4HBWA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a quinazoline ligand
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRETNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Protein binding/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Identification of a Chemical Probe for Bromo and Extra C-Terminal Bromodomain Inhibition through Optimization of a Fragment-Derived Hit.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 45
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hbwA01
4Z1SA 4X2IA 5FE1A 5C7NA 5HCLA 2R0YA 3LQJA 4LZRA 5DLZA 5CUEA 4PCIA 5A5QA 4NYXA 5LJ1A 4YC9A 4MR4A 3DAIA 5KO4A 4WIVA 5EPRA 3DWYA 4HXKA 3HMFA 5FH6A 3O33A 4GPJA 5CQ7A 5E74A 5L99A 5I40A 4PY6A 5L97A 5H1UA 5FG4A 4BHWA 4XY8A 5EWHA 4UYFA 5F3AA 5F60A 4QNSA 4O75A 5A5RA 2OSSA 5CRZA 5EA1A 5E3GA 2YEMA 4HBVA 3LJWA 5IBNA 5I1QA 5EI4A 5IGMA 5L96A 3QZTA 2OUOA 4NYVA 3SVHA 1WUMA 4NUCA 5CFWA 5FE0A 4TT2A 4YH4A 4PCEA 4QR3A 5FE7A 3HMHA 5KTXA 2RFJA 5FE3A 2DVVA 5EV9A 5IG6A 4QSQA 2WP1A 5LVRA 4QSXA 5EM3A 5EU1A 5AD2A 5ACYA 5EK9A 3UV4A 2E7NA 3MULA 3GG3A 2D9EA 4OUFA 5DBMA 5KTWA 5DW1A 4O70A 2OO1A 5AD3A 4NR8A 4UIWA 4CUUA 2G4AA 4NUDA 4YY6A 4BW2A 5HEMA 4MR5A 4IOOA 5JWMA 5D24A 4NR6A 3JVKA 3UVWA 5KHMA 5CUDA 4UYFB 3IU6A 5FE5A 4NR4A 3MUKA 3P1CA 5ENJA 5I89A 5D3PA 5D0CA 4IORA 5A81A 5E9LA 2YYNA 5CTLA 4QUUA 5BT5A 5E0RA 5CZGA 4NYWA 4LZSA 4WHUA 5CP5A 3HMEA 2LSPB 2DWWA 5HENA 4A9HA 1F68A 5HRXA 5CQ5A 5D3LA 4LRGA 5D3HA 2I7KA 4QYDA 4N4FA 4YADA 4LZ2A 5AMEA 4HBYA 4NR5A 5L98A 5FE9A 5DLXA 4AKNA 5FE4A 4YH3A 3O37A 4QUTA 4NRBA 4Z1QA 4MR6A 4CL9A 5IGLA 2DVQA 2YDWA 4PS5A 4KCXA 5COIA 4O7AA 4QSPA 3P1EA 4UYHA 5FE2A 5EWCA 5F1HA 4NQMA 4OGIA 3U5NA 5KTUA 4NS5A 4BJXA 4PKLA 1JM4B 2D82A 5D3JA 5FFYA 3LQIA 4QSUA 5G4SA 4HXRA 4Y03A 4LYWA 1E6IA 5TB6A 3LXJA 4A9IA 5LKXA 5FH8A 5F25A 3U5JA 2NXBA 4YATA 3UVDA 4A9JA 3U5KA 5DFDA 4UIZA 2RNXA 4OGJA 5LUUA 5EWVA 1JSPB 4LYIA 5FG6A 5LVQA 5F1LA 4YK0A 4J0RA 5FFVA 5IGNA 5H85A 5HLSA 2RNYA 5DYAA 5G4RA 4YBTA 4Q0NA 5CRMA 5DFBA 4HXOA 5JI8A 3FKMX 4FLPA 5CUAA 3SVGA 5J0DA 3UV2A 4QEUA 4CLBA 4N4HA 4QSWA 5A5OA 3UVXA 4TT4A 5HQ6A 4IR3A 2R10A 4XY9A 5HQ5A 5EGUA 5L8TA 5LJ2A 4QSVA 5E73A 4CFLA 3P5OA 4QSTA 5DKCA 5F5ZA 5K29A 4XUBA 5CUGA 3P1DA 2F6NA 2I8NA 4O7CA 4MEOA 4O74A 5ENIA 5C8GA 2L84A 4QEWA 4YBMA 4UIVA 3O34A 3UW9A 2MJVB 4TT6A 5FH7A 5II2A 5LKTA 5DYCA 5E3DA 5FE8A 4UYGA 4QZSA 2KTBB 3SVFA 5HRWA 4BW4A 5A5PA 5I88A 4A9FA 4YBSA 5C85A 3U5OA 4YABA 1ZS5A 4O78A 5F62A 4WHWA 4O76A 5I83A 2RS9B 5I7XA 4IR6A 3S92A 4IR4A 4BW1A 5CY9A 2YQDA 4NRAA 4YYDA 4MR3A 5E9IA 5BT4A 5TCMA 5EISA 3O35A 5CU8A 4QBMA 3Q2EA 4PTBA 5DX4A 4NUEA 3ONIA 4LYSA 2GRCA 3I3JA 5C87A 5ENHA 5A85A 1N72A 4Z6IA 4QYLA 5E9YA 5CQ8A 4ZC9A 2DKWA 4YYKA 5DYUA 5EPBA 5EWWA 5HRVA 3AQAA 5ENBA 5CGPA 2N9GA 4HXPA 5IGKA 5D3RA 4YYNA 5CPEA 5HELA 5A82A 5ETBA 2WP2A 4YAXA 4F3IA 4E96A 5LKZA 5DKDA 4NR7A 3ZYUA 4C67A 5FB0A 4HXMA 4IR5A 3NXBA 5CQTA 4O77A 4TU4A 4J1PA 4QC1A 5CQ6A 4YYJA 4CURA 3JVLA 5FG5A 4QR5A 5EPSA 4CUTA 3MXFA 5EICA 4BW3A 4KV4A 5KU3A 5I29A 4N3WA 5FBXA 2L85A 5AMFA 4TZ8A 4CUPA 3MB4A 4N4GA 4NQNA 5DKHA 4A9KA 5F36A 2R0SA 4A9EA 4Z93A 4TU6A 5C89A 5FE6A 3P1FA 3Q2FA 3JVJA 4YYGA 5HFRA 2E7OA 3MB3A 4N4IA 5E9VA 5LKUA 5CQ4A 4A9LA 4QB3A 5LJ0A 3QZSA 4J3IA 5EQ1A 3TLPA 4O71A 5L8UA 5E7DA 4J0SA 4NRCA 4LR6A 3RCWA 5D25A 5ENFA 4CUSA 4HBXA 3U5LA 4YYHA 4HXLA 2YW5A 3LQHA 4DONA 3G0LA 2DVRA 4HBWA 4CUQA 4YYMA 5HM0A 5EWDA 4XUAA 4YYIA 5A5NA 5BT3A 5F63A 5H1TA 2DVSA 4XYAA 5D3SA 3O36A 5CQAA 2H60A 4LC2A 4LDFA 4ZQLA 2YEKA 5I80A 4IOQA 5DFCA 2YELA 5DY7A 2FSAA 5CUBA 5IIDA 2RNWA 4RVRA 4TQNA 5D3TA 3UV5A 5HJCA 4TTEA 4ALHA 4UIXA 4O7EA 5E9KA 5A83A 5HQ7A 5CUCA 5DW2A 2DATA 4YY4A 3MQMA 5A5SA 4O72A 4UYDA 4MEPA 4TYLA 3U5PA 5F2PA 5ENCA 4MEQA 5D3NA 3G0JA 4QR4A 4O7FA 4MENA 2RI7A 4NR9A 3U5MA 4QEVA 4A9NA 5ENGA 5I7YA 4QSRA 4QY4A 4KV1A 4Q0OA 4Z6HA 4TS8A 1WUGA 4NXJA 5EVAA 4UIYA 3S91A 4A9MA 5F61A 5II1A 4UIUA 5CQ3A 4O7BA 1EQFA 5C4QA 4QSSA 5A7CA 3IU5A 5D26A 5I86A 2RO1A 5FFWA 5E9MA 3JVMA 4ALGA 5FDZA 5DYXA 1X0JA 5FB1A 3QZVA 5CS8A 4QC3A 4HXNA 4A9OA 4HXSA 5ETDA 5HFQA 2E3KA 2F6JA 2L5EA 4TZ2A 5D7XA 5H1VA 4UITA 3AADA 4C66A 3UVYA 5EP7A 5ENEA 4UYEA 2R0VA 4CFKA 3D7CA 3K2JA 4ZW1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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