4H8JA

Structure of glua2-lbd in complex with mes
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis of an artificial photoreceptor
rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Signaling protein
total genus 80
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8jA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4h8jA02
1J1NA 1FQDA 3FXQA 3TZAA 3G3HA 4G8HA 1DOTA 4H65A 1MDQA 1XC1A 5BWJA 4FEDA 2QS1A 2UVJA 3ZSFA 2XX8A 2FNCA 4DXUA 3ECRA 4OWDA 1R9QA 2QMXA 4MFIA 3TTRA 3K6VA 4OMBA 5CI5A 2OBGA 2YJPA 1VSOA 4EUOA 4KYSA 3Q28A 3QYTA 1LCFA 1LSTA 5CMBA 3G7WA 2R6GE 2Y7IA 1EZOA 2Z8DA 5CMKA 1H3DA 1XOCA 4OFJA 4IB2A 3DP6A 1N76A 1P1NA 2QJEA 2GHAA 1MXWA 3FZVA 4GL8A 2OJTA 1NNKA 3H6TA 3MVYA 3HN0A 3GXAA 2DQVA 5KCJB 1MM6A 1P1UA 4BDQA 5AA4A 4ISUA 1QUIA 1UTBA 3CSBA 3MPKA 4GRKA 4HS7A 4ZEBA 5L9SA 4DE8A 2DYXA 3K2DA 2ANJA 2R9JA 5IAIA 3OO6A 2FA7A 2ZYMA 2HZLA 3K1NA 1NH8A 1XS5A 5A5XA 2V84A 2V3TA 2Z8FA 1FW0A 4NEDA 2GRVA 3RNNA 4G68A 3B6QA 3MC2A 4G2ZA 1RKMA 1Q35A 1B6HA 1O7TA 3C33A 4M1VA 1L5TA 3IOUA 1TFAA 4OYVA 2O69A 3SEVA 3I6VA 1UIVA 3TAJA 1P1WA 1NNTA 4DCYA 1AMFA 3FXUA 2I0BA 3V5AA 4F2QA 1LBCA 3LC8A 3MZ9A 4PFUA 1HSEA 3GBBA 3SERA 2KLFA 3UP9A 2XXWA 4FORA 1B46A 1B7UA 3V8XB 1I69A 4MBPA 1A8FA 3I3VA 5FHNA 1IEJA 1M5CA 2Q9TA 4U22A 3T96B 3OO9A 1B51A 3TQWA 4JXIA 2F7AA 3PUVE 1UTHA 3EQ1A 2ONRA 3KG2A 4HCYA 2M8CA 4H6DA 3VLWA 2UYFA 1Y1MA 5I58A 4ESWA 3GBAA 4RK2A 5AA1A 1I6AA 1JETA 4I8CA 2F35A 3ONMA 4R72A 3B7DA 2F97A 3PMWA 3LSXA 1EZ9A 4R75A 2VD3A 4F22A 4U4XA 4R6YA 3IOTA 4OTEA 4G8MA 4F2OA 1PC3A 4KI0E 3WAFA 4TQUQ 1UQWA 3C36A 5H8HA 1SD3A 1MRPA 3LBSA 3DM0A 3H6VA 2G29A 3TODA 4G4PA 2F78A 2DWHA 4M4GA 3K6XA 3KN3A 1PBQA 3MZBA 1T0KA 1B0LA 4ZE8A 2PT1A 1ZBMA 2CZLA 2A5SA 3BBRA 1B3FA 4OFOA 1XHYA 2RCBA 3O6HA 3JYRA 3TKDA 4OVJA 4OZ9A 3FIRA 5HBCA 2X7PA 4I62A 1AIVA 3PU5A 4LUBA 5EYFA 5ICQA 2UVHA 2ZYOA 1H45A 2Q8JA 5B7DA 1D4NA 5F7VA 4ZZAA 3T66A 4ELQA 3VE1B 3UORA 4RYAA 4NF6A 1AH5A 2DE2A 2H25A 3GLBA 1OLAA 3FV1A 2DXRA 4R9GA 2HQ0A 3KEIA 1MS7A 4QFPA 3FJ7A 2OLBA 5I59B 3O6GA 1N3WA 1ZKBA 4PQJA 1LB9A 5FTHA 1FQAA 3C35A 2NUVA 1EU8A 3MP6A 3KSJA 5I56B 1A8EA 4LQ2A 5H8SA 3EF7A 2OCUA 1R9LA 5FHMA 3H03A 3SEYA 1MY2A 1DPEA 4QSEA 1GVCA 1Y3PA 4QSCA 3KOTA 4IGTA 2VHAA 4Q8RA 1Y4TA 5CRYA 1B40A 3RY3A 4WEDA 3ILTB 4BDRA 4EXKA 3FVOA 3M3KA 1Y4CA 3MW0A 4F3SA 3S4UA 1LB8A 3KN8A 1VFEA 3VLUA 2OWSA 3S9NC 1LCTA 1YAEA 3KGCA 5H8NB 4F1YA 2I3VA 4WKMA 2GFEA 3KN7A 3IJOB 3OMBA 4KR5A 4PETA 5AA3A 1MH3A 1RYXA 3F11A 4GLIA 4RPOA 3CG3A 2GH9A 3CIJA 3CFZA 1JNFA 1B32A 2I4CA 1MQGA 3C9HA 1M5BA 5KDTB 2VD2A 1Z7ME 2WKYA 4F3GA 2ZNTA 3DELB 3PPRA 2HFBA 4PFTA 4IO7A 3PPNA 2O1LA 3T9VA 4YICA 2PBWA 4GQOA 1IQ7A 4H0WA 2XXPA 1OMPA 4F1UA 1MH4A 4I1DA 5ITOA 2IA4A 4QFOA 3H4ZA 4H8IA 1OQHA 1MG1A 3VVEA 1ZTYA 3MVWA 2H9BA 3EHUA 3TTNA 3GZGA 2XX9A 1JEUA 4I9DA 1DSNA 4H1XA 1B5JA 1URDA 3T9HB 1A54A 2XXRA 2NWJA 1XVYA 5IKBA 4UA8A 3IO6A 3RT6B 2XXTA 2QRYA 1MXUA 3RGYA 4LZ5A 3TTMA 1JW5A 2DE3A 2QS2A 1A55A 4JBZA 4OXVA 2PX1A 4JSOA 1PBPA 4OEVA 1TT1A 3MP8A 4G68C 2ABHA 4POXA 4H67A 3CFLA 4OERA 4X1BA 3W9WA 2BJJX 3HSTA 3C31A 1IXHA 4G8NA 4NF4B 3FATA 4KCCA 1QUKA 3DP4A 1SI0A 5EHMA 1AOVA 2ZNSA 1DPPA 1NMUA 1POTA 4Q30B 3OOAA 4R74A 4E0WA 4NF8B 1P99A 3A3CA 3OELA 1WDNA 3OSRA 1NH7A 5TU0A 4YB7A 4BDOA 4FIMA 3KZGA 2P1SA 3C34A 4NE4A 3KSXA 4NF5B 5AA2B 5CMMA 4H5GA 4XKNA 1II5A 2H99A 1USYE 5JTYA 5CC2A 2PMSA 2F34A 2A5TA 1NNFA 4AB6A 3ILUB 2DP8A 3P7IA 3E13X 2ZYKA 4XIGQ 3VFJA 5I2NB 1GTKA 2XD2A 5K2XA 2O51A 3Q25A 4JWXA 3IB2A 2D21A 1N0TA 3SDFA 1FCKA 3K6UA 1AL3A 4BDNA 3RUMA 4FJPA 3EN3A 1QKAA 3E3KA 3CR9A 2NOOA 3IO4A 4EQ9A 4E0XA 2QSXA 1MXVA 3RTWB 3EPEA 4PFYA 3R6UA 4U23A 3LSLA 3QSLA 4ONYA 2HZKA 4R6HA 4YKIA 3SEWA 4LZ8A 3H6UA 4F29A 4YMAA 5DEXA 1JW1A 3R26A 4ZE9A 5I84A 3RLFE 4R73A 1OVBA 3PV0E 5AA4B 1UTBB 1MM7A 1M5FA 4XKPA 1OIBA 3BFUA 1B7HA 2DVZA 4PE5B 3H06B 4QFLA 4RA1A 4XKQA 4XTCQ 4YU0A 1N84A 2ESNA 1FTJA 2I58A 2RKMA 3TCGA 2O1MA 3A09A 5CBSA 5CM6A 4DZ1A 3IB1A 5A5XB 1I6QA 3TQLA 4IY5A 4GIZA 1H43A 1MY4A 2B3BA 4Q5TA 1TWYA 4XKRA 3K1PA 3UIFA 3U92A 4H5FA 2OZZA 2H4IA 4RXLA 1QKBA 3OSQA 4K3FA 4NWDA 2UVIA 4F1VA 1B9JA 4P0IA 3V89B 2XXUA 1M5DA 2LAOA 1FQCA 4OENA 3MZ1A 1QW0A 1URSA 1IXCA 1I6BA 2O6AA 2PYYA 3JV9A 5TP9B 1TXFA 4TLMB 3MP1A 1P1QA 3BFTA 3EHSA 4JWYA 1EZPA 1SYIA 3RPWA 5H8QA 2XXIA 1ANFA 1R6ZA 1NFTA 2QPQA 1QVSA 1UTHB 4HTGA 4IO2A 3K01A 1B05A 4G77A 3PUZE 3QUFA 3Q29A 2UXAA 4F3PA 2UYEA 1ATGA 3O2AA 1VE4A 2P0SA 5I58B 2XXXA 3FV2A 3LSFB 4BDMA 2RC7A 1MQHA 5FHOA 1MQIA 2X7QA 4LVQA 2AYSA 1B5IA 2F36A 4PP0A 3ODBA 1LBBA 4IY6A 2R71A 1PEBA 2QL3A 1DTZA 4LONB 3E9XA 3TTLA 2THIA 3FUZA 1DMBA 2ZMBA 4H8JA 4JB7A 4JDFA 4KQPA 4PFWA 1O64A 5I59A 3QAXA 1JW4A 1BTJA 3H6WA 4QRZA 5H8HB 4F18A 3OD7A 2DWJA 3PMVA 1S50A 5ITPA 1Y9UA 4R9FA 2F6GA 4DCXA 3N6UA 4X1DA 3H3GA 5I56A 2HXWA 1RYOA 2QS3A 1D3KA 2XXHA 4GFRA 2X26A 3PD9A 1S7YA 5DVIA 1SYHA 2IEEA 5I2KA 1PB8A 3TUSA 3SKPA 3ZKLA 2XXVA 1ZIUA 4LZ7A 4QFKA 4X48A 1S9TA 1N3XA 2F5XA 2ZNUA 4GF8A 4R6KA 2G93A 1MDP1 3N5LA 2Q2AA 4GXAA 1MPCA 5ICTA 3KJTA 5H8FA 2F7CA 2O84X 4AB5A 3MUQA 4YZZA 4EQBA 3TFLA 5EHSA 2ONSA 2I4BA 1LAHE 2HAVA 4DIGA 4DDDA 3A3UA 1O63A 2I49A 2PT2A 4LA9A 4ZEKA 3K4UA 1B0HA 5CMCA 4FAJA 3N6TA 1LFHA 2QMWA 3LSWA 4IGRA 4NWCA 3TPAA 3S9LC 2RINA 1LGBC 2D5WA 2NVUB 4OQOA 1NL5A 4MH5A 1SDXA 3L6GA 5FTIA 1SW2A 3OXNA 1LFGA 4HW8A 5L8DA 3Q26A 1LAXA 4ZECA 1NNPA 5JK4A 4IO3A 1WVJA 1ZU0A 3UGWA 5TPAA 5L9MA 2DXYA 2XXYA 4DXCA 5I57B 4O3BA 1ZJLA 3TTKA 4EQ7A 1Q1KA 4YMBA 2F7BA 4NTLA 2PVUA 1BIYA 2RC9A 1D9VA 3QK6A 4MLQA 2DE4A 4EDPA 4YKJA 5JEIA 5HM4B 1A99A 4ZEIA 3EHTA 3PUWE 1OLCA 3IORA 2P2AA 3G3KA 1B52A 3HCQA 4F3BA 4YB6A 1FQFA 4POWA 1B1XA 5DT6A 4EF2A 2QS4A 5DVFA 3SESA 3ZKKA 4ELPA 2Q89A 4U21A 1LAFE 3G3JA 3W9VA 1H44A 1HSJA 4AQ4A 3TCHA 3PUYE 1ZMGA 3IB0A 1BLFA 5K2YA 5B70A 5BUUA 2H98A 3I5OA 3RQTA 3KFMA 2O68A 3L6HA 3OEMA 3OO8A 4RJZA 3MBPA 3PGFA 1B1HA 3N94A 4P0GA 1Y3QA 4QHQA 2Q2CA 4GD5A 3JZJA 3T9XB 2XD3A 1Y1ZA 4NF5A 1PB7A 1N7WA 3FXRA 5KZTA 4OHNA 1D9YA 5KCJA 3O6IA 1MY3A 5AE4A 2ZYNA 3IK6B 3PPQA 2AL4A 1B3GA 1US4A 1B58A 5I2NA 1A7LA 2XX7A 2YLNA 1FTMA 1IXIA 3IOVA 4KCDA 1URGA 3HO7A 2B3FA 4C1UA 3SETA 1M5EA 4MLVA 5CBRA 4WXJA 1MPDA 2V93A 4KPTA 4OETA 1B3EA 3UK4A 1QJMA 2E1SA 2F8DA 4QSDA 4N6PA 1IUDA 1SW4A 1SVXB 3VLVA 4BDLA 2B65A 3AXFA 1US5A 4LQ5A 3MWBA 3S9MC 3USDA 4FATA 1FTKA 3LUYA 2Y7RA 4ZEFA 3D4GA 3IL1B 1LLSA 2I0CA 4ELRA 5J1DA 1B4ZA 2DS9A 4Z0IA 4F39A 2GHBA 4U2RA 1QUJA 3W15C 3OO7A 3CRBA 5L9OA 3FJMA 4OEUA 5HPQA 1EH3A 1GR2A 3HV1A 1OVTA 4X9TA 5JTYB 2YPNA 1VR5A 4FE8A 2E0SA 1MXXA 2A5TB 1FTOA 1MY1A 1MQJA 3WAEA 3FVNA 4TLLB 1OQGA 4GXSB 3PPOA 3E4RA 5DTBA 1FTLA 4RPNA 4KHZE 4R2BA 3VVDA 1B2HA 5AA2D 1SI1A 5DVJA 3T22A 2V3UA 3U72A 1P1OA 5TP9A 3K02A 4G68B 2Y84A 3OEKA 2OK2A 4RK9A 4Z7EA 1ELJA 3VVFA 4THIA 3TELA 3BKIB 3TDJA 4LATA 1MQDA 3IOWA 4N13A 5DEXB 4TOZA 4OFLA 3VXBA 2DOJA 3G3GA 3H7MA 2O7UA 4C0RA 2VOZA 2DSFA 1N04A 3O29A 4L17A 2ALUA 1FQEA 3CVGA 3K0VA 1IITA 5DYHA 2XXQA 1SQYA 3IJXB 2Z8EA 2NXOA 1USYH 3G3FA 3M8UA 1SW5A 1CE2A 1XT8A 4QF9A 4GL0A 3DLNA 1MXYA 1A40A 1QULA 3IR1A 4U4SA 4JSDA 4F19A 1PDAA 3RT8A 1SBPA 4KYDA 4ZEDA 3HHGA 2ONKE 3B6TA 1Y3NA 3THIA 2REJA 4UACA 1BKAA 2HCAA 3C32A 3PD8A 4ZS9A 2FYIA 2Z23A 4FECA 3HHFA 3B6WA 1JQFA 5ISUA 4JWOA 3T9UA 3S9EA 1R1NA 3G3IA 4LP2B 4ZDMA 5ELVA 1Y20A 1MXZA 2RCAA 3CFXA 2DWAA 4RNSA 3FVKA 1NKXA 5H8QB 4O3CA 1XVXA 1IZ1A 4F31B 4WEPA 2ZXTA 3PMXA 3M3LA 3O28A 3MPLA 4IO5A 1B3LA 2AIXA 1B5HA 2V3QA 2Y7WA 3FGSA 4DLDA 3M3FA 2REGA 2DVCA 4YAHX 2I48A 4P11A 4QFNA 4YB5A 3LR1A 1YTVA 5F1QA 1DTGA 4HCWA 1WODA 2RC8A 4EF1A 3D4CA 4U1OA 3ZS6A 1KWHA 4DXBA 2I3WA 2Q88A 3MJNA 4NMYA 3IAZA 5H8NA 3VDFA 3U1OA 4ELOA 4C1TA 1SW1A 3VV5A 4NF6B 3C4MA 3CI8A 3K6WA 2CMOA 3KBRA 1UIUA 4BLAA 1JEVA 4KD5A 4IO4A 2Z22A 4EXLA 3TCFA 5I2KB 1N7XA 4YKKA 1POY1 3UA8A 5KDTA 3O97A 3MVZA 5I57A 3PUXE 1B7ZA 1MPBA 1LAGE 1B4HA 3QIMA 3MVXA 3FJGA 3CG1A 4IO6A 3FASA 1Z7NE 3V83A 3S2VA 4O3AA 5H8FB 4MF3A 5M2VA 1ZLQA 4KYEA 1B3HA 1IXGA 2W7YA 3K00A 2HAUA 4N07A 4U1ZA 4ECFA 1TFDA 4KFQA 1YCJA 3DP8A 4GOTA 1YPNA 4YKPA 3Q27A 2HEUA 3RTFB 5LOMA 1PB9A 3RN8A 1GGGA 1F9BA 3K1MA 3KOSA 2V25A 4OESA 2I6EA 1LFIA 2F6PA 4Q0CA 4RY1A 2VP1A 2OWTA 3FD3A 3TEPA 2VGQA 3QXMA 3CSGA 2O7IA 1VFDA 4GWOA 4ESXA 2DWIA 3N26A 3SEUA 3U93A 3TMGA 3QUJA 2H5YA 1GV8A 3MQ9A 3PPPA 1CB6A 4ZZEA 2Y7PA 1IIWA 5TPAB 1HSLA 3U8QA 3VXCA 1FQBA 4FEBA 2XHDA 4R2FA 2UVGA 3UN6A 3O9PA 1BP5A 3FVGA 4NF4A 4GVOA 4XXUA 3MAMA 3IX1A 3OENA 1H76A 1JVXA 4NF8A 1MY0A 1JVYA 3T93B 3KJ7A 3U94A 2AL5A 3SEXA 4ND9A 2RF1A 3O66A 2Y7KA 3TYHA 3HPIA 2D3IA 3R7XA 5AA2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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