4HW8A

2.25 angstrom structure of the extracellular solute-binding protein from staphylococcus aureus in complex with maltose.
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
376
structure length
376
Chain Sequence
KDKPNQLTMWVDGDKQMAFYKKITDQYTKKTGIKVKLVNIGQNDQLENISLDAPAGKGPDIFFLAHDNTGSAYLQGLAAEIKLSKDELKGFNKQALKAMNYDNKQLALPAIVETTALFYNKKLVKNAPQTLEEVEANAAKLTDSKKKQYGMLFDAKNFYFNYPFLFGNDDYIFKKNGSEYDIHQLGLNSKHVVKNAERLQKWYDKGYLPKAATHDVMIGLFKEGKVGQFVTGPWNINEYQETFGKDLGVTTLPTDGGKPMKPFLGVRGWYLSEYSKHKYWAKDLMLYITSKDTLQKYTDEMSEITGRVDVKSSNPNLKVFEKQARHAEPMPNIPEMRQVWEPMGNASIFISNGKNPKQALDEATNDITQNIKILHP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title 2.25 Angstrom Structure of the Extracellular Solute-binding Protein from Staphylococcus aureus in complex with Maltose.
rcsb
molecule tags Solute-binding protein
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule keywords Bacterial extracellular solute-binding protein, putative
total genus 124
structure length 376
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4hw8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4hw8A02
3OD7A 3OEMA 1OMPA 1B40A 4YB6A 4H0WA 4RPOA 1USYH 5EHSA 5H8QB 1B51A 4OMBA 4F1VA 5M2VA 1SBPA 5I2NA 1FW0A 1MPDA 3FVGA 3GZGA 1LAFE 2E0SA 4ZZEA 3KOTA 2AIXA 3FD3A 3O6GA 5DTBA 1I6BA 1B1HA 2HQ0A 2Q89A 3TCFA 2PVUA 1MQDA 4DXBA 1LSTA 1WODA 1FTKA 3DP8A 2V84A 2DE2A 1LCFA 3DP4A 1SDXA 3SEWA 5ICTA 4H5FA 2UYFA 1A8FA 5CC2A 1B0LA 3EHSA 2B65A 1H44A 3T22A 3O97A 4U4XA 3RNNA 1TFAA 2QJEA 3PUVE 4R6HA 2I3WA 1FQBA 1R9QA 3W9WA 3LBSA 4LQ5A 4N07A 1MY1A 4ESWA 5I57B 3WAFA 1A99A 3OO9A 3QSLA 4BDQA 5I58A 2I0CA 3H7MA 5FTHA 1SW1A 3UP9A 3M3FA 3A09A 3S9EA 1B1XA 4FAJA 1EU8A 1GR2A 4G4PA 1A8EA 1LAHE 1B3EA 3U8QA 5I2KA 4LQ2A 4C1TA 3TCGA 3G3HA 2VP1A 4GXSB 3Q27A 1LLSA 1AH5A 2DVZA 3VLVA 3KN7A 3O66A 2H98A 1PEBA 4TLMB 2RF1A 2Y7KA 1H3DA 3PPPA 4DIGA 2O1LA 4OESA 1B3LA 4LZ7A 4MLVA 3KJ7A 1LGBC 4ZS9A 4KCCA 5AA2B 5F7VA 4BDLA 3MUQA 1US5A 3A3CA 3TMGA 2DWAA 4HW8A 2DE3A 4LA9A 2NVUB 2RC9A 5TP9A 2O7UA 2XXTA 1USYE 3MVXA 5ICQA 4I8CA 4ZE9A 2F36A 3TODA 2DWIA 1M5FA 4GFRA 3HHGA 3TEPA 5AA4B 4JB7A 2YPNA 3CG1A 3N6TA 3M8UA 2Q9TA 2VD2A 4YMBA 1NNPA 3FUZA 4O3BA 1JVXA 2B3BA 4DZ1A 1S7YA 1MXUA 4ISUA 4OEVA 3TCHA 1VR5A 3HV1A 5A5XB 1MXWA 3KSXA 2ZMBA 4HCYA 1FTJA 5ITPA 4TLLB 2XXVA 4UA8A 3RTFB 1FQEA 2DSFA 2XXIA 5L8DA 3A3UA 4LVQA 1I6AA 3FATA 4OQOA 2QSXA 4QRZA 3FXUA 1POY1 3RQTA 1B7UA 4EXKA 3FZVA 1LCTA 5JEIA 1MDP1 3EN3A 3IO4A 4G77A 2REGA 5DYHA 3TQLA 3T66A 3O2AA 4Q0CA 4U22A 2V25A 3H3GA 1CB6A 1P1OA 3CIJA 5KZTA 1IIWA 5H8HA 4QF9A 1Y20A 2PYYA 3O29A 5L9OA 4NF8A 3K4UA 2OCUA 4GD5A 4I9DA 4G68A 4F2QA 3K6VA 1B6HA 5DVJA 1H43A 3QAXA 3CSBA 4JSOA 1QUKA 3O6HA 4NWCA 3FJ7A 3OEKA 4PP0A 1N7XA 1QJMA 3IR1A 5H8NA 2XX9A 4U21A 2DS9A 4OENA 2DQVA 1SYIA 2QS2A 4ZEKA 1TWYA 4NF5B 2PBWA 5KCJB 2ZYNA 1B5JA 3KBRA 4MBPA 1N3WA 4N6PA 1P1QA 3FXRA 1ZIUA 4DDDA 4F39A 2XXHA 1MM7A 2O6AA 3DLNA 4OXVA 1MY4A 3N94A 3ZS6A 1TT1A 3SERA 4IY5A 1DPPA 2QRYA 4JDFA 2E1SA 4ELQA 4OFJA 2D5WA 3IJXB 1DSNA 2X7PA 3RTWB 3MP6A 3KSJA 3R26A 4P11A 5B70A 2I49A 3CSGA 5BUUA 4M1VA 3UK4A 3FVNA 3PD8A 1B58A 4JBZA 2XXYA 4BLAA 4RY1A 4O3AA 3S4UA 3TTMA 1IQ7A 5CM6A 1NL5A 5H8QA 1IZ1A 4X1BA 5JK4A 3OELA 4FE8A 4LZ8A 4QSDA 2GFEA 3L6GA 4U2RA 2PT2A 1HSJA 1Y3QA 5KDTB 1POTA 3TYHA 3DM0A 4YICA 2Q88A 3G3IA 2QS3A 5I56B 2ZYKA 1NFTA 1SI1A 3G7WA 4O3CA 1H45A 4OWDA 1OLCA 5ITOA 2ONKE 2Z22A 2GRVA 1O7TA 3KGCA 1BLFA 2H5YA 4Z0IA 3SEYA 3EPEA 3P7IA 4U1OA 4RK9A 5I59B 2DXYA 3THIA 1UIVA 5I84A 1A40A 2UXAA 1MXVA 1S9TA 2P2AA 3IOVA 1NH8A 2ONSA 1AMFA 2HXWA 3FVOA 1B3HA 2NOOA 4EXLA 5CMMA 1GTKA 2R9JA 2ZXTA 3IO6A 1MPCA 3TKDA 4IO7A 1B46A 1DOTA 4GXAA 3KJTA 4PQJA 2R6GE 4POXA 4KR5A 2UVIA 5H8FA 5B7DA 3EHUA 3MAMA 2DXRA 2I6EA 5EYFA 2ZYMA 1WVJA 2D21A 3UA8A 1SW4A 4YKIA 3VDFA 3MJNA 4PFWA 5CMBA 3R6UA 4WKMA 4EQ9A 1XT8A 5ISUA 3IORA 3HCQA 1PC3A 2F5XA 5DEXB 3OMBA 4XXUA 3U1OA 4DE8A 4ZECA 5EHMA 1D3KA 1B5HA 4R75A 2HAVA 4JWOA 2VD3A 3E4RA 1P99A 4IO2A 4KPTA 2KLFA 4NF6B 1RYOA 5AA2A 1JW1A 2HZLA 4JXIA 3PMVA 4GL0A 3PUZE 4F29A 3OSQA 3IX1A 3TTLA 1URDA 1FQDA 4YKKA 3PUYE 1OVTA 3T96B 3N6UA 3H6UA 3TAJA 4H8IA 1Y3PA 3KOSA 2GHBA 1US4A 1XC1A 5AA4A 4ELOA 2RINA 4GQOA 2XD3A 1AL3A 2QMXA 2V3TA 1VFDA 4LZ5A 1N7WA 2Y7WA 5IKBA 4THIA 1NNFA 2IA4A 4BDNA 3CVGA 4RYAA 1N84A 2DWJA 1BP5A 2Q8JA 3ECRA 5FHNA 5A5XA 1ZU0A 1SD3A 3RT6B 2VHAA 1GV8A 4OVJA 3C32A 1UTBB 4U4SA 2D3IA 4ONYA 5FHOA 4EUOA 3KEIA 4ZEBA 1M5BA 3OO8A 3PD9A 2W7YA 1EZPA 3CFZA 4DCXA 4F22A 3I6VA 2H25A 2QS4A 4OHNA 3W9VA 4UACA 4I62A 2AL5A 4F31B 4ZE8A 1FTMA 1N76A 2RKMA 2F97A 5J1DA 4IO4A 4GVOA 2WKYA 3PPRA 4OFOA 1FCKA 3VVEA 4WXJA 1NKXA 4XKPA 4QFLA 3MQ9A 3G3JA 2ZYOA 1MXXA 1QKBA 3VVDA 3JV9A 1BKAA 4PE5B 1MXZA 3LR1A 3USDA 3K6XA 4HS7A 3V89B 4PETA 1N3XA 3ODBA 4TOZA 1OLAA 1R9LA 3TPAA 1FQCA 3MC2A 2OWSA 3FJMA 4NMYA 2FA7A 4L17A 2DOJA 4KYEA 5AE4A 3H03A 3PMWA 2Z8EA 4G2ZA 2XHDA 5KCJA 1Q1KA 4F1YA 4Q30B 4QHQA 3B6WA 4XKNA 4ZZAA 3HSTA 4R6KA 5I58B 4ZEFA 1FQFA 1M5CA 3S9LC 4XKQA 3TUSA 5DVIA 4ESXA 1QUIA 1MS7A 3FASA 3PPNA 4R6YA 4KCDA 4N13A 2O1MA 1NNTA 3HHFA 4GRKA 1VSOA 3LC8A 4F19A 3U72A 4MH5A 3JZJA 3Q25A 1BIYA 4GOTA 3V8XB 1JVYA 2DP8A 1JQFA 1J1NA 4LP2B 3G3FA 4YMAA 3OENA 4QFOA 3FGSA 1MG1A 4DCYA 5L9SA 3ILTB 4PFTA 1IEJA 3DELB 1MDQA 4P0GA 3G3GA 4DXCA 1B4ZA 1ZTYA 3IB0A 2O69A 1QULA 2OWTA 2PT1A 3SETA 3ZKLA 3LSLA 3LSWA 1ZJLA 3IAZA 5I56A 2NXOA 1O64A 1NNKA 4IGTA 3H6WA 1SI0A 1A7LA 2H99A 5CRYA 3MPLA 2RC7A 3C31A 4JWYA 1BTJA 3RY3A 4ELPA 3CFXA 4R2BA 3CR9A 2OLBA 3LSFB 3Q26A 4KQPA 1IXHA 2QMWA 4AB5A 2O68A 1KWHA 1JEVA 1GGGA 4NE4A 4U1ZA 4QSEA 1IXIA 3EF7A 3PV0E 1S50A 2H9BA 1MQJA 4QFPA 1HSEA 3OO7A 2DVCA 1B7HA 3QYTA 2REJA 2RCBA 1DTZA 4FECA 2Z8DA 3H6VA 3QUFA 1MH4A 5K2XA 4RK2A 2ZNUA 1EZOA 3O28A 4FORA 3Q28A 3QIMA 4NF4A 4G8HA 4WEPA 3MP1A 4EQBA 2Q2CA 4F1UA 2I0BA 4DLDA 2DWHA 3TTRA 2A5TB 1Z7ME 1QW0A 4HTGA 3OSRA 3SEUA 2HAUA 2P1SA 2AL4A 2QPQA 2I4BA 2XXPA 1D4NA 3VV5A 2YJPA 1UTHB 3CFLA 3S2VA 1YCJA 4G8MA 3UORA 1QKAA 4QFKA 4R2FA 2NWJA 1XS5A 5CI5A 1SQYA 2OZZA 3IJOB 2R71A 2GH9A 5JTYB 2F6PA 2HZKA 4NF8B 2V93A 3PU5A 1B7ZA 4OYVA 2XXRA 4NF6A 2F8DA 2F34A 3C34A 4IGRA 5TPAB 1T0KA 4IO6A 3IOTA 4KFQA 3GXAA 1QVSA 1FTOA 1DTGA 4QSCA 2A5SA 1II5A 1DMBA 3RLFE 4FATA 1JW4A 3KN3A 2FNCA 2G93A 1M5EA 4ELRA 1QUJA 3ONMA 1B52A 3U94A 1IUDA 5I57A 4KI0E 3GBBA 1PB8A 1MY0A 3IL1B 4X48A 3MZ9A 2M8CA 3RT8A 2XXQA 4OTEA 4GL8A 4EF2A 3H4ZA 1Z7NE 1LB8A 3KG2A 3C35A 2ALUA 4FJPA 4E0XA 1P1NA 1NMUA 3K00A 3I5OA 1H76A 1UTBA 4RA1A 3FXQA 1XOCA 1UIUA 3O6IA 2PX1A 1R1NA 1P1UA 1ZLQA 1MY3A 3K1MA 3UGWA 1DPEA 1N04A 3SESA 2DYXA 1O63A 3FIRA 2QS1A 5HM4B 4ECFA 3T9HB 1B4HA 5CMCA 1Y4TA 2AYSA 2OBGA 4JWXA 3B6TA 5HBCA 4GWOA 2XXUA 1B2HA 1URSA 4Q5TA 4LUBA 3HN0A 1F9BA 1RYXA 4X9TA 1NH7A 3TDJA 1Y4CA 4ZDMA 3C9HA 2B3FA 1MQHA 3N5LA 3B7DA 1I69A 3EQ1A 2F7BA 3E3KA 2F78A 4OFLA 2PMSA 1LFGA 3VXBA 4KHZE 4H1XA 3VLUA 3R7XA 4I1DA 2HFBA 3ILUB 1CE2A 5H8SA 1YPNA 1EZ9A 3V83A 4EQ7A 3WAEA 1B0HA 1MQIA 1SW2A 2ZNSA 4HCWA 3IB1A 4RXLA 3BKIB 2UVGA 4H65A 3IK6B 2LAOA 1PBPA 1LFHA 4YKPA 4GLIA 4MFIA 2ESNA 3CI8A 2V3UA 4R74A 4AQ4A 2GHAA 2Y7RA 1Q35A 3D4CA 4FEDA 3C4MA 3T9VA 2NUVA 5H8FB 3K2DA 3QXMA 3MVWA 2F7AA 4ZEIA 5LOMA 4C0RA 3VVFA 3MP8A 3TELA 1HSLA 3H06B 3GLBA 4GF8A 3FV1A 2V3QA 3S9NC 1IITA 4OERA 1B9JA 5HPQA 4YU0A 1MRPA 3MZBA 4ZEDA 3TTKA 3OXNA 1ATGA 5I2NB 4OEUA 4LONB 1LBBA 1LB9A 2Y7PA 2P0SA 1Y1ZA 2OK2A 1JEUA 1JW5A 1LFIA 5AA3A 2X26A 2Q2AA 2THIA 3MWBA 3O9PA 4KYDA 1SVXB 4IO3A 4R72A 1SW5A 4YAHX 4LATA 3IB2A 3BFTA 4P0IA 4BDOA 3PUWE 3QK6A 3VFJA 1LAXA 3OOAA 2I48A 3BBRA 1EH3A 4R9GA 3V5AA 4EF1A 1OIBA 2G29A 3B6QA 1MY2A 2F35A 4JSDA 3ZSFA 2QL3A 3LUYA 4IB2A 1YTVA 4FEBA 5BWJA 4MF3A 2RCAA 4PFYA 5FTIA 4XKRA 3UIFA 4NF5A 4AB6A 1N0TA 3N26A 4YB5A 3K0VA 1IXCA 1VE4A 4YKJA 3S9MC 4Z7EA 4E0WA 1B3GA 1MH3A 3EHTA 4KYSA 1RKMA 3TQWA 2H4IA 4WEDA 4RNSA 3PMXA 5ELVA 3M3LA 3FJGA 5I2KB 2IEEA 3AXFA 1MQGA 1JNFA 3T9XB 4BDMA 2A5TA 2I4CA 3MZ1A 1A55A 3HPIA 4R73A 4NTLA 1AIVA 3SKPA 1B5IA 3MPKA 1A54A 2XXXA 4F18A 1UTHA 3VE1B 1FQAA 3OO6A 2BJJX 1Y9UA 2Z23A 3PPOA 5L9MA 3G3KA 1MM6A 4G8NA 3PUXE 3RPWA 2I58A 4XTCQ 3KN8A 3MW0A 4H8JA 1ANFA 4BDRA 1VFEA 5AA2D 3I3VA 2O84X 5JTYA 2HCAA 4RJZA 2FYIA 3LSXA 2Z8FA 5K2YA 5KDTA 4H6DA 4IY6A 5TP9B 5FHMA 4EDPA 2VOZA 2Y7IA 3K01A 3E13X 4PFUA 4H67A 3C33A 3JYRA 5TPAA 1ZKBA 1URGA 4K3FA 2XX7A 4H5GA 1MPBA 4U23A 3K02A 1I6QA 4OETA 3M3KA 3F11A 1PB9A 1XHYA 3RUMA 4OZ9A 1B3FA 5I59A 3QUJA 1L5TA 5CBRA 3IOWA 1FTLA 4FIMA 4KD5A 3RN8A 2I3VA 3KZGA 2ABHA 3KFMA 4F3BA 1ZMGA 5CMKA 4GIZA 4M4GA 4F3SA 3Q29A 3PGFA 2XD2A 3MBPA 3H6TA 4NWDA 4YZZA 1R6ZA 1OVBA 2VGQA 1TXFA 4TQUQ 1D9YA 5IAIA 2RC8A 3UN6A 2ANJA 5DT6A 1TFDA 3K1PA 3L6HA 2UYEA 4DXUA 2YLNA 1PB7A 1PDAA 4R9FA 1B05A 2HEUA 4C1UA 2O51A 2OJTA 3D4GA 1IXGA 2XXWA 3MVZA 3MVYA 4F3GA 1ELJA 5DEXA 5H8HB 5CBSA 1Y3NA 3DP6A 4F3PA 3CRBA 4G68B 2UVJA 4G68C 3T93B 2ONRA 1AOVA 1XVYA 4XIGQ 3C36A 5TU0A 1UQWA 1YAEA 1OQGA 3W15C 4F2OA 3K6UA 2UVHA 2F6GA 5DVFA 2X7QA 5H8NB 3TFLA 4RPNA 3E9XA 4NEDA 1SYHA 4MLQA 4X1DA 3SEVA 4YB7A 2Y84A 3FV2A 4IO5A 3T9UA 3SEXA 2CZLA 3GBAA 3U92A 3PPQA 5AA1A 3K6WA 3ZKKA 3FVKA 1LAGE 1D9VA 1MXYA 1B32A 3CG3A 3TZAA 3HO7A 2XX8A 1OQHA 1M5DA 3U93A 1PBQA 1WDNA 1LBCA 2ZNTA 4Q8RA 3RGYA 3VXCA 4NF4B 2O7IA 2DE4A 1JETA 3K1NA 1Y1MA 3SDFA 1GVCA 3IOUA 2F7CA 4POWA 4ND9A 1ZBMA 3BFUA 1P1WA 4QFNA 1XVXA 2CMOA 3VLWA 5F1QA 3TTNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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