4HXPA

Brd4 bromodomain 1 complex with 4-(2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl)benzamide inhibitor
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
124
structure length
124
Chain Sequence
MNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Fragment-Based Drug Discovery of 2-Thiazolidinones as Inhibitors of the Histone Reader BRD4 Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Protein binding/inhibitor
total genus 44
structure length 124
sequence length 124
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hxpA01
4ALHA 4A9MA 3U5NA 5EWVA 4Z6HA 5F61A 5ACYA 3MXFA 5FE1A 5D25A 3QZVA 5A83A 4O72A 5A7CA 5DFBA 4WHWA 3HMHA 5DW2A 5I1QA 4ZQLA 5HRXA 4HXKA 1N72A 5FH7A 4QSQA 2OO1A 2RNXA 5CQTA 4UYGA 3IU6A 2YW5A 4PKLA 4KCXA 4OGIA 4YBMA 4YH3A 5CQ6A 3U5OA 5ETDA 5IBNA 4HBWA 4KV1A 5FE5A 3RCWA 4HXRA 4NQNA 5A81A 3UVWA 5BT5A 5CQ5A 3LQIA 5FFWA 5KO4A 3FKMX 4FLPA 5FG4A 5LKZA 5F1LA 4O75A 5F5ZA 2H60A 2GRCA 5LKXA 5HFQA 3D7CA 5DKHA 4QR3A 5H1TA 4LZ2A 4QNSA 4YY6A 4YABA 4QSVA 3UVDA 1WUGA 4PTBA 4YYKA 4NXJA 5DFCA 2L5EA 5FB0A 5EWCA 5I89A 5CZGA 4QYLA 4J0RA 4BW1A 5HEMA 3I3JA 3HMEA 5F25A 4YYNA 4NS5A 4UYEA 4QR5A 2D82A 4A9LA 4QZSA 4NYXA 5CGPA 4IOQA 5LJ2A 4XUAA 4TYLA 4CUQA 4TT6A 1EQFA 4WIVA 3U5LA 5A82A 4BW2A 3QZSA 5COIA 2MJVB 5C85A 4NR8A 5IGMA 4IR4A 4TT2A 5A5QA 4E96A 4QC1A 4HXMA 3S92A 4HXOA 5LKUA 4N4GA 5E9IA 5KTXA 5CQ8A 5II1A 3UV5A 5DKCA 5F36A 3JVJA 5KHMA 5D3LA 2WP2A 5I7YA 5CU8A 1F68A 5HCLA 3P5OA 3P1CA 4HXLA 2RI7A 5C4QA 4IOOA 2DVRA 5E3GA 4CUUA 5L96A 4TT4A 4QSUA 4C66A 4A9OA 2RNWA 5E9MA 4O7FA 3DAIA 5DYXA 5EP7A 5A5SA 2DATA 4CUPA 4XYAA 2I7KA 5D3NA 4TU6A 5JI8A 2KTBB 5EICA 3UV2A 4BJXA 4YYDA 4X2IA 4HBXA 5JWMA 4A9EA 4O71A 5ENBA 2D9EA 3LQHA 5E74A 5E7DA 5ENGA 4MR5A 4PS5A 4XY9A 4IORA 5IGLA 2R0SA 3O37A 5E3DA 4UIUA 5KU3A 5FE7A 4N3WA 4NUCA 5AMFA 4ZC9A 4RVRA 4YY4A 5DKDA 5D3TA 4CLBA 4UIXA 5A5RA 5H85A 4NYVA 4QUUA 5DX4A 4CFLA 2DVVA 2YQDA 5D24A 5ENFA 3UVYA 3MULA 3HMFA 2RO1A 5HQ7A 5II2A 2YDWA 2G4AA 5EGUA 5DBMA 4CURA 4HBVA 5EWWA 5ENCA 5FH8A 5L98A 5I80A 5F3AA 4PCIA 4QSPA 4J3IA 4MR3A 4QSWA 5I7XA 2F6NA 2R0VA 2NXBA 4A9NA 5CUCA 5D3PA 5IIDA 5CQ3A 5ETBA 4F3IA 5HRVA 5FE9A 4NR5A 5F63A 5H1VA 4QY4A 5CRZA 3MUKA 4ZW1A 3LXJA 3U5JA 2E3KA 4UYHA 4C67A 5E9LA 5FG6A 4AKNA 4YH4A 5CS8A 4BW3A 5C87A 2L85A 4LYWA 4XY8A 4A9KA 4PY6A 4NQMA 4LYIA 4QEUA 5H1UA 5LJ0A 5ENHA 5DLXA 4ALGA 4Z1QA 5EWDA 5HJCA 5HRWA 5EQ1A 5AD2A 5D3JA 2YEMA 4YYIA 3U5KA 4NRAA 4A9HA 4LZRA 5CPEA 4O70A 5D7XA 2OSSA 5DLZA 2YEKA 3DWYA 2YYNA 3O36A 5EV9A 3O35A 3U5MA 5J0DA 4J0SA 4UYFA 3UVXA 5LJ1A 5I83A 4IR6A 5FG5A 3MB4A 4OGJA 4YYHA 4YADA 1WUMA 4NYWA 3P1FA 5IG6A 4CL9A 3Q2EA 2WP1A 5C7NA 5FDZA 4Y03A 3G0JA 5F62A 4YYJA 4NR7A 5DW1A 4DONA 5CY9A 2F6JA 5I29A 4N4FA 5CUGA 3LQJA 5AD3A 4Z1SA 5I40A 5EVAA 4MR4A 2L84A 5ENIA 4NRBA 4LC2A 3P1EA 5TB6A 5CUBA 5FE0A 3G0LA 5A5PA 4LR6A 5BT4A 3ONIA 2DWWA 4XUBA 5TCMA 4YBSA 3SVHA 5LVRA 5CP5A 3O34A 5A5NA 5LUUA 5FFVA 3LJWA 4Q0NA 5L99A 2OUOA 5DYUA 5EPRA 4TZ8A 3U5PA 5FE3A 5CQAA 3UW9A 4QBMA 2N9GA 4TU4A 4YATA 1X0JA 4UIZA 5DYCA 5FE2A 4KV4A 5D3HA 4UIYA 5AMEA 4QSSA 2DKWA 4HXNA 5HQ5A 4IR3A 4TQNA 3O33A 4HBYA 4MEPA 4HXSA 4QEVA 4GPJA 5HQ6A 3Q2FA 2E7OA 4WHUA 4NRCA 3QZTA 5EI4A 4YYGA 5A5OA 3JVLA 5E9VA 3UV4A 5G4RA 4N4IA 4TTEA 5BT3A 5F2PA 4TS8A 4LDFA 4PCEA 4NR6A 4Z93A 5EISA 5K29A 4LRGA 4QYDA 4QR4A 4MEQA 5HFRA 4O78A 5EM3A 4UIWA 4BHWA 2E7NA 5CQ4A 4LZSA 5LVQA 2FSAA 5FE6A 5CUAA 1JM4B 4O7BA 4CUTA 5EPBA 5F1HA 3JVMA 5CFWA 4Z6IA 4HXPA 4NUDA 4A9JA 2R0YA 3MB3A 2DVQA 5E73A 5CUEA 5ENEA 4A9FA 5LKTA 5L97A 5C89A 5EPSA 4YAXA 5A85A 5EK9A 2I8NA 4IR5A 4MEOA 4YC9A 4YBTA 4CUSA 5ENJA 2R10A 4QSXA 5FB1A 5D0CA 4QSRA 3TLPA 5I86A 4MENA 5L8TA 4QB3A 1ZS5A 4UIVA 2RFJA 4O7AA 5DYAA 4QSTA 5L8UA 5HLSA 5EWHA 5FE4A 4CFKA 3NXBA 4YK0A 5CUDA 1E6IA 5I88A 4N4HA 3IU5A 5C8GA 5F60A 5D26A 4Q0OA 5CTLA 3AQAA 5E0RA 5CRMA 4O7EA 2YELA 3AADA 4LYSA 4QUTA 2RS9B 3P1DA 4J1PA 5FFYA 3SVGA 5IGNA 4UYFB 4O77A 4TZ2A 5G4SA 3ZYUA 2LSPB 5D3SA 3S91A 3SVFA 4MR6A 5HM0A 5EA1A 5FBXA 5D3RA 5HENA 5KTWA 4OUFA 4O74A 5CQ7A 5DFDA 4QEWA 3GG3A 4A9IA 4UITA 4YYMA 3JVKA 5E9KA 5IGKA 5HELA 4NR4A 4O7CA 2RNYA 5FE8A 4UYDA 4BW4A 4QC3A 5E9YA 2DVSA 4NUEA 5FH6A 5DY7A 3K2JA 5KTUA 4NR9A 5EU1A 1JSPB 3MQMA 4O76A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ALHA 4A9MA 3U5NA 5EWVA 4Z6HA 5F61A 5ACYA 3MXFA 5FE1A 5D25A 3VKGA 3QZVA 5A83A 4O72A 5A7CA 5DFBA 4WHWA 3HMHA 5DW2A 5I1QA 4ZQLA 5HRXA 4HXKA 1N72A 5FH7A 4QSQA 2OO1A 2RNXA 5CQTA 4UYGA 3IU6A 2YW5A 4PKLA 4KCXA 4OGIA 4YBMA 4YH3A 5CQ6A 3U5OA 5ETDA 5IBNA 4HBWA 4KV1A 5FE5A 3RCWA 4HXRA 4NQNA 5A81A 3UVWA 5BT5A 5CQ5A 3LQIA 5FFWA 5KO4A 3FKMX 4FLPA 5FG4A 5LKZA 5F1LA 3D1DA 4O75A 5F5ZA 2H60A 2GRCA 5LKXA 5HFQA 3D7CA 5DKHA 4QR3A 5H1TA 4LZ2A 4QNSA 4YY6A 4YABA 4QSVA 3UVDA 1WUGA 4PTBA 4YYKA 4NXJA 5DFCA 2L5EA 5FB0A 5EWCA 5I89A 5CZGA 4QYLA 4J0RA 4BW1A 5HEMA 3I3JA 3HMEA 5F25A 4YYNA 4NS5A 4UYEA 4QR5A 2D82A 4A9LA 4QZSA 4NYXA 5CGPA 4IOQA 5LJ2A 4XUAA 4TYLA 4CUQA 4TT6A 1EQFA 4WIVA 3U5LA 5A82A 4BW2A 3QZSA 5COIA 2MJVB 5C85A 4NR8A 5IGMA 4IR4A 4TT2A 5A5QA 4E96A 4QC1A 4HXMA 3S92A 4HXOA 5LKUA 4N4GA 5E9IA 5KTXA 5CQ8A 5II1A 3UV5A 5DKCA 5F36A 3JVJA 5KHMA 5D3LA 2WP2A 5I7YA 5CU8A 1F68A 5HCLA 3P5OA 3P1CA 4HXLA 2RI7A 5C4QA 4IOOA 2DVRA 5E3GA 4CUUA 5L96A 4TT4A 4QSUA 4C66A 4A9OA 2RNWA 5E9MA 4O7FA 3DAIA 5DYXA 5EP7A 5A5SA 2DATA 4CUPA 4XYAA 2I7KA 5D3NA 1PUOA 4TU6A 5JI8A 2KTBB 5EICA 3UV2A 4BJXA 4YYDA 4X2IA 4HBXA 5JWMA 4A9EA 4O71A 5ENBA 2D9EA 3LQHA 5E74A 5E7DA 5ENGA 4MR5A 4PS5A 4XY9A 4IORA 5IGLA 2R0SA 3O37A 5E3DA 4UIUA 5KU3A 5FE7A 4N3WA 4NUCA 5AMFA 4ZC9A 4RVRA 4YY4A 5DKDA 5D3TA 4CLBA 4UIXA 5A5RA 5H85A 4NYVA 4QUUA 5DX4A 4CFLA 2DVVA 2YQDA 5D24A 5ENFA 3UVYA 3MULA 3HMFA 2RO1A 5HQ7A 5II2A 2YDWA 2G4AA 5EGUA 5DBMA 4CURA 4HBVA 5EWWA 5ENCA 5FH8A 5L98A 4AKIA 5I80A 5F3AA 4PCIA 4QSPA 4J3IA 4MR3A 4QSWA 5I7XA 2F6NA 2R0VA 2NXBA 4A9NA 5CUCA 5D3PA 5IIDA 5CQ3A 5ETBA 4F3IA 5HRVA 5FE9A 4NR5A 5F63A 5H1VA 4QY4A 5CRZA 3MUKA 4ZW1A 3LXJA 3U5JA 2E3KA 4UYHA 4C67A 5E9LA 5FG6A 4AKNA 4YH4A 5CS8A 4BW3A 5C87A 2L85A 4LYWA 4XY8A 4A9KA 4PY6A 4NQMA 4LYIA 4QEUA 5H1UA 3VKHA 5LJ0A 5ENHA 5DLXA 4ALGA 4Z1QA 5EWDA 5HJCA 5HRWA 5EQ1A 5AD2A 5D3JA 2YEMA 4YYIA 3U5KA 4NRAA 4A9HA 3D1BA 4LZRA 5CPEA 4O70A 5D7XA 2OSSA 5DLZA 2YEKA 3DWYA 2YYNA 3O36A 5EV9A 3O35A 3U5MA 5J0DA 4J0SA 4UYFA 3UVXA 5LJ1A 5I83A 4IR6A 5FG5A 3MB4A 4OGJA 4YYHA 4YADA 1WUMA 4NYWA 3P1FA 5IG6A 4CL9A 3Q2EA 2WP1A 5C7NA 5FDZA 4Y03A 3G0JA 5F62A 4YYJA 4NR7A 4AI6A 5DW1A 4DONA 5CY9A 2F6JA 5I29A 4N4FA 5CUGA 3LQJA 5AD3A 4Z1SA 5I40A 5EVAA 4MR4A 2L84A 5ENIA 4NRBA 4LC2A 3P1EA 5TB6A 5CUBA 5FE0A 3G0LA 1ZKRA 5A5PA 4LR6A 5BT4A 3ONIA 2DWWA 4XUBA 5TCMA 4YBSA 3SVHA 5LVRA 5CP5A 3O34A 5A5NA 5LUUA 5FFVA 3LJWA 4Q0NA 5L99A 2OUOA 5DYUA 5EPRA 4TZ8A 3U5PA 5FE3A 5CQAA 3UW9A 4QBMA 2N9GA 4TU4A 4YATA 1X0JA 4UIZA 5DYCA 5FE2A 4KV4A 5D3HA 4UIYA 4AKHA 5AMEA 4QSSA 2DKWA 4HXNA 5HQ5A 4IR3A 4TQNA 3O33A 4HBYA 4MEPA 4HXSA 4QEVA 4GPJA 5HQ6A 3Q2FA 2E7OA 4WHUA 4NRCA 3QZTA 5EI4A 4YYGA 5A5OA 3JVLA 5E9VA 3UV4A 5G4RA 4N4IA 4TTEA 5BT3A 5F2PA 4TS8A 4LDFA 4PCEA 4NR6A 4Z93A 5EISA 5K29A 4LRGA 4AKGA 4QYDA 4QR4A 4MEQA 5HFRA 4O78A 5EM3A 4UIWA 4BHWA 2E7NA 5CQ4A 4LZSA 5LVQA 2FSAA 5FE6A 5CUAA 1JM4B 4O7BA 4CUTA 5EPBA 5F1HA 3JVMA 5CFWA 4Z6IA 4HXPA 4NUDA 4A9JA 2R0YA 3MB3A 2DVQA 5E73A 5CUEA 5ENEA 4A9FA 5LKTA 5L97A 5C89A 5EPSA 4YAXA 5A85A 5EK9A 2I8NA 4IR5A 4MEOA 4YC9A 4YBTA 4CUSA 5ENJA 2R10A 4QSXA 5FB1A 5D0CA 4QSRA 3TLPA 5I86A 4MENA 5L8TA 4QB3A 1ZS5A 4UIVA 2RFJA 4O7AA 5DYAA 4QSTA 5L8UA 5HLSA 5EWHA 5FE4A 4CFKA 3NXBA 4YK0A 5CUDA 1E6IA 5I88A 4N4HA 3IU5A 5C8GA 5F60A 5D26A 4Q0OA 5CTLA 3AQAA 5E0RA 5CRMA 4O7EA 2YELA 3AADA 4LYSA 4QUTA 2RS9B 3P1DA 4J1PA 5FFYA 3SVGA 5IGNA 4UYFB 4O77A 4TZ2A 5G4SA 3ZYUA 2LSPB 5D3SA 3S91A 3SVFA 4MR6A 5HM0A 5EA1A 5FBXA 5D3RA 5HENA 5KTWA 4OUFA 4O74A 5CQ7A 5DFDA 4QEWA 3GG3A 4A9IA 4UITA 4YYMA 3JVKA 5E9KA 5IGKA 2EJNA 5HELA 4NR4A 4O7CA 2RNYA 5FE8A 4UYDA 4BW4A 4QC3A 5E9YA 2DVSA 4NUEA 5FH6A 5DY7A 3ERRA 3K2JA 5KTUA 4NR9A 5EU1A 1JSPB 3MQMA 4O76A
chains in the Genus database with same CATH topology
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