4HZ8A

Crystal structure of bglb with natural substrate
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
439
structure length
439
Chain Sequence
KFPEGFLWGAATSSYQIEGAWNEDGKGESIWDRFTRIPGKIKNGDSGDVACDHYHRYEQDLDLMRQLGLKTYRFSIAWARIQPDSSRQINQRGLDFYRRLVEGLHKRDILPMATLYHWDLPQWVEDEGGWLSRESASRFAEYTHALVAALGDQIPLWVTHNEPMVTVWAGYHMGLFAPGLKDPTLGGRVAHHLLLSHGQALQAFRALSPAGSQMGITLNFNTIYPVSAEPADVEAARRMHSFQNELFLEPLIRGQYNQATLMAYPNLPEFIAPEDMQTISAPIDFLGVNYYNPMRVKSSPQPPGIEVVQVESPVTAMGWEIAPEGLYDLLMGITRTYGKLPIYITENGAAFDDQPDQSGQVNDPQRVGYFQGHIGAARRALADGVDLRGYYAWSLLDNFEWAEGYSKRFGIIYVDFETQQRTLKQSAQWYRDVIANNGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Uncultured bacterium
publication title Structural insights into the substrate recognition properties of beta-glucosidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase
total genus 171
structure length 439
sequence length 439
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4hz8A00
2OWXA 3QHNA 5E6YA 2J75A 1TFVA 3VTRA 1CGXA 1E1FA 1B90A 1V3JA 4HOWA 5E0CA 4TTUA 1PX8A 3VPLA 3W53A 4AD3A 4CCEA 4BZYA 2OWCA 1M04A 3WNOA 4PTVA 4M8UA 2D3LA 3N11A 1H4PA 1EQCA 3PN8A 1VAHA 4B3LA 5D8WA 1W9VA 1U30A 1QW8A 3SIMA 3I3BA 1J11A 3N15A 1UR1A 3VD3A 3TOPA 1EOKA 1ZBKA 3ARQA 2YA0A 3NSXA 1WAWA 2V3FA 1KBKA 3BH4A 2J25A 4C7FA 2PBOA 2XSAA 2X09A 4N42A 4C7GA 4F9DA 5AYIA 5EMYA 3ARTA 1Y7VA 1OT1A 2A3BA 2WVVA 3N18A 1J0KA 2VJXA 1QVBA 4C7DA 2GJXA 4U31A 4JZ5A 4D6CA 4HOZA 1FOBA 4BQ2A 1W3LA 3WDHA 3WF1A 3FAXA 4PMUA 2YBUA 4M1RA 2ZOXA 3UR7A 1XD0A 5D4YA 4PTMA 1W3HA 4DM2A 8A3HA 5I24A 3K4DA 3VINA 4ATWA 4WK9A 2ZXQA 2XVLA 4IPLA 3VNZA 4EAMA 1LLOA 1Q6DA 4HMEA 2E9BA 4H8UA 4UQCA 3UG3A 4R5EA 1V6WA 1E9LA 3WQVA 1TMQA 3GNOA 3AXHA 4AEEA 3W0KA 5BRQA 3ZJ8A 3U7VA 6A3HA 4P7LA 3BAKA 5A95A 1TA3B 1W91A 3AMKA 2WMHA 2JEQA 1E0VA 2J7EA 1PZ2A 5DT5A 1VFOA 1H09A 1BYDA 4WLCA 1KGUA 5A6KA 1H1NA 2JF6A 4UCFA 3M07A 1GQKA 5HPCA 1J0ZA 4UQEA 2WWCA 1W2VA 3PZUA 3U57A 1EHNA 4JCMA 1LL4A 3WUFA 1YQ2A 1MXDA 3WFZA 2VR5A 4JKKA 1PX3A 4AD0A 3CZGA 4J27A 1U33A 2EQDA 4BQ3A 5AC4A 3LMYA 4JL1A 4K68A 1E6QM 1MW0A 4CD8A 2F61A 4JFWA 1E0XA 2Y24A 3AS3A 4P8UA 3AIVA 3IAQA 1AQMA 3T2OA 1O6IA 1ISXA 4GI8A 1PX4A 1QI0A 2EXOA 2VCCA 2WB5A 3T08A 1QNRA 3CPUA 3WD1A 2CYGA 4UNIA 2UY3A 1G94A 4D72A 3M46A 4S3KA 1ITCA 3GXFA 2YL9A 1H3GA 3APGA 4TVDA 3T0BA 1B3XA 1QI3A 4UZUA 3RILA 1SR0A 3PTMA 3VX1A 1OBAA 2ZWYA 2VOTA 3WIJA 3VD9A 1X1NA 4AZBA 4CN1A 5AYBA 2V38A 5IHSA 2EPMX 2PWGA 1HJUA 2IUZA 3SCVA 1NQ6A 4OBRA 4CGTA 3BSHA 1E4MM 1JZ8A 4BCEA 2Q8XA 2TAAA 1TE1A 1B3VA 2F8QA 2GSJA 4B3KA 1CLVA 3MMWA 1R8LA 3GDBA 4CN6A 5BXPA 2WANA 3L4ZA 2XSBA 2FGLA 3OZPA 2DSVA 1H2JA 4JIEA 4URIA 2A3CA 4MNLA 1UD4A 3U7BA 5ABHA 3WDIA 3UERA 4MNJA 3WF4A 2G3NA 4WKHA 4FLRA 1HJXA 4FK9A 3MV01 5A3HA 5GNYA 1HKKA 4BQ4A 4E8CA 2G41A 4MTVA 3L4WA 3ZJ7A 4AD4A 5EB8A 2Y5EA 4W5UA 4BF7A 1ISWA 4AIUA 5I77A 1CBGA 4UFHA 2XFRA 1WZKA 3NSMA 4AZCB 4CVWA 3AZRA 4W7WA 2ZUWA 1HKMA 4W89A 3POCA 2UWFA 4HA1A 1W1VA 3T2PA 4AD1A 2JALA 1E43A 3OA5A 1CXEA 3QOKA 1SMDA 3AIUA 1M7XA 3ALGA 2CBJA 4TXEA 2D3NA 4MAVA 4Y7EA 4ATLA 1AQ0A 1BYBA 3K1DA 1G0CA 3CZ8A 1UH4A 1E6ZA 3L4YA 3GXDA 3VO0A 3SCWA 4A3HA 4DM1A 3AROA 1I1XA 5BXRA 1V6YA 1H0GA 5FL1A 3PZGA 4IM4A 1V3LA 2DDXA 1WDRA 4LX4A 1W1YA 1FFRA 4MPKA 3BC9A 4EK7A 2BV9A 2WCSA 2DT1A 1GOOA 1KGWA 2O9OA 3FAWA 4UFJA 3WD2A 2BY2A 2CHOA 2OWWA 3TONA 4LGXA 2G3IA 5LA1A 3BGAA 1VBRA 1OIFA 4MJ2A 2QMKA 2YLAA 4J3SA 1EA9C 1DTUA 4J3TA 3VDHA 5CLTA 3PZOA 2ESCA 5EBAA 4BA0A 1Q6GA 3ARSA 1AQHA 3WL1A 3JUGA 3NSNA 4KGJA 5CG0A 3OGSA 1GONA 3M7SA 1SYTA 5I6SA 2WVVB 1J0YA 4EANA 2J8FA 3A4WA 3W26A 2VQTA 3OB8A 5A6AA 1KCKA 2QHAA 5A94A 5E6ZA 4MB4A 3BAJA 1UHVA 2VX7A 3SCRA 5A6MA 3WD3A 1KB3A 1TCMA 2D0FA 2DSZA 1UWRA 1NWUA 5E9AA 2WPGA 1XSKA 3OLGA 1R85A 1W1TA 4UTFA 4ACZB 2W91A 4ACYA 2J7CA 4F8XA 5A2BA 1UKQA 3MMUA 1DEDA 2WSKA 4J3XA 3RM8A 4P7NA 3WENA 2O9PA 2VX5A 4W7UA 3VGHA 1R7OA 3NDYA 1J9YA 1W9BM 1QNOA 3NYDA 1CYGA 4FLQA 2WMJA 3W25A 2VCBA 1E1EA 5GNZA 1E6SM 5I5RA 1LG2A 3WMBA 1B2YA 1BFNA 3BAYA 3RIKA 1QOXA 2PB1A 2VX4A 2G3JA 5EFDA 3M6DA 1V0MA 3VGDA 3GBDA 1QI4A 3AIEA 4QAWA 1JL8A 4KGLA 1MW3A 2WYSA 2EPKX 2RGLA 3WNLA 4CKQA 2VMFA 1GCYA 2NSXA 1NOWA 4A4AA 3GM8A 2J62A 2VQUA 2VO5A 5KZ6A 2FHBA 1DWGM 1VEPA 1H11A 3G6LA 1W1PA 2YL8A 4U2YA 1CWYA 3GH5A 1XH1A 1WE5A 2BVTA 4X0VA 4AZHA 1F4HA 5CGTA 2CERA 1WCGA 2ZUSA 4J3WA 5A8NA 1CDGA 1GVYA 4OKDA 1Q6FA 3CBWA 5A8QA 1WO2A 4M81A 3PBGA 1MFVA 1J10A 4W88A 3W6LA 3B9EA 2J4GA 1EDGA 2V5DA 1V6UA 4YHGA 3SCNA 1EOMA 1FHDA 1JF5A 1UKSA 2DT3A 3VMOA 1US3A 3SUWA 2UY4A 4FF5A 3WH9A 5C8BB 5I2UA 1EO7A 3WH5A 4U5IA 3AFBA 3BSGA 1M03A 1C91A 4AD5A 1BHGA 2JIWA 2GDVA 1CENA 3B9DA 1JF6A 4CVUA 1E72M 5M17A 3CMGA 4P7OA 2E9LA 1EDQA 1MFUA 1EQPA 1CLXA 1OB0A 3AMCA 3POHA 3QHMA 1V6VA 5BWFA 2X8RA 4QLJA 3SUTA 2WVUA 1LJYA 1N82A 1JI2A 4L4OA 3VGGA 4MB1A 5A6SA 1G5AA 2XVNA 3WDPP 3WQ8A 4MNKA 4ZE5A 1BGAA 1C7TA 2WZIA 4E4PA 2YL6A 1DWHM 3VD7A 1JI1A 3VIOA 4V27A 2BY1A 4MJ4A 2QF8A 1K9DA 2BFGA 3ZT6A 1E40A 5HPOA 3NUKA 1PPIA 1VJZA 1MYRA 2XJ7A 3E1F1 4CD7A 2ZX5A 2Z1KA 1V02A 4UFLA 4HU8A 3DYMA 5LYRA 4EE9A 2BHZA 3BMWA 2WSPA 2PWEA 5HNNA 1HJSA 2D1ZA 1QHPA 3AS0A 2GK1B 2WMFA 1BTCA 4GINA 4PUEA 2NW0A 3ZR6A 1UKTA 1HF6A 3U5YA 3PTQA 2XIIA 2W4XA 2WWDA 3W4RA 1OT2A 3ARZA 4OZOA 1GNXA 4JAWA 1HL8A 3AIWA 1XCWA 4IUGA 1UKPA 1E6RA 2ZXDA 3NJ3A 2ZUNA 4DWSD 1F4AA 1CGWA 3W24A 4D71A 1JAKA 4D6JA 3W38A 4UOZA 1NWTA 4HPGA 4QCEA 4B15A 5I79A 1CTNA 1K9FA 5HBFA 1KBBA 2VVSA 1HVXA 3TTYA 2Y8VA 2ZUMA 7CGTA 4W87A 4H04A 1D2KA 3LPFA 3II1A 4Q7NA 2VNCA 1CEOA 4GZIA 3PHAA 4PMXA 1GOKA 3VM7A 3AISA 3WQ6A 2BVYA 3CLWA 3QR3A 1G01A 3THCA 1W9PA 2D22A 3VOCA 3AHVA 4DWSB 4Z2LA 1KR0A 2ZIDA 1VENA 1QNPA 3CIVA 1UZ4A 5DT7A 2AMGA 3GNRA 1FHLA 3CMJA 1GOMA 2DIJA 1ZJBA 3NDZA 1OSEA 5TD4A 1L8NA 1P6WA 5JIPA 1KFWA 1ISYA 4UOQA 1VB9A 3WF2A 1JYVA 1IZKA 1GJWA 3VDAA 3WKZA 4ZEPA 1HJVA 3MO4A 1QI5A 1CGUA 3VIIA 1C93A 2XM2A 4ZXOA 1GJUA 4B9YA 4X9YA 2WBGA 2WC7A 3CUFA 1ISZA 2CKSA 1B3WA 2ZXAA 3KE0A 3SCPA 1ZS2A 1KQYA 1E3XA 4U2ZA 2J7GA 2Y8KA 3UEQA 1C8YA 1CPUA 1R87A 1QI2A 1JZ6A 2CITA 1I75A 3LPPA 3PZNA 2WMIA 4Z2JA 1CNVA 4NZCA 3G6MA 4Z2IA 1KCLA 3CZLA 2VRKA 2YL5A 1O7AA 3SEPA 2FH6A 3CO4A 1E55A 2XVKA 3BAWA 1IT0A 1HP4A 1KXHA 1HVQA 2HVMA 3MUAA 4JFVA 1HL9A 2YLLA 3I3EA 4WKAA 2WAGA 5E70A 4U5KA 1E4NA 1B3ZA 4AEFA 3VDBA 2FHCA 5AC5A 3ARXA 1GOIA 2WXDM 2XGBA 2PWDA 1H5VA 2E0PA 3VX0A 3MUY1 3T0AA 4D6EA 5ABFA 2XPKA 1QNSA 2CKRA 3W37A 1JG9A 5HXMA 5FKYA 1B31A 3L4TA 2FHFA 1IV8A 2J7DA 2G3MA 1MQPA 2QLYA 3AJ7A 1UWUA 3THDA 3T09A 4CU8A 5CGMA 5DMYA 3AHYA 3AIQA 1QNQA 1MQRA 1VFFA 4RE4A 1NP2A 1X6LA 3AHXA 3TTSA 1HP5A 3QHOA 1MQQA 4WKFA 5A8MA 3DYOA 4TOQA 1G1YA 2ZX9A 4KWUA 3WBEA 4NF7A 3PZMA 3L4VA 2PF0A 2VVNA 1JNEA 2ZUTA 3UESA 6CGTA 5A6BD 1JXJA 3N9KA 1BG4A 5JBDA 1A47A 1I1WA 3CUHA 5FIPA 2VR4A 3BCFA 4HOXA 2ZICA 1V6XA 1XSJA 4TX6A 1PEZA 4D6GA 3EMCA 3O9NA 1FH7A 4V2XA 1FH9A 5A6LA 3NCOA 3KL3A 5BYWA 4S3JA 3J7HA 3TTQA 2JIEA 3TA9A 2V3EA 2YBTA 2X0HA 3ZJ6A 3ZJKA 4OBSA 4JCLA 3WF0A 3ZT5A 4JL2A 3EBVA 2AOSA 2DT0A 1B3YA 1JFXA 3RPMA 1EDTA 2A3AA 1C7SA 1RP9A 4GIAA 1UWSA 2YDSA 1GOWA 1QBBA 2JF7A 1UQYA 2WHLA 3WFLA 4HMDA 3SUSA 3MMDA 1W32A 2ZE0A 2EBNA 1UKOA 4HTYA 2PWFA 4MNMA 1ITXA 3WEMA 4DUVA 5A1AA 2QPSA 3U5UA 1A3HA 2ZX8A 3BLPX 2VCAA 1ESWA 3SCOA 5D9PA 1D3CA 1OD0A 1HKJA 5E09A 2O9TA 4B16A 1VFMA 1WZLA 3KWXA 4M56A 1UOKA 4P7QA 3CHEA 1HNYA 4D1IA 1K9EA 5CPQA 1OGSA 1UA3A 5D9OA 3VD4A 2E4TA 4XB3A 4UQBA 1JD9A 4M80A 2YOCA 4GO8A 2DH3A 1UR8A 2GJRA 3CGTA 5HDRA 2UY5A 2CCRA 3IJ7A 3S2CA 3UETA 3OGRA 3OLEA 2VX6A 1W2PA 3GYCA 4JFTA 2WHKA 1E4IA 4PTXA 1FP8A 3WD0A 1VRXA 3VIKA 1CECA 5AY7A 4GPNA 2GJXB 3VGEA 1E6NA 4W86A 1E73M 2XWDA 2NT0A 3BAIA 1NOUA 4TVUA 2UY2A 3AXXA 1W3JA 1UD3A 2ZUVA 4GZEA 1QW9A 2WZHA 4M24A 3VIMA 1HN1A 4CU7A 3WUEA 2VL4A 1S46A 1BPLB 2B31A 4EKJA 3PZIA 4OUEA 4CD6A 3T2QA 4UFIA 1Q4NX 1C90A 2D23A 3WMSA 2VURA 4W85A 5EFFA 4JKMA 3SURA 3PZTA 2DSWA 1AMYA 2EO7A 1XYFA 4W93A 2W5FA 1M01A 1UD8A 3IAPA 5GNXA 1TA3A 4ML4A 5ABEA 1JYXA 1DWJM 5F7UA 4U3AA 5A69A 1NWRA 5FD0A 7A3HA 4Z2HA 1KXQA 1CGTA 1CXIA 3WD4A 3RMEA 1UYQA 4JHZA 4H2CA 4WIWA 3ZM8A 4RL3A 3CZKA 1J0HA 3HMCA 1JDAA 4UZSA 1OGGA 4PCSA 5BXSA 1LWHA 5DEZA 1UH3A 1DP0A 3ARVA 1UWTA 2V5CA 4XX6A 1CXKA 2DPEA 5D9NA 3UG5A 3ZR5A 1MW1A 2BHUA 4UOJA 1KQZA 1FH8A 2D20A 1EXPA 4R27A 4F79A 1UWQA 3ZSSA 4UFMA 2AAAA 1UH2A 1CXFA 4HA3A 4GQRA 4HZ6A 4GO9A 3VNYA 1E56A 1HT6A 2RGMA 1BSIA 4J28A 4FMVA 1JGIA 2YJQA 1OGBA 3WH6A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2OWX A;  3QHN A;  5E6Y A;  2J75 A;  1TFV A;  3VTR A;  1CGX A;  1E1F A;  1B90 A;  1V3J A;  4HOW A;  5E0C A;  4TTU A;  1PX8 A;  3VPL A;  3W53 A;  4AD3 A;  4CCE A;  4BZY A;  2OWC A;  1M04 A;  3WNO A;  4PTV A;  4M8U A;  2D3L A;  3N11 A;  1H4P A;  1EQC A;  3PN8 A;  1VAH A;  4B3L A;  5D8W A;  1W9V A;  1U30 A;  1QW8 A;  3SIM A;  3I3B A;  1J11 A;  3N15 A;  1UR1 A;  3VD3 A;  3TOP A;  1EOK A;  1ZBK A;  3ARQ A;  2YA0 A;  3NSX A;  1WAW A;  2V3F A;  1KBK A;  3BH4 A;  2J25 A;  4C7F A;  2PBO A;  2XSA A;  2X09 A;  4N42 A;  4C7G A;  4F9D A;  5AYI A;  5EMY A;  3ART A;  1Y7V A;  1OT1 A;  2A3B A;  2WVV A;  3N18 A;  1J0K A;  2VJX A;  1QVB A;  4C7D A;  2GJX A;  4U31 A;  4JZ5 A;  4D6C A;  4HOZ A;  1FOB A;  4BQ2 A;  1W3L A;  3WDH A;  3WF1 A;  3FAX A;  4PMU A;  2YBU A;  4M1R A;  2ZOX A;  3UR7 A;  1XD0 A;  5D4Y A;  4PTM A;  1W3H A;  4DM2 A;  8A3H A;  5I24 A;  3K4D A;  3VIN A;  4ATW A;  4WK9 A;  2ZXQ A;  2XVL A;  4IPL A;  3VNZ A;  4EAM A;  1LLO A;  1Q6D A;  4HME A;  2E9B A;  4H8U A;  4UQC A;  3UG3 A;  4R5E A;  1V6W A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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