The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
30
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sequence length |
75
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structure length |
75
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Chain Sequence |
DEVGALSKFAASLADQMRAGSNSLDRDVQSLFGVWKGSAADAYRSGWDEMQDGATKVWNALTDIASTLGSNAAAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Heterologous expression of mycobacterial Esx complexes in Escherichia coli for structural studies is facilitated by the use of maltose binding protein fusions.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| source organism |
Mycobacterium abscessus
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| molecule keywords |
ESAT-6-like protein MAB_3112
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| total genus |
30
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| structure length |
75
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| sequence length |
75
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| chains with identical sequence |
C, E, G, I, K
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-11-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | ESAT-6-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WA8 B; 3OGI B; 3GVM A; 2AZ2 A; 2KG7 A; 3HR0 A; 2KG7 B; 3G80 A; 2B9Z A; 4LWS A; 2AZ0 A; 3GWK C; 3FD9 A; 4LWS B; 3O9O A; 3ZBH A; 3Q4H A; 4GZR B; 2DE0 X; 3Q4H B; 3FAV A; 2VRZ A; 4ABM A; 3TXQ A; 3FAV B; 2VS0 A; 1WA8 A; 4I0X A; 3TXS A; 4I0X B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4U7O A; 2YXL A; 3TET A; 2YSU B; 1DGS A; 2AW9 A; 1YDX A; 4KL1 A; 1WP8 A; 2ZCE A; 5E79 Z; 2ZR2 A; 2OIG A; 3JAL B; 2EUL A; 3JAK A; 1WPB A; 2Y69 B; 5KAF Z; 3J7A U; 3RGB A; 4J7Z A; 3LSS A; 1GMG A; 1R73 A; 3CXC U; 1YVW A; 3OE7 G; 1NQT A; 1IBL O; 4XBF A; 1AJP A; 1SF9 A; 3DSQ A; 3BAA A; 3FKS G; 4J10 A; 3CJH A; 5CA3 A; 3GWO A; 3K79 A; 4LF8 B; 2Y0I A; 3F5W C; 5EZY B; 1VQN V; 3JCU Z; 1YTF B; 1FD9 A; 1B6Q A; 2P6J A; 4YJ3 A; 4MTG A; 4FFB B; 4DRX B; 1NT2 B; 1LNQ A; 2ZDI A; 3ABL B; 4TV8 B; 3E22 B; 3AG2 B; 4MVQ A; 3RBZ A; 3QVN A; 4FK5 C; 3CC2 V; 5KHK A; 4WFH A; 1RFY A; 5KHJ A; 1WN7 A; 3OMA B; 4JI2 O; 3G67 A; 3R66 A; 4C7U A; 5EBW C; 4J7K A; 4O4J B; 4FM0 A; 1NR7 A; 5KHH A; 4X62 B; 1B04 A; 4JTC B; 3HKC B; 2XAH A; 1IBK B; 3X2Q C; 2RCV A; 4RUF A; 2EIN B; 1PM9 A; 3FX7 A; 3OR7 C; 1ENV A; 5B3S C; 2LQT A; 1KP2 A; 2CUG A; 2JEU A; 3CXH F; 4G28 B; 5GTH Z; 3T1Y O; 4NB5 A; 1N32 B; 1BHA A; 4MS2 A; 1WNS A; 1EBO A; 1WB7 A; 4MTF A; 4CH5 A; 3JAR B; 4Z2W A; 3CCU V; 3ABK C; 2AXT Z; 5EZY A; 2LGQ A; 3H1I H; 5LGT A; 4J11 A; 5H9C A; 3TXQ A; 5H2F Z; 1Y76 B; 2UXX A; 4FFB A; 3ABM B; 2QSA A; 1S76 D; 2G38 A; 3J81 N; 5EIB D; 2IM9 A; 4UCO A; 5GW7 A; 1SER A; 4OXS A; 4TV8 A; 5DN6 G; 5KX5 A; 5LYJ A; 2KG7 B; 4FLT A; 4R8C A; 4UCV A; 1COW G; 1JJO A; 1TAE A; 4LWS B; 3WB2 A; 1KC8 W; 1HNX O; 2A9H A; 4HZ3 A; 1N36 O; 4LF7 O; 3A2F A; 1NH2 D; 3CC4 V; 2PY5 A; 4PA3 A; 2YID A; 2XTA A; 4O4J A; 4PHZ A; 1OCR C; 1NBM G; 3JAT B; 2CGO A; 5DEC A; 3J80 N; 1F4M A; 3RYF B; 4UVA A; 4YIO A; 4AQY O; 3SJA C; 3CCV V; 3HKC A; 4JYA B; 4EEQ A; 3FD9 A; 4JAU A; 1KQS U; 4DV0 O; 2YI8 A; 1M9N A; 4J80 A; 4FLU A; 2OCC C; 3QTC A; 4CC5 A; 5JVD B; 4BR6 A; 2EZP A; 1K92 A; 5LMU B; 4JV5 B; 4BAY A; 1AJN A; 1GN4 A; 3UKM A; 3E8B A; 1SQG A; 1XL4 A; 1BE3 H; 4TSF G; 4BIO A; 3ZJZ A; 2DJV A; 1AI7 A; 2CAZ C; 3ZHQ A; 4DR5 O; 2GTA A; 1UPG A; 4PDM A; 3WG7 C; 1TVK A; 3W7X A; 4DUZ O; 3FB8 C; 3EHB B; 2VRZ A; 1ZL8 A; 5CA1 B; 4B3T B; 4PJ0 Z; 1AP5 A; 3CRA A; 1E79 G; 2Q7E A; 2HEP A; 3CCS V; 3D3I A; 4J9Y B; 4H13 B; 2OCH A; 2UU9 B; 4O4I A; 3T1C A; 1RSO A; 2QWR B; 1QVG U; 3W7S A; 2KG7 A; 4JI3 B; 2ZT9 B; 2X0L A; 2ZIN A; 3ZHV A; 4LWS A; 2WLL A; 3FB6 C; 3AK1 A; 4LF4 O; 4FM1 A; 1MG1 A; 3CCR V; 4LFB O; 4UFZ A; 4BIZ A; 4I0X A; 2QDO A; 5EC2 C; 3SPC A; 5AG2 A; 1JA8 A; 4X20 B; 3RYI B; 5LOV B; 4X1I B; 3SYO A; 4TQD A; 1VQK V; 1N0J A; 1Q5O A; 5L3F A; 1E1R G; 2F23 A; 3APO A; 1QLN A; 3KKY A; 4TV9 B; 4LBE C; 2ILM A; 2L6L A; 2Q6A A; 3B77 A; 3HKB A; 3N2G B; 4UB8 Z; 1UJW B; 4BW5 A; 5J2T B; 1NI8 A; 3N2K B; 3ZHS A; 4MVS A; 5IYB O; 2IBZ H; 5B1B C; 2WSS G; 2E74 B; 2CDY A; 4FLV A; 2PZS A; 3K04 A; 5J2U B; 1G6U A; 1WP7 A; 5CA1 A; 4YJ2 A; 5FLX N; 2HR3 A; 3ML0 A; 1VQ7 V; 4IT5 A; 1NU1 H; 3WU2 Z; 4QE9 A; 3BRC A; 4K35 A; 2CTW A; 1SC5 B; 2CTP A; 4GT1 A; 2X6C A; 1K5Q A; 3CCQ V; 4DV5 O; 1HWY A; 1M56 C; 3VOU A; 4PA7 A; 1V55 C; 5FPR A; 4X20 A; 5CA0 A; 1QR8 A; 5LOV A; 3H1H H; 4YY3 B; 4PA9 A; 5E1A C; 1FJG B; 2EZO A; 2C2A A; 5ITZ A; 2HVK C; 1VAR A; 1VQ4 V; 3OT7 A; 1US6 A; 3N2G A; 3ZRW B; 1XHX A; 3B4S A; 1O9H A; 3N2K A; 4WF9 V; 4R6Z A; 5EK0 A; 3RYH B; 1MSW D; 1NH2 B; 1XIL A; 5DED A; 4LH6 A; 3OW2 U; 5IT9 N; 1NS1 A; 2UXC B; 4DR4 B; 3H9V A; 2ETN A; 2MK3 A; 3OMN B; 3JD1 A; 3OM3 B; 5LXT B; 4I9Q A; 4Q20 A; 4DYL A; 3C3T A; 1ZWI C; 5D5P A; 5C8Y A; 3LSQ A; 3CCM V; 2Q7G A; 4I5S A; 3K0D A; 1J5E B; 1OCZ C; 4PDR A; 2FML A; 4B7K A; 4FM2 A; 4X1Y A; 1V9P A; 4LFC O; 4NXN B; 1V54 B; 5LP6 A; 1FXK B; 1KUQ A; 4MW8 A; 1KB9 F; 2XT9 A; 4MVO A; 1S5J A; 3SJQ C; 4XDL A; 3AG1 C; 1IBK O; 1Q43 A; 3P3N A; 4DR7 O; 3ETD A; 4X65 B; 1Z5W A; 2X7R B; 2EX3 A; 3ZRW A; 2ODM A; 2AHY A; 2P7T C; 1XDC A; 4EFE A; 5KLV H; 4N21 A; 1P7B A; 1R3L C; 4K3A A; 4FIP C; 3M99 B; 1NZ6 A; 1FPO A; 3QO7 A; 4QE7 A; 4GKJ B; 5GON A; 2AGA A; 1Q90 D; 1AJQ A; 2Y4T A; 4B3M B; 5LXT A; 1XRE A; 3CD6 V; 2UUC B; 3Q4H A; 5JWP A; 4J7J A; 4JI0 O; 4IYI A; 2WAM A; 2H3O A; 1VQ5 V; 1GAX A; 2ZDI C; 1SQP H; 2Q4P A; 3RVY A; 4MVU A; 3AG3 B; 4U3J A; 3G80 A; 3ETG A; 3HPL C; 1MSD A; 1PNK A; 4LH7 A; 3ASO C; 1L0N H; 2PI5 A; 1R3I C; 1H2M A; 2NNU A; 2VS0 A; 1FXK A; 1PP9 H; 2QJ1 A; 3A0R A; 4FFK A; 4DV6 O; 3P3P A; 5IYC O; 4D6T H; 1VP7 A; 5A2Q N; 2P22 C; 2HHH O; 1GN2 A; 1TA8 A; 3HKE B; 4W4K A; 4JYA O; 4NYK A; 2DW4 A; 3AG4 B; 1CEZ A; 4NXM O; 1N0N A; 1Y4M A; 4DR2 B; 1U97 A; 5LHI A; 4WBN A; 1VQ6 V; 5B5E Z; 4D7T A; 2FTK A; 4LF9 B; 3WB1 A; 3D36 A; 5LMN B; 4MSW C; 2UUB B; 3CWB H; 2ZXW B; 1XMO B; 5A9G A; 2Q68 A; 1QBZ A; 3STL C; 3CCE V; 5DM6 V; 2UU9 O; 5H5N A; 3STZ C; 2XAS A; 2IJJ A; 2XOK G; 4UCU A; 4O2B A; 2E76 B; 4JI3 O; 3EXA A; 4MVR A; 1WJZ A; 2Z0A A; 3LNM B; 2VQE O; 5JQG A; 4DV1 B; 2WLI B; 2VQF B; 1Z2G A; 3ETQ A; 4HYO A; 3DC6 A; 1W59 A; 3ASN C; 1KU9 A; 4MW3 A; 1Q82 W; 2VWK A; 1HR0 B; 3I55 V; 2F43 G; 2GTS A; 2EIL C; 2Y4U A; 4K8X A; 1K9M W; 2QKC A; 5IYD O; 1IVS A; 3HKE A; 4WFF A; 1IZ3 A; 4CS3 A; 3OEH G; 2XUM A; 3JD0 A; 2ADQ B; 1OCO B; 1H2L A; 1RM1 B; 1B3Q A; 3KCX A; 2ZNI A; 4DR1 O; 4LFA B; 1F23 A; 3MHS C; 5BR8 B; 4GX2 A; 3SYC A; 1XNQ B; 2PI4 A; 3H1K H; 5JCO A; 3THO A; 1SET A; 3FYE B; 2P90 A; 2WLK A; 1ROP A; 1VQM V; 4KHP B; 4X1K B; 1RPR A; 3FFQ A; 4YHH B; 1N34 B; 2EIM C; 4KUM A; 1Q86 W; 3OD4 A; 5LGU A; 1OZ0 A; 4JI8 B; 1XNR O; 1XQ8 A; 1PL4 A; 2EJR A; 2ZE7 A; 3F5T A; 2V4D A; 2ZNJ A; 2WLI A; 4AHC A; 2DYS C; 4X66 O; 4DO2 A; 4I50 A; 2JVD A; 3D8C A; 5K1X A; 3KCY A; 2Q5Z A; 2DWD C; 1SA0 A; 1K5S A; 3GWK C; 3IGA C; 3UQ8 A; 5IY5 B; 2BSK B; 1NTM H; 4DR6 O; 3JSL A; 1W0J G; 3FYI B; 5KHG A; 1SKV A; 1X4T A; 2LO1 A; 1N4C A; 4X88 A; 1OV9 A; 1H2N A; 1M93 A; 2UUA B; 3JAL A; 2CGN A; 2IH1 C; 1VEW A; 4ZOL B; 2B9Z A; 2ZR3 A; 4I9W A; 4A5U B; 2JIZ G; 3T4Z A; 1PNM A; 1J95 A; 1THZ A; 2B1I A; 4JI4 O; 3I5D A; 2YS8 A; 2NR5 A; 4DR4 O; 3UT5 B; 1R6T A; 1SS3 A; 5JJN B; 3G6B A; 2HKO A; 3SGI A; 1Q7Y W; 4CC6 A; 4X1K A; 3BFR A; 3ZMU A; 1VQO V; 1VQP V; 3VQW A; 3BA9 A; 1T5E A; 2M7W A; 1IBM B; 3C90 A; 2IH3 C; 4BW9 A; 1AR5 A; 3CC7 V; 1JVM A; 1M4U A; 2R9R B; 3CRQ A; 3P32 A; 4I55 B; 4OX9 B; 3U10 A; 3DC5 A; 5KUM A; 4JI5 O; 3BAB A; 4LC1 A; 1G4Y B; 4ZI7 B; 1S5L Z; 2KQX A; 4KP4 A; 2YDE A; 1K34 A; 4DRX A; 4YIP A; 1H38 A; 3SYP A; 3E22 A; 2LP7 A; 2Y48 A; 1KBH A; 1MOF A; 1XUQ A; 3KG2 A; 3G4S V; 1YJ9 V; 1HP8 A; 4G2K A; 2KSD A; 2FYU H; 1GM8 A; 3BHP A; 5L3C A; 4N23 A; 4O2A B; 3ZMT A; 4JZG A; 4H44 B; 1K8A W; 5B1N A; 2F66 C; 3SPG A; 2F95 B; 1QLE C; 1QHT A; 4X65 O; 4FLZ A; 3LDD A; 2DYR C; 2N74 A; 3VBB A; 1I0H A; 4DW0 A; 3RW0 A; 1HNZ B; 1DF4 A; 3NXS A; 3H1J H; 3L71 H; 2YC0 A; 2GHY A; 4FPP A; 1GH6 A; 2YIA A; 3ZCC A; 4O4L B; 4GKJ O; 2XAJ A; 2K1E A; 1GK9 A; 3K0G A; 2XAG A; 4JYC A; 4DV3 B; 2AHZ A; 1I7F A; 1BHB A; 1Q6H A; 3CCJ V; 3JAR A; 1FKA O; 2HG5 C; 5CMU A; 3RWR D; 2ITD C; 2CH7 B; 3JAS B; 4IHJ B; 4QPK A; 1Y76 A; 1YXB A; 3IAY A; 1NR1 A; 3APQ A; 2R9I A; 2PYJ A; 3X2Q B; 4DR3 O; 4CS4 A; 3E83 A; 5IYZ B; 5B3S B; 4NR1 A; 4LF5 B; 4JI1 B; 4O2A A; 1NTZ H; 4IL6 Z; 5B1O A; 5LP6 C; 2H8P C; 3QG5 A; 1BSM A; 1DTO A; 3ABK B; 2QWQ B; 3DGE A; 1I94 B; 1GKF A; 4ASU G; 1IUR A; 1R3K C; 4LR3 A; 2QWO B; 3JAT A; 2DQ3 A; 5IJ0 B; 3RYF A; 2RQ6 A; 1IXB A; 3ZHT A; 2Q73 A; 4DR2 O; 3A8T A; 3RVZ A; 1XEQ A; 2CK3 G; 4IIJ B; 4JI6 B; 1UFI A; 5CB4 B; 4DUY O; 2Q7H A; 1YF2 A; 1XHZ A; 5JVD A; 1W0K G; 4B08 A; 4PEL A; 4HAM A; 3OUF A; 1SES A; 4H0L B; 3BVO A; 4X64 O; 3K5L A; 2ZM6 O; 3D3Q A; 1F4N A; 1FXV A; 2LFR A; 4MVM A; 1ZTE A; 5L3B A; 4JYY A; 1YJW V; 2LGW A; 1JJ2 U; 2ZIO A; 1JR9 A; 1NTK H; 3B8M A; 5CBG A; 1S5H C; 2YIB D; 4D7S A; 2CH7 A; 1YCI A; 1OCR B; 2GUZ B; 1XMQ O; 1NKD A; 4R7C A; 1BMF G; 3F7V C; 1AI6 A; 4CBC A; 1I5X A; 2IU0 A; 3FAV B; 4YXW G; 3TXS A; 3MD0 A; 2OCC B; 3QO5 A; 3BY6 A; 4I4T B; 5EBM C; 1H8E G; 1HR0 O; 1IBL B; 1N33 O; 2ZE8 A; 4B3S O; 1QNM A; 3PN1 A; 1MAB G; 2PYL A; 3SJB C; 3SPH A; 2YEV B; 1YI2 V; 3NR7 A; 2BTQ B; 2HP8 A; 4EFB A; 4RAI A; 2PF4 E; 1BQ0 A; 2EIJ C; 3WG7 B; 4OPA A; 4F6R B; 3RYI A; 2QTO A; 1WAZ A; 3K58 A; 2L35 A; 4X1I A; 3TCU A; 1BZK A; 1YJN V; 1YSC A; 4IIJ A; 3ZMZ A; 4LFA O; 3I56 V; 2DWE C; 5CB4 A; 3OTO B; 5FNV B; 2QE7 G; 2DOS A; 4QNH B; 1R6K A; 5H6R A; 1SZT A; 3JD2 A; 1L0L H; 2GBO A; 2KKW A; 5CN0 A; 4TV9 A; 4ZKI A; 1SQV H; 3RYC B; 2DE0 X; 3CX5 F; 3E86 A; 1LUW A; 1R3J C; 5J2T A; 3P30 A; 1N34 O; 2JRI A; 1D5A A; 1M57 C; 1ZAU A; 3PJS K; 4QIW F; 4JI8 O; 4JI2 B; 3T1H B; 2N04 A; 4LF8 O; 3M8A A; 4B7E A; 5J2U A; 3L72 H; 2GUZ A; 1AI5 A; 2IJK A; 2N05 A; 1N8R W; 5BMV B; 4FZ1 A; 2YXY A; 2ZKO A; 1BGY H; 1VQL V; 4QPJ A; 3SDL A; 2JJ2 G; 3AG3 C; 4TUY B; 5EYP B; 3ZRV A; 1JMK C; 3CE2 A; 4UB6 Z; 1QVF U; 2EIK C; 4JI7 B; 3ZX6 A; 1Z5V A; 3LDE A; 4FLX A; 4WCE V; 1M1K W; 1BCC H; 3FB7 C; 3L74 H; 4I7Z B; 5KMG B; 5B1B B; 3WB0 A; 1EN4 A; 1KEC A; 2UUA O; 3T4D A; 2HVJ C; 1ZLZ A; 1HW7 A; 4X62 O; 5FNV A; 5KAI Z; 3HKD B; 3K5N A; 2AZ0 A; 1SQF A; 3RN4 A; 2CTR A; 1JPX A; 1RPO A; 3AK2 A; 2RMK B; 2P5O A; 2XAF A; 2ZXW C; 1ZSP A; 1N32 O; 3RYH A; 3QNE A; 4FMT A; 3GVM A; 4LF7 B; 1M56 B; 1Y67 A; 3IC7 A; 3ZED A; 4MTX A; 1V55 B; 3UO3 A; 2A3Q A; 2OTJ V; 5BMV A; 2F4V B; 2WLN A; 4JGS A; 5IJ9 B; 3K08 A; 2YXH A; 5HFL A; 1YTF D; 3K57 A; 1JFF B; 2ZE5 A; 3CRR A; 4JF3 A; 4JAS A; 3RFR A; 1JX9 A; 4K0K B; 4AQY B; 4NTX A; 2JEX A; 4TUY A; 2R70 A; 4DW1 A; 2IJI A; 3OTF A; 4BWA A; 5LGN A; 5B1A B; 5LBQ A; 5KMG A; 2QTS A; 2A79 B; 4RQF A; 2Q69 A; 4QGP A; 2QKS A; 1FAF A; 4DR5 B; 3ZMS A; 4EKW A; 4AI8 A; 5F2V O; 2B5U A; 3CCL V; 1WA8 B; 4DUZ B; 4P2Z A; 2Y69 C; 4F6E A; 3HKD A; 4O4H B; 4IYH A; 3CS5 A; 1VF5 B; 3F7Y C; 2ARH A; 3DXR B; 4DK1 A; 3L73 H; 1NJI W; 4NKG B; 3SPI A; 1DF5 A; 2QWN B; 4PD4 F; 2X6B A; 4CS2 A; 5LMU O; 4JV5 O; 4PDL A; 1OCZ B; 4DV3 O; 2PUS A; 4W4L A; 4PDV A; 1SQB H; 4JPR A; 3W7W A; 4MTO A; 2GV9 A; 1XL6 A; 3JYC A; 2OTL V; 5JH7 B; 1S3J A; 3E8H A; 4DV7 B; 2DQ0 A; 5IWA B; 3ZN0 A; 3K59 A; 1CPY A; 4BIU A; 4B3T O; 4JZ2 A; 4LCU C; 2XAQ A; 1M5I A; 3AG1 B; 2KB1 A; 4GZR B; 4J41 A; 3OR6 C; 1VQ9 V; 1G8M A; 2BOC C; 3ABL C; 2Q8V A; 3ZS8 C; 4HNA B; 4LP8 A; 3AG2 C; 4JAA A; 4CH6 A; 2FB5 A; 2FL4 A; 1SRY A; 4JI1 O; 4U3F H; 3TJT A; 1ORQ C; 4L8J A; 2PGG A; 3CJH B; 2UXN A; 1S77 D; 2LJ2 A; 4R50 A; 1S0V A; 3OUS A; 5HFM A; 1WA8 A; 2A06 H; 4KFM A; 1P84 F; 1EFR G; 3OFN G; 5BY1 A; 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