4HJMA

Crystal structure of glutaredoxin 1 from plasmodium falciparum (pfgrx1) solved by s-sad
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
EAVKKWVNKIIEENIIAVFAKTECPYCIKAISILKGYNLNSHMHVENIEKNPDMANIQAYLKELTGKSSVPRIFINKDVVGGCDDLVKENDEGKLKERLQKLGLVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Atomic resolution crystal structure of glutaredoxin 1 from Plasmodium falciparum and comparison with other glutaredoxins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin
source organism Plasmodium falciparum
molecule tags Oxidoreductase
total genus 36
structure length 106
sequence length 106
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2012-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4hjmA00
1XWGA 3KM6A 1K0CA 2I9HA 5HFKA 2PMTA 2FWEA 1SK1A 5DCHA 1X0RA 3LXZA 3HCZA 3KMNA 4KSMA 3P8WA 3VLNA 3TUEA 2OE3A 1USBA 1A2JA 3ZFLA 1XVWA 1JLWA 2WZ9A 2LQOA 2FWHA 3JCML 4J2FA 1FHEA 3VWXA 1GSFA 3HJOA 3HY2A 2VD0A 4ZB9A 4PURA 2YN1A 5D8IA 2V1MA 4PX1A 4DSSB 2GQKA 2YWOA 1PL1A 1V57A 2OE0A 2F3MA 3M9KA 2YANA 4IKHA 1A23A 4X0XA 1O85A 1BX9A 2IFQB 1B9YC 1X5CA 1E2YA 5A4WA 3C7MA 4KX4A 5ECMB 3DRNA 3ZVJD 2JL4A 1GTUA 1XPVA 2L5OA 1B4QA 1SU9A 1R4WA 3VPTA 4O32A 2VOCA 1R7HA 4TXOB 5DAKB 3UBLA 2CX4A 3HHVA 3V1WA 5B8BA 5HR2A 5G1KA 1RW1A 6GSSA 4N10A 4AF2A 3I6AA 1M0UA 1J0FA 3QAVA 2YNXA 4BVXA 3LQ7A 5KEJA 3G7IA 4ID0A 2CQ9A 2FHEA 3FHKA 2XBIA 2PVQA 3GX0A 3FEUA 1ZYEA 1G0TA 3E9JB 2MMZA 2RIIA 3C71A 4TR0A 4G19A 2H0HA 5DJLA 4KSOA 1PMTA 3EC3A 3LG6A 3PGTA 4GRFA 5H5QA 4RUVA 1K0MA 3IAS2 3L4NA 3KP8A 2GT5A 3BCKA 4ECJA 2GSTA 2AUVA 4GXZA 5HR0A 4QL9A 4FYCA 1HQOA 1BAYA 5EL8A 3QR6A 3GX8A 1F37A 3VURA 1T7PB 4KUNA 18GSA 2R2JA 1AQVA 2PBJA 2JADA 2NTOA 5CAXA 2I1UA 4D73B 1U3IA 1SJIA 5LCZA 2FNOA 1BG5A 3D22A 1TK8B 3TOTA 2R37A 5F07A 5DBQA 2NVLA 2XC2A 1U88A 3LFLA 5ECLB 1GSQA 2DIYA 1R26A 3TJBA 1XWKA 1JFUA 2K9FA 4YH2A 4LMWA 2VL2C 1KNGA 4G10A 4HOJA 1T8EB 1U6TA 3UVTA 5ID2A 3TJFA 3HZ4A 4TR3A 1K3OA 3KIJA 2YCDA 3UIWA 1AIUA 4V1Ap 2LJRA 4BVYA 1ZCPA 1IYHA 1TP9A 4WR5A 1T1VA 4EL1A 3APOA 1Z6NA 2MBTA 1O8WA 3I9V2 4ML6A 6GSWA 4GLTA 1NHOA 1AUCA 1B9XC 4KB3A 3L78A 4RQRA 1SL0B 3HJMA 1T4ZA 4FYUA 4V2NA 3HYPA 2VCVA 2C4JA 3IPZA 2LJAA 1JZWA 2FA4A 4CDOA 1RK4A 1TTZA 1SKRB 2VIMA 3I69A 5C04A 2KUCA 5IPGA 3UMAA 2YOIA 5AIXA 4LA1A 1TU7A 1B4PA 3HVXA 2E2MA 3WGEA 2K8VA 4MCUA 4DSRA 1WPIA 5GSSA 1M2BA 4OO4A 3IE3A 4ML1A 4LLRA 2NPBA 4MF5A 4K0GA 12GSA 1EGRA 2LJKA 4MF7A 1GSSA 2C3QA 4XS6A 1QUWA 3HKRA 4MPFA 4EUYA 1G7OA 3IK9A 4NMUA 4MJEA 4MA9A 4O92A 2VO4A 2PWJA 1TW9A 1ZZYA 1GWCA 2FGXA 4TR1B 3GV1A 1TRVA 3RBTA 3QFBC 1PX6A 3FZ4A 4KGIA 3O76A 4E8EA 2DBCA 4LL1B 3HZ8A 2KLXA 2F8AA 3FZ5A 4NV2A 2G0FA 1KBNA 5HR3A 4EDYA 2IFQA 4K7IA 4WKWA 2H30A 3SBCA 4ZL7A 4JE1A 1XXUA 2KHPA 3CYNA 3KXOA 4K7NA 1M99A 5D93A 3TKRA 2DJ1A 3H8QA 4XS1A 4JEDA 4TXOA 3RHBA 1HNBA 2A2SA 2XPEA 3KP9A 1IYIA 2GSSA 2H66A 5CYYA 4ISDA 2DJ2A 5A4UA 1VGLA 1YZXA 4Q5QA 4PUAA 2LRNA 3Q19A 3CRTA 3ERWA 4X43A 5IMCA 2P5RA 3ZIJA 4YQUA 2WRTA 5J9CA 5IIZA 3N9JA 3L9VA 3GNJA 2H72A 5JCGA 1UVZA 5ECQB 2PPTA 1B48A 5COHA 4WETA 4K0NA 3RAZA 5KN3A 3TOUA 4N11A 2HXKA 2H0IA 6GSYA 1XW9A 2H76A 3ZFBA 2IMIA 1EZKA 4MDCA 1NM3A 1Z3EA 3UOMA 3KJYA 1O73A 3ERFA 3D4MA 3IV4A 3VWWA 2X8CA 5FWGA 4WR4A 4PNFA 4HQZA 3FZAA 1FAAA 2I81A 5G30A 2PVOC 1EV4A 5HQPA 4HI7A 2OKAA 3DXBA 2B5EA 4I2UA 2O89A 1V40A 2YP6A 3PINA 3D0ZA 4IGJA 1SK2A 1YJ6A 3CSJA 2A2RA 4YQVA 1PQNA 3LSZA 3TKQA 2NDOA 3SWLA 3ZZXA 7GSSA 1R5AA 5ID2B 2YJ7A 2F51A 4O7HA 5GAPD 4K7OA 2WB9A 3DVWA 3ED3A 3K8NA 3Q74A 2LRTA 4NV5A 1F2EA 2VLVA 1Y6EA 3H1NA 3QPMA 2MMOA 3F3QA 5INYA 3IC4A 2MMNA 1TXXA 4EKZA 1NSWA 2B1LA 4PQHA 3GKMA 5A5KA 3UAPA 1PKZA 3CBUA 3W6GA 2HNLA 1U87A 2LNTA 1H4OA 4MF6A 1NHYA 1OVNA 3IK7A 3OR5A 3KH7A 3M9JA 2GDRA 1UA5A 2H6YA 4HU7A 1W4VA 1M9AA 3QMXA 3C8EA 3VI5A 1GSEA 3C73A 3RPNA 2B7KA 1HYUA 2L4QA 3G9BA 2GGTA 4L5OA 4EDZA 1GUMA 13GSA 1QK8A 2ALBA 4IVFA 1AAZA 2CZ3A 4IP6A 5D96A 3WT2A 3IAM2 1XOAA 1GLPA 3APSA 1TDIA 2P31A 2XPDA 1XW5A 1TRUA 2DJJA 4XCSA 1PRXA 2X64A 5ECKB 2REMA 4OD7A 4N0VA 2OA7A 3TRPA 2H1AA 2GS3A 4TR1A 4K2DA 2IPAA 3F4RA 4PNGA 2BJXA 3FR3A 3H93A 4N30A 1VF3A 5KN2A 2K6VA 2QKEA 2WJUA 2B5YA 3FR6A 2FWGA 3GSSA 4TR4A 1AXDA 1I9DA 2DJKA 2C0EA 4L8EA 1GL8A 1S3AA 4IQAA 3QD9A 5GZZB 2YV9A 2GTUA 3GUSA 4HJMA 2O85A 1ZMAA 3PH9A 4Q5RA 5D9XA 3EMPA 1T3BA 4GSSA 3QDNA 2VLUA 5ECNB 2Z9SA 3IDVA 2CT6A 1X9SB 5HFGA 2FY6A 3Q18A 3IHQA 3GSTA 4DSQA 4J57E 3QFAC 2PU9C 2E2GA 1WP0A 2VUPA 2R5GA 1VF4A 1Z7PA 3KEBA 1SK0A 2ZNMA 4RI7A 5G2ZA 5EVOA 3MAKA 3GL5A 3F4SA 1PD21 2EIOA 2LS5A 3F6FA 3W8SA 2L6DA 5B7CA 4IS0A 3WGDA 5ABRA 4ZL8A 1N2AA 4KDUA 1QFNA 3FYGA 1K0AA 3UVHA 2GQMA 2JZRA 3W8JA 3AY8A 2C3NA 3UBKA 3CMIA 2C1YA 1EEJA 2M72A 4WF4A 1OE7A 1TK5B 4AJ6A 2DMMA 3A2WA 3C1RA 2MBSA 1ZYQB 1Z7RA 1THXA 2ZUPA 3GL3A 1SJZA 1ZGNA 3ZREA 1PSQA 5J41A 5JWRB 2NBSA 5DCGA 2LRCA 5IMZA 1OKTA 4PGTA 2FA8A 5IMAA 2LQQA 1VF1A 1G6YA 1GSYA 1SL1B 1XOBA 2WULA 4AGSA 2B5XA 4GSNA 4IW9A 2E7PA 2YV7A 1EOHA 3CSIA 1DSBA 3GA4A 5ECOB 4NPBA 3ZL5A 4GQCA 2O8VB 4RQXA 2G2QA 2HI7A 3HVVA 1MDJA 5CRHA 3DEXA 2KOKA 3IOSA 1KEBA 1RQMA 1TK0B 4POKA 1JZOA 1VF2A 4IJ3A 5KN0A 2VM1A 1XCCA 3MSZA 2VL9A 5B8AA 5JWOB 4V2MA 4EO3A 1PKWA 1J9BA 3EMXA 6GSXA 3CXGA 1OAZA 5ELAA 1R5PA 4ECIA 3TJGA 1WMJA 3DKSA 5DVBA 1TU8A 1ERWA 2MZCA 3EE2A 2DLXA 3GTUA 2WCIA 3D6IA 22GSA 2L59A 1ON4A 4KAEA 5IPHA 1MD3A 1PN9A 3S9FA 5ENUA 4HQSA 4V2LA 2LEGA 2WDUA 5L71A 3TKPA 1F3AA 2LNSA 1TKDB 2B7JA 1SL2B 3ZIVA 3BJ5A 5ECRB 4WBJA 2H71A 1HNCA 1AW9A 2VCTA 5J9BA 3VI7A 5CRDA 2VCQA 2QSIA 3A3TA 1K0BA 1M2DA 4QL7A 1PA3A 1SYRA 3PR8A 3MNGA 2PUKC 2H74A 1AQWA 5G31A 1GNWA 2L5LA 4LMVA 2DIZA 4PQ1A 2X8HA 1ML6A 1A8LA 1X5EA 3KZQA 3A2VA 2JZTA 4KCAA 1XVQA 3U6VA 3J7Yb 2H8LA 4ZXGA 4JR4A 3TB2A 4F0BA 4TOPA 4I8BA 1O81A 3LJRA 3FKFA 2CAIA 4ZB6A 2FUG2 3LYPA 3NIVA 2YZHA 2JZSA 2PN8A 4MLYA 1LU4A 4YAVA 2TIRA 3LGCA 4H86A 4JR6A 3RPPA 2HZFA 2MYGA 2OJLA 1A0FA 2ES7A 3GKKA 4V1Ag 5G1LA 3EYTA 1ERTA 4YAPA 4HEA2 2R4VA 5E59A 4E8HA 4HZ2A 4EE0A 1SD9A 4POLA 2CZ2A 3DMLA 3DGQA 4XHMA 3TJJA 4ZIJA 4L0UA 5IO0A 4NXIA 5F06A 3UJ1A 2H75A 5IO2A 11GSA 4EXJA 4MMMA 1K0DA 1ZL9A 5IM9A 4IHUA 1G6WA 3O3TA 2L4CA 2KP1A 4TVEA 1N8JA 3US3A 3ZITA 1PX7A 4BPYA 1YY7A 3HXSA 1WRYA 4AJ8A 1SKWB 3HA9A 5G5FA 3F63A 3BOAA 4J56E 2C0GA 3ZVJA 3CTGA 1UN2A 3EURA 6GSUA 5CO3A 1K3YA 2C0FA 5DQYA 4L0WA 4ZBBA 5GAND 3TDGA 4OO5A 4WBRD 4MH3A 1GP1A 2HSYA 3E0UA 4OMVA 1GUHA 5H5RA 1GTBA 5IOXA 4MK3A 6GSTA 2YPMA 3ME7A 3NOFA 2R3XA 4OFMA 1X9MB 3TRQA 1WWJA 2F8FA 4PUFC 4G2EA 2YWNA 4XRDA 3RDWA 1V58A 2C8UA 4GCIA 2YWIA 1EGOA 5ECIB 3GYKA 4Z7XA 1Q4JA 3KMOA 2J23A 2IJYA 4MZWA 4KA0A 2VLTA 17GSA 2DC5A 4HZ4A 2VCXA 3F6DA 3GURA 3RHCA 3ZYWA 4KE3A 3KGKA 3HVSA 2H1BA 2AJQB 4JBBA 2H70A 4IN0A 1GULA 4IP1A 2FCHA 1OC9A 3L9UA 4EF0A 4NHWA 3UEMA 3M1GA 4ULXA 3GTUB 4K1FA 2VAFA 1M7TA 1F6MC 1ABAA 1OKDA 1GSDA 1XIYA 4GF0A 2M46A 3ZLPA 4CHSA 4DEJA 1V98A 3F4TA 2VM2A 3EVIA 4P3YB 8GSSA 5GSTA 1V9WA 3FY7A 5J5NA 1EV9A 1PGTA 2CA8A 1FVJA 2RM6A 2V6OA 4F03A 1SYXA 1G7EA 2WGRA 1JZRA 1QGVA 3LYKA 1EP8A 4IELA 1OE8A 3ZMKA 5HR1A 2JSYA 3BD2A 4I5QA 3A5WA 3FW2A 3GN3A 2RM5A 3UARA 4FYBA 2CVDA 5AGYA 2YZUA 4KDXA 1J08A 2XBQA 2BMXA 1YEPA 4AJ7A 3ME8A 1Z9HA 4GWRA 4K8MA 1Q98A 2RLIA 1ST9A 1F9MA 2IMFA 1SD8A 4WXTA 1ERUA 3KTLA 2GZYA 5A4VA 1MTCA 4I97A 4EVMA 4POMA 5CNWA 2OADA 2H1GA 4JZQA 5JWQB 4ECCA 5IOWA 1TI1A 1DE1A 4FH8A 2V41A 5J3RA 5AISA 1LBKA 1A2MA 3P7XA 2HSHA 1XWAA 1FG4A 4KNDA 1O8XA 3DIEA 1S3CA 2IN3A 1C72A 1SKSB 1URMA 2VL2A 4ZBAA 2HT9A 3VWUA 1EOGA 1OC3A 2HYXA 4IBPA 2LKUA 4HU9A 1JHBA 2D2ZA 2L57A 1XWCA 4TRXA 2VL3A 2IMDA 2QC7A 4I6XA 1Z6MA 4F9ZA 1JZDA 4DVCA 5ECHB 2VCZA 1GUKA 1JLVA 3CRUA 4GQFA 1XWBA 5E4WA 3ZMLA 2M80A 2FWFA 2TRXA 1EP7A 2F9SA 2N5BA 3GMFA 4WF5A 4Q5NA 1WE0A 1K0NA 3FK8A 4RI6A 1GNEA 1BJXA 3BBYA 1CQGA 3M8NA 1EEMA 2GZZA 1A8YA 4MABA 4XTSA 1HNAA 3J7Yk 5DALA 3QCPA 2I3YA 2X8GA 3GH9A 3ERGA 2H01A 2AHEA 1ACVA 2MMAA 1TOFA 3IRAA 4XRAA 2AV4A 1TJDA 2DMLA 2N5AA 4PQIA 4XIHA 5EPFA 2VCWA 5CP1A 4ECBA 1O6JA 1I5GA 10GSA 1DUGA 2YJHA 2VD1A 2KP2A 1A2LA 3WYWA 1S3DA 1Y25A 2H73A 4PXOA 4O5RA 5D73A 5AN1A 1U3AA 1SJ6A 1A24A 5F0GA 1YKCA 2A4VA 3F9UA 4FIWA 3DYRA 2L6CA 4F0CA 5IQYA 1WJKA 4KDYA 1K0OA 1GTIA 3LEFA 1DE2A 4TN8A 1QQ2A 1TRSA 3IBHA 3GH6A 4TXVA 1MDKA 4HUAA 2CAQA 3H79A 2GT6A 2DSAA 1OYJA 4CW9A 1UC7A 3GRXA 3LORA 1XW6A 5FT3A 2CVKA 4G9HA 3KCMA 3GHAA 5F8BA 2ON5A 5D9WA 2HRNA 3VPQA 1M9BA 3IR4A 1YF1A 2BTOT 1OC9B 2I4AA 5KN1A 1GTAA 2EC4A 1K3LA 3EWLA 4BL7A 5B6NA 3L0HA 1WIKA 1ERVA 3IA1A 2V32A 4BA7A 4MJBA 4GSTA 1X5DA 4XS4B 2K18A 5G5EA 1BYEA 3D4TA 3WD6A 3ZRDA 5AIVA 4OFNA 5CREA 3F3RA 3EU4A 2O87A 1X9WB 2HZEA 5H5SA 5ELGA 3VWVA 4TW5A 3IXRA 1YEXA 2HRFA 3TCOA 14GSA 2GZPA 3VK9A 5J4UA 2JSZA 4IQ1A 1Z5YE 4MJAA 4K9ZA 4NAXA 3QAWA 1MEKA 3F8UA 2CV4A 4EC0A 3NZNA 1KTEA 3R2QA 5IMVA 3P2AA 2H0GA 3CTFA 2RUEA 1BQ7A 5LD0A 1FO5A 1GLQA 2X99A 4MPGA 19GSA 4HJ2A 2GSRA 3P90A 5JCUA 4TKYA 2B3SA 2JACA 2OE1A 2PGTA 3HJPA 4HS1A 3KD0A 3EU3A 1YQ1A 3QOUA 1MD4A 5DJMA 3ZTLA 3FRCA 1TRWA 4K6XA 2IMKA 3APQA 4QQ7A 3GKXA 4DSSA 1GSUA 1SENA 2EIQA 5C00A 5F05A 1GH2A 4IJIA 20GSA 2DJ3A 2IL3A 3Q6OA 1NW2A 3TJKA 3TRXA 9GSSA 2GLRA 1W89A 3WGXA 3D5JA 3CSHA 2HFDA 2CVBA 2C80A 1T4YA 2FLSA 4JRRA 1YKAA 1ZOFA 1FB0A 2E0QA 2C0DA 5FHIA 1FB6A 1EWXA 3LXTA 3VFIA 5DAKA 1FOVA 2P5QA 4YQMA 1MDIA 1OC8A 2V6KA 3WT1A 2H6XA 1FW1A 5DQSA 1O7UA 4ZILA 2B6MA 4L5LA 2AB6A 1FVKA 2N5FA 3M3MA 4N0ZA 3H4KA 3LWAA 1QXHA 1XBSA 4HDEA 1A0RP 4F82A 3TKSA 4ZBDA 4MZBA 1AQXA 5DALB 4MP4A 2LV3A 3HD5A 1H75A 2C3TA 3FZ9A 3I43A 2IIYA 1HD2A 3C1SA 2CX3A 2XHFA 2WS2A 1CQHA 2WFCA 1F3BA 2K8SA 1B8XA 1V2AA 3KH9A 2R6KA 1YF0A 1GRXA 2ON7A 3ISOA 5IMDA 4KW6A 2PERA 4X1UA 3GKNA 16GSA 2H19A 2IMEA 4POBA 2HE3A 1ILOA 4D73A 3HDCA 5D9VA 2AAWA 3M0FA 5D9TA 2OBIA 1XFLA 3MWHA 5B6MA 4MH2A 4F2IA 1BEDA 3GFKA 2B1KA 2AYTA 3E3EA 4ZL9A 4MJCA 4KH7A 5IMFA 3G7YA 3EINA 6GSVA 5DDLA 2JU5A 3TGZA 2H1DA 1E6BA 4OCEA 2O7KA 5LNKe 4NWYA 3DVXA 4GTUA 1WOUA 2GQLA 4BWSA 4OWYA 2P0GA 1PL2A 3TKSE 2OACA 3DWVA 1VRSD 2GVPA 3BCIA 1THOA 4I2TA 4ZB8A 4JU5A 2J9HA 1AC1A 3DD3A 4Q5FA 3N5OA 3FR9A 1DBYA 4ACSA 2LTKA 5ECPB 3L9SA 1LJRA 1M2AA 2QGVA 5CRWA 2HLSA 3A2XA 5CRGA 2IWTA 1YDKA 4WEYA 4FO5A 3QAGA 2FD3A 2TRCP 1T00A 1QMVA 4OFTA 2EIRA 2OBKA 3F0IA 4ILFA 4OCFA 2RUFA 2LSTA 3GIXA 3TKSC 3U5RE 4XS4A 3O6TA 2ZCTA 4MZCA 3D21A 2GSQA 2H6ZA 1TI3A 4LL4B 1XZOA 4KCEA 5JCWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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