ANJA 4ZEIA 5B70A 1FTJA 2X26A 3SEWA 1MPCA 4BDNA 3HO7A 2LAOA 2DYXA 2Q88A 5DEXA 5I84A 3MZBA 2KLFA 3TYHA 2DWAA 1B3EA 3K6XA 1LCFA 5CMKA 4YZZA 5AA4B 4F1VA 1B5IA 2DXRA 4QHQA 3VVEA 2REGA 1SW4A 4IO3A 3LSXA 4BDQA 3KSXA 4RA1A 4O3CA 3O6IA 1JQFA 3SESA 4GXAA 2AIXA 2ABHA 3LC8A 4BDLA 4OESA 1LAFE 2H9BA 1MQHA 3TCGA 3IB2A 5H8HA 3UGWA 1UTHB 3T66A 3VDFA 4N13A 1MPBA 3H6TA 4F18A 3B6WA 3TCFA 4DXCA 4JWYA 3IX1A 4HTGA 4H67A 3AXFA 4C1TA 4WKMA 3C35A 3Q29A 1USYH 4DLDA 1R9LA 5HPQA 3KN3A 1B40A 3O97A 4G8HA 2F97A 2GH9A 4R6YA 3TTKA 3T22A 1OMPA 4LUBA 3L6HA 1Y3PA 2OWTA 2QPQA 5H8NB 5M2VA 1PDAA 5JEIA 3UN6A 3H6VA 5KCJA 1B05A 1NNKA 1QUKA 4ELPA 5DVFA 4F39A 3FJMA 4BDRA 5IKBA 4GL0A 4QFNA 3I3VA 4R73A 3RQTA 4ZECA 4F19A 1JNFA 5ITPA 5I57A 1FTLA 4JDFA 1ZU0A 1A8EA 3ZKKA 3OEMA 2DXYA 2V93A 4ESWA 1N3XA 4OHNA 4OEUA 2UYFA 5K2YA 2RCBA 3EHSA 3T9VA 1MQJA 4G77A 4TLLB 2V3QA 4FE8A 4GD5A 3TQLA 2PT1A 1M5EA 2ZXTA 4FIMA 1GGGA 1B3FA 4DE8A 4IO6A 3JZJA 4H5GA 2ZMBA 1D9YA 2PYYA 2HFBA 5I2KA 3PUWE 1XHYA 4HCYA 2OWSA 1SQYA 4U4XA 5ELVA 3ILUB 4KYSA 3MP6A 3CSGA 2R71A 4KQPA 4EF1A 2QL3A 3FJGA 1AIVA 2F7AA 4O3BA 1MY3A 4I62A 3LUYA 3W15C 1UIUA 3MPKA 3EN3A 5H8HB 4NF6A 2E1SA 3CI8A 3WAEA 4POXA 3OD7A 1YCJA 1Q35A 1MM7A 4KYEA 1SDXA 4Z0IA 2ZYKA 1IIWA 4NF4A 3T96B 4QFKA 3FXRA 5I58A 1FQAA 3PUZE 1UTBB 5HM4B 3G7WA 4PE5B 3O28A 5BUUA 3FATA 4IB2A 4JBZA 1Y4CA 1QKBA 1PB8A 1LSTA 5FHOA 1B3HA 3SKPA 1BTJA 3ECRA 2H25A 1A8FA 1UQWA 3FVOA 4OXVA 4JXIA 2Y7PA 5KCJB 2XXWA 4LVQA 3IOVA 4MF3A 4NTLA 1QULA 5EYFA 1LAXA 4KCDA 4RYAA 3EHTA 4U23A 4JB7A 4E0WA 2YPNA 4QFPA 4GXSB 4EF2A 1IEJA 3TZAA 1S9TA 3FZVA 2V84A 2Z8DA 1QUJA 4ZEFA 4ISUA 2DQVA 4ONYA 1SW2A 1H44A 2UVJA 3H4ZA 3GZGA 4KFQA 2OJTA 1A99A 2UVIA 3QK6A 5AA2A 3MVWA 2XXXA 1FTKA 5AA3A 4FATA 4HCWA 4AQ4A 1XOCA 3JYRA 1ZTYA 3W9WA 2Z22A 1B2HA 4QFOA 4EUOA 3ZSFA 4M4GA 2ONRA 4YAHX 5AA4A 2O69A 1SYHA 5CM6A 4THIA 2QRYA 5H8FB 4OQOA 3N26A 3O29A 4ZEBA 3OEKA 4X48A 3B6QA 3R7XA 1B3LA 1US5A 4YB7A 1EZPA 2RINA 5K2XA 4GL8A 1B4ZA 1HSEA 4ZDMA 4OWDA 3RY3A 4G2ZA 2Y7KA 1N04A 1RYXA 3TKDA 1UTHA 3CFZA 3H3GA 3L6GA 1URDA 1Y3QA 4PFTA 4ND9A 3GXAA 1JW4A 3OSQA 1FQBA 3V89B 1MXYA 1LCTA 3Q25A 3K0VA 2GRVA 3E9XA 1B5JA 3UA8A 3GBBA 1MY0A 1URSA 4TQUQ 4WEPA 3N6UA 3VV5A 1EZOA 2QJEA 3KSJA 4F3GA 1PB7A 3O9PA 4MH5A 4QSEA 3B6TA 5DTBA 4F29A 1I6QA 4GIZA 3U93A 3FVNA 4F2QA 1JVXA 3CIJA 4EXKA 1MS7A 3VXBA 4XXUA 4E0XA 5H8NA 2QS3A 1SD3A 4N07A 3FGSA 5AA1A 2CMOA 4F1YA 4U1OA 2XXHA 4DCYA 3KN7A 1GTKA 2P0SA 3G3JA 2H5YA 1VSOA 4G68B 1QVSA 1ATGA 2PT2A 1EH3A 3IORA 4C0RA 2NXOA 3RUMA 2XD2A 1QUIA 5ISUA 5ITOA 4YMBA 2Y7IA 3HV1A 1MM6A 2H99A 3QYTA 1DTZA 1M5FA 2VP1A 5DT6A 3K02A 3IO6A 2Y7RA 2QMWA 5HBCA 1H76A 1S7YA 3A3UA 5CRYA 1Y1ZA 3LR1A 1DTGA 2DS9A 4QF9A 5IAIA 2R9JA 2XXVA 2ZYOA 3MP8A 4YB5A 2F35A 3RT8A 4IO5A 4YICA 4RNSA 1AOVA 1Y3NA 1NNTA 2I0BA 3MUQA 3H03A 4R6KA 1OVTA 4EXLA 3F11A 1B4HA 3N6TA 2XXIA 2A5SA 2DE4A 1J1NA 4F2OA 4YMAA 3OXNA 2R6GE 4P11A 4NEDA 3MVYA 1SI0A 5JK4A 4IY5A 3G3HA 3HHGA 4N6PA 3LSFB 3IJOB 1Y9UA 1QKAA 2RCAA 2I4BA 1HSLA 4IO4A 3DP4A 4K3FA 1WDNA 1N84A 2GFEA 3V5AA 2UVGA 2ZNSA 1RYOA 3R26A 1LLSA 5L8DA 3UORA 3PGFA 3C31A 3RTWB 3PMXA 2AYSA 1UTBA 3PPPA 4GVOA 1VR5A 4RK9A 2O7IA 4F3PA 2OLBA 2QS4A 4QSDA 3SEYA 4NWDA 2G93A 3O2AA 5FHNA 3S2VA 3RGYA 5L9OA 1B7UA 1IZ1A 5L9MA 5H8QB 4OFOA 1GR2A 1AH5A 3K4UA 1MG1A 4OFLA 4HS7A 3KEIA 3K01A 4ZE8A 4HW8A 3BFTA 2ESNA 1FQFA 1NMUA 4IGRA 2XXPA 4OMBA 2VD2A 3C4MA 4BDMA 2NUVA 3S9NC 1JETA 3MBPA 4M1VA 4KHZE 3OENA 4U21A 1B52A 1LFGA 1JW1A 3USDA 3RT6B 2UXAA 3RN8A 2V3TA 4R9FA 2HZKA 1OIBA 2DWHA 4Q0CA 4U22A 4ZEKA 1A40A 2AL4A 4PP0A 4R6HA 3HHFA 4KR5A 4RPOA 2X7QA 1ZIUA 3C9HA 5H8FA 4X1DA 3MVXA 4Q30B 4ZS9A 3TMGA 1R1NA 1MQDA 3K1PA 1JEUA 3S9LC 5CBRA 4FJPA 1CB6A 1IXHA 2D21A 3VLWA 1OLCA 1MY2A 3PD9A 2CZLA 1FTOA 4O3AA 3T93B 3HSTA 2W7YA 3FXUA 3S4UA 4G8NA 1WVJA 4GF8A 2RC7A 2I58A 1MXUA 5FTHA 1N7WA 4QRZA 3EPEA 3Q26A 1VFEA 1YAEA 1NNPA 3TTNA 2NWJA 2Z8FA 5BWJA 4DDDA 1DPPA 1IXCA 3LBSA 3MWBA 5B7DA 4ELQA 3EF7A 1FCKA 4KD5A 1BLFA 3PUVE 4YB6A 3I6VA 3QUJA 3T9XB 4I9DA 5F7VA 2VHAA 1B0HA 3FASA 3FJ7A 4PFYA 3VXCA 1POTA 2F36A 1I69A 3PPQA 4PQJA 3DP8A 5CMCA 4R2FA 1Y4TA 2OBGA 3A09A 4NF8B 1DSNA 2ZNUA 4G68A 4U4SA 1BIYA 1R9QA 1EU8A 2F6GA 3C34A 3W9VA 1UIVA 1NKXA 1Y1MA 3OO8A 3SDFA 2NOOA 2DE2A 2PVUA 4H0WA 3IOUA 4KYDA 3IK6B 2D5WA 4F3BA 1A54A 4G68C 3Q28A 3FVKA 5A5XB 3MJNA 3C36A 3TDJA 1POY1 4NF5B 3QSLA 2THIA 1L5TA 1P1OA 3TTLA 1BKAA 1MRPA 5CMMA 5JTYB 3EHUA 2ONSA 1PC3A 1QW0A 2XXQA 2RF1A 4AB5A 3H7MA 3G3GA 3IAZA 3OO7A 1XS5A 2HQ0A 2O68A 5DVJA 4YU0A 1LGBC 2FA7A 4YKJA 4F31B 2O6AA 3M3LA 2F8DA 2I49A 4MLQA 4GQOA 3OELA 3OMBA 1GV8A 4YKPA 2H4IA 1IUDA 3MPLA 3PU5A 3VVDA 3CSBA 1B7HA 4YKKA 3K00A 4XKPA 4XTCQ 2DVCA 1MDQA 5F1QA 2HXWA 3PPNA 3T9UA 2M8CA 3QXMA 4UA8A 1Z7NE 5TPAB 5TP9B 4IY6A 4X1BA 3PUYE 3D4CA 2B3FA 1GVCA 4TLMB 2XD3A 3DM0A 4OFJA 3U8QA 3CFXA 4H8JA 3KOTA 1IQ7A 2B3BA 2I3WA 3ONMA 1D9VA 4RPNA 1ZLQA 5H8QA 3V8XB 1B1XA 3CRBA 4FEBA 2V3UA 1YPNA 3K6UA 4OZ9A 1RKMA 4LQ5A 3CVGA 3FD3A 2WKYA 4UACA 4OYVA 3SERA 3T9HB 1FQDA 5DVIA 2OK2A 2XXRA 1USYE 2QS2A 1IXIA 5ICQA 3D4GA 1VFDA 2A5TB 3V83A 1PB9A 4ZEDA 1H43A 2F5XA 4U1ZA 1MH4A 1WODA 3I5OA 3H06B 3VLUA 2ZYMA 1FQCA 3ZKLA 1ZMGA 4Z7EA 4NMYA 3IOTA 5FHMA 1M5BA 3SEUA 3IB1A 3IOWA 4RXLA 3CG1A 2Q9TA 3LSWA 2Y7WA 3G3FA 3SEVA 4OTEA 4RK2A 4POWA 2F7BA 4OETA 2XX7A 2GHBA 1M5CA 3GBAA 3KG2A 1JEVA 4GOTA 3QUFA 1DPEA 3VFJA 1SYIA 4TOZA 4OENA 4H5FA 4FORA 3KZGA 3TPAA 1Z7ME 4IO2A 1LB8A 2REJA 3U94A 3P7IA 3O66A 1F9BA 2Q89A 1B6HA 2FNCA 3FXQA 4H1XA 5I59B 3HCQA 3TEPA 3EQ1A 1Y20A 3A3CA 5KZTA 4Q5TA 1MH3A 3Q27A 4NWCA 4LONB 3PPOA 4H65A 4P0GA 5I56B 3IJXB 2BJJX 1LFIA 1TWYA 3VVFA 5KDTB 3MQ9A 3UIFA 4ELOA 1N0TA 3PV0E 1FQEA 1NH7A 4PETA 3KOSA 5ICTA 1DOTA 2DE3A 3M3FA 1PBQA 1LBBA 2H98A 4BLAA 5TU0A 4QSCA 4RJZA 4G4PA 3WAFA 1R6ZA 4KCCA 4PFUA 2Q2CA 2E0SA 1SVXB 4R9GA 3B7DA 3K6VA 3IL1B 2X7PA 4RY1A 4NF8A 2ZNTA 4ZZEA 1FW0A 3FV1A 4GLIA 2DVZA 2DWIA 3QAXA 2UYEA 4JSDA 2Y84A 4FAJA 1O64A 1AMFA 2RKMA 3OO6A 4XIGQ 3UK4A 2G29A 2YJPA 5DYHA 5I2NB 2F78A 3KFMA 2OCUA 2XXUA 3DLNA 2FYIA 1IITA 5CBSA 1SW1A 1P1NA 3MAMA 3FV2A 3DELB 4EQ9A 5A5XA 3C33A 2V25A 4GFRA 3M3KA 3FUZA 1B58A 4JSOA 4G8MA 1ANFA 2O1LA 2P2AA 4NF5A 3TUSA 1XT8A 4WEDA 2IA4A 5LOMA 3U1OA 5JTYA 3MP1A 4X9TA 4MLVA 4F3SA 3TELA 1P1QA 2HCAA 4DZ1A 3E4RA 3E13X 3KGCA 4DIGA 4OEVA 2PX1A 1JW5A 4ECFA 2DOJA 3U72A 3OSRA 4GRKA 3MZ9A 3JV9A 2HZLA 3KBRA 3TFLA 1TFAA 3PPRA 1XVYA 2O51A 4XKRA 4XKNA 4JWXA 3RTFB 5DEXB 2F6PA 4LA9A 4I8CA 1NL5A 1XC1A 3RPWA 3OOAA 2Z23A 4KI0E 1O63A 2O7UA 2O1MA 3E3KA 3HN0A 3S9MC 3O6GA 3HPIA 2I6EA 3GLBA 5TPAA 2XX9A 5TP9A 5J1DA 1I6BA 1SI1A 4Q8RA 1FTMA 2QMXA 4DXBA 3ZS6A 1I6AA 4EQ7A 1US4A 2D3IA 5CMBA 1A7LA 3MVZA 4OERA 1NFTA 5AA2D 3SETA 1ELJA 2F34A 2VD3A 2AL5A 5AE4A 2XX8A 3R6UA 4IO7A 1SBPA 2I48A 2NVUB 3ILTB 4LZ7A 4L17A 3C32A 1MY4A 4MBPA 4I1DA 4ZE9A 3VLVA 4F22A 1EZ9A 3TODA 3PUXE 2GHAA 2A5TA 1MY1A 1MQIA 1CE2A 1N3WA 3K2DA 1H3DA 1MXWA 3IO4A 2HEUA 1B7ZA 2ALUA 4R2BA 4H8IA 1QJMA 3H6UA 1JVYA 1ZKBA 3G3KA 3MC2A 4LZ5A 4C1UA 1B32A 2Q8JA 1MQGA 3TQWA 5CC2A 1MDP1 5FTIA 1TT1A 1KWHA 5I57B 1OQGA 2QS1A 2O84X 1B5HA 2ZYNA 3CG3A 1MXZA 1N76A 3FIRA 2HAUA 4P0IA 3PD8A 2VGQA 3IB0A 1ZJLA 3FVGA 4IGTA 1II5A 4JWOA 1YTVA 2XXTA 1B51A 2F7CA 3U92A 3N5LA 4QFLA 1T0KA 1D4NA 3VE1B 5L9SA 1LFHA 1P99A 3UP9A 2Q2AA 3M8UA 1P1WA 4ESXA 1S50A 5I59A 4PFWA 4R75A 4LATA 3PMVA 5I2KB 1A55A 1Q1KA 2XHDA 1P1UA 1SW5A 5I56A 1B0LA 1DMBA 3MW0A 4EQBA 1NH8A 4NE4A 1VE4A 5CI5A 5KDTA 4LQ2A 1H45A 2IEEA 3BKIB 3G3IA 1HSJA 2B65A 1B46A 3CFLA 3S9EA 1OQHA 2HAVA 1BP5A 1M5DA 1TFDA 1D3KA 1LAHE 3SEXA 3K6WA 1IXGA 1NNFA 1OLAA 2RC8A 3MZ1A 1PBPA 1PEBA 1XVXA 2Z8EA 3DP6A 4NF6B 3QIMA 1N7XA 3ODBA 3RNNA 1URGA 1MXVA 4OVJA 5H8SA 4NF4B 3CR9A 5EHMA 1B1HA 4MFIA 4BDOA 2UVHA 4FEDA 3THIA 1OVBA 5I58B 2DP8A 4GWOA 4ZZAA 3K1MA 3H6WA 1ZBMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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