4HDEA

The crystal structure of a sco1/senc family lipoprotein from bacillus anthracis str. ames
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
168
structure length
168
Chain Sequence
ALRKPLNWDLETFQFTNQDGKPFGTKDLKGKVWVADFMFTNCQTVCPPMTANMAKLQKMAKEEKLDVQFVSFSVDPDLDKPENLKAFIQKFTEDTSNWNLLTGYSLEDITKFSKDNFQSLVDKPENGQVIHGTSFYLIDQNGKVMKKYSGISNTPYEDIIRDMKRLAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of a SCO1/SenC family lipoprotein from Bacillus anthracis str. Ames
rcsb
molecule tags Lipid binding protein
source organism Bacillus anthracis
molecule keywords SCO1/SenC family lipoprotein
total genus 46
structure length 168
sequence length 168
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4hdeA00
1JLWA 1SYXA 1A2MA 5J5NA 1GTBA 3Q74A 4YQMA 3UJ1A 1G6WA 3HDCA 1M9BA 3C1RA 3ISOA 4N30A 4O32A 1FW1A 1TP9A 2CT6A 1BYEA 1O81A 2NBSA 2KHPA 1S3AA 3LYKA 1KTEA 3TKPA 2YCDA 1TRWA 3CRTA 2VIMA 2EIOA 3AY8A 3F4RA 2DLXA 2I1UA 3EWLA 3WGEA 5DCHA 5F07A 1UC7A 2GS3A 3CSIA 2B5YA 3RAZA 1X9SB 2L57A 2C3TA 1XCCA 1XVWA 2GSTA 4CDOA 1U88A 3D21A 2IN3A 4I5QA 3E0UA 4GTUA 3VPTA 4X43A 4JE1A 3GKNA 2LRNA 4G9HA 3KH9A 17GSA 1GSYA 3RHCA 2H0HA 1Z7PA 2CQ9A 2DSAA 4PUAA 4F03A 3UBLA 1TRSA 4KDXA 2B1LA 2PN8A 2DJ2A 4BWSA 4D73A 4EDZA 1HNAA 2KUCA 1ST9A 3K8NA 4ZB8A 4F0BA 3PR8A 1SYRA 4AGSA 1W89A 1FG4A 1Y25A 2LRTA 1Z6MA 4PQIA 2MYGA 4K0GA 1Y6EA 4OCFA 2HRFA 3TJKA 3QD9A 3US3A 3FK8A 2YWIA 3TGZA 3ZVJA 5FWGA 3LFLA 5GZZB 3VWVA 4ZIJA 3KZQA 4AJ6A 5DBQA 3UOMA 5J9CA 2WZ9A 3EE2A 2M72A 5DAKA 3LGCA 1I5GA 7GSSA 1JZDA 4LMVA 4GSSA 5ID2B 4EKZA 5A4VA 5G30A 2LKUA 2H1GA 1TXXA 4LLRA 2AV4A 1UN2A 2WS2A 3ZITA 2H8LA 1VF1A 2CVBA 1GSDA 4QL9A 1ZMAA 2ALBA 1B4PA 4GLTA 2DBCA 2AYTA 5DJLA 4L5OA 4MZWA 4O5RA 3IOSA 2OE0A 3RBTA 2IMDA 1TU7A 2EIRA 3GH9A 2WJUA 4WR4A 4J57E 1GTAA 2K8SA 4MPFA 3UARA 1QXHA 2B3SA 4TXOA 4TXVA 2PWJA 2XHFA 4QL7A 4MP4A 5JCUA 2GTUA 5KN1A 1GTIA 2BJXA 4ZB9A 1GUKA 4IW9A 3FEUA 2TRCP 4MK3A 1A23A 1GH2A 4HZ2A 5G1KA 4V1Ap 3D6IA 1TRUA 1WRYA 2LTKA 5B7CA 3SBCA 5A5KA 5KN3A 1SD9A 1NHYA 5DQYA 2O85A 2WDUA 3H79A 1MDKA 4YAPA 1K0NA 3H8QA 2FNOA 2VM2A 4KCAA 5GSTA 2WRTA 4NHZA 3EURA 3V1WA 3ZREA 1ON4A 1YQ1A 2V2GA 3DEXA 3LWAA 3TOTA 2NTOA 1KNGA 4KA0A 4PX1A 2IPAA 5EPFA 3KMOA 3TKSE 4ECIA 5ECHB 1M2BA 1YDKA 1RQMA 4IKHA 2K18A 4NV5A 3IHQA 1XBSA 1MD4A 4NPBA 3LXZA 1VRSD 1AAZA 3C7MA 4TOPA 1H75A 1VGLA 2YZHA 4HU9A 1G7EA 1PGTA 4OMVA 2QKEA 3ED3A 2AUVA 4OFNA 3DVXA 1B9YC 4GQFA 1X5EA 4HS1A 2CVDA 1GSSA 1EP7A 2JSYA 5ECRB 1V58A 3UIWA 1TRVA 3HA9A 2FCHA 1O73A 1OC9A 5E4WA 1EOHA 2P5RA 4HQZA 1U3IA 1TK0B 3GA4A 4MMMA 3ZIVA 3BD2A 2IMKA 2AB6A 1PA3A 2FD3A 4MF6A 4F82A 2OACA 4TN8A 4YH2A 1QFNA 3TDGA 4LA1A 3QDNA 2VD0A 3FY7A 1VF4A 3GTUB 1LU4A 2I4AA 1NHOA 2DJJA 5CP1A 3M0FA 18GSA 5CRWA 4ILFA 5LNKe 2E7PA 2VCVA 1RW1A 2J23A 5ECMB 5ECSA 4MH2A 4EXJA 1PQNA 2GSSA 2VD1A 1SKRB 2L5OA 3M8NA 4MF7A 11GSA 1T4YA 4WBJA 4PURA 1EV4A 1EWXA 4GWRA 3I9V2 4MJEA 2F8AA 1FB0A 4BVYA 3P8WA 1F3BA 3LG6A 2PBJA 4PGTA 4IJ3A 3QMXA 2IMFA 2L6CA 2GQKA 2FA8A 2R2JA 2H01A 2E0QA 2OKAA 1VF3A 2VCZA 1FVKA 2N5BA 4ZB6A 3VLNA 1ABAA 1X0RA 4L5LA 5ECLB 2FWGA 1WWJA 4PUFC 3G9BA 2OADA 4BA7A 1X9MB 5F06A 2MMAA 3HY2A 2C80A 2KP2A 2M80A 3UVTA 1AQXA 1O85A 16GSA 1M99A 5AIVA 3ZMLA 3GN3A 3D5JA 4FYUA 3HVXA 3ZYWA 1BQ7A 1TK8B 4JZQA 1PMTA 2GZZA 2H75A 5B8AA 1C72A 2H6XA 3MDKA 4XIHA 2MMNA 1GNEA 4KUNA 3QOUA 2CZ3A 5KN2A 1SL2B 1OE7A 1TTZA 4AJ7A 3CBUA 5ELGA 3TKQA 4ULXA 5DDLA 1PKZA 1GSQA 3HVSA 1J08A 2JSZA 1SK2A 3IE3A 2KP1A 2B5EA 1MD3A 3PINA 1ZYEA 4WEYA 4JEDA 3ZVJD 1IYIA 3O3TA 2C0DA 1I9DA 2JACA 5H5SA 3WT1A 1FOVA 3EVIA 4PNFA 1A8YA 2N5FA 5E59A 2GSQA 3F63A 4KGIA 2ON7A 3DD3A 2LS5A 2VCXA 3QFBC 1PN9A 3ZLPA 3UVHA 1M2AA 2M46A 2HNLA 2WFCA 1CQGA 4POMA 1B8XA 1QMVA 3GX8A 1GSFA 2KOKA 5CAXA 4TR0A 3M3MA 1PD21 2V6OA 3PH9A 1XW6A 4IELA 2YWNA 3HKRA 1EGRA 4JR4A 3KH7A 1EZKA 5HFGA 3QCPA 2REMA 2JZSA 4GCIA 1U6TA 1TJDA 1BJXA 5IPGA 4MJCA 2YV9A 2FLSA 4ID0A 5CRGA 3D4MA 1GP1A 2HI7A 5EL8A 3TRXA 4L0WA 1F2EA 5IIZA 1BG5A 2YN1A 2IIYA 4ECJA 3TKSA 2LRCA 1T7PB 5B8BA 4KAEA 5AIXA 1BAYA 1AC1A 3I43A 2VCTA 3CMIA 4Q5RA 5LD0A 1DE1A 2G0FA 4XS4A 1A8LA 3VI7A 2O7KA 1K0MA 3DXBA 3BBYA 3KD0A 4MJAA 5CRDA 2H30A 6GSTA 1WMJA 3HJOA 5IO0A 2HLSA 1SJIA 3HZ8A 5D96A 2V1MA 2A2SA 5LCZA 2LJAA 4PXOA 5KEJA 1K0BA 1NW2A 2VL9A 1EEMA 3GKXA 2C3QA 2B6MA 3FKFA 2P31A 5EVOA 4OCEA 2V41A 3Q19A 4LL4B 3F4SA 2CVKA 1FB6A 1QUWA 4TR3A 1OVNA 2FA4A 2FGXA 3WT2A 1XW9A 3GSTA 1XWKA 4IBPA 1N8JA 4MCUA 2JU5A 5AN1A 1QQ2A 3IV4A 2HZFA 1Z9HA 2V32A 2YOIA 3PGTA 2VOCA 4IGJA 1TOFA 5J41A 3IPZA 1XXUA 5IPHA 3FRCA 4DSSA 2FY6A 2LQOA 1THOA 2QC7A 4K0NA 1PKWA 2X8HA 2LJRA 4Z7XA 1TDIA 2VLUA 2VL2A 3LQ7A 1WIKA 1B9XC 5F05A 2CAQA 3UEMA 2H70A 2HXKA 1RK4A 2NPBA 2O89A 6GSUA 1YJ6A 13GSA 4GXZA 5A4WA 1ZCPA 5ENUA 1ZZYA 4EE0A 4NMUA 3GKMA 4OO4A 1GTUA 5C00A 1GULA 4POBA 5B6NA 1V2AA 1WE0A 2P0GA 4IVFA 1BEDA 3RPPA 3WGDA 2V6KA 4CW9A 1MDIA 2ON5A 1PRXA 5IMCA 4MABA 2D2ZA 3TJBA 5DQSA 1GL8A 4MDCA 5DALA 2ES7A 5JWOB 1XFLA 3A3TA 2X99A 2GQLA 3HHVA 2YWMA 2H1AA 4CHSA 2H0GA 5COHA 3GHAA 3MSZA 1GSEA 1FAAA 3I69A 1Z3EA 1OKTA 4HUAA 2AAWA 5ECIB 2I3YA 4NHWA 2B5XA 3W8JA 1YEXA 4POLA 1T00A 1USBA 5ABRA 2R5GA 2K9FA 2CA8A 2RUFA 4XCSA 3L4NA 6GSWA 4HEA2 20GSA 1ZOFA 4RQXA 1T8EB 1G6YA 3A5WA 2VUPA 2E2MA 4ZBAA 3APQA 2AJQB 4HOJA 2RM5A 4OO5A 2GZPA 3F6DA 3FR9A 4HZ4A 3L9UA 1B48A 2JZRA 1AIUA 1SK1A 1CQHA 5D73A 5J9BA 5HR2A 5IMZA 4EF0A 2RUEA 1PL1A 1SKSB 3CXGA 1XZOA 1A2LA 3N9JA 3BJ5A 3U6VA 2H6ZA 4HJ2A 3UBKA 1XPVA 3KMNA 4N0ZA 1XOAA 2WCIA 4OD7A 1WP0A 3GIXA 2YZUA 3KXOA 2OE3A 1YY7A 4HU7A 5GAPD 4ZBDA 1PX7A 2GT6A 3KP9A 4JU5A 1JHBA 1UA5A 2AHEA 5DCGA 6GSYA 1R7HA 4OFTA 1R5PA 5FT3A 4IQ1A 3G7IA 3FZ4A 2IMEA 4PQ1A 2OA7A 3EYTA 4IHUA 2IFQB 3GURA 3DIEA 4KCEA 4ZL8A 1SKWB 4ACSA 4KSOA 2HZEA 3CYNA 5EY6A 2BMXA 2H66A 2OE1A 4L8EA 22GSA 5IOWA 3WYWA 1F6MC 1URMA 4F2IA 5IO2A 3GYKA 3DYRA 4FYBA 4XS6A 1AUCA 4BWQA 19GSA 4WR5A 2WULA 2O8VB 2HE3A 2R3XA 4HI7A 3DGQA 5HR3A 1ZYQB 1T3BA 3TJJA 3CTFA 3FZ9A 1KEBA 2VCQA 3C71A 3HVVA 2LNTA 4LMWA 1WJKA 1OC3A 1K3LA 4XRAA 3F8UA 1AQVA 1V40A 2PVOC 3CSJA 2X64A 4HJMA 1GUMA 1AXDA 3WD6A 1O7UA 4WF4A 2XPEA 2MMOA 2CX3A 3ZRDA 2GLRA 5C04A 3ZZXA 1K0OA 5ECPB 4EUYA 5JCWA 1ACVA 4TR1A 5ECOB 3IDVA 1GRXA 1U3AA 4MLYA 2DJ3A 2WB9A 4F0CA 3M9JA 2PUKC 2CAIA 2HYXA 3F0IA 1BX9A 3JCML 12GSA 3HCZA 3Q6OA 3ME8A 4I8BA 5AGYA 1PSQA 3HD5A 4I97A 3M1GA 2VLVA 3LORA 4MZBA 2LEGA 4D73B 3LJRA 2BTOT 2TRXA 3C1SA 1WOUA 4KSMA 1XIYA 2X8GA 5CRHA 3QAGA 1SL0B 4V2NA 2LV3A 4WXTA 3SWLA 1S3DA 1W4VA 2R4VA 1XOBA 3F3RA 1E2YA 5ID2A 2MMZA 1M7TA 1JZWA 3ZFLA 5IQYA 1K0DA 4TRXA 4G10A 3D22A 4K6XA 4K9ZA 2DMLA 3ME7A 3ZIJA 2FWEA 1TKDB 5DAKB 2H74A 3IRAA 2QGVA 4G2EA 2HSYA 4DEJA 5G2ZA 1S3CA 8GSSA 2RIIA 1DUGA 1LBKA 1ZL9A 3UL3A 2CV4A 3HJMA 2EIQA 4MPGA 3L9VA 4NV2A 3VK9A 4G19A 3IC4A 2C0GA 4K7NA 5IMFA 3DWVA 9GSSA 2F51A 1XWGA 1G7OA 4E8HA 1EGOA 3L0HA 3TB2A 3ZFBA 4ECBA 2VM1A 5DALB 2Z9SA 2I9HA 4XRDA 1GSUA 3GH6A 2DMMA 3NOFA 3DMLA 5L71A 3P2AA 4ZXGA 4NAXA 2YWOA 3FYGA 4TXOB 2C1YA 5IM9A 1U87A 4KDUA 2HFDA 1X5DA 2OBKA 2HT9A 4LL1B 2R6KA 3GMFA 3H1NA 1NM3A 3E9JB 2FUG2 3E3EA 2L59A 4EDYA 1XVQA 1JFUA 1XW5A 1K0AA 3TJFA 4N0VA 2FHEA 1DE2A 2PGTA 1XWBA 1QK8A 3GUSA 2C4JA 1K3YA 2RLIA 5ELAA 2VLTA 5B6MA 3EU4A 1SL1B 3VWXA 3F9UA 3H4KA 4WETA 5IMAA 4WBRD 2F3MA 3ZMKA 2WGRA 3L78A 1K3OA 5KN0A 1A24A 1ERUA 3A2XA 4I6XA 3KEBA 2GZYA 1JLVA 3WGXA 1M9AA 5CNWA 2FWFA 4K7OA 1PL2A 2L6DA 3KTLA 3KTBA 5ECQB 2H72A 1TI1A 2JL4A 2DIZA 2LQQA 5F8BA 4V2MA 2HZEB 4MZCA 1XWCA 4V2LA 3J7Yk 4TW5A 4XHMA 1A0RP 4HQSA 2H73A 3O76A 4XTSA 4IN0A 4BL7A 2OBIA 5D9TA 5G1LA 1K0CA 5D9XA 4YQUA 3IXRA 3GTUA 4ML6A 5DVBA 3P90A 1EV9A 3DRNA 1MEKA 1O6JA 1R4WA 1OC9B 3W8SA 1ERWA 4KB3A 5AISA 1V98A 3N5OA 3CTGA 1A0FA 2GQMA 3FR6A 4EVMA 1OE8A 1O8XA 5D9VA 5FHIA 1J9BA 3CSHA 3QR6A 3QFAC 3HJPA 4KNDA 1JZRA 3GV1A 4O92A 5G5FA 1EOGA 3TKSC 3G7JA 4H86A 4EO3A 1Z7RA 1SK0A 3HXSA 4TR1B 4K7IA 2CX4A 3F3QA 4X0XA 3TKRA 5F0GA 3VWUA 2H1DA 2L4QA 3IK9A 1Z5YE 1V9WA 4JR6A 4JBBA 4DSRA 4Q5QA 3VI5A 2ZNMA 4IS0A 2GSRA 3UAPA 1MTCA 3TUEA 2GVPA 1FVJA 3LXTA 5D9WA 3MAKA 2XBQA 2VL3A 3TRQA 3EC3A 5JCGA 2YJHA 4ECCA 1YKCA 3VWWA 2VAFA 1O8WA 3RPNA 3MWHA 2R37A 4PNGA 5D8IA 1ZGNA 4E8EA 5JWRB 3M9KA 4MJBA 3RHBA 1N2AA 4Q5FA 4FYCA 4RQRA 5HR0A 1IYHA 3DVWA 4EL1A 3EMPA 4HDEA 4IJIA 4PQHA 1YZXA 1OAZA 4O7HA 3A2WA 3FR3A 3A2VA 3VPQA 2XC2A 2NVLA 1ERVA 4NWYA 1GNWA 1GLQA 2KLXA 2LNSA 2VCWA 2YANA 3HZ4A 3APSA 3D0ZA 1QGVA 2VL2C 4RI7A 5HR1A 3EINA 1SU9A 2GDRA 1LJRA 3HYPA 1G0TA 1UVZA 4GRFA 3TRPA 2TIRA 1ILOA 4IP6A 5HQPA 1HQOA 3FHKA 3RDWA 1SJ6A 2DJ0A 1OYJA 2HSHA 2ZCTA 1X9WB 5IMVA 2PERA 1NSWA 1OC8A 4I2UA 1SENA 10GSA 3GNJA 2QSIA 4K8MA 4K1FA 2VO4A 4ZL9A 2FWHA 5G31A 5DJMA 3BOAA 1A2JA 1M0UA 2B1KA 5A4UA 2C0FA 3IA1A 1T4ZA 3P7XA 1AQWA 6GSXA 1Z6NA 3GRXA 4TVEA 2K8VA 3F6FA 3NZNA 4BVXA 1ERTA 1HD2A 4IP1A 1DSBA 2MZCA 2I81A 2PVQA 1EEJA 1GLPA 4J56E 6GSVA 5GSSA 4MA9A 3S9FA 2G2QA 4FIWA 3Q18A 4K2DA 2XPDA 4AJ8A 3IBHA 2PPTA 5IMDA 2IL3A 3VFIA 1GUHA 4N11A 4J2FA 3J7Yb 1F3AA 1SJZA 4TKYA 2LSTA 3QAWA 2YP6A 1VF2A 4EC0A 4GSNA 1FO5A 2YV7A 5CO3A 1XWAA 1F9MA 5JWQB 4GF0A 3ERWA 4KW6A 3IK7A 4OFMA 2N5AA 4KX4A 3FW2A 2NDOA 4TR4A 2A4VA 1HNCA 4RUVA 4XS4B 5D93A 4ZILA 3GKKA 3GSSA 4NXIA 3UMAA 3ERGA 1SD8A 5HFKA 4ZBBA 1YEPA 1R5AA 1T1VA 1E6BA 4YQVA 5ECNB 5GAND 1Q98A 4WF5A 3F4TA 3O6TA 2DJ1A 2H1BA 3TOUA 3R2QA 2C3NA 1MDJA 3GL5A 3EU3A 3W6GA 6GSSA 2EC4A 2DIYA 2ZUPA 3KJYA 3MNGA 5INYA 1Q4JA 2C0EA 2H71A 2PMTA 1PX6A 3KP8A 3FZ5A 2JADA 4Q5NA 3KM6A 2J9HA 3BCKA 2GT5A 3QAVA 5ECKB 2B7JA 2YJ7A 4DVCA 1OKDA 1J0FA 1KBNA 4DSSB 5H5RA 2B7KA 2IMIA 5CREA 3TCOA 4FO5A 3L9SA 1H4OA 1F37A 4FH8A 2L5LA 2O87A 2K6VA 1YF0A 4IQAA 3H93A 2OJLA 1TU8A 3G7YA 5J4UA 3C8EA 4MF5A 4BPYA 3EMXA 2MBSA 4POKA 2HRNA 4KH7A 14GSA 1X5CA 3QPMA 3KIJA 4ISDA 4QQ7A 4I2TA 1FHEA 2GGTA 1WPIA 3LYPA 1TK5B 2DC5A 3DKSA 3GL3A 2H6YA 5CYYA 1V57A 5G5EA 3NIVA 2MBTA 2RM6A 3U5RE 5J3RA 3FZAA 3D4TA 4RI6A 2JZTA 4YAVA 2YNXA 1HNBA 2IJYA 3APOA 4KDYA 4OWYA 3CRUA 4WKWA 3OR5A 2YPMA 1EP8A 3BCIA 3GX0A 2H76A 2H0IA 1R26A 4V1Ag 1M2DA 4F9ZA 2CZ2A 5H5QA 2PU9C 4ZL7A 4DSQA 3IAM2 2F9SA 2X8CA 3TJGA 2DJKA 4GSTA 5IOXA 5HFIA 4AF2A 4P3YB 2XBIA 2E2GA 1DBYA 4JRRA 2H19A 1YF1A 3LEFA 4MH3A 2P5QA 1HYUA 1B4QA 2L4CA 3ERFA 3KCMA 3ZTLA 2LUSA 3VURA 2F8FA 3ZL5A 4N10A 1GWCA 2C8UA 4X1UA 1TW9A 1ML6A 2LJKA 2IFQA 2IWTA 1TI3A 2A2RA 3GFKA 1AW9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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