4I2UA

Crystal structure of the reduced glutaredoxin from chlorella sorokiniana t-89 in complex with glutathione
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
b'SAAKQLVDSTISGNKVVIFSKTYCPYCVKGKRALEKFLPKSKITAIELDGRNDGAAIQDYLLELTGGRSVPRVFIDGQFIGGGDDTDALARNGKLEVMLRNAGVLLEHH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure and functional analysis of glutaredoxin from Chlorella sorokiniana T-89
rcsb
molecule keywords glutaredoxin
source organism Chlorella sorokiniana
molecule tags Oxidoreductase
total genus 34
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4i2uA00
5CAXA 2WULA 4TN8A 2HSHA 2KOKA 4IBPA 3KM6A 3DKSA 4XS6A 5F05A 4G9HA 2NDOA 3D21A 4XTSA 1GNWA 3LYPA 4MP4A 4POKA 2IMFA 5D9XA 2O87A 1EV4A 1A8YA 4TXVA 3VI7A 4BPYA 3K8NA 3F8UA 4IVFA 3VWWA 2LRCA 3ERFA 1SJ6A 2YWIA 2HZEB 1XPVA 2ES7A 3UVHA 1YZXA 5J4UA 3GURA 3VWXA 3TKQA 1GP1A 3UBLA 1JZDA 4HUAA 4KUNA 4MK3A 5KN1A 1TDIA 1VF4A 2XHFA 5INYA 5CRWA 4ACSA 1B48A 2GLRA 2M72A 4ECIA 2L57A 1Z7RA 4JU5A 2V6OA 1U87A 3UBKA 3WD6A 3EMPA 2LJAA 2OBIA 3D4TA 4PQIA 4MABA 3TJJA 5DJLA 6GSTA 4JBBA 1GSEA 2CT6A 2L6DA 1PKWA 3BOAA 2LRNA 3CRUA 1G6WA 1XXUA 1YDKA 5D9TA 5DAKA 1DE1A 3L4NA 5CP1A 3ZITA 5ECNB 5G1KA 1WP0A 3APOA 14GSA 2L4CA 3MWHA 2CZ2A 4D73B 3QOUA 4DSRA 3DYRA 1T4YA 5COHA 2VCWA 2I1UA 2IJYA 2VAFA 1Z6MA 4G10A 4KAEA 3ZZXA 2H6YA 1M2AA 3A5WA 2HT9A 1V40A 4GXZA 2ZCTA 5DQYA 3FYGA 3CMIA 2N5FA 3EU4A 2JACA 4KB3A 1ERTA 3IHQA 4EE0A 3L78A 2VIMA 5H5RA 3EVIA 1X9MB 1GSYA 3FHKA 2PMTA 3M9KA 5AIVA 1K0DA 2B7JA 3C1RA 1Z3EA 2IMDA 1T00A 1WWJA 1BAYA 1S3CA 1THOA 1TJDA 12GSA 1JZOA 3E0UA 4GRFA 16GSA 4K9ZA 1T8EB 4ISDA 1SKRB 1GL8A 4TOPA 1WE0A 4IW9A 2DJ3A 3APQA 2F8FA 4WETA 2ON7A 4AJ6A 1Z5YE 4WR4A 2R6KA 1TP9A 4ZBDA 1UA5A 1HNAA 4KSMA 1EWXA 1EEMA 2JZRA 1GSFA 1TK8B 2MZCA 3FZ9A 4ID0A 3BCKA 4WF5A 4KDYA 3FR6A 5EVOA 3LG6A 5EL8A 4MA9A 3M1GA 5HFGA 1EGOA 1WMJA 2O89A 4EF0A 3GHAA 4TRXA 3CBUA 1UC7A 5CRHA 2RLIA 4I2TA 3IXRA 1TU7A 1DBYA 2C8UA 1VF3A 2LNSA 5DJMA 4EXJA 2YV9A 3CTGA 2GQKA 5GAPD 4JR6A 2WJUA 5IMVA 4PNFA 5LD0A 3P7XA 2DBCA 4ECCA 4TXOA 2GSQA 2WCIA 2J9HA 2CQ9A 2A2SA 1SYRA 2DJ0A 3TRQA 4EVMA 4WR5A 18GSA 1M2BA 2KHPA 2H1BA 2OADA 3GTUB 2VOCA 4N10A 2CVDA 2B1LA 1FVJA 2VL9A 4EC0A 5IPHA 1GSSA 4QL9A 3UMAA 1SU9A 1V9WA 2QKEA 2H66A 2WGRA 3H79A 1Q4JA 4L5OA 5HR1A 2AUVA 1S3DA 1TRSA 2MBSA 4AJ8A 2YJHA 5G31A 5HQPA 4JE1A 1MDKA 2H01A 4KSOA 1PA3A 3G7IA 3US3A 1TRWA 2PPTA 1VF1A 1QFNA 2L5LA 5GZZB 5J5NA 1SJIA 2JU5A 2VLVA 1G7EA 2FHEA 3IOSA 1NSWA 2PUKC 4NHZA 3HXSA 4TR0A 6GSXA 2OACA 3HJPA 2CVBA 1SK1A 3GYKA 1TRUA 1PL1A 4MF5A 5ECSA 2D2ZA 3N9JA 2HZFA 4TR1A 4K1FA 1VRSD 3QFBC 4IJIA 5D96A 1YF0A 4J57E 4TW5A 2X99A 3KTLA 1MDJA 3LYKA 3QAVA 3RHCA 2FUG2 2YCDA 3IE3A 2H0GA 1YKCA 1F3BA 1BQ7A 2R5GA 4IGJA 2DMLA 3CYNA 5ID2B 2L59A 2IMEA 3D6IA 2CVKA 3ZMLA 4PNGA 4DVCA 4MZCA 5GSTA 4KCEA 2LV3A 3UL3A 4MH2A 1TKDB 2RM6A 2FA8A 3GNJA 3F0IA 3LXTA 3HJMA 1XWKA 4RQRA 4HQSA 4MH3A 4FO5A 4NMUA 5F8BA 1FAAA 2MMNA 2C80A 4HJ2A 3TOTA 2EIQA 3C1SA 10GSA 4ZB8A 4ZBAA 1J9BA 1RQMA 2L5OA 2VL3A 4KCAA 4LMVA 2EC4A 5L71A 3WT2A 2EIRA 1NM3A 1QQ2A 2CA8A 4FH8A 4GTUA 2FY6A 3H1NA 1SL2B 3NOFA 2C3QA 4WEYA 1XBSA 5CRGA 3ZIVA 1FHEA 5ENUA 1PX7A 4NV5A 4HU9A 2HXKA 2B5EA 2E0QA 3CRTA 1U88A 2NVLA 5DBQA 1O6JA 2R3XA 1G6YA 1ZYQB 3UARA 1G0TA 3IBHA 3FRCA 4WF4A 3HDCA 3BD2A 1C72A 3JCML 3G7JA 1GRXA 1MEKA 5LCZA 2VM2A 1YEPA 3GMFA 4F82A 3VURA 1RW1A 4YQMA 2C3TA 2V1MA 1AQWA 1XWAA 2DLXA 1ABAA 1T7PB 2FLSA 2L6CA 2R37A 3HVXA 3ME7A 4IQAA 1GTBA 2J23A 2DSAA 1LU4A 1UVZA 4E8EA 1OKTA 3VPTA 9GSSA 2JL4A 4XHMA 5E59A 4K7NA 1WPIA 2E2GA 1Z7PA 2VLUA 3KXOA 4ECJA 1ERUA 1EP8A 1YJ6A 4KGIA 3HVSA 1URMA 2GZYA 2B5YA 5ECKB 4MMMA 3IDVA 2OKAA 1YQ1A 5DQSA 1RK4A 5D8IA 3ZVJD 3KEBA 5FHIA 2EIOA 5IM9A 5ABRA 1MTCA 4HI7A 3VLNA 1DSBA 2H30A 2XPEA 2GSTA 4ZIJA 1WJKA 1GUHA 3H8QA 4WBRD 5HR2A 5JCWA 3GKXA 5G1LA 3RHBA 5A4VA 4NWYA 2F3MA 4D73A 5G5FA 3QFAC 4PUFC 1TK5B 2I4AA 1YKAA 3C71A 5IO2A 1PKZA 5ECHB 4BVYA 2QSIA 3WYWA 3O3TA 4JR4A 2LQOA 4ZBBA 3A2VA 3KZQA 4OFNA 3LEFA 3FZAA 2JADA 2GS3A 3ZFBA 3EU3A 4K8MA 2GGTA 4FYBA 4PUAA 1GH2A 2GSSA 2E2MA 5CRDA 1XIYA 1K3OA 1AUCA 4HEA2 3LXZA 3FR9A 3LJRA 3GH6A 4KNDA 1K3YA 5J3RA 4V2LA 4ZL8A 4MF7A 5B8AA 1BYEA 2KP1A 3IK9A 1FOVA 1PMTA 2H1GA 2LQQA 1QGVA 1A8LA 1K0BA 4X1UA 1HNCA 5D73A 3DEXA 5AIXA 19GSA 2R2JA 3AY8A 3MSZA 3I69A 5HR3A 2YPMA 3CSHA 2RIIA 4POBA 3GIXA 1PQNA 5G30A 3L9SA 1SK0A 4K7IA 3IA1A 3G7YA 3FR3A 1SENA 1GSUA 2P5QA 5AGYA 2K8VA 1PGTA 2WS2A 1SL0B 3ZIJA 1U3AA 3TJBA 3IPZA 3Q74A 3UAPA 2IPAA 4LL1B 1MD4A 3RPPA 1AIUA 1JZRA 3C8EA 1W89A 5IOWA 13GSA 2HE3A 2XPDA 4ILFA 4OCEA 1T1VA 4KE3A 4QL7A 1Q98A 3LGCA 3FEUA 5HR0A 5D93A 2YN1A 2C0DA 2YZUA 2VLTA 2F8AA 3F9UA 2Z9SA 2H6XA 4TR4A 2JZTA 3EC3A 3KJYA 2K8SA 3GTUA 4X43A 1H4OA 3F6FA 2WRTA 2YP6A 2VL2A 4O5RA 1VF2A 2CX4A 1SL1B 3H93A 2V32A 3P2AA 3DIEA 4YQVA 2OA7A 3EMXA 4AJ7A 3WGXA 2FCHA 4K6XA 3DVWA 3TKSE 5J41A 1A2MA 2GTUA 2CX3A 3TUEA 2H75A 4YH2A 4OMVA 4FIWA 4QQ7A 4IKHA 4ZXGA 1GSQA 2GQLA 5F06A 1T3BA 1ZL9A 1M2DA 3FK8A 1O81A 1F9MA 1WRYA 1X5DA 1GTIA 22GSA 1TI1A 2AAWA 3DVXA 1BX9A 1YY7A 4DSQA 5EY6A 4YAVA 2WZ9A 2VCQA 1GLPA 4IHUA 1R7HA 1O73A 3P90A 2TIRA 4J2FA 5IO0A 4AGSA 4G19A 2HRFA 4OO4A 1GUMA 1FG4A 1B8XA 4MPFA 1NHOA 4J56E 4PQHA 2LNTA 1GLQA 2X8GA 1DUGA 3D22A 4EDYA 5FWGA 5ID2A 2H1AA 2BJXA 4LL4B 2GDRA 2DJJA 3KTBA 4MLYA 2OE3A 1FW1A 3GL5A 3GA4A 2DJ2A 5CYYA 3IK7A 1LBKA 2YNXA 4HZ4A 5IMFA 3KCMA 2YJ7A 2XC2A 3GX0A 3F3RA 1ZMAA 8GSSA 4HZ2A 4MF6A 4BWQA 1JLVA 1TOFA 3D4MA 3R2QA 1XVQA 4OD7A 4XS1A 4XRAA 4PGTA 4EKZA 1DE2A 3ERWA 2PVQA 1QUWA 2H0IA 5JWQB 3F4TA 3ED3A 5DCHA 3A2WA 3U6VA 3Q18A 2K9FA 2NTOA 3TJKA 2WFCA 1T4ZA 4IJ3A 4IS0A 2H8LA 2C4JA 1QXHA 3F4RA 2RUEA 4IP6A 2VD0A 2YV7A 4Q5QA 3DGQA 4O32A 5F07A 1XWCA 2FA4A 3TKRA 4GQFA 3A3TA 3KGKA 1H75A 5ECRB 5GSSA 4HDEA 4OCFA 2O8VB 4K7OA 4XCSA 1GTAA 1EV9A 1M9BA 1TK0B 3W6GA 3MAKA 2REMA 4I5QA 3TKPA 2BMXA 2C3NA 2PVOC 2QGVA 2AB6A 2DIYA 3TGZA 1AW9A 2GT6A 4ML1A 3CSJA 3KMNA 2K6VA 4GQCA 1JLWA 2CAQA 4NXIA 1KBNA 5AISA 1M99A 4F2IA 1AQXA 1W4VA 2HI7A 2N5AA 5J9CA 5JCGA 1E6BA 1XWGA 1GSDA 3EWLA 3F3QA 3LSZA 2OBKA 3HYPA 1OKDA 2FWFA 2R4VA 5IMDA 1ZGNA 4YQUA 2V6KA 1N2AA 3EINA 4ZL7A 1EOHA 2H1DA 4DSSA 4N11A 1OE8A 2DJ1A 2VL2C 5C00A 3J7Yb 4ZB6A 2H70A 4LA1A 7GSSA 1OC3A 1PX6A 3APSA 4RI6A 1IYIA 4I97A 4ZB9A 2H76A 2HLSA 3CXGA 1SKSB 2XBIA 1WOUA 1YEXA 3VWUA 3QCPA 4L8EA 5E4WA 3ZYWA 1IYHA 2P31A 5G2ZA 4LMWA 4CW9A 3FW2A 3DD3A 4Q5FA 2IMIA 2ZNMA 4ZILA 2OE1A 3C73A 3Q19A 3GX8A 1R5PA 1ACVA 4TKYA 2DC5A 4V1Ag 3H4KA 1BG5A 4P3YB 4YAPA 4BL7A 1I9DA 1GUKA 1XW5A 2YZHA 4NPBA 1F2EA 4O92A 4OO5A 1SK2A 3TRXA 4NHWA 3ZLPA 1ILOA 2I3YA 5DALA 2I81A 1TRVA 5ECIB 3ZVJA 3E3EA 3IAS2 4O7HA 3VFIA 2LJKA 5D9VA 1A24A 2NBSA 1KTEA 4OFMA 2GSRA 3HCZA 2FWEA 2ALBA 5CO3A 3UVTA 5DVBA 2V41A 5H5QA 3UIWA 2IFQA 2PN8A 4EUYA 4DSSB 4POMA 5C04A 1XCCA 1GULA 4JEDA 2DJKA 3HZ8A 4NAXA 4RI7A 1LJRA 1K3LA 3GH9A 3TKSC 1XVWA 3ZMKA 2GVPA 3DXBA 3FZ4A 1USBA 3UOMA 1QK8A 5KN2A 4F0CA 1V58A 3ISOA 3VPQA 1VGLA 1THXA 5HFIA 4MDCA 1QMVA 2P0GA 2AHEA 1V98A 2H19A 4ZL9A 2A4VA 5FT3A 3GRXA 5IIZA 1WIKA 17GSA 2KP2A 2FD3A 3GSSA 1OYJA 2C0EA 2KLXA 5B8BA 3A2XA 1B9XC 5KEJA 3O76A 4I2UA 11GSA 1M0UA 3KH7A 3ZREA 2MMOA 1XW9A 3UEMA 5KN0A 1HD2A 2X8HA 4F9ZA 4HS1A 1PL2A 1CQGA 1X5EA 3RAZA 2B3SA 4POLA 1SYXA 3IRAA 3I6AA 3TRPA 1OE7A 1GTUA 1A0FA 5ECQB 3V1WA 2H72A 1F6MC 3CSIA 3U5RE 1EP7A 4JRRA 4MJBA 4PXOA 5D9WA 4BA7A 4F03A 1B4QA 4N30A 2AV4A 5DALB 5CREA 4OFTA 1SJZA 2VCZA 2PGTA 2VUPA 1SD8A 5ECOB 4MJAA 1M9AA 4PQ1A 2IIYA 4GSTA 1ZOFA 1ST9A 2IFQB 3G9BA 4G2EA 4HJMA 1BEDA 2V2GA 1EZKA 3GKKA 2I9HA 4K0NA 4IN0A 3FKFA 1XW6A 4H86A 2YOIA 4KA0A 2JSYA 1OVNA 2P5RA 2DMMA 3GSTA 3C7MA 5IMAA 4TVEA 1XOAA 3PR8A 2VO4A 4TR3A 4JZQA 4GWRA 4ML6A 3IR4A 3ZRDA 3TOUA 3M3MA 3WGEA 3GKNA 3HKRA 4GLTA 3QPMA 1X9WB 1K0AA 2G0FA 3ERGA 3F4SA 1HQOA 1K0OA 1FB6A 1JFUA 2JSZA 1KEBA 1Y6EA 4EDZA 1R5AA 1SD9A 3L0HA 5HFKA 1OC8A 3D0ZA 4MJCA 4PURA 3HZ4A 3D5JA 1U6TA 1GWCA 1ERVA 5G5EA 4I6XA 1J08A 2LSTA 5IQYA 3KP9A 20GSA 3S9FA 2MMAA 2YANA 3WT1A 2M80A 3TDGA 3LQ7A 2CAIA 5JWOB 1Y25A 5JWRB 3VI5A 2AYTA 2CV4A 1AAZA 2PU9C 5AN1A 2BTOT 5IOXA 2JZSA 2X8CA 2O7KA 2A2RA 1OC9A 1M7TA 3DMLA 4IP1A 1ZZYA 3QD9A 4GSSA 5A4UA 2VM1A 4KDUA 3J7Yk 2LRTA 3DWVA 2PERA 1XOBA 1F37A 4V1Ap 2TRCP 3F6DA 1O8XA 5B6NA 1E2YA 2PBJA 1PN9A 2C0FA 2H74A 2K18A 2HYXA 2C0GA 3WGDA 2FWGA 3BBYA 2FGXA 2LKUA 1A2LA 3EURA 5ELAA 4KW6A 5DAKB 4RUVA 2O85A 1K0NA 2LUSA 4N0ZA 4V2NA 4OWYA 1EOGA 3I43A 2YWMA 1TTZA 3KD0A 4L0WA 5JCUA 3GV1A 2F51A 1I5GA 5ELGA 4WKWA 3RDWA 5ECMB 2TRXA 5LNKe 1KNGA 1BJXA 5DCGA 5F0GA 1XFLA 1HNBA 4Q5RA 4KDXA 3HJOA 3W8JA 1K0CA 3IC4A 4BVXA 1NHYA 3SWLA 3PGTA 4RQXA 3TJGA 4WBJA 2GZZA 3NZNA 3BJ5A 3TKSA 3QR6A 5A4WA 4FYUA 4XRDA 4KX4A 5ECPB 1OAZA 2OE0A 3FZ5A 3ZFLA 1Z6NA 2VCVA 2VCXA 1JZWA 3ZTLA 3BCIA 1PD21 4IELA 1SKWB 3EE2A 3VWVA 1N8JA 1GNEA 5KN3A 2HSYA 1OC9B 6GSSA 1B4PA 1PSQA 2GT5A 3TB2A 2GQMA 5EPFA 2F9SA 2HRNA 2L4QA 3M9JA 4Q5NA 1A2JA 3FY7A 4HOJA 1ON4A 1ML6A 4HQZA 1TI3A 4X0XA 2PWJA 4N0VA 2C1YA 2WDUA 5B7CA 3LFLA 5A5KA 3N5OA 3KH9A 4BWSA 3HHVA 3QMXA 4HU7A 4AF2A 1TU8A 3GFKA 2IMKA 4LLRA 4MZBA 5CNWA 2RUFA 3NIVA 2B6MA 2FNOA 2H71A 2OJLA 1V57A 4PX1A 1FO5A 2AJQB 3KP8A 4WXTA 4XS4A 1PRXA 3CTFA 1HYUA 2WB9A 2G2QA 1S3AA 4K2DA 6GSUA 1EGRA 3RBTA 2M46A 2LEGA 4TXOB 4MJEA 3MDKA 2KUCA 3PINA 1X0RA 5IPGA 4ECBA 1FB0A 2LS5A 2VCTA 3E9JB 1V2AA 4L5LA 1AXDA 3HY2A 4NV2A 1X9SB 4V2MA 3M8NA 2HNLA 3QAWA 3GUSA 3GL3A 4KH7A 2MYGA 5IMCA 4DEJA 4F0BA 1ZYEA 3HVVA 1EEJA 4CDOA 2XBQA 1UN2A 3HD5A 5B6MA 1ZCPA 2QC7A 4ULXA 1X5CA 1YF1A 3ME8A 4MCUA 4K0GA 3IV4A 2E7PA 1AQVA 2YWOA 2H6ZA 2ZUPA 3EYTA 2N5BA 3W8SA 5IMZA 1ERWA 3UJ1A 2IL3A 1B9YC 3QDNA 3L9UA 1J0FA 2CZ3A 1MD3A 2B7KA 1R26A 6GSWA 1AC1A 4EL1A 4TR1B 2VD1A 2IN3A 4CHSA 1O85A 3LORA 2FWHA 3I9V2 4XS4B 1O8WA 1U3IA 1A23A 3F63A 3TJFA 3P8WA 2MBTA 2NPBA 2HZEA 5DDLA 2DIZA 4MPGA 3QAGA 4MZWA 4GCIA 4FYCA 1CQHA 3PH9A 1NW2A 3L9VA 1MDIA 2B1KA 3IAM2 3O6TA 5ECLB 1FVKA 3M0FA 1F3AA 1Z9HA 1K0MA 2HFDA 2MMZA 6GSVA 3RPNA 4XIHA 5H5SA 1O7UA 4E8HA 3Q6OA 3KMOA 4Z7XA 4L0UA 3SBCA 1G7OA 5GAND 6GSYA 4EO3A 4IQ1A 3GN3A 3ZL5A 3VK9A 4I8BA 1XWBA 3KIJA 1XZOA 2LJRA 2H73A 1JHBA 2ON5A 2H0HA 3LWAA 1TXXA 3GKMA 3TCOA 4GSNA 2RM5A 3OR5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite