4HXSA

Brd4 bromodomain 1 complex with n-[3-(2-oxo-2,3-dihydro-1,3-thiazol-4-yl)phenyl]-1-phenylmethanesulfonamide inhibitor
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
124
structure length
124
Chain Sequence
MNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Fragment-Based Drug Discovery of 2-Thiazolidinones as Inhibitors of the Histone Reader BRD4 Bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
molecule tags Protein binding/inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 124
sequence length 124
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hxsA01
4BJXA 4PKLA 4MR3A 4QSTA 3ZYUA 4TU6A 5FH7A 5D0CA 3MB3A 4NQMA 4NR9A 4XUAA 4UYEA 4HBYA 5FE1A 4WIVA 3D7CA 4F3IA 2DATA 5CU8A 4PS5A 5D26A 1JSPB 2KTBB 4O72A 5HELA 5EWCA 5LJ0A 5BT4A 5EISA 5ENEA 5FG4A 2YELA 5HRXA 4YAXA 4YH4A 5I83A 2DWWA 5CQ6A 4YBTA 4Q0NA 3RCWA 5H85A 4XY9A 3UV5A 5KU3A 5E3DA 5ENJA 5DYAA 4LC2A 5DFDA 4DONA 4OUFA 3ONIA 4LYIA 3O34A 4NS5A 4HXLA 4YYDA 4IR3A 4PTBA 3JVLA 5L97A 4UYFB 4AKNA 5CY9A 3P1CA 4YH3A 4HXMA 4YYGA 4LYSA 5FE9A 5CQ3A 4WHWA 4UIYA 4BW3A 4CUSA 5F3AA 5C4QA 5F60A 4QEVA 5ENHA 4QR5A 5KTXA 5D3NA 4A9JA 5HQ5A 5DW1A 5A5NA 5JWMA 5E9VA 4HBXA 2G4AA 2RNYA 5D3TA 5IGKA 4YC9A 5I7YA 5LKZA 5HRVA 5FE2A 5TCMA 5L99A 3IU5A 5D25A 5EV9A 5HCLA 4CLBA 5F25A 2NXBA 5CUDA 2E7NA 4BW4A 5AD3A 4Z6HA 4NR4A 5CQ4A 5A5SA 5EWHA 5EGUA 1JM4B 4O74A 4KV1A 3JVJA 2R0YA 5F63A 4UIZA 1N72A 2GRCA 4O7FA 4A9NA 5JI8A 5AD2A 5FE8A 5C85A 4NRBA 4A9FA 4NRAA 4A9MA 5HLSA 5EPSA 5FE3A 5CUBA 3K2JA 2DVVA 4XY8A 4IR6A 4O71A 5E9IA 5D7XA 5LJ1A 5DBMA 5E9LA 3TLPA 4QNSA 5IBNA 4UIXA 3U5JA 4TT2A 4LR6A 5BT3A 3JVKA 5DKCA 4YYHA 4CUQA 5FG5A 4YYMA 2D82A 4QSPA 4MR5A 2I7KA 4KV4A 5CS8A 3HMHA 4YBMA 4MR4A 4QSWA 3DWYA 5EWVA 3UW9A 4A9IA 4YADA 5L8TA 3MULA 3HMFA 5DX4A 5I40A 3UVDA 5A5QA 4QSUA 5FE7A 3DAIA 4QEWA 5FB1A 3SVGA 5I89A 5EVAA 3QZSA 4UYHA 5EICA 4YYNA 4A9HA 3LJWA 4QB3A 4CUUA 5E3GA 4QSSA 4ALGA 4QZSA 4O75A 4ALHA 2RNWA 5EI4A 3UV4A 2WP2A 4RVRA 3QZVA 5LKUA 2YYNA 5DLXA 5EPRA 4NUCA 4NQNA 5HEMA 5D24A 3P1EA 5G4RA 2L84A 5ENBA 5DKHA 3IU6A 4Y03A 3JVMA 4NRCA 1EQFA 4QC3A 5KO4A 5FDZA 5FE5A 5LKXA 2YQDA 5DYCA 5CQ5A 4O77A 4TZ8A 5ENFA 2WP1A 4O76A 4O7CA 5FFWA 5E74A 2RFJA 4TQNA 5H1UA 4Z6IA 4LZSA 4LDFA 5K29A 5E73A 3MB4A 5A7CA 3O35A 4XUBA 4LRGA 4XYAA 4BW1A 4QC1A 4A9KA 5EWWA 4TU4A 5E9KA 4NYWA 5FE6A 5CUAA 1ZS5A 2H60A 4ZC9A 5G4SA 5KHMA 5F36A 4LZ2A 5II2A 4TT6A 3U5OA 4GPJA 4N4GA 5ACYA 3MUKA 4CL9A 4NYXA 2DVRA 4NR8A 3U5KA 5LUUA 5HRWA 5LVRA 5IGNA 3QZTA 4J0RA 5CUGA 5A83A 5J0DA 5DY7A 5D3LA 4TZ2A 1WUMA 4IORA 4NR6A 4QSQA 3SVHA 2YEKA 5L98A 5EK9A 3O33A 5II1A 5FG6A 4YATA 5DLZA 5IGLA 2LSPB 5F5ZA 4MEPA 5DYXA 3MQMA 5HJCA 4A9LA 4X2IA 5CRZA 3AQAA 2YDWA 2RS9B 5I86A 4Q0OA 4HXKA 5FE0A 4UIVA 5HQ6A 5C89A 3P1DA 5FH8A 1X0JA 5IIDA 5IG6A 5E0RA 4IOQA 4C67A 4YYKA 2YEMA 4CUPA 5F1HA 4O70A 5ENIA 5E9YA 4YABA 4J1PA 4IR4A 4YYIA 3FKMX 4Z93A 4UIUA 5AMEA 5E9MA 5CFWA 4PCIA 2MJVB 5ETDA 2OSSA 4UYFA 4FLPA 4IOOA 5F61A 4HXRA 3U5MA 5CQ7A 4QSVA 2RI7A 2E7OA 4YK0A 3LQIA 5I7XA 4QEUA 5CZGA 5HENA 4PCEA 5DFBA 5D3RA 4C66A 4YY4A 2RO1A 4CURA 3P1FA 5F62A 4MEOA 5FBXA 5IGMA 4N4HA 4A9EA 4NXJA 5CUEA 3G0JA 4YY6A 4OGJA 3UVWA 5I88A 2R10A 4QR4A 2FSAA 2R0VA 3Q2EA 4QY4A 5CP5A 5ENCA 5CQAA 5L96A 4QYLA 5CTLA 2I8NA 5C7NA 4BHWA 5F2PA 3U5PA 4UYDA 5A81A 5A5PA 5A5RA 4QR3A 3HMEA 5I1QA 4MENA 3P5OA 5HFRA 3U5NA 4O7EA 5D3SA 5EQ1A 5A85A 2R0SA 5DKDA 3SVFA 1E6IA 4MEQA 5CGPA 4OGIA 5E7DA 5EU1A 4Z1SA 5ENGA 5CQTA 5AMFA 5FB0A 4N4IA 4J0SA 4E96A 4ZW1A 3UV2A 4PY6A 1F68A 5F1LA 5I80A 4LZRA 5DYUA 3MXFA 5D3PA 3S91A 5FH6A 5COIA 4O78A 4QUTA 4QYDA 5H1VA 3UVYA 2D9EA 5L8UA 4HXOA 2F6NA 5D3JA 4QSRA 5LVQA 3S92A 4BW2A 4KCXA 4NR7A 4NYVA 3Q2FA 4LYWA 3LQHA 2DVSA 3LXJA 4NR5A 2DKWA 5A82A 4HBWA 4N4FA 4UITA 5FFYA 4A9OA 5KTWA 5I29A 5EP7A 4QBMA 4HXNA 5D3HA 2DVQA 4TYLA 4MR6A 3I3JA 3AADA 2E3KA 5EWDA 5C8GA 4HXPA 5KTUA 3G0LA 3GG3A 1WUGA 5A5OA 4YYJA 5BT5A 3U5LA 4CFKA 2YW5A 4IR5A 4UYGA 5CRMA 4YBSA 5FE4A 5DW2A 5HFQA 3O36A 3O37A 4NUDA 5CPEA 4Z1QA 2RNXA 4WHUA 5TB6A 4TT4A 4J3IA 5EPBA 5LJ2A 5C87A 4CUTA 4UIWA 4HXSA 2N9GA 5HQ7A 4O7BA 4CFLA 5EM3A 5CUCA 4QSXA 3LQJA 4TTEA 5H1TA 2OO1A 5FFVA 4QUUA 5EA1A 5CQ8A 2OUOA 5ETBA 5HM0A 2F6JA 2L5EA 3UVXA 4HBVA 2L85A 3NXBA 4ZQLA 5LKTA 4N3WA 4TS8A 4O7AA 5DFCA 4NUEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BJXA 4PKLA 4MR3A 4QSTA 3ZYUA 4TU6A 5FH7A 5D0CA 3MB3A 4NQMA 4NR9A 4XUAA 4UYEA 4HBYA 5FE1A 4WIVA 3D7CA 4F3IA 2DATA 5CU8A 4PS5A 5D26A 1JSPB 2KTBB 4O72A 5HELA 5EWCA 5LJ0A 5BT4A 5EISA 5ENEA 5FG4A 2YELA 5HRXA 4YAXA 4YH4A 5I83A 2DWWA 5CQ6A 4YBTA 4Q0NA 3RCWA 5H85A 4XY9A 3UV5A 5KU3A 5E3DA 5ENJA 5DYAA 4LC2A 5DFDA 4DONA 4OUFA 3ONIA 4LYIA 3O34A 4NS5A 4HXLA 4YYDA 4IR3A 4PTBA 3JVLA 5L97A 4UYFB 4AKNA 5CY9A 3P1CA 4YH3A 4HXMA 4YYGA 4LYSA 5FE9A 5CQ3A 4WHWA 4UIYA 4BW3A 4CUSA 5F3AA 5C4QA 5F60A 4QEVA 5ENHA 4QR5A 5KTXA 5D3NA 4A9JA 5HQ5A 5DW1A 1PUOA 5A5NA 5JWMA 5E9VA 4HBXA 2G4AA 2RNYA 5D3TA 5IGKA 4YC9A 5I7YA 5LKZA 5HRVA 3VKGA 5FE2A 5TCMA 5L99A 3IU5A 5D25A 5EV9A 1ZKRA 5HCLA 4CLBA 5F25A 2NXBA 5CUDA 2E7NA 4BW4A 5AD3A 4Z6HA 4NR4A 5CQ4A 5A5SA 5EWHA 5EGUA 1JM4B 4O74A 4KV1A 3JVJA 2R0YA 5F63A 4UIZA 1N72A 2GRCA 4O7FA 4AKGA 4A9NA 5JI8A 5AD2A 5FE8A 5C85A 4NRBA 4A9FA 4NRAA 4A9MA 5HLSA 5EPSA 5FE3A 5CUBA 3K2JA 2DVVA 4XY8A 4IR6A 4O71A 5E9IA 5D7XA 5LJ1A 5DBMA 5E9LA 3TLPA 4QNSA 5IBNA 4UIXA 3U5JA 4TT2A 4LR6A 5BT3A 3JVKA 5DKCA 4YYHA 4CUQA 5FG5A 4YYMA 2D82A 4QSPA 4MR5A 2I7KA 4KV4A 5CS8A 3HMHA 4YBMA 4MR4A 4QSWA 3DWYA 5EWVA 3UW9A 4A9IA 4YADA 5L8TA 3MULA 3HMFA 5DX4A 5I40A 3UVDA 5A5QA 4QSUA 5FE7A 3DAIA 4QEWA 5FB1A 3SVGA 3D1BA 5I89A 5EVAA 3QZSA 4UYHA 5EICA 4YYNA 4A9HA 3LJWA 4QB3A 4CUUA 5E3GA 4QSSA 4ALGA 4QZSA 4O75A 4ALHA 2RNWA 5EI4A 3UV4A 2WP2A 4RVRA 3QZVA 5LKUA 2YYNA 5DLXA 5EPRA 4NUCA 4NQNA 5HEMA 5D24A 3P1EA 5G4RA 2L84A 5ENBA 5DKHA 3IU6A 4Y03A 3JVMA 4NRCA 1EQFA 4QC3A 5KO4A 5FDZA 5FE5A 5LKXA 3ERRA 2YQDA 5DYCA 5CQ5A 4O77A 4TZ8A 5ENFA 2WP1A 4O76A 4O7CA 5FFWA 5E74A 2RFJA 4TQNA 5H1UA 4Z6IA 4LZSA 4LDFA 5K29A 5E73A 3MB4A 5A7CA 3O35A 4XUBA 4LRGA 4XYAA 4BW1A 4QC1A 4A9KA 5EWWA 4TU4A 5E9KA 4NYWA 5FE6A 5CUAA 1ZS5A 2H60A 4ZC9A 5G4SA 5KHMA 5F36A 4LZ2A 5II2A 4TT6A 3U5OA 4GPJA 4N4GA 5ACYA 3MUKA 4CL9A 4NYXA 2DVRA 4NR8A 3U5KA 5LUUA 5HRWA 5LVRA 5IGNA 3QZTA 4J0RA 5CUGA 5A83A 5J0DA 5DY7A 5D3LA 4TZ2A 1WUMA 4IORA 4NR6A 4QSQA 3SVHA 2YEKA 5L98A 5EK9A 3O33A 5II1A 5FG6A 4YATA 5DLZA 5IGLA 2LSPB 5F5ZA 4MEPA 3VKHA 5DYXA 3MQMA 5HJCA 4A9LA 4X2IA 5CRZA 3AQAA 2YDWA 2RS9B 5I86A 4Q0OA 4HXKA 5FE0A 4UIVA 5HQ6A 5C89A 3P1DA 5FH8A 1X0JA 5IIDA 5IG6A 5E0RA 4IOQA 4C67A 4YYKA 2YEMA 4CUPA 5F1HA 4O70A 5ENIA 5E9YA 4YABA 4J1PA 4IR4A 4YYIA 3FKMX 4Z93A 4UIUA 5AMEA 5E9MA 5CFWA 4PCIA 2MJVB 5ETDA 2OSSA 4UYFA 4FLPA 4IOOA 5F61A 4HXRA 3U5MA 5CQ7A 4QSVA 2RI7A 2E7OA 4YK0A 3LQIA 5I7XA 4QEUA 5CZGA 5HENA 4PCEA 4AI6A 5DFBA 5D3RA 4C66A 4YY4A 2RO1A 4CURA 3P1FA 5F62A 4MEOA 5FBXA 5IGMA 4N4HA 4A9EA 4NXJA 5CUEA 3G0JA 4YY6A 4OGJA 3UVWA 5I88A 2R10A 4QR4A 2FSAA 2R0VA 3Q2EA 4QY4A 5CP5A 5ENCA 5CQAA 5L96A 4QYLA 5CTLA 2I8NA 5C7NA 4BHWA 5F2PA 3U5PA 4UYDA 5A81A 2EJNA 5A5PA 5A5RA 4QR3A 3HMEA 5I1QA 4MENA 3P5OA 5HFRA 4AKHA 3U5NA 4O7EA 5D3SA 5EQ1A 5A85A 2R0SA 5DKDA 3SVFA 1E6IA 4MEQA 5CGPA 4OGIA 5E7DA 5EU1A 4Z1SA 5ENGA 5CQTA 5AMFA 5FB0A 4N4IA 4J0SA 4E96A 4ZW1A 3UV2A 4PY6A 1F68A 5F1LA 5I80A 4LZRA 5DYUA 3MXFA 5D3PA 3S91A 5FH6A 5COIA 4O78A 4QUTA 4QYDA 5H1VA 3UVYA 2D9EA 5L8UA 4HXOA 2F6NA 5D3JA 4QSRA 5LVQA 3S92A 4BW2A 4KCXA 4NR7A 4NYVA 3Q2FA 4LYWA 3LQHA 2DVSA 3LXJA 4NR5A 2DKWA 5A82A 4HBWA 4N4FA 4UITA 5FFYA 4A9OA 5KTWA 5I29A 5EP7A 4QBMA 4HXNA 5D3HA 2DVQA 4TYLA 4MR6A 3I3JA 3AADA 2E3KA 5EWDA 5C8GA 4HXPA 5KTUA 3G0LA 3GG3A 1WUGA 5A5OA 4YYJA 5BT5A 3U5LA 4CFKA 2YW5A 4IR5A 4UYGA 5CRMA 4YBSA 5FE4A 5DW2A 5HFQA 3O36A 3O37A 4NUDA 5CPEA 4Z1QA 2RNXA 4WHUA 5TB6A 4TT4A 4J3IA 5EPBA 5LJ2A 5C87A 4CUTA 4UIWA 4HXSA 2N9GA 5HQ7A 4O7BA 4CFLA 5EM3A 5CUCA 4QSXA 3LQJA 4TTEA 5H1TA 2OO1A 5FFVA 4QUUA 3D1DA 5EA1A 5CQ8A 2OUOA 5ETBA 5HM0A 2F6JA 2L5EA 3UVXA 4HBVA 2L85A 3NXBA 4ZQLA 4AKIA 5LKTA 4N3WA 4TS8A 4O7AA 5DFCA 4NUEA
chains in the Genus database with same CATH topology
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