4HBWA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a quinazoline ligand
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRETNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Protein binding/inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Identification of a Chemical Probe for Bromo and Extra C-Terminal Bromodomain Inhibition through Optimization of a Fragment-Derived Hit.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
total genus 45
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hbwA01
4ZW1A 5CQ8A 4OUFA 4KCXA 4UITA 5CUCA 4WHWA 5IGKA 4J3IA 5DLZA 4LYIA 3P5OA 4YYIA 4HXPA 5ENJA 4CUPA 3JVLA 4HBWA 5FE2A 5ENGA 4HXNA 5IG6A 3U5MA 3MXFA 5DYUA 4J1PA 5CPEA 4MR6A 5CUGA 4NYVA 5DYCA 4HXKA 5AMFA 4TS8A 4AKNA 2H60A 4O77A 5E9KA 4NR8A 5A85A 4QYDA 4IR3A 5EWHA 4HBVA 4QC3A 4NQMA 5I29A 5KTUA 4YYNA 5EPRA 4QEWA 5KU3A 4YH4A 5D24A 3O34A 4QC1A 3P1DA 4HBYA 5AD3A 4QUTA 5BT3A 5LUUA 3MUKA 5A5OA 5FE7A 4HXLA 4E96A 3U5PA 4J0SA 4TYLA 5DFCA 5HEMA 4MEQA 4YADA 4XY8A 4N4HA 5EPSA 4TT2A 1EQFA 3K2JA 5DW2A 4QYLA 5EU1A 4QSXA 3JVKA 4CUUA 4YK0A 5HM0A 2MJVB 4LYWA 5C85A 4F3IA 5JWMA 5I40A 3SVHA 5D3TA 1X0JA 5F62A 5COIA 2L85A 1WUGA 4NUCA 5FH6A 5LKTA 4J0RA 4QSWA 5LJ0A 5ENIA 5ENHA 4UIXA 5E9VA 2D9EA 5A83A 5FBXA 5KO4A 5EK9A 3G0JA 4XUBA 5EWDA 4KV4A 5E0RA 4X2IA 5CQ6A 2R0YA 4C66A 5EWVA 3RCWA 4HXOA 3QZSA 4PS5A 3QZTA 5CUAA 4HXSA 4QR4A 4Z6IA 4MENA 2E7OA 5K29A 4O71A 5EM3A 2I8NA 3HMEA 5CU8A 5F61A 4UIYA 2DWWA 3LQJA 4N4GA 3UV5A 4BW2A 4NYXA 5CTLA 4QZSA 5D3PA 4IOQA 5HQ7A 5LVRA 4A9KA 4LR6A 2RI7A 4TU6A 1WUMA 5CQTA 3IU5A 5EI4A 4UIWA 4Z1SA 5DBMA 4QBMA 5HCLA 3LJWA 5I7XA 5FB0A 4MEOA 4GPJA 4O74A 3HMFA 4TQNA 1JM4B 5H1UA 4QEUA 4NUDA 5D26A 5CQ3A 2DVVA 5A5SA 5DW1A 4UYDA 5ACYA 2RO1A 3D7CA 5F2PA 3LQIA 4CUQA 4A9EA 2YW5A 4YYHA 5EGUA 4NR9A 3O37A 5E74A 4TT4A 4O7FA 5HJCA 4ZC9A 4RVRA 2RFJA 4CUSA 4IORA 4YBMA 3O36A 5D3HA 4MR5A 2WP2A 4OGIA 5F36A 4BW3A 4NRBA 5CRMA 1N72A 4UIVA 4Q0OA 5L96A 5E9LA 5EPBA 5KTWA 5HQ5A 5L8UA 3O35A 5AMEA 4A9FA 4A9LA 3UVYA 3AQAA 4YY6A 5KTXA 4NR6A 2I7KA 4QSSA 5IGMA 2R10A 4A9OA 5CUBA 5FE4A 5D3JA 3FKMX 5DKDA 5A7CA 3MQMA 3P1EA 5KHMA 4IR5A 3ONIA 5BT5A 4QB3A 3P1FA 5FE8A 5I80A 4NYWA 4ALHA 5C7NA 4BW1A 5E3DA 3MULA 2R0VA 4XUAA 4ALGA 5FFYA 3MB3A 5JI8A 4O76A 2D82A 5EWCA 4PKLA 2G4AA 4LC2A 4N3WA 4Z6HA 5HFQA 5FDZA 5C8GA 2RNYA 1F68A 4BHWA 4UYGA 5E7DA 5L97A 5H1VA 4O75A 2DATA 4NUEA 5DYXA 2DKWA 4OGJA 4YYGA 5F1LA 5CUDA 5ENFA 2RS9B 4WHUA 2F6NA 5CQ5A 5I83A 4YATA 4MR3A 1ZS5A 4UYEA 5CZGA 5D3NA 4Q0NA 5ENBA 4YC9A 4YH3A 5CQ7A 2E7NA 4NR5A 4IR6A 5HRWA 5G4SA 5FG5A 5E73A 4FLPA 3LXJA 2DVSA 5FE3A 4CURA 4O7EA 4Z93A 4YABA 5EICA 5IBNA 5FE5A 3UVXA 3Q2FA 4LYSA 5J0DA 2YELA 5EV9A 5HQ6A 4QSUA 5F63A 1E6IA 4O78A 5CQAA 5BT4A 2L84A 4N4IA 4UIZA 5E9YA 5FH7A 3LQHA 3DWYA 3DAIA 5LJ2A 5L99A 5ENEA 5FG6A 4CL9A 5FFVA 3ZYUA 5LKUA 4O72A 4O70A 2OO1A 4QSTA 4TT6A 4XYAA 5EA1A 3TLPA 2YEKA 4O7BA 4O7AA 4CFLA 4QUUA 4PY6A 3MB4A 5D3RA 2YYNA 4UYFA 5D3LA 5HLSA 2DVRA 5EWWA 5HENA 5H85A 4YYKA 5L8TA 2FSAA 5EP7A 4YY4A 5F3AA 2DVQA 4NRCA 5FFWA 5FE0A 5A81A 4NQNA 5A82A 5LKZA 1JSPB 5C87A 5IGNA 4CFKA 5D0CA 4ZQLA 4KV1A 5E9MA 4TTEA 5DFBA 2GRCA 5A5NA 5CS8A 5CUEA 5D7XA 4LZRA 5C89A 4QR5A 3P1CA 4BJXA 5D3SA 2KTBB 4DONA 4QEVA 2NXBA 5ENCA 5CFWA 4HXRA 5A5PA 5I7YA 5F25A 4O7CA 4NS5A 5HRXA 2E3KA 3U5OA 2F6JA 4QNSA 5H1TA 4HBXA 4NR4A 2N9GA 2RNWA 5E3GA 5I89A 5LVQA 4A9JA 4QSQA 3U5KA 3GG3A 4YYDA 4N4FA 3UV2A 3JVMA 4TZ8A 5EQ1A 5AD2A 2R0SA 3U5JA 2YEMA 4LZ2A 3S92A 5HFRA 4C67A 5CY9A 4YYMA 4HXMA 4A9MA 5HRVA 3UV4A 5FE6A 4A9IA 5CQ4A 5LKXA 5CRZA 3UVWA 5G4RA 3SVGA 3UW9A 5I86A 3AADA 4LRGA 2LSPB 4MR4A 3G0LA 4TU4A 4PCIA 5TB6A 5II1A 4QSVA 5I1QA 4NXJA 3IU6A 4QY4A 5DY7A 4NR7A 2YQDA 5FB1A 5FG4A 4PTBA 2OUOA 5II2A 3UVDA 5F60A 5TCMA 5DYAA 5HELA 5FH8A 4XY9A 3O33A 4CUTA 5A5QA 4UIUA 5ETBA 5EVAA 2YDWA 4CLBA 4MEPA 4YBSA 4WIVA 4YYJA 5DKCA 5EISA 3QZVA 4LDFA 5D25A 3U5LA 2RNXA 4QSPA 5E9IA 3SVFA 4Y03A 5I88A 3S91A 2L5EA 2WP1A 5A5RA 5F5ZA 2OSSA 3JVJA 4BW4A 4YBTA 4UYHA 5FE1A 5F1HA 5IGLA 5L98A 5DFDA 4QR3A 4A9HA 3U5NA 4PCEA 4YAXA 4NRAA 4Z1QA 3Q2EA 5DKHA 5IIDA 5FE9A 5ETDA 5DLXA 5LJ1A 4UYFB 3HMHA 4LZSA 5CGPA 5CP5A 4IR4A 3NXBA 4IOOA 3I3JA 5C4QA 4QSRA 4TZ2A 5DX4A 4A9NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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