The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
49
|
sequence length |
170
|
structure length |
170
|
Chain Sequence |
MGVMVIVFEGDDLEALEKALKEMIRQARKFAGTVTYTLSGNRLVIVITGVPEQVRKELAKEAERLKAEFNINVQYQIMGSGSGVMVIVFEGDDLEALEKALKEMIRQARKFAGTVTYTLSGNRLVIVITGVPEQVRKELAKEAERLKAEFNINVQYQIMTGSLEHHHHHH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Crystal Structure of Engineered Protein OR280.
rcsb |
molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
source organism |
Synthetic construct
|
molecule keywords |
OR280
|
total genus |
49
|
structure length |
170
|
sequence length |
170
|
chains with identical sequence |
B
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ec nomenclature | |
pdb deposition date | 2012-10-10 |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Ribosomal protein S10 domain | ||
Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Ribosomal protein S10 domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4DR4 J; 4DR2 J; 4NEY A; 4NXM J; 4DV6 J; 1IBK J; 1HNW J; 1N34 J; 2UU9 J; 1N32 J; 2UXD J; 1HR0 J; 4X64 J; 4LF5 J; 2UXB J; 5AJ3 J; 4KYZ A; 1XNQ J; 1N36 J; 4NXN J; 5LM7 E; 5BR8 J; 2F4V J; 4JI8 J; 2KVQ E; 4B3R J; 4GKK J; 4YY3 J; 4LF8 J; 4JI1 J; 4LFB J; 4JI6 J; 1XMO J; 4B3S J; 4DV1 J; 3W1Y C; 2UXC J; 2HHH J; 4X62 J; 3D3B J; 5IT9 U; 5LMU J; 4X65 J; 4JI2 J; 1N33 J; 4V1A k; 3D3C J; 4OX9 J; 5IWA J; 3IMQ J; 4DV3 J; 4LF4 J; 1IBL J; 4JI0 J; 4KHP J; 4LF9 J; 4NEZ A; 4JYA J; 4DR7 J; 2KL8 A; 1HNX J; 4LFC J; 3J80 U; 3J81 U; 4DR3 J; 4JV5 J; 4DR5 J; 2UUB J; 4YHH J; 4B3T J; 1IBM J; 2MQ8 A; 3R2C J; 2UUA J; 3R2D J; 1I94 J; 3JAM U; 3T1H J; 4K0K J; 4JI5 J; 2UUC J; 4X66 J; 5FLX U; 2VQE J; 4LFA J; 4LF7 J; 4GKJ J; 4DV5 J; 5A2Q U; 1HNZ J; 4KY3 A; 4JI7 J; 4DV7 J; 1FJG J; 4PWW A; 5LMN J; 1XNR J; 2VQF J; 4JI4 J; 4DUY J; 4DR1 J; 2E5L J; 2ZM6 J; 2MEW A; 3J7A N; 4RJV A; 3OTO J; 2MTL A; 4AQY J; 4HHU A; 4DV4 J; 4LF6 J; 4DR6 J; 4DV0 J; 1J5E J; 4DV2 J; 1XMQ J; 4B3M J; 4JI3 J; 4DUZ J; 3T1Y J; #chains in the Genus database with same CATH topology 2WSF C; 3M6W A; 4L75 A; 2RRN A; 4L6V 3; 1IWG A; 1N56 A; 3V5R A; 5A8R B; 5DM6 Q; 2XWY A; 3JYT B; 3H2L A; 2AD9 A; 3SV4 A; 3TUJ C; 2FVR A; 4CH1 A; 4OHV A; 2CPH A; 3TAM B; 2I8E A; 4A8Y A; 1X0P A; 3QSI A; 3DOK A; 2J6U A; 2ZJQ Q; 3GLJ A; 2FIU A; 1U09 A; 3HFV A; 3IRX A; 4DUY F; 4HR2 A; 2NPF A; 4N76 A; 2I9S A; 3E2E A; 3RRH A; 3PYD A; 5G4D A; 3TJ8 A; 4XO0 A; 2LKZ A; 2XBP A; 3DCA A; 2YNG B; 4WP9 A; 3PX4 A; 3H4D A; 4FF4 A; 2GFF A; 2MLZ A; 2OKQ A; 4KGZ B; 1MU2 A; 1KVK A; 1X9M A; 2GMJ A; 3KWM A; 2CZ4 A; 4DV2 J; 3NY0 A; 2YX1 A; 4M5L A; 2WW4 A; 2VV5 A; 1KN6 A; 1JWW A; 1X4A A; 1S12 A; 4LUB A; 1OIA A; 1T05 B; 1FNM A; 4O4R A; 4U8Y A; 3ICL A; 1RT7 B; 5KFI A; 4DZ6 A; 4J9Q A; 4K4T A; 2GJ2 A; 3KJF B; 4X66 F; 3MAH A; 2Y8Y A; 2V9K A; 3FVY A; 2I6W A; 3DRP A; 2FZK B; 4P6Q A; 3JSR A; 2B7C B; 4RNM A; 3ILJ A; 1UZD A; 3Q8R B; 5KOX A; 1RHU B; 4X4N A; 1B0V A; 2JRS A; 4B3O B; 4HH1 A; 2AYG A; 5DZ6 A; 3DRX A; 3LOU A; 1KD1 T; 2VQE J; 1RWO B; 5DG7 A; 4KFB A; 2BAC A; 4KR0 B; 3EVM A; 4IG0 B; 2YY3 A; 2AV5 A; 2CNO B; 2YX7 A; 1WI6 A; 3G2X A; 3KFW X; 2J9C A; 2GIF A; 4MKA A; 2W7P A; 2MYF A; 1HNV B; 1LEO A; 4KPC A; 4DR3 F; 1LW2 B; 3MM7 B; 1CJT A; 2NLW A; 1E6Y A; 1P9Q C; 4TU8 A; 3G8T A; 1PYT A; 1FJ7 A; 1REG X; 1FDN A; 4NML A; 2XO6 A; 5K8N A; 3FUY A; 4R25 A; 4JYA J; 2RS2 A; 1ZA1 B; 5E7O B; 3QT8 A; 3KK1 B; 1AW0 A; 4NCG A; 2OEM A; 3ZTO A; 4RW9 B; 5IC4 B; 4LRF A; 3T5H A; 4TQS A; 1XIQ A; 1EQM A; 3WX8 A; 4ZIW A; 3AOD A; 4K59 A; 4UT4 A; 2W9B B; 3M8Z A; 1N4L A; 3GV7 B; 1S77 D; 3QZ7 A; 1U47 A; 2VIC A; 5LXY A; 2Q43 A; 3IBW A; 4CTA A; 1NHU A; 3TUI C; 1K44 A; 2DNK A; 5KFS A; 2ZHB A; 4OHX A; 4GO7 X; 5KFO A; 5GME A; 1X4B A; 1U0S A; 4NLD A; 2L9N A; 1BWV A; 3GII A; 3UWT A; 3CJT A; 5GMK a; 3DRY A; 1Y11 A; 5RUB A; 2W4D A; 1SXL A; 2LQB A; 2FJB B; 4G1Q B; 4CDI A; 4DR5 F; 2HGL A; 5DZ7 A; 2MKH A; 4WFB Q; 1YJU A; 2XMJ A; 2LEA A; 5F3T A; 2UP1 A; 4JI0 F; 3W2W A; 2DVI A; 4LBH A; 3D2W A; 5E5N A; 2J7U A; 4XPC A; 3OV7 A; 4CO1 A; 4NLX A; 1UW4 A; 2FPH X; 2Y0S D; 5HJY A; 2XLI A; 4NA3 A; 5J2M A; 2B9E A; 2B5J A; 4LF1 A; 2QA4 S; 4DS4 A; 3W61 A; 1YBU A; 2P5V A; 2LP4 A; 4K4Z A; 4F8R A; 3D1H A; 2XC9 A; 2EFG A; 1JLB B; 3QT7 A; 3K5O A; 1TP7 A; 1VMB A; 5L1L A; 1ZTT A; 2V2V A; 2CJ9 A; 2LEB A; 4XDC A; 4FBT A; 5H9E J; 1APS A; 3PJX A; 3FC9 A; 3BEG B; 4N7T A; 3JQK A; 3UDE A; 4NXM F; 1NJX A; 1NJZ A; 4WII A; 4WXO A; 4PKD B; 1Q53 A; 1W26 A; 1RT1 A; 4QWA A; 3RRG A; 2MSS A; 3MUR P; 4RW4 A; 2M0G B; 4D3H A; 4NLO A; 4B3S J; 4O3S A; 3RRK A; 3OL9 A; 2EVZ A; 4UY8 T; 4IO1 A; 2IIH A; 1UZH A; 5HJX A; 1V5V A; 5IXU A; 2QSW A; 2ZNZ A; 3G9C A; 2FVC A; 3FRY A; 4Q8E A; 3M05 A; 4IG3 A; 5K5M A; 1VDH A; 3QLH A; 2V69 A; 1TL7 B; 1NEE A; 5SUH A; 3TZW A; 3N5F A; 4KJI A; 5U47 A; 4JI7 F; 3HXM A; 1GNK A; 3DRS A; 3K58 A; 5J2Q A; 1JLC B; 2VG7 B; 3QQC D; 1YBA A; 2H3E B; 4M63 A; 4K4X A; 4ZJQ A; 3OUY A; 2DNQ A; 1NND A; 1H2V Z; 1JKH B; 2EW9 A; 2VOO A; 3V6D B; 1HI8 A; 4WU3 A; 4M95 A; 1Q8K A; 1L3S A; 5HRO B; 1HNW J; 3E3X A; 4URQ U; 1F1B B; 3AH6 A; 3LAL A; 3S6E A; 5IV4 A; 2P9E A; 3PEJ A; 4RNF A; 5KG3 A; 2RF2 B; 2ZUA A; 3CJ3 A; 4AUK A; 2XO7 A; 5HMY A; 4Y6I A; 3ZZT A; 2VQE F; 4FNH A; 2KO1 A; 4LFC F; 3SSR A; 2ZE2 B; 3PJ9 A; 3HCX A; 4I7F B; 1BE4 A; 4IH7 A; 2VBY A; 2UUC F; 2W01 A; 1F60 B; 3GYN A; 1FX2 A; 1BQX A; 1HQE B; 1VQY A; 4F02 A; 2ZC3 A; 2CJK A; 4AT1 B; 3PNI A; 3MEC A; 4HYK A; 1S0O A; 5LMN F; 4PPD A; 3C6T B; 4DX5 A; 1TFW A; 2KI2 A; 1ZPW X; 3MM8 A; 1RHQ B; 1GTH A; 1DLO B; 3IFE A; 4JI3 J; 4FPR A; 1WJ9 A; 2HNZ B; 4IFY B; 4OFZ A; 2HQC A; 5IFM A; 4ZK7 M; 1DQA A; 2VC1 A; 5C42 A; 4ZLJ A; 2QMW A; 2V8D A; 1RU2 A; 2BDP A; 3M32 B; 1FKO B; 3BS9 A; 3L9Z A; 2HUR A; 3DRR B; 3M1V A; 1YRU A; 3PYG A; 2V2Q A; 4MMO A; 4CCH A; 3W1Y C; 4OYO A; 3BPD A; 1JB0 C; 4USV A; 3Q8U A; 3TEH B; 3P5B P; 3KNG A; 4X65 J; 1K47 A; 4Y65 A; 1SC6 A; 2PEB A; 3HZE A; 3MM5 A; 1B7F A; 2HKE A; 5AXM A; 5H9E K; 2VFV A; 4CM0 A; 4NA2 A; 2XUL A; 3JB9 k; 5K14 A; 4RUA A; 4FKY A; 2CUY A; 5ETT A; 2JLF A; 4EU0 A; 2DNN A; 3DMJ B; 1LFP A; 4J37 A; 4NLW A; 3QRR A; 2IVM A; 4ZVP B; 1VC6 A; 2QSF A; 2W2P P; 2F9J A; 3IAM 9; 4DLE A; 2PMH A; 2KG0 A; 4I2P B; 3OTO F; 1U26 A; 2NQP A; 3CC4 S; 3HHL D; 1UWB A; 2XZT B; 3ISN D; 4H4M A; 4ZLL A; 3D6T B; 2KB2 A; 3GP9 A; 1SH2 A; 2DKO B; 1IKW A; 3BH7 B; 4H54 A; 1FFW B; 2WVF A; 3FRZ A; 4B9L A; 1RU1 A; 5D15 A; 4DWI A; 4J9R A; 4M1K A; 2DO4 A; 4J5O A; 2RQC A; 2LU2 A; 1SUQ B; 1SJQ A; 3O5T B; 2OSQ A; 4A8K A; 1S99 A; 2V2K A; 3SBM A; 4J9N A; 3MEK A; 4Z2X A; 3QO9 B; 4C9D A; 1FD8 A; 1WF0 A; 1IXK A; 1U0H B; 4ZS6 A; 1J5O B; 1QD1 A; 1ZAW A; 3PDN A; 2ZBC A; 2MKJ A; 3UN5 A; 3C66 A; 2IYI A; 2VL1 A; 2BA9 A; 2IMW P; 1XEZ A; 3SEO A; 3EXC X; 3CCL S; 5HBM A; 2EG2 A; 2FJA B; 4AQY F; 1VBZ A; 5HVH A; 4RBV A; 3PXG a; 3CJS A; 4YB6 A; 4ZPC A; 2RHS B; 4OYW A; 1G7C B; 4ZIT A; 4CLF A; 4IFV B; 1XK8 A; 2B4O A; 3P5T L; 3CJ5 A; 2DR6 A; 5BR8 J; 2PGC A; 1Y0H A; 2BKO A; 1T94 A; 1Y3K A; 1VLY A; 4JI6 J; 4U7U D; 2HZC A; 2QLW A; 1GMV A; 1A0O B; 3N0V A; 1R3N A; 4IUF A; 3AFG A; 2YNI B; 5HP1 B; 4YB5 A; 2DGX A; 2OPP B; 2X1B A; 3KLV A; 1AZS A; 3J81 j; 1UVJ A; 2DNP A; 1HI0 P; 4QYR A; 3CCS S; 2D74 B; 4ZN1 A; 2VBZ A; 3VGV A; 1IWA A; 2XYH B; 4B3T J; 3D28 A; 2W2M P; 2HHS A; 3D66 A; 2E66 A; 1R8C A; 2YWE A; 2ALZ A; 2R7U A; 4UUX A; 1S1V B; 3LP1 A; 4PRF A; 2CPY A; 2E5H A; 5HO4 A; 3R97 A; 4DV5 J; 3KUH A; 2IVF B; 4J9P A; 3DLE A; 1HWJ A; 2KT3 A; 4FYY B; 1V3Z A; 1GMW A; 3IWN C; 1OY9 A; 2HQD A; 1ZOT A; 4Q8F A; 1GH8 A; 3C6U B; 3IM9 A; 2R4F A; 4ICL A; 3QPI A; 4ELU A; 3CMA S; 1CSJ A; 2GHP A; 2ERR A; 1ELO A; 2J5A A; 2ZWP A; 4DF8 A; 2E5J A; 2YH1 A; 3OLB A; 3NMR A; 2K06 A; 4NI2 B; 1F0X A; 3CIM A; 3F73 A; 1Q4R A; 5IV3 A; 3M8Q B; 2KVQ E; 5B0B A; 2XS5 A; 3W60 A; 2R7Q A; 8RUC A; 2QA2 A; 4JI2 F; 3SDE B; 1VQ4 S; 1VQ7 S; 3ONQ A; 1H7X A; 1RAI B; 1HNX F; 3BGL A; 4Y2K A; 2HYI B; 3GR1 A; 3CJK B; 3J81 U; 1Q82 T; 3VAF A; 3KKF A; 3C2P A; 5IT0 A; 1X9W A; 1LV5 A; 3FBF A; 3HJV A; 4HAC B; 5DM7 Q; 1OPZ A; 2BZ2 A; 2OPS B; 1MWQ A; 4JI3 F; 3DM2 A; 2DXE A; 3W7B A; 3P8B B; 1FNX H; 4X4U A; 1RHM B; 2OPQ A; 2YXL A; 2J0S D; 4DU7 A; 4LRC A; 1Y4Z B; 3DU6 A; 2FZG B; 2JX2 A; 5AE1 A; 2GJI A; 2FHO B; 2YWK A; 4BC7 A; 4DDF A; 4TY8 A; 2JWN A; 4FF1 A; 5KG4 A; 4NEY A; 2YQ1 A; 4KGK A; 2ZBI A; 1FK9 A; 1RT4 B; 1YIJ S; 1NK8 A; 3NGU A; 1CC8 A; 3R27 A; 2AJ0 A; 2JC1 A; 1RTI A; 1Q8B A; 1FT8 A; 2BUN A; 3EZO A; 3CCZ A; 2BQR A; 2BE2 A; 1RP5 A; 3IG1 B; 3R8Y A; 1XC9 A; 2UV8 A; 3OR2 B; 1G3O A; 3IMQ J; 3DYA B; 5C25 A; 1X4G A; 3GFX A; 4RBU A; 2MST A; 3K89 A; 5M2R A; 1BQM A; 3UW1 A; 4FS1 A; 3B4D A; 4ED4 A; 3DLG A; 3P4U B; 4F2R A; 2IM1 A; 3KLE A; 1IKV A; 3NGK A; 4KH0 B; 4WFX A; 3CUL A; 3H2V E; 5THW A; 1TKX A; 1NH8 A; 2R3V A; 1VQO S; 3Q24 A; 4KGM A; 2QA4 G; 4OI0 A; 1FJG J; 1IN0 A; 2C22 A; 3NRB A; 2HBR B; 2CFX A; 4FXW A; 3HHL B; 1X9S A; 4HHU A; 5HAT A; 2MQL A; 5KFW A; 1NLK L; 3R6L B; 1YG0 A; 2XYP B; 1XN9 A; 1K73 T; 1RT5 B; 4XTT A; 1J2V A; 2VKR A; 5K9F A; 4OI1 A; 4ZLN A; 2BM0 A; 1S9E A; 2GVZ A; 1SKU B; 3MMJ A; 4B3R F; 1MMN A; 1Y5I B; 3MAA B; 4KKO A; 4HH0 A; 1QAI A; 2Z57 B; 4JP8 A; 2FJW A; 3BJY A; 1M5S A; 2G0J A; 4LRD A; 1NSA A; 1P8G A; 1M1K T; 2A2D A; 2ZZM A; 1M5H A; 2G2Z A; 3UDC A; 3R3T A; 3TA1 A; 3MOZ A; 4P10 A; 3QRP A; 4HLB A; 1RZM A; 4O3N A; 1ZM3 A; 3TX0 A; 3KHH A; 3VGU A; 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4I64 A; 1HW8 A; 5JXS A; 1N5Y B; 2KH9 A; 1FJC A; 1OS5 A; 2RNE A; 1DHM A; 3CE8 A; 3JSY A; 3VWS A; 5KFD A; 2VFT A; 1HHT P; 1VQL S; 2YBV A; 3UN2 A; 3SZ2 A; 2AZ1 A; 2DIS A; 4PCQ A; 1S6P A; 3T5K A; 3RGI A; 1JJ4 A; 2XCP A; 3HKZ D; 3G6Y A; 4UW2 A; 5A0Y A; 4DCP B; 2XY6 A; 1VQN S; 4IOB A; 2YTC A; 3U27 A; 3NEK A; 4DV0 J; 5M2P A; 4YQW A; 4B3M J; 2ZD1 B; 1EP4 A; 2BEF A; 2RVJ A; 2ZVS A; 4FF2 A; 4P73 A; 3T1Y J; 1FRM A; 2MZT A; 3HVT B; 2ZIT A; 3KK3 A; 4A47 A; 2DRA A; 2ATC B; 5AJ3 F; 2UXD J; 4FNI A; 4Q0B B; 1HAR A; 4OZL A; 4JI8 F; 4DCO B; 4ZJL A; 1RB0 A; 2QL9 B; 1KSP A; 4G1I A; 3EDQ B; 4M5N A; 3OT9 A; 2AYM A; 1FRI A; 1QLN A; 5ADZ A; 3UD5 A; 3FFI B; 1KQF B; 2ILZ A; 2KL8 A; 3UR3 C; 2VB6 A; 1SV5 A; 3W3S A; 3LP0 A; 1U1R A; 4LR9 A; 2BM1 A; 2LXU A; 4J90 A; 2WSE C; 1CJV B; 5E3P A; 4C8L A; 2XHW A; 3CCR S; 3PAC A; 3JSM A; 4DFJ A; 3LF0 A; 1WKK A; 4C97 A; 3CWJ A; 2LQ5 A; 1MLA A; 4BBY A; 2GJF A; 4ED5 A; 3CVK A; 1EB0 A; 1YRT A; 4PAB A; 1C1B B; 1RKJ A; 4XIU A; 3T6B A; 3PCO B; 2X3G A; 1L3K A; 1O8B A; 5ETS A; 1E6V A; 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