4I2TA

Crystal structure of the oxidized glutaredoxin from chlorella sorokiniana t-89
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SAAKQLVDSTISGNKVVIFSKTYCPYCVKGKRALEKFLPKSKITAIELDGRNDGAAIQDYLLELTGGRSVPRVFIDGQFIGGGDDTDALARNGKLEVMLRNAGVLLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure and functional analysis of glutaredoxin from Chlorella sorokiniana T-89
rcsb
molecule keywords glutaredoxin
source organism Chlorella sorokiniana
molecule tags Oxidoreductase
total genus 34
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4i2tA00
3UBKA 4DSSA 3IRAA 3L78A 2J9HA 3KTBA 5ENUA 3ISOA 5E59A 1W89A 2KLXA 3NZNA 1XVQA 1S3DA 1ZYEA 3KCMA 3QD9A 1XWBA 3GTUB 3QFAC 5ECHB 3NIVA 1BYEA 2K18A 2LNTA 2OKAA 5GAPD 2DIZA 4TXOA 2LKUA 5D73A 3KD0A 2LJRA 3CBUA 2BTOT 5D9WA 4JR4A 1FVJA 3FR3A 5ID2B 3TRXA 3KGKA 2E2MA 1J0FA 4EF0A 4F0BA 3KJYA 2YV7A 2H01A 2N5BA 4KAEA 1U88A 1PA3A 1ACVA 2PN8A 2IFQB 4FIWA 4GWRA 2H6ZA 5G31A 4GRFA 4ZB6A 1O85A 1V57A 2HNLA 1B4QA 4EL1A 1TDIA 2HZFA 3LQ7A 2JSZA 2MYGA 10GSA 3TJJA 4GTUA 4BWQA 4ID0A 2VL9A 1GRXA 4OFNA 2ZNMA 4J2FA 3WT2A 5CRGA 1WOUA 5EY6A 2VLTA 2HFDA 1OE7A 3S9FA 2X8HA 1A24A 4D73A 4TR1B 2OE3A 4ZL9A 1THXA 5FHIA 1GTUA 4MJEA 2HRFA 1PSQA 5F07A 1Z7PA 1X5DA 4I8BA 2JZTA 1SJ6A 2EIQA 4OMVA 3TJGA 3TGZA 1FB0A 2CVBA 1TI1A 2XHFA 5IO0A 1FAAA 3F8UA 3QAGA 5DJLA 2VM2A 3GNJA 3FZ4A 3IR4A 1Q4JA 3F63A 1A2JA 3FY7A 2FWHA 2YP6A 1QUWA 2YOIA 3HHVA 2CVKA 2I3YA 4KE3A 3F4SA 5CYYA 5CRWA 2KP1A 2JZSA 2K8SA 3D21A 1HD2A 3DIEA 2CV4A 4K7NA 2RUFA 3GV1A 1TRUA 5IM9A 5FWGA 2YWMA 1AC1A 5F06A 3DRNA 1SK1A 4OCFA 4IBPA 2YWNA 1Z3EA 2L4QA 5D9TA 2C0DA 3ZTLA 2AB6A 4FYCA 4MP4A 1GUHA 4TR0A 2LJKA 1SKSB 1MD3A 3QR6A 1XFLA 14GSA 1AQWA 2H0IA 4KCEA 5H5QA 4XS4B 4CDOA 2PVQA 4MPFA 1B9YC 4G9HA 1WIKA 5DVBA 2ON7A 9GSSA 1AW9A 2GZYA 1EEJA 3LJRA 4IQ1A 1XOAA 1X9SB 19GSA 4EDYA 2VCVA 2MMZA 1VRSD 2JACA 1SL2B 3MSZA 1NSWA 3FZ5A 2O85A 3QFBC 3CSJA 4HOJA 1BQ7A 3M0FA 2JZRA 3DYRA 2B5YA 3L9UA 2C0EA 2YJHA 1Y25A 2KOKA 4G19A 3ZFBA 2WCIA 5AISA 2OBIA 3HZ8A 1XWCA 3MAKA 4XRAA 4LL1B 3L0HA 3UJ1A 1EZKA 4MMMA 2OBKA 3DXBA 1RQMA 3DMLA 2H74A 2FWEA 3BOAA 5IMDA 3N5OA 1CQGA 1WMJA 2HI7A 2LTKA 5ECLB 2XBIA 3LORA 3VPTA 5JCUA 2JSYA 4KDUA 3L9VA 4ML6A 4KSMA 1Z5YE 2MBSA 1EP8A 3Q6OA 2B7KA 4HI7A 2F8FA 1R26A 1ST9A 2CAIA 4MH3A 5ECIB 1DE1A 2R3XA 1YY7A 3GL3A 3GKKA 1FG4A 2H76A 1K0DA 3CRUA 4K6XA 4YH2A 1A2MA 4PNFA 4IQAA 3A3TA 2B1LA 3TRPA 3D6IA 1K0CA 5CRDA 4EUYA 4HU9A 5IQYA 1MDJA 3GMFA 4J57E 3IAM2 2VLVA 4OFTA 4KW6A 3TDGA 3F4TA 2G0FA 3K8NA 3TOTA 5B8BA 3L4NA 4HS1A 1ILOA 3I69A 3CXGA 4AJ8A 3H1NA 1XOBA 5G5FA 3KTLA 4EE0A 2P0GA 11GSA 1XW6A 2P5QA 5J4UA 5ELGA 3TCOA 2GQMA 4MABA 4JEDA 4POKA 1A8LA 3GX0A 18GSA 5B8AA 2VL3A 1GSYA 3GIXA 1JLVA 3JCML 3PR8A 4RQRA 2FWGA 2LQQA 4MZCA 2ZUPA 2C80A 2VD0A 4NAXA 5KEJA 4NHZA 1ZGNA 5L71A 1YZXA 1AUCA 1U3IA 5ECQB 3RBTA 3RDWA 1DUGA 4YQVA 3TJBA 3UL3A 1THOA 2O89A 5COHA 3G7JA 2C1YA 3FR9A 1TK5B 1I5GA 2YN1A 5A4VA 1OVNA 4GF0A 5F05A 1B48A 4EO3A 5DCHA 4XTSA 3F0IA 4PQIA 4XHMA 2NDOA 4PQHA 1Z9HA 2H1GA 4JRRA 3MWHA 1IYIA 3DVXA 3VWWA 3FKFA 2LV3A 1H75A 4KA0A 1GP1A 4ZL8A 1FHEA 3IXRA 2WZ9A 3VWUA 1K0MA 1GSQA 3EU3A 3F6FA 4AJ7A 2MMNA 3N9JA 1S3AA 1URMA 3QCPA 1MTCA 5HR3A 2GSSA 5C04A 3EINA 2B6MA 1FO5A 2PU9C 5DDLA 4IW9A 2GDRA 2XC2A 4YQUA 2LUSA 5ECRB 3O76A 3IHQA 1SD9A 1JZDA 3H79A 1T3BA 4F9ZA 5D93A 3EE2A 2FWFA 3FR6A 5F0GA 3L9SA 5DQYA 2AAWA 4MJAA 5JWQB 2V2GA 2X99A 4OO5A 3UARA 1BX9A 1YF0A 3ZL5A 3GFKA 1M0UA 1AQVA 4QQ7A 2LRNA 1TKDB 3GSSA 4MF6A 2FUG2 5HR1A 2GS3A 1SJIA 1OC3A 1SJZA 1ZL9A 4TRXA 2NTOA 1M9AA 2PPTA 2IMIA 3C73A 5D9VA 4KX4A 4AJ6A 3DD3A 4K0NA 1OKDA 2FA8A 1NHOA 4YAPA 5KN1A 4EXJA 3TJKA 3VK9A 3TJFA 1XWKA 2FY6A 1XW9A 1K3YA 5IOWA 2H72A 4I6XA 1RK4A 1EV9A 4RUVA 4K2DA 2F9SA 4K0GA 3Q74A 5DAKA 1A8YA 5H5RA 4NV2A 1GSFA 2YV9A 5J9BA 2K9FA 1PX6A 3HD5A 4IKHA 3ZRDA 1XWGA 3IPZA 4JZQA 5AN1A 1GSUA 2C3TA 4BVXA 4FYBA 2C0GA 2P5RA 16GSA 1SYXA 4POBA 2N5FA 1KNGA 2YPMA 3BBYA 5LD0A 3KH7A 1XW5A 4MF5A 1JHBA 2HSHA 2CAQA 2XPDA 2OACA 2X8GA 3WGEA 1GSSA 1BAYA 4NWYA 3ZYWA 1BJXA 1ABAA 1M2BA 5CO3A 5A4UA 3UIWA 1KBNA 4IGJA 3MDKA 1F3BA 5IMFA 3C8EA 4YQMA 2XBQA 1U6TA 4RI6A 2KHPA 3HDCA 2REMA 2H0HA 2PUKC 3HXSA 5J3RA 2GVPA 2IL3A 2LNSA 4LA1A 3LEFA 4ML1A 4ZBBA 4TKYA 2H70A 3HJMA 3IC4A 2FGXA 3QMXA 3EMPA 1HNCA 3TKSC 1ZCPA 2QSIA 1OC9B 2OJLA 2IPAA 2GQLA 4JU5A 4BWSA 1GH2A 2GZZA 1TTZA 3IBHA 3SBCA 3IE3A 2F8AA 4X1UA 4MJCA 1OKTA 2YWOA 3HVSA 2L57A 2HLSA 4ZB9A 1PMTA 2HYXA 2VCZA 3BD2A 4GQCA 4IJ3A 5J9CA 4ZILA 1DSBA 3APQA 3P8WA 2TRXA 3P7XA 2FD3A 3A2VA 5C00A 5JCGA 3GURA 4KDXA 1FB6A 3ZMLA 4MA9A 4JR6A 4BA7A 2QKEA 2RLIA 3GH9A 4KNDA 5KN2A 4NHWA 4KH7A 4K7IA 4N0ZA 4MK3A 3WT1A 4HQZA 4ZB8A 4RI7A 3TRQA 1PL2A 3QDNA 1PL1A 1B9XC 4MDCA 4V2LA 4WETA 5E4WA 3ME7A 4EC0A 1X9MB 4ECCA 1OC8A 4FH8A 1AXDA 4TR3A 5J41A 2A4VA 3E0UA 3DVWA 2VCTA 5KN0A 3A2XA 1VF1A 2AHEA 4OCEA 4PNGA 3EU4A 2V6OA 4O92A 3ZLPA 4LMWA 1IYHA 2DMMA 2CZ2A 3ZITA 2H30A 2IJYA 4TN8A 4MZBA 4ZIJA 2HZEB 1HNAA 3HCZA 5IMCA 2WS2A 4Q5FA 4E8EA 1I9DA 3QAVA 1G7OA 4O32A 4V1Ap 2C0FA 3LXTA 2DJ2A 2WULA 4IS0A 1EWXA 1QMVA 3QAWA 4GSSA 2IN3A 20GSA 5G5EA 5D96A 4XRDA 3FEUA 4WF5A 4WBRD 3M3MA 1AQXA 3GKNA 5ECPB 5ECSA 13GSA 5ID2A 3EWLA 3GKMA 3ZVJD 5IMVA 3BCIA 1Y6EA 2DMLA 2RM5A 3ZIJA 3TB2A 2IFQA 2HE3A 3Q18A 2FNOA 1HQOA 4KB3A 2EC4A 3R2QA 4J56E 4K8MA 1EGRA 3TKRA 4ISDA 2WRTA 3G9BA 3E9JB 1T4ZA 1TJDA 2VD1A 2DJ3A 2DJ1A 5DALB 4NV5A 3LSZA 5B6NA 4F82A 1GSEA 2C3NA 4BVYA 3TKSA 1PQNA 4XCSA 3KIJA 1KEBA 4GSTA 1O8WA 2VLUA 2X64A 1J08A 2WJUA 5J5NA 1OE8A 1F37A 2P31A 2H6XA 2OADA 1TW9A 1Z7RA 2NPBA 4HJ2A 2O8VB 1XCCA 3C1RA 3D5JA 4GSNA 2HSYA 1X9WB 2H1BA 3KMNA 5DJMA 4WR4A 3H4KA 3P90A 2V6KA 1A0FA 1TRSA 2TIRA 4DSSB 1GLPA 1EOGA 1PN9A 3PINA 4G10A 2M72A 1BG5A 4IN0A 2VIMA 1JZOA 5GSSA 4PUFC 4MLYA 3FZAA 2GSTA 4PURA 4YAVA 1WWJA 1SU9A 1SK2A 3QPMA 1NM3A 1ZMAA 1X5CA 1PRXA 4NMUA 4OFMA 1LU4A 4E8HA 7GSSA 3LGCA 4TXOB 4KSOA 3ERGA 4FO5A 3UVHA 5IO2A 2E0QA 2LS5A 4MH2A 3D4TA 6GSUA 2EIRA 4TVEA 3VI5A 4HZ4A 4F03A 2NBSA 1WE0A 6GSYA 5GSTA 2R37A 2B7JA 1FW1A 2QGVA 3US3A 2YZUA 2RUEA 2TRCP 1U3AA 1EOHA 3IAS2 1PGTA 1F9MA 3VURA 4NPBA 5F8BA 4EDZA 3EMXA 3ZFLA 1GNEA 2PBJA 5IMAA 3RAZA 1Z6NA 1MEKA 4O5RA 1E2YA 4MPGA 3IK7A 5CAXA 2C8UA 4GQFA 2WDUA 5DCGA 2WGRA 2LQOA 4MF7A 2ON5A 2LSTA 2CQ9A 3KZQA 4BPYA 3HZ4A 2WB9A 1M2DA 1EV4A 1TI3A 1TK0B 1MDIA 2GSRA 4L0UA 1E6BA 1TRWA 22GSA 1O6JA 1USBA 1GULA 1SENA 3TKPA 5DQSA 4D73B 2HRNA 2IMEA 1K0NA 4RQXA 4V2NA 1AAZA 3ME8A 1BEDA 3M8NA 1YKCA 4GXZA 5AIVA 3ERFA 4XS1A 5IPHA 1EP7A 4I2UA 2GSQA 1O8XA 3GX8A 4PUAA 2IMDA 3M9JA 3GKXA 5GAND 2RIIA 1Z6MA 3LFLA 2R2JA 2LRCA 4V1Ag 5G2ZA 1B8XA 4ULXA 2L4CA 4K9ZA 4WXTA 3M9KA 4WBJA 5ECMB 2IMFA 3GYKA 1G6WA 4WF4A 4CW9A 2ALBA 4EVMA 4POMA 4LL4B 2ZCTA 1ERUA 1MDKA 2I1UA 5EPFA 1GLQA 5ECNB 3F9UA 1V2AA 3SWLA 2V1MA 1TXXA 3H8QA 5B6MA 4QL9A 4PXOA 1XWAA 2M80A 2F51A 5FT3A 3FZ9A 4ZL7A 1F2EA 4KCAA 4JE1A 1G6YA 2DJ0A 3RHBA 3H93A 1O73A 3CSIA 1V98A 2DBCA 4PQ1A 3GN3A 5JWOB 3HJOA 4F0CA 5IPGA 2NVLA 3IA1A 2CX3A 2MBTA 1W4VA 3HYPA 4ZBAA 2DJJA 1Q98A 2MZCA 1GL8A 2AUVA 17GSA 2RM6A 1YEPA 3FRCA 1NHYA 2BMXA 5HFIA 6GSTA 2YNXA 3GRXA 1GSDA 5IOXA 1EEMA 3ZREA 1XXUA 1TK8B 4POLA 3WGDA 4I97A 4MJBA 4L8EA 2HT9A 3G7IA 1G7EA 2YWIA 3APSA 2V32A 2VL2C 1AIUA 3D4MA 3J7Yk 2VOCA 1QK8A 1V58A 4H86A 1ML6A 5JWRB 3FHKA 1XBSA 2YCDA 4ZXGA 5CREA 2X8CA 5GZZB 1S3CA 1WP0A 3TKQA 5LNKe 1JLWA 3W8SA 4X0XA 1YEXA 2A2SA 2L5LA 6GSSA 2Z9SA 2PWJA 1PD21 1F3AA 1MD4A 4KUNA 1XIYA 4F2IA 3HKRA 2H1DA 2CX4A 2AJQB 4K1FA 1YDKA 2O7KA 4HUAA 1OYJA 4GLTA 4HZ2A 1JZWA 4OWYA 1EGOA 2K8VA 4IELA 3ZZXA 4PGTA 1YJ6A 3CYNA 5DBQA 3F6DA 5D8IA 5EL8A 3HVXA 1B4PA 1YF1A 2VCWA 2FA4A 4ECJA 2F3MA 4N10A 3UVTA 4IJIA 4L0WA 5HFGA 1UVZA 2H66A 5HR2A 1WRYA 1TP9A 3EVIA 3IOSA 2PVOC 1K0OA 1TU8A 2DC5A 4IP1A 2IMKA 1QGVA 1LBKA 5G1KA 3KEBA 2R5GA 3BJ5A 4O7HA 6GSVA 2BJXA 1GTBA 2VAFA 2J23A 2MMAA 2KP2A 4HEA2 4AGSA 1R5PA 5HFKA 1V9WA 4V2MA 3NOFA 1N2AA 2JU5A 5EVOA 4TOPA 1R7HA 3ERWA 1TRVA 1SK0A 4LMVA 2H19A 3J7Yb 3UEMA 1K0AA 3KP9A 2PMTA 1UN2A 2H0GA 1FOVA 2PGTA 4HJMA 3O3TA 1JFUA 1LJRA 4XIHA 3HJPA 2VUPA 3ZVJA 1ZZYA 2GGTA 1PX7A 3BCKA 3TOUA 4P3YB 3VPQA 2LJAA 3C1SA 5HR0A 3ZIVA 4KDYA 1T1VA 1HYUA 3GTUA 2E7PA 3WYWA 1RW1A 3TKSE 2L6DA 2VO4A 1HNBA 3F3QA 4I5QA 4IVFA 3VI7A 2D2ZA 2KUCA 2ES7A 2VCQA 3GL5A 3LXZA 1U87A 1VF3A 1XVWA 3A2WA 2XPEA 1UA5A 1CQHA 1M99A 1TU7A 1XZOA 3PH9A 4MZWA 5G1LA 3HVVA 5ECKB 3FW2A 3VWVA 2AYTA 3UMAA 2YANA 3GSTA 1VF2A 5INYA 6GSWA 3LWAA 4QL7A 5B7CA 2VL2A 3Q19A 1GUMA 3HA9A 5AGYA 2JL4A 5CNWA 2H71A 2H6YA 5CRHA 4MCUA 1SKWB 1ZYQB 2GZPA 3PGTA 1GWCA 3D0ZA 2LEGA 3MNGA 1OC9A 3QOUA 4ECBA 2V41A 2H75A 3F3RA 4L5LA 3O6TA 5HQPA 3UAPA 1WPIA 2H73A 5IMZA 1A2LA 2L6CA 4I2TA 1PKWA 2N5AA 4KGIA 3CTGA 1GUKA 2VM1A 1O7UA 4TR1A 1GTAA 5A4WA 5JCWA 4FYUA 2OE1A 3C71A 2FLSA 1ZOFA 1OAZA 2OE0A 3UOMA 1DBYA 3GA4A 1M9BA 2FCHA 2GT6A 1YQ1A 4OO4A 2WFCA 1N8JA 4Q5QA 3I43A 4WEYA 3WD6A 3ZMKA 3LYKA 2YJ7A 3KM6A 3IDVA 2E2GA 3IV4A 3RPPA 5KN3A 3C7MA 5DAKB 3V1WA 3KMOA 3W8JA 3E3EA 3GHAA 1T4YA 1SL1B 5G30A 1J9BA 1SKRB 4DVCA 2LRTA 2HXKA 3I9V2 2M46A 2YZHA 8GSSA 3TUEA 2B5XA 2DLXA 5H5SA 2H8LA 3RHCA 1K3OA 3CTFA 3DGQA 3W6GA 4HU7A 4OD7A 4HDEA 5CP1A 2C4JA 2GTUA 1G0TA 5D9XA 3RPNA 3AY8A 3DKSA 3DWVA 3KP8A 2G2QA 1ERTA 2CZ3A 4ECIA 1V40A 4N30A 5IIZA 2CA8A 4IHUA 5LCZA 1O81A 4XS4A 3LYPA 1UC7A 3U6VA 1VF4A 5ABRA 3I6AA 4DSRA 2K6VA 2CT6A 2GLRA 4EKZA 3F4RA 2HZEA 1XPVA 4CHSA 2OA7A 2R4VA 1ERWA 1X0RA 1GTIA 1NW2A 1SL0B 2L59A 4Q5NA 1C72A 3EURA 1VGLA 2CVDA 5ELAA 2GQKA 2I81A 1JZRA 3HY2A 1ERVA 1PKZA 1F6MC 3CSHA 1H4OA 2C3QA 4ACSA 2A2RA 1QFNA 4JBBA 4Q5RA 2H1AA 3VWXA 3UBLA 4K7OA 4N11A 1KTEA 1K0BA 2DJKA 4ILFA 1M7TA 4DEJA 3A5WA 2B3SA 1QQ2A 2DIYA 2DSAA 1FVKA 3FYGA 4G2EA 6GSXA 1WJKA 5ECOB 2VCXA 3U5RE 4TR4A 3GUSA 1SD8A 4IP6A 1T7PB 5AIXA 1K3LA 3VLNA 1R4WA 3WGXA 12GSA 4GCIA 2B5EA 3D22A 4DSQA 2I9HA 4NXIA 3APOA 4XS6A 1A23A 5DALA 2QC7A 1TOFA 3IK9A 4X43A 1QXHA 4TW5A 4PX1A 1DE2A 1T00A 3KXOA 3CRTA 2L5OA 2MMOA 4AF2A 3GH6A 2O87A 3OR5A 2JADA 1ON4A 3DEXA 3LG6A 1YKAA 2R6KA 3VFIA 4L5OA 2IWTA 2PERA 1SYRA 2GT5A 2B1KA 2EIOA 3G7YA 1GNWA 2AV4A 3CMIA 3ED3A 5A5KA 3KH9A 3P2AA 4TXVA 4Z7XA 4ZBDA 1T8EB 1X5EA 3M1GA 4BL7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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