4I2UA

Crystal structure of the reduced glutaredoxin from chlorella sorokiniana t-89 in complex with glutathione
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
SAAKQLVDSTISGNKVVIFSKTYCPYCVKGKRALEKFLPKSKITAIELDGRNDGAAIQDYLLELTGGRSVPRVFIDGQFIGGGDDTDALARNGKLEVMLRNAGVLLEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Chlorella sorokiniana
publication title Crystal structure and functional analysis of glutaredoxin from Chlorella sorokiniana T-89
rcsb
molecule keywords glutaredoxin
total genus 34
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4i2uA00
2GLRA 1YQ1A 3HCZA 1GUKA 4ZB6A 5IPHA 1DSBA 3LQ7A 2R4VA 2XHFA 4NXIA 3A2WA 3HZ4A 5G5FA 6GSXA 2ON7A 2VL9A 3UVHA 2VM2A 5KN2A 3G9BA 2C3NA 2O85A 1GNWA 4BA7A 3TB2A 1X9SB 2IFQB 6GSUA 3MNGA 2X8CA 5GZZB 2P31A 5HR0A 2CX4A 2GSTA 2L5OA 4DSRA 2H72A 5IIZA 2C1YA 1S3DA 4ISDA 3FW2A 4OFTA 1TKDB 2VCQA 1LU4A 1OE8A 4KAEA 3CTGA 3FKFA 4P3YB 5DCGA 2OE1A 3W6GA 1Z6NA 2IN3A 1F3BA 4J57E 1GSFA 2H6XA 3QOUA 4O92A 2AUVA 3KM6A 4YAVA 2NPBA 3ZZXA 5J3RA 1B48A 1M0UA 1TW9A 1B9XC 4AJ8A 3D4MA 3AY8A 2DJ3A 1AC1A 3NIVA 4BL7A 1JLWA 3FYGA 2RM5A 2CVBA 2D2ZA 4OCEA 2LRCA 1OC9B 3FEUA 3LYKA 2YANA 2B1KA 3FRCA 3ZVJA 1T4ZA 3CRUA 4MZBA 1N2AA 3FZ9A 2CAIA 1U88A 2DJJA 4XS4B 4Q5FA 3TCOA 2VL2C 1PN9A 3EMXA 5E4WA 1NSWA 2LTKA 2K8SA 4K1FA 1JLVA 1Z7PA 3KJYA 4TR0A 4CW9A 2K6VA 1NHYA 4IS0A 4ILFA 4IHUA 3APQA 4WF5A 2HLSA 2WFCA 4EF0A 3EURA 1TDIA 5DJMA 3IC4A 5ELGA 1T8EB 3UEMA 3GTUB 1EWXA 4OD7A 1SJZA 4O32A 3MSZA 4OO4A 3D22A 4V2NA 2YWMA 2L4QA 5ECNB 1YKAA 2HXKA 3FZ4A 3FZ5A 1YEPA 1XZOA 4TR1A 1QK8A 1TRVA 1GP1A 2H0HA 1C72A 4KSOA 3F4TA 5AIXA 1NHOA 2FHEA 5G31A 5DALA 2LJAA 3C7MA 4K7IA 1S3AA 2CT6A 4MPFA 1O73A 3HZ8A 4GRFA 5HR2A 4TKYA 5J9CA 2F9SA 2H70A 3DGQA 3CRTA 4L8EA 2VLTA 1PKZA 4ULXA 4HZ2A 1GWCA 2P5RA 4GXZA 5A4WA 2JSZA 4KH7A 4KA0A 1R5AA 1IYHA 4ZILA 5IO2A 2PGTA 3HJOA 1T3BA 1G6YA 3QAVA 2H1GA 5ECRB 3PH9A 1MD4A 1RW1A 1GSUA 4EVMA 6GSTA 1B4QA 3ZVJD 1V40A 3K8NA 1EV4A 4I97A 4LL1B 4N30A 5IOWA 4IQ1A 2V41A 4DSSB 2NTOA 4LMVA 1E2YA 1M2AA 3I69A 1SYXA 1XBSA 1TK0B 2GQKA 1J9BA 1U87A 1AIUA 1TP9A 4I8BA 3FHKA 1V2AA 5DQYA 3VK9A 3UMAA 2VD1A 1PX7A 1PGTA 3KEBA 4QL7A 3WT1A 4G10A 2GVPA 3GIXA 8GSSA 3CSIA 1LJRA 3FR9A 2LNSA 5CREA 5D9TA 1OKTA 3M9JA 1TI1A 1THOA 4JRRA 4EC0A 1A8LA 1KEBA 1GSDA 1WOUA 3KCMA 3F63A 2LKUA 1K3YA 2B5XA 4K2DA 3W8JA 1K3LA 5F06A 5KN0A 2GSRA 4XRAA 1XVWA 5CYYA 1VF4A 2I4AA 4BPYA 1VF3A 3GL3A 4HU7A 1ON4A 3IR4A 2HZEA 5B8AA 1NW2A 1B9YC 3Q18A 3UOMA 4KX4A 4MA9A 3KGKA 3LYPA 1XWKA 4HJ2A 4POLA 3GTUA 1SJIA 3RDWA 4LL4B 3IE3A 1B4PA 3DWVA 5EY6A 1OE7A 5LD0A 4EUYA 1EV9A 3VFIA 3I43A 2HFDA 3PINA 4K0GA 4MF7A 4MJCA 3KD0A 3LEFA 3HHVA 1EEMA 1WWJA 2IMFA 1WRYA 2K9FA 2HSHA 4ID0A 5ELAA 2HNLA 1SK0A 3I9V2 5FWGA 3MWHA 5A5KA 1GULA 2H30A 1QUWA 1O8WA 2FGXA 3H79A 3ZFBA 2L57A 5A4VA 5GAPD 2KUCA 2PU9C 1V98A 1KBNA 5J9BA 2OBKA 3KP8A 3LXTA 1GSYA 3ZFLA 3VWVA 1XW6A 4IQAA 2P5QA 2FWEA 4V2MA 3M0FA 4BWSA 2FWGA 5KN3A 1AQWA 18GSA 4F9ZA 2H75A 1F3AA 2N5FA 4QL9A 2WJUA 1HYUA 3CXGA 4AGSA 2QKEA 3C71A 3CTFA 3ME7A 5IO0A 20GSA 3F9UA 5FHIA 2R2JA 3IRAA 5CAXA 1XVQA 5DCHA 3BBYA 4NWYA 1GLPA 3GX0A 3KMOA 4MF5A 1WJKA 4LLRA 4ML6A 2J9HA 4MZCA 4JR6A 2GT5A 1ILOA 2NDOA 1SD8A 1XCCA 2QSIA 5IMFA 5EPFA 2C4JA 3G7JA 1R4WA 4HS1A 5B6NA 3GSSA 3TUEA 2V6OA 3P90A 2H74A 4RI6A 2JU5A 3E0UA 1SJ6A 1SKWB 4Q5RA 4IBPA 2TRXA 2PPTA 1XXUA 3FR6A 3GV1A 5DAKA 3TOTA 5ID2A 1IYIA 4TVEA 1SENA 6GSSA 2YWOA 11GSA 3ZMLA 17GSA 5EVOA 5IPGA 1X9MB 4ZIJA 1I5GA 3TDGA 2PBJA 3DXBA 3PR8A 3GKKA 5HFKA 3GHAA 2A2RA 1M99A 4JE1A 4ZL9A 2R37A 4HDEA 4V1Ag 3TJGA 1RK4A 1SL2B 2FNOA 2C0DA 3BOAA 3E3EA 3IPZA 4AJ7A 2CAQA 1GUMA 12GSA 5ECSA 1A2LA 4ZXGA 1K0MA 3EINA 4K8MA 4D73A 1ACVA 3D4TA 2DJ0A 2FCHA 3ERGA 4CHSA 4OCFA 1SKRB 5IMCA 6GSVA 2CV4A 4IP1A 5G1LA 1PKWA 3EU3A 1T00A 3H93A 1TK8B 1K0DA 4WBJA 1VF2A 2DJ2A 3UBLA 3GH6A 4ECIA 4FO5A 4CDOA 5DVBA 2DMLA 3VI5A 4XS6A 2AYTA 4IJIA 4I5QA 2Z9SA 4MZWA 2VL2A 1R7HA 4O7HA 2L6CA 1M9AA 2E7PA 4PX1A 5JWQB 1EEJA 1BX9A 5AIVA 1HD2A 1BYEA 4OFMA 4N11A 2VCTA 1CQHA 1O81A 2AAWA 5JWOB 2YNXA 2HZFA 1Y6EA 2QC7A 3H8QA 2B5EA 2AV4A 3GNJA 3O3TA 1ZYQB 2CZ3A 2RLIA 2EC4A 4ZL8A 1U3AA 4KDYA 3L9SA 5G5EA 1EP7A 2LV3A 3SBCA 3LG6A 2PVOC 4KNDA 3CBUA 4POKA 3M3MA 2F8AA 1PA3A 1A2MA 5HR1A 2V6KA 1GSQA 2H0IA 3MDKA 2DBCA 4DEJA 3KIJA 2GQMA 4IVFA 4PURA 3L0HA 4ZB8A 5ECOB 2LNTA 3WGEA 3UAPA 2CX3A 2OACA 4RUVA 2VD0A 1XWGA 1ZYEA 5JCUA 2GQLA 4KE3A 1PX6A 1MDJA 4TXOB 3RHCA 1FHEA 2YWNA 3LSZA 1JFUA 3VI7A 2I9HA 2CA8A 2LUSA 4MJBA 3G7IA 1QXHA 3ZLPA 4MH2A 3OR5A 1XWAA 1OKDA 3TJBA 3QAGA 3J7Yb 1OAZA 5JWRB 3IBHA 4JBBA 4GWRA 5G2ZA 2LS5A 1AW9A 3VWXA 5C00A 1F37A 3Q6OA 4IELA 1YZXA 6GSWA 4V1Ap 4NV2A 2LRTA 5IOXA 1UC7A 5G1KA 4FYCA 1NM3A 1TRWA 4PQ1A 2YZHA 1BJXA 2RUEA 1GL8A 1QFNA 2IMEA 3HVXA 2MMNA 4TR4A 2H01A 4MABA 3TRPA 2YJ7A 2O89A 2IFQA 2TRCP 1O85A 3GH9A 1FW1A 4V2LA 3TKRA 4MJEA 1X0RA 3L9VA 5ECHB 1FB0A 2DSAA 4GQFA 2NVLA 2KHPA 2OADA 2I1UA 5CO3A 3BCIA 4K9ZA 4NV5A 3ME8A 3QFBC 1XWBA 4TW5A 2YJHA 3KP9A 4BWQA 3D0ZA 1AQVA 1SL1B 2GSQA 1G7EA 4Q5QA 1A0FA 1Z5YE 4HJMA 4DVCA 4FH8A 2F51A 5E59A 5JCWA 4AJ6A 1S3CA 2WZ9A 4GCIA 3H4KA 1ZZYA 4WETA 4TRXA 3M1GA 2V32A 3TKQA 2H71A 2R6KA 2QGVA 1HNBA 1PL1A 4LA1A 4O5RA 3DVXA 3M8NA 1YJ6A 3BCKA 1A8YA 3MAKA 1UA5A 1EOHA 3ZRDA 2A2SA 3D21A 1OC9A 3EMPA 2O8VB 1SKSB 2BJXA 1Z9HA 1XWCA 1TI3A 3ISOA 5B6MA 3KMNA 3F4RA 2OKAA 2EIRA 3RBTA 4XS4A 1M2DA 1SK2A 2KP2A 3EE2A 3LJRA 1ZOFA 3GKNA 2GS3A 1H4OA 1HQOA 3HYPA 1OVNA 2DIZA 2OBIA 3VPQA 4WEYA 1DE1A 1JZRA 2IPAA 1XOAA 1YF0A 2G0FA 5CRGA 5CNWA 2VOCA 3TKSA 2L4CA 4XCSA 4EDYA 5DBQA 5ECQB 3QMXA 3GFKA 2DLXA 2IMKA 5DQSA 1KNGA 4PUFC 4L0UA 1JZWA 2ZUPA 2OE3A 5COHA 1ML6A 3IV4A 4WKWA 3ZYWA 1VGLA 3G7YA 3LGCA 5J41A 1J08A 4FYBA 4N0ZA 1ABAA 2E2GA 1MD3A 2HI7A 5D73A 4J2FA 1PSQA 2IIYA 3P7XA 4K6XA 1F2EA 2RM6A 2O7KA 1G0TA 3ZL5A 3D5JA 2HT9A 2C80A 3RPPA 3GUSA 4ZL7A 3HA9A 1I9DA 1G6WA 2ALBA 4KCAA 19GSA 5CRWA 2B7JA 2VCWA 2FWFA 1M2BA 4PQHA 1K0CA 4EO3A 2LSTA 1EGRA 2L5LA 3QR6A 1AAZA 1X5EA 4OMVA 3Q19A 3GKXA 2PERA 4WBRD 3UVTA 4GSSA 4POMA 1VF1A 3FK8A 5EL8A 5ECLB 4DSSA 3TKSC 1E6BA 2H66A 2E2MA 3GYKA 2YV9A 1TRSA 2B7KA 2GSSA 7GSSA 2XC2A 2WULA 3UARA 3IOSA 3N5OA 4F0CA 4X0XA 2GT6A 2JSYA 3HD5A 1JZDA 1GRXA 2LJKA 5IM9A 2VO4A 2C8UA 2KOKA 1USBA 2GZYA 4JU5A 3C1RA 3LWAA 1THXA 2R3XA 3HVVA 4Q5NA 4WXTA 3DEXA 2RUFA 3C73A 1O8XA 4MPGA 4L0WA 3DVWA 1PQNA 5ECKB 3QAWA 1WPIA 4ZBDA 3VLNA 1XIYA 2YPMA 3TRXA 1B8XA 1SU9A 3SWLA 4ECBA 1GNEA 3HY2A 3FY7A 3C1SA 3BJ5A 4IN0A 2K8VA 3WT2A 22GSA 4LMWA 4I2UA 2LRNA 1FO5A 2JL4A 3S9FA 4HQSA 5B7CA 3L78A 5D8IA 1XOBA 2AHEA 2GDRA 3RPNA 1V9WA 2YN1A 2H19A 3E9JB 3ZMKA 4GTUA 1GTIA 4JZQA 2YP6A 1URMA 1YF1A 4NHWA 2FD3A 3F6DA 1XW9A 2KP1A 4X1UA 1H75A 5F8BA 4EL1A 2NBSA 2V1MA 2OJLA 1VRSD 3DIEA 1FB6A 1WMJA 1Q4JA 1Q98A 2L6DA 4NPBA 5ECIB 2MMZA 2L59A 2FUG2 1EOGA 3Q74A 4G19A 2H8LA 4ZB9A 4MDCA 4MP4A 1WIKA 3IA1A 2WRTA 4XIHA 2IL3A 4RI7A 4K7OA 2GZPA 3QD9A 2XPEA 4PNFA 1TU7A 1GSEA 3TGZA 1TU8A 1GUHA 3ZIVA 3QPMA 5F05A 4FIWA 4ECCA 5GSTA 4Z7XA 3QCPA 2IJYA 5IMAA 4PQIA 4TR1B 2C0FA 3TJJA 4X43A 3I6AA 2ZNMA 3ZIJA 5DALB 3M9KA 1TRUA 1WE0A 5D93A 1W4VA 1MDKA 1GTAA 5HFIA 3LFLA 2C0EA 4MH3A 4ZBBA 2DC5A 1M7TA 3ED3A 3EU4A 2H6YA 1SD9A 3APSA 3KXOA 2B3SA 4MJAA 1YDKA 1ERVA 1FVJA 1U6TA 1Y25A 2M46A 2YWIA 2O87A 2B5YA 3RHBA 4F03A 5LCZA 4YQMA 4MF6A 4IP6A 4L5LA 2PUKC 4GSTA 2CZ2A 5G30A 2MMOA 1AUCA 1X9WB 2PMTA 1X5DA 1GSSA 2JZSA 4F82A 1QQ2A 2JZRA 3ZREA 1EGOA 3C8EA 2VCVA 3GRXA 5FT3A 2C3TA 5F0GA 3TKPA 4TOPA 2YOIA 3DKSA 3UBKA 2R5GA 1YY7A 3BD2A 5AISA 3GL5A 1LBKA 1T4YA 4TXVA 2CVKA 1ZGNA 3VPTA 1GTBA 3VWWA 5LNKe 3IXRA 3W8SA 2KLXA 2PWJA 5DJLA 3APOA 3ZTLA 1DUGA 2HZEB 5HR3A 5IMDA 3A3TA 2N5BA 1YEXA 1F9MA 4NHZA 3TKSE 2G2QA 1PD21 1MDIA 5ENUA 3CSHA 4J56E 4L5OA 2V2GA 3ERWA 5JCGA 1K0OA 3HJMA 2YZUA 4G2EA 4HI7A 5IMVA 4BVYA 3IAS2 4AF2A 1ZMAA 3HKRA 4OWYA 4HQZA 2XPDA 1PRXA 3IHQA 5CRHA 2EIQA 4YH2A 3F3QA 3LORA 1O7UA 2DJ1A 3WGXA 4TN8A 1ST9A 4NAXA 1V57A 2YCDA 2WDUA 3US3A 1Z7RA 2VAFA 2MYGA 1A24A 3EVIA 3TRQA 4GSNA 4BVXA 4WR5A 2XBIA 2M80A 3HDCA 2LJRA 3QFAC 5KN1A 2X8GA 1AQXA 4HEA2 2H73A 2VCXA 4OFNA 3EWLA 3U6VA 2CQ9A 3HJPA 5D9WA 3WYWA 1MTCA 2JZTA 2I81A 2P0GA 4WF4A 5GSSA 16GSA 3ZITA 3UJ1A 4GQCA 4MMMA 2H1BA 1JHBA 2XBQA 14GSA 1EZKA 4XS1A 5KEJA 5J4UA 1FAAA 3CMIA 2MBSA 1OC3A 3GURA 2DMMA 2LQQA 4PUAA 3F3RA 1UN2A 3FR3A 2X8HA 3PGTA 2HYXA 1K0NA 1CQGA 3O76A 3VURA 1BAYA 1KTEA 3EC3A 2AJQB 3IDVA 4HOJA 1K0BA 2VCZA 9GSSA 4PGTA 3L9UA 13GSA 2F8FA 1XW5A 3N9JA 1TJDA 4GLTA 4MLYA 4TXOA 1SK1A 2YV7A 2DJKA 3KH7A 2LEGA 4K0NA 2F3MA 5HQPA 2ZCTA 4MCUA 2RIIA 2OA7A 2TIRA 1SL0B 4G9HA 3KTLA 3HVSA 3IK7A 3GSTA 4KCEA 5DAKB 1AXDA 2C0GA 4EXJA 5ID2B 3VWUA 4E8HA 4KSMA 4KW6A 2GZZA 2BTOT 2H0GA 1X5CA 1TTZA 2AB6A 1DBYA 5INYA 2WS2A 1XFLA 2HRFA 2K18A 1GTUA 2A4VA 1BEDA 2X64A 4WR4A 5J5NA 5GAND 4KDUA 4ZBAA 3A2XA 4KGIA 2ES7A 4RQRA 1JZOA 4YQVA 1M9BA 3D6IA 1K0AA 3P8WA 5IMZA 4IGJA 10GSA 3A5WA 2REMA 4QQ7A 2MMAA 3DMLA 2IMIA 2CVDA 2J23A 2DIYA 2ON5A 3GMFA 1DE2A 1R5PA 1V58A 2VL3A 3NOFA 4EE0A 1PL2A 3DYRA 3L4NA 1A23A 3F6FA 1TK5B 3NZNA 4ACSA 5D9VA 2E0QA 1GLQA 1QGVA 2FWHA 1RQMA 1TXXA 2B6MA 1ZCPA 3UL3A 1R26A 4D73B 1T1VA 4TR3A 4F0BA 2X99A 3R2QA 2EIOA 3P2AA 3IAM2 2JACA 1G7OA 1FVKA 1U3IA 5CRDA 3WGDA 1FG4A 1HNAA 5D9XA 5DDLA 5ABRA 5L71A 1EP8A 1QMVA 2GTUA 3GA4A 5A4UA 1OYJA 4OO5A 4XTSA 3ERFA 2IWTA 1HNCA 2H76A 1MEKA 5H5RA 5D96A 3A2VA 1T7PB 1BG5A 2VLVA 5F07A 2GGTA 2LQOA 3EYTA 2FY6A 2FA4A 2VIMA 2I3YA 3IK9A 4IJ3A 5CP1A 5HFGA 4JR4A 3KH9A 4EDZA 4POBA 1A0RP 3LXZA 4RQXA 4H86A 3FZAA 3F0IA 4ML1A 3QDNA 1ZL9A 4MK3A 2HSYA 4PXOA 1YKCA 1WP0A 4EKZA 3JCML 2WCIA 5AN1A 2HE3A 5AGYA 1N8JA 3DD3A 2VM1A 5IQYA 4YAPA 5B8BA 2OE0A 4XRDA 2WGRA 1Z3EA 4FYUA 1W89A 1SYRA 2H6ZA 2M72A 3CYNA 3DRNA 3RAZA 3TOUA 2N5AA 2IMDA 4N10A 1ERUA 2MZCA 1ERWA 3H1NA 2VLUA 1ERTA 4E8EA 3J7Yk 2JADA 4NMUA 5C04A 4XHMA 4IW9A 1OC8A 1XPVA 4JEDA 4HUAA 3TJKA 3U5RE 1PMTA 4F2IA 3F8UA 5ECPB 2H1DA 2WB9A 4N0VA 5ECMB 4IKHA 5H5SA 3WD6A 4DSQA 2B1LA 3CSJA 2PVQA 1FOVA 1A2JA 3F4SA 5H5QA 4KB3A 1Z6MA 3V1WA 3GKMA 3O6TA 2FLSA 2VUPA 2FA8A 3KZQA 4GF0A 4K7NA 1TOFA 6GSYA 2MBTA 4PNGA 1UVZA 4I2TA 3UIWA 4HZ4A 3GX8A 4YQUA 4I6XA 1GH2A 4KUNA 1O6JA 1K3OA 1BQ7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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