4HW8A

2.25 angstrom structure of the extracellular solute-binding protein from staphylococcus aureus in complex with maltose.
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
376
structure length
376
Chain Sequence
KDKPNQLTMWVDGDKQMAFYKKITDQYTKKTGIKVKLVNIGQNDQLENISLDAPAGKGPDIFFLAHDNTGSAYLQGLAAEIKLSKDELKGFNKQALKAMNYDNKQLALPAIVETTALFYNKKLVKNAPQTLEEVEANAAKLTDSKKKQYGMLFDAKNFYFNYPFLFGNDDYIFKKNGSEYDIHQLGLNSKHVVKNAERLQKWYDKGYLPKAATHDVMIGLFKEGKVGQFVTGPWNINEYQETFGKDLGVTTLPTDGGKPMKPFLGVRGWYLSEYSKHKYWAKDLMLYITSKDTLQKYTDEMSEITGRVDVKSSNPNLKVFEKQARHAEPMPNIPEMRQVWEPMGNASIFISNGKNPKQALDEATNDITQNIKILHP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bacterial extracellular solute-binding protein, putative
publication title 2.25 Angstrom Structure of the Extracellular Solute-binding Protein from Staphylococcus aureus in complex with Maltose.
rcsb
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule tags Solute-binding protein
total genus 124
structure length 376
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4hw8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4hw8A02
1IITA 2G29A 2H5YA 5DYHA 2XX8A 1F9BA 2F7AA 1T0KA 2PX1A 1N04A 3PPOA 4OZ9A 2RINA 3S9EA 4ZZAA 1IEJA 4QRZA 5BWJA 3DM0A 2XXIA 3R7XA 2AYSA 1MXZA 2QPQA 4YKIA 3THIA 4PFUA 1IIWA 4LQ2A 3TCGA 3FV2A 5EYFA 1N3XA 1VFEA 2OBGA 1SYIA 4KCDA 3G7WA 4G4PA 5I58B 1B1HA 4ZECA 5H8HB 3S9LC 3H6WA 3OOAA 3JZJA 1JQFA 2CMOA 1RYXA 1II5A 4YAHX 1US4A 3DP8A 3GBAA 4JSDA 3RTWB 4KYEA 2DP8A 3O9PA 4Z7EA 2VP1A 3LSWA 3FVNA 3B6QA 4H1XA 4NF6B 1Y3NA 2F36A 4JWYA 4WKMA 3UGWA 1FQAA 1BTJA 5JEIA 2I4CA 4OENA 2Z8EA 5H8SA 3RLFE 1SYHA 1LFIA 2ESNA 3K6VA 1N76A 2P2AA 1CB6A 3VVEA 3SEWA 1I6QA 3CR9A 4K3FA 3RY3A 2DSFA 1XC1A 4U4XA 3K6XA 4E0XA 4LZ7A 2IA4A 1Y4CA 3MVWA 3HPIA 4ZEIA 2I58A 2ZMBA 4POXA 1B5JA 3G3IA 3PPQA 1FTLA 1LBBA 4DXUA 4OXVA 2O68A 4RY1A 3MZ1A 3UN6A 3QSLA 3B6WA 3ZS6A 3M3KA 4F18A 3IJOB 4F39A 2ZYNA 1MPDA 3Q28A 3PMVA 4BDLA 3K1PA 5I2KB 3HO7A 3L6HA 3LSFB 3MUQA 2V3TA 1Y1ZA 4OQOA 4U1ZA 3Q25A 2ONRA 2NUVA 1CE2A 2P0SA 1Y4TA 1YTVA 1XVYA 1H43A 2ABHA 5HM4B 4GLIA 2I6EA 4HTGA 4R2BA 4I9DA 2M8CA 4XTCQ 1POTA 2P1SA 3IOWA 5CMKA 3MPKA 1MQGA 2Z22A 4FEBA 4YKKA 2HEUA 4GXAA 2DE2A 3H4ZA 3OENA 4POWA 4TQUQ 2V3UA 3M3LA 4WEPA 1MQDA 4AQ4A 2Q2CA 3FATA 1USYH 4XXUA 3RNNA 1UTHB 3BFUA 2I48A 4RJZA 3LSLA 2R6GE 4H8JA 3K1NA 4QF9A 4GIZA 3WAFA 1HSJA 1WDNA 3V83A 3CRBA 1A55A 4F22A 3G3KA 3LBSA 1DMBA 3W9VA 3R26A 3H3GA 3UORA 3KGCA 1TT1A 1SI0A 4Q8RA 1EU8A 2HCAA 5K2XA 3SEYA 3T96B 4F1YA 4IB2A 3KJ7A 2UYEA 1PBPA 3CFZA 3TDJA 1B2HA 2HAVA 2FA7A 1MDP1 5M2VA 1JW4A 3EN3A 5AA3A 5K2YA 5B7DA 4FJPA 3PUVE 1MXVA 1MY4A 1FQFA 2I0BA 2LAOA 3C33A 3FVGA 1B3LA 3B6TA 4NF5A 3IOUA 5I2NB 1I69A 5DEXA 3CSGA 3RT6B 1OIBA 2QSXA 3BFTA 1OVBA 3PMWA 1LAXA 2E1SA 2XXVA 3UP9A 4MLQA 4C0RA 3F11A 1RKMA 4IO7A 1B7ZA 4BDQA 5B70A 2GFEA 3E13X 1JEUA 4LQ5A 4M1VA 1URDA 1B58A 2QS3A 3QYTA 3VDFA 3G3FA 3C36A 3H6TA 4F3PA 1MY2A 1FQDA 3K00A 2B3FA 4OFLA 2Y84A 3KEIA 4RA1A 3KSXA 4U1OA 3SKPA 5AE4A 4GXSB 1XS5A 4ELOA 4EQ7A 4X1BA 2DQVA 3IO6A 2F78A 4KI0E 4PFWA 3IOVA 1B0HA 4EDPA 2F34A 1N7WA 2DVZA 5BUUA 1B46A 1N3WA 3MZ9A 1O63A 3OELA 5CM6A 5DVIA 2B3BA 3EF7A 3RPWA 2PMSA 4ZEFA 5H8FA 1SBPA 4NMYA 2PYYA 4ELQA 1A8EA 1MXYA 4JWOA 5TPAB 5AA2B 5KZTA 1IZ1A 1US5A 4P0IA 3U93A 4IY5A 4G8HA 4F1UA 1JW5A 3I6VA 4R72A 4JDFA 3OMBA 1EZPA 2RC7A 3A3CA 2DE3A 4O3BA 5I56A 5AA4A 3KZGA 4GWOA 4G68A 4C1TA 4MH5A 4OMBA 3ECRA 4ONYA 4LONB 1S7YA 2DWJA 3OO6A 4H65A 4N6PA 3MZBA 3Q26A 4NWCA 2Y7PA 4QSCA 2H9BA 3MW0A 3OEKA 4XKPA 1OQHA 4OFJA 4JB7A 2ONKE 3C31A 2DE4A 3DP6A 1P1WA 1S9TA 2XX7A 3QUJA 2NOOA 2OK2A 3E9XA 2F97A 2RF1A 1OLCA 3EHTA 4I8CA 1MXXA 4QSEA 3PPRA 2H99A 4G68C 1P1NA 4HS7A 1LB9A 1M5CA 1SW1A 1FQEA 3HCQA 4AB5A 4WXJA 5I57A 1Y1MA 1FTKA 4R9FA 4KQPA 1B51A 2V93A 5L9SA 1NMUA 4TLMB 1B3HA 3O6GA 4FATA 4QFPA 1IXGA 1SW5A 4FORA 4ISUA 1VR5A 1ZU0A 5IAIA 3GLBA 5L8DA 2XX9A 3H6UA 3MP8A 1S50A 4ZEKA 2UVJA 3V89B 2DS9A 3TEPA 4FEDA 4Q0CA 3VLUA 1D9VA 1Y20A 3D4GA 1SW4A 1MRPA 4KCCA 5JTYB 1UTBA 4U21A 4YMAA 1WVJA 4DLDA 5IKBA 1M5EA 3U1OA 3LR1A 2XHDA 3CVGA 3FZVA 1NH7A 3QUFA 2RC8A 3O29A 5F1QA 4UA8A 4OEVA 3KOSA 1MQJA 3T66A 3EHUA 1EZ9A 2D3IA 2XXPA 3KOTA 3VFJA 4NEDA 3CFLA 2HQ0A 1Y3PA 1B1XA 3SEXA 4IO3A 2DVCA 3TTRA 3KN8A 2ZNSA 5DVFA 4QSDA 1H76A 4L17A 1B32A 1SI1A 4H0WA 1J1NA 3UIFA 1A40A 4ZE9A 2DYXA 1M5DA 3UK4A 1LSTA 3SEUA 2ONSA 3T9XB 4PE5B 2OZZA 4NTLA 1URSA 3ZSFA 4R2FA 1BIYA 2XXYA 3ODBA 3HHGA 1FQBA 4YB7A 5AA2D 3ILUB 1MY3A 1Y9UA 1NNPA 2W7YA 2OWSA 5TU0A 4DCXA 3FXQA 3OD7A 3IR1A 2Q88A 3ILTB 2A5TA 1XOCA 3IB0A 2I3VA 5J1DA 3IB2A 4ESWA 3KJTA 1GR2A 3IX1A 2O6AA 1AMFA 4UACA 3FVKA 2Z8FA 4JXIA 3K0VA 1MPCA 1MS7A 2V25A 3SETA 3VVDA 4KD5A 3ZKLA 5DEXB 2WKYA 2Q2AA 1B05A 1NNKA 3TFLA 4HW8A 4ELRA 5I59A 5TP9A 2XXTA 4NE4A 4OESA 3OSQA 3Q27A 2UVIA 1YCJA 1D3KA 3C34A 4R75A 3FXUA 3K2DA 1NFTA 4EQ9A 1I6BA 4N07A 3TTMA 3V5AA 2ZYMA 1N7XA 4M4GA 1IQ7A 5ISUA 5CBRA 5H8NB 4C1UA 3O6HA 1MQHA 4LUBA 2I49A 4F3BA 1SW2A 2I3WA 3TUSA 3RN8A 5DTBA 4PETA 1MM6A 3G3GA 3FUZA 3N5LA 5HPQA 5ICTA 2YLNA 4IGRA 3N26A 3A09A 1JVYA 4WEDA 4LA9A 3ZKKA 3C35A 1JVXA 4R9GA 5CMBA 1IUDA 1EZOA 1MY1A 4X1DA 4JBZA 1PB8A 4PP0A 3MVZA 4RK2A 3VE1B 3LSXA 1DOTA 2FYIA 2XD3A 3S9MC 2Z23A 2F35A 1LLSA 1B4ZA 3QIMA 2ALUA 2QMXA 4KR5A 3TTLA 1B5HA 3MP1A 4H67A 4OERA 1P1QA 2I4BA 2AL5A 3QXMA 5H8FB 2H98A 1VE4A 4YMBA 1LGBC 4PFYA 1AH5A 2THIA 1Z7ME 4P0GA 1NNFA 1AOVA 5EHMA 1URGA 1FQCA 3K1MA 3S2VA 1LB8A 4FECA 2YPNA 4EXKA 4OFOA 3TZAA 2Q8JA 1KWHA 3PD9A 5F7VA 1QUIA 3CI8A 2O51A 4RYAA 2DXYA 1UQWA 5KCJA 1UTHA 1P99A 4IO5A 5CBSA 3TPAA 4BDNA 4X9TA 5I56B 5AA4B 1A54A 4NWDA 4G68B 4GD5A 1QW0A 4OHNA 4GOTA 3O6IA 3LC8A 3QK6A 3DP4A 4KFQA 3I3VA 4RNSA 4O3CA 2Y7RA 4YB6A 1UIUA 1A8FA 1YPNA 3P7IA 3OXNA 2DWHA 1PBQA 4MLVA 2DWIA 2R9JA 3MP6A 4NF8A 3MVXA 4R74A 4U2RA 2I0CA 3SESA 1P1OA 2H25A 3OEMA 2FNCA 1FTOA 3HN0A 3VV5A 2A5SA 3CSBA 4NF4B 1IXIA 4H8IA 1B5IA 2F5XA 3PD8A 3N94A 4XKRA 2PT2A 4YU0A 4P11A 3KFMA 4DZ1A 1QUJA 3TCHA 1TFAA 3K6UA 5A5XA 4IO6A 3TELA 4BDMA 4BLAA 1GVCA 1ZIUA 4KYSA 5KDTB 4ESXA 4YICA 5ITPA 4EF2A 5I57B 3FJMA 5DVJA 4DXCA 3OO9A 4N13A 1A7LA 3IOTA 2V84A 4X48A 4GL0A 4TOZA 3T9HB 4AB6A 4GL8A 3K02A 3FASA 1DPEA 4I62A 3H06B 4TLLB 4YKPA 3SEVA 2KLFA 4GFRA 1O7TA 1JW1A 1LFGA 2XXWA 4DCYA 2REJA 2GHBA 3KN3A 4QFKA 4ZS9A 2E0SA 2NXOA 1MM7A 1NNTA 4KHZE 5H8QA 1TXFA 4YZZA 2RCBA 5JK4A 2NWJA 3TYHA 1VSOA 2XXHA 3VLVA 1B7UA 1VFDA 4RK9A 2X26A 2F6PA 1FTJA 2PT1A 4ND9A 3HHFA 1OMPA 2RKMA 3GBBA 3TODA 3RTFB 3RQTA 3PUWE 4XIGQ 3MAMA 4R6KA 4F2QA 3QAXA 3CIJA 3MC2A 4EXLA 3VLWA 4JWXA 5ELVA 1MG1A 1Q35A 2HXWA 4EUOA 4GF8A 3PU5A 2HFBA 2Q9TA 3BBRA 3AXFA 3T9VA 4EF1A 3H03A 2F8DA 2O69A 5AA2A 1HSLA 3W9WA 1H45A 4I1DA 3MPLA 1B52A 1QKBA 1EH3A 4QFLA 2PVUA 1QKAA 1RYOA 3JYRA 4U4SA 1NH8A 4GRKA 3S9NC 3MWBA 2RC9A 3C4MA 2ANJA 4DIGA 3FJ7A 4IGTA 1MQIA 1A99A 3U92A 3PUXE 3O66A 3USDA 4U23A 3M3FA 1SD3A 2O84X 1R1NA 3UA8A 4BDRA 2YJPA 4U22A 4FIMA 1H44A 1NL5A 1NKXA 2F6GA 3K01A 2ZNUA 2X7PA 3OO8A 2XXXA 3LUYA 2A5TB 2Q89A 1GTKA 4LP2B 4EQBA 4DE8A 2R71A 2VD2A 3DLNA 2RCAA 4THIA 3I5OA 3VXCA 3S4UA 2GRVA 3U72A 4E0WA 4ECFA 4LZ8A 1B3EA 2O7UA 3M8UA 3D4CA 4LZ5A 1UIVA 3RUMA 5I84A 3PMXA 4F19A 5AA1A 3IO4A 5I59B 5TP9B 4ZDMA 3U8QA 1LAHE 2D21A 1HSEA 1QVSA 3G3HA 3KN7A 1DTGA 3PPPA 4OTEA 2QRYA 5CRYA 2ZYOA 2XD2A 3TQWA 2QS1A 2XXQA 1MH3A 3FJGA 3O28A 2QS2A 3BKIB 1N0TA 1D9YA 5FTIA 2UYFA 3C32A 4Q5TA 3R6UA 3MJNA 3CG1A 3GZGA 2ZYKA 5CMMA 5ICQA 3E4RA 1QULA 3TQLA 3PPNA 1ZBMA 1LCTA 1B9JA 3IB1A 5JTYA 2V3QA 1B3GA 5I58A 3C9HA 5H8HA 4ZEDA 3JV9A 4O3AA 2OLBA 4MFIA 2OWTA 2G93A 4PFTA 2VHAA 4NF6A 2UVHA 2VD3A 4NF5B 3O2AA 3T93B 2XXUA 1L5TA 4F3SA 2ZNTA 3FD3A 4F29A 1LAGE 3H6VA 3FV1A 4H5GA 5CC2A 1XVXA 4OETA 4PQJA 2DOJA 1FTMA 3TTNA 1Z7NE 4QHQA 5EHSA 1LAFE 1ZLQA 5KCJB 1QUKA 3PV0E 4FAJA 1PEBA 1OQGA 4HCYA 4F31B 2H4IA 4QFNA 4H6DA 4LVQA 3TKDA 1SVXB 4OVJA 2B65A 1P1UA 2HZKA 2QS4A 3KG2A 3A3UA 1MY0A 1M5BA 4IY6A 4RPNA 5I2KA 4NF8B 4F2OA 1H3DA 3Q29A 1JEVA 3WAEA 1LFHA 2GHAA 2NVUB 3EHSA 1B6HA 4XKNA 1B7HA 5A5XB 3CFXA 1FW0A 5FHNA 1D4NA 5FHOA 1BP5A 1R6ZA 4ZEBA 4IO4A 1Q1KA 3KBRA 3U94A 4QFOA 3VVFA 1DSNA 1GV8A 3T22A 1ANFA 2F7CA 2O1MA 1R9LA 2Y7WA 3FIRA 1WODA 3FGSA 2IEEA 2X7QA 1IXCA 3OO7A 3K6WA 2F7BA 3N6UA 4DDDA 5L9MA 3SERA 3IORA 4GQOA 2DWAA 1MXWA 2CZLA 4GVOA 3GXAA 4JSOA 3W15C 1I6AA 3MBPA 2Y7KA 3B7DA 3K4UA 1ZKBA 4F3GA 1GGGA 3TAJA 4XKQA 3OSRA 4Q30B 1N84A 3RGYA 1POY1 1FCKA 3TTKA 5H8QB 2DXRA 5H8NA 4Z0IA 2UVGA 2PBWA 2AIXA 3EQ1A 4G8NA 4LATA 2QL3A 2XXRA 4IO2A 3RT8A 4OEUA 4FE8A 1TWYA 1SDXA 1XT8A 1MPBA 1USYE 4KYDA 4OYVA 1ATGA 4ZE8A 4MF3A 2OCUA 3KSJA 3SDFA 2Z8DA 1M5FA 2BJJX 1PC3A 1LCFA 1B4HA 3ONMA 2HAUA 1OLAA 1YAEA 3H7MA 5LOMA 3L6GA 5FHMA 2O1LA 3TMGA 1BLFA 3EPEA 1QJMA 5I2NA 4G2ZA 2AL4A 2VOZA 1MDQA 4R6YA 1AIVA 2O7IA 5CI5A 3TCFA 3PGFA 4G77A 1IXHA 4R6HA 3MVYA 4RXLA 3N6TA 4G8MA 3T9UA 3IAZA 4KPTA 2QMWA 3IL1B 1Y3QA 1PB9A 3FXRA 1ELJA 2ZXTA 4HCWA 1UTBB 1JNFA 3CG3A 5DT6A 3HSTA 1MXUA 3E3KA 2REGA 5CMCA 1ZTYA 3PUYE 4F1VA 5L9OA 4OWDA 2VGQA 1ZMGA 1DPPA 4MBPA 3FVOA 2HZLA 2GH9A 1MH4A 1JETA 4BDOA 1SQYA 4NF4A 3V8XB 1PB7A 3MQ9A 1B40A 4YKJA 1LBCA 1R9QA 5HBCA 4YB5A 3PUZE 2UXAA 2OJTA 5FTHA 1DTZA 1ZJLA 3G3JA 3HV1A 1B0LA 4H5FA 1O64A 2D5WA 5ITOA 3O97A 4ZZEA 1AL3A 5KDTA 5TPAA 3IJXB 1B3FA 4RPOA 3IK6B 4ELPA 4R73A 1BKAA 1PDAA 1XHYA 3VXBA 1OVTA 2Y7IA 2QJEA 4DXBA 1TFDA 3DELB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IITA 2G29A 3E79A 2H5YA 5DYHA 1FBPA 4GWZA 2XX8A 1F9BA 2F7AA 1T0KA 2PX1A 1N04A 4HE0A 3PPOA 4OZ9A 2RINA 3S9EA 4ZZAA 1FPFA 1IEJA 4QRZA 5BWJA 3DM0A 2XXIA 3R7XA 2AYSA 1MXZA 2QPQA 4YKIA 3THIA 4PFUA 1IIWA 2R8TA 4LQ2A 3TCGA 3FV2A 5EYFA 1N3XA 2MKZA 1VFEA 2OBGA 1SYIA 4KCDA 3G7WA 4G4PA 4NX1A 5I58B 1B1HA 4ZECA 5H8HB 3S9LC 3H6WA 3RPLB 5IZ3B 3OOAA 3JZJA 4GWWA 1FPDA 1FJ9A 1JQFA 2CMOA 1RYXA 3NOHA 1II5A 4YAHX 1US4A 3DP8A 3GBAA 4JSDA 3RTWB 4KYEA 2DP8A 3O9PA 4Z7EA 2VP1A 3LSWA 3FVNA 3B6QA 2OX3A 4H1XA 4NF6B 1Y3NA 2F36A 4JWYA 4WKMA 3UGWA 1FQAA 1BTJA 5JEIA 2I4CA 4OENA 2Z8EA 5H8SA 3RLFE 1SYHA 1LFIA 1QGXA 2ESNA 1NV1A 3K6VA 1N76A 2P2AA 1CB6A 3VVEA 3SEWA 1I6QA 1FBGA 3CR9A 4K3FA 3RY3A 2DSFA 1XC1A 4U4XA 3K6XA 4E0XA 4LZ7A 2IA4A 1Y4CA 3MVWA 3HPIA 4ZEIA 2I58A 2ZMBA 4POXA 1B5JA 3G3IA 3PPQA 1FTLA 1LBBA 4DXUA 4OXVA 2O68A 4RY1A 3MZ1A 3UN6A 3QSLA 3B6WA 3ZS6A 3M3KA 4F18A 3IJOB 4F39A 2ZYNA 1MPDA 3Q28A 3PMVA 4BDLA 3K1PA 5I2KB 3HO7A 3RYDA 3L6HA 3LSFB 4N8YA 3MUQA 2V3TA 1Y1ZA 4OQOA 4U1ZA 3Q25A 2ONRA 2PFZA 2NUVA 1CE2A 2P0SA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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