4HXPA

Brd4 bromodomain 1 complex with 4-(2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl)benzamide inhibitor
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
124
structure length
124
Chain Sequence
b'MNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Fragment-Based Drug Discovery of 2-Thiazolidinones as Inhibitors of the Histone Reader BRD4 Bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
source organism Homo sapiens
molecule tags Protein binding/inhibitor
total genus 44
structure length 124
sequence length 124
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hxpA01
2YEKA 5EWWA 5F2PA 3UVYA 4BJXA 4MR5A 4YABA 5AMFA 5FE3A 2R0VA 4PS5A 5D3PA 4XYAA 4NR8A 4LYSA 3UV4A 4CLBA 2DVSA 4QSVA 4QC3A 4YY6A 4J3IA 5EP7A 4NS5A 4N4FA 4TS8A 2N9GA 4HXRA 3LQIA 5I7YA 5DYCA 2GRCA 4NR9A 5D3SA 4A9MA 3U5NA 4CUPA 4NR5A 2YDWA 3LQJA 4MENA 5KHMA 5CFWA 5FE5A 5FH8A 2D9EA 3FKMX 1X0JA 5FDZA 5L98A 3UV2A 4UIXA 2YW5A 5LVQA 5IGKA 3JVJA 3MQMA 4YYMA 5ENBA 4O7EA 1N72A 3AQAA 3JVKA 5EWDA 4C67A 2F6NA 4QR5A 4YBMA 4OGJA 5L8TA 5FE6A 5FE8A 5CU8A 2YYNA 5EK9A 5FFYA 3MB4A 3SVFA 4LYWA 5IG6A 4QB3A 3QZTA 5II1A 4Z1QA 4CL9A 5L99A 5FFWA 3JVMA 2H60A 4ZC9A 4QY4A 5A82A 3SVHA 5DLZA 5BT4A 5LUUA 5IIDA 2E7NA 4O72A 5FE7A 2WP1A 4NYXA 4O7BA 5TB6A 4ZW1A 4A9HA 5C8GA 4MR3A 5CQ5A 5C4QA 5LKXA 2L5EA 4MEPA 4QUUA 3MB3A 4IORA 4O77A 4LZSA 5CP5A 5LKTA 4O74A 4Z93A 5F1HA 4O7CA 5DYXA 3UVWA 4QUTA 4A9FA 5F62A 2YEMA 5HLSA 4O7FA 4E96A 3UW9A 4Z6HA 3U5MA 4YATA 5ENGA 4MR4A 4QYLA 4YC9A 4DONA 4TZ8A 4YAXA 5DYAA 5ETBA 4IR3A 2R0YA 5D3TA 4YADA 3GG3A 5A81A 5FH7A 4ZQLA 5CUAA 4CFLA 5I29A 4QZSA 5D3NA 3LQHA 5A5PA 4TU6A 4YBTA 4NYWA 4KV1A 5EWVA 5FH6A 5CPEA 4C66A 5KTXA 5CS8A 5HJCA 5E73A 4YYNA 4Z6IA 4NRCA 3QZVA 4QSSA 4XY9A 4NQNA 3U5JA 4LC2A 4YYHA 4HXPA 5BT3A 4HXLA 2OUOA 3HMEA 4UIVA 5CY9A 4PCEA 5DY7A 4HBVA 5E3GA 4CUTA 4X2IA 2RNYA 5HFRA 4O78A 5CUGA 3MULA 4NUDA 5AD2A 5TCMA 5I88A 5D3RA 5I7XA 4A9LA 4QSQA 5C7NA 4Q0OA 1JM4B 5EVAA 3I3JA 3DAIA 3P5OA 5E9MA 4A9NA 4TT6A 4UIWA 5DYUA 3S92A 5K29A 2L84A 4OGIA 3P1DA 4YYJA 4MR6A 5BT5A 5C89A 3IU5A 3JVLA 5A85A 5A5QA 4NRBA 2DATA 3U5OA 5L97A 5HFQA 4CURA 5HRWA 1JSPB 5AMEA 3O37A 5D3HA 5F25A 4HBWA 5ENCA 3Q2EA 4ALGA 2F6JA 5CQ3A 5KU3A 3P1FA 3O35A 5A5OA 3ONIA 4CFKA 5E74A 4NYVA 4HXOA 5EICA 3TLPA 4CUSA 5FG5A 4QSTA 4MEQA 5FB0A 4PY6A 4NXJA 4UYFA 3IU6A 2DVRA 4YYIA 1WUGA 5ACYA 4QNSA 4FLPA 4NR7A 4UITA 4YH4A 5HM0A 4O75A 2I7KA 4QSXA 2RS9B 5D7XA 4GPJA 4KCXA 2DWWA 5FG4A 5FE2A 4UYFB 5H1TA 4NRAA 5HCLA 2RNWA 3SVGA 2RI7A 5CQ4A 4QSUA 4BW3A 5HQ6A 5E9KA 3K2JA 5IGNA 5FE4A 5DFDA 4NR6A 2E3KA 4NR4A 4QR4A 1WUMA 4O7AA 4PCIA 4QEWA 5ETDA 3O34A 4CUUA 5F60A 1E6IA 5E9YA 2WP2A 4NUEA 4QEUA 5FB1A 5CQTA 5I80A 1EQFA 5J0DA 3D7CA 4HXMA 2D82A 5JWMA 5E7DA 5D26A 4A9OA 4YY4A 4IR4A 4YK0A 4TT2A 4HBYA 5ENHA 3U5LA 5CUDA 4PTBA 2RFJA 3P1EA 4WHWA 5I40A 5DBMA 4TYLA 4LDFA 3O33A 2R0SA 5EM3A 5HEMA 5F63A 4MEOA 4LZ2A 5CQAA 5LKZA 4UIUA 5LJ0A 5EWHA 3DWYA 5DFBA 3QZSA 3P1CA 2NXBA 5CGPA 5I1QA 5L96A 5EISA 5KTUA 2OSSA 4RVRA 5D3LA 4UYGA 2YQDA 5EPRA 5EWCA 4J0RA 2MJVB 4YH3A 5IGLA 5CZGA 4TQNA 5H1UA 2E7OA 5I86A 4TU4A 5F36A 3S91A 4YBSA 5CQ6A 4IOQA 4N4IA 5F5ZA 2FSAA 5LKUA 4OUFA 4ALHA 2LSPB 4UIYA 5A5NA 5D0CA 1F68A 3HMHA 5DFCA 4QC1A 4J0SA 4XUBA 4AKNA 4QSWA 3RCWA 5C87A 5F61A 5E9LA 2G4AA 3U5PA 3G0JA 3UVDA 2R10A 5DKHA 5EPBA 4UYHA 5DKCA 3AADA 5CRZA 5E9VA 4HBXA 5EPSA 5CTLA 5A5SA 5II2A 5HENA 4KV4A 4UYDA 4HXKA 5CRMA 5E9IA 5EI4A 4IR6A 4A9IA 3HMFA 5EV9A 4PKLA 4HXSA 5LJ1A 5EA1A 2L85A 5JI8A 5A7CA 5IGMA 4BW1A 3ZYUA 5LJ2A 4TT4A 5I89A 2OO1A 5DKDA 5A83A 5FG6A 5FBXA 4BW4A 5HQ7A 5CUBA 5KO4A 4TZ2A 3NXBA 5COIA 3Q2FA 3UVXA 5G4SA 4YYGA 4J1PA 5C85A 5DW2A 4YYKA 5ENJA 4N4GA 5D3JA 5I83A 3O36A 5HRVA 5A5RA 5HQ5A 5LVRA 4A9JA 4Q0NA 4QSRA 5DW1A 5F1LA 2YELA 5AD3A 4LRGA 5H85A 5F3AA 4O70A 4BHWA 5ENIA 4LZRA 5EU1A 5HELA 3LJWA 5E0RA 3MUKA 4XUAA 4NUCA 4QEVA 5DLXA 2DVQA 3MXFA 5EQ1A 4UYEA 4O76A 4A9EA 2RO1A 4LR6A 5FE1A 5D24A 5L8UA 5FFVA 4WHUA 3U5KA 5ENFA 4BW2A 5H1VA 4YYDA 4QR3A 5FE9A 1ZS5A 2KTBB 4CUQA 4QSPA 4UIZA 5IBNA 5FE0A 4XY8A 4TTEA 4F3IA 2I8NA 3LXJA 4N4HA 5DX4A 4IR5A 4IOOA 5CUCA 4N3WA 5G4RA 4HXNA 3G0LA 4WIVA 4Y03A 5ENEA 5D25A 3UV5A 4LYIA 4QBMA 4A9KA 5E3DA 5CUEA 2DVVA 4Z1SA 5CQ7A 5KTWA 5HRXA 5CQ8A 4O71A 2RNXA 4QYDA 5EGUA 4NQMA 2DKWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YEKA 5EWWA 5F2PA 3UVYA 4BJXA 4MR5A 4YABA 5AMFA 5FE3A 2R0VA 4PS5A 5D3PA 4XYAA 4NR8A 4LYSA 3UV4A 4CLBA 2DVSA 4QSVA 4QC3A 4YY6A 4J3IA 5EP7A 4NS5A 4N4FA 4TS8A 4AKIA 2N9GA 4HXRA 3LQIA 5I7YA 5DYCA 2GRCA 4NR9A 5D3SA 4A9MA 3U5NA 4CUPA 4NR5A 2YDWA 3LQJA 4MENA 5KHMA 5CFWA 5FE5A 5FH8A 1PUOA 2D9EA 1X0JA 3FKMX 5FDZA 5L98A 3UV2A 4UIXA 2YW5A 5LVQA 5IGKA 3JVJA 3MQMA 4YYMA 5ENBA 4O7EA 1N72A 3AQAA 3JVKA 5EWDA 4C67A 2F6NA 4QR5A 4YBMA 4OGJA 5L8TA 5FE6A 5FE8A 5CU8A 2YYNA 5EK9A 5FFYA 3MB4A 3SVFA 4LYWA 5IG6A 4QB3A 3QZTA 5II1A 4Z1QA 4CL9A 5L99A 5FFWA 3JVMA 2H60A 4ZC9A 4QY4A 5A82A 3SVHA 5DLZA 5BT4A 5LUUA 5IIDA 2E7NA 4O72A 5FE7A 2WP1A 4NYXA 4O7BA 5TB6A 4AKHA 4ZW1A 4A9HA 5C8GA 4MR3A 5CQ5A 5C4QA 5LKXA 2L5EA 4MEPA 4QUUA 3MB3A 4IORA 4O77A 4LZSA 5CP5A 5LKTA 4O74A 4Z93A 5F1HA 4O7CA 5DYXA 3UVWA 4QUTA 4A9FA 5F62A 2YEMA 5HLSA 4O7FA 4E96A 3UW9A 4Z6HA 3U5MA 4YATA 5ENGA 4MR4A 4QYLA 4YC9A 4DONA 4TZ8A 4YAXA 5DYAA 5ETBA 4IR3A 2R0YA 5D3TA 4YADA 3GG3A 5A81A 5FH7A 4ZQLA 5CUAA 4CFLA 5I29A 4QZSA 5D3NA 3LQHA 5A5PA 4TU6A 4YBTA 4NYWA 4KV1A 5EWVA 5FH6A 5CPEA 4C66A 5KTXA 5CS8A 5HJCA 2EJNA 5E73A 4YYNA 4Z6IA 4NRCA 3QZVA 4QSSA 4XY9A 4NQNA 3U5JA 4LC2A 4YYHA 4HXPA 5BT3A 4HXLA 2OUOA 3HMEA 4UIVA 5CY9A 4PCEA 5DY7A 4HBVA 5E3GA 4CUTA 4X2IA 2RNYA 5HFRA 4O78A 5CUGA 3MULA 4NUDA 5AD2A 5TCMA 5I88A 5D3RA 5I7XA 4A9LA 4QSQA 5C7NA 4Q0OA 1JM4B 5EVAA 3I3JA 3DAIA 3P5OA 5E9MA 4A9NA 4TT6A 4UIWA 5DYUA 3S92A 5K29A 2L84A 4OGIA 3P1DA 4YYJA 4MR6A 5BT5A 5C89A 3IU5A 3JVLA 5A85A 5A5QA 4NRBA 2DATA 3U5OA 5L97A 5HFQA 4CURA 5HRWA 1JSPB 5AMEA 3O37A 5D3HA 5F25A 4HBWA 5ENCA 3Q2EA 4ALGA 2F6JA 5CQ3A 5KU3A 3P1FA 4AKGA 3O35A 5A5OA 3ONIA 4CFKA 5E74A 4NYVA 4HXOA 5EICA 3TLPA 4CUSA 5FG5A 4QSTA 4MEQA 5FB0A 4PY6A 4NXJA 4UYFA 3IU6A 2DVRA 4YYIA 1WUGA 5ACYA 4QNSA 4FLPA 4NR7A 4UITA 4YH4A 5HM0A 4O75A 2I7KA 4QSXA 2RS9B 5D7XA 4GPJA 4KCXA 2DWWA 5FG4A 5FE2A 4UYFB 5H1TA 4NRAA 5HCLA 2RNWA 3SVGA 2RI7A 5CQ4A 4QSUA 4BW3A 5HQ6A 5E9KA 3K2JA 5IGNA 5FE4A 5DFDA 4NR6A 2E3KA 4NR4A 4QR4A 1WUMA 4O7AA 4PCIA 4QEWA 5ETDA 3O34A 4CUUA 5F60A 1E6IA 5E9YA 2WP2A 4NUEA 4QEUA 5FB1A 5CQTA 3D1DA 1ZKRA 5I80A 1EQFA 5J0DA 3D7CA 4HXMA 2D82A 5JWMA 5E7DA 5D26A 4A9OA 4YY4A 4IR4A 4YK0A 4TT2A 4HBYA 5ENHA 3U5LA 5CUDA 4PTBA 2RFJA 3P1EA 4WHWA 5I40A 5DBMA 4TYLA 4LDFA 3O33A 2R0SA 5EM3A 5HEMA 5F63A 4MEOA 4LZ2A 5CQAA 5LKZA 4UIUA 5LJ0A 5EWHA 3DWYA 5DFBA 3QZSA 3P1CA 2NXBA 5CGPA 5I1QA 5L96A 5EISA 5KTUA 2OSSA 4RVRA 5D3LA 4UYGA 2YQDA 5EPRA 5EWCA 4J0RA 2MJVB 4YH3A 5IGLA 5CZGA 4TQNA 5H1UA 2E7OA 5I86A 4TU4A 5F36A 3S91A 4YBSA 5CQ6A 3ERRA 4IOQA 4N4IA 5F5ZA 3D1BA 2FSAA 5LKUA 4OUFA 4ALHA 2LSPB 4UIYA 5A5NA 5D0CA 1F68A 3HMHA 5DFCA 4QC1A 4J0SA 4XUBA 4AKNA 4QSWA 4AI6A 3RCWA 5C87A 5F61A 5E9LA 2G4AA 3U5PA 3G0JA 3UVDA 2R10A 5DKHA 5EPBA 4UYHA 5DKCA 3AADA 5CRZA 5E9VA 4HBXA 5EPSA 5CTLA 5A5SA 5II2A 5HENA 4KV4A 4UYDA 4HXKA 5CRMA 5E9IA 5EI4A 4IR6A 4A9IA 3HMFA 5EV9A 3VKHA 4PKLA 4HXSA 5LJ1A 5EA1A 2L85A 5JI8A 5A7CA 5IGMA 4BW1A 3ZYUA 5LJ2A 4TT4A 5I89A 2OO1A 5DKDA 5A83A 5FG6A 5FBXA 4BW4A 5HQ7A 5CUBA 5KO4A 4TZ2A 3NXBA 5COIA 3Q2FA 3UVXA 5G4SA 4YYGA 4J1PA 5C85A 5DW2A 4YYKA 5ENJA 4N4GA 5D3JA 5I83A 3O36A 5HRVA 5A5RA 5HQ5A 5LVRA 4A9JA 4Q0NA 4QSRA 5DW1A 5F1LA 2YELA 5AD3A 4LRGA 5H85A 5F3AA 4O70A 4BHWA 3VKGA 5ENIA 4LZRA 5EU1A 5HELA 3LJWA 5E0RA 3MUKA 4XUAA 4NUCA 4QEVA 5DLXA 2DVQA 3MXFA 5EQ1A 4UYEA 4O76A 4A9EA 2RO1A 4LR6A 5FE1A 5D24A 5L8UA 5FFVA 4WHUA 3U5KA 5ENFA 4BW2A 5H1VA 4YYDA 4QR3A 5FE9A 1ZS5A 2KTBB 4CUQA 4QSPA 4UIZA 5IBNA 5FE0A 4XY8A 4TTEA 4F3IA 2I8NA 3LXJA 4N4HA 5DX4A 4IR5A 4IOOA 5CUCA 4N3WA 5G4RA 4HXNA 3G0LA 4WIVA 4Y03A 5ENEA 5D25A 3UV5A 4LYIA 4QBMA 4A9KA 5E3DA 5CUEA 2DVVA 4Z1SA 5CQ7A 5KTWA 5HRXA 5CQ8A 4O71A 2RNXA 4QYDA 5EGUA 4NQMA 2DKWA
chains in the Genus database with same CATH topology
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