4I2TA

Crystal structure of the oxidized glutaredoxin from chlorella sorokiniana t-89
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SAAKQLVDSTISGNKVVIFSKTYCPYCVKGKRALEKFLPKSKITAIELDGRNDGAAIQDYLLELTGGRSVPRVFIDGQFIGGGDDTDALARNGKLEVMLRNAGVLLEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure and functional analysis of glutaredoxin from Chlorella sorokiniana T-89
rcsb
molecule keywords glutaredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Chlorella sorokiniana
total genus 34
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4i2tA00
2QKEA 2CAIA 3M8NA 1LJRA 3M0FA 1Q4JA 1JLVA 1Q98A 1B48A 3VK9A 3TUEA 2WCIA 1XFLA 4RQRA 4ZBBA 5G5EA 4TR0A 1XCCA 5CRHA 2L4CA 4ZILA 1GLQA 3F3QA 4HOJA 1A0FA 2DMMA 3DVXA 3O3TA 2R6KA 18GSA 1K0BA 3EWLA 4XS4B 3PGTA 3QDNA 1TK0B 2DMLA 4PNFA 4V1Ap 3HVSA 1R4WA 5ECQB 2CZ3A 4AJ8A 3ZIJA 5IO2A 5FHIA 5CO3A 3IOSA 2TRCP 1PL2A 2FWEA 1JHBA 3LWAA 2BMXA 3D6IA 2RM6A 1ABAA 3H79A 2J9HA 2EIRA 1THXA 2R4VA 2CX4A 2K8VA 4X0XA 3TGZA 4HZ4A 3WT2A 5ECOB 2PUKC 1XOBA 4HEA2 3IHQA 5KN1A 4KUNA 3GN3A 1YZXA 3RDWA 5HR0A 4MZCA 5E4WA 1OKTA 2H6XA 3CRTA 1PX7A 4JRRA 1SJIA 4HDEA 3IR4A 1GLPA 3WD6A 2H1AA 3DGQA 1ZL9A 1XWAA 4BPYA 3CBUA 4MJEA 1T3BA 4HUAA 3APOA 1S3AA 2WB9A 2FWHA 5D9TA 1DBYA 3G7JA 1GNEA 1GSYA 3M9JA 1FOVA 3IDVA 5ID2A 2F9SA 2AYTA 4RI7A 2HZEA 1A24A 2F8FA 2NTOA 3J7Yk 3HZ8A 3HZ4A 3GFKA 1ML6A 2I9HA 4ZL8A 1YEXA 3UAPA 1K0DA 4POLA 2MZCA 4F9ZA 2ALBA 2ON7A 1O7UA 1EZKA 2YWNA 4MA9A 4TRXA 5IO0A 2PN8A 1SKRB 1CQGA 1SKWB 4ECJA 4HS1A 2A2SA 3GTUB 3LSZA 4I8BA 2PPTA 4EXJA 1KEBA 3M9KA 5GZZB 2V41A 3TKRA 1VGLA 5G30A 1QMVA 3KD0A 4KW6A 5GSSA 2PMTA 1V98A 3KIJA 5H5RA 1B4PA 4EUYA 5A4UA 3CTGA 2DJ3A 2JZRA 4ULXA 4YAPA 2H1BA 4N0VA 1TRSA 1SYRA 2LSTA 2C0FA 3KGKA 3WGEA 3F6DA 1AXDA 4F0BA 1GWCA 2MBSA 5EY6A 4TR1A 4GQFA 1MDJA 4CHSA 4YQMA 3DMLA 4I5QA 2GSSA 2VLTA 1GSQA 2QSIA 4G19A 3O76A 3FYGA 1O85A 1GL8A 1DUGA 1EEMA 1GULA 2B6MA 4AJ6A 4MF7A 3F63A 2OE1A 4K9ZA 2JSZA 1EOGA 2H1DA 3LJRA 4Q5QA 2H71A 2LNSA 1DE1A 3ME8A 4K7OA 2F3MA 4NAXA 1FG4A 1USBA 2TRXA 1V2AA 4NV2A 1FVJA 2DBCA 5GAPD 2M46A 4EE0A 1Z7PA 2VM1A 1QFNA 1LU4A 3DWVA 1XWKA 4G10A 6GSXA 1JFUA 3EU4A 12GSA 1YDKA 2I4AA 4LL1B 3E9JB 4PQ1A 5F05A 2GVPA 4I2TA 1NHOA 3FEUA 4ZBDA 2NVLA 2GQLA 5JCUA 2RUEA 3ZMLA 3OR5A 1K0CA 2IMEA 1M2AA 5F8BA 1GTAA 5HR1A 3TJJA 2D2ZA 1OC9B 2B5XA 3UMAA 4OWYA 3TRPA 4GQCA 3FW2A 3GYKA 2YWOA 3ME7A 2E0QA 1ZCPA 4MF6A 4F82A 3TJKA 3W8SA 5ECIB 1RQMA 4WF4A 2WZ9A 3HYPA 1URMA 1PKWA 1HQOA 5CP1A 4N0ZA 1AIUA 5IOWA 2DJJA 2JU5A 1TKDB 2HRFA 1ZOFA 3EU3A 2CV4A 1YEPA 3KZQA 3VWWA 2MBTA 2FNOA 3C71A 3VPQA 1K0NA 2LTKA 4ZBAA 4DEJA 4WR4A 4EO3A 3TJBA 2G0FA 4MJCA 4ZXGA 3F4SA 2FLSA 2GSQA 4HU9A 4GSTA 3F4RA 2PWJA 2GGTA 5EL8A 1AQWA 2H0GA 3IE3A 4G2EA 5HFGA 2XPDA 1QXHA 3EINA 3UBLA 2CVBA 4MJAA 3ZITA 1WPIA 2WDUA 4OCFA 4HJMA 4XS1A 3TKSE 4XTSA 4IHUA 4GXZA 5L71A 2OE3A 5E59A 3GKMA 4I6XA 3IA1A 2PU9C 1T4YA 2L59A 2BJXA 4F2IA 3CRUA 3F4TA 1M2DA 4RUVA 2OACA 1YY7A 4BA7A 1BAYA 1R26A 1R7HA 1YF0A 5GSTA 4MMMA 1K3OA 2VL9A 4EL1A 4LA1A 4FH8A 2B1LA 1IYIA 1MTCA 2GDRA 1VF3A 5LD0A 3GX0A 5DQSA 2GZYA 3MAKA 5IMAA 3QFBC 3Q18A 2X64A 5G5FA 3C8EA 3QD9A 2FUG2 2H6YA 2AHEA 3GL5A 4QL7A 5ECKB 3HHVA 1WE0A 1OC3A 4RQXA 2VO4A 5GAND 2FHEA 4KSOA 2WS2A 1F6MC 1UA5A 3N9JA 2LQQA 2YJ7A 1F2EA 4IP6A 3HDCA 4FYCA 4Q5FA 4PXOA 4MABA 2K9FA 4NHWA 4MF5A 1SL2B 4MCUA 5DCHA 1GTIA 4H86A 3MNGA 4RI6A 2DJKA 4NWYA 4GRFA 4PGTA 1R5PA 1EV9A 2VCVA 3A2WA 2H01A 1XVWA 4IW9A 1FHEA 2LUSA 1WIKA 4HI7A 2CX3A 1KBNA 4EC0A 2PGTA 1JLWA 2ES7A 3EURA 2HT9A 4O92A 1PRXA 3GSSA 2MMAA 3VWUA 1TJDA 1GTUA 2C3NA 3C7MA 1PL1A 1WWJA 1TI1A 2CT6A 3EE2A 1G7OA 4GSSA 1U3IA 3EMPA 2H66A 2YWMA 3KJYA 5DAKA 3DVWA 1FB6A 2C4JA 2PVOC 5J5NA 3S9FA 3DKSA 1K3LA 5ID2B 2IJYA 3HA9A 1MDIA 2MYGA 3GHAA 3LYPA 2FWFA 3APQA 5J41A 2VCTA 4HZ2A 4MK3A 4K7NA 2VAFA 1I5GA 1K0MA 3KXOA 4L5LA 5JCGA 1XOAA 1DE2A 3H93A 5ENUA 3BJ5A 3Q6OA 2DIZA 3CTFA 4D73B 2PVQA 2WJUA 3M1GA 4V1Ag 1Y6EA 3GH6A 4AGSA 3IAM2 3A3TA 2HYXA 2HRNA 1T4ZA 3QMXA 2YANA 1EP7A 1MD3A 3I6AA 5KN0A 3GH9A 1HNCA 3QOUA 1N2AA 2VCWA 1TK8B 5H5QA 2JADA 2V32A 3WGXA 3ERWA 4TR4A 2EIOA 4ZB8A 2GSTA 1WJKA 3ZIVA 1OC8A 2GT5A 1A0RP 5D9XA 3A2XA 3VFIA 1W4VA 4GLTA 4WF5A 4WETA 4OFNA 1YQ1A 5A4WA 3FK8A 1XWCA 4IQ1A 4MZWA 2H76A 4BVYA 16GSA 2GT6A 3D21A 3LG6A 3APSA 3FR6A 4WEYA 4KA0A 1SU9A 3CSHA 2OA7A 4O5RA 2GZZA 4ZIJA 4K2DA 19GSA 2VD0A 1GUMA 2KP2A 2VD1A 5ECRB 4PNGA 5LCZA 1AAZA 2H72A 3HKRA 4KNDA 3D4MA 3M3MA 3TJFA 3VWVA 1CQHA 3H4KA 3L0HA 4GCIA 4XS4A 5G1KA 2OBIA 5ABRA 4N30A 22GSA 3PH9A 3KP9A 2YN1A 1GNWA 3FZ5A 2K18A 3KMOA 1XW5A 2GLRA 3F3RA 1QUWA 1H75A 3SBCA 14GSA 2L4QA 3DD3A 5IPGA 3GNJA 4NXIA 3HJPA 2B3SA 1SL0B 1FO5A 1XW9A 2B7JA 3LFLA 4ID0A 1A2JA 4BWQA 3GKNA 4N10A 1BYEA 3DYRA 2KLXA 4P3YB 2HFDA 5AIVA 2C3TA 2H30A 3FRCA 4ZB9A 2CA8A 2F51A 3V1WA 2P0GA 3RPNA 4LMWA 2HXKA 4JU5A 2IFQB 1TI3A 2KOKA 5IPHA 5ECNB 5H5SA 4YH2A 1ZYQB 4V2MA 4MPFA 1GH2A 2I81A 2L6DA 1O8WA 2I3YA 2JACA 3EMXA 5AIXA 1X5EA 4NPBA 3HCZA 2P5RA 4ISDA 4ECIA 1NSWA 3HJMA 5F0GA 4DSQA 1YKCA 2MMNA 3UIWA 1TP9A 2B5EA 2E2GA 4KX4A 3VPTA 4GSNA 3IBHA 1B4QA 4N11A 5IQYA 1M9AA 4WBJA 1HYUA 1X9SB 1SL1B 3U5RE 3ISOA 1ERWA 2AAWA 4OO5A 5HQPA 2JZTA 4BL7A 2B7KA 5G31A 1F3BA 1PA3A 3DRNA 1I9DA 20GSA 2LJAA 2IWTA 2N5FA 2KHPA 3UJ1A 3BCIA 2GTUA 3UVTA 1B8XA 4NMUA 4TXOB 2XPEA 2LJRA 1X0RA 2A4VA 4KCEA 4CW9A 2VM2A 3QAWA 1X5CA 3FKFA 1E6BA 1SJ6A 2R5GA 1XVQA 2VCXA 6GSYA 1O81A 1Z6MA 1JZOA 3KM6A 1PQNA 1MDKA 2N5BA 4LLRA 4FIWA 2YCDA 1THOA 3QR6A 1AC1A 3GTUA 1C72A 2NDOA 3GIXA 2H6ZA 2E2MA 2LRCA 2PBJA 2LNTA 3WGDA 4WKWA 1GP1A 3DXBA 4K1FA 2L6CA 3ZMKA 1G0TA 2H0HA 2V6KA 1TTZA 4WBRD 3VI7A 1B9XC 2M72A 4Z7XA 4CDOA 4MJBA 3FR3A 4MZBA 4MH3A 1XIYA 1WMJA 1TXXA 1TW9A 2REMA 1KTEA 3G7IA 4KDXA 2XBIA 2TIRA 5B8BA 2X99A 1ILOA 2RLIA 3TKQA 3TCOA 2C0DA 13GSA 4JEDA 3UBKA 5G2ZA 3IK7A 1GSDA 2I1UA 4X43A 2VOCA 5J3RA 3RBTA 1A2MA 1EOHA 4GWRA 3IAS2 2H73A 3SWLA 2IMIA 4POBA 2DJ1A 1AUCA 5AGYA 4IP1A 5DDLA 5CNWA 5IMVA 8GSSA 4PQIA 1H4OA 2GSRA 2C3QA 2DIYA 2LJKA 3HVXA 3IC4A 5HR3A 3P90A 4XCSA 3E3EA 1EEJA 1TRUA 3NOFA 3A2VA 4TKYA 4KAEA 2P31A 2J23A 2CZ2A 1U6TA 3PR8A 5DALB 5FWGA 4WXTA 2CVKA 3D4TA 1OAZA 1XW6A 3BD2A 1J9BA 2HLSA 9GSSA 2YWIA 3Q74A 4EDYA 3KTBA 3HY2A 3C1RA 3KMNA 3F0IA 5JCWA 3GX8A 2IMFA 5B6NA 2BTOT 4HQSA 2RUFA 1HNAA 1MD4A 1PGTA 3VURA 5DAKB 1PN9A 2G2QA 4DSSA 3P7XA 3KH7A 3L9VA 4XHMA 5JWRB 4G9HA 1SJZA 3ZRDA 5DCGA 4KGIA 1TOFA 1AQVA 4ML6A 1DSBA 5IMDA 3ZFLA 2HNLA 4KH7A 5KN3A 4I97A 1S3CA 5HR2A 4DSRA 2O87A 3TKPA 4F03A 1IYHA 5IOXA 1V57A 5CRWA 1VF1A 3TOUA 4L0UA 3FZ9A 3ED3A 2VLUA 2VL2A 4K6XA 3A5WA 2OKAA 3ZTLA 1M2BA 3I9V2 3CMIA 2HSHA 2N5AA 5EPFA 1SYXA 4O32A 3P8WA 1VRSD 2R3XA 5J4UA 4PX1A 3UL3A 2CVDA 2FGXA 5KN2A 3J7Yb 2C80A 1GSSA 1FW1A 2VCZA 2HI7A 2EC4A 2NBSA 2DSAA 4MDCA 3LQ7A 2MMOA 5CREA 5ECLB 1M7TA 4LL4B 4FYUA 1PMTA 4XRDA 2O85A 2ZUPA 3I43A 2AB6A 3LXZA 1T8EB 1XBSA 3ZL5A 1F37A 2B1KA 1OYJA 6GSTA 1T7PB 2HZEB 1RK4A 1VF2A 3KP8A 1UC7A 3QFAC 1Z9HA 2DJ0A 3GSTA 2H0IA 2JZSA 3RHCA 3TKSA 3BCKA 3H1NA 3HJOA 4TN8A 3G9BA 3EVIA 2OJLA 2LQOA 2YP6A 4PURA 3TDGA 1JZDA 3NIVA 3GL3A 3ZREA 4ECBA 1AQXA 1ZMAA 5ELGA 2QC7A 2C0GA 4E8EA 4OO4A 5C00A 2X8GA 3KTLA 4ZL7A 2RM5A 1ERVA 1OE7A 1JZRA 3GRXA 4ZL9A 5F07A 2WGRA 5DBQA 4EKZA 5D9VA 3HD5A 3FY7A 3QPMA 3FZ4A 2HE3A 1R5AA 5D8IA 1HD2A 1X9MB 3D5JA 4YAVA 4TW5A 2YOIA 3GV1A 3RHBA 4ACSA 1M99A 1GTBA 2YZHA 2V1MA 3W6GA 3ERGA 3CSJA 4TR3A 2FA4A 3WYWA 1BG5A 2MMZA 5HFIA 3UEMA 3QCPA 4OFTA 5DJMA 2WULA 1QK8A 1FAAA 3D0ZA 4XS6A 2FY6A 3Q19A 3N5OA 4TR1B 1Y25A 2GZPA 4J56E 3MWHA 5IMFA 4TXVA 2LEGA 1BQ7A 5C04A 1BJXA 3UARA 3F6FA 4X1UA 3GUSA 1SD8A 1TU7A 1Z3EA 4MH2A 4IGJA 1ZZYA 4F0CA 2FA8A 4OMVA 1WP0A 2C1YA 1QQ2A 2L57A 4NHZA 4Q5RA 4XIHA 1YJ6A 4TVEA 4DVCA 4POKA 5COHA 4K7IA 4HJ2A 2VL3A 1T1VA 2X8CA 2O89A 1F9MA 2KUCA 4ML1A 3KCMA 3F9UA 5IIZA 1GUHA 3ZFBA 1GSFA 3W8JA 1PD21 3KH9A 4I2UA 3ZYWA 1PKZA 1SK1A 3DEXA 1SK2A 3CXGA 1K0OA 4AJ7A 4IN0A 4D73A 1K3YA 5ECSA 1E2YA 2HZFA 3LYKA 2X8HA 1ERTA 6GSUA 3LGCA 4L5OA 2E7PA 4MP4A 1EGRA 2YV7A 3WT1A 2GQKA 3UOMA 6GSWA 2OADA 2R37A 2ZCTA 4LMVA 4KCAA 17GSA 4Q5NA 5CYYA 1YF1A 2CQ9A 3CSIA 2YPMA 2YNXA 1PSQA 3IXRA 2B5YA 4IS0A 5DQYA 4PUAA 2FD3A 1F3AA 4K0NA 4YQUA 2QGVA 2VL2C 11GSA 3GKKA 3LORA 3VI5A 1SD9A 1NM3A 1GRXA 1NW2A 4MLYA 1SENA 3GA4A 4KB3A 5JWOB 3DIEA 1WOUA 5B7CA 3P2AA 4KDUA 3G7YA 1OKDA 5EVOA 3MDKA 1QGVA 2C8UA 1O73A 4L8EA 4EVMA 2WFCA 5CRDA 2JSYA 2LKUA 1WRYA 3ZVJA 6GSVA 1EP8A 1O6JA 4ECCA 5A5KA 1N8JA 2C0EA 6GSSA 3TJGA 2IMDA 2A2RA 1XPVA 4FYBA 2P5QA 4IKHA 3TOTA 3LEFA 1PX6A 1RW1A 1J08A 2XHFA 4O7HA 1YKAA 3EC3A 1M0UA 1B9YC 3PINA 2H70A 4KSMA 4AF2A 1T00A 2H8LA 2AV4A 1Z7RA 2FWGA 3HXSA 2YV9A 1VF4A 1V40A 4WR5A 3ERFA 1V58A 3TKSC 5CAXA 3BBYA 5IMCA 2IFQA 5KEJA 3R2QA 3RAZA 1A8YA 1M9BA 3L4NA 2Z9SA 2AJQB 1V9WA 2GS3A 1G7EA 1UN2A 5ECMB 2FCHA 4K0GA 3FHKA 3D22A 4QL9A 2K6VA 1BEDA 3ZZXA 1U88A 3I69A 3K8NA 4IJ3A 4EDZA 3US3A 1ST9A 1GSEA 4E8HA 4TOPA 3TB2A 2JL4A 4BVXA 4DSSB 5D9WA 2IPAA 4V2NA 3RPPA 1ZGNA 2H75A 1U87A 4JR4A 5JWQB 2HSYA 4K8MA 4PUFC 3FZAA 1UVZA 1TRVA 5IMZA 3IV4A 5AISA 3NZNA 4KE3A 3H8QA 1ERUA 3QAVA 4GF0A 5ECPB 3HVVA 3L9SA 1ON4A 4IELA 1GUKA 1W89A 3KEBA 1JZWA 4IVFA 3AY8A 3GURA 1TK5B 3O6TA 1SK0A 4GTUA 3BOAA 4TXOA 3GMFA 3C1SA 2XBQA 5ELAA 1OVNA 2VCQA 3EYTA 2PERA 4HQZA 1ZYEA 1G6WA 2L5OA 3QAGA 1EV4A 3JCML 5HFKA 1X9WB 2LV3A 2R2JA 3L9UA 1SKSB 5J9CA 2OE0A 5A4VA 2V2GA 1A8LA 1X5DA 2ZNMA 1BX9A 3VWXA 2NPBA 1Z5YE 4ZB6A 2DC5A 2XC2A 5AN1A 1EWXA 2H1GA 1NHYA 3IPZA 2ON5A 4IJIA 2IN3A 1XWBA 4J57E 2M80A 2DLXA 3F8UA 1HNBA 5D73A 1KNGA 2K8SA 2VUPA 4JZQA 1MEKA 1Z6NA 3L78A 2VIMA 1AW9A 5D96A 3VLNA 4JE1A 1OC9A 3TRXA 4QQ7A 3E0UA 2EIQA 4IBPA 2H19A 5FT3A 1TRWA 4BWSA 4FO5A 2H74A 2F8AA 3ZLPA 2L5LA 4L0WA 5D93A 7GSSA 3LXTA 1TDIA 4MPGA 2IIYA 1LBKA 4PQHA 5J9BA 2KP1A 5IM9A 3ZVJD 1XZOA 5G1LA 1OE8A 4NV5A 1TU8A 4JR6A 10GSA 4EF0A 4V2LA 2O8VB 4J2FA 5LNKe 2LRNA 2RIIA 4XRAA 4POMA 5DVBA 3IK9A 1J0FA 4OCEA 1GSUA 4YQVA 1XXUA 2YZUA 1EGOA 1ACVA 1K0AA 4KDYA 5CRGA 3TRQA 3MSZA 3IRAA 3FR9A 3CYNA 1G6YA 4OFMA 4HU7A 2LS5A 4ILFA 2O7KA 5DJLA 2LRTA 5B8AA 1FB0A 5ECHB 5DALA 5INYA 1A2LA 2YJHA 2VLVA 4OD7A 2IMKA 5B6MA 2V6OA 4JBBA 2GQMA 3C73A 2WRTA 3UVHA 1U3AA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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