4HTLA

Lmo2764 protein, a putative n-acetylmannosamine kinase, from listeria monocytogenes
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
MKIAAFDIGGTALKMGVVLPHGEIILTKSAEISGSDGDQILAEMKVFLAENTDVTGIAVSAPGYVNPKTGLITMGGAIRRFDNFNLKEWLEAETGLPVAIENDANCALLAEKWLGKGQDLDDFLCLTIGTGIGGGIFSNGELVRGGRFRAGEFGYMFSERPGAFRPGKYTLNETTTMLVLRRQYAELTGRPLEEITGEEIFANYDAHDAVSERLITEFYTGICTGLYNLIYLFDPTHIFIGGGITSRPTFIAELKHHMESFGLRDTIIETATHKNQAGLLGAVYHFLQEEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Beta-glucoside kinase
publication title Lmo2764 protein, a putative N-acetylmannosamine kinase, from Listeria monocytogenes.
rcsb
source organism Listeria monocytogenes
molecule tags Transferase
total genus 92
structure length 291
sequence length 291
ec nomenclature ec 2.7.1.85: Beta-glucoside kinase.
pdb deposition date 2012-11-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA01
5AQLA 2VCPA 4CZKA 3CI5A 5E26A 3WQTA 3QMLA 4ISEA 1S3XA 1NBWA 2CGLA 3L4IA 3C7NB 5AQRA 3MN9A 4BREA 1GLBG 2W41A 4H0XB 4XH5A 3VOVA 3VF2A 3FE1A 2IIRA 5F1XA 3L6QA 5FPMA 3WXLA 3FFKB 5B8HA 2NRHA 3VPZA 3ZX0A 2P9SA 3H45C 4I6MB 2P9NB 4WQ5C 4BVPA 3SK3A 1QHAA 4AM7A 5BPNA 2VYPA 3CJBA 3O5BA 2A42A 4KBOA 3OHRA 3AAQA 3WXIA 1LCUA 3UKUB 5BREA 2YI1A 4Z94A 1QZ5A 2HF4A 1NGIA 1NGDA 1ZC6A 3HM8A 3H1VX 5E84A 1Y64A 3U9ZA 2GUPA 2FF6A 4DHYA 4H5VA 4K43A 4DQ8A 1T6CA 3WUHA 5BR9A 5JLFA 2GWKA 3MDQA 1RFQA 3WT0A 1LOTB 1CZAN 3C0BA 4QS9A 1QQNA 3D2EB 1EQYA 4MO5A 3CJ1A 5F0XA 1ESVA 4BG8A 2QWMA 4BRAA 2E2PA 3RSEB 4FWMA 3ZEUB 4FPAA 2P9PB 2E20A 2PAVA 3A5NC 4BR0A 5ADXH 2ZGYA 4B9QA 3A5OC 3CETA 2Q0UA 5AR0A 2A5XA 3BP8A 2Q36A 2CGKA 4F9OA 4YDUA 4BRFA 1DGKN 2D0OA 4JD2B 4H03B 3SMPA 3ZETA 1V4SA 3QFUA 5AQUA 1GLCG 3CJCA 4BRPA 1ZBSA 3QFPA 3FR0A 2P9LB 3GG4A 4NO7A 1Z6RA 4PKGA 3S41A 2IVOA 4CZFA 3AY9A 3GL1A 3G25A 4BC5A 1XQSC 3HZ6A 5EX5A 3LDPA 3LM2A 5FPDA 4FSVA 4EHUA 4BRHA 5AFUH 1C0GA 3SLCA 5BPLA 4FWPA 3VF6A 1HUXA 2ZGZA 4BR2A 4FWKA 2QWRA 2D0PA 2A6AA 4BR7A 1NGAA 4A62A 1TYQA 3UE5A 3FZFA 1ATNA 3HBTA 3MCPA 5FPNA 4CZHA 4BRDA 2NLXA 4WYBA 3DJCA 3M1FA 2FXUA 3ULEB 3VESA 4O5FA 2YHYA 3MMVA 5AQZA 1IG8A 4FL9A 2WUSA 1WUAA 2P9KA 1GLDG 5JMVA 3A8YA 2QWNA 1X3NA 1BA1A 2AP1A 2E2QA 4CI6A 4EFHA 3JS6A 5BN8A 3ATUA 3CIPA 4H0PA 4CZMA 1NGGA 4IJNA 2DPNA 3MK6A 5AQVA 4B1ZA 2D4WA 1YUWA 3QICA 3DXKB 5ADXA 4BRKA 1SQKA 2P9UA 2Q1NA 4MLHA 1R59O 4BR5A 2YJEA 3QBWA 1GLLO 3ZX3A 4C23A 1KAXA 1NWKA 3LDLA 2YHXA 4A61A 4CBUA 2Q31A 4BRGA 5AZJB 2P9IB 4PL8A 3VEZA 4BQLA 5JICA 3L0QA 4B1VA 3MN5A 3GDQA 1KXPA 3WEEA 2KHOA 1NLVA 4CBWA 4PL7A 2Q97A 1TUYA 2E1ZA 2ITMA 1JCFA 5KQ8A 3AARA 3VEYA 5AQPA 3R6MA 4GNIA 5F2RA 1V4TA 2V52B 5BRFA 5BPMA 1BUPA 4H0YB 1YXQA 2ASMA 1ATSA 2ASPA 4O8KA 2E88A 2A41A 3IFRA 4QS8A 3LL3A 2D1KA 5AFUA 2IVNA 3CQYA 2GELA 4FWLA 1DKGD 4NB4A 4IJAA 4BRMA 2P9UB 2P9SB 5AQKA 5AQJA 1E4FT 2CGJA 3MN7A 3VEWA 4A2BA 1P8ZA 4CZIA 1T6DA 4FWNA 4EAHD 1DEJA 1QQOA 5AQGA 2QWOA 3DXMA 2I7NA 3O1WA 2J4RA 4RCHA 2HOEA 2V7YA 1GLAG 4K41A 4BVOA 4QS7A 5AQSA 1NGHA 1NGFA 1X3MA 3QBXA 2PBDA 1GLEG 1JCEA 1NGJA 3I33A 4IZ9A 1MA9B 3KZBA 2A3ZA 2FF3B 3TPQA 2IVPA 4H0OA 3A5LC 4ISGA 4DB3A 1HJOA 3BEXA 4EIAA 3VERA 3VEOA 2E2NA 2FSKA 1GLFO 3M3ZA 4WQ4A 1WOQA 2ZF5O 1HLUA 4CBXA 4BR9A 4YDUC 1BU6O 4CZJA 3D2FA 4B1XB 1Q18A 1K8KA 1SZ2A 3H3NO 3ENOA 5AQIA 3UKRA 4BC2A 4HWIA 5EY4A 3DXMB 4M7YA 3CQXA 5JLHA 2E1YA 3O6WA 3HSCA 5EOYA 5BN9A 3R9PA 5I9EB 4LC9B 2W40A 3O4WA 3U8XA 3I8BA 4FO0A 1YAGA 3D7EO 3C7NA 3EN9A 3U9DA 1BO5O 3CERA 3VF4A 1KAYA 3LDNA 5AQXA 4H5RA 3W3DA 4BC4A 3ZETB 2V51B 4H5NA 2BUPA 1E4GT 1QQMA 3UB5A 3VGLA 5EXWA 2NZTA 3HTVA 3J8AA 3B8AX 1BWFO 2QWQA 2CH5A 4FPBA 3O1BA 3EO3A 1SAZA 2P9NA 3F9MA 3LDOA 2FSJA 4I6MA 2AA4A 2HF3A 3FZKA 5LJWA 1U2VA 1S22A 4FWQA 4K42A 5LY3A 2GEMA 5ELZA 5EVZA 3A0IX 3HI0A 4FWSA 3GE1A 4IO8A 5AQTA 1QZ6A 3BUZB 5AQQA 3UKUA 1HKBA 1OKJA 3ID8A 4L3QA 2V7ZA 3IUCA 3VEXA 4BRIA 5KQDA 1ZXOA 4H5WA 1NMDA 3A5MC 4B1WB 1X9JA 1RGIA 4IXCA 2OANA 5AQWA 5CE3A 4WQ5A 1MWKA 1TYQB 1HPMA 4BQZA 1YVNA 3H1QA 5AZIA 3BF1A 2GWJA 3ZX2A 5AQOA 4PKHA 1GLJO 4CJ7A 2Q2RA 2F9TA 3ATVA 5AQFA 2QWPA 3H3OB 5AQNA 3DAWA 2YHWA 3H6EA 4JNEA 2P9KB 3D2EA 5KPRA 4CZLA 2ZWHA 1G99A 1U6ZA 1XUPO 3RSEA 4M7XA 1U2VB 3CHWA 3SMSA 3ZEUA 3FZHA 3JXUA 2P9PA 4CZGA 4RTFD 4BRLA 4BC3A 4K25A 4XH4A 1ATRA 4H5TA 4ISFA 1XC3A 3FZMA 3IDHA 3R8EA 3VENA 4JN4A 2H3GX 4CD3A 1NGEA 1NM1A 4XH1A 4BGAA 4MLEA 5BRHA 5FPEA 1BG3A 2YJFA 4JD2A 3CJAA 5AQHA 5LJVA 4AM6A 3EKSA 3U4LA 4Y0WA 3EL2A 4HTLA 5AZIB 4FWRA 5TKYA 4BROA 2P9LA 3M6GA 3VETA 3QB0A 1MWMA 4M63C 4H0VB 4BGBA 1H1VA 5KPTA 3LM9A 1MDUB 4B1UB 3AAPA 3CJ9A 1JCGA 3EKUA 3WEEB 2BTFA 4H0TB 3H46O 3KHYA 4BR4A 1D4XA 2QXLA 3SJHA 4GY2B 3DWLA 3KVGA 2ASOA 3MN6A 4XEIA 3TU5A 2QM1A 3VGMA 4FOIA 4JHDA 2Q0RA 4MO4A 3BF3A 4JAXA 3WXKA 5AQYA 1BDGA 1NGCA 1HKCA 3VGKA 4BG9A 1NGBA 4FOEA 4B1YB 2UYTA 2HMPA 3LDQA 3ULEA 4CZEA 1T44A 4BRNA 4DCHA 2GTDA 2QWLA 2YCHA 1RDWX 1Z05A 3IMXA 3P4IA 2EWSA 2FSNA 5BRDA 2FLOA 4IWVA 2CH6A 4EHTA 4WQ4C 3WQUA 4BRQA 2QW9A 3GOIA 3O08A 3WXJA 3O8MA 4PKIA 2A40A 3ENHA 2E8AA 3GBTA 3FZLA 3DXKA 3EZWA 1C0FA 2I7PA 1BA0A 4CD1A 1IJJA 4JHDB 2E2OA 1TUUA 3W0LA 3FGUA 3QDKA 2VWBA 1HKGA 4RWTA 5AZJA 2P9IA 3D2FB 3O80A 1BOTO 5KPZA 4BRCA 1J6ZA 3VEVA 1K8KB 1HX1A 1KAZA 2F9WA 3UKRB 5AQMA 4J8FA 4E1JA 4FWOA 3CJ7A 4A2AA 3FLCO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AQLA 1NU0A 4JLHA 3WQTA 1NMNA 3THXA 4HUGA 2CGLA 1ASUA 3P1GA 4FW2A 5CR4A 4W5NA 3EY1A 4BREA 2HHQA 1GLBG 4BE0A 4H0XB 1RTHA 4H4OA 5K14A 4CEBA 3FE1A 2IIRA 4CJFA 5F1XA 2ZJRL 3SAHA 1XMOK 5FPMA 3LPTA 4OPJA 3VQ6A 2F96A 2OPRA 3FFKB 4JKFA 3V9WA 5B8HA 4DLEA 3VPZA 3ZX0A 3NFAA 4I6MB 3PO4A 4BVPA 4DQPA 4F3OA 1IH7A 1B9DA 4JI6K 1W0HA 5LMUK 3OHRA 3PLAA 4GVMA 1S6PA 3J7ZO 1UA1A 2Z1JA 3ZSOA 2GBZA 2PYLA 1QVFM 1NGIA 1NGDA 2BANA 3HM8A 2HMIA 4L8RB 1TL1A 1Y64A 3QNNA 3SCXA 2FF6A 1F21A 3OYBA 3WNGA 3TTCA 4M42A 2E6LA 5KRSA 1T6CA 1D9FA 5JLFA 1L3UA 1C1BA 2GWKA 4ID5A 3CCSN 3MEEA 1YT3A 1TK8A 3RTVA 4JKBA 3C0BA 1CZAN 1QQNA 4Z0UA 1JLAA 4IO9L 3MXJA 4FK0A 4BG8A 2E2PA 4FWMA 3ZEUB 5J2NA 2KKZA 4FYDA 4BR0A 1E3MA 3A5OC 4DFKA 3NBPA 3CETA 1FKOA 3OY9A 3I0RA 4M3UA 4GKJK 4B3RK 4BRFA 4CHQA 2D0OA 1HRHA 2HHWA 2G8HA 3KKSA 5HRSA 3NF9A 3QFUA 3NH1A 5J1EA 3M8QA 2Z1IA 3KK1A 4EP4A 3PX0A 1C1AA 2DFEA 4PKGA 3KK3A 2O4IA 3VQPA 1KFSA 1YHQN 4DU1A 5FPDA 4AHRA 1C0GA 4DTXA 4CK1A 3RR8A 1S9GA 4B3OA 3VF6A 1WSIA 4DV2K 1HUXA 1VSFA 1WSEA 2ZGZA 3CD6N 2D0PA 2A6AA 1NGAA 1TYQA 4KHSA 4FJ5A 3FZFA 3AA3A 1JLCA 3AV9A 3MWPA 4M3ZA 4OGEA 1L3VA 4Q5VA 2G8UA 1VQNN 4KTZA 3MMVA 3MX2A 5J2QA 2G8FA 4FLZA 2P5GA 2XRIA 2P9KA 1GLDG 4WF9L 1RDDA 3HOTA 3M8RA 4CEFA 2O8CB 2AP1A 2E2QA 2UUAK 1JXBA 1HNIA 5TKWA 3RWUA 1SKWA 5BN8A 3CIPA 1NJZA 4B9NA 1W7AA 4N76A 3CMAN 3MK6A 1NG9A 4YOVA 5FRNA 1VQPN 3DXKB 4IOCL 1NJXA 4CEOA 1SQKA 4A59A 4I9LA 3TAQA 2Q1NA 4BR5A 1ZBUA 3ZT4A 1WSGA 3TANA 3TAMA 3QBWA 4CGDA 3LDLA 3HL8A 3MEGA 5I42A 2P9IB 4FJ7A 3VEZA 2I5JA 2PFUA 4BQLA 3ZSZA 3L0QA 4B1VA 5JICA 3C65A 3PV8A 1WN7A 4CIFA 2BDPA 4JS5A 4CJTA 1NLVA 4PL7A 1TUYA 2KFZA 1JCFA 1EWQA 3VEYA 5AQPA 4FJXA 3THXB 4MDBA 3AVGA 4JKDA 3NMUA 1BUPA 4H0YB 1YXQA 2ZJQL 1ASVA 4DSKA 4QS8A 1UWBA 1J5EK 1O13A 3O9RA 1ASWA 1NNEA 4YNQA 3V9UA 1Q86O 4LFAK 3CC4N 4CJVA 2NNWA 4ZTJA 3VQAA 4CK3A 1VQ9N 5HRRA 3OYIA 4FWNA 3BZCA 3L2RA 3R1XA 3ZSQA 2P1JA 3CC7N 2J4RA 4RCHA 2NUBA 3NVMA 2R7YA 4QS7A 1T3VA 1K6YA 1RDAA 1TKTA 4IFYA 2X78A 3I33A 5KGXA 1MA9B 3KZBA 3TPQA 3U6FA 3A5LC 1VRTA 4ISGA 1HNXK 1Z26A 4ILJA 4JKAA 4DF8A 4LF6K 3BEXA 1RDCA 4DF4A 3TAPA 1I94K 3AVKA 3RVCA 2O8EA 4JK8A 1OH5A 1N36K 4C8KA 4BR9A 4CZJA 4H8KA 4BE1A 3D2FA 4B1XB 1QSYA 3U3GA 1Q18A 3VN5A 1K8KA 4FK4A 3JAMO 5EY4A 3L2WA 3DXMB 5JLHA 3CQXA 1VQ4N 3O6WA 3R9PA 3HSCA 1LW0A 3AVFA 3K9JA 4KAZA 2W40A 3O4WA 3U8XA 3D7EO 3LP3A 3U9DA 4CIGA 3LP0A 3CERA 4FW1A 1KAYA 4ELVA 3CG7A 2ZQBA 3KJVA 2VGMA 1QQMA 3V81A 4DR4K 3UB5A 5EXWA 3ID6A 1BWFO 2WOMA 4AHSA 2OZSA 4ELUA 2P9NA 2AA4A 3KLFA 5LJWA 1KTQA 1U2VA 1RTDA 1CXUA 4FWQA 5JS2A 4JS4A 4CCHA 2HHTA 5LY3A 4E0DA 1RBSA 3GE1A 1YJNN 1HKBA 4Z4CA 2V7ZA 3IUCA 4H5WA 1NMDA 3OYDA 4NCAA 4B1WB 3G10A 1LAWA 2OANA 1QHTA 4IXCA 4OLBA 2NRXA 1TYQB 4WQ5A 1HPMA 4CHOA 3H1QA 3EZ5A 4LF5K 5AQOA 4PKHA 3A2FA 1ILYA 3H3OB 4FVMA 2YNHA 4B9UA 1HR0K 2P9KB 1BHLA 3B6PA 4DV6K 2Z1GA 4KHQA 4EZ6A 2P9PA 5LL6Z 1J5OA 1QE1A 1ATRA 1HMVA 3FZMA 1YJWN 2NRWA 1Q9YA 1VSEA 4XH1A 4BGAA 1Q81O 1IBMK 4O8UA 1C6VA 3TARA 3NGZA 5FPEA 4KPYA 1BG3A 1TVRA 1JLGA 3CJAA 4JD2A 4LSLA 3CF5L 1HQEA 4OKJA 5AQHA 5LJVA 3CCQN 4AM6A 1L5UA 2IOCA 4FWRA 1Z25A 4CJ4A 3AVBA 4JYAK 3M6GA 2VG6A 4QOZB 1MWMA 4BGBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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