4HBWA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a quinazoline ligand
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
b'SMNPPPPETSNPNKPKRETNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Identification of a Chemical Probe for Bromo and Extra C-Terminal Bromodomain Inhibition through Optimization of a Fragment-Derived Hit.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
source organism Homo sapiens
molecule tags Protein binding/inhibitor
total genus 45
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hbwA01
2YW5A 4Z1QA 4YABA 3P1DA 4O75A 2RNXA 4QSQA 4CUUA 1JSPB 2MJVB 5ENFA 4MR5A 4PCEA 5E9YA 2DVSA 4LZSA 5DKCA 4CFKA 5TB6A 4GPJA 3MQMA 5I7YA 3P1FA 3QZVA 4YYHA 5F5ZA 4UIXA 4UYFB 4X2IA 5F62A 5CPEA 4ALGA 5CQ4A 5LVRA 4J3IA 4NUDA 4IORA 5D3LA 5KHMA 4YK0A 5CTLA 4Y03A 5H1VA 4A9HA 4UYGA 4TZ2A 4ZQLA 3HMHA 5D26A 5AMEA 5LUUA 4NRCA 1N72A 4O78A 4NS5A 5LVQA 4HBVA 4TQNA 4QSRA 4O77A 5L97A 4O72A 4XUBA 4WIVA 5BT4A 4O7BA 4J1PA 4KV1A 2E3KA 2OO1A 3LQHA 5ENGA 2F6NA 5FE3A 2R0YA 5C4QA 3UVYA 3U5LA 5FE8A 3JVJA 4CUPA 5F63A 3O35A 5KO4A 3S92A 5ENBA 5L98A 5J0DA 4QYDA 5A5OA 4QSPA 4XY9A 5EPRA 2DVVA 5F25A 4MENA 4J0RA 4YBMA 2E7OA 4TU6A 5LKTA 5KTUA 5FG4A 4NRBA 5L8TA 4KV4A 4MR4A 5HENA 3O33A 5DFDA 5EISA 4HXRA 2R0SA 3SVGA 5I86A 4HXNA 5KTXA 5EV9A 4YY4A 5H1UA 5E74A 5FE5A 5FH6A 4UIZA 4CURA 3MB3A 4CUTA 5ENCA 1X0JA 1EQFA 5FE1A 2OSSA 4LR6A 4OGIA 5A7CA 3D7CA 4QSXA 5CUBA 5CUDA 4N3WA 4MEPA 4BW3A 3UVXA 4QEVA 2YEKA 5E7DA 5DFCA 2WP1A 4A9LA 5CFWA 4UITA 5D7XA 3TLPA 3LQIA 5DYAA 4TT6A 5G4SA 3IU6A 5I40A 2RFJA 5LJ1A 4N4HA 5ENJA 4A9IA 4HXLA 4LYWA 4QUUA 4QB3A 2I7KA 2H60A 2OUOA 4PS5A 3SVHA 4TT4A 5FBXA 5DBMA 4IR3A 5L8UA 4A9NA 5CQAA 5HFRA 5CQ7A 2NXBA 5DYXA 5A81A 5AD3A 5F61A 4UYFA 3U5PA 5JI8A 4YBTA 5DKDA 5AMFA 3UVWA 5D3NA 3JVLA 5HFQA 4F3IA 5DW1A 5F60A 4QYLA 3K2JA 4BJXA 5H1TA 5I89A 4QSUA 5EVAA 5IGLA 4UYHA 2FSAA 2KTBB 4HBYA 4O71A 1WUGA 4MEQA 4TT2A 5DY7A 4C66A 3MULA 4UYDA 5CQ8A 4YYGA 4QNSA 3MXFA 4UIWA 4WHWA 5E9MA 2DKWA 5CQ5A 3FKMX 4YYKA 5A5QA 4Q0OA 4E96A 4LRGA 5HRXA 5EPBA 5F1LA 4BW1A 2LSPB 5A82A 4LZRA 5E73A 5II1A 4TU4A 3O34A 4UIUA 5DLZA 4BW2A 3SVFA 5EU1A 5TCMA 4QR5A 5LKUA 4A9OA 5HQ5A 5IG6A 5FE6A 4QC1A 4A9FA 2DATA 4N4GA 4PY6A 5II2A 4BW4A 4YYDA 3O37A 5LJ2A 5EWDA 2F6JA 5F2PA 1F68A 5EP7A 5C89A 5C8GA 3HMFA 4LYSA 3Q2FA 2RNWA 5EA1A 5FG6A 4YYJA 5A5PA 4HXMA 2YYNA 2I8NA 3LJWA 5E3GA 1E6IA 5F3AA 5EICA 4WHUA 3MUKA 4TYLA 4NR7A 5COIA 1WUMA 4NR5A 4Q0NA 2RO1A 5FFYA 4IR4A 4HXPA 3RCWA 4UIYA 5I29A 4QY4A 3P1EA 4O7FA 5A85A 4O76A 5HRVA 4LZ2A 4LDFA 3AADA 4HBWA 4NR9A 4YH3A 3UVDA 5HRWA 2G4AA 5EGUA 5BT5A 4Z6HA 4XYAA 5CUCA 4QSTA 4O7CA 5E3DA 5FE2A 5CRMA 5CUEA 4QEWA 3U5NA 4Z1SA 5L99A 5EWVA 5IGNA 5I83A 5D25A 5CQTA 3U5JA 3UV2A 2RI7A 5ETBA 5L96A 5CGPA 5CQ6A 5HJCA 5EPSA 5FB0A 5D3JA 2RS9B 5FE0A 3S91A 4OGJA 4NR6A 4QR4A 5D3TA 4QC3A 5KTWA 2YDWA 5CP5A 5JWMA 3UV5A 4TZ8A 5D3SA 4XY8A 3MB4A 4J0SA 3Q2EA 4IOQA 2YQDA 5LKZA 3I3JA 4MEOA 5EWHA 4YADA 5AD2A 3O36A 5BT3A 5I1QA 4NR8A 5D3PA 5E9IA 3AQAA 5CQ3A 4UYEA 5FE9A 3DAIA 4NRAA 4OUFA 4QR3A 4NQMA 2DVQA 4TS8A 3IU5A 4O7AA 5HCLA 5ACYA 3G0LA 2GRCA 5H85A 1ZS5A 4DONA 5EM3A 4NR4A 4NUEA 4YY6A 5A5RA 5FB1A 3P1CA 4IOOA 2D82A 5D24A 4CL9A 4HXKA 4AKNA 5FE7A 5DYUA 4QSSA 4QUTA 5LJ0A 5A83A 4A9JA 4QEUA 5FH8A 5E9VA 4A9KA 5C87A 4YYNA 4QBMA 2E7NA 4NYXA 4HXOA 4YAXA 5DFBA 4NYVA 3LQJA 5DKHA 4PTBA 4MR3A 4ZW1A 5HQ7A 4ZC9A 4YATA 4TTEA 4QZSA 5LKXA 5C85A 4N4IA 5F1HA 3DWYA 5A5NA 4YC9A 4IR5A 5G4RA 3ZYUA 5FFVA 2L5EA 5D3HA 5FDZA 4YYIA 4N4FA 3U5OA 2YELA 2D9EA 2DWWA 5FE4A 3NXBA 5DX4A 5IGMA 5DW2A 5CS8A 5ENHA 5CY9A 4MR6A 5D3RA 4YYMA 4XUAA 5ENIA 4CFLA 4RVRA 5K29A 5IBNA 5HELA 4A9MA 1JM4B 4FLPA 3LXJA 5C7NA 5D0CA 4QSVA 4YBSA 4O70A 3UV4A 5EWWA 5HEMA 4HXSA 5CRZA 2DVRA 3UW9A 4O7EA 5CUAA 3QZSA 3U5MA 4C67A 3GG3A 4O74A 4UIVA 4CUSA 5EK9A 4A9EA 3JVMA 5IGKA 4LYIA 5IIDA 5I80A 2R0VA 3G0JA 5DYCA 4HBXA 3P5OA 5E0RA 5I88A 5ENEA 5E9KA 4ALHA 5EI4A 4BHWA 4Z6IA 5CUGA 2R10A 4YH4A 4QSWA 2WP2A 5CU8A 5CZGA 5HQ6A 5A5SA 3ONIA 3QZTA 5I7XA 3HMEA 4Z93A 2L84A 5F36A 5HLSA 4PCIA 2YEMA 4CUQA 2L85A 4NUCA 4KCXA 2RNYA 4PKLA 4LC2A 5FG5A 3U5KA 4NXJA 3JVKA 5ETDA 4IR6A 5FFWA 5DLXA 5FH7A 5EQ1A 5HM0A 5KU3A 4CLBA 4NQNA 4NYWA 5E9LA 5EWCA 2N9GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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