4HXPA

Brd4 bromodomain 1 complex with 4-(2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl)benzamide inhibitor
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
124
structure length
124
Chain Sequence
MNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Protein binding/inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Fragment-Based Drug Discovery of 2-Thiazolidinones as Inhibitors of the Histone Reader BRD4 Bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
total genus 44
structure length 124
sequence length 124
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hxpA01
4N4HA 4HBVA 5KO4A 4OGIA 4A9HA 3O37A 4IR3A 3O36A 5DFBA 5FG4A 4N4FA 5FH7A 5LUUA 4CUTA 3U5JA 5AMEA 5EQ1A 4QYLA 4NRAA 5FE3A 3P5OA 4BHWA 2F6NA 5CUGA 4LYWA 5ENIA 5CTLA 4O7CA 4J3IA 3UVDA 5EWHA 4DONA 5HQ6A 4UIZA 5CGPA 4A9OA 5D24A 4QC3A 5ACYA 4TU4A 4NQMA 3Q2FA 2FSAA 5CS8A 3D7CA 4IORA 5EWCA 5ETDA 5EWWA 4QBMA 5E9IA 5F1LA 5HQ7A 4J0RA 3U5MA 5EWDA 5EA1A 4N3WA 4LC2A 4YY4A 4QSWA 5EK9A 5E73A 4YYDA 2R0YA 4NR7A 3UVWA 2OO1A 3SVHA 4LYSA 4XUBA 2YQDA 4O77A 5ENFA 3JVLA 5LKUA 4CUSA 5CUCA 5D3NA 5CUEA 5DYAA 3U5LA 4QUUA 4N4IA 4F3IA 3DAIA 4CUPA 2F6JA 3JVKA 5FB1A 5TB6A 5BT4A 4YH3A 3P1EA 5DY7A 4QB3A 4YADA 3JVMA 5EVAA 5H1VA 5IGNA 4A9EA 4PS5A 4HXKA 3O35A 5I1QA 5I40A 2DATA 4TZ2A 5E9KA 4MR5A 4NR8A 4YYGA 5FE6A 4XY8A 5DKCA 5LJ0A 5D26A 2WP1A 4MR3A 5ENCA 4IOQA 5F63A 5EI4A 4Z1SA 4NR5A 5CPEA 5I29A 4UYHA 4UYFB 4Z93A 4QEUA 2YELA 4O70A 2GRCA 4O7BA 3LQHA 5KTWA 2DKWA 4YBMA 5CP5A 5EWVA 5LVRA 4TU6A 5D3HA 5D3JA 4TT4A 5F2PA 4Z6HA 4QYDA 2L84A 4PKLA 5J0DA 1WUGA 3ONIA 4A9JA 4YY6A 5H1TA 5FE1A 5CRMA 3I3JA 5DLZA 3K2JA 4HXSA 5FG6A 4YYNA 4QEVA 3LQIA 2H60A 2I8NA 5CQ6A 5F60A 4XY9A 4N4GA 3U5PA 5EP7A 5F5ZA 5I7XA 2YEMA 3Q2EA 5FG5A 5DX4A 3SVGA 4YH4A 5L97A 3LJWA 3UV4A 4QR4A 4YK0A 2DVSA 3FKMX 2RNYA 3U5KA 3HMEA 1JM4B 4NS5A 5DYUA 4QSRA 5DFDA 4YYJA 5LVQA 5DKDA 4PY6A 5HRXA 5DW1A 5LKXA 4UIVA 5E3GA 4QSSA 4A9LA 5F62A 5FB0A 4KCXA 4NUDA 4GPJA 5LKZA 4O74A 3O34A 4WIVA 5HJCA 3IU5A 5EGUA 5FE8A 5HFRA 5FE9A 3GG3A 2YEKA 2RS9B 5G4SA 5EM3A 3G0JA 4UITA 4WHWA 5CQ4A 2R10A 4MR4A 5HLSA 4LZ2A 2KTBB 4O7AA 4XUAA 5G4RA 4A9NA 5FBXA 5HM0A 4E96A 5F36A 4YYIA 4NYXA 5DYXA 4Z1QA 4O78A 5L8UA 5D3TA 4BW2A 3SVFA 5AD2A 5I80A 3UVYA 1X0JA 4TZ8A 4C66A 4PCEA 5KU3A 5EPRA 5TCMA 4UIUA 4OUFA 4HXRA 4LRGA 5D3RA 5I88A 2R0VA 4KV4A 5FE4A 2DVRA 4O7FA 4HXNA 5F61A 3TLPA 4YC9A 4A9IA 3MQMA 5DYCA 4TS8A 4PCIA 4YABA 2G4AA 4FLPA 4HXPA 4LR6A 5E0RA 5EU1A 5C4QA 5EPSA 5CQAA 4A9MA 2LSPB 4YATA 4YAXA 1EQFA 4A9KA 5D3PA 5HFQA 2YDWA 3QZSA 4NUCA 5C89A 5D3SA 4NUEA 5FH8A 4HXOA 4YYHA 4MEPA 5A83A 3AADA 2YW5A 5A81A 2E3KA 5ENHA 3U5OA 4BW1A 1JSPB 5CQ5A 5LJ2A 5DFCA 5FH6A 3P1DA 5CUBA 4LYIA 5E9VA 1N72A 3QZTA 4PTBA 5EV9A 1WUMA 5FE5A 5LJ1A 4NYWA 4TTEA 4TYLA 4QSXA 5D7XA 4QSQA 5BT3A 5KTUA 4IR4A 5C85A 4NR4A 4Q0OA 5CRZA 2WP2A 4ALHA 3G0LA 5JI8A 4O7EA 5HEMA 4HXLA 2RNXA 5AD3A 2OSSA 5CUDA 4IR6A 5H85A 2I7KA 4QZSA 2RFJA 4WHUA 5CU8A 5L96A 5FDZA 3UV5A 4MEQA 5FFYA 1E6IA 5ENEA 2E7NA 3S92A 4YYMA 3IU6A 3DWYA 2YYNA 4RVRA 4LZSA 5F1HA 4NRCA 5K29A 4Q0NA 1ZS5A 5C8GA 4TT2A 4QR5A 5DLXA 5D25A 4ZW1A 4QY4A 5CFWA 5A5QA 3RCWA 4CURA 3UVXA 5A7CA 5L99A 4QSPA 5HENA 5IBNA 5ENBA 3U5NA 4OGJA 2N9GA 2DVQA 2DWWA 4QUTA 4XYAA 4A9FA 4CFLA 5IG6A 4UIWA 4UIXA 2OUOA 5DBMA 4ALGA 5C7NA 3MB3A 5CQTA 4QR3A 5DKHA 5F25A 4O76A 4ZC9A 4UYFA 4QSTA 5L8TA 3S91A 4CL9A 4NR9A 4Y03A 5A5PA 4CUUA 4QSVA 5C87A 3QZVA 4YBSA 4CUQA 4YYKA 5I86A 5CQ7A 5D0CA 5HRWA 4UIYA 4C67A 5II2A 3JVJA 5HCLA 4QNSA 5II1A 4HBYA 4BW4A 2MJVB 4J1PA 4LDFA 3AQAA 5COIA 5ENJA 5LKTA 3HMHA 4J0SA 2D82A 5IGLA 4TT6A 5FE2A 3P1CA 5A5RA 5HQ5A 4ZQLA 3MULA 5E9MA 4QC1A 3ZYUA 2L85A 4IR5A 5H1UA 5IGMA 5FFVA 4MENA 3O33A 5I7YA 5A5OA 4YBTA 3MB4A 4Z6IA 4QSUA 4NR6A 5E9LA 5L98A 2D9EA 5CQ8A 5A5SA 5IGKA 4NRBA 2L5EA 5ENGA 3MXFA 5EICA 3LXJA 5FFWA 4O71A 4CFKA 5E3DA 2R0SA 5D3LA 4BJXA 2RO1A 5F3AA 5AMFA 5E9YA 5KHMA 3HMFA 4QEWA 5EISA 5HRVA 4NYVA 4HBXA 4MR6A 5CUAA 4AKNA 2E7OA 5EPBA 5DW2A 3LQJA 5I89A 2RNWA 4NXJA 2DVVA 4MEOA 5FE0A 5JWMA 5ETBA 5CQ3A 2RI7A 5CZGA 4CLBA 4UYDA 3MUKA 4HBWA 5I83A 1F68A 5A5NA 5CY9A 3UV2A 5HELA 4IOOA 4O75A 4UYGA 4NQNA 2NXBA 4X2IA 3P1FA 4LZRA 4HXMA 5A85A 5FE7A 4O72A 4TQNA 5IIDA 5A82A 5BT5A 5KTXA 3NXBA 3UW9A 4KV1A 4BW3A 5E74A 4UYEA 5E7DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N4HA 4HBVA 5KO4A 4OGIA 4A9HA 3O37A 4IR3A 3O36A 5DFBA 5FG4A 4N4FA 5FH7A 5LUUA 4CUTA 3U5JA 5AMEA 5EQ1A 4QYLA 4NRAA 5FE3A 3P5OA 4BHWA 2F6NA 5CUGA 4LYWA 5ENIA 5CTLA 4O7CA 4J3IA 3UVDA 5EWHA 2EJNA 4DONA 5HQ6A 4UIZA 5CGPA 4A9OA 5D24A 4QC3A 5ACYA 4TU4A 4NQMA 3Q2FA 2FSAA 5CS8A 3D7CA 4IORA 5EWCA 5ETDA 5EWWA 4QBMA 5E9IA 5F1LA 5HQ7A 4J0RA 3U5MA 5EWDA 5EA1A 4N3WA 4LC2A 4YY4A 4QSWA 5EK9A 5E73A 4YYDA 2R0YA 4NR7A 3UVWA 2OO1A 3SVHA 4LYSA 4XUBA 2YQDA 4O77A 5ENFA 3JVLA 5LKUA 4CUSA 5CUCA 5D3NA 5CUEA 5DYAA 3U5LA 4QUUA 4N4IA 4F3IA 3DAIA 4CUPA 2F6JA 3JVKA 5FB1A 5TB6A 5BT4A 4AI6A 4YH3A 3P1EA 5DY7A 4QB3A 4YADA 3JVMA 5EVAA 5H1VA 5IGNA 4A9EA 4PS5A 4HXKA 3O35A 5I1QA 5I40A 2DATA 4TZ2A 5E9KA 4MR5A 4NR8A 4YYGA 5FE6A 4XY8A 5DKCA 5LJ0A 5D26A 2WP1A 4MR3A 5ENCA 4IOQA 5F63A 5EI4A 4Z1SA 4NR5A 5CPEA 5I29A 4UYHA 4UYFB 4Z93A 4QEUA 2YELA 4O70A 2GRCA 4O7BA 3LQHA 5KTWA 2DKWA 4YBMA 5CP5A 5EWVA 5LVRA 4TU6A 5D3HA 5D3JA 4TT4A 5F2PA 4Z6HA 4QYDA 2L84A 4PKLA 5J0DA 1WUGA 3ONIA 4A9JA 4YY6A 5H1TA 5FE1A 5CRMA 3I3JA 5DLZA 3K2JA 4HXSA 5FG6A 4YYNA 4QEVA 3LQIA 2H60A 2I8NA 5CQ6A 5F60A 4XY9A 4N4GA 3U5PA 5EP7A 5F5ZA 5I7XA 2YEMA 3Q2EA 5FG5A 5DX4A 3SVGA 4YH4A 5L97A 3LJWA 3UV4A 4QR4A 4YK0A 2DVSA 3FKMX 2RNYA 3U5KA 3HMEA 1JM4B 4NS5A 5DYUA 4QSRA 5DFDA 4YYJA 5LVQA 5DKDA 4PY6A 5HRXA 5DW1A 5LKXA 4UIVA 5E3GA 4QSSA 1ZKRA 4A9LA 5F62A 5FB0A 4KCXA 4NUDA 4GPJA 5LKZA 4O74A 3O34A 4WIVA 5HJCA 3IU5A 5EGUA 5FE8A 5HFRA 5FE9A 3GG3A 3VKGA 2YEKA 2RS9B 5G4SA 5EM3A 3G0JA 4UITA 4WHWA 5CQ4A 2R10A 3ERRA 4MR4A 5HLSA 3VKHA 4LZ2A 2KTBB 4O7AA 4XUAA 5G4RA 4A9NA 5FBXA 5HM0A 4E96A 4AKHA 5F36A 4YYIA 4NYXA 5DYXA 4Z1QA 4O78A 5L8UA 5D3TA 4BW2A 3SVFA 5AD2A 5I80A 3UVYA 1X0JA 4TZ8A 4C66A 4PCEA 5KU3A 5EPRA 5TCMA 4UIUA 4OUFA 4HXRA 4LRGA 5D3RA 5I88A 2R0VA 4KV4A 5FE4A 2DVRA 4O7FA 4HXNA 5F61A 3TLPA 4YC9A 4A9IA 3MQMA 5DYCA 4TS8A 4PCIA 4YABA 2G4AA 4FLPA 4HXPA 4LR6A 5E0RA 5EU1A 5C4QA 5EPSA 5CQAA 4A9MA 4AKGA 2LSPB 4YATA 4YAXA 1EQFA 4A9KA 5D3PA 5HFQA 2YDWA 3QZSA 4NUCA 5C89A 5D3SA 4NUEA 5FH8A 3D1DA 4HXOA 4YYHA 4MEPA 5A83A 3AADA 2YW5A 5A81A 2E3KA 5ENHA 3U5OA 4BW1A 1JSPB 5CQ5A 5LJ2A 5DFCA 5FH6A 3P1DA 5CUBA 4LYIA 5E9VA 1N72A 3QZTA 4PTBA 5EV9A 1WUMA 5FE5A 5LJ1A 4NYWA 4TTEA 4TYLA 4QSXA 5D7XA 4QSQA 5BT3A 5KTUA 4IR4A 5C85A 4NR4A 4Q0OA 5CRZA 2WP2A 4ALHA 3G0LA 5JI8A 4O7EA 5HEMA 4HXLA 2RNXA 5AD3A 2OSSA 5CUDA 4IR6A 5H85A 2I7KA 4QZSA 2RFJA 4WHUA 3D1BA 5CU8A 5L96A 5FDZA 3UV5A 4MEQA 5FFYA 1E6IA 5ENEA 2E7NA 3S92A 4YYMA 3IU6A 3DWYA 2YYNA 4RVRA 4LZSA 5F1HA 4NRCA 5K29A 4Q0NA 1ZS5A 5C8GA 4TT2A 4QR5A 5DLXA 1PUOA 5D25A 4AKIA 4ZW1A 4QY4A 5CFWA 5A5QA 3RCWA 4CURA 3UVXA 5A7CA 5L99A 4QSPA 5HENA 5IBNA 5ENBA 3U5NA 4OGJA 2N9GA 2DVQA 2DWWA 4QUTA 4XYAA 4A9FA 4CFLA 5IG6A 4UIWA 4UIXA 2OUOA 5DBMA 4ALGA 5C7NA 3MB3A 5CQTA 4QR3A 5DKHA 5F25A 4O76A 4ZC9A 4UYFA 4QSTA 5L8TA 3S91A 4CL9A 4NR9A 4Y03A 5A5PA 4CUUA 4QSVA 5C87A 3QZVA 4YBSA 4CUQA 4YYKA 5I86A 5CQ7A 5D0CA 5HRWA 4UIYA 4C67A 5II2A 3JVJA 5HCLA 4QNSA 5II1A 4HBYA 4BW4A 2MJVB 4J1PA 4LDFA 3AQAA 5COIA 5ENJA 5LKTA 3HMHA 4J0SA 2D82A 5IGLA 4TT6A 5FE2A 3P1CA 5A5RA 5HQ5A 4ZQLA 3MULA 5E9MA 4QC1A 3ZYUA 2L85A 4IR5A 5H1UA 5IGMA 5FFVA 4MENA 3O33A 5I7YA 5A5OA 4YBTA 3MB4A 4Z6IA 4QSUA 4NR6A 5E9LA 5L98A 2D9EA 5CQ8A 5A5SA 5IGKA 4NRBA 2L5EA 5ENGA 3MXFA 5EICA 3LXJA 5FFWA 4O71A 4CFKA 5E3DA 2R0SA 5D3LA 4BJXA 2RO1A 5F3AA 5AMFA 5E9YA 5KHMA 3HMFA 4QEWA 5EISA 5HRVA 4NYVA 4HBXA 4MR6A 5CUAA 4AKNA 2E7OA 5EPBA 5DW2A 3LQJA 5I89A 2RNWA 4NXJA 2DVVA 4MEOA 5FE0A 5JWMA 5ETBA 5CQ3A 2RI7A 5CZGA 4CLBA 4UYDA 3MUKA 4HBWA 5I83A 1F68A 5A5NA 5CY9A 3UV2A 5HELA 4IOOA 4O75A 4UYGA 4NQNA 2NXBA 4X2IA 3P1FA 4LZRA 4HXMA 5A85A 5FE7A 4O72A 4TQNA 5IIDA 5A82A 5BT5A 5KTXA 3NXBA 3UW9A 4KV1A 4BW3A 5E74A 4UYEA 5E7DA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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