4HPIA

Crystal structure of hen egg white lysozyme complex with gn2-m
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
128
structure length
128
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Lysozyme C
publication title A novel transition-state analogue for lysozyme, 4-O-beta-tri-N-acetylchitotriosyl moranoline, provided evidence supporting the covalent glycosyl-enzyme intermediate.
pubmed doi rcsb
total genus 46
structure length 128
sequence length 128
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4hpiA00
4H8YA 3MGWA 4YEMA 1G7MC 1LJHA 2DQAA 2HEFA 4LGKA 1ZMYL 1GB2A 4LZTA 1LHIA 1RI8B 5II3A 3A95A 1IWTA 1LZ9A 2I25L 4TTDA 3TMVA 1GE4A 1UIGA 2W1XA 3ATNA 2D4JA 4ML7A 4FDYA 2HEEA 1RCMA 4L41A 4UWUA 1CJ7A 4Z46A 1JTTL 2ZILA 4RLNA 1ALCA 1LZ6A 1IR8A 1QDRA 4MR1A 4OWEA 4XJGA 4CFPA 4QY9A 3LHMA 4PRUA 1LSPA 1JIYA 5KKJA 4XJIA 5KXZA 2LYMA 3AZ4A 4XJHA 2ZQ3A 2BQFA 1UCOA 1YAQA 5DN4A 2D4IA 1HMLA 1LJ3A 5KXWA 3BKHA 3HBHA 4GLAA 4NGOA 3A96A 3HFMY 1IX0A 1WQRA 1GHLA 1IWXA 1FLQA 3G3AB 3SP3A 5F81A 4WG7A 2XJWA 1IR7A 4WLYA 1HMKA 8LYZA 5C6IA 4NSHA 1NBZC 1WVUA 1GFVA 2DKVA 2Z2FA 3RW8A 1B5YA 4XJFA 3WUAA 1HENA 1IP4A 4HTQA 5D5FA 1HSWA 1ZV5L 5LVIA 3ATOA 1LMAA 4D9ZA 5LYZA 1LMQA 3WXUA 1LZRA 1GB9A 1NF5A 2GV0A 4H9AA 4YEOA 1GE2A 5LIOA 1DPWA 1LHJA 4DWXA 5F9UA 4H90A 1LJNA 3W6FA 3W6CA 1B7OA 4N1CC 1GBWA 1LZEA 1UC0A 1NDGC 1BB3A 2BQBA 4NGYA 3RNXA 2BQOA 5ILCA 1LSYA 1IC4Y 4DD7A 4DDBA 1BWJA 2Z2EA 3CSZA 5I4XA 1QUSA 3B0IA 2G4QA 4YENA 1LJ4A 1AKIA 1LMPA 1LYYA 1UICA 1IWWA 3AZ5A 1IORA 4R0FA 5KKIA 1JJ0A 2FBDA 4GCBA 1UA6Y 1OUCA 5DM9A 1YKZX 3E3DA 1JISA 5I5QA 5IHGA 3CT0A 1YROA 4WM6A 1IEEA 2YBNA 1BWIA 2CDSA 4NSGA 2I26L 2Y8PA 2ZYPA 5LVJA 1IOQA 4UWNA 2A7DA 1LSZA 4I0CA 3B0OA 4H94A 3W6EA 1OUGA 4BADA 1LJIA 2BQIA 3TXBA 5HLLA 1GF9A 2HEBA 4Z41A 4YM8A 2HECA 4OWHA 1UIFA 3A3RX 3LYZA 1G7JC 4ZIXA 2YBIA 2YDGA 5LXWA 2AUBA 3AGHA 5LVHA 1I1ZA 1FBIX 1LSNA 1GXV2 4YF2A 2ZQ4A 1EQEA 4LFPA 3AZ7A 4LYZA 5EBHA 4HJVA 1OUHA 5FDJA 1GPQC 3EO5A 4DYGA 2D91A 1JUGA 4GN4A 4WM4A 1LJFA 5KXMA 1LHMA 2W1MA 2LYZA 1GE0A 1XSFA 3CSRA 5APEA 1RFPA 3WVXA 1LSMA 3T6UA 1PZYA 1IOTA 2DQEY 1DXJA 2D6BA 1WQPA 1IIZA 4U3XB 1QDTA 5F9XA 1GFEA 1LOZA 2XTHA 1B5ZA 1F6SA 3CT5A 4P2EA 4LT2A 2BQEA 2Z19A 154LA 1GAZA 2RSCA 1YKYX 1VDSA 1DZBX 1DI4A 1LZDA 4PGJB 2EPEA 3RT5X 1IP6A 1IC7Y 3IJUA 4NHIA 3TXJA 4XJBA 1GFJA 2X0AA 5LAGA 4FJRA 3WUNA 1NKHA 4LYMA 4NGVA 4WLTA 1C08C 1GBYA 1BB6A 1UIEA 1GDWA 5B07A 1HHLA 1LZ5A 1IR9A 1HEOA 3TXDA 1LJGA 4WL7A 4X3BA 1B5UA 1LZSA 2MEDA 1CKCA 2FYDA 1G7HC 2WARA 5L3HA 4BAFA 3LYTA 1JJ1A 4NGZA 2BQAA 4DD0A 2H5ZA 3N9EA 3A91A 4ET9A 5C6LA 1GD6A 1B7NA 2YVBA 4GN5C 2XBSA 2G4NA 1GFRA 1XFPL 1GB6A 4MCKA 1VDPA 4A7DA 1OP9B 2C8PA 1YIKA 4NGKA 4HJYA 1TBYA 2DQIY 5LA8A 1AZFA 5E4PA 1WQOA 4W96A 3TMWA 1YANA 4HJZA 2B5ZA 1HF4A 1HEPA 4CGEA 2DQFC 4XN6A 1LHHA 3VWOA 4G4CA 4II8A 5HNCA 1BWHA 4GCDA 1IWVA 1REXA 3AYQA 1BGIA 1GF4A 2BQHA 1GFKA 6LYZA 1NHEA 1UACY 4J1BA 5B05A 1LSBA 5B1GA 3IWRA 3BKVA 4O34A 4RDSA 1IWZA 1IP1A 1QSAA 1JHLA 2DQDY 3CQLA 3KAMA 1FDLY 1BVKC 1LZ8A 3WU7A 1TEWA 1ZVYB 4E3UA 3TMUA 4WL6A 4XYYA 5A3EA 1SLYA 1YAPA 5B06A 3ZEKA 1QTKA 1NWGA 1GF7A 1ZVHL 4R6CA 4ET8A 1RJCB 1B2KA 1LMNA 4IJ4A 1CKDA 1HSXA 4WMGA 3WXTA 4QEQA 1B7SA 3AJNA 1LSEA 2BQMA 4J7VA 1C46A 1B0DA 5DN5A 3LYOA 2D4KA 1NBYC 1LZNA 1D9UA 1LCNA 4OW1A 4HV2A 1GFGA 5LYMA 1LJEA 1B5VA 2ZIJA 5APDA 1IP3A 2BQKA 4H9HA 4WLDA 4G4HA 1JKDA 1B7QA 1D6QA 1GDXA 2CJLA 1GF8A 4QGZA 1KXYA 4N8ZA 1GB5A 4OOOA 3A3QA 3A90A 4N9RA 4CJ2A 1GE3A 3W6BA 2ZYCA 3TMXA 1DPXA 1NQIA 5ILFA 3RZ4A 4NGIA 5APCA 3G3BB 1XGQC 1LJKA 1LHKA 1OUIA 4WM5A 1F6RA 4OWAA 4NSJA 1GBXA 4DDCA 1AM7A 2MEHA 4XJDA 3WH1A 2DQCY 3TXGA 1JITA 1EQ5A 1B5WA 1FKQA 4KL7A 1VATA 1E8LA 1CKGA 1VDQA 1W08A 4IATA 4I8SA 2MECA 1IP2A 4H91A 1DI3A 3A94A 1XGPC 2F2NA 4G49A 4B4EA 2Z39A 2N5ZA 153LA 5B59A 1GXXA 2XBRA 4ZEEA 1IOCA 4C3WA 3LZTA 2Z37A 1B7PA 2BQGA 2IFFY 3IJVA 1DKKA 4J1AA 3A6CY 5HMVA 5FELA 1LMOA 1O23A 4H9FA 1EL1A 5KXLA 4IASA 4H92A 3EXDA 2DQJY 3W6DA 1LZAA 1LTMA 4RW1A 3AB6A 4WG1A 1HELA 1T3PA 5D5CA 3WVYA 4ETCA 1BQLY 1J1OY 2BLYA 2YBMA 3N9CA 4NGJA 4B49A 4Z3MA 4LT0A 1W6ZA 4HV1A 4OOTA 1LAAA 4TSBA 5I53A 4M4OA 2BAAA 5F16A 1VDTA 4NWEA 2Z18A 1YL1X 4DD3A 4N1EI 1JKBA 1P2CC 4YOPA 4PHIA 4WOAA 4KT3A 1LMTA 1QQYA 3WPJA 1OUEA 4H9IA 3ZVQB 4HTKA 3QE8A 4H8XA 5KXPA 2BQCA 1GBOA 2YBHA 4GN3A 1CJ6A 2FYCA 4TWSA 5DLAA 2C8OA 1AT5A 1BB7A 3QNGA 5K7OA 193LA 1JTOL 2BQDA 4NGWA 5KJ9A 4B0DA 1TCYA 1F10A 4NG8A 2CWIA 3P68A 4DD9A 3OK0A 2F4AA 5LVKA 2BPUA 1D0MA 1DQJC 3WMKA 3F6ZA 1HEMA 3TXHA 3WULA 4NIJA 1B9OA 1JWRA 4LFXA 4BAPA 1LZTA 3TXIA 3W3EA 1FLUA 1IP7A 4NSIA 1LZ1A 4NWHA 4ETAA 1H87A 1OQMA 5L9JA 3AW7A 5HMJA 1PS5A 1KIPC 1UBZA 3QY4A 5I54A 1LZCA 1XEKA 1XEJA 5KXNA 5I4WA 1GEZA 5J7CA 5LYTA 3WUMA 4GCFA 5APFA 4B4IA 1C43A 9LYZA 1UIHA 4LT1A 1UUZC 3ZVQA 135LA 4CFOA 3D3DA 4CHXA 4NGLA 1WTNA 3GXRA 3CB7A 2ZIKA 4H1PA 3RU5A 1FLWA 1N4FA 1I56A 5HQ1A 1V7SA 3A8ZA 1EQ4A 3AGIA 4G4BA 1T6VL 5LA5A 1JTPL 2G4PA 3CSQA 1OUAA 2NWDX 1IO5A 1C10A 1GFAA 4LT3A 1OUJA 4AXTA 1MELL 3W6AA 4ZFPA 1A2YC 5KXOA 4M6DA 5F14A 1INUA 4J0LA 3J6KA 1DKJA 2EIZC 2LHMA 2MEBA 4W94A 2F4GA 4HTNA 4GCEA 2LZTA 4NG1A 1OUBA 1B5XA 1VEDA 194LA 4ETEA 1OUDA 3FI7A 1REZA 4H9CA 4HPIA 5KXTA 1WQQA 1GB8A 1IWUA 1LYSA 1HFZA 1LZBA 4C5FA 1KIRC 1KXWA 1D6PA 4GLVA 1GF0A 1LSGA 2LZ2A 1FN5A 1LSFA 3M18B 4NY5A 4LYCA 1HERA 4DD1A 1A4VA 1BVXA 1GEVA 1UIBA 1IP5A 2VB1A 3WU8A 1LPIA 3WPLA 1GBZA 4WO6A 1KXXA 4WM1A 5LAFA 1LZGA 1LYZA 3T36A 3TXKA 1H6MA 1D0LA 1I20A 5HNLA 5M1YA 4ETBA 2BQJA 4HPEA 1TDYA 1YAOA 4WM3A 1B7RA 3EBAB 4NFVA 2LYOA 4GCCA 5L3IA 134LA 2YSSC 4G9SA 4OWCA 1HNLA 3P64A 1LZYA 1JEFA 1HFXA 5KXXA 5C6JA 2DQHY 2MEEA 4EOFA 4PJ2C 1NMMA 3N9AA 1JSFA 5B1FA 1Z55A 2BQNA 1IVMA 1WQNA 3P65A 4DT3A 4OWBA 1CJ9A 1JPOA 1IOSA 1REMA 1GAYA 1GF5A 4PRQA 4WM2A 5KXSA 4NHSA 3A67Y 1IWYA 1QTEA 4LYTA 2BLXA 1JKCA 4ANRA 3GXKA 1IC5Y 2HUBA 1G7LC 1IY3A 1C7PA 1J1XY 2W1YA 4H8ZA 4KPMA 1GB7A 1GWDA 1LSCA 1AT6A 4WLXA 3A93A 208LA 3WL2A 4XENA 5AMYA 3AZ6A 4PPOA 5IELA 1OUFA 1WQMA 3AW6A 1KIQC 4H9EA 2H9KA 3A34A 1C45A 2A7FA 4TSCA 3WW6A 133LA 1FLYA 1LZ4A 1LKSA 2F30A 7LYZA 2EKSC 4EMNA 5I4YA 1HEQA 1LYOA 3FE0A 1GBSA 4LYBA 1HEWA 1YAMA 4MSTA 1GFHA 1GE1A 2ZWBA 3LZ2A 1HC0A 5KXKA 3AGGG 2YBJA 4H9BA 4XADA 1QIOA 4TUNA 3B72A 2MEFA 1CKFA 1YKXX 4NEBA 3B0KA 1CJ8A 1BB5A 1MLCE 2CGIA 4B1AA 2YBLA 1CKHA 1LKRA 1XEIA 1GFTA 1LJJA 3WYHA 1V7TA 1YL0X 1YQVY 1WVVA 2ZNXY 5DL9A 3WU9A 5LVGA 1JSEA 1WTMA 1CNSA 3HBDA 1RE2A 2DQGY 5A3ZA 2HU1A 2EQLA 3J4GA 4NHQA 1XGUC 5IDDA 1BHZA 3LYMA 2Z12A 4UWVA 4BS7A 2HU3A 2I6ZA 4HP0A 5LINA 4N5RA 4HSFA 4NHPA 2H9JA 1UIAA 3OJPA 4Z98A 1JKAA 1IY4A 2MEAA 2BQLA 3B6LA 5KXYA 1XGTC 2Q0MX 3D9AC 3TXFA 1J1PY 1FKVA 5E9RA 1LHLA 2PC2A 1DI5A 4ETDA 1SQ2L 3CT1A 5FHWA 1G7IC 5FSTA 2W1LA 5KY1A 1TAYA 2IHLA 1GB3A 2Z38A 3ULRA 2HEDA 1GF3A 1BB4A 4RW2A 3WW5A 3P66A 3TXEA 2HTXA 4AGAA 1VAUA 4WO9A 1LSDA 5FEKA 3WPKA 6LYTA 3HBEX 1GF6A 4TX7A 4B4JA 2FBBA 4NHTA 3EMSA 1NDMC 207LA 1YILA 1LMCA 4DD2A 3P4ZA 4RLMA 1B7MA 4H93A 4DDAA 132LA 4DC4A 2DBTA 1REYA 1XGRC 1B7LA 2HEAA 2ZNWY 5FCPA 1QSWA 1LSAA 5JENB 5KXRA 4LYOA 1JJ3A 4QDNA 2MEIA 1HFYA 1VFBC 1UIDA 2MEGA 1GB0A 3K3TA 1F0WA 1D0KA 4KXIA 1GFUA 5T3FA 1QUTA 3LN2A 4N0JA 3M3UA 3A92A 3A6BY
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H8YA 1LJHA 2DQAA 1GB2A 1LHIA 4DQJA 1IWTA 210LA 4LDLA 1QS5A 4L41A 1LZ6A 4OWEA 1C6PA 1L64A 4XJIA 2BQFA 215LA 1HMLA 3HBHA 3HFMY 4WG7A 4EKRA 1HMKA 3HUQA 8LYZA 1NBZC 2DKVA 2Z2FA 3G3WA 1K28A 1HENA 1IP4A 3ATOA 111LA 5LYZA 3WXUA 3HT7A 4YEOA 5LIOA 1L62A 3W6CA 1B7OA 3DN2A 4NGYA 3RNXA 139LA 1IC4Y 3CSZA 1P7SA 4ARQA 1LJ4A 1AKIA 4GCBA 3E3DA 1JISA 5I5QA 3CT0A 1D2YA 1IEEA 2YBNA 214LA 1BWIA 2CDSA 4NSGA 178LA 2A7DA 4I0CA 4H94A 1OUGA 4YM8A 2RBNA 3G3XA 2HECA 4I7RA 177LA 5LVHA 1I1ZA 1LSNA 2ZQ4A 4EKPA 1T97A 3AZ7A 4LYZA 1LI6A 1JUGA 2W1MA 5APEA 1XSFA 224LA 1IOTA 1L61A 2B75A 112LA 1B5ZA 2BQEA 183LA 1L86A 1GAZA 1VDSA 4PGJB 1C6NA 1QUDA 1IC7Y 4NHIA 1GFJA 5LAGA 4FJRA 3WUNA 4LYMA 1C08C 1L17A 1BB6A 1HHLA 4EXMA 1L08A 150LA 1LJGA 4X3BA 1B5UA 2FYDA 1G7HC 4BAFA 1G0LA 3NY9A 1JJ1A 4NGZA 3A91A 1XFPL 4MCKA 1VDPA 1L06A 2C8PA 2XQOA 5LA8A 1AZFA 3TMWA 2B5ZA 1D3JA 1IWVA 1REXA 3AYQA 1BGIA 3HT6A 6LYZA 143LA 1LSBA 4LDOA 3IWRA 3CQLA 1FDLY 1BVKC 1LZ8A 1TEWA 4I7NA 137LA 5A3EA 165LA 1T6HA 1NWGA 4ET8A 1QTZA 1B2KA 1CKDA 4WMGA 1B7SA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4H8Y A;  3MGW A;  4YEM A;  1G7M C;  1LJH A;  2DQA A;  2HEF A;  4LGK A;  1ZMY L;  1GB2 A;  4LZT A;  1LHI A;  1RI8 B;  5II3 A;  3A95 A;  1IWT A;  1LZ9 A;  2I25 L;  4TTD A;  3TMV A;  1GE4 A;  1UIG A;  2W1X A;  3ATN A;  2D4J A;  4ML7 A;  4FDY A;  2HEE A;  1RCM A;  4L41 A;  4UWU A;  1CJ7 A;  4Z46 A;  1JTT L;  2ZIL A;  4RLN A;  1ALC A;  1LZ6 A;  1IR8 A;  1QDR A;  4MR1 A;  4OWE A;  4XJG A;  4CFP A;  4QY9 A;  3LHM A;  4PRU A;  1LSP A;  1JIY A;  5KKJ A;  4XJI A;  5KXZ A;  2LYM A;  3AZ4 A;  4XJH A;  2ZQ3 A;  2BQF A;  1UCO A;  1YAQ A;  5DN4 A;  2D4I A;  1HML A;  1LJ3 A;  5KXW A;  3BKH A;  3HBH A;  4GLA A;  4NGO A;  3A96 A;  3HFM Y;  1IX0 A;  1WQR A;  1GHL A;  1IWX A;  1FLQ A;  3G3A B;  3SP3 A;  5F81 A;  4WG7 A;  2XJW A;  1IR7 A;  4WLY A;  1HMK A;  8LYZ A;  5C6I A;  4NSH A;  1NBZ C;  1WVU A;  1GFV A;  2DKV A;  2Z2F A;  3RW8 A;  1B5Y A;  4XJF A;  3WUA A;  1HEN A;  1IP4 A;  4HTQ A;  5D5F A;  1HSW A;  1ZV5 L;  5LVI A;  3ATO A;  1LMA A;  4D9Z A;  5LYZ A;  1LMQ A;  3WXU A;  1LZR A;  1GB9 A;  1NF5 A;  2GV0 A; 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 1CKF A;  1YKX X;  4NEB A;  3B0K A;  1CJ8 A;  1BB5 A;  1MLC E;  2CGI A;  4B1A A;  2YBL A;  1CKH A;  1LKR A;  1XEI A;  1GFT A;  1LJJ A;  3WYH A;  1V7T A;  1YL0 X;  1YQV Y;  1WVV A;  2ZNX Y;  5DL9 A;  3WU9 A;  5LVG A;  1JSE A;  1WTM A;  1CNS A;  3HBD A;  1RE2 A;  2DQG Y;  5A3Z A;  2HU1 A;  2EQL A;  3J4G A;  4NHQ A;  1XGU C;  5IDD A;  1BHZ A;  3LYM A;  2Z12 A;  4UWV A;  4BS7 A;  2HU3 A;  2I6Z A;  4HP0 A;  5LIN A;  4N5R A;  4HSF A;  4NHP A;  2H9J A;  1UIA A;  3OJP A;  4Z98 A;  1JKA A;  1IY4 A;  2MEA A;  2BQL A;  3B6L A;  5KXY A;  1XGT C;  2Q0M X;  3D9A C;  3TXF A;  1J1P Y;  1FKV A;  5E9R A;  1LHL A;  2PC2 A;  1DI5 A;  4ETD A;  1SQ2 L;  3CT1 A;  5FHW A;  1G7I C;  5FST A;  2W1L A;  5KY1 A;  1TAY A;  2IHL A;  1GB3 A;  2Z38 A;  3ULR A;  2HED A;  1GF3 A;  1BB4 A;  4RW2 A;  3WW5 A;  3P66 A;  3TXE A;  2HTX A;  4AGA A;  1VAU A;  4WO9 A;  1LSD A;  5FEK A;  3WPK A;  6LYT A;  3HBE X;  1GF6 A;  4TX7 A;  4B4J A;  2FBB A;  4NHT A;  3EMS A;  1NDM C;  207L A;  1YIL A;  1LMC A;  4DD2 A;  3P4Z A;  4RLM A;  1B7M A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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