4HTLA

Lmo2764 protein, a putative n-acetylmannosamine kinase, from listeria monocytogenes
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
MKIAAFDIGGTALKMGVVLPHGEIILTKSAEISGSDGDQILAEMKVFLAENTDVTGIAVSAPGYVNPKTGLITMGGAIRRFDNFNLKEWLEAETGLPVAIENDANCALLAEKWLGKGQDLDDFLCLTIGTGIGGGIFSNGELVRGGRFRAGEFGYMFSERPGAFRPGKYTLNETTTMLVLRRQYAELTGRPLEEITGEEIFANYDAHDAVSERLITEFYTGICTGLYNLIYLFDPTHIFIGGGITSRPTFIAELKHHMESFGLRDTIIETATHKNQAGLLGAVYHFLQEEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Lmo2764 protein, a putative N-acetylmannosamine kinase, from Listeria monocytogenes.
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Listeria monocytogenes
molecule keywords Beta-glucoside kinase
total genus 92
structure length 291
sequence length 291
ec nomenclature ec 2.7.1.85: Beta-glucoside kinase.
pdb deposition date 2012-11-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4htlA01
2GTDA 2CGLA 3FE1A 4BRNA 4FWOA 4CD3A 3CI5A 2E2NA 4H0YB 5BPMA 2A42A 3UKRB 4BQZA 5JLHA 2P9PB 1DGKN 3CERA 4B1VA 3CQXA 4ISGA 1EQYA 5BREA 3KZBA 3VOVA 2V52B 3HM8A 3W0LA 4JHDB 5AQRA 4FWQA 1BDGA 4CJ7A 1SQKA 3L0QA 1KAYA 3D2EB 3LDPA 3IMXA 3O4WA 3VEXA 3ULEA 5KQDA 2YJFA 3A5OC 3QDKA 2YHYA 3EKSA 4QS9A 2IIRA 1NGIA 1X3MA 3P4IA 3FLCO 4M7XA 2W40A 4CBWA 3O6WA 3LDLA 3L6QA 1QQNA 2CH6A 4YDUC 4HWIA 3VPZA 3WUHA 1GLJO 5AR0A 4BRMA 5B8HA 3D2FB 2P9UB 1Z05A 3BF1A 3VEWA 4FOEA 3UKUB 3VF4A 1K8KB 3HZ6A 3LDNA 4BVOA 1YVNA 3GE1A 3VERA 2D0OA 4L3QA 3I8BA 3FZKA 2ZF5O 3QBWA 4FWRA 3W3DA 5AQYA 3QB0A 5F2RA 4FPAA 4K25A 3SMPA 3G25A 2OANA 5LJWA 5BN8A 3QFPA 2E20A 5AQTA 4GY2B 3EL2A 1NGJA 4FSVA 4NO7A 2A3ZA 4BQLA 4B1YB 4EFHA 4ISEA 3WXKA 3ZETA 5AFUA 3B8AX 3A5LC 1ATNA 1J6ZA 4I6MA 5FPNA 3S41A 4BRDA 1TUUA 4CZMA 2Q0RA 4BR7A 2E1ZA 5KPZA 2ZGYA 3O1BA 3VESA 2D4WA 3CJCA 3KVGA 4CBXA 1U2VA 4H0PA 4WQ4A 5AQQA 4BRLA 1CZAN 1KAXA 2E1YA 2VYPA 3GDQA 3O08A 1NM1A 2VCPA 5AQZA 3H45C 3EZWA 3IFRA 2QWPA 3FZMA 5FPDA 3R8EA 3DJCA 3WXJA 3OHRA 5AQPA 3U9DA 2QWOA 3EN9A 3CETA 1QQMA 4PKHA 1BO5O 3MN7A 3QBXA 1GLEG 1IJJA 4NB4A 4YDUA 1MWKA 2FF3B 4O5FA 4BR4A 3A5MC 5BR9A 1HPMA 1MDUB 2CGKA 3JXUA 1Y64A 4B1UB 4RCHA 2D1KA 4K41A 2PBDA 4FPBA 4IJAA 2VWBA 1BOTO 5AQMA 4BG9A 1Z6RA 2P9UA 3A0IX 3WT0A 3UKUA 5ADXH 1HLUA 1K8KA 3GL1A 1QHAA 3TPQA 3EKUA 1XC3A 5AQFA 4FWSA 1C0FA 4KBOA 1MA9B 2NZTA 2QWQA 2P9LA 2ZWHA 4PKGA 3ZX2A 3C7NA 1G99A 2QWNA 3VGMA 3CJ9A 2P9SB 2F9WA 2H3GX 4WQ4C 1GLFO 1HKCA 2YHWA 3WQTA 3HSCA 3AAPA 1BUPA 1U6ZA 1YXQA 5TKYA 3CJAA 4H5VA 5AQGA 1NBWA 4BC4A 4DQ8A 3MK6A 3SJHA 3BP8A 4ISFA 2NRHA 3CJ1A 5LY3A 5AQHA 4DB3A 2E88A 5EX5A 1X9JA 4DHYA 2F9TA 2IVPA 2GEMA 2E2QA 3L4IA 5KPTA 3CIPA 3GG4A 1GLBG 1NLVA 2QWRA 3TU5A 1R59O 2HF4A 5AZJA 4H0OA 2ASPA 4H5NA 3DWLA 1JCEA 1YUWA 2QM1A 2AA4A 2YCHA 4BRFA 3MN6A 4JD2A 4CZFA 4BRQA 4BR9A 1MWMA 2FXUA 4IO8A 5JICA 1KXPA 4H0VB 4EAHD 4EIAA 2GWJA 4PKIA 2P9NA 2P9IB 4BR2A 2I7PA 1JCGA 1XUPO 1NGGA 3D7EO 3MMVA 3MCPA 3WEEB 2QW9A 3FGUA 5AQWA 3LL3A 4BRHA 4WYBA 1OKJA 2PAVA 3DXMA 4IJNA 2HF3A 4CD1A 5CE3A 3VGKA 3VEZA 3R9PA 2E2PA 3ZX3A 4BG8A 2FLOA 3RSEB 3UB5A 5KPRA 3SMSA 3UKRA 2Q2RA 1YAGA 2P9PA 4CZJA 5ELZA 1IG8A 1SZ2A 3SK3A 3AY9A 4CZEA 1HKBA 1GLAG 4H5RA 1S3XA 4MO5A 5BPLA 3ULEB 3MDQA 3FZHA 4BRGA 3O1WA 5JMVA 5EY4A 3CJ7A 4JNEA 1E4GT 2ASMA 4H5WA 4JHDA 4A2AA 4XH4A 4QS8A 1P8ZA 4IWVA 2NLXA 3D2EA 3FZLA 1HX1A 2FSKA 3R6MA 4AM7A 3O80A 4CZIA 1BA1A 1Q18A 3M6GA 1T6CA 2KHOA 1ZC6A 2W41A 2GWKA 5BRFA 4BGBA 5KQ8A 3GOIA 4IZ9A 4WQ5C 4CZHA 4A61A 1LCUA 1BG3A 3D2FA 1ATRA 3O8MA 2EWSA 2UYTA 5JLFA 3VETA 1GLCG 4M63C 3HTVA 4RWTA 5AQSA 3VF6A 4GNIA 2HOEA 3FZFA 5AQUA 3ENHA 2Q97A 3LM9A 2A5XA 2P9KB 3WXLA 3U8XA 4BRKA 4FWMA 3ZX0A 5AQLA 4XEIA 1RDWX 1V4TA 2FSJA 3ZEUB 3C0BA 3CHWA 3H46O 2E8AA 3O5BA 3VF2A 4BREA 3KHYA 3LM2A 4BRAA 4BC3A 2P9IA 5AQKA 3H3OB 1BA0A 4FWKA 1GLDG 4I6MB 3CQYA 5AZIB 3UE5A 2V7YA 3ATUA 3VENA 3WEEA 4FOIA 1C0GA 4BR5A 1TUYA 4IXCA 1WOQA 2Q0UA 1T44A 3FFKB 4C23A 2ZGZA 4QS7A 1U2VB 3QICA 4O8KA 4DCHA 2YHXA 4Z94A 4H0TB 3FR0A 2WUSA 3RSEA 1WUAA 2V7ZA 3SLCA 4BGAA 4BRCA 3BUZB 3VEOA 2YI1A 4MLEA 5E26A 3M3ZA 3DXKB 3IDHA 3U9ZA 5LJVA 1NGDA 4JN4A 2QXLA 1NGHA 2D0PA 5EOYA 1NGFA 5E84A 1RFQA 1ZBSA 3F9MA 5AQVA 3IUCA 4BVPA 4A62A 1HUXA 4E1JA 5EVZA 1QZ6A 1BU6O 3LDOA 2BUPA 2ASOA 4FWNA 5AQOA 4BC2A 3BF3A 1TYQB 4FL9A 3AARA 2AP1A 1NGBA 4FWLA 2YJEA 4WQ5A 3H3NO 1T6DA 4CI6A 2IVOA 1DKGD 3WQUA 4CBUA 2J4RA 3JS6A 4HTLA 1X3NA 4XH5A 4MLHA 3ATVA 4CZGA 1QQOA 2A41A 2HMPA 3H1VX 1QZ5A 1D4XA 4CZLA 5FPMA 2BTFA 3AAQA 1RGIA 2P9LB 3EO3A 5BPNA 3LDQA 2E2OA 3C7NB 1JCFA 1LOTB 2FSNA 4Y0WA 2P9KA 3H6EA 3QFUA 2CGJA 4B1WB 4RTFD 5AQIA 4B9QA 5AQJA 3ZEUA 1KAZA 5FPEA 5AFUH 4A2BA 3VEYA 2P9SA 4XH1A 2ITMA 3H1QA 4H03B 5I9EB 1H1VA 1ESVA 3BEXA 4CZKA 4J8FA 5AZIA 3ID8A 2A6AA 4K42A 5AQNA 3VEVA 1BWFO 1V4SA 1XQSC 5EXWA 4JAXA 4B1XB 5BRDA 3A5NC 3GBTA 5F1XA 1NGEA 5BRHA 3ENOA 4K43A 3I33A 2GUPA 4FO0A 2FF6A 2CH5A 4PL8A 5AZJB 2V51B 3A8YA 3HBTA 1NGCA 2Q1NA 3DAWA 2A40A 4H5TA 2QWLA 3DXKA 4LC9B 2Q36A 4BC5A 4JD2B 1NMDA 1HKGA 5BN9A 3CJBA 1SAZA 4F9OA 4BR0A 2DPNA 1NGAA 1NWKA 4FWPA 5AQXA 5ADXA 3M1FA 3U4LA 2P9NB 5F0XA 1ZXOA 3WXIA 4AM6A 2Q31A 2QWMA 4BRPA 2I7NA 1ATSA 3HI0A 4EHTA 1DEJA 1E4FT 1GLLO 1TYQA 1HJOA 3MN5A 3MN9A 2GELA 3QMLA 3J8AA 4MO4A 4EHUA 4BRIA 4B1ZA 2IVNA 3DXMB 3VGLA 3ZETB 1S22A 4H0XB 4M7YA 4BROA 4PL7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HW3A 1DT9A 1CLQA 4CD3A 3M8RA 3CFOA 2BANA 1BCMA 3BDPA 2KFZA 1NG9A 1VSEA 1WN7A 2B5JA 3B6PA 4B1VA 3CQXA 4ISGA 5M1KA 3KZBA 3HM8A 1CXUA 5GAEP 3OYAA 2RN2A 1XHXA 1SQKA 3L0QA 4CHOA 3LDPA 3IMXA 1NJYA 4FJ7A 4E0DA 2YJFA 3A5OC 4GKKK 3EKSA 1QHTA 1CXQA 2IIRA 3O3FA 1YF5L 4B08A 3FLCO 2W40A 3E01A 3O6WA 4CE9A 4B9TA 4K8ZA 1ASVA 4CHZA 2HMIA 4HWIA 3VPZA 3WUHA 3VMFB 3VQDA 3RRGA 3QETA 3KK7A 5B8HA 3RMBA 3TSUA 3UKUB 1K8KB 1YVNA 3KIOA 3VERA 2D0OA 3I8BA 3SV4A 4JI3K 3C94A 3QB0A 4JI0K 3OJSA 2W42A 5FLXO 4DTPA 3G25A 5HRPA 1VSKA 1YJWN 3L3VA 4GY2B 1K6YA 3NMUA 4DTNA 4DFKA 2EHGA 4FSVA 1OH7A 5M1OA 2A3ZA 4CK3A 3AVMA 4CIGA 3V1RA 4FK0A 3THXA 4DU3A 1ZBFA 4CJEA 4LF5K 5AFUA 4JKGB 3ZYYX 5AJ3K 3L2UA 3V9UA 1X9MA 4XIUA 1TUUA 3K5LA 3FFIA 4BR7A 2RHKA 4LSNA 3O1BA 3CJCA 4CBXA 4DTSA 4DR5K 4BE2A 3AVIA 2E1YA 3KLHA 3GDQA 3OVNA 3O08A 1JL1A 4O44A 4B3OA 3H45C 3EZWA 3F9KA 1OH5A 4DV3K 1VSIA 4KHNA 2HBJA 2O8FB 3I56N 3SQ0A 1NK6A 3T1AA 4BE0A 3LPTA 1T8EA 3BGRA 4IG0A 3QBXA 1GLEG 3TI0A 2HVIA 3PIPL 1YHQN 1IJJA 3L2QA 4JI1K 4E1MA 4KV8A 1IH7A 4BR4A 5C15A 2IGIA 3JXUA 1KC8O 4RCHA 4FPBA 4YOWA 3K5NA 1NKBA 4JRQA 5H1SQ 4O5BA 3WT0A 4X62K 3EKUA 4CJPA 5I42A 2VGMA 2P9LA 4PKGA 3V1OA 3P38A 3PIOL 4IOAL 3ZSXA 5J2MA 3CJ9A 3NH1A 2YHWA 1J9AA 3WQTA 1NJZA 2RE2A 4JRPA 3G10A 3O4QA 5TKYA 5AQGA 1N6QA 1FJGK 5LMUK 3MK6A 4L8RB 1VK0A 4WE1A 3L4QA 3ZCMA 3KWIA 3NF9A 3WNHA 4DU4A 1C0UA 2ETJA 3L4IA 4PHTX 2YV0X 1R59O 1LW2A 4KHUA 1QVFM 2HF4A 5AZJA 4H0OA 2QM1A 4BRFA 4DLGA 3CCUN 4JI4K 3WNGA 4CZFA 4BRQA 4BR9A 3V9SA 1FK9A 1MWMA 2FXUA 4I7FA 4IO8A 5BR8K 1UA0A 3TAFA 5JICA 4FJKA 4DF8A 3PX0A 1S9GA 3CCVN 4DQPA 4JV5K 4PKIA 4C8LA 1S5JA 2P9NA 3PV8A 2HNYA 5M1PA 3Q7CA 2I7PA 1JCGA 5I3UA 1VQPN 5KGXA 4NCGA 1FKPA 4FJ5A 3AO3A 3LL3A 4BRHA 2NRWA 4GMJB 2KQ2A 2HF3A 4CD1A 5CE3A 4FJ9A 4KTZA 3NCIA 1Y97A 3R9PA 3MEGA 4B9NA 3RSEB 5HRSA 3F73A 4DQRA 2OPQA 4LF4K 4B3TK 1IG8A 3AY9A 4IFYA 4PQUA 3CC2N 2YNHA 2ZJQL 3MDQA 1SL0A 3OA9A 4BRGA 3G0ZA 1B92A 5EY4A 4JI6K 3L3UA 4KH6A 1E4GT 1LW0A 4JHDA 1NJXA 4QS8A 3D2EA 5HBMA 3FZLA 3DLEA 4FM0A 4CZIA 2F96A 2XY5A 1T7PA 1YJNN 1Q18A 3KKSA 3M6GA 2VWKA 3AA5X 1KVAA 1NKEA 3CCLN 5KI6A 1S1TA 1JLBA 1VSDA 4O4GA 5CYQA 2EWSA 1KLMA 5JLFA 4YOVA 1GLCG 3C95A 3HTVA 3AVBA 4M63C 1S1VA 2WC9A 3TAGA 1W7AA 2WFBA 1VSJA 3AGRA 4DG1A 2Q97A 3M5RA 3ZX0A 2DTUA 4HHTA 3NGYA 2UXDK 3KTQA 3C0BA 3VF2A 1EWRA 4DV5K 4ILGB 3I8DA 1VSFA 3ZSQA 1GLDG 4I6MB 4HUEA 3WEEA 4BE1A 4BR5A 1YI2N 4DU1A 1TGOA 4RW9A 3HRGA 5GIOA 4OO1J 1NJWA 3OYCA 1U2VB 1DTQA 4CEFA 3KLIA 1DTTA 2OZMA 3VQ4A 4BRCA 2F7TA 4DUZK 3IAYA 3K59A 2QI2A 1WSFA 3V81A 3DXKB 2R7YA 3IDHA 4JKCA 3U9ZA 3HOTA 3TTFA 4DTMA 1NK7A 4BDPA 3U3GA 4CHYA 3KD1E 3K9JA 5EOYA 2HHVA 4R79A 2NRZA 5KRTA 4CGGA 3CG7A 2YX6A 4GV9A 1HUXA 1QZ6A 3QIOA 3C6TA 4MQ3A 1J5OA 1VQNN 1TYQB 3NF7A 4F8RA 3O9QA 4FL9A 4NCAA 2NRRA 4CI6A 2IVOA 1DKGD 3TAPA 1WB9A 4DR1K 1X3NA 1XI1A 4CEDA 3D6RA 2A41A 5C10A 4CJWA 1L5UA 3DMJA 5FPMA 2BTFA 3OBYA 1BHLA 5BPNA 1FKOA 3LDQA 3O9SA 3RVCA 2E2OA 3C7NB 1BIUA 1IBLK 2E4LA 5M1FA 1WLJA 4ELUA 2P9KA 3S3MA 2OPRA 1LAWA 3QFUA 4B1WB 1Q9XA 3CCQN 4FXDA 1WSHA 3ZEUA 4IDHA 1JLEA 1WSIA 5FPEA 5AFUH 3K5MA 1EXQA 3F5TA 4LF9K 3H1QA 3EY1A 3LZJA 4JK9A 5K14A 3E9LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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