4HTLA

Lmo2764 protein, a putative n-acetylmannosamine kinase, from listeria monocytogenes
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
MKIAAFDIGGTALKMGVVLPHGEIILTKSAEISGSDGDQILAEMKVFLAENTDVTGIAVSAPGYVNPKTGLITMGGAIRRFDNFNLKEWLEAETGLPVAIENDANCALLAEKWLGKGQDLDDFLCLTIGTGIGGGIFSNGELVRGGRFRAGEFGYMFSERPGAFRPGKYTLNETTTMLVLRRQYAELTGRPLEEITGEEIFANYDAHDAVSERLITEFYTGICTGLYNLIYLFDPTHIFIGGGITSRPTFIAELKHHMESFGLRDTIIETATHKNQAGLLGAVYHFLQEEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Lmo2764 protein, a putative N-acetylmannosamine kinase, from Listeria monocytogenes.
rcsb
molecule keywords Beta-glucoside kinase
molecule tags Transferase
source organism Listeria monocytogenes
total genus 92
structure length 291
sequence length 291
ec nomenclature ec 2.7.1.85: Beta-glucoside kinase.
pdb deposition date 2012-11-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA01
5ADXH 1TYQB 2VCPA 2AP1A 1GLCG 3EL2A 4B1UB 3GE1A 5AQGA 5AQSA 3CIPA 3R9PA 3B8AX 4CI6A 4O5FA 3D2EB 3UKUB 1JCGA 4EAHD 4JNEA 3C7NB 3O80A 3JS6A 4BRQA 5BN9A 1NGGA 2FSJA 1RGIA 2V7YA 4IO8A 5AQKA 3CQYA 3ZX3A 1DKGD 3ENOA 1YUWA 2CH5A 4FOEA 1DGKN 3QICA 1NGAA 4BQZA 5AQVA 4BR0A 3FGUA 4FPAA 3TPQA 5LJVA 3QFPA 4BROA 1HPMA 1NGJA 5BREA 2KHOA 5AQXA 4FL9A 2PBDA 2P9UA 5FPMA 3GOIA 4EIAA 3VENA 1T6CA 5AQUA 3UKRB 3KZBA 2GWJA 4CZLA 5BR9A 1NGDA 4YDUA 3VF4A 3WT0A 2EWSA 4M63C 4NO7A 2YHWA 4H0XB 1BU6O 4XEIA 4GNIA 4EFHA 4RCHA 5TKYA 1ZBSA 2FF6A 1WUAA 2YHYA 3ENHA 3KHYA 4MO4A 4K25A 3M1FA 4PL8A 3BUZB 3KVGA 4BG8A 4EHTA 2AA4A 5LJWA 1HUXA 1QHAA 4H5RA 2A6AA 4RTFD 3MN6A 5AQHA 3R6MA 3U8XA 2P9PB 4B1ZA 5FPEA 2Q97A 1BWFO 5AQIA 1BOTO 3FLCO 1CZAN 2UYTA 5JICA 2QWRA 1HJOA 5BPMA 1D4XA 3UB5A 3O8MA 1BA1A 1P8ZA 4JN4A 1BDGA 2E8AA 3MN9A 4CZMA 2E2NA 1T44A 5E26A 1JCEA 3O1WA 1V4TA 3D7EO 3FZHA 4CD1A 1SQKA 5JLHA 4JAXA 3ID8A 4AM6A 3LDOA 1XUPO 5AQZA 3DAWA 3I33A 5BRFA 3EKUA 5KQ8A 1BA0A 3J8AA 4C23A 2P9UB 3DJCA 1OKJA 4CBUA 5EVZA 4BQLA 4JHDA 2ZGYA 4RWTA 2A5XA 2GUPA 2FXUA 3FZLA 1BG3A 1GLAG 3FZMA 4MLEA 5AR0A 1HKGA 4CBXA 2HF3A 4DB3A 2HOEA 1XQSC 3QBWA 2Q0RA 1T6DA 5AFUA 4BVOA 1ATSA 4H5NA 4DHYA 4JD2A 1WOQA 4BC5A 1MDUB 2V52B 3D2FA 3GBTA 5ADXA 5AZJA 2D1KA 1XC3A 3H6EA 3O08A 4WQ5C 4DCHA 2CGLA 2V51B 2YI1A 3VGKA 1RFQA 3I8BA 4CZEA 1HKCA 4BRCA 3M6GA 4K43A 3A5NC 1SAZA 5F2RA 3QMLA 1MA9B 4XH5A 4L3QA 1JCFA 1KAZA 4BC2A 4H0OA 3R8EA 1IG8A 1ATNA 2IIRA 4BR5A 1C0GA 3IFRA 1ATRA 1ESVA 3A8YA 3ZEUA 2QWNA 5FPNA 4FWSA 1X3MA 3U4LA 3O5BA 3P4IA 1ZC6A 2P9LA 2E1ZA 4PL7A 2F9WA 2V7ZA 3BF3A 4B1VA 4WYBA 5F1XA 3AARA 4BGAA 1NM1A 1H1VA 1YVNA 3EKSA 1MWMA 4IJAA 3LM9A 4ISEA 5EOYA 4A61A 1U6ZA 4H0PA 4B9QA 3L0QA 3CJAA 4H0YB 1Z6RA 2FLOA 4BRKA 3CI5A 4FWQA 1J6ZA 4QS8A 3HTVA 1QQNA 4FOIA 3G25A 4BREA 1NGBA 2ASOA 2HMPA 4K42A 2IVOA 2QWPA 2YJFA 1HLUA 3HSCA 3H1QA 1GLBG 4A2BA 3CJ9A 3VESA 1Y64A 2Q0UA 4PKIA 4B1XB 1E4GT 4CZFA 2D0OA 3VEXA 3ZETB 3A0IX 5BPNA 2Q36A 4IWVA 2A3ZA 3DXKA 3O4WA 4JD2B 3U9ZA 2A42A 2D0PA 4FPBA 5FPDA 2OANA 3MDQA 3D2FB 4B1YB 3WXKA 4BGBA 2W40A 3A5OC 5AQQA 3QFUA 5AZJB 4J8FA 3MN5A 4FWOA 4H03B 4MLHA 4BRPA 1KAXA 2FSKA 3CJ1A 3LDNA 4H0VB 2GEMA 5AQJA 3M3ZA 3VEVA 3BF1A 2P9SA 1QZ6A 1V4SA 5KQDA 3C0BA 5AQWA 4PKGA 4PKHA 4BC3A 3AAPA 3ZX2A 2E2OA 1QQMA 4H5VA 4CJ7A 4HWIA 3ZEUB 3UKUA 2NZTA 2BUPA 3VERA 4Y0WA 5KPTA 3VGMA 1QQOA 3HI0A 2HF4A 5EXWA 3JXUA 2FSNA 2P9LB 2BTFA 4XH4A 3EZWA 4FWKA 1X3NA 2YCHA 4H5TA 4BC4A 1NGCA 3H45C 4B1WB 1GLJO 4H0TB 3FR0A 4XH1A 4BVPA 4FWNA 4FO0A 3FE1A 3ULEA 3H46O 3BEXA 3MK6A 5AQLA 3RSEA 3DXMA 2W41A 4IZ9A 1NGIA 4FWLA 3H1VX 4I6MA 4WQ5A 2P9IA 3CJBA 1QZ5A 4M7YA 3GDQA 4LC9B 4CZKA 3GL1A 4NB4A 4BRNA 3L6QA 4A62A 2QWLA 4BG9A 3DXKB 1KXPA 4CZHA 1KAYA 2YHXA 3VEWA 3WEEA 5EX5A 2GTDA 3TU5A 4BR2A 2D4WA 3LDPA 2A40A 3WXJA 3MN7A 5AQFA 1Z05A 3CETA 2P9SB 5AQRA 1GLEG 4BRIA 5BN8A 3EO3A 3VPZA 2VYPA 4EHUA 3WQTA 2Q1NA 3DWLA 4HTLA 1BO5O 2ASPA 5AQYA 3QDKA 2E1YA 5KPRA 1NGEA 1LCUA 4GY2B 5AQNA 3S41A 2H3GX 3CQXA 3FZFA 3L4IA 3GG4A 5I9EB 1GLFO 4DQ8A 5E84A 3VEYA 2CH6A 1GLDG 1RDWX 1U2VA 2I7NA 2QWQA 3AY9A 2P9KA 4FWMA 3SMSA 3ATVA 3VEOA 4JHDB 5LY3A 1NLVA 1S3XA 4KBOA 2Q31A 3VEZA 4ISFA 4A2AA 4IJNA 1HKBA 5AZIA 3ULEB 2J4RA 3VOVA 3IUCA 2P9NA 3IDHA 2Q2RA 3RSEB 3LL3A 2ITMA 4YDUC 1LOTB 2GWKA 3DXMB 2CGKA 5KPZA 1TUUA 3ZX0A 4ISGA 3VETA 3FZKA 4I6MB 4BRMA 2P9IB 4BRDA 2FF3B 1G99A 3SLCA 5EY4A 3BP8A 1NBWA 2ZF5O 3AAQA 3MCPA 3A5LC 1BUPA 4FWRA 1YAGA 4QS7A 3CJ7A 1NGHA 3LDQA 3ATUA 5BRDA 1K8KA 3CHWA 5CE3A 5AQTA 2E20A 2ASMA 3WEEB 1X9JA 4CD3A 4M7XA 2A41A 2IVPA 2ZGZA 1TYQA 4FWPA 1GLLO 4BRLA 4FSVA 3W0LA 1NWKA 1YXQA 3O6WA 3WXLA 4Z94A 5BPLA 3D2EA 3HBTA 2F9TA 2GELA 3VF2A 3C7NA 4BRAA 3UE5A 4BR4A 3QB0A 2QWOA 3MMVA 1C0FA 4WQ4A 5BRHA 4WQ4C 2ZWHA 3CERA 4BRHA 4IXCA 2QM1A 2YJEA 3FFKB 5B8HA 5F0XA 1EQYA 3O1BA 5AQPA 1S22A 5JMVA 3SK3A 3LDLA 3SMPA 3WQUA 3VGLA 3H3OB 5ELZA 1E4FT 5AQOA 3EN9A 1U2VB 3U9DA 1DEJA 2P9KB 3H3NO 3UKRA 1R59O 3HM8A 2NLXA 3W3DA 2I7PA 3F9MA 4F9OA 5AQMA 2QXLA 5JLFA 2PAVA 4CZIA 2E88A 4BR9A 4QS9A 5AZIB 4CZGA 1SZ2A 2DPNA 1IJJA 2CGJA 2P9NB 3WXIA 3OHRA 2E2PA 3LM2A 4AM7A 1Q18A 1TUYA 4K41A 4CBWA 4H5WA 4BR7A 3VF6A 3CJCA 3ZETA 2QW9A 1NGFA 4E1JA 2E2QA 4CZJA 2IVNA 1HX1A 1MWKA 3QBXA 3SJHA 4BRFA 4O8KA 5AFUH 2P9PA 2QWMA 4MO5A 3IMXA 2NRHA 1K8KB 4BRGA 3HZ6A 1NMDA 2VWBA 1ZXOA 2WUSA 3A5MC 3WUHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4A5BA 4CJSA 1RDAA 3VQ4A 2X74A 1TK8A 3CIPA 2HBJA 3K59A 3UKUB 1NGGA 4Z4CA 2HB5A 2W6KA 3OJSA 3VQ6A 4KHWA 3ZX3A 3O9SA 3HVRA 2RE2A 4CHPA 1S6PA 4AHCA 1C0TA 1ZBFA 4R5PA 3AGKA 3FGUA 1YT3A 5CY4A 4IFVA 1N33K 4CIFA 3IS9A 5BREA 4KHPK 1TGOA 1W9HA 2Z1HA 2P9UA 3QO9A 3VENA 5DM7L 1T6CA 4CEDA 5AQUA 4CEOA 3ITHA 1NGDA 2BDPA 1BU6O 4XEIA 3AO4A 4KTQA 3SZ2A 1Z26A 3MXJA 4O4GA 3TABA 1TAUA 5TKYA 1ZBSA 2FF6A 3TSPA 3OYGA 2YNGA 1S5JA 1SKWA 4DG1A 3ENHA 4MO4A 1VRTA 4BG8A 5LJWA 4H5RA 3TAGA 4CF1A 5T7BA 4Z4GA 4K8XA 3CF5L 4DF8A 3THXA 4LF7K 4JI5K 1VSIA 1HJOA 1D4XA 4KHNA 4DQSA 4JKAA 2E8AA 3MN9A 3JYTA 3L2QA 3OYMA 3CC2N 1V4TA 1NOYA 3AVAA 5FDLA 2I5JA 2KLAA 1XC9A 4FVUA 4CD1A 1SQKA 3ID8A 1BIZA 2ZJRL 2OYQA 1VSKA 1JLFA 4ID5A 3DAWA 1I39A 1WLJA 3EKUA 5KQ8A 1OKJA 4LF4K 2ZGYA 4CJQA 2GUPA 3FZLA 3DLLL 4LH5A 3OYCA 3FZMA 4X64K 1HKGA 4CGFA 5C25A 3VA3A 4OLBA 1NK9A 4IEIA 3SBGA 4DV6K 3TARA 4OPHA 4BVOA 1ATSA 2P51A 2D0AA 3D0PA 4E7LA 1C0MA 1MDUB 3AVBA 5ADXA 3LP0A 3M8QA 3THWA 1KVCA 3J81O 1KCFA 4OJRA 1HKCA 4BRCA 3M6GA 4GMJB 4DR4K 1SAZA 1NU0A 1KVBA 1MA9B 3K9JA 4H0OA 3M5RA 1WBDA 1IG8A 1RILA 2IIRA 1ASUA 4CJ4A 5SZTA 4BR5A 3PX0A 1C0GA 3IFRA 2VGMA 4X65K 3O3HA 2B5JA 5M1QA 3ASMA 4BE1A 4F2RA 4DR6K 4FWSA 4JYAK 5GAEP 4PY5A 4ZTJA 1X3MA 1ZC6A 3V6DA 1W7AA 2E1ZA 4PL7A 3C6AA 4JEPA 1J5OA 4WYBA 1RTIA 5F1XA 1JLGA 5FROA 1H1VA 4M3RA 1CZBA 1YVNA 4CEAA 4DSKA 1IKXA 1BIUA 4CGDA 5J2NA 3LM9A 3WNEA 1U6ZA 4H0PA 4B9QA 3PO5A 3L0QA 4I2QA 4H0YB 2O4IA 5M1FA 4BRKA 2RN2A 1QQNA 1L3SA 1NK5A 4K42A 1HLUA 5KGWA 4NCBA 1GLBG 2LSNA 3VESA 3NBPA 1J53A 1RT4A 4ID1A 4PKIA 4B1XB 2R7YA 4CZFA 2D0OA 3VEXA 3A0IX 5BPNA 3V81A 4OO1J 4KTZA 4KH6A 3V9XA 3DYAA 1TK5A 4CEBA 4BDZA 2A42A 4KHQA 2D0PA 4E1NA 2VG6A 2OANA 3MDQA 4B1YB 1VSJA 3WXKA 5FPDA 2OCEA 1XI1A 3K9KA 4J8FA 4BRPA 2FSKA 4FM1A 3RVCA 1WSEA 2WONA 1V4SA 4JRQA 2ITGA 3OYEA 3RRHA 4PKGA 4PKHA 1J9AA 2HNYA 3SQ0A 4BC3A 1I3AA 3AAPA 5LL6Z 1VRUA 4CJ7A 3KLHA 1J5EK 2X78A 3UKUA 1EP4A 4CHOA 5EXWA 2FSNA 3ALYA 4E3SA 3DMJA 4DTNA 1VQMN 4IDKA 1IH7A 1X3NA 4H5TA 4AHVA 3SUQA 4BC4A 3H45C 5KRSA 1GLJO 1LWCA 4H0TB 3RMAA 3KK1A 3ENBA 4CEZA 5GADP 4FJHA 2UXCK 1CZ9A 2OPRA 3ULEA 2G8UA 3G4SN 2O8BA 3BEXA 2Y1IA 4O8UA 1DLOA 3VQQA 1S9EA 4AHTA 3HVTA 4JS4A 1NKCA 1M1KO 4V19S 4JKCA 4W5OA 3SV3A 4DQRA 3TAQA 1UA1A 1U49A 1TL1A 1QZ5A 4M7YA 2HSTA 1ZBUA 1S1WA 3GL1A 4LFAK 2XY7A 2ZJPL 2E4LA 4CZHA 3L4QA 1KAYA 4CHYA 1NK4A 5EX5A 5HROA 1WN7A 4DSFA 1VSMA 1VQLN 4CFBA 4OPJA 3T1HK 1B9DA 3MN7A 1Q9XA 2P9SB 3KTQA 2Z1GA 3I0SA 5CYMA 4U7BA 3I56N 3QNNA 5BN8A 4FW2A 4EHUA 1VQ7N 2Q1NA 5C12A 3HP6A 3CCQN 2O8EB 3AA4A 1ZBIA 1JL2A 5C10A 3HJFA 2E1YA 3ZLJA 4TSXA 2WFBA 4FJGA 1LCUA 1RBRA 4Z4HA 3CQXA 3L4IA 3GG4A 1GLFO 4CJFA 4DFMA 1U2VA 2QWQA 2P9KA 4KB0A 1WSGA 3NMUA 1GOAA 2YHAA 1NLVA 3VEZA 4ISFA 4A2AA 4QOZB 4LH4A 3QEXA 2OPQA 2Q3SA 1N34K 4FLTA 1JLBA 3RTVA 2GWKA 1F21A 3DXMB 3V9WA 1TUUA 1LAVA 4FLUA 1N36K 1G99A 1RBSA 3VN5A 3MCPA 1ZYQA 1YAGA 3CJ7A 3KLEA 3LDQA 4WE1A 1S1VA 4HCCA 1SUQA 1R0AA 4BDYA 1TKZA 3L3UA 3CM6A 3WEEB 4OKKA 2QTDA 1HR0K 1X9JA 2A41A 2ZGZA 1EXQA 2VWJA 4NLBA 4FK0A 1A5VA 4B9UA 3O6WA 3PUFA 4AILC 3C7NA 4KREA 3UE5A 1NKEA 3QB0A 3OYIA 3KK7A 4CJTA 2ZWHA 1K8AO 1C6VA 3CERA 4BRHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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