4HTLA

Lmo2764 protein, a putative n-acetylmannosamine kinase, from listeria monocytogenes
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
MKIAAFDIGGTALKMGVVLPHGEIILTKSAEISGSDGDQILAEMKVFLAENTDVTGIAVSAPGYVNPKTGLITMGGAIRRFDNFNLKEWLEAETGLPVAIENDANCALLAEKWLGKGQDLDDFLCLTIGTGIGGGIFSNGELVRGGRFRAGEFGYMFSERPGAFRPGKYTLNETTTMLVLRRQYAELTGRPLEEITGEEIFANYDAHDAVSERLITEFYTGICTGLYNLIYLFDPTHIFIGGGITSRPTFIAELKHHMESFGLRDTIIETATHKNQAGLLGAVYHFLQEEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Lmo2764 protein, a putative N-acetylmannosamine kinase, from Listeria monocytogenes.
rcsb
molecule keywords Beta-glucoside kinase
source organism Listeria monocytogenes
molecule tags Transferase
total genus 92
structure length 291
sequence length 291
ec nomenclature ec 2.7.1.85: Beta-glucoside kinase.
pdb deposition date 2012-11-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA01
2NRHA 1NGCA 1OKJA 1YVNA 4FL9A 1KAZA 5AZJA 2D0PA 1ATRA 1JCGA 1U6ZA 4C23A 3CI5A 2I7NA 2CGKA 4CZLA 2FLOA 3UKUB 4BRKA 4DQ8A 4RWTA 4BRNA 3CJ7A 2GEMA 4YDUA 4CZEA 1QQNA 2QWLA 2ZGYA 4H5VA 3U4LA 2DPNA 1LCUA 4BR4A 1H1VA 3FZKA 4BRLA 2NLXA 4I6MB 3LDNA 4L3QA 1X3MA 4CZHA 4ISEA 5BN9A 1LOTB 4BC4A 3HZ6A 5EX5A 4BRPA 4EHTA 1NGBA 2GTDA 5AQYA 1HKGA 3D2EA 4QS9A 3R8EA 4DB3A 4CBWA 2IVPA 3C7NB 2IVNA 1V4TA 4BVOA 4GNIA 4Z94A 1KAYA 2QWPA 1TYQA 2P9UB 2E20A 3W0LA 4BR9A 4BG9A 5BRDA 1XUPO 3CQXA 2V7YA 3CIPA 3H1QA 3VOVA 4EIAA 1X9JA 3WQUA 3VGMA 3BUZB 4XH4A 3VEXA 1QQMA 3VEYA 2HF3A 3IUCA 3ZX0A 3M6GA 2YHXA 1NWKA 1RDWX 2E1YA 5AQRA 5AZJB 3VF4A 3VPZA 5KPRA 3MMVA 1U2VA 4B1YB 3OHRA 5AQLA 2GWKA 3HSCA 3D2FA 4RTFD 4M63C 1WOQA 1K8KA 1MDUB 2A3ZA 4RCHA 4MLHA 4QS7A 2A6AA 4HTLA 4IXCA 4M7YA 4BVPA 5AQFA 2P9PA 3DWLA 1V4SA 1Z6RA 4H0YB 2Q31A 3CERA 4J8FA 2FF6A 1X3NA 5ADXH 4DCHA 3CJBA 3O80A 4CBXA 4BRGA 4BRCA 3MN6A 3CQYA 4JAXA 4ISFA 1GLEG 3VERA 2HOEA 3H3NO 3JXUA 3LM2A 3VF6A 5BRHA 4NO7A 2P9LA 2ITMA 5F1XA 3TU5A 4CZKA 3D2EB 3ZEUA 1S22A 3LM9A 1BWFO 2FF3B 2CH5A 3CETA 4B9QA 5AQZA 1NLVA 3IMXA 4FPBA 2ASOA 1S3XA 3SMSA 2P9NA 4XH5A 1NMDA 3SLCA 4EFHA 2IVOA 5BPMA 3AARA 3VF2A 4JN4A 4AM7A 2E1ZA 1TYQB 3H46O 4AM6A 2QWRA 1ATSA 1DEJA 1HLUA 4IJAA 1J6ZA 4WQ5C 3QBWA 4A61A 4O5FA 3LDQA 3UE5A 4H03B 3QMLA 3O08A 3ENHA 1NM1A 3VEWA 1YXQA 2IIRA 2E2QA 3GG4A 4H0OA 4FWRA 4FWPA 4A62A 1SZ2A 4ISGA 3L4IA 3L0QA 3WEEA 2CGJA 2ZWHA 3EKSA 1U2VB 2HMPA 3VEOA 5EVZA 1NGFA 1GLAG 3D2FB 4JHDA 2Q97A 5E84A 4B1VA 3JS6A 1HKBA 2ASPA 3D7EO 3ATVA 3SMPA 4B1XB 2WUSA 3W3DA 3IFRA 2F9WA 5AQHA 5AQSA 3HI0A 1BA0A 5AQIA 1XQSC 5AQMA 5LJVA 4H5WA 3S41A 3KZBA 5JLFA 1BG3A 2E2OA 1CZAN 2A42A 2AA4A 5JLHA 3FR0A 1QHAA 4CZJA 5EY4A 3ZEUB 3O5BA 3VGKA 4BRHA 5BPLA 2A40A 1QZ5A 5LY3A 3IDHA 5AQJA 3WXKA 5AZIA 4XH1A 1NGEA 4CZGA 4GY2B 5F2RA 2P9NB 3TPQA 4H5NA 3G25A 2VWBA 3U9ZA 5AQNA 2ASMA 3CJ1A 2UYTA 2V52B 4BRDA 4IWVA 3FZHA 1T6DA 1GLCG 1HX1A 1Z05A 4H0PA 3A0IX 2A5XA 1HJOA 1WUAA 3ATUA 3FE1A 1GLFO 5ADXA 3U9DA 2YI1A 3GDQA 4B1ZA 2QWQA 1BU6O 4M7XA 2BUPA 3UB5A 3VESA 4B1UB 4MO5A 1HUXA 3WEEB 5KPZA 3WT0A 5AQWA 2V7ZA 3AAPA 2HF4A 3BEXA 4JHDB 2FXUA 4EHUA 4FWOA 4CJ7A 2E2PA 3WXJA 2QWNA 2P9IA 2BTFA 2P9SA 5BPNA 2QW9A 3BP8A 3O1BA 3O6WA 1ESVA 3RSEA 4K25A 4BRAA 3FLCO 3DJCA 2Q2RA 3WXLA 2YHYA 3AY9A 1D4XA 5BR9A 4YDUC 4BR2A 2QWMA 4NB4A 1TUYA 3WUHA 3KVGA 4CI6A 1EQYA 3GOIA 3FZLA 1SQKA 3B8AX 3ULEA 4E1JA 2FSJA 2Q0RA 1E4GT 4FSVA 2E88A 5E26A 3P4IA 1NGAA 5AQXA 5I9EB 2FSKA 3DXMA 5AFUH 1DKGD 5AZIB 3LDOA 4B1WB 4HWIA 1P8ZA 1BUPA 4BRFA 4H5RA 1E4FT 3HBTA 3DXKA 3F9MA 4CZFA 4CZIA 2QWOA 3EL2A 4BGAA 2YJEA 4FWMA 2J4RA 5CE3A 3A5NC 3A5LC 1JCFA 3O4WA 3DAWA 3FFKB 3VGLA 4BR0A 1MWMA 2E2NA 3GE1A 1IG8A 5F0XA 2E8AA 5FPNA 4PKGA 5KQ8A 1GLDG 5JICA 3UKRA 4MO4A 4CD3A 4LC9B 1YAGA 3VEVA 4BC5A 4QS8A 3C0BA 1YUWA 5FPEA 1NBWA 2FSNA 3VETA 1K8KB 5LJWA 4BREA 3CHWA 2F9TA 2P9IB 3LDPA 2NZTA 2P9SB 1BA1A 2P9PB 1XC3A 1KAXA 3H3OB 1BOTO 4BG8A 5AQVA 4BC3A 1IJJA 3RSEB 4PL8A 3O1WA 3QB0A 4DHYA 1NGHA 2W40A 3AAQA 4EAHD 1T44A 3ZX2A 3LL3A 2P9LB 1ZC6A 4FWNA 2KHOA 3U8XA 5AQTA 3SK3A 2YHWA 2CH6A 3ULEB 4BRIA 4MLEA 3EKUA 4JNEA 4FOEA 3CJCA 3DXMB 3A5MC 1MA9B 4BR5A 4CBUA 3J8AA 1Y64A 4CZMA 2H3GX 4BGBA 4BQLA 4K41A 1SAZA 4H5TA 4IJNA 3SJHA 2P9KA 5BREA 3DXKB 3R6MA 3ID8A 1C0FA 1KXPA 2OANA 3CJ9A 5EXWA 1ZXOA 3ZETA 5AQUA 1GLLO 3WXIA 3EN9A 2GWJA 2I7PA 3M3ZA 2GELA 3EO3A 2QXLA 3O8MA 3MDQA 3VENA 2D1KA 1MWKA 3M1FA 3QFPA 3QICA 1JCEA 4WQ5A 5ELZA 3UKRB 4WQ4C 4FWLA 4FPAA 5AFUA 4O8KA 4PKHA 2Q36A 1TUUA 3QDKA 1QZ6A 1Q18A 2Q0UA 5FPDA 3QBXA 1ZBSA 2D4WA 2QM1A 3ENOA 4JD2A 2PAVA 3R9PA 3VEZA 5KQDA 3A8YA 5AQGA 3L6QA 2VYPA 2A41A 4IO8A 5AQQA 4BC2A 3I33A 4K43A 4F9OA 5BRFA 5B8HA 4BRQA 4K42A 3MCPA 3MK6A 1HPMA 2Q1NA 3UKUA 4H0XB 4BROA 2V51B 3HTVA 4Y0WA 5FPMA 1NGGA 4WYBA 4BQZA 5AR0A 3A5OC 2YJFA 1ATNA 4PKIA 5AQOA 1RGIA 3FGUA 2P9KB 3KHYA 4KBOA 3BF1A 4FWQA 3GL1A 4FWKA 1C0GA 1GLBG 3CJAA 4H0TB 3FZFA 3ZETB 4I6MA 1G99A 3HM8A 1R59O 2ZGZA 2GUPA 3H45C 4BRMA 5KPTA 3MN9A 2PBDA 1HKCA 3FZMA 2CGLA 4BR7A 3EZWA 2VCPA 3GBTA 2YCHA 3C7NA 4H0VB 3H1VX 4XEIA 1NGDA 5AQKA 5BN8A 1BO5O 3QFUA 1BDGA 2W41A 2EWSA 3LDLA 5TKYA 2P9UA 3ZX3A 1NGIA 5JMVA 3H6EA 1NGJA 4FOIA 5EOYA 1DGKN 4A2AA 3BF3A 2ZF5O 1GLJO 2AP1A 2D0OA 1RFQA 4FO0A 3MN7A 4IZ9A 5AQPA 4PL7A 4JD2B 4A2BA 4WQ4A 3WQTA 1QQOA 4FWSA 4CD1A 3I8BA 3MN5A 1T6CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QNNA 4HUFA 3ZYYX 1ATRA 1JJ2M 3DLGA 4E7HA 3HRGA 1QE1A 4GVMA 3LP1A 1LWEA 4LF9K 3HXMA 4OGEA 3S9HA 4H5VA 4BR4A 3KD5E 4BRLA 2IOCA 3BY5A 4I6MB 3LDNA 4L3QA 4ISEA 4KPYA 3VQ4A 4EHTA 5M1QA 1X9WA 3HT3A 1HKGA 4JS4A 3KWIA 3ASMA 3DOKA 4CBWA 1C1CA 4U7BA 1RT2A 3OY9A 1KAYA 3OYCA 4ELUA 1TYQA 4OJRA 1RBUA 3OYLA 3HJFA 1XUPO 3CQXA 2V7YA 3AVGA 3D45A 3VOVA 5GAGP 4IKFA 3VGMA 3THXB 4C1NK 3BUZB 4XH4A 3VEXA 3WNHA 5JS2A 4CHOA 4IO9L 2VGMA 2O8BB 3M6GA 3MXIA 1EWQA 2YHXA 1WSJA 5AZJB 5AQRA 3NCIA 3VPZA 2QXFA 5KPRA 2KTQA 4B1YB 3E9PA 2GWKA 5HRPA 1WOQA 4RCHA 2OPRA 3L3VA 1T7PA 2A6AA 3R1XA 4BVPA 3MXJA 4CECA 2P9PA 1T8EA 3DWLA 1HNWK 3CC4N 4H0YB 3SBTA 1X3NA 1VRTA 4CEAA 3CJBA 3MN6A 1RILA 4DUYK 3U3GA 3VERA 2HOEA 5BRHA 3MEEA 4NO7A 4YOUA 2FBTA 4NXNK 3IG1A 1BWFO 2NRVA 4A5AA 3M8RA 1VQKN 4I7FA 5AQZA 5M1KA 3IMXA 4FPBA 4M41A 1JLEA 4NYFA 1S3XA 3K59A 3KJVA 3SLCA 1NMDA 4EFHA 1IH7A 3OYFA 3AARA 1TAUA 1JLQA 2RE2A 3HSTB 4AM7A 1LAVA 3HYFA 1ATSA 3QBWA 2VGNA 4E89A 1D8YA 4ZTFA 3T7ZA 1RTIA 4B3TK 3UE5A 4JI8K 4H03B 2UUBK 4FWPA 2XY5A 4KKOA 2CGJA 1A5WA 4CGIA 3VQ9A 2ITGA 4JK8A 4BWMA 3RMCA 1NGFA 4B1VA 1SKRA 1HKBA 1YF5L 1YTUA 2F9WA 4DU4A 5AQSA 4YOWA 1A5XA 2JGUA 1TKTA 3C6UA 5AQMA 3KKSA 2O4IA 3OYAA 1BG3A 3CC7N 1XHZA 4DSIA 1RBRA 4KAZA 4N5SA 5EY4A 4IEEA 2WTUA 5CYMA 3ZEUB 3O5BA 3VGKA 5BPLA 1QZ5A 3OYHA 1C1BA 5AQJA 4WFBL 4GY2B 2P9NB 4KTWA 4H5NA 5AQNA 4EZ6A 1U4BA 2VWKA 3CJ1A 1LWCA 1SL0A 3KLEA 3FZHA 1T6DA 1GLCG 2PFUA 1VQ6N 5GIOA 1YT3A 2OTJN 1ASVA 1Q9XA 2A5XA 5AJ3K 5C42A 1XHXA 4AHUA 4CJLA 3LPTA 4B1ZA 4KH5A 1IG9A 2BUPA 4B3OA 3EY1A 4DTUA 1HUXA 3ZT0A 2HF4A 1RT6A 4JHDB 4FWOA 4CHQA 3TANA 1O1WA 3ZSYA 2P9SA 5CY4A 5JVGL 5BPNA 3SQ2A 1W9HA 3O6WA 1UAXA 2ZJQL 4K25A 3JAMO 3FLCO 2QEXN 4DTSA 4IEIA 3WXLA 2QWMA 3WUHA 3GOIA 3R3LA 1TKZA 1SQKA 3L2QA 1LW2A 4FSVA 5I9EB 3AGRA 2HBLA 1XMOK 1BIUA 3BGRA 1EO1A 3AVAA 3RVCA 1VQLN 1P8ZA 1BUPA 1QS4A 4BRFA 4N47A 4H5RA 1VQPN 4FJNA 4CZIA 1KVAA 3EL2A 4BGAA 1P90A 2RN2A 2J4RA 5CE3A 3A5NC 3TTDA 3A5LC 1ILYA 3ZSXA 1J5EK 1S9GA 3FFKB 4BR0A 1CZ9A 3SYZA 2IS3A 4FCYA 1GLDG 3ZSVA 3UKRA 4R5PA 4AILC 4WF9L 1BL3A 3SQ0A 4BE2A 1YUWA 5LJWA 2E4LA 4BREA 2NZTA 2P9PB 3G0ZA 3VN5A 1KAXA 1LAWA 5AQVA 1IJJA 4PY5A 4CJ4A 2ZE2A 5C2FA 3O1WA 3TARA 1NGHA 4AQYK 4PUOA 1RT4A 2KHOA 3MEGA 4KFBA 2IDOA 4FOEA 4DQRA 1MA9B 3V1RA 2XY6A 3V9ZA 3L2WA 1NK4A 1VSMA 4K41A 3DRPA 3SJHA 3DXKB 4FJ7A 2HNYA 2NUBA 3EN9A 2GWJA 1CXUA 2I7PA 2A1RA 2RF2A 4M45A 4YOXA 2G8FA 2PZSA 3EO3A 5KI6A 3LDSA 3MDQA 3S3OA 1X1PA 3U3YA 3QICA 4CJPA 3OYBA 2YV0X 2D0AA 3E01A 3OVNA 3M8PA 4WQ4C 4FWLA 3O3FA 4FPAA 4H8KA 5AFUA 3AVNA 3ZT3A 4O8KA 1OVQA 2Z1IA 2Q36A 4LFBK 1YI2N 4KHPK 1Q18A 4WE1A 1JL1A 3PIPL 4DTPA 2D4WA 1BCOA 2QA4N 3R9PA 4CJTA 3TR8A 4DWIA 3L6QA 1TL1A 3OYGA 2A41A 1WN7A 3EEQA 4HCBA 5B8HA 4DR5K 4M3WA 1RDAA 1KVCA 4UQGA 3KIOA 4NYNA 4BROA 5FPMA 3SNNA 1Z25A 4YOTA 4JKAA 4CIFA 5IT9O 5HROA 2HNDA 4JKCA 4DF8A 3A5OC 2YJFA 3O3HA 5EU7A 1ATNA 4GKJK 1RDUA 2P9KB 3ZT4A 3V1OA 3C65A 2ZD1A 4KI4A 5T7BA 4O0IA 4I6MA 5M1PA 4B3RK 3NGZA 2KFNA 3VQCA 2D5RA 3DRSA 4BRMA 4YORA 3SV3A 3AVHA 3OYMA 1HKCA 2GV9A 3HP9A 4LF5K 2VCPA 3GBTA 1NOYA 1RDBA 4LSNA 4F4KA 4KHUA 3CCRN 1Q8IA 4H0VB 1BQNA 4G9ZA 3KLGA 4B9VA 1EETA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4BC2 A;  1YTA A;  1RT5 A;  4DF4 A;  3SV4 A;  1WSH A;  1HNV A;  1HRH A;  4MDA A;  3MCP A;  4YY3 K;  1JLF A;  3TSQ A;  2Q1N A;  4K8X A;  4H0X B;  1ZYQ A;  2V51 B;  5HOO A;  2DFE A;  4Y0W A;  1NGG A;  4BQZ A;  4CK3 A;  1FW6 A;  4PKI A;  3KHY A;  4KBO A;  4FWQ A;  4FM0 A;  1GLB G;  3DLE A;  4DR7 K;  5HL7 L;  1R59 O;  2ZGZ A;  2WBN A;  4ELV A;  2GUP A;  4KB0 A;  4CJR A;  4O44 A;  3NF7 A;  3CFR A;  2PBD A;  4BR7 A;  3THW A;  4F2R A;  4I9L A;  3QO9 A;  1E3M A;  3PX0 A;  2YCH A;  3C7N A;  3CD6 N;  4XEI A;  1NGD A;  2Z1J A;  5LL6 Z;  1IO2 A;  1ZBH A;  5AQK A;  3QFU A;  4DFP A;  4CW7 B;  3LDL A;  5HLF A;  5TKY A;  2Z1G A;  4N41 A;  5JMV A;  1IKW A;  1JKH A;  3H6E A;  3T1A A;  1NGJ A;  4FOI A;  4A2A A;  3BF3 A;  3CFO A;  3G6E N;  1OH7 A;  1BGX T;  2D0O A;  4IZ9 A;  5AQP A;  4PL7 A;  1SL2 A;  3PLA A;  4WQ4 A;  1VRU A;  3WQT A;  1FKP A;  4HVJ A;  1BCM A;  3K9K A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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